BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg487516
Length=3714
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G06970.1 | Symbols: | Protein of unknown function (DUF810) ... 5930 0.0
> AT5G06970.1 | Symbols: | Protein of unknown function (DUF810)
| chr5:2158228-2166398 REVERSE LENGTH=3781
Length=3781
Score = 5930 bits (3211), Expect = 0.0
Identities = 3592/3768 (95%), Gaps = 58/3768 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATACACAGATAGATCTTTCGGCCCCGGCGCGTTCTCTAGATTTGCTCA-CACGACCTCGA 59
||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||
Sbjct 18 ATATACAGATAGATCTTTCGGCCCCGGCGCATTCTCTAGATTTGCTCATCACCACCTCGA 77
Query 60 AA-TT-T-CT----G--CTCC---A-AGTTC--TC--C-A-A---AACAGTTC--ATTCC 95
|| || | || | |||| | ||||| || | | | | ||| || ||||
Sbjct 78 AATTTCTGCTCGAAGTTCTCCAAAACAGTTCATTCATCTACATTTACCAGATCATATTCG 137
Query 96 T-CT-A--CAT-T-TAAATTCTCACTAAATCAATCCTTCCGTTGGATTAATTGCTGTGTT 149
| | | | | | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||
Sbjct 138 TATTCAGTCGTCTCTAAATTCTCACTAAATCAATCCTTCCTTTGGA-TAATTCCGGTGTT 196
Query 150 CGCGAGGAATCTGA-AGAAATGGTTGGTTAATTTGAAATCTGAGAATCCGTGTGACTATT 208
||||||||||||| | ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 197 TGCGAGGAATCTGATA-AAATGATTGGTCAATTGGAAATCTGAGAATCCGTGTGACTATT 255
Query 209 ATTGCAGCTGGATCGACATGGAAGAAGAAAATGCTGTTGAGATTCTTCAGAGATATCGCC 268
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 256 ATTGCAGCTGGATCGAGATGGAAGAAGAAAATGCTGTCGAGATTCTTCAGAGATATCGCC 315
Query 269 GGGATAGGCGGAAACTCTTGGATTTTATGTTGGCTGGTAGCTTGATCAAGAAAGTTATAA 328
||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 316 GGGATAGGCGGAAGCTATTGGATTTTATGTTGGCTGGTAGCTTAATCAAGAAAGTTATAA 375
Query 329 TGCCTCCTGGGGCTGTTACTCTGGATGATGTTGATTTGGATCAAGTTAGTGTTGATTATG 388
|||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 376 TGCCTCCTGGTGCTGTGACTCTTGACGATGTTGATTTAGATCAAGTTAGTGTTGATTATG 435
Query 389 TCATTAACTGTGCTAAGAAAGGTGGAATGCTTGAACTTGCTGAAGCGATTCGGGACTATC 448
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 436 TCATTAACTGTGCTAAGAAAGGTGGAATGCTCGAACTCGCTGAAGCGATTCGGGACTATC 495
Query 449 ATGATCACATTGGATTGCCTTATATGAATAGCGTCGGTACTGCTGATGAATTCTTTTTGG 508
|||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 496 ATGATCACATTGGATTGCCTTATATGAACAGCGTGGGTACTGCTGATGAATTCTTTTTGG 555
Query 509 CTACAAATCCTGAATCTTCCGGCTCACCTCCAAAAAGGGCCCCACCACCTATTCCTGTAT 568
|||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 556 CTACAATTCCTGAATCTTCTGGCTCACCTCCAAAAAGGGCCCCACCGCCTATTCCTGTAT 615
Query 569 TAATTTCCTCATCCTCTCCCATGGTTACAAATCCGGAGTGGTGTGAGTCACCAACTGTGC 628
||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||
Sbjct 616 TAATTTCCTCATCTTCTCCCATGGTTACAAATCCCGAGTGGTGTGAGTCACCATCTGCGC 675
