BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg487099
Length=4706
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G03280.1 | Symbols: EIN2, PIR2, CKR1, ERA3, ORE3, ORE2, ATEI... 7005 0.0
> AT5G03280.1 | Symbols: EIN2, PIR2, CKR1, ERA3, ORE3, ORE2, ATEIN2
| NRAMP metal ion transporter family protein | chr5:787428-793356
FORWARD LENGTH=4803
Length=4803
Score = 7005 bits (3793), Expect = 0.0
Identities = 4092/4236 (97%), Gaps = 21/4236 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 487 TGTTGAGTTGACCTTAAATCCTACTCTGAGTAATTATATTATCAGATAGATTTAGGATGG 546
||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 573 TGTAGAGTTGACCTTGAATCCTACTCTGAGTAATTATATTATCAGATAGATTTAGGATGG 632
Query 547 AAGCTGAAATTGTGAATGTGAGACCTCAGCTAGGGTTCATCCAGAGAATGGTTCCTGCTC 606
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 633 AAGCTGAAATTGTGAATGTGAGACCTCAGCTAGGGTTTATCCAGAGAATGGTTCCTGCTC 692
Query 607 TACTGCCAGTCCTTTTGGTTTCTGTCGGATATATTGATCCCGGGAAATGGGTTGCAAATA 666
|||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 693 TACTTCCTGTCCTTTTGGTTTCTGTCGGATATATTGATCCCGGGAAATGGGTTGCAAATA 752
Query 667 TTGAAGGAGGTGCTCGTTTCGGGTATGACTTGGTGGCAATTACTCTGCTTTTCAATTTTG 726
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 753 TCGAAGGAGGTGCTCGTTTCGGGTATGACTTGGTGGCAATTACTCTGCTTTTCAATTTTG 812
Query 727 CCGCCATCTTGTGCCAGTATGTAGCAGCTCGAATAAGCGTTGTAACTGGTAAACACTTGG 786
|||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 813 CCGCCATCTTATGCCAATATGTTGCAGCTCGCATAAGCGTTGTGACTGGTAAACACTTGG 872
Query 787 CTCAGATCTGCAATGAAGAATATGACAAGTGGACGTGCATGTTCTTGGGCATTCAGGCGG 846
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 873 CTCAGATCTGCAATGAAGAATATGACAAGTGGACGTGCATGTTCTTGGGCATTCAGGCGG 932
Query 847 AGTTCTCAGCAATTCTGCTCGACCTTACCATGGTTGTGGGAGTTGCGCATGCACTTAACC 906
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 933 AGTTCTCAGCAATTCTGCTCGACCTTACCATGGTTGTGGGAGTTGCGCATGCACTTAACC 992
Query 907 TTTTGTTTGGGGTGGAGTTATCTACTGGAGTGTTTTTGGCTGCCATCGATGCGTTTTTAT 966
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||
Sbjct 993 TTTTGTTTGGGGTGGAGTTATCCACTGGAGTGTTTTTGGCCGCCATGGATGCGTTTTTAT 1052
Query 967 TTCCTGTTTTCGCCTCTTTCCTTGAAAATGGTATGGCAAATACAGTATCCATTTGCTCGG 1026
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
Sbjct 1053 TTCCTGTTTTCGCCTCTTTCCTTGAAAATGGTATGGCAAATACAGTATCCATTTACTCTG 1112
Query 1027 CAGGCCTGGTTTTACTTCTCTATGTTTCTGGCGTCTTGCTGAGTCAGTCTGAGATCCCAT 1086
|||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1113 CAGGCCTGGTATTACTTCTCTATGTATCTGGCGTCTTGCTGAGTCAGTCTGAGATCCCAC 1172
Query 1087 TCTCTATGAACGGAGTGTTAACTCGGTTAAATGGAGAGAGCGCATTCGCACTGATGGGTC 1146
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1173 TCTCTATGAATGGAGTGTTAACTCGGTTAAATGGAGAGAGCGCATTCGCACTGATGGGTC 1232
Query 1147 TTCTTGGAGCAAGCATCGTCCCTCACAATTTTTATATCCATTCTTATTTTGCTGGGGAAA 1206
