BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg487352
Length=3709
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G05570.1 | Symbols: | transducin family protein / WD-40 rep... 3061 0.0
> AT5G05570.1 | Symbols: | transducin family protein / WD-40 repeat
family protein | chr5:1656566-1663929 FORWARD LENGTH=3776
Length=3776
Score = 3061 bits (1657), Expect = 0.0
Identities = 1842/1927 (96%), Gaps = 30/1927 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATCGGTCATCCTCTCTGACTCTCTCAAATCGAATCTCAAG-TTTT-CTTCTTATTCTACG 58
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||
Sbjct 1 ATCGGTCATCCTCTCTGACTCTCTCAAATCGAATCTGAAGCTTTTAGTT-TTATTCTACG 59
Query 59 ATCAGATTCCG-ACGAACAAAATTCTCTTGCTTCCACCGATTTCTCCGTCCGATGCATCG 117
|||| |||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||
Sbjct 60 ATCAAATTCCGAACGAACAAAATTCTCTTGATTCCGCTGATTTCTCCGTCCGATGCATCT 119
Query 118 TCTCGATTGATAATTCTATCCTCGTTTAAAAGACAAGTTGTTCCACCGGAGGAGTGAGCA 177
|||||||||| ||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 120 TCTCGATTGAAAATTCCATTCTCGTTT---------GTTATTCCACCGGAGGAGTGAGCA 170
Query 178 ATCGGCTCTCATCTGTCTTGATCTAGCTCGATGTTCGCCAGAAAATTTCTGCAGAAATCC 237
|||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 171 ATCGGCTCTCATTTGTCTTGTTTTAGCTCGATGTTCGTCAGAAAATTTCTGCAGAAATCC 230
Query 238 TCCGGCGGTCAGAA------TCCT-C-----CTCCT---CCTCGGGGATGTTTGATAGCA 282
|||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct 231 TCCGGCGGTCAGAATCCTCCTCCTCCTATAGCTCCTCCGCCTCGGGGATGTTTGATGGCA 290
Query 283 GAAGACTTGGATCCCCAT-TTAGTCACCCACTGTGGGATACCTTCGACTGCGTCTCTTCT 341
||||| |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 291 GAAGATTTGGATCCTCATATTA-TCACCCACTCTGGGATACCTTCGACGGCGTCTCTTCT 349
Query 342 TGCCTTTGACCCTATTCAATGCCTCTTGGCTGTAGGAACTCTAGATGGAAGGATAAAAGT 401
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 350 TGCCTTTGACCCTATTCAATGCCTCTTGGCTGTGGGAACACTAGATGGAAGGATAAAAGT 409
Query 402 GATTGGTGGCGATAACATCGAGGCGATTCTTGCATGTCCTAAGCAGTTACCTTTCAAAAA 461
|||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 410 GATTGGTGGCGATAACATCGAGGCAATTCTTGCATCTCCTAAGCAGTTACCTTTCAAAAA 469
Query 462 CTTAGAGTTCATGCAGAACCAAGGCTTTCTGGTTAGCATCTCAAATGAAAACGAGATTCA 521
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 470 CTTAGAGTTCATGCAGAACCAAGGCTTTCTGGTTAGCATCTCAAATGAAAACGAGATTCA 529
Query 522 GGTTTGGGACTTGGATCTTAGGCAACCAGCATCAAGCTTAAAATGGGAGTCAAACATTAC 581
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 530 GGTTTGGGACTTGGATCTTAGGCAACCAGCATCAAGCTTAAAGTGGGAGTCAAACATTAC 589
Query 582 TGCGTTTGCAATCCTTCATGGCACTGGTTACATGTATGTTGGTGATGAGTATGGTATGGT 641
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 590 TGCGTTTGCAATCCTTCATGGCACTGGTTACATGTATGTTGGTGATGAGTACGGTATGGT 649
