BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg487868
Length=5455
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G10370.1 | Symbols: | helicase domain-containing protein / ... 8735 0.0
AT4G01020.1 | Symbols: | helicase domain-containing protein / ... 8514 0.0
> AT5G10370.1 | Symbols: | helicase domain-containing protein
/ IBR domain-containing protein / zinc finger protein-related
| chr5:3261245-3267344 FORWARD LENGTH=5484
Length=5484
Score = 8735 bits (4730), Expect = 0.0
Identities = 5246/5490 (96%), Gaps = 56/5490 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGAGGAACTCTTTTCCTCCTTCAGACGGTGGAAGATCGGAGACTGATCGTCGTCAGCAG 60
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAGGAACTCTTTTCCTCCTTCAGACGGTGGAAGATCGGCGACTGATCGTCGTCAGCAG 60
Query 61 TCGTTTCCCTCATCCTCTATGAACCGTTATAACTCTCACTCTGCACAATCATCTCCGCCG 120
|||| || ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||
Sbjct 61 TCGTCTCACTCATCCTCCACGAACCGTTATAACTCTCGCTCTGCACAATCTTCTCCGCCG 120
Query 121 CTCAACCACCGTCCTTCTTGGAACCAGCAACACTCTCAGCACCCTAACTCTAATTTCCCG 180
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||
Sbjct 121 CTCAACCACCGTCCTACTTGGAACCAGCAACACTCTCAGTACCCTAACTCAAATTTCCCG 180
Query 181 CCAAATTACAGGCGTGATCATGTTCCGTCGCCGAGAAT-CTCGTCTCCAGGTT-CGCGGG 238
||||||||||||||||||| | ||||||| || | || |||| ||||| ||| ||||||
Sbjct 181 CCAAATTACAGGCGTGATCGTAATCCGTCGTCG-GGATACTCGCCTCCA-GTTACGCGGG 238
Query 239 CTAGGCCGAATTTCATCGTTCAGCTGCTTCACCCGAGAATTAACGCCGCCGCTAACAGTG 298
|||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 239 CTAGACCTAATTTCATCGTTCAGCTGCTTCACCC---------CGCCGCCGCTAACAGTG 289
Query 299 ACACAAAGCTGTCTTTTTCTTCTAAGGAGCAAGAGATCAAGAGTCTCGCTTTGCTTTGCG 358
|||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 290 ACACAAAGCTGTGTTTTTCGACTAAGAAACAAGAGATCGAGAGTCTCGCTTTGCTTTGCG 349
Query 359 AAATTCCGGAGGAATCTGTTCATGTGCCTCAATTTGGTTGTATCGCCGGAAGTTTCAGTT 418
||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 350 AAATTCCTGAGGAATCAATTCATGTGCCTCAATTTGGTTGTATCGCTGGAAGTTTCAGTT 409
Query 419 TTCGTCAGTGGGTCGATGCGCGCTCTGCCGTTGTGGCTCTTTGGGACAATCGGCTTCAAG 478
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||
Sbjct 410 TTCGTCAGTGGGTCGATGCGCGCTCTGCCGTGGTGGCTCTTTGGGATTATCGACTTCAAG 469
Query 479 GGAAACATGATTTTGTTCCTGAGCTGATTCCTAATGTTATTGTTCCGTCTGACATGAACG 538
|||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 470 GGAAGCATGAGTTTGTTCCTGAGCTGATCCCTAATGTTATTGTTCCGTCTGACATGAACG 529
Query 539 AGCTTAAAGACAGGCTTCGTGATCTTTTCTCTG-CTCATGTTCTTTTGCTTATGGAAAAT 597
||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||
Sbjct 530 AGCTTAAAGACAGGCTTCGTGATCTTTTCTC-GTCTCATATTCTTTCGCTTATGGAAAAT 588
Query 598 GGAGAAGGCGTCAAGAAGGTGAGAATGGAGATAGAGGAGAAGTCTCGTCAAGTTGCGTCC 657
||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 589 GGAGAAGGCGTCAAGAAGGTGAGGTTGGAGATTGAGGAGAAGTCTCGTCAAGTTGTGTCC 648
Query 658 TTTTCGTCTAAAAGGGGTCTTAAATTTGAGGTTTTTGAGAAAAAGAAGGCTATAGAGGCG 717
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 649 TTTTCGTCTAAAAGGGGTCTTAAATTTGAGGTTTTTGAGAAAAAGAAGGCTATAGAGGCT 708
Query 718 GAGAGAGATTTGGTTGTCAATCGGCTTGAAGAATTCAACAATGCCATGAAGAGCATTTTG 777
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 709 GAGAGAGATTTGGTTGTGAATCGGCTTGAAGAATTCAATAATGCCATGAAGAGCATTTTG 768
Query 778 CGATATCTCATAGGACAAGACGGGTATGAGTTTGATTTAGA--A-GAAGAAGACGAAGAC 834
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||
Sbjct 769 CGATATCTCATAGGACAAGACGGGTATGAGTTTGATTTAGATGATGAAGAAGAAGGAGAC 828
Query 835 GTGGCCGTGTTTTGTTTGGAAGGGGCCTATGATTGGAGACGTATTCATTATTTGATTCGT 894
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 829 GTGGCCGTGTTTTGTTTGGAAGGGGCTTATGATTGGAGACGTATTCATTGTTTGATTCGT 888
Query 895 AGAGAGTGTCGAAGGCTAGAGGATGGACTGCCTATCTATGCCTACCGGCGAG-AGATTTT 953
|| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||
Sbjct 889 AGGGAGTGTCGAAGGCTAGAGGATGGACTTCCTATCTATGCCTACCGGCG-GCAGATTTT 947
Query 954 GAAGAGAATTCATTGTGAACAGATAATGGTATTGATTGGAGAAACTGGTTCAGGGAAGAG 1013
||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 948 GAAGAAAATTCATCGTGAACAGATAATGGTGTTGATTGGAGAAACTGGTTCAGGGAAGAG 1007
Query 1014 CACTCAGTTAGTTCAGTTCCTTGCTGATTCCGGAGTTGCTGCTAGTGATTCCATTGTTTG 1073
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||
Sbjct 1008 CACTCAGTTAGTTCAGTTCCTTGCTGATTCCGGAGTTGCTGCTAGTGAGTCGATTGTTTG 1067
Query 1074 TACACAACCACGGAAAATTGCTGCCATGACATTGGCTGATCGGGTCAGAGAAGAAAGCAG 1133
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1068 TACACAACCACGGAAGATTGCTGCCATGACATTGGCTGATCGGGTCAGAGAAGAAAGCAG 1127
Query 1134 TGGTTGTTATGAGGAAAATACTG-TCCGTTGTACTCCAACTTTTTCGTCTACTGAGCAGA 1192
||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1128 TGGTTGTTATGAGGAAAATACTGTTTC-TTGTACTCCAACTTTTTCGTCTACTGAGGAGA 1186
Query 1193 TTAGTTCCAAAGTTGTATACATGACGGATAATTGTCTGCTTCAGCACTACAT-AAGAGAT 1251
