BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg488471
Length=3857
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G16210.1 | Symbols: | HEAT repeat-containing protein | chr5... 6407 0.0
> AT5G16210.1 | Symbols: | HEAT repeat-containing protein | chr5:5290867-5297974
REVERSE LENGTH=3870
Length=3870
Score = 6407 bits (3469), Expect = 0.0
Identities = 3741/3870 (97%), Gaps = 27/3870 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ACCGTCACTCCCTTCCGGTGAGATTCATCGGCGAGAACACCGACACGATCTGGTGAATCG 60
|||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 10 ACCGTCACTCGCTTCCGGAGAGATTCATCGGCGAGAACACCGACACGATCTGGTGAATCG 69
Query 61 AATTCGATCGAATCGAGAGAGGGATAGTTTGAATTCTC-TTTCGGAATGCTCAGTGATAT 119
||| |||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| |||||||||||||||||
Sbjct 70 AATCCGATCGAATCGAGAGAGGAAAAGTTTGAATTTTCATTT-GGAATGCTCAGTGATAT 128
Query 120 TGGAACGAAGGAGGTGTTTCCTCTGATTGGGTTTTAGGGGTTCCTGTGAAAGAAGGAGAA 179
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||| ||||
Sbjct 129 TGGAACGAAGGAGGTGTTTCCTCTGATTGGATTTTA-GTGTTCCCGTGAAAGAAGAAGAA 187
Query 180 AACAAAACATGGACGCGGAGCGATCGTCGTTGTGCAACTTTTTCGTCAACTTCCTGATGG 239
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 188 AACAAAACATGGACGCGGAGCGATCGTCGTTGTGCAACTTTTTCGTCAACTTCCTGATGG 247
Query 240 AGGAGAACTACCTTTTGACGGCGTTTGAGCTTCTTCACGAGCTCCTCGACGATGGCCGCG 299
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 248 AGGAGAACTACCTCTTGACGGCGTTTGAGCTTCTTCACGAGCTCCTCGACGATGGCCGCG 307
Query 300 ATGCCCAAGCAATTCGTCTTAAGGAGTTCTTTTCCGATCCTTCCCGTTTCCCTCCTGATC 359
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 308 ATGCCCAAGCAATTCGTCTTAAGGAGTTCTTTTCCGATCCTTCCCGTTTCCCTCCTGATC 367
Query 360 AGATTTCTCGGTATAATTCAATTCGAGTTGCGGATCCACAAAGTTTATTGGAGGAGAAAG 419
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 368 AGATTTCTCGGTATAATTCAATTCGAGTTGCGGATCCACAAAGTTTGTTGGAGGAGAAAG 427
Query 420 AAGCATTAGCTGAGAAGTTAGCTATCAGCGAATATGAATTTCGTCTAGCTCAGGAGGATA 479
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 428 AAGCTTTAGCTGAGAAGTTAGCTATCAGCGAATATGAATTTCGTCTAGCTCAGGAGGATA 487
Query 480 TTACAAGATTGAAAACTGAAGGACAGAAGAAATCTAATCCTTCGATTGACAAGTCAGAAG 539
|| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 488 TTGCAAGATTGAAAACTGAAGGACAGAAGAAATCTGTTCCTTCGATTGACAAGTCAGAAG 547
Query 540 AGTTGGACTCGGATGAGTTTGGAGACAACAGGCCAGAGATTCAACGGAAAAAGAAAGATT 599
|| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 548 AGATGGATTCGGATGAGTTTGGAGGCAACAGGCCAGAGATTCAACGGAAAAAGAAAGATT 607
Query 600 TTTCCTTCACTGATATAGGGCCTTTGAAGAACAATGAACGTCGAGACTTAAATTGTGCAG 659
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||
Sbjct 608 TTTCCTTCACTGATATAGGGCCTTTGAAGAACAATGAACGTCAAGACTTAAACTGTGCAG 667
Query 660 TGAAAGAATATCTTCTTCTAGCAGGTTACAGGCTTACGGCTATGACATTTTATGAGGAGG 719
