BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg488069
Length=2800
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G12950.1 | Symbols: | Putative glycosyl hydrolase of unknow... 4200 0.0
AT5G12960.1 | Symbols: | Putative glycosyl hydrolase of unknow... 4152 0.0
> AT5G12950.1 | Symbols: | Putative glycosyl hydrolase of unknown
function (DUF1680) | chr5:4092953-4096975 FORWARD LENGTH=2919
Length=2919
Score = 4200 bits (2274), Expect = 0.0
Identities = 2582/2729 (95%), Gaps = 27/2729 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 86 TTTAGTTACACACtttttt--tttttttttAAGACAAAAAAGATACGATGAAGTCTGGTG 143
||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 120 TTTAGTT--ACACTTTTTTCATTCTTTTTTAAGACAAAAGAGATACGATGAAGTCTGGTC 177
Query 144 TCATCATTACCATTGCTCTGTTATTATACAC-A--AGCTTTCTTCTTGTTTGTGTAGCGA 200
||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||
Sbjct 178 TCATCATAACCATTGCTCTGTTACTATACACAAGCAGCTTTGTTCTTGTTTCTGTAGCGA 237
Query 201 AAGAGTGTA-CAGACATTCCTAC-CAAGCTCTCATCGCATACTTTGCACAGCGAGCTTCT 258
||||||||| || ||| |||||| | |||||||||| |||||||| | ||||||||||||
Sbjct 238 AAGAGTGTACCA-ACACTCCTACGC-AGCTCTCATCCCATACTTTCCGCAGCGAGCTTCT 295
Query 259 ACAATCACACAACAAAACTTTGAAGACAGAGTTGTTCTCTCATTACCATTTAACTCCAAC 318
|||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 296 GCAATCAAAGAACGAAACTTTGAAGACAGAGTTGTTCTCTCATTACCATTTAACTCCAGC 355
Query 319 TGATGACGCTGCTTGGTCTACTTTGTTGCCAAGGAAGATGTTGAAAGAAGAGACGGATGA 378
||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||
Sbjct 356 TGATGACTCTGCTTGGTCTAGTTTATTGCCAAGGAAGATGTTGAAAGAAGAGGCAGATGA 415
Query 379 ATTTGCTTGGACTATGTTGTATAGGAAGTTCAAGGACTCTAATT-CTGTTGGTAACTTTC 437
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||
Sbjct 416 ATTTGCTTGGACTATGTTGTATAGGAAGTTCAAGGACTCTAATTCCT-CTGGTAACTTTC 474
Query 438 TCAAGGATGTCTCTTTGCACGACGTTAGGCCCGACCCCA-ACTCCTTTCATTGGAGGGCT 496
| || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 475 TTAAAGATGTCTCTTTGCACGACGTTAGGCTCGA-CCCAGACTCCTTTCATTGGAGGGCT 533
Query 497 CAGCAGACAAACCTTGAGTATCTATTGATGTTGGATGTTGACGGTTTAGCCTATAGCTTC 556
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||
Sbjct 534 CAGCAGACAAACCTTGAGTATCTATTGATGTTGGATGTTGATGGTTTGGCCTGGAGCTTC 593
Query 557 CGTAAAGTTGCTGGTCTTGATGCTTCTGGAG-TTCCCTATGGAGGATGGGAGAAACCAGA 615
||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 594 CGTAAAGAAGCTGGTCTTGATGCACCTGGAGATT-ACTATGGAGGATGGGAGAGACCAGA 652
Query 616 TAGTGAACTCCGTGGCCATTTTGTCGGTCACTATTTGAGTGCAACAGCTCATATGTGGGC 675
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 653 TAGTGAACTCCGTGGCCATTTTGTCGGTCACTATTTGAGTGCAACAGCTTATATGTGGGC 712
Query 676 AAGTACTCATAATGATACTCTCAAGGCGAAAATGTCAGCTCTTGTCTCAGCTTTAGCGGA 735
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||
Sbjct 713 TAGTACTCATAATGATACTCTCAAGGAGAAAATGTCAGCTCTTGTCTCAGCTCTATCGGA 772
