BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg488087
Length=4746
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G12400.1 | Symbols: | DNA binding;zinc ion binding;DNA bind... 7350 0.0
> AT5G12400.1 | Symbols: | DNA binding;zinc ion binding;DNA binding
| chr5:4013813-4021543 FORWARD LENGTH=5334
Length=5334
Score = 7350 bits (3980), Expect = 0.0
Identities = 4446/4674 (95%), Gaps = 19/4674 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGAGTTGGTGGGTAAAGTCGTTCGGAAGGAGATCCAAGGGATTGGGTTTTGCTCCGGG 60
|||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGAGCTGGTTGGTAAAGTCGTTAGGAAGGAGATCCAAGGGATTGGGTTTTGCTCCGGG 60
Query 61 ACGGTTCGATCTCGCGATTCGTCTGGAGTTTTCGAGATCGTTTACGAGAACGGAGTCACG 120
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||
Sbjct 61 ACGGTTCGATCTCGCGATTCGTCTGGATTTTTCGAGATCGTTTATGAGAACGGTGTTACG 120
Query 121 GAGATTTCGGAATTGGATGAGGTTGTTGCTCTCGTCATGGGAGATGGTAAATCTCAGGAG 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 GAGATTTCGGAATTGGATGAGGTTGTTGCTCTCGTGATGGGAGATGGTAAATCTCAGGAG 180
Query 181 AATTCGGTTCCAGT---GAAGAAGAGAGTTGGTAGGAAGCCGAAGAAACGGTCTCGTGTC 237
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 AATTCGGTTCCAGTGAAGAAGAAGAGAGTTGGTAGGAAGCCGAAGAAACGGTCTCGTGTT 240
Query 238 GCGAGGATGGTTGAGATCAAGCGAGAAAGCTCTGAGTTGGATGAGGTAAATGTCGATTTA 297
|||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 241 GCGAGGGTGGTTGAGATCAAGCGAGAGAGCTCTGGGTTGAATGAGGTAAATGTCGATTTA 300
Query 298 AATGATGGAGTTACGGAGATTTCGGGAGTTAGTGATGTGAATTTGAGAGGGAATGTTGAT 357
|||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 AATGATGGAGTTGCGGAGAATTCGGGAGTTAGTGAGGAGAATTTGAGAGGGAATGTTGAT 360
Query 358 TTGAATTGTGGTCCTGTGGAAACCCTAGGTAGGACATGTGA---CTCTGTGACGGATTTG 414
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||
Sbjct 361 TTGAATTGTGGTCCTGTGGAAACCCTAGGTAGGACATGGGACTCCTCTGTCACGGATTTG 420
Query 415 AATAGGACGGTGCCGCAATCGGAAACTGGGTTTGATCTGACTACCGGGTTGGATTGGAAT 474
|||||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||
Sbjct 421 AATAGGACGGTGTCGGAATCGGAAACTGGATTTGATTTGACTACTGGGTTGGATTGGAAT 480
Query 475 TCCAATGAAGGTTTAGGTTTGATTAATGTGAATATCGATTATGAAGACAATTGTAGTGAC 534
|| |||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 481 TCGAATGAAAATCTAGGTTTGGTTAATGTAAATATCGATTATGAAGAAAATTGTAGTGAC 540
Query 535 AAAAGGAGGTGGGATATTGATCTGAACATGGATGCGAGCTGTGATTTGGACAATGCTGCT 594
||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 AAACGGAAGTGGGATATTGATCTGAACATGGATGCGAGCTGTGATTTGGACAATGCTGCT 600
Query 595 GTCTGTAATTTCAATGGGCAGAAGAGGGAGGGAGGATTTGATTTGAACGTGGAGGTTGAT 654
||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 ATCTGTGATTTCAGTGGGCAGAAGAGGGAGGTAGGATTTGATTTGAACGTGGAGGTTGAT 660
Query 655 GTAGAGAACAGCAAGGATG-GCGAGTACATTCAAATGAATGGAAATGACATTGTTCAGGA 713
||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 661 GTAGAGAACAGCAAGGATGAG-GAGTACAGTCAAATGAATGGAAATGACATTGTTCAAGA 719
