BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg488411
Length=6581
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G15680.1 | Symbols: | ARM repeat superfamily protein | chr5... 1.128e+04 0.0
> AT5G15680.1 | Symbols: | ARM repeat superfamily protein | chr5:5100984-5111029
REVERSE LENGTH=6798
Length=6798
Score = 1.128e+04 bits (6110), Expect = 0.0
Identities = 6429/6586 (98%), Gaps = 9/6586 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTTCGTC-TTTGGGGATCTATTCTTGTTGAACGTGATGAAGTCTGGGAGTGCGGCGAAAT 59
||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 99 TTTCG-CTTTTGAGGATCTATTCTTGCTGAACGTGATGAAGTCTGGGAGTGCTGCGAAAT 157
Query 60 TGATAGTAGAGGCGCTTCTTCAGCGTTTCCTTCCTCTCGCAAGACGACGAATCGAGACAG 119
|||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 158 TGATAGTAGAAGCGCTTCTTCAGCGTTTCCTGCCTCTCGCAAGACGACGAATCGAGACAG 217
Query 120 CTCAGGCTCAGGATGGACAGTATCTTCGTCCATCAGATCCTGCTTATGAGCAGGTGTTGG 179
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 218 CTCAGGCTCAGGATGGACAGTACCTTCGTCCATCAGATCCTGCTTATGAGCAGGTGTTGG 277
Query 180 ATTCATTGGCCATGATTGCGCGTCATACACCTGTTCCTCTTTTAGAAGCTCTTCTTAGAT 239
|||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 278 ATTCATTGGCTATGATTGCCCGTCATACACCTGTTCCTCTTTTAGAAGCTCTTCTTAGAT 337
Query 240 GGAGGGAAAGTGAATCACCTAAAGGTGCAAATGATGCATCGACTTTCCAGAGAAAGTTGG 299
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 338 GGAGGGAAAGTGAATCACCTAAAGGTGCAAATGATGCCTCGACTTTCCAGAGAAAGTTGG 397
Query 300 CTGTTGAGTGCATCTTCTGCTCAGCTTGCATTCGCTTTGTGGAGTGTTGCCCGCAGGAAG 359
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 398 CTGTTGAGTGCATCTTCTGCTCAGCTTGCATTCGCTTTGTGGAGTGTTGCCCGCAGGAAG 457
Query 360 GGCTCACTGAGAAGCTATGGTCTGGACTTGAGAACTTTGTTTTTGATTGGCTAATCAACG 419
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 458 GGCTCACTGAGAAGCTATGGTCTGGACTTGAGAACTTTGTTTTTGATTGGCTAATCAACG 517
Query 420 CTGACAGGGTTGTTAGCCAAGTGGAATACCCATCGCTGGTCGATTTGAGGGGTCTCCTTC 479
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 518 CTGACAGGGTTGTTAGCCAAGTGGAATACCCATCGCTGGTCGATTTGAGGGGTCTCCTTC 577
Query 480 TTGACTTGGTTGCTCAACTCCTGGGTGCACTATCCCGTATTAGATTCAGCTCTGTCACGG 539
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 578 TTGACTTGGTTGCTCAACTCCTGGGTGCACTGTCCCGTATTAGATTCAGCTCTGTCACGG 637
Query 540 AGCGGTTTTTCATGGAACTCAATACTCGCCGGATTGATACAAGTGTTGCAAGAAGTGAAA 599
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 638 AGAGGTTTTTCATGGAACTCAATACTCGCCGGATTGATACAAGCGTTGCAAGAAGTGAAA 697
Query 600 CTCTCAGCATCATTAATGGGATGCGATACTTGAAGCTTGGGGTTAAGAGTGAGGGTGGGC 659
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 698 CTCTCAGCATCATTAATGGGATGCGTTACTTGAAGCTTGGGGTTAAGAGTGAGGGTGGGC 757
Query 660 TGAATGCGTCTGCCTCCTTTGTAGCAAAAGCAAACCCTCTTATTCGTGATATACACAAAC 719
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||
Sbjct 758 TGAATGCGTCTGCCTCCTTTGTAGCAAAAGCAAACCCTCTTATCCGGGATATACACAAAC 817
