BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg487193
Length=5231
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G04140.2 | Symbols: GLU1, GLS1, GLUS, FD-GOGAT | glutamate s... 4420 0.0
> AT5G04140.2 | Symbols: GLU1, GLS1, GLUS, FD-GOGAT | glutamate
synthase 1 | chr5:1130031-1138438 FORWARD LENGTH=5199
Length=5199
Score = 4420 bits (2393), Expect = 0.0
Identities = 2657/2784 (95%), Gaps = 19/2784 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 2438 CAA-TGCTGTATGCCCATACTTGGCACTGGAGACATGTAGGCAATGGCGCTTAAGTAACA 2496
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2390 CAAGTGCTGTATGCCCATACTTGGCACTGGAGACATGTAGGCAATGGCGCTTAAGTAACA 2449
Query 2497 AAACTGTCGCATTCATGCGTAACGGGAAAATTCCCACTGTAACCATTGAGCAGGCTCAGA 2556
||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2450 AAACTGTGGCCTTCATGCGTAACGGGAAAATTCCTACTGTAACCATTGAGCAAGCTCAGA 2509
Query 2557 AGAATTATACCAAGGCGGTTAATGCAGGGCTTCTTAAAATTCTTTCTAAGATGGGCATCT 2616
|||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2510 AGAACTACACTAAGGCGGTTAATGCAGGGCTTCTTAAAATTCTTTCTAAGATGGGAATCT 2569
Query 2617 CATTGCTTTCAAGTTATTGTGGTGCTCAGATATTTGAGATATATGGTTTGGGGA-AAGAG 2675
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||
Sbjct 2570 CATTGCTTTCAAGTTATTGTGGTGCTCAGATATTTGAGATATATGGTTT-GGGACAGGAT 2628
Query 2676 GTTGTTGATCTTGCATTCACTGGAAGTGTGTCAAAAATCAGTGGACTCACCTTTGATGAG 2735
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2629 GTTGTTGATCTTGCATTCACTGGAAGTGTGTCAAAAATCAGTGGACTCACCTTTGATGAG 2688
Query 2736 TTGGCAAGAGAGACATTGTCTTTCTGGGTGAAGGCCTTTTCTGAGGATACAACTAAACGA 2795
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2689 TTGGCAAGAGAGACATTGTCTTTCTGGGTGAAGGCCTTTTCTGAGGATACAACTAAGCGA 2748
Query 2796 TTAGAAAATTTCGGGTTTATTCAATTTAGGCCTGGAGGTGAGTATCATTCAAACAACCCA 2855
||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2749 TTAGAAAATTTTGGGTTTATTCAATTCAGGCCTGGAGGTGAGTATCATTCAAACAACCCA 2808
Query 2856 GAGATGTCAAAGTTGCTCCACAAGGCTGTCCGTGAAAAGAGTGAAACTGCATATGCAGTC 2915
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2809 GAGATGTCAAAGTTGCTTCACAAGGCTGTCCGTGAAAAGAGTGAAACTGCATATGCAGTC 2868
Query 2916 TATCAACAACATCTCTCTAACAGACCTGTTAATGTCCTCCGTGATCTCCTTGAATTCAAG 2975
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||
Sbjct 2869 TATCAACAGCATCTCTCTAACAGACCTGTTAATGTCCTCCGTGACCTGCTTGAGTTCAAG 2928
Query 2976 AGTGACCGTGCACCGATCCCAGTAGGGAAAGTTGAACCAGCCGTTTCTATTGTCCAGAGA 3035
||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||
Sbjct 2929 AGTGATCGTGCACCGATCCCAGTAGGGAAAGTAGAACCGGCCGTTGCTATTGTTCAGAGA 2988
Query 3036 TTTTGTACTGGTGGAATGTCACTTGGTGCTATTTCAAGAGAAACTCATGAAGCAATTGCT 3095
