BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg488376
Length=3672
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G15280.1 | Symbols: | Pentatricopeptide repeat (PPR) superf... 5734 0.0
> AT5G15280.1 | Symbols: | Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily
protein | chr5:4962293-4966141 FORWARD LENGTH=3849
Length=3849
Score = 5734 bits (3105), Expect = 0.0
Identities = 3499/3690 (95%), Gaps = 24/3690 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGCTTAATCTTCTCTCCATCAGTAGCTCTTCTCGGCTTCGTTTTCTTAACAAGGTTTCT 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCTTAATCTTCTCTCCATCAGTAGCTCTTCTCGGCTTCGTTTTCTTAACAAGGTTTCT 60
Query 61 TCTCTCTCATGTCGTTACTCTTTCGCG-TTTTC-CT-C-AG-T--GC--CTTCGT-C-C- 108
|| ||| ||| || ||||||||||||| ||||| || | || | | |||||| | |
Sbjct 61 TCACTCACATATCATTACTCTTTCGCGTTTTTCTCTACTAGCTCACCTGCTTCGTCCTCT 120
Query 109 TCTTCTTCCTTGGGAAATGATTCAGCGATCCCAAGAAATTATGAATCTTCCTCGTTTAAT 168
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 121 TCTTCTTCCTTGGGAAATGATTCAGCGATCCCAAGAAATTATGAGTCTTCCTCGTTTAAT 180
Query 169 TTACTTTCGAGGTCGAATGAAAAGCTTGACCTTACTGGTTCCTCTCTAAAAGACTTGCTT 228
||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 TTACTTTCGAGGTCGAAGGAGAAGCGTGACCTTACTGGTTCCTCTCTAAAAGACTTGCTT 240
Query 229 TTGGATTTGTCCGATGTAATTCCCAATATTATCCGTAGATTTAGGAGATTTCCTGGCTTG 288
|| |||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||
Sbjct 241 TTTGATTTGTCAGATGTAGTTCCCAATATTACCCGTAGGTTTAGAAGATTTCCGGGCTTG 300
Query 289 AAACCCGAAAATGTGCTTGAACTGTTACTGGGTTTTGAATCTGAGCTTCAGAGAGGTAGA 348
||||||||| ||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 301 AAACCCGAAGATGTGCTTGAATTATCATTGGGTTTTGAATCTGAGCTTCAGAGAGGTGGA 360
Query 349 ATTGGGAGTACAAAGGTTCAAGCTTTATGGGAGATTTTCAGATGGGCTAGTGGGCAATAC 408
||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 361 ATTGGAAATATAAAGGTTCAAGCTTTATGGGAGATTTTCAGATGGGCTAGTGTGCAATAC 420
Query 409 CAAGGGTTTAAGCATCTACCTCATGCTTGTGAAATTATGGCATCGATGCTTATCAGGGAA 468
||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 421 CAAGGGTTTAAGCATTTACCTCAGGCTTGTGAAATTATGGCGTCGATGCTTATCAGGGAA 480
Query 469 GGAATGGTTAAGGAAGTTGAATTTTTGCTTATGGAGATGGAGAGACATGGAGACACAATG 528
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 GGAATGGTTAAGGAAGTTGAATTGTTGCTTATGGAGATGGAGAGACATGGAGACACAATG 540
Query 529 GTTAAGGAGGGGATTTTCTGTGATTTGATTGGTAAATATGTTGATGCTTTCGATTCCAGG 588
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 541 GTTAACGAGGGGATTTTCTGTGATTTGATTGGTAAATATGTTGATGATTTCGATTCCAGG 600
Query 589 AAGGCGGTTATGCTGTTTGATTGGATGACGCGTAAGGGTTTAGTACCTTTAACTTCGTGT 648
|| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 601 AAAGCAGTTATGCTGTTTGATTGGATGAGGCGTAAGGGTTTAGTACCTCTAACTTCGTGT 660