Query 642 GTCTGTTATAAACTACAGTGCTGACGAAGGGAAATTACTGCAGCTTCCTTATTATGTTCC 701
||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 650 GTCTGTTCTAAACTACAGCGCTGACGAAGGGAAATTACTGCAGCTTCCTTATTATGTTCC 709
Query 702 AACTGATGCTTTAGCTGAAGCAGCGGGGCTTTCATCTCCTATTGATTATCCGGTTGTTGG 761
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 710 AACTGATGCTTTATCTGAAGCAGCGGGGCTTTCATCTCCTATTGATTATCCGGTTGTTGG 769
Query 762 ACTTCTTTCTCAGCCTTGTTCAAAGGGAACTAGATTGTTGATTGCATTTTCAAATGGATT 821
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 770 ACTTCTTTCCCAGCCTTGTTCAAAGGGAACTAGATTGTTGATTGCATTTTCAAATGGATT 829
Query 822 ACTTTTTCTTTGGGATGCATCAGAAGATCATGTCGTGTTAGTTCGGGGGAACAAAGATCT 881
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 830 ACTTTTTCTTTGGGATGCATCAGAAGATCATGTCGTGTTAGTTCGGGGGAACAAAGATCT 889
Query 882 ACCTGTGGAGGGTAACACAGTTGCTGATTCTCTGGAAGCCTCACATGATGAGCTTTCTGA 941
||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 890 ACCTGTGGAGGGTAAAACAGTTGCTGATTCTCTTGAAGCTTCACATGATGAGCTTTCCAA 949
Query 942 TCTTGAACTCGATGGAAAAGAGATAAGTTCTTTGTGTTGGGCATCAACTGATGGTTCAGT 1001
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 950 TCTTGAACTCGATGGAAAAGAGATAAGTTCTTTGTGTTGGGCATCAACTGATGGTTCAGT 1009
Query 1002 TCTTGCTGTTGGCTATGTGGATGGGGATATATTATTTTGGGACTTTTCTGATGGGCAAAA 1061
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1010 TCTTGCTGTTGGCTATGTGGATGGGGATATATTATTTTGGGACTTTTCTGATGGGCAAAA 1069
Query 1062 GGGGAAGCCATCTAATCACGTTGTCAAGTTACAGTTGTCTTCAGCTGAGAAAAGACTTCC 1121
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1070 GGGGAAGCCATCTAATCACGTTGTTAAGTTACAGTTGTCTTCGGCTGAGAAAAGACTTCC 1129
Query 1122 TGTCATTGTTATGCACTGGTGTTTGGATGTATCCCACAAGAGTAGTGGTGGAAAACTCTT 1181
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1130 TGTCATTGTTATGCATTGGTGTTTGGATGTATCCCGCAAGAGTAGTGGTGGAAAACTCTT 1189
Query 1182 CATCTACGGTGGTGATATCATTGGATCTGACGAAGTACTTACGATGTTAGGTCTTGATTG 1241
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1190 CATCTATGGTGGTGATATCATTGGATCTGACGAAGTACTTACGATGTTAGGTCTTGATTG 1249
Query 1242 GTCTTCTGGTATGAGAGGTCTGAAATGTGTTGGCCGCGCTGACCTGACCCTTAGCGGTTC 1301
||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1250 GTCTTCTGGTATGGGAGGTCTGAAATGTGTTGGCCGTGCTGACCTGACCCTTAGTGGTTC 1309
Query 1302 ATTTGCTGATATGGTCTTGTCTCCAATAGCCAGTTCAAGGCAAAGTGGGATGTTTTTATT 1361
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||
Sbjct 1310 ATTTGCTGATATGGTCTTGTCTCCAATTGCCAGTTCAAGGCAGAGTGGGGTGTTTTTATT 1369
Query 1362 TCTGTTGACAAATCCAGGACAACTGCAAGCATATGACGATACCTCTCTGGCTTCTCTGAT 1421
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1370 TCTGTTGACAAATCCAGGACAACTGCAAGCATATGACGATACCTCTCTGGCTTCTCTGAT 1429
Query 1422 GTCTCAGAAAGAGAATAAGATTTCTGTTTCTCCACTGCCATATCCAATGGTTGTACCAAC 1481