Query 736 ATGTCAGCAGAAATCTGGCACAGGATATCTCTCTGCTTTTCCTTCCAGTTTTTTCGACCG 795
||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 773 ATGCCAACAGAAGTCTGGCACAGGATATCTCTCTGCTTTTCCTTCCAGTTTTTTCGACCG 832
Query 796 GTTTGAAGCTATAACACATGTTTGGGCTCCTTACTACACCATTCACAAGATTTTGGCCGG 855
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 833 CTTTGAAGCTATAACACCTGTTTGGGCTCCTTACTACACCATTCACAAGATTTTAGCTGG 892
Query 856 CCTGGTGGATCAATACAAGTTGGCTGGGAATATTCAAGCTTTAAAGATGGCAACAGGGAT 915
||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 893 TCTGGTTGATCAATACAAGTTGGCTGGGAACAGTCAAGCTTTAAAGATGGCAACCGGGAT 952
Query 916 GGCTGATTACTTT-TATGGTCGTGTTCGTAATGTGATAACGAAGTACAGTGTTGAACGAC 974
||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 953 GGCTGATTA-TTTCTATGGCCGTGTTCGTAATGTGATAAGGAAGTACAGTGTTGAACGAC 1011
Query 975 ATTATCAATCACTAAACGAAGAGACTGGTGGCATGAATGATGTTCTTTATCAGCTATACA 1034
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1012 ATTGGCAATCACTAAACGAAGAGACTGGTGGCATGAATGATGTTCTTTATCAGCTATACA 1071
Query 1035 GCATCACTAGAGATTCCAAGTATTTGTTTCTCGCACATCTCTTTGACAAGCCTTGCTTTC 1094
|||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1072 GCATCACTGGAGATTCCAAGTATTTGCTGCTCGCACATCTCTTTGACAAGCCTTGCTTTC 1131
Query 1095 TCGGGGTCCTCGCAATTCAGGCCGATGATATTAGTGGATTCCACGCTAATACACATATTC 1154
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1132 TCGGAGTCCTCGCAATTCAGGCCGATGATATTAGTGGATTCCACGCTAATACACATATTC 1191
Query 1155 CCATCGTCGTTGGATCCCAACAACGGTATGAAATCACTGGTGATCTACTCCATAAGGAAA 1214
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1192 CCATCGTCGTTGGATCCCAACAACGGTATGAAATCACTGGTGATCTACTCCATAAGGAAA 1251
Query 1215 TCTCGATGTTCTTTATGGACATAATTAATGCTTCTCACAGCTATGCAACTGGAGGAACAT 1274
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1252 TCTCGATGTTCTTTATGGACATTTTTAATGCTTCTCACAGCTATGCAACAGGAGGAACAT 1311
Query 1275 CAGTCAGAGAGTTCTGGCAAGATCCAAAGAGAATGGCGACTACACTGCAAACTGAAAACG 1334
||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1312 CAGTCAGTGAGTTCTGGCAAGATCCCAAGAGAATGGCGACTGCACTGCAAACTGAAAACG 1371
Query 1335 AGGAATCATGTACTACTTATAACATGCTCAAGGTCTCTAGGAATCTGTTCAGATGGACAA 1394
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1372 AGGAATCATGTACTACTTATAACATGCTCAAGGTCTCTAGGAATCTGTTCAGATGGACAA 1431
Query 1395 AAGAGGTTAGCTATGCAGACTATTACGAGCGCGCTTTGACCAACGGTGTGCTCGGAATTC 1454
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||
Sbjct 1432 AAGAGGTTAGCTATGCAGACTATTACGAGCGCGCCTTGACCAACGGCGTGTTGGGAATTC 1491
Query 1455 AAAGAGGAACCCAACCCGGACGGATGATCTACATGCTCCCATTAGGTCAAGGTGTTTCTA 1514
||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1492 AAAGAGGAACCCAGCCTGGACTGATGATCTACATGCTCCCATTAGGTAAAGGTGTTTCTA 1551
Query 1515 AGGCTGTGACTTATCACGGTTGGGGAACACCTTATGATTCCTTCTGGTGTTGCTATGGCA 1574
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1552 AGGCTGTGACTTATCACGGTTGGGGAACACCTTATGATTCCTTCTGGTGTTGCTATGGCA 1611