Query 714 AATCAACATGCAAGACGGAAATGTTGTCCATGATAATATTGAGACTGGGGAATATAAAGA 773
|||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 720 AATCAACATGCAGGACGGAAATGGTGCCCAGGATAATATTGAGACTGGGGAATATAAAGA 779
Query 774 AGTTCATGTTGCTGAAGTGTCCAGCGCTCAGCTTTTGGAGGAGATACAGAAGCAGAACAT 833
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 780 AGTTCATGTTGCTGAAGTGTCCAGCGCTGAGCTTTTGGAGGAGATACAGAAGCAGAACAT 839
Query 834 TGTTTCACCGCAAGATCCCAATAATCCTAATTCTAATGGGGTTGAGCAA-GATCATGAGC 892
||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| || |||| ||| |
Sbjct 840 TGTTTCACCGCAAGATCTCAAGAATCTTAATTCTAATGGGGTTGAG-AAGGATCCTGATC 898
Query 893 TACCTCAGCATGATGCTAAGACTGTTGATGAGTCTCTATCTGATAGGGGAAATTCAGATG 952
||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||
Sbjct 899 TACCTCATCATGATGCTAAGACTGTTGATGAGACTCTCTCTGATAGGGGAAATTCAGGTG 958
Query 953 AATATGGAAGTGGTAGGAGGAAAAGAAGAAAACCTTCTGACAATCCAAAATTCATGAGTG 1012
||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 959 AATATACAAGTGGTAGGAGGAAAAGAAGAAAAGCTTCTGACAATCCAAAATTCATGAGTG 1018
Query 1013 AACCTCGGTTGAGAAGAAGCGCTCGTAGAAGGTTAGCTCGATCTCCTGTCAGTAGTACTG 1072
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1019 AACCTCAGTTGAGAAGAAGCGCTCGTAGAAGGTTAGCTCGATCGCCTGTCAGTAGTACTG 1078
Query 1073 TAACAGCGTGCTTAGTTGATGAAGTATCCCCTTCTCCTTCAATTAGTAGTCTGACAGAGG 1132
||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1079 TAACAGCTTGCTTTGTTGAGGAAGTATCCCCTTCTCCTTCAATTAGTAGTCTGACAGAGG 1138
Query 1133 AGAAAACTTGG---GTCGATGGAAAAGCTGAGAATATTTCTGCCCTCCCGCCAAAGCCAC 1189
||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1139 AGAAAACTTGGATTGTTGATGGAAAAGCTGATAATATTTCTGCACTCCCGCCAAAGCCAC 1198
Query 1190 AATTACCTCCATCCTCCCATATTTTGGATTTAGATGGTCTTCCCGTACTTGATGTCTTTA 1249
|||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1199 AATTACCTCCATCCTCCCCTATTTTGGATTTAGACGGTCTTCCTGTACTTGATGTCTTTA 1258
Query 1250 CTACTTACTCTTGTCTGCGGTCCTTCAGTACTTTGCTGTTTTTGAGTCCCTTTGAGCTGA 1309
|| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1259 CTGCTTACTCTTGTCTGAGGTCCTTCAGTACTTTGCTGTTTTTGAGTCCTTTTGAGCTGA 1318
Query 1310 AAGATTTTGTGGAAGCATTGAGGTGCATGTCTCCTAGTCTATTATTTGATAGCATCCATG 1369
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1319 AGGATTTTGTGGAAGCATTGAGGTGCATGTCTCCTAGTCTATTATTTGATAGCATCCATG 1378
Query 1370 TTTCTGTCTTGCAAATATTAAGAAAACATTTGAAACAACTCGCTGCTGAAGGTGAACTAT 1429
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1379 TTTCTGTCTTGCAAATATTAAGAAAACATTTGAAACAACTCGCTGCTGAAGGTGACCTAT 1438
Query 1430 CTGCGTCTGCTTGCCTGAGGAGTCTTGATTGGGATACGTTGGATGTGGTCACATACCCCC 1489
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||
Sbjct 1439 CTGCGTCTGCTTGTCTGAGGAGTCTTGATTGGGATACGTTGGATGTGGTTACATATCCCC 1498
Query 1490 TTTTTGTGGTTGAATACCTACTATTTTCTGGGTACAAAGACAACCCTGGATTGGATCTTA 1549