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 668 TGAAAGAATATCTTCTTCTAGCAGGTTATAGGCTTACGGCTATGACATTTTATGAGGAGG 727
Query 720 TGACAGACCAGAACTTGGACGTTTGGCAGGACAGTCCAGCACATGTACCTGATGCCTTGC 779
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 728 TGACAGACCAGAACTTGGACGTTTGGCAGGACAGTCCAGCACACGTACCTGATGCCTTGC 787
Query 780 GCTATTATTACTATCAGTACCTCTCATCAACTTCAGAAGCAGCTGAGGAGAAAATAGCCA 839
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 788 GCTATTATTACTATCAGTACCTCTCATCAACTTCAGAAGCAGCTGAGGAGAAAATAGCCA 847
Query 840 TGCTTCAGGAGAATGAATCTTTGAAAAAGGAGATTGAGAGGCTAAACAAAGAAAAGGACG 899
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 848 TGCTTCAGGAGAATGAATCATTGAAAAAGGAGATTGAGAGGCTAAGCAAAGAAAAGGACG 907
Query 900 GACTACTTAAGAGCAAAGAAAATTTCGAAGAGCAAATCGGTGCTTTTAACAAGTCTACAG 959
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 908 GACTACTTAAGAGCAAAGAAAATTTCGAAGAGCAAATAGGTGCTTTTAACAAGTCTACAG 967
Query 960 AATCACTTCAGAAGGATCTTCGGGACAGAGAAAAGCAGGTGCAAAGTTTGAAGCAATCCT 1019
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 968 AATCACTTCAGAAGGATCTTCGGGACAGAGAAAAGCAGGTGCAAAGTTTGAAGCAATCCT 1027
Query 1020 CAGAGCATCAGAGGAGGAACCTCAATGACTGTAGGGCTGAGATCACTTCTCTTAAAATGC 1079
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1028 CAGAGCATCAGAGGAGGAACCTCAATGACTGTAGGGCTGAGATCACTTCTCTTAAAATGC 1087
Query 1080 ATATTGAAGGGTCTCGTGCTGGTCAATATGTGTCATC-GAATGAAGGTGATCCTGTAAAA 1138
|||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1088 ATATTGAAGGGTCTCGCGCTGGTCAATATGTGTCA-CTGAATGAAGGTGATCCTGTAAAA 1146
Query 1139 TTACAATCC-----A----AGGAACAGATCAGCACGCTGTCGGAGGAAGTTGTAAAACCA 1189
||||||||| | |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||
Sbjct 1147 TTACAATCCAAGGAAGTCGAGGAACAGATAAGCACTCTGTCAGAGGAAGTTGTAAATCCA 1206
Query 1190 ACAGTGGAAAAGGATGGTGGTTTGATTTCTGAAGTTTCTATATTGGCTGAGAAAGGGCAC 1249
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1207 ACAGTGGAAAAGGATGGTGGTTTGATTTCTAAAGTTTCTATATCGGCTGAGAAAGGGCAC 1266
Query 1250 ATACAAACAGAAGACGATCTGGTGGTGGAAGAGGTTAAGAATATTATTGCTGATCAAAGA 1309
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1267 ATACAAACAGAAGACGATATGGTGGTGGAAGAGGTTAAGAATATTATTGCTGATCAAAGA 1326
Query 1310 GAGGTGGCAGCAGAGGCCAGCAATATATC-TATTGCCAACAATGGTACTTTAGAAAACCA 1368
|||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| || || |||||
Sbjct 1327 GAGGTGGCAGGAGAGGCCGGCAATATATCTTA-TGCCAACAATGGTACGTTGGAGAACCA 1385
Query 1369 GAAAGAAGTCTCAAACTATTTGTTAAGTCCATCAAACGGCAATTTCTCACCCAGAGACCT 1428
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1386 GAAAGAAGTCTCAAACTATTTGTTAAGTCCATCAAACGGTAATTTCTCACCCAGAGACCT 1445
Query 1429 AGGAAGCATCTTGAAAGTGGATCCTGGAATTGGTCGTGGTTCTAACTCAAAATCAGACAA 1488
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1446 TGGAAGCATCTTGAAAGTGGATCCTGGAATTGGTCGTGATTCTAACTCAAAATCAGACAA 1505