Query 629 CATCATTGATGCGATCAGAATCTATTGATTCACCAAAAGCTCAAGAGCTGACTGTTGATG 688
|| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 676 CACCATTGATGCGATCAGAATCTTTTGATTCACCAAAAGCTCAAGAGCTGACTGTTGATG 735
Query 689 ACATTGAAGATTTTGAAGACGATGATGATCTTGATGAAGTTGGTAATTTCAGAATCTCAA 748
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
Sbjct 736 ACATTGATGATTTTGAAGACGATGATGATCTTGATGAAGTTGGTAATTTCAGGATCTCTA 795
Query 749 GGCGAACTGCGAATGATGCGGCTGATTTTGTGCCAAAACTGCCCTCCTTTGCGACTGGTA 808
|||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 796 GGCGGACTGCAAATGATGCTGCTGATCTTGTGCCAAGACTGCCCTCCTTTGCGACTGGTA 855
Query 809 TTACAGATGATGATCTCCGTGAAACTGCATTTGAAATCCTTTTGGCTTGCGCTGGAGCTT 868
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 856 TTACCGATGATGATCTCCGTGAAACTGCATTTGAAATACTTTTGGCTTGCGCTGGAGCTT 915
Query 869 CAGGAGGTCTCATAGTACCATCAAAAGAGAAAAAGAAGGAGAAAAGCAGGTCTAGGCTGA 928
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 916 CAGGAGGTCTCATAGTACCATCAAAAGAGAAAAAGAAGGAGAAAAGCAGGTCTAGGCTGA 975
Query 929 TTAAGAAGCTTGGTCGCAAAAGTGAGAGTGTTTCTCAGTCTCAGAGTTCATCAGGATTGG 988
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||
Sbjct 976 TTAAGAAGCTTGGTCGCAAAAGTGAGAGTGTTTCTCAATCTCAGAGCTCATCAGGATTGG 1035
Query 989 TTGCTCTTTTAGAAATGATGCGGGGTCAAATGGAGATTTCTGAGGCTATGGACATCAGAA 1048
|| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1036 TTTCTCTTTTAGAAATGATGCGGGGCCAAATGGAGATTTCTGAGGCCATGGACATCAGAA 1095
Query 1049 CAAGACAGGGGTTACTTAATGCCCTAGCGGGAAAAGTAGGCAAAAGAATGGACAGCCTCC 1108
||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1096 CAAGACAAGGGTTGCTTAATGCCCTAGCGGGAAAAGTTGGCAAAAGAATGGACAGCCTCC 1155
Query 1109 TGGTCCCTTTAGAATTGCTATGTTGCGTGTCTCGTACCGAGTTCTCTGACAAGAAAGCGT 1168
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1156 TGGTGCCTTTAGAATTGCTATGTTGCGTGTCTCGTACCGAGTTCTCTGACAAGAAAGCAT 1215
Query 1169 ACTTACGTTGGCAGAAAAGGCAGTTAAACATGTTAGCAGAGGGGCTCATTAACAATCCAG 1228
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1216 ACTTACGCTGGCAGAAAAGGCAGTTAAACATGTTAGCAGAGGGGCTCATTAACAATCCAG 1275
Query 1229 TTGTTGGATTTGGAGAATCAGGTCGTAAGGCAACTGACCTGAAGAGTCTTCTGCTAAGGA 1288
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1276 TTGTTGGATTTGGAGAATCAGGTCGTAAGGCAACTGACCTGAAGAGTCTTCTGCTAAGGA 1335
Query 1289 TTGAAGAATCAGAGTCTCTTCCATCCTCAGCTGGAGAAGTGCAAAGAGCAGAATGTTTAA 1348
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1336 TTGAAGAATCAGAGTCTCTTCCATCCTCAGCTGGAGAAGTGCAAAGAGCAGAATGTTTAA 1395
Query 1349 AATCTCTTAGAGAAGTTGCTATCTCACTTGCCGAGAGACCGGCTCGTGGTGATTTGACGG 1408
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1396 AATCTCTTAGAGAAGTTGCTATCTCACTTGCTGAGAGACCGGCTCGTGGTGATTTGACGG 1455