Query 720 GTAAAAGTGAGCTTTATCATGCGCTTTGCAATATGCTTTCTAACATTTTGGCGCCACTTT 779
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||
Sbjct 818 GTAAAAGTGAGCTTTATCATGCGCTTTGCAATATGCTCTCTAACATCTTGGCGCCACTTT 877
Query 780 CCGATGGTGGCAAAAGCCAGTGGCCTCCTTCAGTTGCAGAGCCTGCACTGACACTCTGGT 839
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 878 CCGATGGTGGCAAAAGCCAGTGGCCTCCTTCAGTTGCAGAACCTGCACTGACACTCTGGT 937
Query 840 ATGAGGCTGTGGGACGCATTAGAGTGCAGCTAATCCAGTGGATGGAGAAACAGAGTAAAC 899
|||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 938 ATGAGGCTGTTGGACGCATCAGAGTGCAGCTAATCCAGTGGATGGAGAAACAGAGTAAAC 997
Query 900 ATCTTGGTGTTGGCTATCCGCTTGTGAGTCTTCTTCTCTGTCTCGGTGACCCACTTATAT 959
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 998 ATCTTGGTGTTGGCTATCCGCTTGTGAGTCTTCTTCTCTGTCTCGGTGACCCGCTTATAT 1057
Query 960 TTCATCATAATTTAAGCTCTCACATGGAACAACTGTACAAGCTTCTGAGAGATAAGAACC 1019
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1058 TTCATCATAATTTAAGCTCTCACATGGAACAACTGTACAAGCTTCTGAGAGATAAGAACC 1117
Query 1020 ATCGCTACATGGCACTTGATTGTCTTCACCGGGTGTTGAGGTTTTATTTGAGTGTCTATG 1079
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1118 ATCGCTACATGGCACTTGATTGTCTTCACCGGGTGTTGAGGTTTTATTTGAGTGTCTATG 1177
Query 1080 CTTCCTCCCAGCCACCAAATCGTATATGGGATTACTTGGATAGTGTGACATCACAATTGC 1139
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1178 CTTCGTCCCAGCCACCAAATCGTATATGGGATTACTTGGATAGTGTGACATCACAATTGC 1237
Query 1140 TAACAGTTCTGAGAAAAGGAATGCTCACTCAGGATGTCCAACAAGATAAACTAGTTGAGT 1199
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||
Sbjct 1238 TAACAGTTCTGAGAAAAGGAATGCTCACTCAGGATGTCCAGCAAGATAAACTCGTTGAGT 1297
Query 1200 TCTGTGTGACCATCGCTGAACATAACCTTGACTTCGCTATGAATCACATGTTACTAGAAC 1259
||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1298 TCTGTGTGACCATAGCTGAACATAACCTTGACTTTGCTATGAATCACATGTTACTAGAAC 1357
Query 1260 TGTTAAAACAAGATAGTCCAAGCGAAGCAAAGATTATTGGTCTTCGTGCTTTGCTTGCCC 1319
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||
Sbjct 1358 TGTTAAAGCAAGATAGTCCAAGCGAAGCAAAGATTATTGGTCTCCGTGCTTTACTTGCCC 1417
Query 1320 TCGTTATGTCACCTTCAAGCCAGTATGTTGGGTTGGAGATATTTAAGGGTCATGGAATAG 1379
| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1418 TTGTTATGTCGCCTTCAAGCCAGTATGTTGGGTTGGAGATATTTAAGGGTCATGGGATAG 1477
Query 1380 GCCATTACATACCAAAGGTGAAAGCAGCAATTGAGTCAATTTTAAGATCCTGCCACAGGA 1439
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1478 GCCATTACATACCAAAGGTGAAAGCAGCAATTGAGTCAATTTTAAGATCCTGCCACAGGA 1537
Query 1440 CCTATAGTCAAGCTCTTCTAACATCATCGAGGACTACAATAGATGCTGTGAATAAAGAAA 1499
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1538 CCTACAGTCAAGCTCTTCTAACATCATCGAGGACTACAATCGATGCTGTGAATAAAGAAA 1597
Query 1500 AGTCTCAAGGGTCTCTCTTCCAGTCAGTGCTGAAGTGCATACCTTATCTAATTGAGGAAG 1559
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1598 AGTCTCAAGGATCTCTCTTCCAGTCAGTGCTGAAGTGCATACCTTATCTGATTGAGGAAG 1657
