BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg488339
Length=3998
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G14950.1 | Symbols: GMII, ATGMII | golgi alpha-mannosidase I... 6318 0.0
> AT5G14950.1 | Symbols: GMII, ATGMII | golgi alpha-mannosidase
II | chr5:4837152-4841942 REVERSE LENGTH=4004
Length=4004
Score = 6318 bits (3421), Expect = 0.0
Identities = 3830/4022 (95%), Gaps = 50/4022 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGAAAAGTCCGTCGAATCTAAAGAGTCAAGACCATCATCATCCACTTACATAAATCTCAG 60
|||||||||| |||||||| | | |||| | |||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1 AGAAAAGTCCATCGAATCT--A-A---AAGA-C--CATCATCCGCTTACATAAATCTCAG 51
Query 61 AGCCGAACACAAGT----AAGaaaaaa-aaGACCACTCGAAACGACGTAGTTTTAATTCA 115
||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 52 AGCAGAACACAAGTAAGAAAGAAAAAAGAAGACAACTCGAAACGACGTAGGTTTAATTCG 111
Query 116 TTAGCCAGAAGaa-aaaaaGGAAATTCCGAGGAGGAGAGATTATGCCGTTCTCCTCCTAC 174
|||| |||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||
Sbjct 112 TTAGATAGAA-AAGAAAAAGGAAATTCCGAGGAGGAGA-A-TATGCCGTTCTCCTCGTAT 168
Query 175 ATCGGCAACACCCGCCGTAGCTCCA-C--C---GG---CGGTGGTTGGGGCCAATCACTT 225
|||||||||| |||||||||||||| | | || ||| |||||||||||||| |||
Sbjct 169 ATCGGCAACAGCCGCCGTAGCTCCACCGGCGGAGGAACCGGCGGTTGGGGCCAATCTCTT 228
Query 226 CTCCCAACAGCGTTATCAAAGTCAAAACTAGCGACCAATCGAAAACCACGAAAACGAACA 285
|| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 229 CTTCCAACAGCGTTATCAAAGTCAAAACTAGCGATCAATCGAAAACCACGAAAACGAACT 288
Query 286 GTCGTAATCAATTTCCTCTTCGCCAACTTCTTCATCATCGCACTCATGGTCTCACTCCTC 345
||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 289 CTCGTAGTCAATTTCATCTTCGCCAACTTCTTCGTCATCGCACTCACCGTCTCACTCCTC 348
Query 346 TTCTTCCTCCTCACTCTCTTCCATTTCGGCGTACCAGGACCGATCTCCTCACGATTCCTC 405
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 349 TTCTTCCTCCTCACTCTCTTCCACTTCGGCGTACCAGGACCGATCTCCTCACGATTCCTT 408
Query 406 ACCTCCAGATCCAATCGGATCGTGAAGCCACGGAAGAATATCAATCGCCGACCATTAAAC 465
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||
Sbjct 409 ACCTCCAGATCCAATCGGATCGTCAAGCCACGGAAGAATATTAATCGCCGACCCTTAAAC 468
Query 466 GATTCCAATTCCGGCGCCGTCGTTGATATCACAACTAAAGATCTATACGATAGGATTGAG 525
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 469 GATTCCAATTCAGGCGCCGTCGTTGATATCACAACTAAAGATCTATACGATAGGATTGAG 528
Query 526 TTTCTTGATGCAGATGGTGGTCCATGGAAACAAGGTTGGAGAGTTACGTATAAAGGA-GA 584
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 529 TTTCTTGATACAGATGGTGGTCCATGGAAACAAGGTTGGAGAGTTACGTATAAA-GACGA 587
Query 585 TGAGTGGGAGAAAGAGAAGCTCAAAATCTTCGTTGTGCCTCATTCTCATAACGATCCTGG 644
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 588 TGAGTGGGAGAAAGAGAAGCTCAAAATCTTCGTTGTTCCTCATTCTCATAACGATCCTGG 647
Query 645 TTGGAAATTGACGGTGGAGGAGTATTATCAGAGACAATCCAGGCATATTCTTGACACCAT 704
|||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 648 TTGGAAATTGACTGTAGAGGAGTATTATCAGAGACAATCCAGACATATTCTTGACACCAT 707
