BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg488188
Length=3985
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G13680.1 | Symbols: ELO2, ABO1 | IKI3 family protein | chr5:... 6623 0.0
> AT5G13680.1 | Symbols: ELO2, ABO1 | IKI3 family protein | chr5:4410361-4415471
REVERSE LENGTH=4121
Length=4121
Score = 6623 bits (3586), Expect = 0.0
Identities = 3858/3992 (97%), Gaps = 8/3992 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGAAAAATTTGAAGCTTTACTCCGAGGTTTCTCAGAACATCCAATTGCATTCGACCGAA 60
||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1 ATGAAAAATTTGAAGCTTTTCTCGGAGGTTCCTCAGAACATCCAATTGCATTCGACTGAA 60
Query 61 GAAGTTGTACAGTTCGCAGCTTACGACATCGACCAAAGTCGCTTATTTTTCGCATCTTCT 120
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 GAAGTTGTACAGTTCGCAGCTTATGACATCGACCAAAGTCGCTTATTTTTCGCATCTTCT 120
Query 121 GCTAATTTCGTTTACTCCCTTCAGCTCTCTTCCTTCCAAAATGGAATATCT--GG----G 174
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || || |
Sbjct 121 GCTAATTTCGTTTACGCCCTTCAGCTCTCTTCCTTCCAAAATGAAAGCGCTGGGGCAAAG 180
Query 175 AGTGCTTTGCCTGCGGAGGTCTGCAGTATCGATATGGAGCCTGGGGATTTCATCACGGCC 234
|||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 AGTGCTATGCCTGTGGAGGTCTGCAGTATTGATATTGAGCCTGGGGATTTCATCACGGCT 240
Query 235 TTCGATTATCTGGCGGAGAAGGAGTCTCTATTAATTGGGACTTCTCATGGGCTTCTGCTA 294
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 241 TTCGATTATCTCGCGGAGAAGGAGTCTCTATTAATTGGGACTTCTCATGGGCTTTTGCTA 300
Query 295 CTGCATAATGTGGAGAGCGATGTGACTGAGCTAGTTGGAAATATAGAAGGAGGTGTCAAG 354
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 GTGCATAATGTGGAGAGTGATGTGACTGAGCTAGTTGGAAATATAGAAGGAGGTGTCAAG 360
Query 355 TGTATCTCGCCTAGTCCGACTGGAGATCTACTTGGATTGATTACTGGTCTTGGGCAGTTG 414
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 TGTATCTCGCCTAATCCGACTGGAGATCTACTTGGATTGATTACTGGTCTTGGGCAGTTG 420
Query 415 CTTGTAATGACTTATGATTGGGTTTTGATGTACGAGAGGGCGCTTGGAGAGGTTCCTGAA 474
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 CTTGTAATGACTTATGATTGGGCTTTGATGTACGAGAAGGCGCTTGGAGAGGTTCCTGAA 480
Query 475 GGTGGTTACGTACGTGAGGCGGAGGATGTGTCTGTAAATTGTGGGGGTATTTCCATTTCC 534
||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 GGTGGTTACGTACGTGAAACGAATGATTTGTCTGTAAATTGTGGGGGTATTTCCATTTCC 540
Query 535 TGGAGAGGTGATGGAAAGTATTTTGCGACTATGGGTGAGGTTTATGAATCCGGTTGTATG 594
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||
Sbjct 541 TGGAGGGGTGATGGAAAGTATTTTGCGACTATGGGTGAGGTTTATGAGTCTGGTTGTATG 600
Query 595 TCTAAGAAGATTAAGATATGGGAAAGTGATTCCGGCGCTTTGCAGTCTTCTTCAGAAACA 654
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 TCTAAGAAGATTAAGATATGGGAAAGTGATTCCGGTGCTTTGCAGTCTTCTTCAGAAACA 660
Query 655 AAAGAATTTACGCAGGGGATTCTTGAATGGATGCCGAGTGGTGCTAAAATCGCAGCTGTT 714
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 AAAGAATTTACGCAGGGGATTCTTGAATGGATGCCGAGTGGTGCTAAAATCGCAGCTGTT 720
