BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg487204
Length=4249
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G04240.1 | Symbols: ELF6 | Zinc finger (C2H2 type) family pr... 6691 0.0
> AT5G04240.1 | Symbols: ELF6 | Zinc finger (C2H2 type) family
protein / transcription factor jumonji (jmj) family protein
| chr5:1169544-1174878 FORWARD LENGTH=4263
Length=4263
Score = 6691 bits (3623), Expect = 0.0
Identities = 4064/4275 (95%), Gaps = 38/4275 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGGTAATGTTGAAATTCCGAATTGGCTTAAAGCTTTGCCATTGGCACCTGTGTTTAGA 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGGTAATGTTGAAATTCCGAATTGGCTTAAAGCTTTGCCATTGGCACCTGTGTTTAGA 60
Query 61 CCTACAGACACTGAATTTGCAGATCCCATTGCGTATATATCGAAAATCGAGAAGGAAGCT 120
|||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||
Sbjct 61 CCTACAGACACTGAATTTGCAGATCCCATTGCTTACATATCGAAAATCGAAAAGGAAGCT 120
Query 121 AGTGCTTTTGGGATTTGCAAGATCATTCCTCCTTTACCCAAGCCATCCAAAAAGTATGTT 180
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 121 AGTGCCTTTGGGATTTGCAAGATCATTCCTCCTTTACCCAAGCCATCGAAAAAGTATGTT 180
Query 181 TTCTATAACTTGAACAAGTCTCTTTTGAAGTGTCCGGAGTTGGTTTCGGATGTTGACATT 240
||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||
Sbjct 181 TTCTACAACTTGAACAAGTCTCTTTTGAAGTGTCCCGAATTGGTTTCAGATGTTGACATT 240
Query 241 TCCAAGGTGTGTAAAGAGGACAGAGCTGTATTCACCACTAGGCAGCAAGAGTTAGGCCAG 300
|| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 TCGAAGGTGTGTAAAGAGGATAGAGCTGTATTCACCACTAGGCAGCAAGAGTTAGGCCAA 300
Query 301 ACTGTG-aaaaaaaCGAAAGGAGAGAAGAGTAAGAGTAATTCTCAAAGGAGTGGTGTTAA 359
|||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 ACTGTGAAAAAAAAC-AAAGGAGAGAAGGGTAAGAGTAATTCTCAAAGGAGTGGTGTTAA 359
Query 360 GCAGGTTTGGCAAAGTGGAGGCGTATATACATTGGAGCAGTTTGAAACTAAGTCGAGAA- 418
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||
Sbjct 360 GCAGGTTTGGCAAAGTGGAGGCGTTTATACATTGGATCAGTTTGAAGCTAAGTCGA-AAG 418
Query 419 CTTTCTACAAAAGCCAATTAGGGACGATTAAAGAAGTGTCACCAGTTGCCATTGAGGCAT 478
|||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||| || ||||||||| |||||||||||
Sbjct 419 CTTTCTACAAAACCCAATTAGGAACGGTTAAGGAACTGGCACCAGTTGTCATTGAGGCAT 478
Query 479 TGTTCTGGAAAACGGCTTCAGATAAGCCTATATACATAGAGTATGCTAATGATGTGCCTG 538
||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 479 TGTTCTGGAAAGCGGCTTTAGAGAAGCCTATATATATAGAGTATGCTAATGACGTGCCTG 538
Query 539 GCTCTGCTTTCGGTGAGCCAGATGG-TCATTTCAGGCATTTCCGGCAGAGGAAGAGGAGG 597
|||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 539 GCTCTGCTTTCGGTGAGCCAGA-GGATCATTTCAGGCATTTCCGGCAGAGGAAGAGGAGG 597