|||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1499 TTTTTGTGGTTGAATACCTACTATGTTCTGGGTCCAAAGACAACCCTGGATTGGATCTTA 1558
Query 1550 CTCGGTTGAACTTTTTCAGAAACGAGTATTTCAGACAACCCATGAATCTGAAAATTGAGA 1609
||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1559 CTCGGCTGAACTTTTTCAGAAACGATTATTTCAGACAACCCGTGAATCTGAAAATTGAGA 1618
Query 1610 TACTTAGTCGTTTGTGCGATGATATGACAGATGCTGAAGTTGTGAGGTCAGAGCTTAATA 1669
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||
Sbjct 1619 TACTTAGTCGTTTGTGCGATGATATGACAGATGCTGAAGTCGTGAGGGCAGAGCTTAATA 1678
Query 1670 AAAGATCTTTTGCAGCTGAGTTTGAAACGGAACTTGATAGGAAGACAAACACAGAAGTTC 1729
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |
Sbjct 1679 AAAGATCTTTTGCAGCTGAGTTTGAAATGGAACTTGATAGGAAGACGAACACAGAAGTGC 1738
Query 1730 GACGCAGAAAGCGAACTATGATGGAGCTGGCAGATGATTTATCTTTTAATAACGAGGTCA 1789
|||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||
Sbjct 1739 GACGTAGAAAGCGAACTATGATGGAGCTGGCTGATGATTTTTCTTTAAATAACGAGGTCA 1798
Query 1790 TTGATACCTCATTTGACCGGAACAGTGACGACTGCTGTTTTTGTAAAATGGATGGGAGCT 1849
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1799 TTGATACTTCATTTGACCGGAACAGTGACGACTGCTGTTTCTGTAAAATGGATGGGAGCT 1858
Query 1850 TACTGTGCTGTGATGGTTGTCCGGCTGCATATCATTCTAAGTGTGTCGGTCTTGCCAGTC 1909
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1859 TACTGTGCTGTGATGGTTGTCCGGCTGCATATCATTCTAAGTGTGTCGGTCTTGCCAGTC 1918
Query 1910 ACCTTTTGCCTGAGGGTGACTGGTACTGTCCTGAATGTGCATTTGATCGGCGTGTACCAG 1969
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1919 ACCTTTTGCCTGAGGGGGACTGGTACTGTCCTGAATGTGCATTTGATCGGCGTGCACCAG 1978
Query 1970 GATTGAAGCCTGAAAAGCAAATTCGAGGCGCAGAGTTTATAGAGATTGATCCCCATGGTC 2029
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1979 GATTGAAGCCTGATAAGCAAATTCGAGGCGCAGAGTTTATAGAGATTGATCCGCATGGTC 2038
Query 2030 GAAAATACTACAGCAGTTGTGGCTACTTATTGGTGATAGATACAGATGGCACAGGCTCAT 2089
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2039 GAAAATACTACAGCAGTTGTGGCTACTTATTGGTGATAGATACAGATGGCACAGGCTCAT 2098
Query 2090 TTAACTACTATCATGTGAATGATGTGAACCTTGTGCTGGAACAGCTAAAGTCATGCAGTA 2149
| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2099 TGAACTACTATCATGTGACTGATGTGAACCTTGTGCTGGAGCAGCTAAAGTCATGCAGTA 2158
Query 2150 GTTTCTATAG-TGGCGTAGTAAGGGCAATTAAAAAACACTGGGATATCACTGTTGGGCCA 2208
|||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||
Sbjct 2159 GTTTCTAT-GCTGGCGTAGTAAGTGCAATTAGAAAACACTTGGATATCCCTGTTAGGCCA 2217
Query 2209 ATAAGGACAATCAGCGGTGTGAATTCCCAAATGTCTGTATGCCTGGATAAGTCTGTCAAA 2268
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||
Sbjct 2218 GTAAGGACAATCAGCGGTCTGAATTCCCAAATGTCTGTATGCATGGATAAGTCAGTCAAA 2277
Query 2269 GAAATGATTCCTTCTATTGATGGGTTTAAGGCTCCTCTACCAGCTTCAGAAAAACAGTCA 2328
| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2278 GGAATGATTCCTTCGATTGATGGGTTTGGGGCTCCTCTACCAGCTTCAGAGAAACAGTCA 2337