Query 1575 CTGGAATTGAATCCTTCTCAAAACTGGGAGATTCCATATATTTTCAAGAAGATGGTGCAT 1634
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1612 CTGGAATTGAATCCTTCTCAAAACTGGGAGATTCCATATATTTTCAAGAAGATGGTGCAA 1671
Query 1635 CTCCAGCTCTTTATGTCACCCAATATATATCAAGCTCACTTGATTGGAAATCTGCTGGTC 1694
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1672 CTCCAGCTCTTTATGTCACCCAATATATATCAAGCTCACTTGATTGGAAATCTGCTGGTC 1731
Query 1695 TTTTGCTATCTCAGAAAGTTAATCCTGTTGTGTCGTGGGATCCGTACATGCGTGTGACAT 1754
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1732 TTTCAATATCTCAGAAAGTTAATCCTGTTGTGTCGTGGGATCCGTACATGCGTGTGACAT 1791
Query 1755 TCACTCTTTCTTCTTCCAAAGTGGGAGTGGCGAAGAAGTCGACTTTGAATCTAAGAATTC 1814
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1792 TCACTCTTTCTTCTTCCAAAGTGGGAGTGGCGAAGGAGTCGACTTTGAATCTAAGAATTC 1851
Query 1815 CTGTTTGGACTAACTCTATAGGTGCCAAAGTATCTTTGAATGGGAAACCCTTAAAAGTAC 1874
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||
Sbjct 1852 CTGTTTGGACTAACTCTATAGGTGCCAAAGTATCTTTGAATGGGCGACCCTTAAACGTAC 1911
Query 1875 CAACTTCAGGTAATTTCCTATCGATCAAACAGAACTGGAAATCTGGCGATCAAGTAACCA 1934
|||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1912 CAACTTCAGGTAATTTCCTATCAATCAAACAGAAATGGAAATCTGGTGATCAAGTAACCA 1971
Query 1935 TGGAGCTACCAATGAGTATCAGAACCGAAGCTATAAAAGATGATCGTCCGGAGTACGCAT 1994
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||
Sbjct 1972 TGGAGCTACCAATGAGTATCAGAACCGAAGCTATAAAAGATGATCGGCCAGAGTACGCAT 2031
Query 1995 CTCTTCAAGCCATACTCTATGGCCCCTACTTGTTAGCCGGACACACGAGCAGGGACTGGA 2054
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2032 CTCTTCAAGCCATACTCTATGGCCCCTACTTGTTAGCCGGACACACGAGCAGGGACTGGA 2091
Query 2055 GCATCACAACTCAGGCTAAAGCTGGAAATTGGATAACCCCTATACCTGAAACTTATAACA 2114
|||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||
Sbjct 2092 GCATCACAACTCAGGCTAAACCTGGAAAATGGATAACCCCTATACCTGAAACTCAAAACA 2151
Query 2115 GTCACCTTGTCACACTCTCACAACAATCTGGAAACATATCTTACGTGTTGTCAAATACCA 2174
|| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||
Sbjct 2152 GTTACCTTGTCACACTCTCACAACAATCTGGAAACGTATCTTACGTGTTTTCAAATAGCA 2211
Query 2175 ACCAAACCATCACAATGAGGGTATCACCCGAGCTAGGGACACAAGATGCCGTTGCAGCGA 2234
||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2212 ACCAAACCATCACAATGAGAGTATCACCCGAGCCAGGGACACAAGATGCCGTTGCAGCGA 2271
Query 2235 CTTTCAGGCTCGTGACTGATAATTCTAAACCACGGATTTCGGGTCTAGA-GGCACTAATT 2293
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||
Sbjct 2272 CTTTCAGGCTCGTGACTGATAATTCTAAACCACGGATTTCGGGTCCAGAAGG-ACTAATT 2330
Query 2294 GGAAGCCTGGTCATGCTTGAGCCGTTTGATTTCCCTGGCATGATTGTAAAGCAAACAACT 2353
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2331 GGAAGGCTGGTCATGCTTGAGCCGTTTGATTTCCCTGGCATGATTGTAAAGCAAGCAACT 2390
Query 2354 GATAGCTCCCTCACGGTTCAAGCTTCTTCTCCTAGTGACAAAGGAGCTTCTAGCTTTCGG 2413