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||
Sbjct 1187 TTAGTTCCAAAGTTGTATACATGACGGATAATTGTCTGCTTCAGCACTACATGAA-AGAT 1245
Query 1252 CGTAGCTTGTCTGGCATTTCATGTGTTATTATTGACGAAGCTCATGAAAGAAGCTTAAAC 1311
|| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1246 CGGAGTTTGTCTGGCATTTCATGTGTTATTATTGACGAAGCTCATGAAAGAAGCTTAAAC 1305
Query 1312 ACGGACCTTCTTTTGGCATTGCTCAAAGAGTTGCTATCCAGAAGGATTGACCTGAGGCTC 1371
||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1306 ACGGACCTTCTGTTGGCATTGCTTAAAAAGTTGCTATCCAGAAGGATTGACCTGAGGCTT 1365
Query 1372 GTAATCATGTCTGCCACGGCCGATGCCCACCAACTTTCACAGTATTTCTTCAGTTGTGGT 1431
||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1366 GTAATCATGTCTGCCACGGCCGATGCCAAACAACTTTCACAGTATTTCTTCAGTTGTGGT 1425
Query 1432 ATTCTTCCTGTCAATGGGAGGAACTTTCCGGTGGAGATTGTATATTCCCCTAGTGACACA 1491
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1426 ATTCTTCTTGTCAATGGGAGGAACTTTCCGGTGGAGATTGTATATTCCCCTAGTGACACA 1485
Query 1492 GAAGAGACTTCTGTTGTTGGCGGCATTGCTTCATATGTTGGTGATGTTGTTAAGATGGCA 1551
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||
Sbjct 1486 GAAGAGAATTCTGTTGTTGGCGGCATTGCTTCATATGTTGGCGATGTTGTTAAAATGGCA 1545
Query 1552 GTGGAAATACATAAAACAGAGAAAGAAGGAACCATCCTTGCATTCTTGACTTCCCAAGTA 1611
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1546 GTGGAAATACATAAAACAGAGAAAGAAGGAACCATCCTTGCATTCTTGACTTCCCAAGCA 1605
Query 1612 GAAGTAGAATGGGCATGCGAAAGGTTTATAGCTCCGTCTGCAATTGCTTTGCCTTTGCAT 1671
|| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1606 GAGGTAGAATGGGCATGCGAAAGGTTTATAACTCCGTCTGCAATTGCTTTGCCTTTGCAT 1665
Query 1672 GGAAAGCTTTCCTTCGAAGAACAATTTAGGGTTTTCCAGAACCATCCTGGGAGACGAAAA 1731
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1666 GGAAAGCTTTCCTTCGAAGAACAGTTTAGGGTTTTCCAGAACCATCCTGGGAGACGGAAA 1725
Query 1732 GTGATATTTGCCACAAATATTGCAGAGACGTCGCTGACTATTCCTGGTGTCAAGTATGTA 1791
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1726 GTGATATTTGCCACAAATATTGCAGAGACGTCGCTGACTATTCCTGGTGTCAAGTATGTA 1785
Query 1792 ATTGATTCCGGGATGGTGAAAGAGAGTAAATATGAACCTAGAACGGGTATGAGCATCCTC 1851
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1786 ATTGATTCCGGGATGGTGAAAGAGAGTAAATATGAACCTAGAACGGGGATGAGCATCCTC 1845
Query 1852 AAGGTGTGCCAGGTCAGTCAGAGTTCTGCTCGACAACGTGCTGGTCGTGCTGGAAGGACA 1911
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1846 AAGGTGTGCCGGGTCAGTCAGAGTTCTGCTCGACAACGTGCTGGTCGTGCTGGAAGGACA 1905
Query 1912 GAACCCGGACGATGTTACAGACTCTACTCAAAAAATGATTTTGATTCATTGAATCTTAGT 1971
||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |
Sbjct 1906 GAACCCGGAAGATGTTACAGACTCTACTCAAAAAACGATTTTGATTCAATGAATCTTAAT 1965
Query 1972 CAGGAACCTGAAATTCGGAGGGTCCATCTTGGTGTAGCACTTTTAAGGATGCTTGCTCTG 2031
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1966 CAGGAACCAGAAATTCGGAGGGTCCATCTTGGTGTAGCACTTTTGAGGATGCTTGCTCTG 2025
Query 2032 GGTGT-AGACAACATAG-ATGCTTTTGACTTTATTGACGCGCCTGTCCCGGAAGCCATTG 2089
||||| | ||||||||| | | ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2026 GGTGTCA-ACAACATAGCA-GAATTTAACTTTGTTGATGCGCCTGTCCCGGAAGCCATTG 2083
Query 2090 CAATGGCTGTCCAAAATCTTGTTCAGTTGGGTGCAGTCGTTGTGAAGAACGGTGTTCTTG 2149
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||
Sbjct 2084 CAATGGCTGTCCAAAATCTTGTTCAGTTGGGTGCAGTTGTTGAGAAGAACGGTGTTCATG 2143
Query 2150 AATTAACACAGGAAGGGCATTGTTTAGTCAAGCTGGGGCTGGAGCCAAAGCTTGGAAAGT 2209
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2144 AATTAACACAGGAAGGGCATTGTTTAGTCAAGCTGGGGCTGGAGCCAAAGCTTGGAAAGT 2203
Query 2210 TAATTTTAGGCTGCTTCAGACACAGAATGGGCAAAGAGGGGATTGTTCTTGCTGCTGTCA 2269
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2204 TAATTTTAGGCTGCTTCAGACACAGAATGGGCAAAGAGGGGATTGTTCTTGCTGCTGTCA 2263
Query 2270 TGGCTAATGCTACTAGTATATTTTGTAGAGTTGGCAGCTTCGATGATAAGATGAAAGCTG 2329
|||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2264 TGGCTAATGCTAGTAGTATATTTTGCAGAGTTGGCAACTTCGATGATAAGATGAAAGCTG 2323
Query 2330 ATCGCCTAAAGGTGCAATTCTGCAATCATAATGGAGACTTGTTCACTCTTCTTTCGGTGT 2389
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2324 ATCGCCTAAAGGTGCAATTCTGCAATCAGAATGGAGACTTGTTCACTCTTCTTTCGGTGT 2383
Query 2390 ACAAAGCATGGGCATCTCTGCCGCGAGAGAGAAGAAATAAATGGTGCTGGGAAAATAGCC 2449
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2384 ACAAAGAATGGGCATCTCTGCCGCGAGAGAGAAGAAATAAATGGTGCTGGGAAAATAGCC 2443
Query 2450 TGAATGCCAAATCAATGAGGAGATGTGAAGACACAGTCAAGGAATTGGAGATATGCATTG 2509
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2444 TGAATGCCAAATCAATGAGGAGATGTGAAGACACAGTCAAGGAATTGGAGATATGCATTG 2503
Query 2510 AGAGAGAACTTACTCTTGTCAGTCCTAGTTACTGGGTTTGGAATCCAAATGAGGGTACTA 2569
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2504 AGAGAGAACTTACTCTTGTCAGTCCTAGTTACTGGGTTTGGAATCCAAATGAGGGTACTA 2563
Query 2570 AACACGACAAGCATTTGAAAATGGTTATACTTGCATCTCTTGCAGAAAACGTGGCGATGT 2629
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2564 AACACGACAAGCATTTGAAAATGGTTATACTTGCATCTCTTGCAGAAAACGTGGCGATGT 2623