Query 2329 ACATCTGGTGCTaaaaaaaaGCTGAACAAAGCATCCAGCAATGGATGGTCACATAATCAT 2388
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2338 ACATCTGGTGCTAAAAAAAAGCTGAACAAAGCAACCAGCAATGGATGGTCACATAATCAT 2397
Query 2389 GGTCCTAGGACTCGTCGGAAGATATTAGATTCAGCTACTGGGCTAGATATCCTTAATATG 2448
|||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2398 GGTCCTAGGACTCGCCGGAAGATATCAGATTCAGCTACTGCGCTAGATATCCTTAATATG 2457
Query 2449 AGTTCTGAAGGATCTGCTGAAACTGTACAAAATGGATCAGACGTCCAGAGACTTCATGAG 2508
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2458 AGTTCTGAAGGATCTGCTGAAACTGTACAAAATGGTTCAGATGTCCAGAGACTTCATGAG 2517
Query 2509 CCAGCATCATCAAGCATTTTGGATATCATGGAAGAGCCAAATATGAATTCCCATAATTTG 2568
||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2518 CCAGCATCATCAAGCATGTTGGATATCATGAAAGAGCCAAATATGAATTCCCAAAATTTG 2577
Query 2569 GCTAGAATAAACACACGGAAAGGAATTAAACCAAATGTGCAGAGTGAAACAGGCTACAGA 2628
|||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2578 GCTAAAATAAACACACGGAAAGGAACTAAACCAAATGTGCAGACTGAAACAGGCTACAGA 2637
Query 2629 AACCATTACATATTTGCTCAGATGACTAGATCAGTTTATGAAGAGATGATACGTAAGTCA 2688
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2638 AACCAATACATATTTGCTCAGATGACTAGATCAGTTTATGAAGAGATGATACGTAAGTCA 2697
Query 2689 CCAATCCGTACCAATGATATGAGATCTGATGAAGAAATAGCTTCTACCCAGGTGAAGACT 2748
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2698 CCAATCCGTACCAATGATATGAGATCTGATGAAGAAATAGCTTCTACCCAGGTGAGGACT 2757
Query 2749 ATATTGATGAAAACCACCAAATTTCAATGGCGAAACATCCAAAGCCTCTACCTAGATGCG 2808
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2758 ATATTGATGAAAACCACCAAATTTCAATGGCGAAACATCCAAAGTCTCTACCTAGATGCA 2817
Query 2809 TGGAAAGAAAAATGTGGATGGTGTCATTCCTGCAAAAGTTCTTCTGAGGATGCTGGTAGT 2868
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |
Sbjct 2818 TGGAAAGAAAATTGTGGATGGTGTCATTCCTGCAAAAATTCTTCTGAGGATGCCGGTACT 2877
Query 2869 GAGATAAATTGTTTGTTTAATATGAGTCTTGGGGCTTTACGAGGTCTTTCGGAAAGTGAA 2928
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2878 GAGATAAATTGTTTGTTTAATATGAGTCTCGGGGCTTTACGAGGTCTTTCGGAAAGTGAA 2937
Query 2929 GTAGCTAACATTCAATCCATTGAGAAGAACAGTCATCTTTTGGCCATCATATGCCAGATA 2988
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2938 GTAGCTAACATTCAATCCTTTGAGAAGAACAGTCATCTTCTGGCCATCATATGCCAGATT 2997
Query 2989 CTTTCCATGGAAAGTCGACTGCAAGGACTCTTGGTTGGTCCATGGTTGAATCCGCAGCAC 3048
|||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2998 CTTTCCTTGGAAAGTCGACTACAAGGACTTTTGGTTGGTCCATGGTTGAATCCACAGCAC 3057
Query 3049 TCCGGCATTTGGCGTGAACACATTCTGAAGGCATCAAATATCTCAAGCTTGAAACATTTA 3108
||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3058 TCCAGCTTTTGGCGTGAACACATTCTGAAGGCATCAAATATCTCAAGCTTGAAACATTTA 3117
Query 3109 TTGGTTGAAT-TAGAGGCAAGTTTGCATCATCGTGTACTTTCACTTGAGTGGCTAAGCCA 3167
||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3118 TTGGTTG-ATCTAGAGGCAAATTTGCATCATCGTGTACTTTCACTTGAGTGGCTAAGCCA 3176