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||
Sbjct 2989 TTTTGTACTGGTGGAATGTCACTTGGTGCTATTTCAAGAGAGACTCATGAAGCTATTGCT 3048
Query 3096 ATTGCTATGAATAGGATTGGTGGTAAATCAAACTCTGGAGAAGGTGGAGAGGATCCTATC 3155
||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3049 ATTGCAATGAATAGGATTGGTGGGAAATCAAACTCTGGAGAAGGTGGAGAGGATCCTATC 3108
Query 3156 CGTTGGAAGCCACTTACAGATGTGGTTGATGGATATTCATCAACATTACCACATCTCAAA 3215
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 3109 CGTTGGAAGCCACTTACAGATGTGGTTGATGGATATTCACCAACACTACCACATCTCAAA 3168
Query 3216 GGACTTCAAAACGGCGATATCGCAACAAGTGCTATCAAGCAGGTTGCTTCAGGACGTTTT 3275
|| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3169 GGTCTTCAAAACGGCGATATTGCAACAAGTGCTATCAAGCAGGTTGCTTCAGGGCGTTTT 3228
Query 3276 GGAGTCACACCAACATTCTTGGTGAATGCAGACCAATTGGAAATCAAAGTTGCACAAGGT 3335
|||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3229 GGAGTCACACCAACGTTCTTGGTCAATGCAGATCAATTGGAAATCAAAGTTGCACAAGGT 3288
Query 3336 GCCAAGCCTGGGGAAGGTGGTCAGCTTCCTGGAAAGAAAGTTAGTGCATATATCGCAAGG 3395
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 3289 GCCAAGCCTGGGGAAGGTGGTCAGCTTCCTGGAAAGAAAGTTAGTGCGTATATCGCTAGG 3348
Query 3396 CTAAGAAGCTCTAAACCTGGTGTTCCGCTTATATCTCCGCCTCCTCACCACGACATTTAC 3455
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3349 CTAAGAAGCTCTAAACCTGGTGTTCCGCTTATATCTCCGCCTCCTCACCACGACATTTAC 3408
Query 3456 TCTATTGAGGATCTTGCTCAGTTGATCTTTGATCTACATCAGATTAATCCGAATGCAAAA 3515
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3409 TCTATTGAGGATCTTGCTCAGTTGATCTTTGATCTACATCAGATTAATCCAAATGCAAAA 3468
Query 3516 GTATCAGTCAAGCTGGTCGCAGAAGCTGGAATCGGAACAGTTGCTTCTGGAGTTGCAAAG 3575
|||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct 3469 GTATCAGTCAAGCTAGTTGCAGAAGCTGGAATCGGAACTGTTGCTTCAGGAGTTGCAAAG 3528
Query 3576 GGTAACGCTGATATCATTCAGATATCAGGGCATGATGGTGGAACTGGTGCTAGTCCAATA 3635
||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||
Sbjct 3529 GGTAACGCTGATATCATCCAGATATCAGGCCATGATGGTGGAACCGGGGCTAGTCCAATA 3588
Query 3636 AGCTCCATAAAACATGCTGGTGGACCATGGGAGCTTGGACTAACAGAAACTCACCAAACT 3695
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3589 AGCTCCATAAAACATGCTGGTGGACCATGGGAACTTGGACTAACAGAAACTCACCAAACA 3648
Query 3696 CTTATCGAAAATGGACTCAGAGAACGAGTCATTTTAAGAGTCGATGGAGGCTTAAAGAGT 3755
||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3649 CTTATCGCAAATGGACTAAGAGAAAGAGTCATTTTAAGAGTCGATGGAGGCTTAAAGAGT 3708
Query 3756 GGTGTTGATGTTCTAATGGCTGCAGCTATGGGTGCTGATGAATACGGATTTGGTTCCTTG 3815
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3709 GGTGTTGATGTTCTAATGGCTGCAGCTATGGGTGCTGATGAATACGGATTCGGTTCCTTG 3768