Query 1409 GTGAAGTCTGCCATTGGGCTGATGGCTATCATTTGAATGTCAGACTATATGAGAAATTGC 1468
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1456 GTGAAGTCTGCCATTGGGCTGATGGCTATCATTTGAATGTCAGACTATATGAAAAATTGC 1515
Query 1469 TTCTCTGTGTCTTTGACATATTGAATGATGGGAAGCTCACAGAGGAAGTTGAAGAAATTC 1528
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1516 TTCTCTGTGTCTTTGACATATTGAATGATGGGAAGCTCACAGAGGAAGTTGAAGAAATTC 1575
Query 1529 TTGAGCTTTTGAAGTCAACGTGGCGTGTTCTTGGAATTACAGAGACCATCCATTACACAT 1588
||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1576 TTGAGCTTTTGAAGTCAACATGGCGTGTTCTCGGAATTACAGAGACCATCCATTACACAT 1635
Query 1589 GCTATGCCTGGGTATTGTTTCGACAGTATGTAATTACTAGTGAACGAGGACTTCTGCGAC 1648
||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1636 GCTATGCTTGGGTTTTGTTTCGACAGTATGTCATTACTAGTGAACGAGGACTTCTGCGAC 1695
Query 1649 ATGCTATTCAGCAGCTGAAGAAAATCCCTCTAAAAGAACAACGTGGGCCTCAAGAGCGCA 1708
|||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1696 ATGCTATTCAGCAGCTGAAGAAGATCCCACTAAAAGAACAACGAGGGCCTCAAGAGCGTT 1755
Query 1709 TACACTTGAAAACATTGCAGTGTAGGGTTGAAAATGAAGAGATATCCTTCCTAGAGTCCT 1768
||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1756 TACACTTGAAAACCTTGAAGTGTAGGGTTGATAATGAAGAGATATCCTTCCTGGAGTCCT 1815
Query 1769 TCTTGTCACCTATACGGAGTTGGGCCGATAAGCAGCTGGGCGATTACCATTTGCATTTTG 1828
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||
Sbjct 1816 TCTTGTCACCTATACGGAGTTGGGCCGATAAGCAGCTGGGCGACTACCATCTGCATTTTG 1875
Query 1829 CCGAGGGTTCACTTGTCATGGAGGATACAGTCACAGTTGCAATGATAACTTGGAGGCTTT 1888
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1876 CCGAGGGTTCACTTGTCATGGAGGATACAGTCACAGTTGCAATGATAACTTGGAGGCTCT 1935
Query 1889 TGTTGGAGGAATCTGATCGAGCGATGCATTCTAACTCTTCAGACCGAGAGCAAATTGAGT 1948
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
Sbjct 1936 TGTTGGAGGAATCTGATCGAGCGATGCATTCTAACTCTTCAGATCGAGAGCAAATTGAAT 1995
Query 1949 CATACATTTTATCTTCCATCAAGAATACGTTCACAAGGATGTCACTTGCCATTGATAGAT 2008
| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1996 CCTACGTTTTATCTTCCATCAAGAATACGTTCACAAGGATGTCACTTGCCATTGATAGAT 2055
Query 2009 CAGACAGAAATAATGAGCACCCTTTGGCATTGCTTGCTGAGGAGACTAAGAAACTTATGA 2068
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2056 CAGACAGAAATAATGAGCACCATTTGGCATTGCTTGCTGAGGAGACTAAGAAACTTATGA 2115
Query 2069 AAAAAGACTCTACCATCTTTATGCCAATTTTATCTCAGAGGCACCCACAGGCAATTGCGT 2128
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2116 AAAAGGACTCTACCATCTTTATGCCAATTTTATCTCAGAGGCACCCACAGGCAATTGCGT 2175
Query 2129 TTTCTGGATCCCTTGTTCACAAGCTTTATGGGAACAAGTTGAAACCTTTTCTTGATGGTG 2188
|||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2176 TTTCTGCATCCCTTATTCACAAGCTTTATGGGAACAAGTTGAAACCTTTTCTTGATGGTG 2235
Query 2189 CTGAACACTTGACTGAGGACGCTGTCTCTGTTTTTCCTGCGGCTGATAGCCTTGAGCAAT 2248