Query 3168 TGTCGATGCTGCCGTGGTAATGGGATCAGCAATACATATTCTCATTGCTTCGACACGATC 3227
||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3177 TGTCGATGCTGCCGTAGTGATGGGCTCAGCTATACATATTCTAATTGCTTCGACACGATC 3236
Query 3228 ATGGTCAAAGACTGCTATTGGTAAAAGAAGGGGGACATTGTTGGAGTCTGGGGTTAACCC 3287
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3237 ATGGTCAAAGACTGCTATTGGTAAAAGAAGGGGGACATTGTTGGATTCTGGGGTTAACCC 3296
Query 3288 TACTGCAAAGAAAAATGGTGGATTGACCATGTGTTGGTGGAGAGGTGGGCAGCTCTCACG 3347
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||
Sbjct 3297 TACTGCAAAGAAAAATGGTGGATTGACCATGTGCTGGTGGAGAGGCGGGCAACTTTCACG 3356
Query 3348 GCGGTTATTCAATTGGAAGGTTTTACCTCGCTCTTTAATCTCGAAGGCTGCTAGACAAGG 3407
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3357 ACGGTTATTCAATTGGAAGGTTTTACCTCGCGCTTTAATCTCGAAGGCTGCTAGACAAGG 3416
Query 3408 TGGAAGTATGAGTATTCCAGGAATATTGTATCCTGAGAATTCAGAGTCTGCTAAGAGAAG 3467
||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3417 TGGAAGTATGAATATTCCAGGAATATTTTATCCGGAGAATTCAGAGTCTGCTAAGAGAAG 3476
Query 3468 CCGACGTGTTGCCTGGGAAGCAGCTGTTGAGTCATCTACGACTTCAGAGCAGCTCGGTTT 3527
|||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3477 CCGACGTGTTGCCTGGGAAGCAGCGGTGGAGTCATCTACGACTTCAGAGCAGCTCGGTTT 3536
Query 3528 GCAGGTGAGGACACTCCAATCTTACATAAAGTGGGATGATATTGAAAACAGTCATCTTCT 3587
|||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3537 GCAGATTAGGACACTCCAATCTTACATAAAGTGGGATGATATTGAAAACAGTCATCTTCT 3596
Query 3588 TCCTACATTGGACAAAGAATCCAGAAAATCTACCAGGCTATTCAAAAAAGCGATTGTCCG 3647
||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3597 TCCTACATTAGACAAAGAATCCAGAAAATCTGCCAGGCTATTCAAAAAAGCAATTGTCCG 3656
Query 3648 TAGGAAGTGCACGGAGGAAGAGACTGTGAAATATCTCCTTGACTTTGGTAAGAGGAGAAA 3707
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3657 TAGGAAGTGCACGGAGGAAGAGACTGTGAAATATCTCCTTGACTTTGGTAAGAGGAGAAA 3716
Query 3708 TATTCCGGATGTTGTGTCGAAGAATGGTTGCATGGTTGAAGAATCCTCGAGTGGAAGAAA 3767
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3717 TATTCCGGATGTTGTGTCGAAGAATGGTTGCATGGTTGAAGAATCCTCGAGTGGAAGAAA 3776
Query 3768 AAAGTTCTGGCTGAATGAATCACATGTGCCTTTACATCTTATGAAAGGATTTGAAGAGAA 3827
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3777 AAGGTTCTGGCTGAATGAATCACATGTGCCTTTACATCTTGTGAAAGGATTTGAAGAGAA 3836
Query 3828 AAAAGCTGTACGGAAAACTAGCAAGTCAGGAGGCTCTTTCAGACACTCTGAGATAC-ACA 3886
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |
Sbjct 3837 AAAAGCTGTACGGAAAACTAGCAAGCCAGGAGGCTCTTTCAGACACTCTGAGATAGGA-A 3895
Query 3887 AATTACGGAAAAGGTCCTCAGAGGGAAAAGGATTCTCATACCTATTTGAAAGGGCAGAAA 3946
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3896 AATTACGGAAAAGGTCCTCAGAGGGAAAAGGATTCTCATACCTATTTGAAAGGGCAGAAA 3955
Query 3947 GATCTGAATCCTCTTTGTGTGAGCAATGTAAGAAAGATGTGCCTTTGAGTGAAGCTGCAA 4006