Query 3816 GCAATGATTGCTACTGGTTGTGTTATGGCTCGTATTTGCCACACTAATAACTGCCCAGTG 3875
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3769 GCAATGATTGCTACTGGTTGTGTTATGGCTCGTATTTGCCACACTAATAATTGCCCAGTG 3828
Query 3876 GGTGTAGCAAGTCAGAGAGAAGAATTACGTGCAAGATTCCCCGGTGTGCCTGGTGATCTT 3935
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||
Sbjct 3829 GGTGTAGCAAGTCAGAGAGAAGAATTACGTGCAAGATTCCCTGGTGTACCTGGTGATCTT 3888
Query 3936 GTCAATTACTTCTTATACGTAGCAGAAGAGGTGAGAGGTATCTTAGCACAGTTGGGATAC 3995
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3889 GTCAACTACTTCTTATACGTAGCAGAAGAGGTGAGAGGTATCTTAGCACAGTTGGGATAC 3948
Query 3996 AGCAAG-TTAGATGACATCATTGGACGAACAGAGTTACTGAAACCACGAGACATTTCGTT 4054
| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
Sbjct 3949 AAC-AGTTTAGATGACATCATTGGACGAACAGAGTTACTGAGACCACGAGACATTTCGCT 4007
Query 4055 AGTGAAAACTCAGCATCTCGATCTGAGTTATCTTCTTTCGTCTGTTGGAACACCTTCATT 4114
||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4008 AGTTAAAACTCAACATCTCGATCTGAGTTATCTTCTTTCGTCTGTTGGAACACCTTCATT 4067
Query 4115 GAGCAGTACTGAAATCAGAAAGCAGGAAGTTCATACAAATGGACCTGTTCTCGACGACGA 4174
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4068 GAGCAGTACTGAAATCAGAAAGCAGGAAGTTCATACAAATGGACCTGTTCTCGACGACGA 4127
Query 4175 TATTCTTGCAGATCCATTGGTGATTGATGCAATAGAGAACGAAAAGGTGGTCGATAAAAC 4234
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||
Sbjct 4128 TATTCTTGCAGATCCATTGGTGATTGATGCAATAGAGAACGAAAAAGTGGTTGAGAAAAC 4187
Query 4235 CGTCAAAATATGCAACGTAGACCGTGCGGTCT-GTGGTCGCGTTGCTGGTGTTATCGCAA 4293
||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||
Sbjct 4188 CGTCAAAATATGCAACGTAGACCGTGCGG-CTTGTGGTCGTGTTGCTGGTGTTATTGCAA 4246
Query 4294 AGAAGTATGGAGACACTGGTTTTGCTGGACAAGTGAATCTAACTTTCCTT-GGGAGCGCG 4352
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||
Sbjct 4247 AGAAGTATGGAGACACTGGTTTTGCAGGACAAGTGAACCTAACTTTC-TTAGGGAGCGCG 4305
Query 4353 GGACAGTCTTTTGGGTGCTTTTTGATTCCCGGTATGAACATCCGGCTAATAGGAGAGTCA 4412
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 4306 GGACAGTCGTTTGGGTGCTTTTTGATTCCCGGTATGAACATCCGGCTCATAGGAGAGTCA 4365
Query 4413 AATGACTACGTTGGAAAGGGAATGGCTGGTGGGGAAATAGTAGTAACTCCTGTGGACACA 4472
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |
Sbjct 4366 AATGACTACGTTGGAAAGGGAATGGCTGGTGGTGAAATAGTAGTAACTCCTGTGGAAAAA 4425
Query 4473 ATCGGGTTTGTGCCCGAGGAAGCAACGATAGTCGGGAACACTTGCTTGTATGGTGCCACA 4532
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 4426 ATCGGGTTTGTGCCTGAGGAAGCAACGATAGTCGGGAACACTTGCTTGTATGGTGCAACA 4485
Query 4533 GGCGGTCAGATATTTGCTAGAGGCAAAGCTGGAGAGAGATTTGCAGTGAGAAACTCACTA 4592
|| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4486 GGTGGTCAGATATTCGCTAGAGGCAAAGCTGGAGAGAGATTTGCAGTGAGAAACTCACTC 4545
Query 4593 GCTGAAGCGGTAGTTGAAGGCACTGGAGACCATTGCTGTGAGTACATGACTGGTGGTTGT 4652
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 4546 GCTGAAGCAGTAGTTGAAGGCACTGGAGACCATTGCTGTGAGTACATGACTGGTGGCTGT 4605
Query 4653 GTCGTCGTGCTTGGAAAGGTGGGAAGGAACGTTGCTGCGGGTATGACTGGAGGCTTAGCT 4712
|| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||
Sbjct 4606 GTAGTCGTGCTTGGAAAGGTGGGAAGAAACGTTGCTGCTGGTATGACAGGAGGGTTAGCT 4665
Query 4713 TACCTTCTTGATGAAGACGACACTCTTCTCCCTAAGATTAACAGAGAGATAGTGAAGATG 4772
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4666 TACCTTCTTGATGAAGACGACACTCTTCTTCCTAAGATTAACAGAGAGATAGTGAAGATC 4725
Query 4773 CAAAGAGTAGCTGCGCCTGCAGGGGAATTGCAGCTGAAGAGCTTAATTGAAGCACATGTC 4832
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4726 CAAAGAGTAACTGCGCCTGCAGGGGAATTGCAGCTGAAGAGCTTAATTGAAGCACATGTG 4785
Query 4833 GAAAAAACCGGAAGCAGCAAAGGCGCAACGATTCTGAATGAATGGGACAAGTATCTACCA 4892
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||
Sbjct 4786 GAAAAAACCGGAAGCAGCAAAGGCGCAACGATTCTGAATGAGTGGGAAAAGTATCTACCT 4845
Query 4893 CTCTTCTGGCAACTGGTTCCACCGAGTGAAGAAGACACTCCTGAAGCTTCAGCTGCTTAT 4952
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 4846 CTCTTCTGGCAACTGGTTCCACCGAGTGAGGAAGACACTCCTGAAGCTTCTGCTGCTTAC 4905
Query 4953 GTAAGAACAGCCACCGGCGAAGTCACATTTCAATCGGCATAAAGATCATTCAAGAGAAGG 5012
||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||
Sbjct 4906 GTAAGAACATCCACCGGGGAAGTCACATTTCAATCGGCTTAGAGATCATTCAAGAGCAGG 4965
Query 5013 TTGTTGCAGTTGAAACACAAGGATTGATATACATACA-TCAATGGTGGACTATGGAG-G- 5069
|||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||| |
Sbjct 4966 TTGTGGCAGTTGAAACACAAGGATTGATATACAT-CAATGG-TGGAGGACTATGGAGAGC 5023
Query 5070 ACA--AATAGAAAATCATTATCATTT-CAT--AGATCAAATGTGTGAGACAATATTCTTA 5124
| | ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 5024 AGATTAATGGAAAATCATTATCATTCACATGTAGATCAAATGTGTGGGACAATATTCTTA 5083
Query 5125 TTGTCTTGTGATCTTTACAACAATACCATGGTTGCTATAACTGTACAGTAAATTCAGTAA 5184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5084 TTGTCTTGTGATCTTTACAACAATACCATGGTTGCTATAACTGTACAGTAAATTCAGTAA 5143
Query 5185 AATAACTGCTTTCAACTGTCATAA 5208
||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5144 AATAACTGCTTTCAACTGTCATAA 5167
Score = 3249 bits (1759), Expect = 0.0
Identities = 1891/1956 (97%), Gaps = 4/1956 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 444 CAGGTTGCTAATTTGGAGGATATATTGTCTGAAAGAGGAGCTTGTGGAGTTGGGTTTATA 503
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 352 CAGGTTGCTAATTTGGAGGATATATTGTCTGAAAGAGGAGCTTGTGGAGTTGGGTTTATA 411
