BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg488184
Length=2585
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G13640.1 | Symbols: ATPDAT, PDAT, PDAT1 | phospholipid:diacy... 3866 0.0
> AT5G13640.1 | Symbols: ATPDAT, PDAT, PDAT1 | phospholipid:diacylglycerol
acyltransferase | chr5:4393062-4397541 FORWARD LENGTH=2811
Length=2811
Score = 3866 bits (2093), Expect = 0.0
Identities = 2467/2636 (94%), Gaps = 71/2636 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATGAACCGCAACCTGAATCAGGAGCAAAGTGGTCAAGTTTCGCCATTCGGTCCGAGTCC 60
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||
Sbjct 196 CATGAACCGCAACCTGAACCAGGAGCAAAGTGGTCAAGTTTTGCCATCCGGTCCGAGTCC 255
Query 61 CTT----G----------G---a-aaaaaaaCAGAAAAGT-----AT---CAGAAAGAGA 94
||| | | | |||||||||||||||| || || |||||||
Sbjct 256 CTTGGAGGAATAATACCAGAACAGAAAAAAACAGAAAAGTCGACAATAAACA-AAAGAGA 314
Query 95 CAAATTTGATTTGATTGGTTCCAGAAATTCGCAGCGAAACAGCTCTTTG------T---C 145
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |
Sbjct 315 CAAATTTGATTTGATTGGTTCCAGAAATTCGCAGAGAAACAGCTCTTTGTCTCTCTCGAC 374
Query 146 ---TCT--C--T--C-AATCTGGGTTCTGAATTCCTGGAAGAGATTAGACAAAGTCCG-- 193
||| | | | |||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||
Sbjct 375 TGATCTAACAATCCCTAATCTGTGTTCTAAATTCCTGGACGAGATTTGACAAAGTCCGTA 434
Query 194 TAGCTTATTAATCTGG-TTAATTTCAAGTGACAGAGATGCCCCTTATTCATCGGAAAAAG 252
|||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 435 TAGC---TTAACCTGGTTTAATTTCAAGTGACAGATATGCCCCTTATTCATCGGAAAAAG 491
Query 253 CCGACGGAGAAACCATCGTCGCCGCCATCTGAAGAGGTGGTGGTACCCGATGAGGATTCC 312
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||
Sbjct 492 CCGACGGAGAAACCATCGACGCCGCCATCTGAAGAGGTGGT-G--CACGATGAGGATTCG 548
Query 313 CAAAAGAAACCACACGAATCTTCCAAATCCCACCATAAGAAATCCAACGGAGGAGGGAAG 372
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 549 CAAAAGAAACCACACGAATCTTCCAAATCCCACCATAAGAAATCGAACGGAGGAGGGAAG 608
Query 373 TGGTCGTGCATCGACTCTTGTTGTTGGTTCATTGGGTGTGTGTGCGTCACATGGTGGTTT 432
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||
Sbjct 609 TGGTCGTGCATCGATTCTTGTTGTTGGTTCATTGGGTGTGTGTGTGTAACCTGGTGGTTT 668
Query 433 CTTCTCTTCCTTTACAACGCAATGCCTGCCAGCTTCCCTCAGTATGTAACGGAGCGAATC 492
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 669 CTTCTCTTCCTTTACAACGCAATGCCTGCGAGCTTCCCTCAGTATGTAACGGAGCGAATC 728
Query 493 ACGGGTCCTTTGCCTGACCCGCCCGGTGTTAAGCTTAAGAAAGAAGGTCTTAAGGCGAAA 552
||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||
Sbjct 729 ACGGGTCCTTTGCCTGACCCGCCCGGTGTTAAGCTCAAAAAAGAAGGTCTTAAGGCGAAA 788
Query 553 CATCCCGTTGTCTTCATTCCTGGGATTGTCACTGGTGGGCTTGAGCTTTGGGAAGGCAAA 612
||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 789 CATCCTGTTGTCTTCATTCCTGGGATTGTCACCGGTGGGCTCGAGCTTTGGGAAGGCAAA 848
Query 613 CAATGCGCTGATGGTTTATTTAGAAAACGTTTGTGGGGTGGAACTTTTGGTGAAGTCTAC 672
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 849 CAATGCGCTGATGGTTTATTTAGAAAACGTTTGTGGGGTGGAACTTTTGGTGAAGTCTAC 908
Query 673 AAAAGGCCTCTATGTTGGGTGGAACACATGTCACTTGACAATGTAACTGGGTTGGATCCT 732
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 909 AAAAGGCCTCTATGTTGGGTGGAACACATGTCACTTGACAATGAAACTGGGTTGGATCCA 968
Query 733 GCTGGTATTAGAGTTAGAGCTGTATCAGGACTCGTGGCTGCCGACTACTTTGCTCCTGGC 792