Query 2630 ACACTGGCTATGATCAGCTTGGATACGAGGTGGCATTGACTGGTCAACAAGTTCAGTTAC 2689
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2624 ACACTGGCTATAATCAGCTTGGATACGAGGTGGCATTGACTGGTCAACAAGTTCAGTTAC 2683
Query 2690 ATCCATCGTGTTCATTGCTAGCATTTGGCCAGAAGCCAAGCTGGGTTGTTTTCGGTGAAC 2749
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2684 ATCCATCGTGTTCATTGCTAGCATTTGGCCAGAAGCCAAGCTGGGTTGTTTTCGGTGAAC 2743
Query 2750 TTCTATCTATTGTGGACCAGTACTTGGTATGTGTAACTGCGTTTGATTTTGAAGCTTTGT 2809
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2744 TTCTATCTATTGTGGACCAGTACTTGGTATGTGTAACTGCGTGTGATTTTGAAGCTTTGT 2803
Query 2810 ATATGCTTGATCCACCACCACCTTTTGATGCATCCCAGATGGATGAGCGGAGGCTCCGAG 2869
|||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2804 ATATGCTTGATCCACCACCACCTTTTGACGTATCCCAGATGGATGAGCGGAGGCTCCGAA 2863
Query 2870 TGAAAAAAGTGGTTGGTTGTAGCAGCACTGTGCTAAAACGATTATGTGGGAAATCTAATC 2929
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2864 TTAAAAAAGTGGTTGGTTGTAGCAGCACTGTGCTAAAACGATTCTGTGGGAAATCTAATC 2923
Query 2930 GTAGTCTGCTTTCAATTGTTTCTCGTGCTAGGTCTCTTTGTTCGGATGAAAGGATTGGTA 2989
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2924 GTAGTCTGCTTTCAATTGTTTCTCGTGCTAGGTCTCTTTGTTCGGATGAAAGGATTGGTA 2983
Query 2990 TTCAAGTCGATGTTGATCAGAATGAGATTCTACTGTATGCGCCTCCCCTCGACATGGAAA 3049
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2984 TTCAAGTCGATGTTGATCAGAATGAGATTCGACTGTATGCGCCTCCCCTCGACATGGAAA 3043
Query 3050 AAGTGTCAGCCCTTGTGAACGATGCATTGGAATGTGAAAAGAAATGGATGCGTAATGAAT 3109
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3044 AAGTGTCAGCCCTTGTGAACGATGCATTGGAATGTGAAAAGAAATGGATGCATAATGAAT 3103
Query 3110 GTTTGGAGAAGTATCTATTTCATGGTCGGGGACAAGTACCTATTGCACTGTTTGGATCTG 3169
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3104 GTTTGGAGAAGTATCTATATCATGGTCGGGGACAAGTACCTATTGCACTGTTTGGATCTG 3163
Query 3170 GTGCTCAGATAAAGCATCTTGAAGTTGATCAGAGATTTCTGACAGTCGATGTACTTTATT 3229
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3164 GTGCTCAGATAAAGCATCTTGAAGTTGATCAGAGATTTCTGACAGTCGATGTACTTTATT 3223
Query 3230 ATGGCGATAATTTTGTTGATGACAGAGAGCTTCTGTCGTTTCTGGAGAAGAAGATTGATG 3289
|||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3224 ATGGCGATGATGTTGTTGATGACAGAGAGCTTCTGACGTTTCTGGAGAAGAAGATTGATG 3283
Query 3290 GGTGTATTTGCTCTATTTACAAGTTTGCTGCGAACAAGCAAGACTGTGATGAGAAGGAGA 3349
||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3284 GGTCTATTTGCTCTATATACAAGTTTGCTGCGAACAAGCAAGACTGTGATGAGAAGGAGA 3343
Query 3350 AGTGGGGTAGAATAACCTTTCTCACTCCAGAATCTGCTATGAAGGCAACAGAAATTCAGA 3409
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3344 AGTGGGGTAGAATAACCTTTCTCACTCCAGAATCTGCTATGAAGGCAACAGAAATTCAGA 3403
Query 3410 AATTTGATTTCAAAGGATCAGTGCTTAAATTATTTCCATCACTGTCAACTGGTGGAGGAA 3469
||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3404 AATTTTATTTCAAAGGATCAGTGCTCAAATTATTTCCATCACTGTCAACTGGTGGAGGAA 3463
Query 3470 TTTTCAAGATGCCTTCTTTCCCTTCCGTGACAGCTAAGATTCGTTGGCCGAGAAAGGAAA 3529
||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3464 TTTTCAAGATGCCTTATTTCTCTTCCGTGACAGCTAAGATTCGTTGGCCGAGAAGGGAAA 3523
Query 3530 GCAGTGGTAGAGGATGTCTTAAGTGCCCTTCCGGAGATATTCACAGTATAATTGGTGGGA 3589
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |
Sbjct 3524 GCAGTGGTAGAGGATGTCTTAAGTGCCCTTCCGGAGATATTCACCGTATACTTGGTGATA 3583
Query 3590 TATCCAACCTTGTGATTGGAACAAATTATGTCAATATTCAGAGAGATCAACGGTCCAATG 3649
|||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||
Sbjct 3584 TATCCAGCCTTGAGATAGGAACAAATTATGTCCATATTCAGAGAGATCAACAGTCAAATG 3643
Query 3650 ATTCTATCTTGATAAGTGGACTTGGAGATCTTTCAGAAGCAGAAGTTTTAGATGTTTTGG 3709
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3644 ATTCTATCTTGATAAGTGGACTTGGAGATCTTTCGGAAGCAGAAGTTTTAGATGTTTTGG 3703
Query 3710 AGTTG-GAAACGAAGAGAAGAGATCTGAATTTTTTCATATTCAGAAAAAA---CAGTGTG 3765
| || ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3704 AATTCAGAA-CGCAGAGAAGAGATCTGAATTTTTTCATATTCAGAAAAAAATACAGTGTG 3762
Query 3766 CAGTGCCCATCTCCTACTGCTTGCGAAGAAGAGCTTCATAAGAGAATATTTGCGCGCATG 3825
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3763 CAGTGCCCATCTCCTACTGCTTGCGAAGAAGAGCTTCATAAGAGAATATTTGCGCGCATG 3822
Query 3826 TCAGCAAAGAATCCAGAGCCAAACTGTGTCCAAGTCCAAGTTTTTGAACCAAAAGAAGAC 3885
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3823 TCAGCAAAGAATCCAGAGCCAAACTGTGTCCAAGTTCAAGTTTTTGAACCAAAAGAAGAC 3882
Query 3886 AATTATTTCATGCGAGCGTTGATTACGTTTGACGGGAGATTACATTTGGAAGCTGCAAAA 3945
||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3883 AATTACTTCATGCGAGCGTTAATTAAGTTTGACGGGAGATTACATTTCGAAGCTGCAAAA 3942
Query 3946 GCTTTGCAAGAGTTAAATGGGGAGGTGCTACCTGGATGTCTTCCATGGCAGAAGATAAAG 4005
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3943 GCTTTGCAAGAGTTAAATGGGGAGGTGCTACCTGGATGTCTTCCATGGCAGAAGATAAAG 4002