Query 504 GCAAACTTAGATAACATACCTTCACATGGAGTTGTCAAAGATGCTCTTATTGCTCTTGGT 563
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 412 GCAAACTTAGATAACATACCTTCACATGGAGTTGTCAAAGATGCTCTTATTGCTCTTGGG 471
Query 564 TGTATGGAACATCGTGGAGGTTGTGGAGCTGACAATGATTCTGGTGATGGCTCTGGTCTT 623
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 472 TGTATGGAACATCGTGGAGGTTGTGGAGCAGACAATGATTCTGGTGATGGCTCTGGTCTT 531
Query 624 ATGTCTTCCATTCCTTGGGATTTCTTTAACGTCTGGGCCAAGGAACAAGGTCTTTCTCCT 683
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 532 ATGTCTTCCATTCCTTGGGATTTCTTTAACGTCTGGGCCAAGGAACAAAGTCTTGCTCCT 591
Query 684 TTTGATAAGTTGCATACTGGTGTTGGCATGATCTTTCTTCCACAAGAGGATACCTTTATG 743
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 592 TTTGATAAGTTGCATACTGGTGTTGGCATGATCTTTCTTCCACAAGATGATACCTTTATG 651
Query 744 CAAGAAGCCAAACAAGTTATTGAAAACATATTTGAGAAAGAAGGATTACAAGTTCTTGGG 803
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 652 CAAGAAGCCAAGCAAGTTATTGAAAACATATTTGAGAAAGAAGGATTACAAGTTCTTGGG 711
Query 804 TGGAGGGAAGTTCCTGTGAATGTTCCTATAGTTGGTCAAAATGCTAGGGAAACAATGCCT 863
||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||
Sbjct 712 TGGAGGGAAGTTCCTGTTAATGTTCCTATAGTTGGTAAAAATGCTAGGGAGACAATGCCT 771
Query 864 AACATTCAACAAGTGTTTGTCAAAATCGCAAAGGAAGATAGTACGGATGATATTGAAAGG 923
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 772 AACATTCAACAAGTGTTTGTGAAAATCGCAAAGGAAGATAGTACTGATGATATTGAAAGG 831
Query 924 GAACTTTACATATGCCGGAAACTAATCGAAAGGGCGGTGGCTACTGAGAGTTGGGGAACA 983
||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||
Sbjct 832 GAACTTTACATCTGCCGGAAACTAATCGAAAGGGCCGTAGCTACTGAGAGTTGGGGAACA 891
Query 984 GAGCTATACTTCTGTTCACTGTCCAATCAAACCATAGTGTACAAGGGCATGCTTCGGTCC 1043
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 892 GAGCTTTACTTCTGTTCACTGTCCAATCAAACCATAGTGTACAAGGGCATGCTTCGATCT 951
Query 1044 GAAGCTCTTGGATTGTTTTATCTAGATCTTCAGAATGAGCTTTATGAGTCTCCTTTTGCT 1103
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 952 GAAGCTCTTGGATTGTTTTATCTAGATCTTCAGAATGAGCTTTATGAGTCTCCTTTTGCT 1011
Query 1104 ATTTATCATCGAAGGTACAGTACAAACACTAGTCCTAGGTGGCCTCTTGCTCAACCAATG 1163
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1012 ATTTATCATCGAAGGTACAGTACAAACACTAGTCCTAGGTGGCCTCTTGCTCAACCAATG 1071
Query 1164 AGGTTTCTTGGACATAACGGAGAGATCAATACCATACAGGGGAACTTAAATTGGATGCAG 1223
|||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1072 AGGTTTCTTGGACATAACGGGGAGATCAATACCATTCAGGGGAACTTAAATTGGATGCAG 1131
Query 1224 TCTCGAGAAGCTTCTTTGAAGTCCT-CTGTTTGGAATGGCCGTGAAAATGAAATCCGTCC 1282