Query 715 TATAAGAGGAAGTCAGATGATAGCTGTCCATCAATTGCTTTCTTCGAGAGGAATGGACTT 774
|||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 721 TATAAGAGGAAGTCAGATGATAGCAGTCCATCGATTGCTTTCTTTGAGAGGAATGGACTT 780
Query 775 GAGAGGAGCTCGTTTAGAATTGGTGAACCAGAAGATGCTACGGAATCATGTGAAACTCTG 834
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 781 GAGAGAAGCTCGTTTAGAATTGGTGAACCAGAAGATGCTACGGAATCATGTGAAAATCTG 840
Query 835 AAATGGAATTCTGCATCAGATCTTCTTGCAGGGGTTGTTAGTTGCAAAACATATGATGCC 894
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 841 AAATGGAATTCTGCATCAGATCTTCTTGCAGGGGTTGTTAGTTGTAAAACATATGATGCC 900
Query 895 ATTAGGGTGTGGTTCTTTAGCAACAACCACTGGTACCTGAAACAGGAGATTAGGTATCCA 954
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 ATTAGGGTGTGGTTCTTTAGCAACAACCACTGGTACCTGAAACAGGAGATTAGGTATCCA 960
Query 955 AGGGAAGCTGGGGTAACGGTCATGTGGGATCCAACAAAGCCACTGCAGTTAATATGTTGG 1014
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 AGGGAAGCTGGGGTAACAGTCATGTGGGATCCAACAAAGCCACTGCAGTTAATATGTTGG 1020
Query 1015 ACTCTGTCAGGGCAGGTGTCTGTTCGCAACTTTATGTGGGTAACAGCGGTCATGGAGGAC 1074
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021 ACTCTGTCAGGGCAGGTGTCTGTTCGCCACTTTATGTGGGTAACAGCGGTCATGGAGGAC 1080
Query 1075 TCCACAGCGTTTGTCATAGATAACTCCAAGATACTCGTGACACCACTATCTTTGTCCTTG 1134
|| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1081 TCAACAGCCTTTGTCATAGATAACTCCAAGATACTCGTGACACCACTATCTTTGTCCTTG 1140
Query 1135 ATGCCACCTCCTATGTATTTGTTCAGCCTTAGTTTTTCTTCTGCTGTCAGAGATATAGCA 1194
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1141 ATGCCACCTCCTATGTATTTGTTCAGCCTTAGTTTTTCTTCTGCTGTCAGAGATATAGCA 1200
Query 1195 TATTACTCAAGGAATTCTAAGAATTGTCTGGCTGTGTTTTTGTCAGATGGAAACCTGTCT 1254
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1201 TATTACTCAAGGAATTCTAAGAATTGTCTGGCTGTGTTTTTGTCAGATGGAAACCTGTCT 1260
Query 1255 TTTGTTGAGTTTCCTGCACCTAATACTTGGGAAGATCTCGAAGGCAAAGACTTCATTGTG 1314
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1261 TTTGTTGAGTTCCCTGCACCTAATACTTGGGAAGATCTCGAAGGCAAAGACTTCAGTGTG 1320
Query 1315 GAAATATCAGACTGTAACACAGCACTGGGCTCTTTTGTACATCTTCTATGGTTGGATGCC 1374
||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1321 GAAATTTCAGACTGTAAAACAGCACTGGGCTCTTTTGTACATCTTCTATGGTTGGATGTC 1380
Query 1375 CACTCACTTCTGTGTGTCTCCGCTTATGGTTCTAGCCACAACAAGTGTCTCTCTTCGGGA 1434
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1381 CACTCACTTCTGTGTGTCTCCGCTTATGGTTCTAGCCACAACAAGTGTCTCTCTTCGGGA 1440
Query 1435 GCGTATGAGACAGAGCTTCATGGTTCTTATTTACAAGAAGTCGAAGTAGTCTGTCACGAG 1494
| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||
Sbjct 1441 GGGTATGACACAGAGCTTCATGGTTCTTATTTACAAGAAGTTGAAGTAGTCTGTCATGAG 1500
Query 1495 GATCATGTTTCTGATCAAGTGACTTGCTCTGGCTTTAAGGCTAGCGTTACTTTCCAGACA 1554
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1501 GATCATGTTCCTGATCAAGTGACTTGCTCTGGCTTTAAGGCTAGCATTACTTTCCAGACA 1560