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 969 GCTGGTATTAGAGTTCGAGCTGTATCAGGACTCGTGGCTGCTGACTACTTTGCTCCTGGC 1028
Query 793 TACTTTGTCTGGGCAGTGCTGATTGCTAACCTTGCACATATTGGATATGAAGAGAAAAAC 852
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1029 TACTTTGTCTGGGCAGTGCTGATTGCTAACCTTGCACATATTGGATATGAAGAGAAAAAT 1088
Query 853 ATGTACATGGCTGCTTATGACTGGAGGCTTTCGTTTCAGAACACAGAGGTACGTGACCAG 912
|||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1089 ATGTACATGGCTGCATATGACTGGCGGCTTTCGTTTCAGAACACAGAGGTACGTGATCAG 1148
Query 913 ACGCTTAGCCGTATGAAAAGTAATATAGAGTTGATGGTTTCTACCAACGGTGGAAAAAAG 972
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1149 ACTCTTAGCCGTATGAAAAGTAATATAGAGTTGATGGTTTCTACCAACGGTGGAAAAAAA 1208
Query 973 GCAGTTATAGTTCCCCATTCCATGGGAGTCTTGTATTTTCTACATTTTATGAAGTGGGTT 1032
|||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1209 GCAGTTATAGTTCCGCATTCCATGGGGGTCTTGTATTTTCTACATTTTATGAAGTGGGTT 1268
Query 1033 GAGGCACCAGCTCCTATGGGTGGCGGGGGTGGGCCAGATTGGTGTGCAAAGTATATAAAG 1092
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1269 GAGGCACCAGCTCCTCTGGGTGGCGGGGGTGGGCCAGATTGGTGTGCAAAGTATATTAAG 1328
Query 1093 GCGGTGATGAACATTGGTGGACCATTTCTTGGTGTTCCAAAAGCTGTTGCAGGGCTTTTC 1152
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1329 GCGGTGATGAACATTGGTGGACCATTTCTTGGTGTTCCAAAAGCTGTTGCAGGGCTTTTC 1388
Query 1153 TCTGCAGAAGCAAAGGATGTTGCAGTTGCCAGAGCGATTGCCCCAGGGTTCTTAGACACC 1212
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1389 TCTGCTGAAGCAAAGGATGTTGCAGTTGCCAGAGCGATTGCCCCAGGATTCTTAGACACC 1448
Query 1213 GACATATTCAGACTTCAGACCTTGCAGCATGTAATGAGAATGACACGCACATGGGACTCA 1272
|| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1449 GATATATTTAGACTTCAGACCTTGCAGCATGTAATGAGAATGACACGCACATGGGACTCA 1508
Query 1273 ACAATGTCTATGTTACCAAAGGGAGGTGACACAATATGGGGCGGTCTTGATTGGTCGCCG 1332
||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||
Sbjct 1509 ACAATGTCTATGTTACCGAAGGGAGGTGACACGATATGGGGCGGGCTTGATTGGTCACCG 1568
Query 1333 GAGAAAGGCCACACCTGTTGTGGGAAAAAGCAAAAGAGCAATGAGACTTGTGGTGAAGCA 1392
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||
Sbjct 1569 GAGAAAGGCCACACCTGTTGTGGGAAAAAGCAAAAGAACAACGAAACTTGTGGTGAAGCA 1628
Query 1393 GGTGAAAATGGAGTTTCCAAGACAAAG-CCTGTTAACTATGGAAGGATTATATCTTTTGG 1451
|||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1629 GGTGAAAACGGAGTTTCCAAGA-AAAGTCCTGTTAACTATGGAAGGATGATATCTTTTGG 1687
Query 1452 GAAAGAAGTAGCAGAGGCTGCGCCGTCTGAGATTAATAATATTGATTTTCGAGGTGCAGT 1511
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1688 GAAAGAAGTAGCAGAGGCTGCGCCATCTGAGATTAATAATATTGATTTTCGAGGTGCTGT 1747
Query 1512 CAAAGGTCAGAGTATCCCAAATCACACCTGTCGTGACGTGTGGACAGAGTACCATGATAT 1571
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1748 CAAAGGTCAGAGTATCCCAAATCACACCTGTCGTGACGTGTGGACAGAGTACCATGACAT 1807
Query 1572 GGGAATTGCAGGGGTCAAAGCTATCGCTGAGTATAAGGTCTACACTGCTGATGAAGCTAT 1631
||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1808 GGGAATTGCTGGGATCAAAGCTATCGCTGAGTATAAGGTCTACACTGCTGGTGAAGCTAT 1867
Query 1632 AGATCTACTACATTATGTTGCTCCTAAGATGATGGCGCGTGGTTCCGCTCATTTCTCTTA 1691
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1868 AGATCTACTACATTATGTTGCTCCTAAGATGATGGCGCGTGGTGCCGCTCATTTCTCTTA 1927