|||||||||||||| |||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1132 TCTCGAGAAGCTTCATTGAAGGC-TGCTGTTTGGAATGGCCGTGAAAATGAAATTCGTCC 1190
Query 1283 GTTTGGTAATCCCAGGGGTTCAGACTCTGCTAATCTTGATAGTGCTGCAGAAATCTTGAT 1342
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1191 ATTTGGTAATCCCAGGGGTTCAGACTCTGCTAATCTTGATAGTGCTGCAGAAATCATGAT 1250
Query 1343 TAGAAGTGGCCGTACTCCAGAGGAAGCTCTAATGATTCTTGTCCCTGAGGCATACAAAAA 1402
||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1251 TAGAAGTGGAAGAACACCAGAGGAAGCTCTAATGATTCTTGTCCCTGAGGCATACAAGAA 1310
Query 1403 TCATCCAACCTTATCTGTCAAATATCCTGAGGTTATAGATTTCTATGACTACTACAAAGG 1462
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1311 TCATCCAACCTTATCTGTCAAATATCCTGAGGTTGTAGATTTCTATGACTACTACAAAGG 1370
Query 1463 ACAAATGGAGGCTTGGGATGGTCCTGCCTTACTTTTGTTCAGTGATGGAAAAACAGTTGG 1522
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1371 ACAAATGGAGGCTTGGGATGGTCCTGCCTTACTTTTGTTCAGTGATGGAAAAACAGTTGG 1430
Query 1523 GGCTTGTCTTGACCGTAACGGCCTTCGTCCTGCTCGATATTGGCGGACTAGTGACAATGT 1582
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1431 GGCTTGTCTTGACCGTAATGGCCTTCGTCCTGCTCGATATTGGCGGACTAGTGACAATTT 1490
Query 1583 CGTCTATGTAGCATCTGAGGTCGGAGTTGTACCAGTTGATGAAGCGAAAGTCACAATGAA 1642
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||
Sbjct 1491 CGTCTATGTTGCATCTGAGGTCGGAGTTGTACCAGTTGATGAGGCAAAAGTCACAATGAA 1550
Query 1643 AGGCCGTCTAGGACCTGGAATGATGATTGCTGTTGACCTAGTGAATGGCCAGGTATATGA 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1551 AGGCCGTCTAGGACCTGGAATGATGATTGCTGTTGACCTTGTGAATGGCCAGGTATATGA 1610
Query 1703 GAACACAGAGGTCAAGAAGAGGATATCTTCATTTAATCCATATGGAAAATGGATTAAAGA 1762
||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1611 GAATACAGAGGTCAAGAAGAGAATATCTTCATTTAATCCATATGGAAAATGGATTAAAGA 1670
Query 1763 AAACCCCCGGTTCTTGAAGCCTGTGAATTTCAAATCCTCAACTGTCATGGAAAATGAAGA 1822
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1671 AAACTCCCGGTTCTTGAAGCCTGTGAATTTCAAATCCTCAACTGTCATGGAAAATGAAGA 1730
Query 1823 AATCTTAAGAAGCCAACAGGCATTTGGTTATTCAAGTGAGGATGTGCAAATGGTTATTGA 1882
|||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1731 AATCCTAAGAAGCCAACAAGCATTTGGTTATTCAAGTGAGGATGTGCAAATGGTTATTGA 1790
Query 1883 GTCTATGGCTTCTCAAGGAAAGGAACCAACCTTCTGCATGGGCGATGATATTCCGCTGGC 1942
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1791 GTCTATGGCTTCTCAAGGAAAGGAACCAACCTTCTGCATGGGCGACGATATTCCGCTGGC 1850
Query 1943 AGGATTGTCTCAAAGACCACACATGCTTTACGATTATTTCAAACAAAGATTTGCGCAGGT 2002
|||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1851 AGGATTGTCTCAAAGACCGCATATGCTTTATGATTATTTCAAACAAAGATTTGCACAGGT 1910