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2391 GATAGCTCCCTCACAGTTCAAGCTTCTTCTCCTAGTGACAAAGGAGCTTCTAGCTTTCGG 2450
Query 2414 TTAGTATCTGGAGTTGATGGGAAGCCAGGAAGCGTGTCGTTAAGACTAGAGAGCAACAAT 2473
|||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2451 TTAGTATCTGGACTTGACGGGAAGCTAGGAAGCGTTTCGTTAAGACTAGAGAGCAAAAAA 2510
Query 2474 GGTTGTTTTGTGTACAGCGATCAAACACTAAAGCAGGGGACGAAACTAAAGCTTGAATGT 2533
|||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||
Sbjct 2511 GGTTGTTTTGTGTACAGCGATCAAACCCTAAAGCAAGGGACAAAACTAAGGCTAGAATGT 2570
Query 2534 GGTCCGGTTGCGACTGATGAGAAGTTTAAACAGGCAGCAAGCTTTAAGTT-AAACACAGG 2592
||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||
Sbjct 2571 GGTTCGGATGCGACTGATGAGAAGTTTAAAGAGGCAGCAAGCTTTA-GTTTAAAGACAGG 2629
Query 2593 AATGAATCAATACAATCCAATGAGTTTCGTGATGAGCGGAACACAGAGGAACTTTGTGTT 2652
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2630 AATGCATCAATACAATCCAATGAGTTTCGTGATGAGCGGAACACAGAGGAACTTTGTGTT 2689
Query 2653 ATCGCCATTGTTTAGCTTAAGAGATGAAACATACAATGTGTACTTCAGTGTGCAAACTTG 2712
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2690 ATCGCCATTGTTTAGCTTAAGAGATGAAACATACAATGTGTACTTCAGTGTGCAAACTTG 2749
Query 2713 AAGAAAGAAACCCTTTTATGGGAGaaaaaataagaaa-aaaaGTCTCATTTGAAATATAA 2771
||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2750 AAGAAAGAAACCCTTAT-TGGGTGAAAATATAAGAAAGAAAAGTCTCATTTGAAATATA- 2807
Query 2772 AGACATGTGTTTAGATGTTTAGCCTCTTA 2800
||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2808 -GACATGTGTTTAGATGTTTAGCCTCTTA 2835
Score = 80.5 bits (43), Expect = 8e-14
Identities = 54/59 (92%), Gaps = 2/59 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCTACTCACATTATTCTCTTCTCCCA-ATTCAAATCTCCTCTCCCTAACTGTTTTATG 58
|||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2 CTCTTCTCACATTATCCTCTTCT-TCATATTCAAATCTCCTCTCCCTAACTGTTTTATG 59
> AT5G12960.1 | Symbols: | Putative glycosyl hydrolase of unknown
function (DUF1680) | chr5:4097701-4101668 FORWARD LENGTH=2835
Length=2835
Score = 4152 bits (2248), Expect = 0.0
Identities = 2507/2633 (95%), Gaps = 14/2633 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 104 ttttttttttAAGACAAAAAAGATACGATGAAGTCTGGTGTCATCATTACCATTGCTCTG 163
|||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||
Sbjct 78 TTTTTTGTTTATG--AAAAAACATACGATGAAGTCTGGTGTGATCATAACCATTGCTCTG 135
Query 164 TTATTATACACAAGCTTTCTTCTTGTTTGTGTAGCGAAAGAGTGTACAGACATTCCTACC 223
|||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 136 TTATTATACACAAGCTTTCTTCTTGTTTGTCTGGCGAAAGAGTGTACAGACATTCCTACG 195
Query 224 AAGCTCTCATCGCATACTTTGCACAGCGAGCTTCTACAATCACACAAC-AAAACTTTGAA 282
|||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||
Sbjct 196 AAGCTCTCATCGCATACTCTCCGCAGCGAGCTTCTGCAATCACAGAACGCAAA-TTTGAA 254
Query 283 GACAGAGTTGTTCTCTCATTACCATTTAACTCCAACTGATGACGCTGCTTGGTCTACTTT 342
| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 255 GTCAGAGGAGTTCTCTCATTACCATTTAACTCCAACTGATGACTCTGCTTGGTCTACTTT 314
Query 343 GTTGCCAAGGAAGATGTTGAAAGAAGAGACGGATGAATTTGCTTGGACTATGTTGTATAG 402
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 315 GTTGCCAAGGAAGATGTTGAAAGAAGAGACTGATGATTTTGCTTGGACTATGTTGTATAG 374
Query 403 GAAGTTCAAGGACTCTAATT-CTGTTGGTAACTTTCTCAAGGATGTCTCTTTGCACGACG 461
||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 375 AAAGTTCAAGGACTCTAATTCCT-CTGGTAACTTTCTCAAGGATGTCTCTTTGCACGACG 433
Query 462 TTAGGCCCGACCCCAACTCCTTT-CATTGGAGGGCTCAGCAGACAAACCTTGAGTATCTA 520
|||||| ||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 434 TTAGGCTGGACCCGAGCT-CTTTCCATTGGAGGGCTCAGCAGACAAACCTTGAGTATCTA 492
Query 521 TTGATGTTGGATGTTGACGGTTTAGCCTATAGCTTCCGTAAAGTTGCTGGTCTTGATGCT 580
||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||
Sbjct 493 TTGATGTTGGATGTTGATGGTTTGGCCTATAACTTCCGTAAAGAAGCTGGTCTTAATGCT 552
Query 581 TCTGGAGTTCCCTATGGAGGATGGGAGAAACCAGATAGTGAACTCCGTGGCCATTTTGTC 640
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 553 CCTGGAGTTCCCTATGGAGGATGGGAGAAACCAGATAGTGAACTCCGTGGCCATTTTGTC 612
Query 641 GGTCACTATTTGAGTGCAACAGCTCATATGTGGGCAAGTACTCATAATGATACTCTCAAG 700
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||
Sbjct 613 GGTCACTATTTGAGTGCAACAGCTTATATGTGGGCAAGTACTCATAACGAAACTCTCAAG 672
Query 701 GCGAAAATGTCAGCTCTTGTCTCAGCTTTAGCGGAATGTCAGCAGAAATCTGGCACAGGA 760
||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||
Sbjct 673 GCGAAAATGACAGCTCTTGTCTCAGCTCTAGCGGAATGCCAGCAGAAATATGGCACAGGA 732
Query 761 TATCTCTCTGCTTTTCCTTCCAGTTTTTTCGACCGGTTTGAAGCTATAACACATGTTTGG 820
|||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 733 TATCTCTCAGCTTTCCCTTCCAGTTTTTTCGACCGGTTTGAAGCTATAACACATGTTTGG 792
Query 821 GCTCCTTACTACACCATTCACAAGATTTTGGCCGGCCTGGTGGATCAATACAAGTTGGCT 880
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 793 GCTCCTTACTATACCATTCACAAGATTTTGGCCGGCCTGGTGGATCAATACAAGTTGGCT 852
Query 881 GGGAATATTCAAGCTTTAAAGATGGCAACAGGGATGGCTGATTACTTTTATGGTCGTGTT 940
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 853 GGGAATACTCAAGCTTTAAAGATGGCAACAGGGATGGCTGATTACTTTTATGGCCGTGTT 912
Query 941 CGTAATGTGATAACGAAGTACAGTGTTGAACGACATTATCAATCACTAAACGAAGAGACT 1000
| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||
Sbjct 913 CAAAATGTGATAAAGAAGTACAGTGTTGAACGACATTGGCTATCACTAAACGAAGAGACT 972
Query 1001 GGTGGCATGAATGATGTTCTTTATCAGCTATACAGCATCACTAGAGATTCCAAGTATTTG 1060
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 973 GGTGGCATGAATGATGTTCTTTATCAGCTATACAGCATCACTAGAGATTCCAAGTATTTG 1032
Query 1061 TTTCTCGCACATCTCTTTGACAAGCCTTGCTTTCTCGGGGTCCTCGCAATTCAGGCCGAT 1120
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1033 TTTCTCGCACATCTCTTTGACAAGCCTTGCTTTCTCGGAGTCCTCGCAATTCAGGCCGAT 1092