Query 649 TATCAGATTCTAATTGATCATTTGGTTAGAGTTCATAGAACAGAATCAGCTTATAGAATT 708
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 TATCAGATTCTAATTGATCAATTGGTTAGAGTTCATAGAACAGAATCAGCTTATAGAATT 720
Query 709 TGTTTGGATTGGGTGGAGACAACGGCTGAATCAAATCACATGAACATAGATAGCATCGGG 768
|||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 TGTTTGGATTGGGTGGAGACAAGGGCTGAATTAAATCACATGAACATAGATAGCATCGGG 780
Query 769 AAAGTTATCGAGTTGCTTTGCTTGGACCAGAGGGTTCAGGAGGCTAGAGTCCTGGAAAGA 828
|||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||
Sbjct 781 AAAGTTATAGAGTTGCTTTGTTTGGACCAGAAGGTTCAGGAGGCTAGAGTTCTGGCAAGA 840
Query 829 AAGCTTGTGGCTTTAGGTTGTAACCTGAATAGCTCAATATATAGTAAGATCACTATAGGA 888
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 841 AAGCTTGTGGCTTTAGGTTGTATCCTGAATAGCTCAATATATAGTAAGATTACTATAGGA 900
Query 889 TACAGCGAGAAGCAAGATTTTGATGATTTGTTGAGTTTCATTGGTGAAGTTAAATATGAA 948
|||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 TACAACGAGAAGCAAGACTTTGAGGATTTGTTGAGTTTCATTGGTGAAGTTAAATATGAA 960
Query 949 CCTGATGTGTTTGTTGGCAATAGGATTGTGCATTCTCTCTGCAGGAGGTTTGGCTCAGAG 1008
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 CCTGATGTGTTTGTTGGCAATAGGATTCTGCATTCTCTCTGCAGGAGGTTTGGCTCAGAG 1020
Query 1009 AGAGCTTATGTATATATGGAGGAACTCGAACACTTGGGTTTTAAACCTGATGAAGTTACA 1068
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1021 AGAGCTTATGTATATATGGAGGAACTCGAACACTTGGGTTTTAAACAAGATGAAGTTACC 1080
Query 1069 TTTGGTATCTTGATTGGGTGGTGTTGTTATGAAGGAGATATCAAGAGGGCGGTTCTTTAT 1128
||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||
Sbjct 1081 TTTGGTATCTTGATTGGTTGGTGTTGCTATGAAGGAGATATTAAAAGAGCGGTTCTTTAT 1140
Query 1129 TTATCCGAGATTACGTCAAAGGGTT-TCAAACCCGATGTGTGTAGTTATGATGCTATCCT 1187
||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||
Sbjct 1141 TTATCCGAGATTATGTCAAAGGGTTAT-AAACCCGATGTGTATAGTTATAATGCTATCCT 1199
Query 1188 AAGTGGGCTTTTTAGAAAAGGATTGTGGCAACATACCCATTGTATTCTGGATGAGATGAA 1247
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1200 AAGTGGGCTTTTTAGAAAAGGATTGTGGCAACATACCCATTGTATTCTGGATGAGATGAA 1259
Query 1248 GGAAAATGGAATGCTGCTCAGCTTGTCTACGTGTAAGATTATGGTAACTGGATATTGCAA 1307
||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||
Sbjct 1260 GGAAAATGGAATGATGCTCAGCTTGTCTACTTTTAAGATAATGGTAACTGGATACTGCAA 1319
Query 1308 AGCTAGACAGTTTGAAGAAGCGAAGATGATTGTTAATAAGATGTTTGGTTATGGGTTAAT 1367
|||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1320 AGCTAGACAGTTTGAAGAAGCGAAGAGGATTGTCAACAAGATGTTTGGTTATGGGTTAAT 1379
Query 1368 CGAAGCATCTAAAGTTGAAGATCCGCTTTCAGAAGCTTTTAGTTTGGTAGGATTTGATCC 1427
|||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1380 CGAAGCATCTAAAGTTGAGGATCCACTTTCAGAAGCTTTTAGTTTGGTAGGATTTGATCC 1439