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1233 TTCTTGGCGCAAGCATCGTCCCTCACAATTTTTATATCCATTCTTATTTTGCTGGGGAAA 1292
Query 1207 GTACATCTTTGTCAGATG-CGGACAAGAGCAGCTTGTGTCAAGATCATTTGTTCGCCATC 1265
||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1293 GTACATCTTCGTCTGATGTC-GACAAGAGCAGCTTGTGTCAAGACCATTTGTTCGCCATC 1351
Query 1266 TTTGGTGTCTTCAGCGGACTTTCACTTGTAAATTATGTATTGATAAATGCAGCAGCGAAT 1325
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||
Sbjct 1352 TTTGGTGTCTTCAGCGGACTGTCACTTGTAAATTATGTATTGATGAATGCAGCAGCTAAT 1411
Query 1326 GTGTTCCACAGTACTGGCCTTGTGGTATTGACTTTTCACGATGCCATGTCACTAATGGAG 1385
||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1412 GTGTTTCACAGTACTGGCCTTGTGGTACTGACTTTTCACGATGCCTTGTCACTAATGGAG 1471
Query 1386 CAGGTATTTATGAGTCCGCTCATTCCAGTGGTCTTTTTGATGCTCTTGTTCTTCTCTAGT 1445
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1472 CAGGTATTTATGAGTCCGCTCATTCCAGTGGTCTTTTTGATGCTCTTGTTCTTCTCTAGT 1531
Query 1446 CAAATTACAGCACTAGCTTGGGCTTTCGGTGGAGAGGTCGTCCTGCATGACTTCCTGAAG 1505
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1532 CAAATTACCGCACTAGCTTGGGCTTTCGGTGGAGAGGTCGTCCTGCATGACTTCCTGAAG 1591
Query 1506 ATAGAAATACCCGGTTGGCTTCATCGTGCTACAATCAGAATTCTTGCAGTTGCTCCTGCC 1565
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1592 ATAGAAATACCCGCTTGGCTTCATCGTGCTACAATCAGAATTCTTGCAGTTGCTCCTGCG 1651
Query 1566 CTTTATTGTGTATGGACATCTGGTGCAGACGGAATATACCAGTTACTTATATTCACCCAG 1625
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1652 CTTTATTGTGTATGGACATCTGGTGCAGACGGAATATACCAGTTACTTATATTCACCCAG 1711
Query 1626 GTCCTGGTGGCGATGATGCTTCCTTGCTCAGTAATACCGCTGTTCCGCATTGCTTCGTCG 1685
||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1712 GTCTTGGTGGCAATGATGCTTCCTTGCTCGGTAATACCGCTTTTCCGCATTGCTTCGTCG 1771
Query 1686 AGACAAATCATGGGTGTCCATAAAATCCCTCAGGTTGGCGAGTTCCTCGCACTTACAACA 1745
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1772 AGACAAATCATGGGTGTCCATAAAATCCCTCAGGTTGGCGAGTTCCTCGCACTTACAACG 1831
Query 1746 TTTTTGGGATTTCTGGGTTTGAATGTTGTTTTTGTTGTTGAGATGGTATTTGGGAGCAGT 1805
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1832 TTTTTGGGATTTCTGGGGTTGAATGTTGTTTTTGTTGTTGAGATGGTATTTGGGAGCAGT 1891
Query 1806 GACTGGGCTGGTGGTTTAAGATGGAATACCGTGATGGGCACCTCGATTCAGTACACCACT 1865
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1892 GACTGGGCTGGTGGTTTGAGATGGAATACCGTGATGGGCACCTCGATTCAGTACACCACT 1951
Query 1866 CTGCTTGTATCGTCATGTGCATCCTTTTGCCTAATGCTCTGGCTTGCAGCTACGCCGCTG 1925
|||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||
Sbjct 1952 CTGCTTGTATCGTCATGTGCATCCTTATGCCTGATACTCTGGCTGGCAGCCACGCCGCTG 2011
Query 1926 AAATCTGCGAGTAACAGAGCAGAAGCTCAAATATGGAACATGGATGCTCAAAATGCTTTA 1985
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2012 AAATCTGCGAGTAACAGAGCGGAAGCTCAAATATGGAACATGGATGCTCAAAATGCTTTA 2071