Query 705 TGTTGAGACTTTATCTAAGGATTCAAGAAGAAAGTTTATATGGGAGGAGATGTCATATCT 764
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 708 TGTTGAGACTTTATCTAAGGATTCAAGAAGAAAGTTTATATGGGAGGAGATGTCATATCT 767
Query 765 GGAGAGATGGTGGAGAGACGCTTCACCTAATAAACAAGAAGCTTTGACTAAATTGGTTAA 824
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 768 GGAGAGATGGTGGAGAGACGCTTCACCTAATAAACAAGAAGCTTTGACTAAATTGGTTAA 827
Query 825 GAATGGGCAGCTAGAGATTGTTGGAGGTGGCTGGGTTATGAATGATGAGGCTAATTCTCA 884
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 828 GGATGGGCAGCTAGAGATTGTTGGAGGTGGCTGGGTTATGAATGATGAGGCTAATTCACA 887
Query 885 TTATTTTGCCATAATTGAACAGATAGCAGAGGGTAATATGTGGCTGAATGACACAATTGG 944
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 888 TTATTTTGCCATAATTGAACAGATAGCAGAGGGTAATATGTGGCTGAATGACACAATTGG 947
Query 945 GGTTATTCCTAAGAATTCTTGGGCTATAGATCCCTTTGGCTATTCATCAACCATGGCTTA 1004
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 948 GGTTATTCCTAAGAATTCTTGGGCTATAGATCCCTTTGGCTATTCATCAACCATGGCTTA 1007
Query 1005 TCTCCTCCGGCGTATGGGTTTTGAAAACATGCTTATTCAGAGGACTCATTACGAGCTCAA 1064
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1008 TCTTCTCCGGCGTATGGGTTTTGAAAACATGCTTATTCAAAGGACTCATTACGAGCTCAA 1067
Query 1065 GAAAGACCTTGCCCAGCATAAGAATCTTGAATATATTTGGCGTCAAAGTTGGGATGCTAT 1124
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||
Sbjct 1068 GAAAGACCTTGCCCAGCATAAGAATCTTGAATATATTTGGCGTCAGAGCTGGGATGCTAT 1127
Query 1125 GGAAACAACAGATATCTTTGTTCATATGATGCCTTTTTATTCATACGATATCCCACACAC 1184
|||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1128 GGAAACCACAGATATCTTTGTTCATATGATGCCGTTTTATTCATACGATATCCCACACAC 1187
Query 1185 TTGTGGACCAGAGCCTGCAATTTGCTGTCAGTTTGATTTCGCTCGGATGCGGGGATTTAA 1244
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1188 TTGTGGACCAGAGCCTGCAATTTGCTGTCAGTTTGATTTCGCTCGGATGCGGGGATTTAA 1247
Query 1245 GTATGAACTTTGTCCATGGGGAAAGCACCCAGTGGAGACCACACTAGAGAATGTGCAGGA 1304
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1248 GTATGAACTTTGTCCATGGGGAAAGCACCCAGTGGAGACCACACTAGAAAATGTGCAGGA 1307
Query 1305 GAGGGCATTAAAGCTTCTGGATCAATACAGGAAAAAATCCACCCTATATCGAACTAATAC 1364
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1308 GAGGGCATTAAAGCTTCTGGATCAATACAGGAAAAAATCCACTCTATATCGAACTAATAC 1367
Query 1365 CCTTCTTATACCTCTTGGAGATGATTTTAGGTACATTAGTATCGATGAAGCCGAGGCTCA 1424
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1368 ACTTCTTATACCTCTTGGAGATGATTTTAGGTACATTAGTATCGATGAAGCCGAGGCTCA 1427
Query 1425 GTTCCGTAACTACCAGATGTTGTTTGATCACATCAACTCTAATCCTAGTCTAAACGCAGA 1484
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1428 GTTCCGTAACTACCAGATGTTGTTTGATCACATCAACTCTAATCCTAGTCTAAACGCAGA 1487
Query 1485 GGCAAAGTTTGGCACTTTGGAGGATTATTTCAGGACACTCCGAGAAGAAGCCGACATAGT 1544
||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||
Sbjct 1488 AGCAAAGTTTGGTACTTTGGAGGATTATTTCAGAACAGTCCGAGAAGAAGCAGACAGAGT 1547