Query 4006 TGCGAACAATTGTTTCAGAGCTCCATAATCTGCTCCGCTGCTATCTACAACACTGTCAAA 4065
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 4003 TGCGAACAATTGTTTCAGAGCTCCATAATCTGCTCCGCTTCTATCTACAACACTGTCAAA 4062
Query 4066 AGACAATTGAACGTTTTATTAGCAAGCTTTGAGAGACAACAAGGGGGT-ATATGGC-GTC 4123
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||| | |||
Sbjct 4063 AGACAATTGAACGTTTTATTAGCAAGGTTTGAGAGACAAAAAGGGGGTGA-ATG-CTGTC 4120
Query 4124 TGGAACCAACTCATAACGGGGCTTATCGTGTTAAAATTATTGCTTATGCAACAAGACCCG 4183
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 4121 TGGAACCAACTCATAACGGGGCTTATCGTGTTAAAATTACTGCTTATGCAACAAGACCCG 4180
Query 4184 TTGCGGAGATGCGGAGAGAACTTGAAGAACTCTTAAGAGGAAGACCTATTAACCATCCAG 4243
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||
Sbjct 4181 TTGCGGAGATGCGGAGAGAACTTGAAGAACTCTTAAGAGGAAGACCCATAAACCATCCAG 4240
Query 4244 GCTTAACCCCTAGAGTCCTGCAGCATCTTATGTCCAGAGATGGTATTAATCTGATGCGGA 4303
|||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4241 GCTTCACACGTAGAGTCCTGCAGCATCTTATGTCCAGAGATGGTATTAATCTGATGCGGA 4300
Query 4304 AGATCCAACAGGAGACAGAAACTTACATTGTATTAGACAGGCACAATCTCACAGTACGAA 4363
||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |
Sbjct 4301 AGATCCAGCAGGAGACAGAAACTTACATTCTATTAGATAGGCACAATCTCACAGTACGCA 4360
Query 4364 TTTGTGGATCAAGTGAGAAAATTGCCAAGGCAGAACAAGAACTGGTTCAATCACTTATGG 4423
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||
Sbjct 4361 TTTGTGGAACAAGTGAGAAAATTGCCAAGGCAGAACAAGAACTGATTCAGGCACTTATGG 4420
Query 4424 CTTATCATGAGAGCAAGCAACTTGAAATCCACCTCCGAGGTCCTGAGATCCGTCCTGACC 4483
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4421 ATTATCATGAGAGCAAGCAACTTGAAATCCACCTCCGAGGTCCTGAGATCCGTCCTGACC 4480
Query 4484 TCATGAAGGAAGTTGTGAAGCGGTTTGGTCCGGAGCTTCAAGGTATCAAAGAAAAGGTAC 4543
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
Sbjct 4481 TCATGAAGGAAGTTGTGAAGCGGTTTGGTCCGGAGCTCCAAGGTATCAAAGAAAAGGTGC 4540
Query 4544 ATGGTGTGGATCTCAAGCTCAACACCCGGTACCATGTTATTCAGGTTCATGGGAGCAGAG 4603
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 4541 ATGGTGTGGATCTCAAGCTCAACACCCGGTACCATGTTATTCAGGTTCATGGGAGCAAAG 4600
Query 4604 AAATGAGGCAGGAAGTACAAAAGATGGTCGATGAACTTGCACGAGAAAAGAGTGCACTGG 4663
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4601 AAATGAGGCAGGAAGTACAAAAGATGGTCAATGAACTTGCACGAGAAAAGAGTGCACTGG 4660
Query 4664 GTGAAAAACCAGATGACATTGAAGTTGAATGCCCCATTTGCTTGTCTGAAGTTGATGATG 4723
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4661 GTGAAAAACCAGATGAGATTGAAGTTGAATGCCCCATTTGCTTGTCTGAAGTTGATGATG 4720
Query 4724 GCTACTCTCTTGAAGGATGTTCACACCTCTTCTGCAAAGCTTGTTTGTTGGAGCAATTTG 4783
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4721 GCTACTCTCTTGAAGGATGTTCACACCTCTTCTGCAAAGCTTGTTTGTTGGAGCAATTTG 4780
Query 4784 AGGCATCGATGAGAAACTTTGACGCATTCCCAATACTTTGTTCTCACATAGACTGTGGAG 4843
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4781 AGGCATCGATGAGAAACTTTGACGCATTCCCAATACTTTGTTCTCACATAGACTGTGGAG 4840
Query 4844 CTCCAATAGTACTGGCTGATATGAGAGCCCTCTTATCACAAGAGAAGCTCGATGAACTCT 4903
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4841 CTCCAATAGTACTCGCTGATATGAGAGCCCTCTTATCACAAGAGAAGCTCGATGAACTCT 4900
Query 4904 TCAACGCATCCTTGTCCTCTTTTGTAACATCTAGTGATGGAAAGTTCAGGTTTTGCTCCA 4963
||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4901 TCAGCGCATCCTTGTCCTCTTTTGTAACATCCAGTGATGGAAAGTTCAGGTTTTGCTCCA 4960
Query 4964 CACCTGATTGCCCTTCCATCTACCGTGTAGCTGGACCTCAAGAATCCGGCGAGCCATTCA 5023
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||
Sbjct 4961 CACCTGATTGCCCTTCCGTCTACCGTGTAGCTGGACCTCAAGAATCTGGTGAGCCATTCA 5020
Query 5024 TCTGTGGAGCATGTCACTCGGAAACATGCACAAGGTGTCACCTCGAGTATCACCCGTTAA 5083
||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5021 TCTGTGGAGCATGTCACTCAGAAATATGCACAAGGTGTCACCTCGAGTATCACCCGTTAA 5080
Query 5084 TCACTTGTGAAAGGTACAAAAAGTTCAAGGAAAATCCAGACTTGTCCCTTAAGGACTGGG 5143
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||
Sbjct 5081 TCACTTGTGAAAGGTACAAAAAGTTCAAGGAAAATCCGGACTTGTCGCTAAAGGACTGGG 5140
Query 5144 CAAAAGGGAAGGACGTAAAGGAGTGTCCGATTTGCAAGTCGACGATAGAGAAGTCTGATG 5203
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 5141 CAAAAGGGAAGAACGTAAAGGAGTGTCCGATTTGCAAGTCGACGATAGAGAAGACTGATG 5200
Query 5204 GGTGTAACCATCTGCAGTGCCGGTGTGGAAAGCACATTTGCTGGACCTGCTTAGACGTCT 5263
||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 5201 GGTGTAACCATATGAAGTGCCGGTGTGGAAAGCACATTTGTTGGACCTGCTTAGACGTCT 5260
Query 5264 TCACTCAAGCAGAACCTTGTTATGCCCATTTAAGGACAATTCATGGTGGAATCGGATTGG 5323
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 5261 TCACTCAAGAAGAACCTTGTTATGCCCATTTAAGGACAATTCATGGTGGAATCGGATTAG 5320
Query 5324 CCGAGTTAGGTGTCCCGGTGGAC----T-----AG---GAC----C-GGACCCATGTATC 5366
||||| ||||||||| | |||| | || ||| | ||||| |||||||
Sbjct 5321 TCGAGTAAGGTGTCCCAGAGGACCCCGTTGCCCAGCCCGACTAGACCGGACCTATGTATC 5380