Query 1986 TCTTATCCATCTGTTCAAGAAGAGGAAATTGAAAGAAGC-GAAACAAGGCGGAATGAAGA 2044
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||
Sbjct 2072 TCTTATCCATCTGTTCAAGAAGAGGAAATTGAAAGAA-CAGAAACAAGGAGGAACGAAGA 2130
Query 2045 CGAATCGATAGGGCGACTGGAAAGCAGGATAAAGGATCAGTTTGATACTACGTCTGTTAC 2104
|||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2131 CGAATCAATAGTGCGGTTGGAAAGCAGGGTAAAGGATCAGTTGGATACTACGTCTGTTAC 2190
Query 2105 TAGCCCGGTCTATGATTTGCCAGAGAACATTCTAATGACGGATCAAGAAATCCGTTCGAG 2164
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2191 TAGCTCGGTCTATGATTTGCCAGAGAACATTCTAATGACGGATCAAGAAATCCGTTCGAG 2250
Query 2165 CCCTCTAGAGGAAAGTGAGTTGGATGTAAAATTCTCTACCTCTCAAGTTAGTAGTCTTAA 2224
||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2251 CCCTCCAGAGGAAAGAGAGTTGGATGTAAAGTACTCTACCTCTCAAGTTAGTAGTCTTAA 2310
Query 2225 GGAAGACTCTGATGTAAAGGAACAGTCTGTAGTGCAGTCAACGGTGGTTAATGAGGTCAG 2284
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2311 GGAAGACTCTGATGTAAAGGAACAGTCTGTATTGCAGTCAACAGTGGTTAATGAGGTCAG 2370
Query 2285 TGATAAGGATCTGATTGTTGAAACAAAGATGGC-AAAATTTGAACCGATGAGTCCTGTGG 2343
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||
Sbjct 2371 TGATAAGGATCTGATTGTTGAAACAAAGATGGCGAAAA-TTGAACCAATGAGTCCTGTGG 2429
Query 2344 AGAAGATTGTTAGTATGGAGAATAACAGCATGTTCATTGAAAAGGATGTTGAAGGGGTTT 2403
||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2430 AGAAGATTGTTAGCATGGAGAATAACAGCAAGTTTATTGAAAAGGATGTTGAAGGGGTTT 2489
Query 2404 CATGGGAAACAGAAGAAGCTACCAAAGCTGCTCCTGCAAGCAACTTTACTGTCGGATCTG 2463
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2490 CATGGGAAACAGAAGAAGCTACCAAAGCTGCTCCTACAAGCAACTTTACTGTCGGATCTG 2549
Query 2464 ATGGTCCTCCTTCATTCCGCAGCTTAAGTGGGGAAGGGGGAAGTGGGACTGGAAGCCTTT 2523
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2550 ATGGTCCTCCTTCATTCCGCAGCTTAAGTGGGGAAGGGGGAAGTGGGACTGGAAGCCTTT 2609
Query 2524 CACGGTTGCAAGGTTTGGGGCGTGCTGCCCGGCGACATTTATCAGCGATCCTTGATGAAT 2583
||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2610 CACGGTTGCAAGGTTTGGGACGTGCTGCCCGGAGACACTTATCTGCGATCCTTGATGAAT 2669
Query 2584 TTTGGGGACATTTATATGATTTCCATGGGCAATTGGTTGCTGAAGCCAGGGCAAAGAAAA 2643
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2670 TTTGGGGACATTTATATGATTTTCATGGGCAATTGGTTGCTGAAGCCAGGGCAAAGAAAC 2729
Query 2644 TAGATCAGTTGTTTGGCGCTGATCAAAAGTCAGCCTCTTCTATGAAAGCAGATTCTTTTG 2703
|||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2730 TAGATCAGCTGTTTGGCACTGATCAAAAGTCAGCCTCTTCTATGAAAGCAGATTCGTTTG 2789
Query 2704 GAAAAGACATGAGTAGTGGATATTGCATGTCACCAACTGCAAAGGGAATGGATTCACAGA 2763
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2790 GAAAAGACATTAGCAGTGGATATTGCATGTCACCAACTGCGAAGGGAATGGATTCACAGA 2849
Query 2764 TGACTTCAAGTTTATATGATTCACTGAAGCAGCAGAGGACACCCGGAAGTATCGATTCGT 2823
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2850 TGACTTCAAGTTTATATGATTCACTGAAGCAGCAGAGGACACCGGGAAGTATCGATTCGT 2909