Query 598 GGCAGGGGATTTTATCAGAGGAAGACAG-AAATCAATGACCCATCAGGTAAGAGCGGTGA 656
|||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||
Sbjct 598 GGCAGGGGATTTTATCAGAGGAAGACAGAAAAT-AATGATCCATCAGGTAAGAACGGTGA 656
Query 657 AAACTCATCCCCTGAGGTAGAAAAGGCACCCCTTGCTTCTACAAGTTTATCATCTCAGGA 716
||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 657 AAAGTCATCGCCTGAGGTAGAAAAGGCACCCCTTGCTTCTACAAGTTTATCATCTCAGGA 716
Query 717 TTCGTCCAAGCAGAAGAACGTGGATATTGTTGATGAAATGGAAGGCACTGCAGGCTGGAA 776
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 717 TTCGTCCAAGCAGAAGAACATGGATATTGTTGATGAAATGGAAGGTACTGCAGGCTGGAA 776
Query 777 GCTCTCCAACAGTTCGTGGAACCTTCAGACGATTGCACGTTCACCTGGTTCTGTTACACG 836
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 777 GCTCTCCAACAGTTCGTGGAACCTTCAGATGATTGCACGTTCACCTGGTTCTGTTACACG 836
Query 837 TTTCATGCCAGATGACATCCCTGGTGTCACATCTCCCATGGTTTATATCGGTATGTTGTT 896
|||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 837 TTTCATGCCAGATGACATTCCTGGTGTTACATCTCCCATGGTTTATATCGGTATGTTGTT 896
Query 897 CAGCTGGTTTGCCTGGCACGTTGAGGATCATGAGCTTCACAGTATGAATTATCTTCACAC 956
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 897 CAGTTGGTTTGCCTGGCACGTTGAGGATCATGAGCTTCACAGTATGAATTATCTTCACAC 956
Query 957 TGGCTCACCAAAGACTTGGTACGCTGTCCCTTGTGATTATGCGCTTGACTTTGAAGAGAT 1016
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 957 TGGCTCACCAAAGACTTGGTACGCTGTCCCTTGTGATTATGCGCTTGACTTTGAAGAGGT 1016
Query 1017 TATCCGCAAAAATTCTTGTGGCAGAAACATTGACCAATTGGCTGCTCTCACCCAACTAGG 1076
||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1017 TATCCGCAAAAATTCTTATGGCAGGAACATTGACCAACTGGCTGCTCTCACCCAACTAGG 1076
Query 1077 CGAAAAGACAACTCTTGTATCACCTGAGATGATAGTTGCATCTGGCATTCCCTGCTGTAG 1136
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1077 CGAAAAGACAACTCTTGTATCACCTGAGATGATAGTTGCATCTGGCATTCCCTGCTGTAG 1136
Query 1137 GTTGGTACAAAATCCTGGTGAATTTGTTGTGACTTTTCCGAGGTCTTATCATGTAGGATT 1196
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1137 GTTGGTACAAAATCCTGGTGAATTTGTTGTGACTTTTCCGAGGTCTTATCATGTAGGATT 1196
Query 1197 CAGCCACGGTTTTAACTGTGGGGAAGCCGCTAATTTTGGAACCCCACAGTGGCTCAACGT 1256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1197 CAGCCACGGTTTTAACTGTGGGGAAGCCGCTAATTTTGGAACCCCACAGTGGCTCAACGT 1256
Query 1257 AGCTAAGGAAGCTGCTGTGCGTCGGGCAGCCATGAATTATCTACCCATGCTGTCCCATCA 1316
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1257 AGCAAAGGAAGCTGCTGTGCGTCGGGCAGCCATGAATTATCTACCCATGCTGTCCCATCA 1316
Query 1317 GCAGCTGCTATATCTCTTGACCATGTCATTTGTTTCAAGAGTGCCACGATCATTGCTACC 1376