Query 1555 CTTCTCGAATCACCGGTCCTGGCTCTTGCCTGGAATCCTAGTAAGCGTGATTCAGCCTTT 1614
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1561 CTTCTCGAATCACCGGTCCTGGCTCTTGCCTGGAATCCTAGTAAGCGTGATTCAGCCTTT 1620
Query 1615 GTAGAGTTTGAGGGTGGGAAAGTGCTTGGATATGCATCAAGGTCAGGAATTATGGAAACT 1674
|| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1621 GTGGAGTTTGAGGGTGGGAAAGTGCTTGGATATGCGTCAAGGTCAGAAATTATGGAAACT 1680
Query 1675 CGTATTAGTGATGATAGTGTATGTTTTCCATCGACTTGTCCTTGGGTGAGGGTGGCGCAG 1734
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1681 CGTAGTAGTGATGATAGTGTATGTTTTCCATCGACTTGTCCTTGGGTGAGGGTGGCACAG 1740
Query 1735 GTTGATGCTAGTGGGGTGCATAAACCCTTGATATGTGGGCTTGATGATATGGGTAGACTG 1794
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1741 GTTGATGCTAGTGGGGTGCATAAACCCTTGATATGTGGGCTTGATGATATGGGTAGACTG 1800
Query 1795 TACATCAACGGGAAGAACCTATGTAATAACTGTAGCAGTTTCTCATTTTATTCAGAGTTG 1854
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1801 TCCATCAACGGGAAGAACCTATGTAATAACTGTAGCAGTTTCTCATTTTATTCAGAGTTG 1860
Query 1855 GCCAATGAAGTGGTTACCCATCTGATTATTTTGACCAAACAGGATTTTCTCTTTATTGTC 1914
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1861 GCCAATGAAGTAGTTACCCATCTGATTATTTTGACCAAACAGGATTTTCTCTTTATTGTC 1920
Query 1915 GATACCAAGGATGTACTGCAGGGAGATGTGGCACTTGGAAATGTGTACTTTGTTATTGAT 1974
|||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1921 GATACCAAGGATGTACTGAATGGAGATGTGGCACTTGGAAATGTGTTCTTTGTTATTGAT 1980
Query 1975 GGTAGAAGGCGAGATGAGGAAAATATGAGCTATGTTAATATATGGGAAAGAGGTGCAAAA 2034
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1981 GGTAGAAGGCGAGACGAGGAAAATATGAGCTATGTTAATATTTGGGAAAGAGGTGCAAAA 2040
Query 2035 GTGATAGGAGTCCTCAATGGAGACGAAGCTGCTGTAATATTACAAACTATGCGGGGGAAT 2094
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2041 GTGATAGGAGTCCTCAATGGAGATGAAGCTGCTGTGATATTACAAACTATGCGGGGGAAT 2100
Query 2095 CTGGAATGCATATATCCCAGAAAGCTGGTCCTCTCTTCCATTACGAATGCGTTAGCTCAG 2154
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2101 CTCGAATGCATATATCCCAGAAAGCTGGTCCTCTCTTCCATTACGAATGCGTTAGCTCAG 2160
Query 2155 CAACGGTTCAAAGATGCATTAAACTTGGTAAGGCGTCATAGAATCGACTTTAATGTTATC 2214
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2161 CAACGGTTCAAAGATGCATTTAACTTGGTAAGGCGTCATAGAATCGACTTTAATGTTATC 2220
Query 2215 GTGGATCTATATGGGTGGCAGGCATTTCTACAGTCAGCTGTAGAATTTGTTGAGCAAGTA 2274
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||
Sbjct 2221 GTGGATCTATATGGGTGGCAGGCATTTCTACAGTCAGCCGTAGCATTTGTTGAGCAAGTA 2280
Query 2275 AACAATTTGAACCATGTTACAGAATTTGTTTGTGCCATGAAGAATGAAGATGTTACAGAA 2334
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2281 AACAATTTGAACCATGTTACAGAATTTGTTTGTGCCATGAAGAATGAAGATGTTACAGAA 2340
Query 2335 ACACTGTACAAAAAATTTTCCTTTTCCAAAAAGGGAGACAAAGTTTTTCAAGTGAAAGAT 2394
|| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||
