BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg487687 Length=2550 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT5G08490.1 | Symbols: | Tetratricopeptide repeat (TPR)-like s... 4222 0.0 > AT5G08490.1 | Symbols: | Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein | chr5:2745208-2747757 REVERSE LENGTH=2550 Length=2550 Score = 4222 bits (2286), Expect = 0.0 Identities = 2459/2545 (97%), Gaps = 2/2545 (0%) Strand=Plus/Plus Query 7 CCTTTACGGCAATTTGTTCAGAATTTCAGACTTTTGTCTGGTTTTGGAACTGATCACAGG 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 7 CCTTTACGGCAATTTGTTCAGAATTTCAGACTTTTGTCTGGTTTTGGAACTGATCACAGG 66 Query 67 GtttttttGGATGTTGTCAAAGCTTGTGCTTCAGTGTCTGAGCTCACATCAGGGAGGGCT 126 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 67 GTTTTTCTGGATGTTGTCAAAGCTTGTGCTTCAGTGTCTGATCTCACATCAGGGAGGGCT 126 Query 127 CTGCACGGTTGCGTGTTCAAGCTTGGTCATATAGCCTGCACTGAGGTCTCGAAGTCAGTT 186 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| Sbjct 127 CTGCACGGTTGCGTGTTCAAGCTTGGTCATATAGCCTGCTCTGAGGTTTCGAAGTCAGTT 186 Query 187 CTTAACATGTATGCGAAATGCAGGAGAATGGATGATTGCCAGAAGATGTTTAGGCAAATG 246 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 187 CTTAACATGTATGCGAAATGCAGGAGAATGGATGATTGCCAGAAGATGTTTAGGCAAATG 246 Query 247 GACAGTGTTGATCCTGTTGTTTGGAATATTGTTCTGACTGGACTTTCTGTTTCTTGTGGT 306 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 247 GACAGTCTTGATCCTGTTGTTTGGAATATTGTTCTGACTGGACTTTCTGTTTCTTGCGGT 306 Query 307 CGTGAAACGATGAGGTTTTTCAAAGCAATGCACTTTGCAGATGAACCTAAGCCCAGCTCC 366 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 307 CGTGAAACGATGAGGTTTTTCAAAGCAATGCACTTTGCAGATGAACCTAAGCCGAGCTCT 366 Query 367 GTTACCTTTGCGATTCTTCTTCCTGTGTGTGTTCGCCTTGGGGATTCATACAATGGGAAA 426 ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 367 GTTACCTTTGCGATTGTTCTTCCTTTGTGTGTTCGCCTTGGGGATTCATACAATGGGAAG 426 Query 427 AGTATGCATTCTTATATTATTAAAACCGGTTTAGAGAAAGATACACTTGTGGGGAATGCT 486 |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 427 AGTATGCATTCTTATATTATTAAAGCCGGTTTGGAGAAAGATACACTTGTGGGGAATGCT 486 Query 487 TTGGTTTCCATGTATGCCAAATTTGGGTATATTATTCCTGATGCTTTTACTGCATTTGAT 546 |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||| ||||||||||||| Sbjct 487 TTGGTTTCCATGTATGCCAAATTTGGTTTTATTTTTCCCGATGCTTATACTGCATTTGAT 546 Query 547 GATATAGCTGACAAAGATGTTGTCTCATGGAATGCGATTATTGCTGGGTTTTCTGAGAAT 606 | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 547 GGTATAGCTGATAAAGATGTTGTCTCTTGGAATGCGATTATTGCTGGGTTTTCTGAGAAT 606 Query 607 AAGATGATGGCTGATGCATTTAGATCGTTTTGTCTAATGCTGAAAGAACCTACAGAGCCA 666 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 607 AATATGATGGCTGATGCATTTAGATCGTTTTGTCTAATGCTGAAGGAACCTACAGAGCCA 666 Query 667 AATTATGCAACAATTGCAAATGTTTTGCCAGTTTGCGCTTCCATGGGCAAGAACATTGCA 726 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| Sbjct 667 AATTATGCAACAATTGCAAATGTTTTGCCTGTTTGCGCTTCTATGGACAAGAACATTGCA 726 Query 727 TATCGAAGTGGGAGACAGATTCACAGTTATGTTGTGCAGAGATCTTGGTTGCAAACCCAT 786 | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| Sbjct 727 TGTCGAAGTGGTAGACAGATTCACAGTTATGTTGTGCAGAGGTCTTGGCTGCAAACCCAT 786 Query 