||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1317 GCAGCTGCTATATCTCTTGACTATGTCCTTTGTTTCAAGAGTGCCACGATCATTGCTACC 1376
Query 1377 AGGTGGTCGTAGCTCCCGACTGAGAGATCGGCAGAGAGAAGAAAGAGAGTTCCTTGTGAA 1436
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1377 AGGTGGTCGTAGCTCCCGACTAAGAGATCGGCAGAGAGAAGAAAGAGAGTTCCTTGTGAA 1436
Query 1437 AAGAGCTTTTGTAGAAGATATATTGAACGAAAACAAGAATTTATCTGTTCTTCTTCGAGA 1496
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1437 AAGAGCTTTTGTAGAAGATATATTGAACGAAAACAAGAATTTATCTGTTCTTCTTCGAGA 1496
Query 1497 ACCAGGCTCTCGTTTGGTGATGTGGGACCCTGATTTACTTCCGCGTCATAACGCAGTGGC 1556
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||
Sbjct 1497 ACCAGGCTCTCGTTTGGTGATGTGGGACCCTGATTTACTTCCGCGTCATAGCGCACTGGC 1556
Query 1557 TCTTGCAGCTGC------TGC---TGCTTCTGCTGTTTCACCTCCAGCAGTGGCAACAAA 1607
|||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1557 TCTTGCAGCTGCTGGAGTTGCTGGTGCTTCTGCTGTTTCACCTCCAGCAGTGGCAAAAAA 1616
Query 1608 TGAACTTGAGGAGGGTCATTCTGAATTGCAGAATAAAGAGAAGACGACTCTTTTAGAGGA 1667
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||
Sbjct 1617 AGAACTTGAGGAGGGTCATTCTGAATTGCAGAATAAAGAAAAGACTTCTCTTTTAGAGGA 1676
Query 1668 ATTGAGCTTGTTCATGGAGAAGCTGAATGATGTATACTACGACGATGATGATGGTCTGCT 1727
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1677 ATTGAGCTTGTTCATGGAGAAGCTGAATGATGTATACTACGACGATGATGATGGTCTGCT 1736
Query 1728 TAACGATTTCCAAGTTGATTCTGGAACCTTGCCATGTGTGGCGTGTGGCGTTCTTGGCTT 1787
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1737 TAACGATTTCCAAGTTGATACTGGAACCTTGCCATGTGTGGCTTGTGGCGTTCTTGGCTT 1796
Query 1788 CCCCTTTATGTCTGTGGTCCAGCCTTCAGAAAAAGCATTAAAAGATCTCCCAGAGAGACA 1847
|||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1797 CCCCTTTATGTCTGTGGTACAGCCTTCTGAAAAAGCATTAAAAGATCTCTCAGAGAGACA 1856
Query 1848 AGGAGATACAGATGCTCAGGAAATTACGACACTGTCATCAGAAAAGTCTGACTGCGAATG 1907
|||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1857 AGGAGAGACAGATGCTCAGGAAATTATGACACTGTCATCAGAAAAGTCTGACTGCGAATG 1916
Query 1908 GAAAACGTCTTCTAGATATATAAGACCTCACATTTTCTGCCTTGAACACACTATTGAACT 1967
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1917 GAAAACGTCTTCTAGATATATAAGACCTCGCATTTTCTGCCTCGAACACACTATTGAACT 1976
Query 1968 TCAGAGACTGCTGCAACCCAGAGGTGGACTGAAGTTCCTTGTAATTTGCCAGAAAGACTT 2027
|||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||
Sbjct 1977 TCAGAGACTGCTGCAATCAAGAGGTGGATTGAAATTCCTTGTTATTTGCCATAAAGACTT 2036
Query 2028 TCAAAAATTTAAGGCACATGCGGCTATAGTGGCAGAGGAGGTCAAAGTCCCTTTCAGCTA 2087
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2037 TCAAAAATTCAAGGCACATGCGGCTATAGTGGCAGAGGAGGTCAAAGTCCCTTTCAGCTA 2096