Query 5367 TATATTCTGTTACATCTGGTTTGCTTAATGTGTATATATGTGATCATTAGCGTAGTTCGG 5426
|||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| || || |||||||||
Sbjct 5381 TATATTCTGTAACATCTGGTATGCTTAATGTGTACATATGTGAAGAT-AGTGTAGTTCGG 5439
Query 5427 TA-TTGTACCTTCTTTAACCAACTGAAAAA 5455
|| || ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5440 TAGTTATACCTTCTTTAACCAACTGAAAAA 5469
> AT4G01020.1 | Symbols: | helicase domain-containing protein
/ IBR domain-containing protein / zinc finger protein-related
| chr4:439086-445168 FORWARD LENGTH=5489
Length=5489
Score = 8514 bits (4610), Expect = 0.0
Identities = 5116/5357 (96%), Gaps = 48/5357 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGAGGAACTCTTTTCCTCCTTCAGACGGTGGAAGATCGGA-GACTGATCGTCGTCAGCA 59
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAGGAACTCTTTTCCTCCTTCAGACGGTGGGAGATC-GACGACTGATCGTCGTCAGCA 59
Query 60 GTCGTTTCCCTCATCCTCTATGAACCGTTATAACTCTCACTCTGCACAATCATCTCCGCC 119
|||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||
Sbjct 60 GTCGTTTCCCTCATCCTCAACGAACCGTTATAACTCTCGCTCTGCACAATCTTCTCCGCC 119
Query 120 GCTCAACCACCGTCCTTCTTGGAACCAGCAACACTCTCAGCACCCTAACTCTAATTTCCC 179
|||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||
Sbjct 120 GCTCAACCACTGTACTACTTGGAACCAGCAACACTCTCAGTACCATAACACTAATTTCCC 179
Query 180 GCCAAATTACAGGCGTGATCATGTTCCGTCGCCGAGAATCTCGT-CTCCAGGT-TCGCGG 237
|||||||||||| ||||||| || ||||||| || || |||| | ||||| || |||||
Sbjct 180 GCCAAATTACAGACGTGATCGTGCTCCGTCGTCGGGATTCTC-TCCTCCA-GTCACGCGG 237
Query 238 GCTAGGCCGAATTTCATCGTTCAGCTGCTTCACCCGAGAATTAACGCCGCCGCTAACAGT 297
|||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 238 GCTAGGCCTAATTTCATCGTTCAGCTGCTTCACCC---------CGCCGCCGCTAACAGT 288
Query 298 GACACAAAGCTGTCTTTTTCTTCTAAGGAGCAAGAGATCAAGAGTCTCGCTTTGCTTTGC 357
|||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 289 GACACAAAGCTG---------TCTAAGAAGCAAGAGATCGAGAGTATCGCTTTGCTTTGC 339
Query 358 GAAATTCCGGAGGAATCTGTTCATGTGCCTCAATTTGGTTGTATCGCCGGAAGTTTCAGT 417
||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||
Sbjct 340 GAAATTCCGGAGGAATCAGTTCACGTGCCTCAATTTGGTTGTATCGCTGCAAGCTTCAGT 399
Query 418 TTTCGTCAGTGGGTCGATGCGCGCTCTGCCGTTGTGGCTCTTTGGGACAATCGGCTTCAA 477
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||
Sbjct 400 TTTCGTCAGTGGGTCGATGCGCGTTCTGCCGTTGTGGCTCTTTGGGATTATCGTCTTCAA 459
Query 478 GGGAAACATGATTTTGTTCCTGAGCTGATTCCTAATGTTATTGTTCCGTCTGACATGAAC 537
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct 460 GGGAGACATGATTTTGTTCCTGAGCTGATTCCTAATGTTGTTGTTCCGTCTGACATGGAC 519
Query 538 GAGCTTAAAGACAGGCTTCGTGATCTTTTCTCTG-CTCATGTTCTTTTGCTTATGGAAAA 596
|||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 520 GAGCTTAAAGACAGGCTTCGTGATCTTTTCTC-GTCTCATGTTCTTTCGCTTATGGAAAA 578
Query 597 TGGAGAAGGCGTCAAGAAGGTGAGAATGGAGATAGAGGAGAAGTCTCGTCAAGTTGCGTC 656
|||| |||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||
Sbjct 579 TGGACAAGGGGTCAAGAAGGTGAGAATGGAGATTGATGACAAGTCTCGTCAAGTTGCGTC 638
Query 657 CTTTTCGTCTAAAAGGGGTCTTAAATTTGAGGTTTTTGAGAAAAAGAAGGCTATAGAGGC 716
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||
Sbjct 639 CTTTTCGTCTAAAAGGGGTCTGAAATTTGAGGTTTTTGAGAAAAAGAAGGCTCTTGAAGC 698
Query 717 GGAGAGAGATTTGGTTGTCAATCGGCTTGAAGAATTCAACAATGCCATGAAGAGCATTTT 776
|||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 699 GGAGAGAGATTTGGTTGTGAATCGGCTTGACGAATTCAATAATGCCATGAAGAGCATTTT 758
Query 777 GCGATATCTCATAGGACAAGACGGGTATGAGTTTGATTTAGA--A-GAAGAAGACGAAGA 833
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||
Sbjct 759 GCGATATCTCATAGGACAAGACGGGTATGAGTTTGATGTAGATGATGAAGATGACGAAGA 818
Query 834 CGTGGCCGTGTTTTGTTTGGAAGGGGCCTATGATTGGAGACGTATTCATTATTTGATTCG 893
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 819 CGTGGCCGTGTTTTCTTTGGAAGGGGCCTATGATTGGAGACGTATTCATTATTTGATTCT 878
Query 894 TAGAGAGTGTCGAAGGCTAGAGGATGGACTGCCTATCTATGCCTACCGGCGAG-AGATTT 952
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||
Sbjct 879 TAGAGAGTGTCGAAGGCTAGAGGATGGACTGCCTATCTATGCCTACCGGCG-GCAGATTT 937
Query 953 TGAAGAGAATTCATTGTGAACAGATAATGGTATTGATTGGAGAAACTGGTTCAGGGAAGA 1012
|||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 938 TGAAGAAAATTCATTGTGAACAGATAATGGTGTTGATTGGAGAAACTGGTTCAGGGAAGA 997
Query 1013 GCACTCAGTTAGTTCAGTTCCTTGCTGATTCCGGAGTTGCTGCTAGTGATTCCATTGTTT 1072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||
Sbjct 998 GCACTCAGTTAGTTCAGTTCCTTGCTGATTCCGGAGTTGCTGCTAGTGAGTCGATTGTTT 1057
Query 1073 GTACACAACCACGGAAAATTGCTGCCATGACATTGGCTGATCGGGTCAGAGAAGAAAGCA 1132
|||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1058 GTACACAACCACGGAAGATTGCTGCCATGACATTGACTGATCGGGTCAGAGAAGAAAGCA 1117
Query 1133 GTGGTTGTTATGAGGAAAATACTG-TCCGTTGTACTCCAACTTTTTCGTCTACTGAGCAG 1191
|||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1118 GTGGTTGTTATGAGGAAAATACTGTTTC-TTGTACTCCAACTTTTTCGTCTACTGAGGAG 1176