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2236 CTGAACACTTGACTGAGGACGCTGTCTCTGTTTTTCCTGCGGCTGATAGCCTTGAGCAAT 2295
Query 2249 ATTTACTGGAGTTAATGACTTCTGTCTGCAGAGAGGATACAAGTGGACCTTACTTCAGAA 2308
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2296 ATTTACTGGAGTTAATGACTTCTGTCTGCGGAGAGGATACAAGTGGACCTTACTTCAAAA 2355
Query 2309 AATTAATTCCATATGAGGTCGAATCACTCTCTGGCACATTGGTTTTGAGATGGATCAATT 2368
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2356 AATTAATTCCATATGAGGTCGAATCCCTCTCTGGCACATTGGTTTTGAGATGGATCAATT 2415
Query 2369 CACAGCTGGGGAGAATTTTAAGCTGGGTGGAGCGAGCTTTTAAACAAGAGCAATGGGACC 2428
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||
Sbjct 2416 CACAACTGGGGAGAATTTTAAGCTGGGTGGAGCGAGCTTATAAACAAGAGCATTGGGACC 2475
Query 2429 CAATATCACCTCAACAGCGGCATGGGAGCTCAATTGTCGAAGTTTTCAGGATTGTAGAAG 2488
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2476 CAATATCACCTCAACAGCGGTATGGGAGCTCAATTGTCGAAGTTTTCAGGATTGTAGAAG 2535
Query 2489 AGACTGTTGATCAATTTTTTGCGCTGAAAGTTCCAATGAGATCCATTGAACTAAGTGCTT 2548
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2536 AGACTGTTGATCAATTTTTTGCGCTGAAAGTTCCAATGAGATCCATTGAACTAAGTGCTT 2595
Query 2549 TATTTCGTGGCATTGACAATGCATTTCAAGTATATACTAACCATGTCATGGAGAAGCTAG 2608
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2596 TATTTCGTGGCATTGACAATGCATTTCAAGTATATACTAACCATGTCATGGAGAAGCTAG 2655
Query 2609 CTAGCAAGGATGATTTGGTTCCACCTGTACCTGTTCTTACTCGTTACAAGAAGGAAACCG 2668
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2656 CTAGCAAGGATGATTTGGTTCCACCTGTACCTGTTCTTACTCGTTACAAGAAGGAAACAG 2715
Query 2669 CAATCAAGGTTTTTGTTAAGAAGGAACTATTCGAGTCAAAACATCCT-GATGAGAGAAGG 2727
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||
Sbjct 2716 CAATCAAGGTTTTTGTTAAGAAGGAACTATTCGACTCAAAACA-CCTTGATGAGAGAAGG 2774
Query 2728 TCGATTAACATTAATGTTCCTGCAACCGCTATGCTTTGCGTTCAGCTCAATACTTTACAT 2787
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2775 TCGATTAACATTGATGTTCCTGCAACCGCTATGCTTTGCGTTCAGCTCAATACTTTACAT 2834
Query 2788 TATGCTGTTAGTCAACTGAGCAAGTTAGAAGACAGCATGTGGG-AGCGCTGGATAGCGAA 2846
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||
Sbjct 2835 TATGCTGTTAGTCAACTGAGCAAGTTAGAAGACAGCATGTGGCTA-CGCTGGATAGCAAA 2893
Query 2847 AAAACCTCGTGAAAAGATTGTCATCAGAAAATCTATGGTTGAGAAATCCAAGAGTTTTAA 2906
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2894 AAAACCTCGTGAAAAGATTGTCATCAGAAAATCTATGGTTGAGAAATCCAAGAGTTTTAA 2953
Query 2907 CCAGAAGGAATCTTTTGAGGGGAGTCGAAAAGATATCAATGCAGCTCTGGATCGTATCTG 2966
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2954 CCAGAAGGAATCTTTTGAGGGGAGTAGAAAAGATATCAATGCAGCTCTGGATCGTATTTG 3013
Query 2967 CGAGTTTACTGGAACCAAGATTATCTTCTGCGATTTAAGGGAGCCATTTATTGAAAATTT 3026