Query 2088 TGATGATGTCCTGTTAGAGAGTGCATCTCAGGAAGAGTTGAGTCTAATTGATCTTGCAAT 2147
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2097 TGATGATGTCCTGTTAGAGAGTGCATCTCAGGAAGAGTTGAGTCTAATTGATCTTGCAAT 2156
Query 2148 TGAAGATGAAGAAAACTACGAACACGGTGTAGACTGGACCTCAGAACTTGGCATCAATTT 2207
||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2157 TGAAGATGAAGAAAAATACGAACACAGTGTAGACTGGACCTCAGAACTTGGCATCAATTT 2216
Query 2208 ACGGTACTGTGTTAAAGTGAGGAAAAATTCCCCTACTAAGAAAATTCAGCATGCACTGTC 2267
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2217 ACGGTACTGTGTGAAAGTGAGGAAAAATTCCCCTACTAAGAAAATTCAGCATGCACTGTC 2276
Query 2268 ACTAGGTGGCTTGTTCTCCGATACAAGCCAGATGCTAGATATTT-CAACTATGAGATGGC 2326
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||
Sbjct 2277 ACTAGGTGGCTTGTTCTCCGATACAAGCCAGATGCTAGAT-TTTACAACTATCAGATGGC 2335
Query 2327 TGCAGAGAAAATCACGCTCAAAAGCTAAACCCATTTCTACCTCAAGTTTCACACCTCGTG 2386
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2336 TGCAGAGAAAATCACGCTCAAAAGCTAAACCCAGTTCTACCTCAAGTTTCACACCTTGTG 2395
Query 2387 AACATCTTGAAGTAAAAGCAGATGGAAAATTAAGGGATAATATGGATTCTCAGGCCGGAA 2446
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||
Sbjct 2396 AACATCTTGAAGTAAAAGCAGATGGAAAATTAAGGGATAATTTGGATTCTCAGACCGGAA 2455
Query 2447 AAAAGGAAGAAAAGATCATCCAGTACTCTAGAAAGAAAAAGTTGAATCCAAAGCCTTCTG 2506
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2456 AAAAGGAAGAAAAGATCATCCAGTACTCGAGAAAGAAAAAGTTGAATCCAAAGCCTTCAG 2515
Query 2507 CAGAACAAGGTCAGGAGCTAGCTACCCTAGCTAAATCAAAAGATTTTGATAAGACATGCA 2566
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2516 CAGAACAAGTTCAGGAGCTAGCTACCCTAGCTAAATCAAAAGATTTTGATAAGACATGTA 2575
Query 2567 ATAAA-TTTACCAATAGGTCACATCTGGATAGTGCAATTCGTTCTGAGATGAACAGTGAG 2625
| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2576 A-AAATTTTAGCAGTAGGTCACATCTGGATAGTGCAATTCGTTCTGAGATGAACAGTGAG 2634
Query 2626 ATTGGAGACTCTGGAAGGGTCATTGGGGTATCATTTTCCATAAATCCTTGTAGCTCATCT 2685
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2635 ATTGGAGACTCTGGAAGGGTCATTGGGGTATCATTTTCCATAAATCCTTGTAGCTCATCT 2694
Query 2686 TTCACTGTGGGACATGGGCAAGAACATCCCGAGATCACTGTCAAGTTTGGTTCAGCTTTA 2745
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2695 TTCACTGTGGGACATGGGCAAGAACATCCCGAGATCACTGTCAAGTTTGGTTCAGATTTA 2754
Query 2746 GATGGGAATGTCACAAATAGTTCCAGTATGGGGAATACAGACTCTGCTGACCTAACCTTA 2805
|||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2755 GATGGGAATGTCACAAATAGTTTGAGTATGGTGAATGGAGACTCTGCTGACCTAACCTTA 2814
Query 2806 ACCTCCATATCTAGAGAGC-GC-C-AAGGACACTCTTTGACCAGCAACAATAATGGCTCC 2862