787 GTTTTTGTATGTAATTCACTTGTGAGTTTCTATTTGAGAGTCGGAAGAATAGAAGAAGCA 846 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 787 GTTTTTGTATGTAATTCACTTGTTAGTTTCTATTTGAGAGTCGGAAGGATAGAAGAAGCA 846 Query 847 GCCTCATTGTTTACGAGGATGGGTTCCAAAGATCTGGTTTCATGGAACGTTGTCATAGCC 906 |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| Sbjct 847 GCCTCATTGTTTACCAGGATGGGTTCTAAAGATCTAGTTTCATGGAATGTTGTCATAGCT 906 Query 907 GGTTATGCATCAAATCATGAGTGGCTTAAAGCATTGCAGTTATTTCACAACTTGGTGCAA 966 ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 907 GGTTATGCATCAAATTGTGAGTGGTTTAAAGCATTTCAGTTATTTCACAACTTGGTGCAT 966 Query 967 AAGGGGGATGTTTCTCTTGATTCAGTAACTATTCTCAGCATCCTTCCTGTCTGTGCGCAG 1026 |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| Sbjct 967 AAGGGGGATGTTTCTCCTGATTCGGTAACTATTATCAGTATCCTTCCTGTCTGTGCGCAA 1026 Query 1027 TTAACTGACTTGACCTGTGGGAAAGAGATCCACAGTTATATTTTGCGCCATTCTTACCTT 1086 |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 1027 TTAACTGACTTGGCCTCTGGGAAAGAGATCCACAGTTATATATTGCGCCATTCTTACCTT 1086 Query 1087 TTGGAGGATACATCAGTTGGTAACGCTCTCATTAGTTTCTATGCAAGATTTGGTGACACG 1146 |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1087 TTGGAGGATACATCAGTTGGGAATGCTCTCATTAGTTTCTATGCAAGATTTGGTGACACA 1146 Query 1147 AGTGCAGCATATTGGGCCTTTTCACTGATGTCCATGAAGGATATAATATCTTGGAATGCT 1206 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1147 AGTGCAGCATATTGGGCCTTTTCACTGATGTCCACGAAGGATATAATATCTTGGAATGCT 1206 Query 1207 ATACTTGATGCCTTTGCAGACAGTCCAAAGCAGTTTCAATTTTTGAATCTCTTGCACCAC 1266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1207 ATACTTGATGCCTTTGCAGACAGTCCAAAGCAGTTTCAATTTTTGAATCTCTTGCACCAC 1266 Query 1267 TTATTTAACGAAGCAATCACTCTTGACTCTGTTACTATTTTAAGCCTACTCAAGTTCTGC 1326 ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| Sbjct 1267 TTACTTAATGAAGCAATCACTCTTGACTCTGTTACTATTTTAAGCCTACTAAAGTTTTGC 1326 Query 1327 ACAAATGTACAGGGAATTGGTAAAGTAAAAGAAGTTCATGGGTACTCAGTTAAGGCTGGT 1386 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1327 ATAAATGTACAGGGAATTGGTAAAGTAAAAGAAGTTCATGGGTACTCAGTTAAGGCTGGT 1386 Query 1387 CTTTTACACAATGAAGAGGAACCCAAGCTTGGCAATGCATTGCTTGATGCATATGCCAAA 1446 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1387 CTTTTACACGATGAAGAGGAACCCAAGCTTGGCAATGCATTGCTTGATGCATATGCCAAA 1446 Query 1447 TGTGGTAATGTTGAATACGCTCATAAGATTTTTCAGGGTTTATCAGAGAGGAGAACTTTG 1506 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1447 TGTGGTAATGTTGAATACGCTCATAAGATTTTTCTGGGTTTATCAGAGAGGAGAACTTTG 1506 Query 1507 GTTACCTATAACTCATTGTTATCAGGATATGTTAATAGTGGAAGTCATGATGATGCTCAG 1566 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1507 GTTTCCTATAACTCATTGTTATCAGGATATGTTAATAGTGGAAGTCATGATGATGCTCAG 1566 Query 1567 ATGCTGTTCAGTGAGATGTCTACTACTGATCTGACCACTTGGAGTTTGATGGTTCGTATC 1626 ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1567 ATGCTCTTCACTGAGATGTCTACTACTGATCTCACCACTTGGAGTTTGATGGTTCGTATC 1626 Query 1627 TATGCTGAAAGTTGTTTCCCTAATGAAGCCATTGGTGTTTTCCGTGAGATTCAAGCTCGA 1686 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1627 TATGCTGAAAGTTGTTGCCCTAATGAAGCCATTGGTGTTTTCCGTGAGATTCAAGCTCGA 1686 Query 1687 