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1430 GTCTCAGAAAGAGAATAAGATTTCTGTTTCTCCACTGCCATATCCAATGGTTGTACCAAC 1489
Query 1482 GATGGATCCACATATGACAGTAGCAACGTTTGCTGCATTAAATGTGAATGATAAAACGTC 1541
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1490 GATGGATCCACATATGACAGTAGCAACGTTTTCTGCATTAAATGTGAATGATAAAACGTC 1549
Query 1542 ATTAGCTCTTTCTGAGATAGTCTTAGCTGCAAAAGCTCGAACCCCACGTACTCCATCCGG 1601
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 1550 ATTAGCTCTTTCTGAGATAGTCTTAGCTGCAAAAGCTCGAACCCCTCGTACCCCATCCGG 1609
Query 1602 AGAAAGTGCACAATGGCCTCTGACAGGTGGTGTTCCAAGCCACCTTGATGACTACAAGCT 1661
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1610 AGAAAGTGCACAATGGCCTCTGACAGGTGGTGTTCCAAGCCACGTTGATGACTACAAGCT 1669
Query 1662 TGAAAGACTTTACATGGCAGGATATCAAGATGGGTCTATGCGAATATGGGATGCAACCTA 1721
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1670 TGAAAGACTTTACATGGCAGGATATCAAGATGGGTCTATGCGAATATGGGATGCAACCTA 1729
Query 1722 TCCATGTCTGTCTCTTATTTATATTTTGGAACCAAAGGCAAGTGTTATTGACATAACTGG 1781
|||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1730 TCCATGTCTGTCCCTTATTTATATTTTGGAGCCAAAGGCAAGTGTTATTGACATAACTGG 1789
Query 1782 AGTAGATGCATCAGTAACGGCATTTTGCTTCTGCTCTAAGACTTCTTGTTTGGCTGTTGG 1841
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1790 AGTAGATGCATCTGTAACGGCATTTTGCTTCTGCTCTAAGACTTCTTGTTTGGCTGTTGG 1849
Query 1842 TAACGAATGTGGTATGGTTCGCCTATTCAAGCTGGTCGGCCATACAAGTGGAGGAACTTT 1901
|||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1850 TAACGAATGTGGTATGGTTCGCCTATACAAGTTGGTCGGCCATACAAGTGGAGGAACTTT 1909
Query 1902 GGAAGTT 1908
|||||||
Sbjct 1910 GGAAGTT 1916
Score = 3009 bits (1629), Expect = 0.0
Identities = 1749/1807 (97%), Gaps = 7/1807 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1909 ATTTGTTATGCTTTATCTCATGCTGTAGGTTCATTACTTGTAGCTCACCATTTGTATCAA 1968
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1971 ATTTGTTATGCTTTATCTCATGCTGTTGGTTCATTACTTGTAGCTCACCATTTGCATCAA 2030
Query 1969 GAAGATGGTCCTCAATGGTTGGCTGCGTTTTCCTTCCTGAGTTCCCCAGTGTGCACCCTG 2028
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2031 GAAGATGGTCCTCAATGGTTGGCTGCGTTTTCCTTCCTGAGTTCCCCAGTGTGCACCCTG 2090
Query 2029 AAATTTGTACAGTCTACAAGAAGGCTTGCCGTGGGATTTAAATGTGGCAAGGTTGCAATG 2088
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2091 CAATTTGTACAGTCTACAAGAAGGCTTGCCGTGGGATTTAAATGTGGCAAGGTTGCAGTG 2150
Query 2089 CTTGACATTGGTGTGCCGTCAGTATTATTCGTTACAAATAGCTTATCTGACTCAGGTTCT 2148
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2151 CTTGACATTGGTGTGCCGTCAGTATTATTTGTTACAAATAGCTTATCTGACTCAGGTTCT 2210
Query 2149 CCGATCAAGTCACTCTATGTGAAATTCACTTCAGCTCCATCAGGCTCAAAAAGTGATCCA 2208