Query 2824 TGTATGGATTACAAAGAGGTTCGTCACCGTCACCGTTGGTCAACCGTATGCAGATGTTGG 2883
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2910 TGTATGGATTACAAAGAGGTTCGTCACCGTCACCGTTGGTCAACCGTATGCAGATGTTGG 2969
Query 2884 GTGCTTATGGTAACACCACTAATAATAATAATGCTTATGAATTGAGTGAGAGAAGATACT 2943
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2970 GTGCATATGGTAACACCACTAATAATAATAATGCTTACGAATTGAGTGAGAGAAGATACT 3029
Query 2944 CTAGCCTGCGTGCTCCATCATCTTCAGAGGGTTGGGAACACCAACAACCAGCTACAGTTC 3003
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3030 CTAGCCTGCGTGCTCCATCATCTTCAGAGGGTTGGGAACACCAACAACCAGCTACAGTTC 3089
Query 3004 ACGGATACCAGATTAAGTCATATGTTGACAATTTGGCAAAAGAAAGGCTTGAAGCCTTAC 3063
||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3090 ACGGATACCAGATGAAGTCATATGTAGACAATTTGGCAAAAGAAAGGCTTGAAGCCTTAC 3149
Query 3064 AATCCCGTGGAGAGATCCCGACATCGAGATCTATGGCGCTTGGTACATTGAGCTATACAC 3123
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3150 AATCCCGTGGAGAGATCCCGACATCGAGATCTATGGCGCTTGGTACATTGAGCTATACAC 3209
Query 3124 AGCAACTTGCTTTAGCCTTGAAACAGAAGTCCCAGAATGGTCTAACCCCTGGACCAGCTC 3183
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3210 AGCAACTTGCTTTAGCCTTGAAACAGAAGTCCCAGAATGGTCTAACCCCTGGACCAGCTC 3269
Query 3184 CTGGGTTTGAGAATTTTGCTGGGTCTAGAAGCATATCGCGACAATCTGAAAGATCTTATT 3243
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3270 CTGGGTTTGAGAATTTTGCTGGGTCTAGAAGCATATCGCGACAATCTGAAAGATCTTATT 3329
Query 3244 ACGGTGTTCCATCTTCTGGAAATACTGATACTGTTGGCGCAGCAGTAGCCAATGAGAAAA 3303
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3330 ACGGTGTTCCATCTTCTGGCAATACTGATACTGTTGGCGCAGCAGTAGCCAATGAGAAAA 3389
Query 3304 AGTATAGTAGCATGCCAGATATCTCAGGATTGTCTATGTCTGCAAGGAACATGCATTTGC 3363
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 3390 AATATAGTAGCATGCCAGATATCTCAGGATTGTCTATGTCCGCAAGGAACATGCATTTAC 3449
Query 3364 CGAACAACAAGAGCGGATACTGGGATCCGTCAAGTGGAGGAGGAGGGTATGGTGCGTCTT 3423
| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3450 CAAACAACAAGAGTGGATACTGGGATCCGTCAAGTGGAGGAGGAGGGTATGGTGCGTCTT 3509
Query 3424 ATGGTCGGTTAAGCAACGAATCATCGCTATATTCTAATTTGGGGTCACGGGTTGGAGTAC 3483
|||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3510 ATGGTCGGTTAAGCAATGAATCATCGTTATATTCTAATTTGGGGTCACGGGTGGGAGTAC 3569
Query 3484 CCTCGGCTTATGATGACATTTCTCAATCAAGAGGAGGCTACAGAGATGCCTACACTTTGC 3543
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3570 CCTCGACTTATGATGACATTTCTCAATCAAGAGGAGGCTACAGAGATGCCTACAGTTTGC 3629
Query 3544 CACAGAGTGCAACAACAGGGACCGGATCGCTTTGGTCAAGACAGCCCTTTGAGCAGTTTG 3603
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3630 CACAGAGTGCAACAACAGGGACCGGATCGCTTTGGTCCAGACAGCCCTTTGAGCAGTTTG 3689
Query 3604 GTGTAGCGGAGAGGAATGGTGCAGTTGGTGAGGAGCTCAGGAATAGATCGAATCCGATAA 3663