Query 1560 TTGGTCGGAGTGATAAGATCACGGAAATAATACCTCAGCACGGTATAAGTATTGATCCTG 1619
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1658 TTGGCCGGAGTGATAAGATCACGGAAATAATACCTCAGCATGGTATAAGTATTGATCCTG 1717
Query 1620 GAGTTCGAGTGGAAGCGGTGCAAGTTCTGAACCGGATTGTTAGATACCTTCCTCATCGTC 1679
|||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1718 GAGTTCGAGTGGAAGCAGTGCAAGTCCTGAACCGGATTGTTAGATACCTTCCTCATCGTC 1777
Query 1680 GTTTTGCAGTCATGAGAGGGATGGCAAACTTCATCTTAAAGCTTCCTGATGAATTCCCAC 1739
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1778 GTTTTGCAGTCATGAGAGGAATGGCAAACTTCATCTTAAAGCTTCCTGATGAATTCCCAC 1837
Query 1740 TCCTCATTCAAGCATCACTAGGACGCCTGTTGGAACTCATGCGTTTCTGGAGGGCTTGTT 1799
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1838 TCCTCATTCAAGCATCACTAGGACGTCTGTTGGAACTCATGCGTTTCTGGAGGGCTTGTT 1897
Query 1800 TAGTAGATGACAGACAAGATACTGATGCTGAGGAAGAAAAGAAAACAGCAAAGGCAAACG 1859
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |
Sbjct 1898 TAGTAGATGACAGACAAGATACTGATGCTGAAGAAGAAAACAAAACAGCAAAGGGAAATG 1957
Query 1860 ATAGGTTCAAGAAATTATCTTTTCATCAAGCAGCAGATGCAATTGAGTTTCGCGCTGCTG 1919
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1958 ATAGGTTCAAGAAATTATCTTTTCATCAAGCAGCAGATGCAATTGAGTTTCGCGCTTCTG 2017
Query 1920 ATATTGATGCTGTTGGGCTAATTTTTCTTAGTTCAGTCGACAGCCAGATTCGGCACACTG 1979
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2018 ATATTGATGCTGTTGGGCTAATATTTCTTAGTTCAGTCGACAGTCAGATTCGGCACACTG 2077
Query 1980 CGCTAGAATTATTGCGATGTGTACGTGCATTGAGAAATGATATTCGGGATCTCATGATTC 2039
| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2078 CCCTAGAATTATTACGATGTGTACGTGCTTTGAGAAATGATATTCGGGATCTCATGATTC 2137
Query 2040 AAGAGCACCCAGACCATGTTATGAAATTTGAAGCTGAACCCATATACATGATCGATGTCT 2099
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2138 AAGAGCACCCAGACCATGTTATGAAATTTGAAGCTGAACCCATATACATGATCGATGTCT 2197
Query 2100 TAGAAGAACATGGGGATGATATTGTTCAAAGTTGCTATTGGGATTCTGCCCGTCCTTTTG 2159
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2198 TGGAAGAACATGGGGATGATATTGTTCAAAGTTGCTATTGGGATTCTGCCCGTCCTTTTG 2257
Query 2160 ATTTAAGACGAGATTCCGATGCCATTCCTTCTGATGTGACTCTTCAATCCATAATCTTTG 2219
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2258 ATTTAAGACGAGATTCCGATGCCATTCCTTCTGATGTGACTCTTCAATCCATTATCTTTG 2317
Query 2220 AGAGCCTTGATAAAAACAAATGGGGTCGGTGTCTCAGCGAGCTTGTTAAATATGCTGCTG 2279
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2318 AGAGCCTTGATAAAAACAAATGGGGTCGATGTCTCAGCGAGCTTGTTAAATATGCTGCTG 2377
Query 2280 AGCTCTGCCCACGCTCTGTTCAAGAAGCCAAGTCTGAAATTATGCACCGCCTTGCCCATA 2339
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2378 AGCTCTGCCCACGCTCTGTTCAAGAAGCCAAGTCTGAAATTATGCACCGCCTGGCCCATA 2437
Query 2340 TTACACCTGTTGAATTTGGTGGAAAGGCAAGCCAGTCACAAGATACAGATAACAAACTGG 2399
||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2438 TTACACCTGTTGAGTTTGGTGGAAAGGCAAACCAGTCACAAGATACAGATAACAAACTGG 2497
Query 2400 ATCAATGGCTTCTGTATGCTATGTTTGTGTGTTCGTGTCCACCTGATGGCAAAGATGCGG 2459
