BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg486975 Length=1773 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT5G01040.1 | Symbols: LAC8 | laccase 8 | chr5:13128-16173 REVE... 2702 0.0 AT5G01050.1 | Symbols: | Laccase/Diphenol oxidase family prote... 2579 0.0 > AT5G01040.1 | Symbols: LAC8 | laccase 8 | chr5:13128-16173 REVERSE LENGTH=2052 Length=2052 Score = 2702 bits (1463), Expect = 0.0 Identities = 1676/1779 (94%), Gaps = 14/1779 (1%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGCCTCGACTTCATCATTATCTCCCAATTCAAACCTTCGTCGTTCTTCTTCTCTTCTCT 60 |||||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||| |||| ||||||||||||||| Sbjct 32 ATGCCTCGACTTCATCATTATCTCTCAAATCAAGCGTTCCTCGTCCTTCTTCTCTTCTCT 91 Query 61 TCCATTGCCTCAGCAGCTATTGTCGAACATGTCCTCCACGTCAAAGACGTCATGGTGAAA 120 |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||| Sbjct 92 TCCATTGCCTCAGCAGCTGTTGTCGAACATGTTCTCCACATCCAAGACGTCGTGGTGAAA 151 Query 121 CCGTTATGCAAGGAGCAAATGATACCAACAGTTAACGGAAGTTTTCCGGGTCCAACGATA 180 |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||| |||| || ||||||||| Sbjct 152 CCGTTATGCAAGGAGCAAATAATACCGGCAGCTAATGGAAGTCTTCCCGGCCCAACGATA 211 Query 181 AACGTTAGAGAAGGCGACACTCTTGTGGTTCATGTCATTAACAACTCAACTTACAACGTA 240 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 212 AACGTTAGAGAAGGCGACACTCTTGTGGTTAATGTCATTAACAACTCAACTTACAATGTA 271 Query 241 ACCATCCATTGGCATGGAGTTTTTCAGTTGAAGAGCGTATGGATGGACGGTGCGAATATG 300 |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 272 ACCATCCACTGGCATGGAGTTTTCCAGTTGAAGAGCGTATGGATGGACGGTGCGAATATG 331 Query 301 ATAACTCAATGTCCGATTCAACCAAGTAACAACTTCACATATCAATTCGATATCACCGGA 360 |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct 332 ATAACTCAATGTCCGATTCAACCAGGTTACAACTTCACATATCAATTTGATATCACTGGA 391 Query 361 CAAGAAGGTACATTGTTATGGCACGCACACGTCGTTAATCTACGTGCCACTCTTCATGGG 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 392 CAAGAAGGTACATTGTTATGGCACGCACACGTCGTTAATCTACGTGCCACTCTTCACGGG 451 Query 421 GCTCTAGTCATCCGTCCTCGATCCGGCCGTCCTTACCCTTTTCCTAAACCCTACAAGGAA 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 452 GCTCTAGTCATCCGTCCCCGATCCGGCCGTCCTTACCCTTTTCCTAAACCCTACAAGGAA 511 Query 481 GTTCCTATCATTTTTCAACAATGGTGGGACACAGATGTTAGACTTCTCGAATTACGGCCA 540 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 512 GTTCCTATCGTTTTTCAACAATGGTGGGACACAGATGTTAGACTTCTCCAATTACGGCCA 571 Query 541 GCTCCGGTTTCTGATGCTTACCTCATCAATGGCCTCGCCGGAGATTCATATCCTTGCTCT 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 572 GCTCCGGTTTCTGATGCTTACCTCATCAATGGCCTCGCCGGAGATTCATATCCTTGCTCT 631 Query 601 CAGAATAGAATGTTTAACCTCAAGGTTGTACACGGAAAAACATACTTGCTAAGGATTATA 660 |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || Sbjct 632 GAGAATAGAATGTTTAACCTCAAAGTTGTACAAGGAAAAACATACTTGCTAAGGATCGTA 691 Query 661 AACGCAGCACTCAACACTCACCTCTTCTTCAAAATAGCCAATCACAACGTCACAGTTGTC 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 692 AACGCAGCACTCAACACTCACCTCTTCTTCAAAATAGCCAATCACAACGTCACAGTTGTC 751 Query 721 GCTGTAGATGCTGTCTACACGACGCCGTACCTCACCGATGTGATGATCTTAACGCCGGGA 780 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 752 GCTGTAGATGCTGTCTACTCGACGCCGTACCTCACCGATGTGATGATCTTAACGCCGGGA 811 Query 781 CAAACTGTTGACGCACTTCTCACCGCCGACCAGCCCATTGGAATGTACTACATGGCCACC 840 || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 