||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3956 GATCTGAATCCTCCTTGTGTGAGCAATGTAAGAAAGTTGTGCCTTTGAGTGAAGCTGCAA 4015
Query 4007 GCTGCCACATCTGCAAAGGAGTATTTCACAAAAAGCATATAAAGAGGGCAGAGAAGGAGG 4066
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |
Sbjct 4016 GCTGCCACATCTGCAAAGGAGTATTTCACAAAAAGCATATCAGGAGGGGAGAGAAGGAAG 4075
Query 4067 GCATGTACATCTGTCTTCCATGCAGAAGTGAAGTGATAGCAAAAGAACAACCCACCGTAC 4126
|||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||
Sbjct 4076 GCATGTACATATGTGTTCCATGCAAAAGTGAAGTGCTATCAAAAGAACAACCCACCGTAC 4135
Query 4127 GAAAAAGAGGGCGGCCGCCAGGGAGTTTCCGGaaaaaaaTTGGAGTTCAGACACAAAAGC 4186
|||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 4136 GAAAAAGAGGGCGGCCCCCTGGGAGTTTCCGGAAAAAAATTGGAGTTCAGACGCAAAAGC 4195
Query 4187 GTAAAAAGGTCATACCTGCTCGCAAATCACCTCGGCTAAAGAAGACTAAGACCTCAATGG 4246
||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||
Sbjct 4196 GTAAAAAAGTCATAGCTGCTCGCAAATCACCTCGGTTAAAGAAGACTAAGACTTCAATGG 4255
Query 4247 CAGAGAGAATTGCCATAAGGTTAAAGAATCATAAAAAGGTTGTTGCAAGCAAACCATTGC 4306
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4256 CAGAGAGAATTGCCATAAGGTTAAAGAATCATAAAAAGGTTGTTGCAAGCAAACCATTGC 4315
Query 4307 GACGTTCTGGCAGGCAATTGAAGCATGTTATTCGGCTGCAGGATGAAAGTAAAGTTCCTG 4366
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 4316 GACGTTCTGGCAGGCAATTGAAGCATGTTATTCGGCTGCAGGATGAAAGTAAAGTCCCTG 4375
Query 4367 AAGGGAGTAAGAAACGGAAACTGGAAACCAAAAGAGGTAGAGGCAGACCTAAGAAAGTAA 4426
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct 4376 AAGGGAGTAAGAAACGGAAACTGGAAACCAAAAGAGGCAGAGGTAGACCTAAGAAAGTAA 4435
Query 4427 AACAAGAGATCTCCATTAGAAAGGAGAGAACAGATAGGTGTTTGAGCTATTGGTTGAATG 4486
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||
Sbjct 4436 AACAAGAGATCTCCATTAGAAAGGCGAGAACAGATAGGTGCTTGAACTATTGGTTAAATG 4495
Query 4487 GCCTCCTTTTGTCCAGAAAGGCTGACGATGAACGGGTTCATAAGTTCCGGAAAGATAGAT 4546
|||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||| |||||| | ||| ||||
Sbjct 4496 GCCTCCTTTTGTCCCGAAAGGCTGGCAATGAACGGGTCCATCAGTTCCACAGAGAGAGAT 4555
Query 4547 ATTATATTCCCTTGGAGAACTCTGATTCTGATCATGATCAACCTAAGTGTCACTTATGTG 4606
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4556 ATTATGTTCCCTTGGAGAACTCTGATTCTGATCATGATCAACCTAAGTGTCACTTATGTG 4615
Query 4607 GCCCAATTGAATCTGAATCTGGATCAACTTTCATTGCTTGCGAAATCTGTGGAG 4660
|| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||
Sbjct 4616 GCTCAATTGAATCTAAATCTGGATCAACTTTCATTTCTTGCGAATTATGTGGAG 4669
Score = 58.4 bits (31), Expect = 6e-07
Identities = 31/31 (100%), Gaps = 0/31 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4716 AATGGTACCACGGAGATGCTTATGGGCTTAA 4746
|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4670 AATGGTACCACGGAGATGCTTATGGGCTTAA 4700
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 236737804017
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5