Query 1692 TGGAATTGCTGATGATTTGGATGACCCCAAGTATCAACAGCCCAAATACTGGTCAAATCC 1751
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||
Sbjct 1928 TGGAATTGCTGATGATTTGGATGACACCAAGTATCAAGATCCCAAATACTGGTCAAATCC 1987
Query 1752 GCTAGAGACAAAATTACCCAATGCTCCTGAGATGGAAATCTACTCATTATACGGAGTGGG 1811
| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1988 GTTAGAGACAAAATTACCGAATGCTCCTGAGATGGAAATCTACTCATTATACGGAGTGGG 2047
Query 1812 GATACCAACGGAACGAGCATATGTCTATAAGCTTAACCAGTCTCCTGACAGTTGCATCCC 1871
||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2048 GATACCAACGGAACGAGCATACGTATACAAGCTTAACCAGTCTCCCGACAGTTGCATCCC 2107
Query 1872 CTTTCAGATCTTCACTTCTGCTCACGAGGAGGACGAAGATAGCTGTCTGAAAGCAGGAGT 1931
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2108 CTTTCAGATATTCACTTCTGCTCACGAGGAGGACGAAGATAGCTGTCTGAAAGCAGGAGT 2167
Query 1932 TTACAATGTGGATGGGGATGAAACAGTACCGGTCCTAAGTGCCGGGTTCATGTGTGCTAA 1991
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||
Sbjct 2168 TTACAATGTGGATGGGGATGAAACAGTACCCGTCCTAAGTGCCGGGTACATGTGTGCAAA 2227
Query 1992 AGCGTGGCGTGGCAAGACAAGATTTAACCCTTCCGGAATCAAGACTTACATTAGAGAATA 2051
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||
Sbjct 2228 AGCGTGGCGTGGCAAGACAAGATTCAACCCTTCCGGAATCAAGACTTATATAAGAGAATA 2287
Query 2052 CAATCACTCTCCGCCGGCTAACCTGCTGGAAGGGCGAGGGACGCAGAGTGGAGCCCATGT 2111
||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2288 CAATCACTCTCCGCCGGCTAACCTGTTGGAAGGGCGCGGGACGCAGAGTGGTGCCCATGT 2347
Query 2112 TGATATCATGGGAAACTTTGCGTTGATAGAGGATATCATGAGGGTTGCCGCGGGAGGTAA 2171
||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2348 TGATATCATGGGAAACTTTGCTTTGATCGAAGATATCATGAGGGTTGCCGCCGGAGGTAA 2407
Query 2172 CGGATCCGATATAGGACATGACCAGGTCTACTCAGGCATATTTGAATGGTCGGAGCGTAT 2231
||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2408 CGGGTCTGATATAGGACATGACCAGGTCCACTCTGGCATATTTGAATGGTCGGAGCGTAT 2467
Query 2232 TGACCTGAAGCTGTGAATATCATGATCTCTTTAAGCTGTC-TGTCAGCTTCTGTGAATCC 2290
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||
Sbjct 2468 TGACCTGAAGCTGTGAATATCATGATCTCTTTAAGCTGTCCTGTCAGCTTATGTGAATCC 2527
Query 2291 AATACTTTGCAAGAGAGatcatcaacaattcatcatcatagtcatcatcatGATGCTCAC 2350
||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2528 AATACTTTGAAAGAGAGATCATCATCAATTCATCATCATCGTCATCATCATGATGCTCA- 2586
Query 2351 AAGTCACAAAGAAGCCTGAGAATGATACTTTGGTGCAAAATTCTCAATACCT-TTTAAAT 2409
| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |
Sbjct 2587 AC-TCACAAAGAAGCCTGAGAATGATACTTTGGTGCGAAATTCTCAATACCTCTTTAA-T 2644
Query 2410 ATTCTTATTGAATGTAAATTATACGATCCTATCTAATTGATCCCTAGAACGATAACGCAA 2469
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | | |||||||||| |||
Sbjct 2645 ATTCTTATTGAATGTAAATTATACAATCCTATCTAAT-GTT---T-GAACGATAACACAA 2699
Query 2470 AACTTGCTGCGCCATGTTTATTTGTCTTGTCGAAAGCATCAATTTGTGGGTTATATACGT 2529
||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2700 AACTTGCTGCGCCATGTTTGTTTGTCTTGTCAAAAGCATCAATTTGTGGGTTATA--CGT 2757
Query 2530 AGTGTAGAGGATGACTCAAATTTTGGTTATAAATTTGGTAATCAAAGTTAATTCTG 2585
|||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2758 AGTGTAGAGGATGATTCAAATTT-G-TGATAAATTTGGTAATCAAAGTTAATTCTG 2811
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 128327040194
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5