812 CAGACCGTTGACGCACTTCTCACCGCCGACCAGGCCATTGGAAAGTACTACATGGCCACC 871 Query 841 ATCCCTTACTTTAGTGCCATCGGGATACCAGCATCCCCCGACATCAAACCCACCAGAGGA 900 |||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 872 CTCCCTTACATTAGTGCCATTGGGATACCA--A-CCCCCGACATCAAACCCACCAGAGGC 928 Query 901 TTAATCGTCTACGAGGGTGCCACGTCATCATCATCGCCAGTGAAGCCGTTGATGCCTGCT 960 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | Sbjct 929 TTAATCGTCTACCAGGGTGCCACGTCATCATCATCGCCAGCGGAGCCGTTGATGCCTG-T 987 Query 961 -ACGACTGACATAG-CCACCTCTCATAGGTTCTCCTCGAACATCACTAGCCTCGTGGGTG 1018 ||| |||||| | ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| Sbjct 988 GCCGAATGACAT-GTCCACCGCTCATAGGTTCACCTCAAACATCACTAGCCTCGTTGGTG 1046 Query 1019 GACCACACTGGA-AGCCAGTGCCTCGTCACGTGGACGAGAAGATGTTCATAACCATGGGG 1077 |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1047 GACCACACTGGACA-CCAGTCCCTCGTCACGTGGACGAGAAGATGTTCATAACCATGGGG 1105 Query 1078 CTTGGCTTAGACCCATGTCCTTCGGGTACCAAGTGTATTGGACCGTTGGGTCAAAGGTAT 1137 |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 1106 CTTGGCTTAGACCCATGTCCAGCGGGCACCAAGTGTATTGGACCGTTAGGTCAAAGGTAT 1165 Query 1138 GCTGGATCTCTCAACAACCGCACTTTTATGATTCCGGAGAGAATCTCTATGCAAGAGGCT 1197 ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1166 GCTGGTTCTCTCAACAACCGCACTTTTATGATCCCGGAGAGAATCTCTATGCAAGAGGCT 1225 Query 1198 TATTTTTACAACATTAGTGG-AGTCTACACCGAAGATTTTCCCGACCAACCACCGGTTAA 1256 |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct 1226 TATTTTTACAACATTAGTGGCA-TCTACACCGACGATTTTCCCAACCAACCACCGCTTAA 1284 Query 1257 ATTTGATTACACAAAATTCCAACAGCGTACGAATTCTGACATGAAGATGATGTTTCCGGA 1316 ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 1285 ATTTGATTACACAAAATTCGAACAACGTACCAATAATGACATGAAGATGATGTTTCCGGA 1344 Query 1317 AAGAAAGACTAGCGTCAA-AACAATTAGATTTAATTCAACAGTCGAGATTGTTTTGCAAA 1375 |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | Sbjct 1345 AAGAAAGACTAGCGTCAAGAA-AATTAGATTTAATTCTACAGTCGAGATCGTTTTGCAGA 1403 Query 1376 ACACGGCTATTCTCTCCCCGGAGAGCCACCCCATGCACCTTCACGGCTTCAACTTCTATG 1435 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| Sbjct 1404 ACACGGCTATAATCTCCCCGGAGAGCCACCCCATGCACCTCCACGGTTTCAACTTCTATG 1463 Query 1436 TTTTGGGTTATGGATTTGGTAACTATGATCCTATTCGTGATGCAAGAAAGCTAAATCTAT 1495 | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 1464 TGTTAGGTTATGGATTTGGTAACTATGATCCTATTCGTGATGCAAGAAAGCTTAATCTAT 1523 Query 1496 TTAACCCACAGATGCACAATACCGTTGGTGTACCACCAGGTGGATGGGTTGTCCTCAGAT 1555 ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 1524 TTAACCCGCAAATGCATAATACCGTTGGTGTACCACCAGGCGGATGGGTTGTCCTCAGAT 1583 Query 1556 TTATCGCTAATAATCCTGGTGTATGGCTGTTCCATTGTCACATGGATGCACATTTACCAT 1615 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1584 TTATCGCTAATAATCCTGGTGTATGGCTGTTCCATTGTCACATGGATGCACATTTACCAT 1643 Query 1616 ACGGGATTATGAATGCTTTCATAGTTCAAAATGGGCCAACTCCGGAAACGAGCTTGCCAT 1675 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1644 ACGGGATTATGAGTGCTTTCATAGTTCAAAACGGGCCAACTCCGGAAACGAGCTTGCCAT 1703 Query 1676 CTCCACCGTCGAATCTTCCGCAATGCACTCGTGATCCTACGATCTATGACTCTCGGACGA 1735 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1704 CTCCACCGTCGAATCTTCCGCAATGCACTCGGGATCCTACGATCTATGACTCTCGGACGA 1763 Query 1736 CTAACACTGATTTGTCTTACTAAAAGCAACT-AGGTTCG 1773 |||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||| Sbjct 