Query 1121 GATATTAGTGGATTCCACGCTAATACACATATTCCCATCGTCGTTGGATCCCAACAACGG 1180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1093 GATATTAGTGGATTCCACGCTAATACACATATTCCCATCGTCGTTGGATCCCAACAACGG 1152
Query 1181 TATGAAATCACTGGTGATCTACTCCATAAGGAAATCTCGATGTTCTTTATGGACATAATT 1240
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1153 TATGAAATCACTGGTGATCTACTCCATAAGGAAATCCCGATGTTCTTTATGGACATAGTT 1212
Query 1241 AATGCTTCTCACAGCTATGCAACTGGAGGAACATCAGTCAGAGAGTTCTGGCAAGATCCA 1300
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1213 AATGCTTCACACAGCTATGCAACTGGAGGAACATCAGTCAAAGAGTTCTGGCAAGATCCA 1272
Query 1301 AAGAGAATGGCGACTACACTGCAAACTGAAAACGAGGAATCATGTACTACTTATAACATG 1360
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1273 AAGAGAATGGCGACTACGTTGCAAACTGAAAACGAGGAATCATGTACTACTTATAACATG 1332
Query 1361 CTCAAGGTCTCTAGGAATCTGTTCAGATGGACAAAAGAGGTTAGCTATGCAGACTATTAC 1420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CTCAAGGTCTCTAGGAATCTGTTCAGATGGACAAAAGAGGTTAGCTATGCAGACTATTAC 1392
Query 1421 GAGCGCGCTTTGACCAACGGTGTGCTCGGAATTCAAAGAGGAACCCAACCCGGACGGATG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||
Sbjct 1393 GAGCGCGCTTTGACCAACGGTGTGCTCGGAATTCAAAGAGGAACCGATCCCGGACGGATG 1452
Query 1481 ATCTACATGCTCCCATTAGGTCAAGGTGTTTCTAAGGCTGTGACTTATCACGGTTGGGGA 1540
||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1453 ATCTACATGCTCCCATTGGGTAAAGGTGTTTCTAAGGCTGTGACTTATCACGGTTGGGGA 1512
Query 1541 ACACCTTATGATTCCTTCTGGTGTTGCTATGGCACTGGAATTGAATCCTTCTCAAAACTG 1600
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1513 ACACCTTATGATTCCTTTTGGTGTTGCTATGGCACTGGAATTGAATCCTTCTCAAAACTG 1572
Query 1601 GGAGATTCCATATATTTTCAAGAAGATGGTGCATCTCCAGCTCTTTATGTCACCCAATAT 1660
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1573 GGAGATTCCATATATTTTCAAGAAGATGGTGCAACTCCAGCTCTTTATGTCACCCAATAT 1632
Query 1661 ATATCAAGCTCACTTGATTGGAAATCTGCTGGTCTTTTGCTATCTCAGAAAGTTAATCCT 1720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1633 ATATCAAGCTCACTTGATTGGAAATCTGCTGGTCTTTCAATATCTCAGAAAGTTAATCCT 1692
Query 1721 GTTGTGTCGTGGGATCCGTACATGCGTGTGACATTCACTCTTTCTTCTTCCAAAGTGGGA 1780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1693 GTTGTGTCGTGGGATCCGTACATGCGTGTGACATTCACTCTTTCTTCTTCCAAAGTGGGA 1752
Query 1781 GTGGCGAAGAAGTCGACTTTGAATCTAAGAATTCCTGTTTGGACTAACTCTATAGGTGCC 1840
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1753 GTGGCGAAGGAGTCGACTTTGAATCTAAGAATTCCTGTTTGGACTAACTCTATAGGTGCC 1812
Query 1841 AAAGTATCTTTGAATGGGAAACCCTTAAAAGTACCAACTTCAGGTAATTTCCTATCGATC 1900
|||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1813 AAAGTATCTTTGAATGGGCGACCCTTAAACGTACCAACTTCAGGTAATTTCCTATCAATC 1872
Query 1901 AAACAGAACTGGAAATCTGGCGATCAAGTAACCATGGAGCTACCAATGAGTATCAGAACC 1960
|||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1873 AAACAGAAATGGAAATCTGGTGATCAAGTAACCATGGAGCTACCAATGAGTATCAGAACC 1932