Query 1192 ATTAGTTCCAAAGTTGTATACATGACGGATAATTGTCTGCTTCAGCACTACAT-AAGAGA 1250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||
Sbjct 1177 ATTAGTTCCAAAGTTGTATACATGACGGATAATTGTCTGCTTCAGCACTACATGAA-AGA 1235
Query 1251 TCGTAGCTTGTCTGGCATTTCATGTGTTATTATTGACGAAGCTCATGAAAGAAGCTTAAA 1310
||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1236 TCGGAGTTTGTCTGGCATTTCATGTGTTATTATTGACGAAGCTCATGAAAGAAGCTTAAA 1295
Query 1311 CACGGACCTTCTTTTGGCATTGCTCA-AAGAGTTGCTATCCAGAAGGATTGACCTGAGGC 1369
|||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1296 CACGGACCTTCTTTTGGCATTGCTTAGAA-AGTTGCTATCCAGAAGGATTGACCTGAGGC 1354
Query 1370 TCGTAATCATGTCTGCCACGGCCGATGCCCACCAACTTTCACAGTATTTCTTCAG-TTGT 1428
| || ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||
Sbjct 1355 TTGTTATCATGTCTGCCACGGCTGACGCCAACCAACTTTCACAGTATTTGTTC-GATTGT 1413
Query 1429 GGTATTCTTCCTGTCAATGGGAGGAACTTTCCGGTGGAGATTGTATATTCCCCTAGTGAC 1488
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1414 GGTATTCTTCATGTCAATGGGAGGAACTTTCCGGTGGAGATTGTATATTCCCCTAGTGGC 1473
Query 1489 ACAGAAGAGACTTCTGTTGTTGGCGGCATTGCTTCATATGTTGGTGATGTTGTTAAGATG 1548
|||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1474 ACAGAAGAGAATTCTGTTGTTGGCCGCATTGCTTCATATGCTGGTGATGTTGTTAAGATG 1533
Query 1549 GCAGTGGAAATACATAAAACAGAGAAAGAAGGAACCATCCTTGCATTCTTGACTTCCCAA 1608
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1534 GCAGTGGAAATACATAAAACAGAGAAAGAAGGAACCATCCTTGCATTCTTGACTTCCCAA 1593
Query 1609 GTAGAAGTAGAATGGGCATGCGAAAGGTTTATAGCTCCGTCTGCAATTGCTTTGCCTTTG 1668
| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1594 GCAGAGGTAGAATGGGCATGCGAAAGGTTTGTAGCTCCGTCTGCAATTGCTTTGCCTTTG 1653
Query 1669 CATGGAAAGCTTTCCTTCGAAGAACAATTTAGGGTTTTCCAGAACCATCCTGGGAGACGA 1728
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1654 CATGGAAAGCTTTCCTTCGAAGAACAATTTATGGTTTTCCAGAACTATCCTGGGAGACGA 1713
Query 1729 AAAGTGATATTTGCCACAAATATTGCAGAGACGTCGCTGACTATTCCTGGTGTCAAGTAT 1788
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1714 AAAGTGATATTTGCCACGAATATTGCAGAGACGTCGCTGACTATTCCTGGTGTCAAGTAT 1773
Query 1789 GTAATTGATTCCGGGATGGTGAAAGAGAGTAAATATGAACCTAGAACGGGTATGAGCATC 1848
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1774 GTAATTGATTCCGGGATGGTGAAAGAGAGTAAATATGAACCTAGAACGGGTATGAGCATC 1833
Query 1849 CTCAAGGTGTGCCAGGTCAGTCAGAGTTCTGCTCGACAACGTGCTGGTCGTGCTGGAAGG 1908
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1834 CTAAAGGTGTGCCAGGTCAGTCAGAGTTCTGCTCGACAACGTGCTGGTCGTGCTGGAAGG 1893
Query 1909 ACAGAACCCGGACGATGTTACAGACTCTACTCAAAAAATGATTTTGATTCATTGAATCTT 1968
|||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||
Sbjct 1894 ACAGAACCCGGAAGATGTTACAGGCTCTACTCAAAAACCGATTTTGATTCAATGAATCTT 1953
Query 1969 AGTCAGGAACCTGAAATTCGGAGGGTCCATCTTGGTGTAGCACTTTTAAGGATGCTTGCT 2028
| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1954 AATCAAGAACCTGAAATTCGGAGGGTCCATCTTGGTGTAGCACTTTTGAGGATGCTTGCT 2013
Query 2029 CTGGGTGTAGACAACATAGATGCTTTTGACTTTATTGACGCGCCTGTCCCGGAAGCCATT 2088
|||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2014 TTGGGAATAGACAACATAGCGGCTTTTGAGTTTGTTGACGCGCCTGTCCCGGAAGCCATT 2073
Query 2089 GCAATGGCTGTCCAAAATCTTGTTCAGTTGGGTGCAGTCGTTGTGAAGAACGGTGTTCTT 2148
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2074 GCAATGGCTATCCAAAATCTTGTTCAGTTGGGTGCAGTCGTTGAGAAGAACGGTGTTCTT 2133
Query 2149 GAATTAACACAGGAAGGGCATTGTTTAGTCAAGCTGGGGCTGGAGCCAAAGCTTGGAAAG 2208
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2134 GAATTAACACAGGAAGGGCATTGTTTAGTCAAGCTGGGGCTGGAACCAAAGCTTGGAAAG 2193
Query 2209 TTAATTTTAGGCTGCTTCAGACACAGAATGGGCAAAGAGGGGATTGTTCTTGCTGCTGTC 2268
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2194 TTAATTTTAGGCTGCTTCAGACACAGAATGGGCAAAGAGGGGATTGTTCTTGCTGCTGTC 2253
Query 2269 ATGGCTAATGCTACTAGTATATTTTGTAGAGTTGGCAGCTTCGATGATAAGATGAAAGCT 2328
||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2254 ATGGCTAATGCTAGTAGTATATTTTGCAGAGTTGGTAACTTTGATGATAAGATGAAAGCT 2313
Query 2329 GATCGCCTAAAGGTGCAATTCTGCAATCATAATGGAGACTTGTTCACTCTTCTTTCGGTG 2388
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2314 GATCGCCTAAAGGTGCAATTCTGCAATGATAATGGAGACTTGTTCACTCTTCTTTCGGTG 2373
Query 2389 TACAAAGCATGGGCATCTCTGCCGCGAGAGAGAAGAAATAAATGGTGCTGGGAAAATAGC 2448
||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2374 TACAAAGAATGGGCATCTCTGCCACGAGATAGAAGAAATAAATGGTGCTGGGAAAATAGC 2433
Query 2449 CTGAATGCCAAATCAATGAGGAGATGTGAAGACACAGTCAAGGAATTGGAGATATGCATT 2508
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2434 CTGAATGCCAAATCAATGAGGAGATGTGAAGACACAGTCAAGGAATTGGAGATATGCATT 2493
Query 2509 GAGAGAGAACTTACTCTTGTCAGTCCTAGTTACTGGGTTTGGAATCCAAATGAGGGTACT 2568
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2494 GAGAGAGAACTTACTCTTGTCAGCCCTAGTTACTGGGTTTGGAATCCAAATGAGGGTACT 2553
Query 2569 AAACACGACAAGCATTTGAAAATGGTTATACTTGCATCTCTTGCAGAAAACGTGGCGATG 2628