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2498 ATCAATGGCTTCTGTATGCTATGTTTGTGTGTTCGTGTCCACCTGATGGCAAAGATGCGG 2557
Query 2460 GTAGCATTGCATCAACTAGAGACATGTACCACCTTATTTTCCCTTATCTTAGATTTGGGT 2519
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2558 GTAGCATTGCATCAACCAGAGACATGTACCACCTTATTTTCCCTTATCTTAGATTTGGGT 2617
Query 2520 CAGAAACCCACAACCATGCTGCGACTATGGCTCTTGGGCGCTCACATTTGGAAGCATGTG 2579
|||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2618 CAGAGACCCACAACCATGCTGCAACTATGGCTCTCGGGCGCTCTCATTTGGAAGCATGTG 2677
Query 2580 AAATTATGTTTAGCGAGCTTGCATCTTTCATGGAGGAGATTTCATCAGAGACAGAGACGA 2639
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2678 AAATTATGTTTAGCGAGCTTGCATCTTTCATGGAGGAGATTTCATCAGAGACAGAGACGA 2737
Query 2640 AGCCAAAGTGGAAGATCCAAAAAGGAGGTCGCAGAGAGGACCTCCGTGTTCATGTTTCTA 2699
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2738 AGCCAAAGTGGAAGATCCAAAAAGGAGGTCGAAGAGAGGACCTCCGTGTTCATGTCTCTA 2797
Query 2700 ATATATATCGAACAGTGTCTGAGAATGTCTGGCCTGGAATGCTTGCTCGTAAACCAGTTT 2759
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2798 ATATATATCGAACAGTGTCTGAGAATGTCTGGCCTGGAATGCTTGCTCGTAAACCAGTTT 2857
Query 2760 TCCGCCTCCATTATCTGCGGTTTATTGAAGATTCAACAAGACAGATATCGTTGGCACCTC 2819
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2858 TCCGCCTCCATTATCTGCGGTTCATTGAAGATTCAACAAGACAAATATCGTTGGCACCTC 2917
Query 2820 ATGAAAGCTTTCAGGACATGCAGCCTCTGCGCTATGCACTTGCGTCTGTTTTAAGATTCC 2879
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2918 ATGAAAGCTTTCAGGACATGCAGCCTCTGCGATATGCACTTGCGTCTGTTTTAAGATTCC 2977
Query 2880 TTGCCCCTGAATTTGTTGAATCAAAATCAGAGAAATTTGATGTTAGAAGTAGAAAACGTC 2939
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2978 TTGCCCCTGAATTTGTTGAATCAAAATCAGAGAAGTTTGATGTTAGAAGTAGGAAACGTC 3037
Query 2940 TATTCGATCTGCTTCTTTCCTGGTCTGATGATACAGGAAGTACGTGGGGACAGGATGGTG 2999
||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3038 TATTCGATCTGCTTCTTTCCTGGTCCGATGACACTGGAAATACGTGGGGACAGGATGGTG 3097
Query 3000 TTAGTGATTATCGCCGTGAAGTAGAGCGCTATAAGACCTCGCAGCATAACCGGTCAAAAG 3059
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||
Sbjct 3098 TTAGTGATTATCGCCGTGAAGTAGAGCGCTATAAGACCTCACAGCATAACCGGTCCAAAG 3157
Query 3060 ATTCTGTAGACAAGATTTCTTTTGACAAGGAACTGAATGAGCAAATTGAAGCCATACAGT 3119
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3158 ATTCTGTAGACAAGATTTCTTTTGACAAGGAACTGAATGAGCAAATTGAAGCCATCCAGT 3217
Query 3120 GGGCCTCATTGAATGCAATGGCTTCCCTTCTGTATGGACCGTGTTTTGATGACAATGCAA 3179
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3218 GGGCCTCATTGAATGCAATGGCTTCCCTTCTTTATGGACCGTGTTTTGATGACAATGCAA 3277
Query 3180 GAAAAATGAGCGGCCGTGTGATATCTTGGATAAATAGTTTGTTCATTGAGCCTGCTCCCA 3239
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3278 GAAAAATGAGCGGCCGTGTGATATCTTGGATAAATAGTTTGTTCATTGAGCCTGCTCCCA 3337
Query 3240 GGGTCCCTTTTGGTTACTCGCCTGCTGATCCAAGAACTCCATCTTACTCCAAATACACAG 3299