||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2211 CCGATCAAGTCACTCTATGTGAAATCCTCTTCAGCTCCAACAGGCTCAAAAAGTGATCCA 2270
Query 2209 ACTGATCACAACTCCATAAATTCTGAAGAT-ATTTTAATCTTGTGTGCAATGACCAAAGA 2267
|||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2271 ACTGATCACAACTCCATAAATTCTGAAGATGA-TTTACTCTTGTGTGCAATGACCAAAGA 2329
Query 2268 TGGACAGACCATTCTTTTGGATGGCAATACTGGAAAAATACTCGCCTCATGCTTGAGACC 2327
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||
Sbjct 2330 TGGACAGACCATTCTTTTGGATGGCAATACTGGGAAAATACTTGCCTCTTGCCTGAGACC 2389
Query 2328 TCTAAAGAACCCAACTGCGATTTGTATGCACATTATAGAGAACTGCTATGAAAACTCTGA 2387
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2390 TCTAAAGAACCCAACTGCGATTTGTATGCACATTATAGAGAACTGCTATGAAAACTATGA 2449
Query 2388 AACGCCCAATGGAAAGCCAGCTGGAAATCCATCTGGGAAGGAGAAACATGAGAACAAATC 2447
|||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2450 AACGCCCAGTGAAAAACCAGCTGAAAATCCATCTGGGAAGGATAAACATGAGAACAAATC 2509
Query 2448 TCATATAATCAACGCTAGTGAGAGTCATTCACCA-TC--TGAACAGAATGCTGTCACAGA 2504
|||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||
Sbjct 2510 TCATATAATCAAAGCTAGTGAGAGTCATTCACCAGACGGTGAACAGAATGCTGTCACAGA 2569
Query 2505 AACAAAACTTGCTGATCAGATGTTTGCGAACTCAGTATTTCTCATGTGTTCGGAGGATGC 2564
|||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2570 AACAAAACTTATTGATCAGATATTTGCGAATTCATTATTTCTCATGTGTTCTGAGGATGC 2629
Query 2565 ACTGCGCTTGTATACTTTAAAGTCTCTATCTCAGGGAAGTCTTGAGAGCATTATGGAGGT 2624
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2630 ACTGCGCTTGTATACTGTAAAGTCTCTATCTCAGGGAAGTCTTGAGAGCATTATGGAGGT 2689
Query 2625 AAATCTTCCAAGGCCGTGTTGCTGGATGGGAATCCTaaaaaaaGATGGAAGGGAATGTGC 2684
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2690 AAATCTTCCAAGGCCGTGTTGCTGGATGGGAATCCTAAAAAAAGATGGAAGGGAATGTGC 2749
Query 2685 AGTACTCCTGCTTTACCGAACAGGGCATATTGAAATAAGATCTTTTCCGGATCTTGAAGT 2744
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||
Sbjct 2750 AGTACTCCTGTTTTACCGAACAGGGCATATTGAAATAAGATCTTTCCCGAATCTTGAAGT 2809
Query 2745 TGTGGGAGAGAGCTCTTTGCTGTCACTTCTTAGGTGGAACTTCAAGCCTAACATGGAGAA 2804
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2810 TGTGGGAGAGAGCTCTTTGCTGTCACTTCTTAGGTGGAACTTCAAGCCTAACATGGAGAA 2869
Query 2805 GACAGTATGTTCGGATGATTTCGGCCATGTCGTCCTGGTAAATGGTTGTGAAGTTGCCAT 2864
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2870 GACAGTATGTTCAGATGATTTCGGCCATGTCGTCCTGGTAAATGGTTGTGAAGTTGCCAT 2929
Query 2865 CCTTTCGTTTTTGGCCCACGCAAACGGCTTCAGGCTCCCAGAGTCTTTACCTTTGCTTCA 2924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2930 CCTTTCGTTTTTGGCCCACGCAAACGGCTTCAGGCTCCCAGAGTCTTTACCTTTGCTTCA 2989
Query 2925 TGACAAAGTCCTTGCAGCAGCTGCTGACGCTACCTTTAGCCATATCTCTGCTCATAAGAA 2984
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2990 TGACAAAGTCCTTGCAGCAGCTGCTGACGCTACCTTTAGCCATATCTCTGTTCATAAGAA 3049