Query 2003 TACAAACCCTGCCATTGATCCCCTTAGGGAAGGTTTGGTTATGTCTCTTGAAGTAAATAT 2062
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1911 TACAAACCCTGCCATTGACCCCCTTAGGGAAGGTTTGGTTATGTCTCTTGAAGTAAATAT 1970
Query 2063 TGGAAAACGTGGAAATATATTGGAGCTTGGACCTGAGAATGCCTCACAGGTTATCCTGTC 2122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||
Sbjct 1971 TGGAAAACGTGGAAATATATTGGAGCTTGGACCTGAGAATGCCTCGCAGGTTATTCTGTC 2030
Query 2123 TAACCCTGTGTTAAACGAAGGAGCGTTGGAGGAGTTAAAGAAGGATACA-TACTTAAAAC 2181
||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||
Sbjct 2031 TAACCCTGTGTTAAATGAAGGAGCGTTAGAGGAGTTAATGAAGGAT-CAATACTTAAAAC 2089
Query 2182 CCAAGGTTCTGTCCACATATTTCGATATACGAAAAGGAGTTGAAGGTTCCTTGCAAAAGG 2241
| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2090 CAAAGGTTCTGTCCACATATTTCGATATAAGAAAAGGCGTTGAAGGTTCCTTGCAAAAGG 2149
Query 2242 CTCTATATTATCTTTGTGAAGCAGCTGATGATGCTGTCCGAAGTGGCTCTCAGCTTCTCG 2301
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2150 CTCTATATTATCTTTGTGAAGCAGCTGATGATGCTGTCCGAAGTGGCTCTCAGCTTCTCG 2209
Query 2302 TTCTTTCAGACCGATCCGAAAGCCTGGAACCGACCAGGCCTGCAATTCCGATAATGTTAG 2361
||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||
Sbjct 2210 TTCTTTCAGACCGATCCGATAGACTGGAACCAACCAGGCCTTCAATTCCAATAATGTTAG 2269
Query 2362 CTGTTGGCGCTGTACATCAACATCTTATTCAGAACG 2397
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2270 CTGTTGGCGCTGTCCATCAACATCTTATTCAGAACG 2305
Score = 396 bits (214), Expect = 1e-108
Identities = 260/281 (93%), Gaps = 7/281 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 174 ATGGCGATGAAATCTCTTTCCCCTGTTCCTAAGCTTCTCTCCACAACACCAAGCTCTGTT 233
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGATGCAATCTCTTTCCCCTGTTCCTAAGCTTCTCTCCACAACACCAAGCTCTGTT 60
Query 234 CTTTCTTCTGACAAGAACTTCTTCTTCGTCGATTTCGTTGGATTATACTGTAAGTCCAAG 293
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 CTTTCTTCTGACAAGAACTTCTTCTTCGTCGATTTCGTTGGATTATACTGTAAGTCCAAG 120
Query 294 AGAACCAGACGCAGACTTCGTGGCGAttcttcctcaggctct---tcttcttcttctctc 350
|| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||
Sbjct 121 AGGACCAGACGCAGACTTCGTGGAGACTCTTCCTCTTCCTCACGCTCTTCTTCTTCTCTC 180
Query 351 tctcgtctttcctctGTTCGTGCTGTTATCGACCTTGAACGTGTTAATGGCTTCTCTCAC 410
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |
Sbjct 181 TCTCGTCTTTCCTCTGTTCGTGCCGTTATCGACCTTGAACGTGTTCATGGCGTCTCTGA- 239
Query 411 AAAG-ATCTCTCTTCTCCTTCA-CTTTTAAAACCTCAGGTT 449
|||| ||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||
Sbjct 240 AAAGGATCTCTCCTCTCCTTCAGCTTT-AAGACCTCAGGTT 279
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 261068771372
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5