Query 1428 GTTAGCTGTTAGATTGAAAAGGGACAATGATTCCACATTTTCCAAAGCTGAGTTCTTCGA 1487
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1440 GTTAGCTGTTAGATTGAAAAGGGACAATGATTCCACATTTTCCAAAGCTGAGTTCTTTGA 1499
Query 1488 TGATCTTGGGAATGGGCTATACTTGCACACTGATTTGGATGCTTACGAGCAGAGGGTGAA 1547
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1500 TGATCTTGGGAATGGGCTATACTTGCACACTGATTTGGATGCTTACGAGCAGAGGGTGAA 1559
Query 1548 TATGGTACTTGACAGGTCCGTGCTACCGGAATTCAATTCGCTTATTGTTAGAGCATGTAA 1607
|||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| | |
Sbjct 1560 TATGGTACTTGACAGGTCCGTGCTACCGGAGTTTAATTCGCTTATCGTTAGAGCATCTGA 1619
Query 1608 GGACGGTGACTTACAAACAGCATTGCGGCTTCTTGATGAAATGACTCGATGGGGTCAAAA 1667
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||
Sbjct 1620 GGACGGTGATTTACAAACAGCATTGCGGCTTCTTGATGAAATGGCTCGATGGGGTCAGAA 1679
Query 1668 ACTATCGCGTCGGAGTTTTGCTGTTTTAATGAGGAGTCTCTGTGCATCGCGTGCCCATCT 1727
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1680 ACTATCGCGTCGGAGTTTTGCTGTTTTAATGAGGAGTCTCTGTGCATCGCGTGCCCATCT 1739
Query 1728 CAGAGTAAGTGTTAGCCTCTTGGAAAAATGGCCAAAGCTGGCTAATCAGTTAGATGGAGA 1787
|||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1740 CAGAGTAAGTATTAGTTTATTGGAAAAATGGCCAAAGCTGGCTTATCAGTTAGATGGAGA 1799
Query 1788 AACCCTTAATTTTCTTGTCCAAGAATATTGCAAGAAGGGATTTAGCCGCCATAGCAAACT 1847
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1800 AACCCTTAATTTTCTTGTCCAAGAATATTGCAAGAAGGGATTTAGTCGCCATAGCAAACT 1859
Query 1848 CATTTTCCATAGAATGGTTCAAATGCATCATCCTATCGATAACGTAACTTACACATCTTT 1907
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1860 CATTTTCCATAAAATGGTTCAAATGCATCATCCTATCGATAACGTAACTTACACATCTTT 1919
Query 1908 GATACGTTGTTTCTGTAAGAAAGAAACACTCAATGATCTTCTGAATGTGTGGGGTGTTGC 1967
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||
Sbjct 1920 GATACGTTGTTTCTGTAAGAAAGAAACACTCAATGATCTTCTGAATGTCTGGGGTGCTGC 1979
Query 1968 CCAGAATGATAACTGGTTACCTGATTTGAATGATTGCGGAGATCTGTGGGAA-TGTCTTG 2026
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||
Sbjct 1980 CCAGAATGATAACTGGTTACCTGATTTGAACGATTGCGGAGATCTGTGG-AACTGTCTTG 2038
Query 2027 TCCGGAAAGGACTGGTGGCGGAAGCGGTTCAACTCTTTGAGCGTATATTCATATCTTATC 2086
||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2039 TCCGGAAAGGATTGGTGGAGGAAGTGGTTCAACTCTTTGAGCGTGTATTCATATCTTATC 2098
Query 2087 CTCTATCTCAGTCAGAAGCGTGTAGGATTTTGGTCGAGAAGTTCACAGTTCTTGGGtttt 2146
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||
Sbjct 2099 CTCTATCTCAGTCAGAAGCGTGTAGGATTTTTGTCGAGAAGCTGACAGTTCTTGGGTTTT 2158
Query 2147 tttGTATCGCTCATTCTGTTTTTAAAAGGCTT-ATAGGAGAGGGTTACATTGTGGAACAA 2205