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3690 GTGTAGCGGAGAGGAATGGTGCTGTTGGTGAGGAGCTCAGGAATAGATCGAATCCGATCA 3749
Query 3664 ATATAGACAGCAACGCTTCTTCTAATGTGGATGCAGAGGCTAAGCTTCTTCAGTCGTTCA 3723
||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3750 ATATAGACAACAACGCTTCTTCTAATGTTGATGCAGAGGCTAAGCTTCTTCAGTCGTTCA 3809
Query 3724 GGCACTGTATTCTAAAGCTTATCAAACTGGAAGGATCCGAGTGGTTGTTTGGACAAAGCG 3783
|||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3810 GGCACTGTATTCTAAAGCTTATTAAACTTGAAGGATCCGAGTGGTTGTTTGGACAAAGCG 3869
Query 3784 ATGGAGTCGATGAAGAACTGATTGACCGGGTAGCTGCACGAGAGAAGTTTATCTATGAAG 3843
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3870 ATGGAGTTGATGAAGAACTGATTGACCGGGTAGCTGCACGAGAGAAGTTTATCTATGAAG 3929
Query 3844 CTGAAGCTCGAGAAATAAACCAGGTGGGTCACATGGGGGAGCCACTAATTTCATCGGTTC 3903
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3930 CTGAAGCTCGAGAAATAAACCAGGTGGGTCACATGGGGGAGCCACTAATTTCATCGGTTC 3989
Query 3904 CTAATTGTGGAGATGGTTGCGTTTGGAGAGCTGATCTGATTGTGAGCTTTGGAGTTTGGT 3963
|||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3990 CTAACTGTGGAGATGGTTGCGTTTGGAGAGCTGATTTGATTGTGAGCTTTGGAGTTTGGT 4049
Query 3964 GCATTCACCGTGTCCTTGACTTGTCTCTCATGGAGAGTCGGCCTGAGCTCTGGGGAAAGT 4023
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 4050 GCATTCACCGTGTCCTTGACTTGTCTCTCATGGAGAGTCGGCCTGAGCTTTGGGGAAAGT 4109
Query 4024 ACACCTACGTTCTCAACCGCCTTCAGGGAGTGATTGATCCGGCATTCTCAAAGCTGCGGA 4083
|||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 4110 ACACTTACGTTCTCAACCGCCTACAGGGAGTGATTGATCCGGCGTTCTCAAAGCTGCGGA 4169
Query 4084 CACCGATGACACCGTGTTTTTGCCTTCAGATTCCAGCGAGCCACCAGAGAGCGAGTCCGC 4143
|||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4170 CACCAATGACACCGTGCTTTTGCCTTCAGATTCCAGCGAGCCACCAGAGAGCGAGTCCGA 4229
Query 4144 CTTCAGCTAACGGAATGTTACCTCCGGCTGCAAAACCGGCTAAAGGCAAATGCACAACCG 4203
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4230 CTTCAGCTAACGGAATGTTACCTCCGGCTGCAAAACCGGCTAAAGGCAAATGCACAACCG 4289
Query 4204 CAGTCACACTTCTTGATCTAATCAAAGACGTTGAAATGGCAATCTCTTGTAGAAAAGGCC 4263
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4290 CAGTCACACTTCTTGATCTAATCAAAGACGTTGAAATGGCAATCTCTTGTAGAAAAGGCC 4349
Query 4264 GAACCGGTACAGCTGCAGGAGACGTGGCTTTCCCAAAGGGGAAAGAGAATTTGGCTTCGG 4323
||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4350 GAACCGGTACAGCTGCAGGTGATGTGGCTTTCCCAAAGGGGAAAGAGAATTTGGCTTCGG 4409
Query 4324 TTTTGAAGCGGTATAAACGTCGGTTATCGAATAAACCGGTAAGTATGAATCAGGATGGAC 4383
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||
Sbjct 4410 TTTTGAAGCGGTATAAACGTCGGTTATCGAATAAACCAGTAGGTATGAATCAGGATGGAC 4469
Query 4384 CCGGTTCAAGAAAGAACGTGACTGCGTACGGATCATTGGGTTGAAGAAGAA-AA--T--- 4437
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
Sbjct 4470 CCGGTTCAAGAAAAAACGTGACTGCGTACGGATCATTGGGTTGAAGAAGAAGAACATTGT 4529
Query 4438 -------CTCATGATCAAGGAGACGTCGAGAGGGAAGCCGAAGAATCAAAACTCTTGCTT 4490