Sbjct 2341 ACGCTGTACAAAAAGTTTTCCTTTTCCAAAAAGGGAGACGAGGTTTTTCGTGTGAAAGAT 2400
Query 2395 CGTTGCAGTAACAAAGTATCATCAGTTCTACTGGCAATTAGGAAGGCCCTTGAAGAACAT 2454
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2401 AGTTGCAGTAACAAAGTATCATCAGTTCTACAGGCAATTAGGAAGGCCCTTGAAGAACAT 2460
Query 2455 ATACCAGAGAGTCCATCAAGGGAACTCTGTATTTTGACCACTCTTGCCCGAAGTGATCCA 2514
|| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2461 ATCCCAGAAAGTCCATCAAGGGAACTCTGTATTTTGACCACTCTTGCCCGAAGTGATCCA 2520
Query 2515 CCAGCTATTGAAGAATCTCTTTTGAGGATAAAATCTGTTCGTGAAATGGAGTTGCTAAAC 2574
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2521 CCAGCTATCGAAGAATCTCTTTTGAGGATAAAATCTGTTCGTGAAATGGAGTTGCTAAAC 2580
Query 2575 TCTTCTGATGATATAAGGAAAAAGTCTTGTCCATCTGCAGAAGAAGCCTTGAAACATCTA 2634
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2581 TCTTCTGATGATATAAGGAAAAAGTCTTGTCCATCTGCAGAAGAAGCCTTGAAACATCTT 2640
Query 2635 CTGTGGTTATTGGATTCTGATGCTGTCTTTGAAGCTGCCTTAGGTCTTTATGATCTGAAC 2694
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2641 CTGTGGTTATTGGATTCTGAGGCTGTCTTTGAAGCTGCCTTAGGTCTTTATGATCTGAAC 2700
Query 2695 CTTGCAGCTATTGTGGCACTCAATTCCCAGCGTGATCCAAAAGAATTTCTACCTTATCTC 2754
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2701 CTTGCAGCTATTGTGGCACTCAATTCCCAGCGTGATCCAAAAGAATTTTTACCTTATCTC 2760
Query 2755 CAGGAGCTGGAAAAAATGCCCGAATCCCTGATGCATTTCAAGATTGACATTAAATTGCAG 2814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2761 CAGGAGCTGGAAAAAATGCCCGAATCCCTGATGCATTTCAAGATTGACATTAAATTGCAG 2820
Query 2815 CGTTTTGATAGTGCTCTTAGGAACATTGTATCAGCAGGGGATGGCTACTTTCCTGATTGC 2874
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2821 CGTTTTGATAGTGCTCTTAGGAACATTGTATCAGCAGGGGTTGGCTACTTTCCTGATTGC 2880
Query 2875 ATGAACTTAATAAAGAAAAACCCTCAACTTTTCCCGCTGGGCCTCCGGCTAATTACCGAT 2934
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||
Sbjct 2881 ATGAACTTAATAAAGAAAAACCCTCAACTTTTCCCTCTGGGCCTCCTGCTAATTACTGAT 2940
Query 2935 CCTGAGAAGAAACAAGCTGTTCTAGAGGCTTGGGCAGATCATCTCATTGATGAAAAACGT 2994
||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2941 CCTGAGAAGAAACTAGTTGTTCTAGAGGCTTGGGCAGATCACCTCATTGATGAAAAACGT 3000
Query 2995 TTTGAGGATGCTGCTACTACGTACCTATGTTGCTGTAAACTGGAAAAGGCTTCAAAGGCA 3054
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3001 TTTGAGGATGCTGCTACTACATACCTATGTTGCTGTAAACTGGAAAAGGCTTCAAAGGCA 3060
Query 3055 TATCGTGAATGTGGTGACTGGAGTGGGGTACTCAGAGTGGGGGCGCTAATGAAATTAGGT 3114
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3061 TATCGTGAATGTGGTGACTGGAGTGGGGTACTCCGAGTGGGGGCGCTAATGAAATTAGGT 3120
Query 3115 AAAGATGAGATCTTGAAATTGGCATATGAACTCTGTGAAGAGGTGAACGCTCTTGGGAAA 3174
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||
Sbjct 3121 AAAGATGAGATCTTGAAATTGGCATATGAACTCTGTGAAGAGGTCAATGCTCTTGGGAAA 3180
Query 3175 CCAGCGGAAGCAGCAAAAATAGCTCTTGAGTATTGCAGAGATATAAGCGGTGGAATTAGT 3234