Query 1545 AAATTATTCTCGTCCTGGTGAGGTTGGCTCTGGTCAGGTTGTGGGTTTCCCTTCTCTGTC 1604
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1548 GAATTATTCTCGTCCTGGTGAGGTTGGCTCTGGTCAGGTTGTTGGTTTCCCTTCTCTGTC 1607
Query 1605 AGGTGACTTCTTTACATATGCAGATAGGCAACAAGACTATTGGAGTGGTTATTATGTTTC 1664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1608 AGGTGACTTCTTTACATATGCAGATAGGCAACAAGACTATTGGAGTGGTTATTATGTTTC 1667
Query 1665 AAGGCCTTTCTTCAAAGCTGTTGATCGTGTGCTCGAGCATACCCTTCGTGGAGCTGAGAT 1724
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1668 AAGACCTTTCTTCAAAGCTGTTGATCGTGTGCTCGAGCATACCCTTCGTGGAGCTGAGAT 1727
Query 1725 CATGATGTCATTTCTGCTAGGTTATTGCCATCGGATTCAGTGTGAGAAATTTCCAACAAG 1784
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1728 CATGATGTCATTTCTGCTAGGTTATTGCCATCGAATTCAATGTGAGAAATTTCCAACAAG 1787
Query 1785 TTTTACGTATAAGTTAACTGCTGCAAGAAGAAATCTAGCTCTTTTCCAGCACCATGATGG 1844
||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1788 TTTTACGTATAAGTTGACTGCTGCAAGAAGAAATCTGGCTCTTTTCCAGCACCATGATGG 1847
Query 1845 GGTAACCGGAACTGCTAAGGATTATGTGGTACAAGATTACGGCACCCGGATGCATACTTC 1904
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1848 GGTAACTGGAACTGCTAAGGATTATGTGGTACAAGATTACGGCACCCGGATGCATACTTC 1907
Query 1905 ATTGCAAGACCTTCAGATCTTTATGTCTAAAGCAATCGAAGTTCTTCTTGGGATCCGCCA 1964
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1908 ATTGCAAGACCTTCAGATCTTTATGTCTAAAGCAATCGAAGTTCTTCTTGGGATCCGCCA 1967
Query 1965 CGAGAAAGAAAAATCTGATCAATCCCCATCATTTTTCGAGGCAGAGCAAGTGAGATCCAA 2024
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||
Sbjct 1968 CGAGAAAGAAAAATCTGATCAATCCCCATCATTTTTCGAGGCAGAGCAAATGAGATCAAA 2027
Query 2025 GTATGATGCCCGGCCGGTTCACAAGCCAATTGCTGCGCGGGAAGGAAATTCACACACAGT 2084
||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2028 GTATGATGCTCGGCCAGTTCACAAGCCAATTGCTGCCCGGGAAGGAAATTCGCACACAGT 2087
Query 2085 TATACTTTTCAATCCATCGGAACAGACAAGAGAGGAGGTAGTGACGGTTGTTGTTAACCG 2144
|||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2088 TATACTCTTCAATCCATCAGAACAGACGAGAGAGGAGGTGGTGACGGTTGTTGTTAACCG 2147
Query 2145 CGCTGAAATCTCGGTTTTGGACTCAAACTGGACTTGTGTCCCTAGCCAAATTTCTCCTGA 2204
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2148 CGCTGAAATCTCGGTTTTGGACTCAAACTGGACTTGTGTCCCTAGCCAAATTTCTCCTGA 2207
Query 2205 AGTGCAGCATGACAATACCAAACTATTCACCGGCAGACATCGCCTTTACTGGAAGGCTTC 2264
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2208 AGTGCAGCATGACGATACCAAACTATTCACCGGCAGACATCGCCTTTACTGGAAAGCTTC 2267
Query 2265 CATCCCAGCTCTTGGTCTGAGAACATATTTTATTGCTAATGGGAATGTCGAATGTGAGAA 2324
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2268 CATCCCAGCTCTTGGTCTGAGAACATATTTCATTGCTAATGGGAATGTCGAGTGTGAGAA 2327
Query 2325 AGCTACACAATCTAAACTCAAATACGCTTCTGAGTTTGACCCATTTCCTTGTCCTCCTCC 2384
|||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2328 AGCTACTCCGTCTAAACTCAAATACGCTTCTGAGTTTGACCCATTTCCTTGTCCTCCTCC 2387