Query 1489 TGCAAATGGTGAAGCTGCTTCTGAGGAAATGGGTTTAGGAACGATTCAGATACTTGCAGA 1548
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1506 TGCAAATGGTGAAGCTGCTTCTGAGGAAATGGGTTTAGGAACGATTCAGATACTTGCAGA 1565
Query 1549 TGCTTTGCCGAAGATTGTTCCGTATGTTCTGATAAACCATCGAGAGGAACTCCTTCCCCT 1608
|||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1566 TGCTTTGCCGAATATTGTTCCATATGTTCTGATAAACCATCGAGAGGAACTCCTTCCCCT 1625
Query 1609 GATGATGTGTGCAATTGAGCGGCATCCAGTTAGCAGTACAAGAGATTCCTTGACTCATAC 1668
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1626 GATGATGTGTGCAATTGAGCGGCATCCAGTTAGCAGTACAAGAGATTCCTTGACTCATAC 1685
Query 1669 ACTGTTCAACCTGATCAAACGTCCAGATGAACAGCAGAGGCGGATTATTATGGATGCATG 1728
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1686 ACTGTTCAACCTGATCAAACGTCCAGATGAACAGCAGAGGCGGATTATTATGGATGCATG 1745
Query 1729 TGTTAGCCTATCGCGGAATGTTGGGGAAATGAGAACAGAAACAGAATTGCTTCCACAGTG 1788
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1746 TGTTAGCCTATCGAGGAATGTTGGGGAAATGAGAACAGAAACAGAATTGCTTCCGCAGTG 1805
Query 1789 CTGGGAACAGATAAATCATACATATGAAGAACGCAGGCTGCTAGTTGCTCAATCATGTGG 1848
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1806 CTGGGAACAGATAAATCATACATATGAAGAACGCAGGCTGCTAGTTGCTCAATCATGTGG 1865
Query 1849 GGAGCTTGCAGAATATGTCCGCCCTGAGATACGGGACTCTCTTATTTTATCTATCGTACA 1908
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1866 GGAGCTTGCAGAATATGTCCGCCCTGAGATACGGGACTCTCTTATTTTGTCTATCGTACA 1925
Query 1909 ACAACTCATAGAAGATTCTGCCACCGTTGTTCGAGAGGCTGCCGCTCATAATCTGGCATT 1968
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1926 ACAACTCATAGAAGATTCTGCCACCGTTGTTCGAGAGGCTGCGGCTCATAATCTGGCATT 1985
Query 1969 GCTGCTTCCACTATTTCCGAACACAGACAAATATTTCAAGGTCGAGGAGATGATGTTTCA 2028
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1986 GCTGCTTCCACTATTTCCTAACACAGACAAATATTTCAAGGTAGAGGAGATGATGTTTCA 2045
Query 2029 GCTGATATGTGATCCGTCTGGCCTGGTGGTTGAAACTACATTGAAAGAACTACTTCCTGC 2088
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2046 GCTGATATGCGATCCGTCTGGCCTGGTGGTTGAAACTACATTGAAAGAACTACTTCCTGC 2105
Query 2089 AGTGATAAAATGGGGTAACAGGCTGGATCATATCTTGAGAGGTCTTCTCTCTCACACTTT 2148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2106 AGTGATAAAATGGGGTAACAGGCTGGATCATATCTTGAGAGGTCTTCTCTCTCACACTTT 2165
Query 2149 GAGCTCTGCTCAGCACTGCCCACCTCTTTCTGGAGTTGAAGGGTCATTGGAGTCTCATCT 2208
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2166 GAGCTCAGCTCAGCACTGCCCACCTCTTTCTGGAGTTGAAGGGTCATTGGAGTCTCATCT 2225
Query 2209 GCGGGTCTTAGGTGAACGGGAGCGATGGAACATTGATGTCCTACTACGAATGCTCATGGA 2268
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2226 ACGAGTCTTAGGTGAACGGGAGCGATGGAACATTGATGTCCTACTACGAATGCTCATGGA 2285
Query 2269 CTTGCTTCCAGCTATACACCAGAAGGCAATGACAACATGTCCTTTTTCTTCCATCTCAAA 2328