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2554 AAACACGACAAGTATTTGAAAATGGTTATACTTGCATCTCTTGCAGAAAACGTGGCGATG 2613
Query 2629 TACACTGGCTATGATCAGCTTGGATACGAGGTGGCATTGACTGGTCAACAAGTTCAGTTA 2688
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2614 TACACTGGCTATGATCAGCTTGGATACGAGGTGGCATTGACTAGTCAACAAGTTCAGTTA 2673
Query 2689 CATCCATCGTGTTCATTGCTAGCATTTGGCCAGAAGCCAAGCTGGGTTGTTTTCGGTGAA 2748
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2674 CATCCATCGTGTTCATTGCTAGCATTTGGCCAGAAGCCAAGCTGGGTTGTTTTCGGGGAA 2733
Query 2749 CTTCTATCTATTGTGGACCAGTACTTGGTATGTGTAACTGCGTTTGATTTTGAAGCTTTG 2808
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2734 CTTCTATCTATTGTGGACCAGTACTTGGTATGTGTAACTGCGTTTGATTTTGAAGCTTTG 2793
Query 2809 TATATGCTTGATCCACCACCACCTTTTGATGCATCCCAGATGGATGAGCGGAGGCTCCGA 2868
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2794 TATATGCTTGATCCACCACCACCTTTTGATGCATCCCAGATGGATGAGCGGAGGCTCCGA 2853
Query 2869 GTGAAAAAAGTGGTTGGTTGTAGCAGCACTGTGCTAAAACGATTATGTGGGAAATCTAAT 2928
|| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2854 GTTAAAAAAGTGGTTGGTTGTAGTAGCACTGTGCTAAAACGATTCTGTGGGAAATCTAAT 2913
Query 2929 CGTAGTCTGCTTTCAATTGTTTCTCGTGCTAGGTCTCTTTGTTCGGATGAAAGGATTGGT 2988
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2914 CGTAGTCTGCTTTCAATTGTTTCTCGTGCTAGGTCTCTTTGTTCGGATGAAAGGATTGGT 2973
Query 2989 ATTCAAGTCGATGTTGATCAGAATGAGATTCTACTGTATGCGCCTCCCCTCGACATGGAA 3048
|| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2974 ATCCAAGTCGATGTCGATCAGAATGAGATTCGACTGTATGCGTCTCCCCTCGACATGGAA 3033
Query 3049 AAAGTGTCAGCCCTTGTGAACGATGCATTGGAATGTGAAAAGAAATGGATGCGTAATGAA 3108
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3034 AAAGTGTCAGCCCTTGTGAACGATGCATTGGAATGTGAAAAGAAATGGATGCGTAATGAA 3093
Query 3109 TGTTTGGAGAAGTATCTATTTCATGGTCGGGGACAAGTACCTATTGCACTGTTTGGATCT 3168
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3094 TGTTTGGAGAAGTATCTATTTCATGGTCGGGGACAAATACCTATTGCACTGTTTGGATCT 3153
Query 3169 GGTGCTCAGATAAAGCATCTTGAAGTTGATCAGAGATTTCTGACAGTCGATGTACTTTAT 3228
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3154 GGTGCTCAGATAAAGCATCTTGAAGTTGATCAGAGATTTCTGACAGTCGATGTACATTAT 3213
Query 3229 TATGGCGATAATTTTGTTGATGACAGAGAGCTTCTGTCGTTTCTGGAGAAGAAGATTGAT 3288
|||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3214 TATGGCGACGATGTTGTTGATGACAGAGAGCTTCTGACGTTTCTGGAGAAGAAGATTGAT 3273
Query 3289 GGGTGTATTTGCTCTATTTACAAGTTTGCTGCGAACAAGCAAGACTGTGATGAGAAGGAG 3348
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3274 GGGTGTATCTGCTCTATTTACAAGTTTGCTGCGAACAAGCAAGACTGTGATGAGAAGGAG 3333
Query 3349 AAGTGGGGTAGAATAACCTTTCTCACTCCAGAATCTGCTATGAAGGCAACAGAAATTCAG 3408
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3334 AAGTGGGGTAGAATAACCTTTCTCACTCCAGAATCTGCTATGAAGGCAACAGAAATTCAG 3393
Query 3409 AAATTTGATTTCAAAGGATCAGTGCTTAAATTATTTCCATCACTGTCAACTGGTGGAGGA 3468
|||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3394 AAATTTGATTTCAAAGGATCAGTGCTCAAAGTATTTCCATCACTGTCAACTGGTGGAGGA 3453
Query 3469 ATTTTCAAGATGCCTTCTTTCCCTTCCGTGACAGCTAAGATTCGTTGGCCGAGAAAGGAA 3528
|||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3454 ATTTTCAAGATGCCTTATTTCTCTTCCGTGACAGCTAAGATTCGTTGGCCGAGAAAGGAA 3513
Query 3529 AGCAGTGGTAGAGGATGTCTTAAGTGCCCTTCCGGAGATATTCACAGTATAATTGGTGGG 3588
|| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3514 AGTAGTGGTAGAGGATGCCTTAAGTGCCCTTCCGGAGATATTCACAGTATACTTGGTGAT 3573
Query 3589 ATATCCAACCTTGTGATTGGAACAAATTATGTCAATATTCAGAGAGATCAACGGTCCAAT 3648
||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3574 ATAACCAGCCTTGAGATAGGAACAAATTATGTCCATATTCAGAGAGATCAACTGTCCAAT 3633
Query 3649 GATTCTATCTTGATAAGTGGACTTGGAGATCTTTCAGAAGCAGAAGTTTTAGATGTTTTG 3708
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3634 GATTCTATCTTGATAAGTGGACTTGGAGATCTTTCGGAAGCAGAAGTTTTAGATGTTTTG 3693
Query 3709 GAGTTGGA-AACGAAGAGAAGAGATCTGAATTTTTTCATATTCAG--AAAAA-ACAGTGT 3764
|| || | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||
Sbjct 3694 GAATT-CAGAACGCAGAGAAGAGATCTGAATTTTTTCATATTCAGAAAAAAATACAGTGT 3752
Query 3765 GCAGTGCCCATCTCCTACTGCTTGCGAAGAAGAGCTTCATAAGAGAATATTTGCGCGCAT 3824
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3753 GCAGTGCCCATCTCCTACTGCTTGCGAAGAAGAGCTTCATAAGAGAATATTTGCGCGCAT 3812
Query 3825 GTCAGCAAAGAATCCAGAGCCAAACTGTGTCCAAGTCCAAGTTTTTGAACCAAAAGAAGA 3884
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3813 GTCAGCAAAGAATCCAGAGCCAAACTGTGTCCAAGTTCAAGTTTTTGAACCAAAAGAAGA 3872
Query 3885 CAATTATTTCATGCGAGCGTTGATTACGTTTGACGGGAGATTACATTTGGAAGCTGCAAA 3944
|||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||
Sbjct 3873 CAATTACTTCATGCGAGCGTTAATTAAGTTTGACGGGAGATTACATCTCGAAGCTGCAAA 3932
Query 3945 AGCTTTGCAAGAGTTAAATGGGGAGGTGCTACCTGGATGTCTTCCATGGCAGAAGATAAA 4004
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3933 AGCTTTGCAAGAGTTAAATGGGGAGGTGTTACCTGGATGTCTTCCATGGCAGAAGATAAA 3992