Query 2985 AAATCATGATGGCGCTCCCAAATTCCTAAGTAACATTATCAAAGGCTTCAGATCAAGCAC 3044
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3050 AAATCATGATGGCGCTCCCAAATTCCTAAGTAACATTATCAAAGGCTTCAGATCAAGCAC 3109
Query 3045 TGAACAGAAGATGGACCAAGTACAAGATTTCTCCCACCTGGGGAACATCTTTTCTAATCC 3104
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3110 TGAACAGAAGATGGACCAAGTACAAGATTTCTCCCACCTGGGGAACATCTTTTCTAATCC 3169
Query 3105 ACCATACTTAAAACCTTCTGATACCGGTGGCGACGACGAAAAGATTGTCGAGCTAAACAT 3164
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3170 ACCATACTTAAAACCTTCTGATACCGGTGGCGACGACGAAAAGATTGTTGAGCTAAACAT 3229
Query 3165 AGATGACATCGAGATAGATGAACCTGTGATCATCTTGCCTTTGACagagaaagacaaaaa 3224
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3230 AGATGACATCGAGATAGATGAACCTGTGATCATCTTGCCGTTGACAGAGAAAGACAAAAA 3289
Query 3225 agaaaagaaagataagagaacggataaggaaaagCTGTTTGACAGTGCATCCAGCGATGC 3284
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||
Sbjct 3290 AGAAAAGAAAGATAAGAGAACGGATAAGGAAAAGCTGTTCGACGGTGCATCCAGCGATGC 3349
Query 3285 ACAACCCAAAACGAGAACAGTGGAAGAAATTAAGTCCAAATACAGAAAAGCAGGGGAAAC 3344
|||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3350 ACAACCCAAAACAAGAACAGTGGATGAAATTAAGTCCAAATACAGAAAAGCTGGGGAAAC 3409
Query 3345 CTCAGCAATAGCTTCACAAGCGAAGGACAAACTTCTTGAGCGGGGAGAAAAACTCGAGAG 3404
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3410 CTCAGCAATAGCTTCACAAGCGAAGGACAAACTTCATGAGCGGGGAGAAAAACTCGAGAG 3469
Query 3405 AATCAGCCAACGCACAGCTGAGCTTCAAGACAATGCTGAGAACTTTGCATCCATGGCACA 3464
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3470 AATCAGCCAACGCACAGCTGAGCTTCAAGACAATGCTGAGAACTTTGCATCCATGGCACA 3529
Query 3465 TGAACTTGCTAAGCAAATGGAGAAGCGAAAATGGTGGAACATATGAGAGAGTTGCAGTCA 3524
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3530 TGAACTTGCTAAGCAAATGGAGAAGCGAAAATGGTGGAACATATGAGAGAGTTGCAGCCA 3589
Query 3525 TTGTGGGTTCTTCCGTATATAAACTAATTATCTTG-G-GTTTCCACAGGTGAAAAACTCT 3582
||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||
Sbjct 3590 TTGTGGGCTCTTCCGTATATAAACTAATTATCTTTTGTGTTTCCACAGGTGAAAATTTCT 3649
Query 3583 CTTTCATGTTTATTTATCAATCAAATCTGTAAAATAGATTGATCAAAGGGAGCAACCCTT 3642
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||
Sbjct 3650 TTTTCATGTTTATTTATCAATCAAATCTGTAAAATAGATTGACCAAAGAGAGCAACCCTT 3709
Query 3643 CTAACTTGAGAAGTTGCTTGTGAGCTGATTTGAGGCTGCTATGACTGTCTATCAGAATTT 3702
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3710 CTAACTTGAAAAGTTGCTTGTGAGCTGATTTGAGGCTGCTTTGACTGTCTATCAGAATTT 3769
Query 3703 TAAATTT 3709
|||||||
Sbjct 3770 TAAATTT 3776
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 184714684126
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5