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2286 GTTGCTTCCAGCTATACACCAGAAGGCAATGACAACATGTCCGTTTTCTTCCATCTCAAA 2345
Query 2329 GTCAGAGGAATCTGCATTCTCTGTTTCCTTGCTTGAGATCTATGCCGAGGGACGTTCTGA 2388
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2346 GTCAGAGGAATCTGCATTCTCTGTTTCCTTGCTTGAGATCTATGCCGAGGGACGTTCTGA 2405
Query 2389 GTGGCCTATGTTTGAATGGATGCATGTTGATTGCTTTGCTAACTTGTTGCAACTGGCATG 2448
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2406 GTGGCCTATGTTTGAGTGGATGCATGTTGATTGCTTTGCTAACTTGTTGCAACTGGCATG 2465
Query 2449 CATGTTGCCCCAGAAGGAAGACCATTTGAGAAATCGGATAACAAAGTTTCTCTTGGCTGT 2508
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2466 CATGTTGCCCCAGAAGGAAGACCATTTGAGAAATCGGATAACAAAGTTTCTCTTGGCTGT 2525
Query 2509 ATCTGAACGTTTTGGAAGTTCCTACCTAACTCACATTGAGTTACCTGTATTCTTGGTGGC 2568
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2526 ATCTGAACGTTTTGGAAGTTCCTACCTAACTCACATTGAGTTACCTGTATTTTTGGTGGC 2585
Query 2569 CGCTGGAGATGATGAGGCTGATCTTCGATTCTTACCTTCTGCAATCCATCCAAGGATAAA 2628
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2586 CGCTGGAGATGATGAGGCTGATCTTCGATTCTTACCTTCTGCAATCCATCCAAGAATAAA 2645
Query 2629 AGGCCTGAAACCAAGAACTGCTGTAGCCAATAGACTTGCCACGCTTTGTATTCTACCGCT 2688
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2646 AGGCCTGAAACCAAGAACTGCTGTAGCCAATAGACTTGCCACTCTTTGTATTCTACCGCT 2705
Query 2689 TCTGTTGGCAGGAGTTCTTGGTGCACCAAGTAAACGCGAAGAATTAACTATCCTCTTACG 2748
|||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2706 TCTGCTGGCAGGAGTTCTTGGTGCGCCAAGTAAACGCGAAGAATTAACTATCTTCTTACG 2765
Query 2749 ACAACTCTTAGTGGAGAGCAAAACAAAGGAAAACCAGTCAGCGAAGCACAATAATGAGGT 2808
|||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || |||||
Sbjct 2766 ACAACTTTTAGTTGAGAGCAAAACCAAGGAAAACCAGTCATCGAAGCACAACAACGAGGT 2825
Query 2809 TTTGGATGCAGTTCGCTTCCTTTGCACATTTGAGGAACACCATAACATGATATTCGGAAT 2868
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2826 TTTGGATGCAGTTCGCTTCCTTTGCACATTTGAGGTACACCATAACATGATATTCGGCAT 2885
Query 2869 TTTGTGGGAAATGGTCGTTGATTCCACTGCAGAACTCAAAATCAACGCTGCTAAGTTGTT 2928
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2886 TTTGTGGGAAATGGTCGTTGATTCCACTGCAGAACTCAAAATCAACGCTGCTAAGTTGTT 2945
Query 2929 GAAGACCATTGTTCCATATATCGATGCAAAGGTTGCTTCTGCCAATGTTTTACCAGCCTT 2988
||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2946 GAAGACCATCGTTCCATATATCGACGCAAAAGTTGCTTCCGCCAATGTTTTACCAGCCTT 3005
Query 2989 GATCACTCTTGGTTCAGACCAGAACCTGAATGTAAAATATGCAAGCATAGATGCATTTGG 3048
|||||||||||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||
Sbjct 3006 GATCACTCTTGGCTCGGACCAGAACCTGAATGTGAAGTACGCAAGCATAGATGCATTTGG 3065
Query 3049 ATCTGTAGCACAGCATTTCAAAATCGACATGATTGTTGATAAAATCCTAGTCCAGATGGA 3108
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3066 ATCTGTAGCACAGCATTTCAAAGTCGACATGATTGTTGATAAAATCCTAGTCCAGATGGA 3125