||||||||||| ||||||| || | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2815 ACCTCCATATCCAGAGAGCAGCACCAAGGACACTCTATGACCAGCAATAATAATGGCTCC 2874
Query 2863 AACTCAGGTAGTCATGTTGTGGCAAGCCAGACCATACTTGCTTCTACAGATAATAATCAT 2922
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||
Sbjct 2875 AACTCAGGTAGTCATGTTGTGGCAAGCCAGACCATACTTGTTTCTACAGGTGATAATCAT 2934
Query 2923 GGTGGACCAAGAAAATTGTCTGGTGATTATGTCTGCAGTGATGTGTCTGTACGTGGTATT 2982
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2935 GACGGACCAAGAAAATTGTCTGGTGATTATGTCTGCAGTGATGTGTCTGTACGTGGTATT 2994
Query 2983 CAGGAAGCGGTTGAAATGAGTGACCAAGAGTTTGGAGAACCTAGGTCTACTGTCACTAAT 3042
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2995 CAGGAAGCGGTTGAAATGAGTGACCAAGAGTTTGGAGAACCTAGGTCTACTGTCACTAAT 3054
Query 3043 ATCGAGGATGAACAGCAATCAAAGATGGTGCAACCAACCAAAAGAGAAGCTGTATCTGGT 3102
|| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||
Sbjct 3055 ATTGAGGATGAACAGCAATCACAGATTGTGAAACCAACCCAAAGAGAAGCTGTATTTGGT 3114
Query 3103 GATGACGCACAGGTGGAGGGAGCAGAAGCTGCGTGTACCATAGAAAACTTGTGCTCTGAA 3162
||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3115 GATCACGAACAGGTGGAGGGAGCAGAAGCTGTGTCTACCAGAGAAAACTTGTGCTCTGAA 3174
Query 3163 ATTATTCTGCACACTGAGCATTCTTCAGCTCAAGTGGGTATGGAAATTCCTGAAATAAAC 3222
|| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3175 ATAATTCTGCACACTGAGCATTCTTCAGCTCATGTGGGTATGGAAATTCCTGACATAAAC 3234
Query 3223 ACGGCCAGTGAGAACATAGTTGTTGACATGACCCATGATGGTGAACCTTTGGAAAGTAGC 3282
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3235 ACGGCCAGTGAGAACTTAGTTGTTGACATGACCCATGATGGTGAACCTTTGGAAAGTAGC 3294
Query 3283 GATATATTAAGTTCGAGCAACGGTGATCAAGCTTCTTCAAATGGATTGCAAGTTCTAGAT 3342
|||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3295 GATATATTAAGTTCGAGCAATGGTGATGAAGCTTCTTCAAATGGATTGCAAGTTCTAAAT 3354
Query 3343 GATGAGCTTAGCATGGAGAGCGAAGTTTCAAGCTCAGAAAACACTGAGGTTATCGAGGCT 3402
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||
Sbjct 3355 GATGAGCTTAGCATGGAGAGTGAAGTTTCAAGCTCAGAAAACACCGAAGTTATTGAGGCT 3414
Query 3403 CCCAATTCTATGGAAGAAGCAAAGAAGAAGCGGAAAATAGAATCAGAGTCTGAGACAAAT 3462
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3415 CCCAATTCTATGGGAGAAGCAAAGAAGAAGCGGAAAATAGAATCAGAGTCTGAGACAAAT 3474
Query 3463 GATAATCTAGAGAGTAGCATTGGTTTCATAAGGAGTCCTTGTGAAGGGTTGAGGTCAAGG 3522
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3475 GATAATCCAGAGAGTAGCATTGGTTTCATAAGGAGTCCTTGTGAAGGGTTGAGGTCAAGG 3534
Query 3523 GGCAAGAGGAAAGAAACATGTGAAACTTCATTAAAGCTCACTGAAATGAGTGATGAAGAG 3582
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||