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3338 GGGTCCCTTTTGGTTACTCGCCTGCTGATCCAAGAACTCCATCTTACTCCAAATACACGG 3397
Query 3300 GAGAAGGTGGACGAGGGGCAACAGGCCGTGATAGGCATAGAGGTGGTCATCAACGTGTTG 3359
||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3398 GAGAAGGTGGACGAGGGACAACAGGTCGTGATAGGCATAGAGGTGGTCATCAACGTGTTG 3457
Query 3360 CGTTGGCAAAATTGGCTCTGAAGAATCTTCTACTTACAAACTTGGATCTCTTTCCTGCCT 3419
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3458 CGTTGGCAAAATTGGCCCTGAAGAATCTTCTACTTACAAACTTGGATCTCTTTCCTGCCT 3517
Query 3420 GCATTGATCAGTGTTACTACTCTGATGCGGCTATAGCTGATGGGTACTTCAGTGTGTTGG 3479
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3518 GCATTGATCAGTGTTACTACTCTGATGCGGCTATAGCTGATGGGTACTTCAGTGTGTTGG 3577
Query 3480 CTGAGGTTTACATGCGACAAGAAATACCAAAATGTGAAATCCAGAGGCTCTTGAGTCTAA 3539
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3578 CTGAGGTTTACATGCGACAAGAAATACCAAAATGTGAAATCCAGAGGCTCTTAAGTCTAA 3637
Query 3540 TTCTCTACAAGGTAGTCGATCCATCTAGACAAATTCGCGATGATGCTCTTCAAATGCTTG 3599
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3638 TTCTCTACAAGGTAGTCGATCCATCTAGACAAATTCGCGATGATGCTCTTCAAATGCTTG 3697
Query 3600 AGACACTTTCTATGCGTGAGTGGGCTGAGGATGGTATAGAAGGTTCAGGAGGCTATAGAG 3659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3698 AGACACTTTCTATGCGTGAGTGGGCTGAGGATGGTATAGAAGGTTCAGGAGGCTATAGAG 3757
Query 3660 CAGCAGTTGTAGGTAATCTTCCAGATTCATATCAACAGTTCCAGTACAAGCTCTCCTGCA 3719
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3758 CAGCAGTTGTAGGTAATCTTCCAGATTCATATCAACAGTTCCAATACAAGCTCTCCTGCA 3817
Query 3720 AACTCGCCAAGGATCATCCTGAGTTAAGCCAGCTGCTTTGTGAAGAAATTATGCAGCGTC 3779
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3818 AACTCGCCAAGGATCATCCGGAGTTAAGCCAGCTGCTTTGTGAAGAAATTATGCAGCGTC 3877
Query 3780 AGCTTGATGCTGTTGATATAATTGCTCAGCATCAGGTCTTGACCTGTATGGCTCCATGGA 3839
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3878 AGCTTGATGCTGTTGATATAATTGCTCAGCATCAGGTCTTGACCTGTATGGCTCCATGGA 3937
Query 3840 TTGAGAACCTTAATTTCTGGAAACTCAAGGATTCAGGTTGGAGTGAAAGATTACTGAAAA 3899
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3938 TTGAGAACCTTAATTTCTGGAAACTCAAGGATTCGGGTTGGAGTGAAAGATTACTAAAAA 3997
Query 3900 GTCTTTACTATGTCACATGGCGACATGGGGATCAATTCCCTGATGAAATTGAAAAACTTT 3959
||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3998 GTCTTTACTATGTGACATGGCGACACGGGGATCAATTCCCTGATGAAATTGAAAAACTTT 4057
Query 3960 GGAGTACCATTGCTAGTAAGCCTAGAAACATCAGCCCTGTTTTGGATTTCTTGATCACAA 4019
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 4058 GGAGTACCATTGCTAGTAAGCCCAGAAACATCAGCCCTGTATTGGATTTCTTGATCACAA 4117
Query 4020 AGGGAATTGAGGACTGTGATTCAAATGCATCTGCCGAAATAACTGGTGCATTTGCTACAT 4079
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4118 AGGGAATTGAGGACTGTGATTCAAATGCATCTGCCGAAATAACTGGTGCATTTGCTACAT 4177
Query 4080 ATTTTTCAGTTGCTAAACGTGTAAGTCTT-TACCTAGCACGGATATGTCCTCAGCGTACT 4138