GGAATGAGGCCTAACACTGTGACTATAATGAATCTCCTTCCTGTTTGTGCGCAGCTAGCC 1746 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1687 GGAATGAGGCCTAACACTGTGACTATCATGAATCTCCTTCCTGTTTGTGCGCAGCTAGCC 1746 Query 1747 TCTCTGCATCTAGTAAGACAATGTCATGGATATATTATTAGAGGCAGACTTGGTGATATC 1806 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 1747 TCTCTGCATCTAGTAAGACAATGTCATGGATATATTATTAGAGGCGGACTTGGTGATATC 1806 Query 1807 CGCCTGAAGGGGACTCTACTAGATGTATATGCTAAATGTGGCAGCTTGAAGCATGCATAT 1866 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1807 CGCCTGAAGGGGACTCTACTAGATGTATATGCTAAATGTGGCAGCTTGAAGCATGCATAT 1866 Query 1867 TCTGTCTTCCAGTCAGATGCTCGTAGAGATCTGGTTATGTTCACTGCTATGGTAGCTGGG 1926 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1867 TCTGTCTTCCAGTCAGATGCTCGTAGAGATCTGGTTATGTTCACTGCTATGGTAGCTGGG 1926 Query 1927 TATGCTGTACATGGTAGGGGTAAGGAAGCACTTATGATCTTCTCTCATATGATTGACTCA 1986 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| Sbjct 1927 TATGCTGTACATGGTAGGGGCAAGGAAGCACTTATGATCTACTCTCATATGACTGAATCA 1986 Query 1987 AACATAAAGCCCGATCATGTTTTCATAACTACTCTGTTGACTGCATGCTGTCATGC-GGG 2045 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 1987 AACATAAAGCCCGATCATGTTTTCATAACTACTATGTTGACTGCATGCTGTCATGCAGGG 2046 Query 2046 ATTAATACAGGATGGATTGCAAATATATGACTCAATAAGGGCAGTTCACGGTATGAAACC 2105 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 2047 -TTAATACAGGATGGATTGCAAATATATGACTCAATAAGGACAGTTCACGGTATGAAACC 2105 Query 2106 TACAATGGAACAATATGCTTGTGCTGTAGATCTACTTGCTCGAGGGGGTCGACTTGATGA 2165 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2106 TACAATGGAACAATATGCTTGTGCTGTAGATCTAATTGCTCGAGGGGGTCGACTTGATGA 2165 Query 2166 TGCATATTCTTTCATCACACAGATGCCAGTTGAACCCAATGCAAATATATGGGGAACACT 2225 |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 2166 TGCATATTCTTTTGTCACACAGATGCCAGTTGAACCTAATGCAAATATATGGGGAACACT 2225 Query 2226 GTTAAGGGCGTGTACAACCTATAATAGGATGGATCTGGGGCACTCAGTTGCAAATCATCT 2285 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2226 GTTAAGGGCGTGTACAACCTATAATAGGATGGATCTGGGGCACTCAGTTGCAAATCATCT 2285 Query 2286 TTTGCAAGCTGAATCTGACGACACCGGAAACCACGTTCTCATATCGAATATGTATGCTGC 2345 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 2286 CTTGCAAGCTGAATCTGACGACACCGGAAACCACGTTCTAATATCGAATATGTATGCTGC 2345 Query 2346 AGATGCTAAATGGGAAGGCGTGATGGAGTTGAGAAACCTAATGAAGAAAAAGGAAATGAA 2405 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2346 AGATGCTAAATGGGAAGGCGTGATGGAGTTGAGAAACCTAATGAAGAAAAAGGAAATGAA 2405 Query 2406 AAAGCCAGCGGGATGTAGCTGGCTAGAAGTGGATGGGAAAAGGGATGTTTTTGTGTCTGG 2465 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| Sbjct 2406 AAAGCCAGCGGGATGTAGCTGGCTAGAAGTGGATGGGCAAAGGAATGTCTTTGTGTCTGG 2465 Query 2466 AGATTGTTCTCACCCTCGTAGAGACAGTATTTTTGACTTAGTCAATGCTTTATATCTTCA 2525 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 2466 AGATTGTTCTCACCCTCGTAGAGACAGTATTTTTGACTTAGTAAATGCTTTATATCTTCA 2525 Query 2526 GATGAAAGAGCCTGTGGTGTTTTAA 2550 ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2526 GATGAAAGAGCCTGTGGTGTTTTAA 2550 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 126571197189 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5