Query 1961 GAAGCTATAAAAGATGATCGTCCGGAGTACGCATCTCTTCAAGCCATACTCTATGGCCCC 2020
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1933 GAAGCTATAAAAGATGATCGGCCGGAGTACGCATCTCTTCAAGCCATACTCTATGGCCCT 1992
Query 2021 TACTTGTTAGCCGGACACACGAGCAGGGACTGGAGCATCACAACTCAGGCTAAAGCTGGA 2080
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1993 TACTTGTTAGCCGGACACACGAGCATGGACTGGAGCATCACAACTCAGGCTAAAGCTGGA 2052
Query 2081 AATTGGATAACCCCTATACCTGAAACT-TATAACAGTCACCTTGTCACACTCTCACAACA 2139
|| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2053 AACTGGATAACCCCTATACCTGAAACTCT-TAACAGTCACCTTGTCACACTCTCACAACA 2111
Query 2140 ATCTGGAAACATATCTTACGTGTTGTCAAATACCAACCAAACCATCACAATGAGGGTATC 2199
|||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 2112 ATCTGGAAACATATCTTACGTGTTGTCAAACAGCAACCAAACCATCATAATGAAAGTATC 2171
Query 2200 ACCCGAGCTAGGGACACAAGATGCCGTTGCAGCGACTTTCAGGCTCGTGACTGATAATTC 2259
|||||||| |||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2172 ACCCGAGCCAGGGACACAAGACGCTGTTTCGGCGACTTTCAGGCTCGTGACTGATGATTC 2231
Query 2260 TAAACCA-CGGATTTCGGGTCTAGAGGCACTAATTGGAAGCCTGGTCATGCTTGAGCCGT 2318
||||| | | ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2232 TAAAC-ATCCGATTTCGAGTCCAGAGGGACTAATTGGAAGCCTTGTCATGCTTGAGCCGT 2290
Query 2319 TTGATTTCCCTGGCATGATTGTAAAGCAAACAACTGATAGCTCCCTCACGGTTCAAGCTT 2378
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2291 TTGATTTCCCTGGCATGATCGTAAAGCAAGCAACTGATAGCTCCCTCACGGTTCAAGCTT 2350
Query 2379 CTTCTCCTAGTGACAAAGGAGCTTCTAGCTTTCGGTTAGTATCTGGAGTTGATGGGAAGC 2438
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||
Sbjct 2351 CTTCTCCTAGTGACAAAGGATCTTCTAGCTTTCGGTTAGTATCTGGACTTGACGGGAAGC 2410
Query 2439 CAGGAAGCGTGTCGTTAAGACTAGAGAGCAACAATGGTTGTTTTGTGTACAGCGATCAAA 2498
||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2411 CAGGAAGCGTGTCGTTAAGCCTAGAGAGCAAAAAGGGTTGTTTTGTGTACAGCGATCAAA 2470
Query 2499 CACTAAAGCAGGGGACGAAACTAAAGCTTGAATGTGGTCCGGTTGCGACTGATGAGAAGT 2558
|| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||
Sbjct 2471 CATTAAAGCAAGGGACGAAACTAAGGCTTGAATGTGGTTCGGCTGCGACTGATGAGAAGT 2530
Query 2559 TTAAACAGGCAGCAAGCTTTAAGTT-AAACACAGGAATGAATCAATACAATCCAATGAGT 2617
||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2531 TTAAACAGGCAGCAAGCTTTA-GTTTAAAGACAGGAATGAATCAATACAATCCAATGAGT 2589
Query 2618 TTCGTGATGAGCGGAACACAGAGGAACTTTGTGTTATCGCCATTGTTTAGCTTAAGAGAT 2677
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2590 TTCGTGATGAGCGGAACACAGAGGAACTTTGTGCTATCGCCATTGTTTAGCCTAAGAGAT 2649
Query 2678 GAAACATACAATGTGTACTTCAGTGTGCAAACTTGAAGAAAGAAACCCTTTTA 2730
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||
Sbjct 2650 GAAACATACAATGTGTACTTCAGTGTGCAAGCTTGAAGAAATAAACCCTTTTA 2702
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 139112932939
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5