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3181 CCAGCGGAAGCAGCAAAAATAGCGCTTGAGTATTGCAGCGATATAAGCGGTGGAATTAGT 3240
Query 3235 TTGCTTATCAATGCAAGGGAATGGGAAGAGGCTTTAAGGGTTGCATTTTTGCATACAGCA 3294
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3241 TTGCTTATCAATGCGAGGGAATGGGAAGAGGCTTTAAGGGTTGCATTTTTGCATACAGCA 3300
Query 3295 GATGATAGAATCTCAGTGGTGAAGAGTTCTGCTCTGGAGTGTGCTAGTGGTCTAGTAAGT 3354
||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3301 GATGATAGAATCTCAGTGGTGAAAAGTTCTGCTTTGGAGTGTGCTAGTGGTCTAGTAAGT 3360
Query 3355 GAATTCAAAGAATCAATAGAAAAGGTAGGAAAATATTTGACTCGCTATTTAGCTGTTCGG 3414
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||
Sbjct 3361 GAATTCAAAGAATCAATAGAAAAGGTAGGAAAATATTTGACTCGCTATCTAGCTGTCCGG 3420
Query 3415 CAGAGACGATTATTGCTTGCAGCAAAGCTCAAATCTGAGGAACGGTCAGTAGTTGATCTG 3474
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||
Sbjct 3421 CAGAGACGATTATTGCTTGCAGCAAAGCTCAAATCCGAGGAACGATCTGTTGTTGATCTT 3480
Query 3475 GACGATGACACAGCTTCAGAGGCTAGTAGCAACCTGAGTGGAATGAGCGCCTATACTTTG 3534
|||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3481 GACGATGACACAGCTTCAGAAGCAAGTAGCAACCTGAGTGGAATGAGCGCCTATACTTTG 3540
Query 3535 GGGACAAGGAGAGGTTCTGCTGCTTCAGTCAGCTCAAGCA-CGGCTACTAGCAGGGCAAG 3593
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||
Sbjct 3541 GGGACAAGGAGAGGTTCTGCTGCTTCAGTCAGCTCAAGCAACG-CTACTAGCAGGGCAAG 3599
Query 3594 AGATTTGAGGCGCCAGAGAAAGAGCGGGAAAATCCGTGCTGGCAGTGCGGGTGAAGAGAT 3653
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3600 AGATTTGAGGCGCCAGAGAAAGAGTGGGAAAATCCGTGCTGGCAGTGCGGGTGAGGAGAT 3659
Query 3654 GGCTCTTGTTGATCATTTGAAGGGTATGCGTATGACCGAAGGTGGAAAGCGAGAGCTGAA 3713
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||
Sbjct 3660 GGCTCTTGTTGATCATTTGAAAGGTATGCGTATGACCGATGGAGGAAAGCGAGAGCTGAA 3719
Query 3714 GTCTTTGTTGATATGTCTGGTTACAGTTGGTGAAATGGAGTCTGCACAGAAGTTGCAACA 3773
||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3720 GTCGTTGTTGATATGTCTGGTAACACTTGGTGAAATGGAGTCTGCACAGAAGTTGCAACA 3779
Query 3774 GACTGCAGAGAATTTCCAGGTCTCGCAAGTAGCAGCTGTAGAGCTAGCACACGATACAGT 3833
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3780 GACTGCAGAGAATTTCCAGGTCTCCCAAGTAGCAGCTGTAGAGCTAGCACACGATACAGT 3839
Query 3834 GTCCAGCGAGAACGTGGACGAAGAAGTTTATTGTTTTGAACGTTATGCTCAGAAGACGAG 3893
||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3840 GTCCAGCGAGAGCGTAGATGAAGAAGTTTATTGCTTTGAACGTTACGCTCAGAAGACGAG 3899
Query 3894 ATCCACAGCAAGAGATTCAGATGACTTTAGCTGGATGCTTAAGGTCTTCATTAGCCCATG 3953
|||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3900 ATCCACAGCACGAGATTCAGATGCCTTTAGCTGGATGCTTAAGGTCTTCATAAGCCCATG 3959
Query 3954 AAAATCTCTACATCTGTTTTTGACTGAATAAG 3985
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3960 AAAATCTCTACATCTGTTTTTGACTGAATAAG 3991
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 198560760394
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5