||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2159 CTTGTATCGCTCATTCTGTTGTTAAAAGGCTTGA-AGGAGAGGGTTGCATTGTGGAACAA 2217
Query 2206 GAGGTTTACAATCATCTTATCAAAGGTCTCTGCACGGAGAAGAAGGATTCAGCTGCATTT 2265
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2218 GAGGTTTACAATCATCTTATCAAAGGACTCTGCACGGAAAAGAAGGATTCAGCTGCATTT 2277
Query 2266 GCTATACTCGATGAAATGCTAGACAAGAAACACATTCCAAGCTTGGGAAGTTGTTTGATG 2325
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2278 GCTATACTCGATGAAATGCTAGACAAGAAACACATTCCAAGTTTGGGAAGTTGTTTGATG 2337
Query 2326 TTGATTCCTCGGCTTTGTAGAGCTAACAAAGCAGGAATGGCATTTATTTTAGCAGAGCAA 2385
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||
Sbjct 2338 TTGATTCCTCGGCTTTGTAGAGCTAACAAAGCAGGAACAGCATTTAATTTAGCAGAGCAA 2397
Query 2386 -TCAGATTCA-CCTTATGTACACTATGCTTTGATAAAAGGACTATGCTTAGCTGGGAAAA 2443
| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||
Sbjct 2398 AT-AGATTCATCCT-ATGTACACTATGCTTTGATAAAAGGATTAAGCTTAGCTGGGAAAA 2455
Query 2444 TGCTCGATGCAGAAAATCAGTTACGTATAATGTTATCAAACGGGCTTTTACCGTATAACA 2503
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||
Sbjct 2456 TGCTCGATGCAGAAAATCAGTTACGTATAATGTTATCAAACGGGCTTTCATCGTATAACA 2515
Query 2504 AAATCTACAACT-TGATGTTTCAAGGTTATTGTAAAGGTAACAACGGGATGAAAGTTGAG 2562
|||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2516 AAATCTACAA-TGTGATGTTTCAAGGTTATTGTAAAGGTAACAACTGGATGAAAGTTGAG 2574
Query 2563 GAAGTACTAGGACTCATGGTGAGGAAGAACGTTATATGTTCGGTTAAGAGTTACAGAGAA 2622
|||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2575 GAAGTACTAGGACTCATGGTGAGGAAGAACATAATCTGTTCAGTTAAGAGTTACAGAGAA 2634
Query 2623 TATGTTCGAAAAATGTGTTTAGAGCCTCAGTTTCTCTCTGCAATTAGTCTGAAGGAGTTT 2682
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2635 TATGTTCGAAAAATGTGTTTAGAGCCTCAGTCTCTCTCTGCAATTAGTCTGAAGGAGTTT 2694
Query 2683 CTGTTATTAGGAGAAAGCAATCCTAGCGGCGTAATCATCTATAATATGCTAATTTTCTAT 2742
||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2695 CTGTTGCTAGGAGAAAGCAATCCTGGTGGCGTAATCATCTATAATATGCTGATTTTCTAT 2754
Query 2743 ATGTTTTGGGCTACGAATCACTTGGAGGTTAATAAAGTCTTGCTCGAAATGCAGGGAAGA 2802
||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2755 ATGTTCAGGGCAAAGAATCACTTGGAGGTTAACAAAGTCTTGCTCGAAATGCAGGGAAGA 2814
Query 2803 GGATTGCTGCCTGATGAAACCACGTTTAACTTTCTCGTTCACGGATACTCTTCGTGTGGA 2862
||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |
Sbjct 2815 GGAGTGTTGCCTGATGAAACCACATTTAACTTTCTCGTTCACGGATACTCTTCGTCTGCA 2874
Query 2863 GATTATTCGAGTTCTCTGCGATATATCTCGGCTATGATCTCCAAGGGGATGAAACCGAAT 2922
|||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2875 GATTATTCGAGTTCTCTGCGATATCTCTCAGCTATGATCTCCAAGGGGATGAAACCGAAT 2934
Query 2923 AATCGAAGCTTAAGAGCGGTTACAAGCTCTCTGTGTGATAATGGAGATGTGAAGAATGCT 2982