Query 3109 TGCTTTTTTGGAAGATGGATCTCATGAGGCTATAATCGCAGTCATTCGTGCACTCTTAGT 3168
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3126 TGCTTTTATGGAAGATGGATCTCATGAGGCTATAATCGCAGTCATTCGTGCACTCTTAGT 3185
Query 3169 TGCTATTCCTCACACTACAGAACGGCTTCGAGATTATCTTTTGTCCAAGATTTTACAACT 3228
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3186 TGCTATTCCTCACACGACAGAACGGCTTCGAGATTATCTTTTGTCCAAGATTTTACAACT 3245
Query 3229 TTCAGCAAGTCCAAGCACTTCAACAGATGTAAATCGTCGGCGAGAAAGAGCTAACGCATT 3288
|||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3246 TTCAGCAAGTCCAAGCTCTTCAACAGACGTAAATCGTCGTCGAGAAAGAGCTAACGCATT 3305
Query 3289 CTGTGAAGCCATTCGTGCACTCGATGCAACTGATTTGTCTCAAACAAGTGTCAAAGAATA 3348
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3306 CTGTGAAGCCATTCGTGCACTCGATGCAACTGATTTGTCTCAAACAAGTGTCAAAGAATA 3365
Query 3349 TCTCCTTCCAGCGATTCAAAACCTACTGAAAGATCCAGATGCGCTAGATCCAGCTCACAA 3408
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3366 CCTCCTTCCAGCGATTCAAAACCTACTGAAAGATCCAGATGCGCTAGATCCAGCTCACAA 3425
Query 3409 GGAAGCGTTAGAGATCATAATGAAGGAGAGATCAGGTGGGACATTTGAAGCAATCAGTAA 3468
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3426 GGAAGCGTTAGAGATCATAATGAAGGAGAGATCAGGTGGGACATTTGAAGCAATTAGTAA 3485
Query 3469 AGCTATGGGTGCTCACTTGGGGATTGCATCATCCGTCACAAGCTTGTTTGGAGAAGGAGG 3528
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3486 AGCTATGGGTGCTCACTTGGGGATTGCATCATCCGTCACGAGCTTGTTTGGAGAAGGAGG 3545
Query 3529 CTTGTTGGGGAAGAAAGAAGCAACAGAAAGCACTGCGGTTGCACC-GTCATCACCGACAG 3587
|||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||| | |||||||||||
Sbjct 3546 CTTGTTGGGGAAGAAAGAAGCAACGGAAAGCAC-G-G----CACCTGG-ATCACCGACAG 3598
Query 3588 TTCAGGGACCTGAGTCCCCAAAGGTTGTGGCTGCAGCGACTGAAGACACGAGATTCAGAC 3647
||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||
Sbjct 3599 GTCAGGGACCCGAGTCACCAAAGGTTGTGGCTGCAGCAAGTGAAGACACGAGATTCAGAC 3658
Query 3648 GTATCATGAGAGGCAACTTCACTGAGATGCTAAGGAGTAAAGCCAAGAACCAAGATGAGA 3707
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3659 GTATCATGAGAGGCAACTTCACTGAGATGCTAAGGAGTAAAGCCAAGACCCAAGATGAGA 3718
Query 3708 CACAGCCACAAAATCACTAAATATAAACCAGGTTTTTAATTCATTTAATACTTCTACTGC 3767
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||
Sbjct 3719 CACAGCCACAAAATCACTAAATATAGACCAGGTTTTTA-TTCATTTAATACATCTACTGC 3777
Query 3768 ATATATTCTTAATACACAGAGAAATAAAATCATGTtcttttgttatttagcctgctttat 3827
||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||||||
Sbjct 3778 ATATATTCTAAATACACAGA-AA-TAAAATCATGTTCTTTTGTTATTTGGCTTGCTTTAT 3835
Query 3828 ttttatctctcttttagctattttgttttt 3857
||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3836 TTTTATCTCTCTTTTAGCTATTTTGTTTTT 3865
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 192139391690
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5