|||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 4178 ATTTTTCAGTTGCTAAGCGTGTAAGT-TTGTACCTCGCACGAATATGTCCTCAGCGTACT 4236
Query 4139 ATTGATCACCTGGTTTACCAACTGTCACAGCGGATGCTGGAAGACAGTATTGAACCCATT 4198
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4237 ATTGATCACCTGGTTTACCAACTGTCACAGCGGATGCTGGAAGACAGTATTGAACCCATT 4296
Query 4199 GGTTATAGTGCAAACCGGGGTGATTCCAATGGAAACTTTGTGCTGGAGTTCTCTCAGGGA 4258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4297 GGTTATAGTGCAAACCGGGGTGATTCCAATGGAAACTTTGTGCTGGAGTTCTCTCAGGGA 4356
Query 4259 CCTGCCACAGCACCTCAAGTTGCTTCAGTTGCAGACAGCCAACCACATATGTCACCACTT 4318
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4357 CCTGCCACAGCACCTCAAGTTGTTTCAGTTGCAGACAGCCAACCACATATGTCACCACTT 4416
Query 4319 CTTGTCCGAGGCTCCCTTGATGGTCCCCTTAGGAATACAAGTGGAAGTCTAAGCTGGAGA 4378
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 4417 CTTGTCAGAGGCTCCCTTGATGGTCCCCTTAGGAATACAAGTGGAAGCCTAAGCTGGAGA 4476
Query 4379 ACAGCAGGCATGACTGGGCGAAGTGCTTCTGGGCCTTTAAGTCCAATGCCTCCTGAGTTG 4438
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4477 ACAGCAGGGATGACTGGGCGAAGTGCTTCTGGGCCTTTAAGTCCAATGCCTCCTGAGTTG 4536
Query 4439 AATATTGTTCCTGTAGCTACTGGTCGTTCTGGTCAGCTCCTGCCATCATTGGTGAATGCA 4498
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4537 AATATTGTTCCTGTAGCTACTGGTCGTTCTGGTCAGCTCCTGCCATCATTGGTGAATGCA 4596
Query 4499 TCAGGACCTTTAATGGGAGTTCGTAGCTCTACAGGAAGTTTGAGGAGCCGCCATGTCTCA 4558
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 4597 TCAGGACCTTTAATGGGAGTTCGTAGCTCTACAGGAAGTTTGAGGAGTCGCCATGTCTCA 4656
Query 4559 CGTGATAGTGGAGATTACCTCATTGATACACCAAATTCTGGAGAAGATGTGTTGCATTCT 4618
|||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4657 CGTGATAGCGGAGATTACCTCATAGATACACCAAATTCTGGAGAAGATGTGTTGCATTCA 4716
Query 4619 GGGATCGCAATGCACGGCGTCAATGCAAAGGAACTTCAATCAGCTTTGCAGGGACATCAA 4678
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 4717 GGGATCGCAATGCACGGCGTCAATGCAAAGGAACTTCAATCAGCCTTGCAGGGACATCAA 4776
Query 4679 CAGCATTCACTCACTCATGCCGATATAGCTCTGATTCTTCTTGCAGAAATCGCATATGAG 4738
||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4777 CAGCACTCACTCACTCATGCTGACATAGCTCTGATTCTTCTTGCAGAAATCGCATATGAG 4836
Query 4739 AATGATGAAGATTTTAGGGAACATCTGCCTTTGCTCTTCCACGTCACTTTTGTTTCGATG 4798
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4837 AATGATGAAGATTTTAGGGAACATCTGCCTTTGCTCTTCCACGTCACTTTTGTTTCGATG 4896
Query 4799 GATAGCTCTGAAGACATTGTGCTAGAGCATTGTCAACATTTGCTTGTGAATTTGTTGTAC 4858
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||
Sbjct 4897 GATAGCTCTGAAGACATTGTGCTAGAGCATTGTCAACATTTACTTGTGAATTTATTGTAC 4956
Query 4859 TCACTAGCGGGTCGGCATTTGGAGCTATATGAGGTGGAGAACAGTGATGGAGAGAACAAA 4918
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||
Sbjct 4957 TCACTAGCGGGTCGGCATTTGGAGCTATATGAGGTGGAAAACAGCGATGGAGAGAACAAA 5016
Query 4919 CAACAGGTTGTGAGTTTAATTAAGTATGTGCAATCAAAACGAGGAAGCATGATGTGGGAG 4978