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3014 CGAGTTTACTGGAACCAAGATTATCTTCTGCGATTTAAGGGAGCCATTTATTGAAAATTT 3073
Query 3027 GTATAAGCCAAGTGTTTCTCAATCAAGATTGGAAGGATTAATCGAAGCCCTAGACACGGA 3086
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3074 GTATAAGCCAAATGTTTCTCAATCAAGATTGGAAGGATTAATCGAAGCCCTAGACACGGA 3133
Query 3087 ACTTGGACAGCTATGTAGTGTCATAATGGAGCCATTGAGGGATCGGATAGTCACCAGCCT 3146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3134 ACTTGGACAGCTATGTAGTGTCATAATGGAGCCATTGAGGGATCGGATAGTCACCAGCCT 3193
Query 3147 GCTTCAAGCATCACTTGATGGGTTGCTTCGTGTACTACTAGATGGAGGCCCGTCACGTGT 3206
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||
Sbjct 3194 GCTCCAAGCATCACTTGATGGGTTGCTTCGTGTACTATTAGATGGAGGCGCGTCTCGTGT 3253
Query 3207 ATTTCATCCAAGCGAGTCAAAGCTGTTAGAAGAAGATGTAGAGGTCTTAAAGGAATTTTT 3266
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3254 ATTTCATCCAAGCGAGTCAAAGCTGTTAGAAGAAGATGTAGAGGTCTTAAAGGAATTCTT 3313
Query 3267 TATTTCTGGTGGGGATGGACTTCCGAGAGGAGTGGTTGAAAACCAGGTAGCCAGAGTTCG 3326
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3314 TATTTCTGGTGGGGATGGACTTCCGAGAGGAGTGGTTGAAAACCAAGTAGCCAGAGTTCG 3373
Query 3327 TCTTGTTGTAAAGTTGCACGGATATGAGACACGGGAGCTTATTGATGACTTGAGGTCTAG 3386
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3374 TCTTGTTGTAAAGTTGCACGGATATGAGACACGGGAGCTTATTGATGACTTGAGGTCTAG 3433
Query 3387 AAGCAGTCTAGAGATGCAGCAAGGAGGAAAAGGCAAACTTGGAGCGGACACCCAAACATT 3446
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3434 AAGCAGTCTAGAGATGCAGCAAGGAGGAAAAGGCAAACTTGGAGCGGACACCCAAACATT 3493
Query 3447 GGTACGAGTGCTTTGCCACAGAAACGATTCAGAGGCGTCTCAGTTTCTGAAAAAACAGTA 3506
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3494 GGTACGAGTGCTTTGCCACAGAAACGATTCAGAGGCATCTCAGTTTCTGAAAAAACAGTA 3553
Query 3507 CAAAATCCCAAAATCCCACGGGTAAT--AT-C-----T-------GATCAGATCATATTT 3551
||||||||||| |||||||||||||| || | | |||||||||||||||
Sbjct 3554 CAAAATCCCAAGATCCCACGGGTAATCTATGCGCCGATCTAATCAGATCAGATCATATTT 3613
Query 3552 GCGTCT-TTTGATT-T--CTTTCTTTCGGTCTTTTCTTTAGTAACAAAATCATTTGTATA 3607
|||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3614 GCGTCTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCGGTCTTTTCTTTAGTAACAAAATCATTTGTATA 3673
Query 3608 ATTGATTCTCACAAGTACAGGTTGTAGAGAGATATTACCTGAGTT-TTTTAGGTGTCATT 3666
|||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3674 ATTGATTCTCACAAGTACAGGTTGCAGAGAAATACTACCTGAGGGGTTTTAGGTGTCATT 3733
Query 3667 CTTTTGACTTATCTTTGCTTTTGATACAAATGTTTGTAGTTTGCGATC 3714
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3734 CTTTTGACTTATCTTTGCTTTTTATACAAATGTTTGTAGTTTACGATC 3781
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 184965518841
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5