1764 CTAACATTGATTTGTCTTACTAAAAGTAATTTAGGTTCG 1802 > AT5G01050.1 | Symbols: | Laccase/Diphenol oxidase family protein | chr5:18086-20812 REVERSE LENGTH=1884 Length=1884 Score = 2579 bits (1396), Expect = 0.0 Identities = 1646/1768 (93%), Gaps = 11/1768 (1%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGCCTCGACTTCATCATTATCTCCCAATTCAAACCTTCGTCGTTCTTCTTCTCTTCTCT 60 ||||||||| ||||||||| ||| ||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||| Sbjct 1 ATGCCTCGAGTTCATCATTCTCTGTCAAATCAAGCCTTCCTCGTCCTTCTTCTCTTCTCT 60 Query 61 TCCATTGCCTCAGCAGCTATTGTCGAACATGTCCTCCACGTCAAAGACGTCATGGTGAAA 120 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| | Sbjct 61 TCCATTGCCTCAGCAGCTATTGTCGAACATGTTCTCCACGTTAAAGACGTCGTGGTGACA 120 Query 121 CCGTTATGCAAGGAGCAAATGATACCAACAGTTAACGGAAGTTTTCCGGGTCCAACGATA 180 ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||| |||||||||||| Sbjct 121 CCGTTGTGCAAGGAGCAAATGATACCGATAGTTAATGGAAGTCTTCCCGGTCCAACGATA 180 Query 181 AACGTTAGAGAAGGCGACACTCTTGTGGTTCATGTCATTAACAACTCAACTTACAACGTA 240 |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct 181 AACGTTAGAGAAGGCGACACCCTTGTCGTTCATGTCATTAACAAGTCAACTTACAATGTA 240 Query 241 ACCATCCATTGGCATGGAGTTTTTCAGTTGAAGAGCGTATGGATGGACGGTGCGAATATG 300 |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 ACCATCCACTGGCATGGAGTTTTTCAGCTGAAGAGCGTATGGATGGACGGTGCGAATATG 300 Query 301 ATAACTCAATGTCCGATTCAACCAAGTAACAACTTCACATATCAATTCGATATCACCGGA 360 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct 301 ATAACTCAATGTCCGATTCAACCAAGTAACAATTTCACGTATCAATTTGATATCACCGGA 360 Query 361 CAAGAAGGTACATTGTTATGGCACGCACACGTCGTTAATCTACGTGCCACTCTTCATGGG 420 ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| Sbjct 361 CAAGAAGGTACATTGTTGTGGCATGCACACGTCGTTAATCTACGTGCCACTATTCACGGG 420 Query 421 GCTCTAGTCATCCGTCCTCGATCCGGCCGTCCTTACCCTTTTCCTAAACCCTACAAGGAA 480 |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct 421 GCTCTAATTATCCGTCCCCGATCCGGCCGTCCTTACCCTTTCCCTAAACCATACAAGGAA 480 Query 481 GTTCCTATCATTTTTCAACAATGGTGGGACACAGATGTTAGACTTCTCGAATTACGGCCA 540 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 481 GTTCCTCTCATTTTTCAACAATGGTGGGACACAGATGTTAGACTTCTCGAACTACGGCCA 540 Query 541 GCTCCGGTTTCTGATGCTTACCTCATCAATGGCCTCGCCGGAGATTCATATCCTTGCTCT 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 GCTCCGGTTTCTGATGCTTACCTCATCAATGGCCTCGCCGGAGATTCATATCCTTGCTCT 600 Query 601 CAGAATAGAATGTTTAACCTCAAGGTTGTACACGGAAAAACATACTTGCTAAGGATTATA 660 |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 AAGAATAGAATGTTTAACCTCAAAGTTGTACAAGGAAAAACATACTTGCTAAGGATTATA 660 Query 661 AACGCAGCACTCAACACTCACCTCTTCTTCAAAATAGCCAATCACAACGTCACAGTTGTC 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 661 AACGCAGCACTCAACACTCACCTCTTCTTCAAAATAGCCAATCACAACGTTACAGTTGTT 720 Query 721 GCTGTAGATGCTGTCTACACGACGCCGTACCTCACCGATGTGATGATCTTAACGCCGGGA 780 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 721 GCTGTAGATGCTGTCTACACGACGCCGTACCTCACCGATGTGATGATCTTAACACCGGGA 780 Query 781 CAAACTGTTGACGCACTTCTCACCGCCGACCAGCCCATTGGAATGTACTACATGGCCACC 840 ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | Sbjct 781 CAAACAATTGACGCAATTCTCACCGCTGACCAGCCCATTGGAACGTACTACATGGCCATC 840 Query 841 ATCCCTTACTTTAGTGCCATCGGGATACCAGCATCCCCCGACATCAAACCCACCAGAGGA 900 |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 841 ATCCCTTACTTTAGTGCCATCGGGGTACCGGCATCCCCCGACACCAAACCCACCAGAGGC 900 Query 901 TTAATCGTCTACGAGGGTGCCACGTCATCATCATCGCCAGTGAAGCCGTTGATGCCTGCT 960 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | Sbjct 901 TTAATCGTCTACGAGGGTGCTACGTCATCATCATCGCCAACAAAGCCGTGGATGCCTCCG 960 Query 961 ACGACTGACATAGCCACCTCTCATAGGTTCTCCTCGAACATCACTAGCCTCGTGGGTGGA 1020 ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 961 GCGAATGACATACCCACCGCTCATAGGTTCTCCTCGAACATCACTAGCCTCGTGGGTGGA 1020 Query 1021 CCACACTGGAAGCCAGTGCCTCGTCACGTGGACGAGAAGATGTTCATAACCATGGGGCTT 1080 || ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 1021 CCTCACTGGACGCCGGTGCCTCGTCACGTGGACGAGAAGATGTTCATAACGATGGGGCTT 1080 Query 1081 GGCTTAGACCCATGTCCTTCGGGTACCAAGTGTATTGGACCGTTGGGTCAAAGGT-ATGC 1139 ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||| | || Sbjct 1081 GGCTTAGACCCATGTCCTTCGAACGCCAAGTGTGTTGGACCGTTAGATCAAAGGTTA-GC 1139 Query 1140 TGGATCTCTCAACAACCGCACTTTTATGATTCCGGAGAGAATCTCTATGCAAGAGGCTTA 1199 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1140 TGGATCTCTAAACAACCGCACTTTTATGATTCCGGAGAGAATCTCTATGCAAGAGGCTTA 1199 Query 1200 TTTTTACAACATTAGTGGAGTCTACACCGAAGATTTTCCCGACCAACCACCGGTTAAATT 1259 |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 1200 TTTTTACAACATTACTGGAGTCTACACTGACGATTTTCCCGACCAACCACCGCTTAAATT 1259 Query 1260 TGATTACACAAAATTCCAACAGCGT---ACGAATTCTGACATGAAGATGATGTTTCCGGA 1316 ||||| ||||||||| |||||| | || |||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 1260 TGATTTCACAAAATTTGAACAGCATCCCACCAATTCTGACATGGAGATGATGTTTCCGGA 1319 Query 1317 AAGAAAGACTAGCGTCAAAACAATTAGATTTAATTCAACAGTCGAGATTGTTTTGCAAAA 1376 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || Sbjct 1320 AAGAAAGACTAGCGTCAAGACAATTAGATTTAATTCTACAGTGGAGATCGTTTTGCAGAA 1379 Query 1377 CACGGCTATTCTCTCCCCGGAGAGCCACCCCATGCACCTTCACGGCTTCAACTTCTATGT 1436 ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 1380 CACGGGAATACTAACCCCGGAGAGCCACCCCATGCACCTTCACGGTTTCAACTTCTATGT 1439 Query 1437 TTTGGGTTATGGATTTGGTAACTATGATCCTATTCGTGATGCAAGAAAGCTAAATCTATT 1496 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 1440 GTTAGGTTATGGATTTGGTAACTATGATCCTATTCGTGATGCAAGAAAGCTTAATCTATT 1499 Query 1497 TAACCCACAGATGCACAATACCGTTGGTGTACCACCAGGTGGATGGGTTGTCCTCAGATT 1556 |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1500 TAACCCGCAAATGCACAATACCGTTGGTGTACCACCAGGTGGATGGGTTGTCCTCAGATT 1559 Query 1557 TATCGCTAATAATCCTGGTGTATGGCTGTTCCATTGTCACATGGATGCACATTTACCAT- 1615 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1560 TATCGCTAATAATCCTGGTATATGGCTGTTCCATTGTCACATGGATGCACATTTACCATT 1619 Query 1616 ACGGGATTATGAATG-CTTTCATAGTTCAAAATGGGCCAACTCCGG-AAACGAGCTTGCC 1673 | || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| Sbjct 1620 A-GGAATTATGA-TGGCTTTCATAGTTCAAAATGGGCCAAC-CCGGGAAACGAGTTTGCC 1676 Query 1674 ATCTCCACCGTCGAATCTTCCGCAATGCACTCGTGATCCTACGATCTATGACTCTCGGAC 1733 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1677 ATCTCCACCGTCGAATCTTCCGCAATGCACTCGGGATCCTACGATCTATGACTCTCGGAC 1736 Query 1734 GACTAACACTGATTTGTCTTACTAAAAG 1761 |||||| |||| |||||||||||||| Sbjct 1737 GACTAATGTTGATATGTCTTACTAAAAG 1764 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 87700352115 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5