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5017 CAACAGGTTGTGAGTTTAATTAAGTATGTGCAATCAAAACGAGGAAGCATGATGTGGGAG 5076
Query 4979 AATGAAGATCCAACGGTTGTGAGAACAGATCTTCCTAGTGCCGCTCTTTTGTCTGCACTT 5038
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5077 AATGAAGATCCAACGGTTGTGAGAACAGATCTTCCTAGTGCCGCTCTTTTGTCTGCACTT 5136
Query 5039 GTTCAGAGTATGGTTGATGCTATATTCTTCCAAGGAGATCTTCGAGAAACTTGGGGAACT 5098
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5137 GTTCAGAGTATGGTTGATGCTATATTCTTCCAAGGAGATCTTCGAGAAACTTGGGGAACT 5196
Query 5099 GAAGCTCTCAAATGGGCTATGGAATGCACGTCTAGACATCTAGCATGTCGGTCACACCAA 5158
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5197 GAAGCTCTCAAATGGGCTATGGAATGCACGTCAAGACATCTAGCATGTCGGTCACACCAA 5256
Query 5159 ATATACCGTGCGCTACGGCCAAGTGTGACAAGTGATGCATGTGTCTCCCTTCTACGCTGT 5218
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5257 ATATACCGTGCGCTACGCCCAAGTGTGACAAGTGATGCATGTGTCTCCCTTCTACGCTGT 5316
Query 5219 CTTCATCGATGTCTTAGCAATCCCATTCCTCCAGTTTTGGGTTTTATTATGGAAATCCTT 5278
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5317 CTTCATCGATGTCTTAGCAATCCCATTCCTCCAGTTTTGGGTTTTATTATGGAAATCCTT 5376
Query 5279 CTGACGCTACAAGTCATGGTAGAGAACATGGAGCCAGAGAAAGTCATACTCTACCCACAG 5338
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5377 CTGACGCTACAGGTCATGGTAGAGAACATGGAGCCAGAGAAAGTCATACTCTACCCACAG 5436
Query 5339 CTCTTCTGGGGCTGTGTTGCCATGATGCACACAGACTTCGTCCATGTCTATTGCCAGGTT 5398
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5437 CTCTTCTGGGGCTGTGTCGCCATGATGCACACAGACTTCGTCCATGTCTATTGCCAGGTT 5496
Query 5399 CTTGAGCTTTTCTCCCGTATTATTGACCGTCTATCATTTCGTGACAAAACAACTGAAAAT 5458
|||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5497 CTTGAGCTCTTCTCCCGTATTATTGACCGGCTATCATTTCGTGACAAAACAACTGAAAAT 5556
Query 5459 GTGCTCTTGTCAAGTATGCCTCGGGATGAATTCAACACTAATGATTTGGGGGAATTCCAA 5518
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5557 GTACTCTTGTCAAGTATGCCTCGGGATGAATTCAACACTAATGATTTGGGGGAATTCCAA 5616
Query 5519 AGGTCAGAATCTAGAGGGTACGAGATGCCGCCGTCAAGTGGAACTCTTCCAAAGTTCGAA 5578
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5617 AGGTCAGAATCTAGAGGGTACGAGATGCCGCCGTCAAGTGGAACTCTTCCAAAGTTCGAA 5676
Query 5579 GGTGTACAACCTCTTGTCCTCAAAGGACTGATGTCTACTGTTAGCCACGAGTTCTCTGTT 5638
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 5677 GGTGTACAACCTCTTGTCCTCAAAGGACTGATGTCTACTGTTAGCCACGAGTTCTCTATT 5736
Query 5639 GAGGTCCTATCAAGGATTTCAGTGCCTTCATGTGACTCTATATTTGGCGATGCCGAGACA 5698
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 5737 GAGGTCCTATCAAGGATTACAGTGCCTTCATGTGACTCTATATTTGGCGATGCTGAGACA 5796
Query 5699 AGACTCCTTATGCATATCACAGGTCTACTTCCTTGGCTTTGCTTGCAGCTGAGCCAAGAC 5758
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 5797 AGACTCCTTATGCATATCACAGGTCTACTTCCTTGGCTTTGCTTGCAGCTGACCCAAGAC 5856
Query 5759 CAAGTCATGATTTCTTTGTTACCACTCCAGCAGCAGTATCAAAAGGCATGTTCTGTGGCA 5818