||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 4530 GAGAAATCTCATGATCAAAGTGACGTCGAGAGGGAAGCCGAAGAATCAAAACTCTCGCTT 4589
Query 4491 TTGATTGCTCCTCTGCTTCGTTAATTGTGTATTAAGAAAAGAAGaaaaaaaaaGGATTTT 4550
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 4590 TTGATTGCTCCTCTGCTTCGTTAATTGTGTATTAAGAAAAGAAGAAAAAAAATGGATTTT 4649
Query 4551 TGTTGCTTCAGAATTTTTCGCTCttttttttttAATTTGGTTGTAATGTTATGTTTATAT 4610
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4650 TGTTGCTTCAGAATTTTTCGCTCTTTTTTTCTTAATTTGGTTGTAATGTTATGTTTATAT 4709
Query 4611 ACATATATCATCATCATAGGACCATAGGCTACAAACCGAATCCGGTTTGTGTAATTTTAA 4670
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 4710 ACATATATCATCATCATAGGACCATAG-CTACAAACCGAATCCGGTTTGTGTAATTCTA- 4767
Query 4671 TGCGGAATCATAAAGAAATCGTCGGTTTGAATTGTT 4706
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 4768 TGCGGAATCATAAAGAAATCGTCGGTTTGAAATGTT 4803
Score = 315 bits (170), Expect = 3e-84
Identities = 199/213 (93%), Gaps = 1/213 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 74 ttgaagatccgtttctctctctctcACTGAGAATATTGTTCTTAGGTCAACTTGCGATCA 133
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 97 TTGAAGATCCGTTTCTCTCTCTCTCACTGAGACTATTGTTGTTAGGTCAACTTGCGATCA 156
Query 134 TGGCGATTTCAAAGGTCTGAGGCTGATTTCGAATGGTTTGGGGATATCCGAATTAGTTAA 193
|||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||
Sbjct 157 TGGCGATTTCGAAGGTCTGAAGCTGATTTCGAATGGTTTGGAGATATCCGTAGTGGTTAA 216
Query 194 GCATATGGAAGTCTGTGTTCTGCTCTTGGCTGCTCTATTAGGGCTTCCTCCATTTGGACC 253
|||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 217 GCATATGGAAGTCTATGTTCTGCTCTTGGTTGCTCTGTTAGGGCTTCCTCCATTTGGACC 276
Query 254 AACTTAGCTCA-TGTTGTATGGTCTCTCTCCTT 285
||||||||| | ||||||||| |||||||||||
Sbjct 277 AACTTAGCTGAATGTTGTATGATCTCTCTCCTT 309
Score = 207 bits (112), Expect = 6e-52
Identities = 183/214 (86%), Gaps = 18/214 (8%)
Strand=Plus/Plus
Query 281 TCCTTAACTTAGCAT-TGGTTACTAGAGGAAACTTCAGCTATTA---GGTaaaaaaaGAC 336
||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||
Sbjct 337 TCCTTAACTTAACATCTGGTTACTAGAGGAAACTTCAGCTATTATTAGGTAAAGAAAGAC 396
Query 337 TGTACAGAGCTGTAAAACAAG-ACAGTGTTAGAGTGGCTTTATTTGCCTCAGTGTTATTT 395
||||||||| |||| |||||| | || |||||||||||||| |||||||| ||| ||
Sbjct 397 TGTACAGAGTTGTATAACAAGTA-AGCGTTAGAGTGGCTTTGTTTGCCTCGGTG--AT-- 451
Query 396 TGACAGAAGAACCGACTGATTCGCTACTGTGTGTGA-CTTTGGAGGGAATCAAATTTAC- 453
| |||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||| |||| |
Sbjct 452 --A--GAAGAACCGACTGATTCGTTGTTGTGTGTTAGCTTTGGAGGGAATCAGATTT-CG 506
Query 454 CAAGGGAAAGGTGTTTTAGATCAAATCTGTGAAT 487
| |||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 507 CGAGGGAA-GGTGTTTTAGATCAAATCTGTGAAT 539
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 234731126297
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5