Query 2385 ATATTCCTGCTCCAAACTGGACAGCGACGTTACTGAGATCCGAAATGAACATCAGACTCT 2444
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2388 ATATTCCTGCTCCAAACTGGACAACGACGTTACTGAGATCCGAAATGAACATCAGACTCT 2447
Query 2445 TGTGTTTGATGTGAAGAACGGATCACTGCGGAAGATAATCCATAGAAACGGATCAGAGAC 2504
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2448 TGTGTTTGATGTGAAGAACGGATCACTGCGGAAGATAGTCCATAGAAACGGATCAGAGAC 2507
Query 2505 TGTTGTGGGAGAAGAGATAGGTATGTACTCTAGTCCAGAGAGTGGAGCTTACCTGTTCAA 2564
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2508 TGTTGTGGGAGAAGAGATAGGTATGTACTCTAGTCCAGAGAGTGGAGCTTACCTGTTCAA 2567
Query 2565 ACCAAATGGTGAAGCTCAGCCAATTGTTCAACCCGGTGGACATGTAGTTACCTCTGAGGG 2624
|||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2568 ACCAGATGGTGAAGCTCAGCCAATTGTTCAACCTGATGGACATGTAGTCACCTCTGAGGG 2627
Query 2625 TCTGCTGGTTCAAGAAGTTTTCTCTTACCCTAAAACCAGATGGGAGAAATCACCCCTCTC 2684
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2628 TCTGCTGGTTCAAGAAGTCTTCTCTTACCCTAAAACCAAATGGGAGAAATCACCCCTCTC 2687
Query 2685 TCAGAAAACTCGTCTTTACACTGGAGGTAATACGCTTCAGGATCTAGTGGTCGAGATAGA 2744
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2688 TCAGAAAACTCGTCTTTACACTGGAGGTAATACGCTTCAGGATCAAGTGGTCGAGATAGA 2747
Query 2745 ATATCATGTTGAGCTACTAGGTAACGATTTCGATGACCGGGAATTGATTGTCCGGTACAA 2804
||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2748 ATATCATGTTGAGCTTCTTGGTAATGATTTTGATGACCGGGAATTGATTGTCCGGTACAA 2807
Query 2805 GAGTGATGTTGACAACAAGAAGGTCTTCTATTCAGATCTCAATGGTTTCCAAATGAGCAG 2864
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2808 GACTGATGTTGACAACAAGAAGGTCTTCTATTCAGATCTCAATGGTTTCCAAATGAGCAG 2867
Query 2865 GAGAGAAACTTATGATAAGATCCCACTTCAAGGAAACTACTACCCAATGCCATCTCTCGC 2924
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2868 GAGAGAAACTTATGATAAGATCCCTCTTCAAGGAAACTACTACCCAATGCCATCTCTCGC 2927
Query 2925 ATTCATCCAAGGATCCAAGGGTCAGAGATTCTCCGTGCACTCTCGTCAATCTCTCGGTGT 2984
||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2928 ATTTATCCAAGGATCCAATGGTCAGAGATTCTCCGTGCACTCTCGTCAATCTCTCGGTGT 2987
Query 2985 TGCAAGCCTTAAAGAGGGTTGGTTGGAGATTATGCTAGACAGACGGTTGGTCCGTGATGA 3044
||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2988 TGCAAGCCTCAAAGAGGGTTGGTTGGAGATTATGCTGGACAGACGGTTGGTTCGTGATGA 3047
Query 3045 CGGACGTGGTCTAGGGCAAGGCGTGATGGATAACCGCGCAATGACCGTGGTTTTTCACCT 3104
|||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3048 CGGACGGGGTCTAGGGCAAGGTGTGATGGATAACCGCGCAATGACCGTGGTATTTCACCT 3107
Query 3105 TCTTGCGGAATCTAACATTTCTCA-GTCAGACCCTGCTTCCAACCCAAACCCGAGGAACC 3163
|||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||||
Sbjct 3108 TCTTGCGGAATCTAACATTTCTCAAG-CAGACCCTGCTTCCAACACTAACCCGAGGAACC 3166
Query 3164 CTTCGCTTCTCTCTCACCTCATAGGTGCTCACTTAAACTACCCCATAAACACATTCATTG 3223
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3167 CTTCGCTTCTCTCTCACCTCATAGGTGCTCACTTAAACTACCCCATAAACACATTCATTG 3226