||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5857 CAAGTCATGGTTTCTGCGTTACCACTCCAGCAGCAATATCAAAAGGCATGTTCTGTGGCA 5916
Query 5819 GCTAACATTGCTGTCTGGTGTCGGGCGAAATCACTCGATGAATTGGCTACGGTTTTTGTC 5878
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||
Sbjct 5917 TCTAACATTGCTGTCTGGTGTCGGGCAAAATCACTCGATGAATTAGCGACTGTTTTTGTC 5976
Query 5879 GCATATGCTCGTGGGGAGATTAAAAGAGTTGAAAATCTCCTTGCATGTGTCTCTCCTCTG 5938
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5977 GCATATGCTCGTGGCGAGATTAAAAGAGTTGAAAATCTCCTTGCATGTGTCTCTCCTCTG 6036
Query 5939 CTCTGCAACAAATGGTTCCCGAAACACTCAGCTTTAGCTTTCGGTCACTTGTTAAGACTG 5998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6037 CTCTGCAACAAATGGTTCCCGAAACACTCAGCTTTAGCTTTCGGTCACTTGTTAAGACTG 6096
Query 5999 CTaaaaaaaGGACCAGTGGATTACCAGCGAGTCATATTACTTATGCTCAAGGCATTGCTC 6058
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6097 CTAAAAAAAGGACCAGTGGATTACCAACGAGTCATATTACTTATGCTCAAGGCATTGCTC 6156
Query 6059 CAACACACTCCCATGGATGCTTCGCAGAGTCCCCACATGTACACAATCGTTTCGCAGCTA 6118
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||
Sbjct 6157 CAACACACTCCCATGGATGCTTCGCAGAGTCCCCACATGTACACAATTGTTTCACAGCTA 6216
Query 6119 GTCGAAAGCACTCTGTGTTGGGAGGCATTGAGTGTTCTCGAAGCTCTTCTTCAGAGCTGC 6178
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6217 GTCGAAAGCACTCTGTGTTGGGAGGCATTGAGTGTTCTCGAAGCTCTTCTTCAGAGCTGC 6276
Query 6179 AGCCCGGTACAAGGGGGCACTGGTGGATCCCACCCTCAGGATTTC-AGTTACTCTGAAAA 6237
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||
Sbjct 6277 AGCCCGGTACAAGGGGGCACCGGTGGATCCCACCCTCAGGATT-CGAGTTACTCTGAAAA 6335
Query 6238 TGGGGCTGATGAGAAAACGCTTGTACCTCAGACTTCATTTAAAGCCCGAAGCGGACCTCT 6297
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6336 CGGGACTGATGAGAAAACGCTTGTACCTCAGACTTCATTTAAAGCCCGAAGCGGACCTCT 6395
Query 6298 TCAGTACGCAATGATGGCTGCAACAATGTCGCAACCTTTCCCTCTCAGTGCAGCTGCAGC 6357
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||
Sbjct 6396 TCAGTACGCAATGATGGCTGCAACAATGTCGCAACCTTTCCCTCTTGGTGCAGCTGCGGC 6455
Query 6358 AGAGTCAGGGATACCTCCGAGAGATGTGGCTTTGCAGAACACAAGGCTAATGTTGGGTCG 6417
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6456 AGAGTCAGGGATACCTCCGAGAGATGTGGCTTTACAGAACACAAGGCTAATGTTGGGTCG 6515
Query 6418 GGTTCTTGATAATTGCGCTCTAGGAAGAAGAGATTACAGAAGATTGGTGCCTTTTGTCAC 6477
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 6516 GGTTCTTGATAATTGCGCTCTAGGAAGAAGAGATTACAGAAGATTGGTACCTTTTGTCAC 6575
Query 6478 AACGATCGCAAACATGTAACATTTTCAGTAAAGTTTTGCAAttt-tttt-GGTTATTTGT 6535
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||
Sbjct 6576 AACGATCGCAAACATGTAACATTTTCAGTAAAGTTTTG-AATTTATTTTTGGTAATTTGT 6634
Query 6536 ATGATTTTCATAAGTTTTAAAGAAGCAATGCGTTTGTGTGTGAATA 6581
||| ||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||
Sbjct 6635 ATGCTTTCCAGAAGTTTTAAAGAAGCAATGTGTCTGTGTGTGAATA 6680
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 328523783573
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5