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2935 AATCGAAGCTTAAGAGCGGTTACAAGCTCTCTGTGTGATAATGGAGATGTGAAGAAAGCT 2994
Query 2983 CTTGACTTATGGCAGGTAATGGAATCAAAAGGCTGGATTTTGGGTTCTTCAGTTGCCCAA 3042
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||
Sbjct 2995 CTTGACTTGTGGCAGGTAATGGAATCAAAAGGCTGGAATTTAGGTTCTTCAGTTGTCCAA 3054
Query 3043 ACCAAAATCGTCGAATCCCTAATTTCGAAAGGCGAAATTCCAAAAGCTGAAGACTTTCTG 3102
||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3055 ACCAAAATCGTCGAAACCCTGATTTCGAAAGGCGAAATTCCAAAAGCTGAAGACTTTCTG 3114
Query 3103 ACCCGTGTGACACGCAATGTCATGAAGGCTCCCAACTACGATAATATAATCAAGAAACTA 3162
||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3115 ACCCGTGTGACACGCAATGGCATGATGGCTCCCAACTATGATAATATAATCAAGAAACTA 3174
Query 3163 TCTGATCGCGAGAATCTTGACATTGCGGTTCATCTCTTGAACATAATGCTAAAGAACCAA 3222
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||
Sbjct 3175 TCTGATCGCGGGAATCTTGACATTGCGGTTCATCTCTTGAACACAATGTTAAAGAACCAA 3234
Query 3223 AGCATTCCGGATTCTTCAAGCTATGATTCAGTCATCAGTGGCTTGCTGAGATGCAATCAA 3282
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||
Sbjct 3235 AGCATTCCGGGTTCTTCAAGCTATGATTCAGTCATCAATGGCTTGCTGAGATACAATCAA 3294
Query 3283 TTGGATAAAGCTATGGACTTTCATACAGAAATGGTGGAGTTAGGTCTAAGTCCAAGCACA 3342
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |
Sbjct 3295 CTGGATAAAGCTATGGACTTTCATACAGAAATGGTGGAGTTAGGTTTAAGTCCGAGCATA 3354
Query 3343 AGTACATGGAGTGGTCTTGTTCATAAGTACTGTGAGGCATGTCAAGTTGAGGAATCAGAA 3402
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3355 AGTACATGGAGTGGTCTTGTTCATAAGTTCTGTGAGGCATGTCAAGTTTTGGAATCAGAA 3414
Query 3403 AGACTTATCAAATCAATGGCTGGGTTAGGCGAAACACCGAGTCAAGAAATGTTTAAGACT 3462
||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3415 AGACTTATCAAATCAATGGTTGGGTTAGGCGAATCACCGAGTCAAGAGATGTTTAAGACT 3474
Query 3463 GTGATTGATCGGTTTCGAGTAGAGAACAATACAGTGAAAGCTTCAGAGATGATGGAAATG 3522
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3475 GTGATTGATCGGTTTCGAGTAGAGAAGAATACAGTGAAAGCTTCAGAGATGATGGAAATG 3534
Query 3523 ATGCAAAAGTGTGGCTATGAAGTTGATTTTGAGACTCATTGGTCTTTGATTAGTAACATG 3582
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3535 ATGCAAAAGTGTGGGTATGAAGTTGATTTTGAGACTCATTGGTCTTTGATTAGTAACATG 3594
Query 3583 AGCTCTTGTAAAGAGAAGAAGACAACAACAGTTGGTGAAGGATTCTTGTCTAGGCTTCTC 3642
||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3595 AGCTCTTCTAAAGAGAAGAAGACAACAACAGCTGGTGAAGGATTCTTATCTAGGCTTCTC 3654
Query 3643 TCCGGGAATGGATTTGCTTGGAAGCGATGA 3672
|| |||||||| ||| ||||||||||||||
Sbjct 3655 TCTGGGAATGGGTTTACTTGGAAGCGATGA 3684
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 182858507235
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5