Sbjct 3535 GGCAAGAGGAAAGCAACATGTGAAACTTCATTAAAGCACACTGAAACGAGTGATGAAGAG 3594
Query 3583 AGGAAACCTATTGAGAAAAGGCTCaaaaaaaCTCCAAAGGCTTGCTCAGGGAGTCGTCAC 3642
| |||||| |||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3595 AAGAAACCCATTGCGAAAAGGCTGAAGAAAACACCAAAGGCTTGCTCAGGGAGTCGTCAG 3654
Query 3643 CAAGAAGTCCCCGCGACAACTCACCCCAACCGATGTTACCTAGAGGGATGCAAGATGACT 3702
|||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3655 CAAGAAGTCCCCACGACAACTCACCCCAACCGTTGTTACCTAGAGGGATGCAAGATGACT 3714
Query 3703 TTCGAGAGCAAAGCGAAATTACAAGCTCACAAGAGAAACTGTTGCACTCACGAAGGGTGT 3762
|| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3715 TTTGAGAGTAAAGCGAAATTACAAACTCACAAGAGAAACCGTTGCACTCACGAAGGGTGT 3774
Query 3763 GGAAAGAAATTCAGGGCTCACAAATATCTGGTGCTTCATCAACGTGTTCATAACGATGAA 3822
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||
Sbjct 3775 GGAAAGAAATTCAGGGCTCACAAATATCTGGTGCTTCATCAACGTGTGCATAAGGATGAA 3834
Query 3823 AGACCTTTCGAGTGCTCTTGGAAAGGGTGTTCCATGACTTTCAAATGGAAATGGGCGAGG 3882
|||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3835 AGACCTTTCGAGTGCTCTTGGAAAGGATGTTCAATGACTTTCAAATGGCAATGGGCGAGG 3894
Query 3883 ACAGAGCATTTGCGTCTGCACACAGGAGAACGACCATACAAATGCAAGGTGGATGGATGC 3942
||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||
Sbjct 3895 ACAGAACATTTGCGTCTGCACACGGGAGAGCGACCATACATATGCAAGGTCGATGGATGT 3954
Query 3943 GGATTGTCGTTTAGGTTTGTATCGGATTATAGTCGCCACAGACGGAAAACCCTGCACTAT 4002
||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||
Sbjct 3955 GGATTGTCGTTTAGGTTTGTATCTGACTATAGTCGCCACAGACGTAAAACCATGCACTAT 4014
Query 4003 GTCACATAGAA----CGGCACTGAATGCTGCAAAATGGTGGCTGGAGAAAGTGAAAGGGC 4058
||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||
Sbjct 4015 GTCACATAGAAAAAACGGCACTGAATGCTTAAAAATGGTGGCTGAACAAAGTGAAATGGC 4074
Query 4059 CTCTCTCTGGAATTGAGAGTTGTTGTAAGATCTAATATCTGGTTGGtttttttAGTTGTT 4118
|||||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 4075 CTCTCTTTGGAATCGAGAGTTGTTGTAACATGTAATATCTGGTTGGTTTTTTTAGTTCTT 4134
Query 4119 GTCTAGTGTTTTAGACCGTTGTTATGTCTCTTTTTGTAGTA--GATGTGACTTCTTTCCA 4176
||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 4135 TTCTAGTGGTTTAGACCGTTGCTATATCTCTTTATGTAGTATAGATGTGACTTCTTTCCA 4194
Query 4177 CTTTTGAGAACGACTCACTCACACTCTTGTTT-GCTTTGACTGTTAAAC-TCGTAACCAT 4234
|||||||||| | | | || ||||||||||| | || | |||||||| | ||||| ||
Sbjct 4195 CTTTTGAGAAGG-C-C--TCGCACTCTTGTTTAGATTCGT-TGTTAAACAT-GTAACGAT 4248
Query 4235 TGGATTCAAAATGTT 4249
|||||||||||||||
Sbjct 4249 TGGATTCAAAATGTT 4263
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 211804833346
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5