Query 3224 CCAAGAAACCACAGGACATATCCGTGCGTGTTCCACAATACGGTTCCTTTGCTCCTTTAG 3283
|||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3227 CCAAGAAACCGCAAGACATATCTGTGCGTGTTCCACAATACGGTTCCTTTGCTCCTTTAG 3286
Query 3284 CCAAACCGCTACCGTGTGACCTCCACATAGTGAATTTCAAGGTTCCGCGTCCATCCAAAT 3343
|||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3287 CCAAACCGTTACCATGTGACCTCCACATTGTAAATTTCAAGGTTCCTCGTCCATCCAAAT 3346
Query 3344 ACTCTCAGCAGTTGGAAGAAGACAAGCCGAGATTCGCTCTTATCCTCAACAGACGAGGTT 3403
|||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||
Sbjct 3347 ACTCTCAGCAATTGGAAGAAGACAAGCCAAGGTTCGCTCTTATCCTCAATAGACGAGCTT 3406
Query 3404 GGGACTCAGCTTATTGCCATAAAGGAAGACAAGCAAACTGCACAAGCGTGGCTAATGATC 3463
|||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |
Sbjct 3407 GGGATTCAGCTTATTGCCATAAAGGAAGACAAGTAAACTGCACAAGCATGGCTAATGAAC 3466
Query 3464 CAGTGAACTTTTCCGATATGTTCAAAGATCTTGCAGCTTCAAAGGTAAAACCAACTTCAC 3523
|||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3467 CAGTAAACTTTTCCGACATGTTCAAAGATCTTGCAGCTTCAAAGGTAAAACCAACTTCAC 3526
Query 3524 TGAATCTCTTGCAAGAAGATATGGAGATCCTCGGGTACGATGATCAAGAGCCAACTCGAG 3583
|||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| | ||||||
Sbjct 3527 TGAATCTCTTGCAAGAAGATATGGAGATTCTTGGGTACGATGACCAAGAGCTACCTCGAG 3586
Query 3584 ATAGTTCACAGCCGCGGGAAGGACGTGTCTTGATCTCTCCCATGGAAATACGAGCTTATA 3643
||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3587 ATAGTTCACAGCCACGGGAAGGACGTGTCTCGATCTCTCCCATGGAAATACGAGCTTATA 3646
Query 3644 AGCTTGAGCTACGACCTCACAAGTGAAA-ACACACACTTAAGACTGAACGTTGACTATT- 3701
||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3647 AGCTTGAACTGCGACCTCACAAGTGAAATACACACACTTAAGACTGAACGTTGACTATTT 3706
Query 3702 ATTGGCTGGTATGGCCTCACAA-GATCGTTGACTA-AGAGAGGTTGGGCTCAGAATCTGC 3759
||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3707 ATTGGCTGGTATGGCCTCA-AACGATCGTTGACTATA-AGAGGTTGGGCTCAGAATCGGC 3764
Query 3760 T-CTTCTTGTTCaaaaaaaGCTGTGCCGGGAACATGAACTGTGTCAAAAAGAGAGAGTAG 3818
| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3765 TTCTTCTTGTTCACAAAA-GCTGTGCCGGGAACATGAACTGT--CAAAAAGAGAGAGTAG 3821
Query 3819 AAGCTGGAGCATCTCTGCGTCCATGTAAAACTACTGTAAGACATTAGTTctttctttttt 3878
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||
Sbjct 3822 AAGCTGGAGCATCTCTGTGTCCATGTAAAACTACTGTAAGGCATTAGTT-TTT-TTTG-- 3877
Query 3879 gtccttttttctttttGAGACAAGTGATATTAATTAGTTTTACCATTCTGCCTGGGACTA 3938
| || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||
Sbjct 3878 G-CCGGTT--CTTTTTGAGACAAGTTATATTAATTAGTTTTACCATTTTGCCTGGGATTA 3934
Query 3939 ATATGTTGTGTGTATATAAACGATAT-T-ATACACATTAGATTGAATTGGAGTCCAAAAG 3996
|||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||
Sbjct 3935 TTATGTTGTGTGTATATAAACTATATGTTATACACATTCGATTGAATTGGAGTGCAAAAG 3994
Query 3997 AT 3998
||
Sbjct 3995 AT 3996
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 199212930653
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5