Query 4005 GTGCGAACAATTGTTTCAGAGCTCCATAATCTGCTCCGCTGCTATCTACAACACTGTCAA 4064
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3993 GTGCGAACAATTGTTTCAGAGCTCCATAATCTGCTCCGCTTCTATCTACAACACTGTCAA 4052
Query 4065 AAGACAATTGAACGTTTTATTAGCAAGCTTTGAGAGACAACAAGGGGGT-ATATGGC-GT 4122
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | || || ||
Sbjct 4053 AAGACAATTGAACGTTTTATTAGCAAGGTTTGAGAGACAAAAAGGGGGTGA-AT-GCTGT 4110
Query 4123 CTGGAACCAACTCATAACGGGGCTTATCGTGTTAAAATTATTGCTTATGCAACAAGACCC 4182
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 4111 CTGGAACCAACTCATAACGGGGCTTATCGTGTTAAAATTACTGCTTATGCAACAAGACCC 4170
Query 4183 GTTGCGGAGATGCGGAGAGAACTTGAAGAACTCTTAAGAGGAAGACCTATTAACCATCCA 4242
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||
Sbjct 4171 GTTGCGGAGATGCGGAGAGAGCTTGAAGAACTCTTAAGAGGAAAACCCATAAACCATCCA 4230
Query 4243 GGCTTAACCCCTAGAGTCCTGCAGCATCTTATGTCCAGAGATGGTATTAATCTGATGCGG 4302
||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4231 GGCTTCACACCTAGAGTCGTGCAGCATCTTATGTCCAGAGATGGTATTAATCTGATGCGG 4290
Query 4303 AAGATCCAACAGGAGACAGAAACTTACATTGTATTAGACAGGCACAATCTCACAGTACGA 4362
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 4291 AAGATCCAACAGGAGACAGAAACTTACATTCTATTAGATAGGCACAATCTCACAGTACGC 4350
Query 4363 ATTTGTGGATCAAGTGAGAAAATTGCCAAGGCAGAACAAGAACTGGTTCAATCACTTATG 4422
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 4351 ATTTGTGGAACAAGTGAGAAAATTGCCAAGGCAGAACAAGAACTGGTTCAGTCACTTATG 4410
Query 4423 GCTTATCATGAGAGCAAGCAACTTGAAATCCACCTCCGAGGTCCTGAGATCCGTCCTGAC 4482
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4411 GATTATCATGAGAGCAAGCAACTTGAAATCCACCTCCGAGGTCCTGAGATCCGTCCTGAC 4470
Query 4483 CTCATGAAGGAAGTTGTGAAGCGGTTTGGTCCGGAGCTTCAAGGTATCAAAGAAAAGGTA 4542
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 4471 CTCATGAAGGAAGTTGTGAAGCGGTTTGGTCCGGAGCTCCAAGGTATCAAAGAAAAGGTG 4530
Query 4543 CATGGTGTGGATCTCAAGCTCAACACCCGGTACCATGTTATTCAGGTTCATGGGAGCAGA 4602
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 4531 CATGGTGTGGATCTCAAGCTCAATACCCGGTACCATGTTATTCAGGTTCATGGGAGCAAA 4590
Query 4603 GAAATGAGGCAGGAAGTACAAAAGATGGTCGATGAACTTGCACGAGAAAAGAGTGCACTG 4662
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4591 GAAATGAGGCAGGAAGTACAAAAGATGGTCAATGAACTTGCACGAGAAAAGAGTGCACTG 4650
Query 4663 GGTGAAAAACCAGATGACATTGAAGTTGAATGCCCCATTTGCTTGTCTGAAGTTGATGAT 4722
||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4651 GGTGAAAAACCAGATGAGATTGAACTTGAATGCCCCATTTGCTTGTCTGAAGTTGATGAT 4710
Query 4723 GGCTACTCTCTTGAAGGATGTTCACACCTCTTCTGCAAAGCTTGTTTGTTGGAGCAATTT 4782
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4711 GGCTACTCTCTTGAAGGATGTTCACACCTCTTCTGCAAAGCTTGTTTGTTGGAGCAATTT 4770
Query 4783 GAGGCATCGATGAGAAACTTTGACGCATTCCCAATACTTTGTTCTCACATAGACTGTGGA 4842
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4771 GAGGCATCGATGAGAAACTTTGACGCATTCCCAATACTTTGTTCTCACATAGACTGTGGA 4830
Query 4843 GCTCCAATAGTACTGGCTGATATGAGAGCCCTCTTATCACAAGAGAAGCTCGATGAACTC 4902
|||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4831 GCTCCAATAGTAGTCGCTGATATGAGAGCCCTCTTATCACAAGAGAAGCTCGATGAACTC 4890
Query 4903 TTCAACGCATCCTTGTCCTCTTTTGTAACATCTAGTGATGGAAAGTTCAGGTTTTGCTCC 4962
||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 4891 ATCAGTGCATCCTTGTCCGCTTTTGTAACATCCAGTGATGGAAAGTTGAGGTTTTGCTCC 4950
Query 4963 ACACCTGATTGCCCTTCCATCTACCGTGTAGCTGGACCTCAAGAATCCGGCGAGCCATTC 5022
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 4951 ACACCTGATTGCCCTTCCATCTACCGTGTAGCTGGACCTCAAGAATCCGGTGAGCCATTC 5010
Query 5023 ATCTGTGGAGCATGTCACTCGGAAACATGCACAAGGTGTCACCTCGAGTATCACCCGTTA 5082
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5011 ATCTGTGGAGCATGTCACTCAGAAACATGCACAAGGTGTCACCTCGAGTATCACCCGTTA 5070
Query 5083 ATCACTTGTGAAAGGTACAAAAAGTTCAAGGAAAATCCAGACTTGTCCCTTAAGGACTGG 5142
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct 5071 ATCACTTGTGAAAGGTACAAAAAGTTCAAGGAGAATCCGGACTTGTCGCTTAAGGACTGG 5130
Query 5143 GCAAAAGGGAAGGACGTAAAGGAGTGTCCGATTTGCAAGTCGACGATAGAGAAGTCTGAT 5202
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 5131 GCAAAAGGGAAGGACGTAAAGGAGTGTCCGATTTGCAAGTCGACGATAGAGAAGACTGAT 5190
Query 5203 GGGTGTAACCATCTGCAGTGCCGGTGTGGAAAGCACATTTGCTGGACCTGCTTAGACGTC 5262
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 5191 GGGTGTAACCATCTGCAGTGCCGGTGTGGAAAGCACATTTGTTGGACCTGCTTAGACGTC 5250
Query 5263 TTCACTCAAGCAGAACCTTGTTATGCCCATTTAAGGACAATTCATGGTGGAATCGGATTG 5322
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5251 TTCACTCAGGCAGAACCTTGTTATGCCCATTTAAGGACAATTCATGGTGGAATCGGATTA 5310
Query 5323 GCCGAGTTAGGTGTCCC 5339
| |||||||||||||||
Sbjct 5311 GTCGAGTTAGGTGTCCC 5327
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 272306166604
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5