BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg488471 Length=3857 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT5G16210.1 | Symbols: | HEAT repeat-containing protein | chr5... 6407 0.0 > AT5G16210.1 | Symbols: | HEAT repeat-containing protein | chr5:5290867-5297974 REVERSE LENGTH=3870 Length=3870 Score = 6407 bits (3469), Expect = 0.0 Identities = 3741/3870 (97%), Gaps = 27/3870 (1%) Strand=Plus/Plus Query 1 ACCGTCACTCCCTTCCGGTGAGATTCATCGGCGAGAACACCGACACGATCTGGTGAATCG 60 |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 ACCGTCACTCGCTTCCGGAGAGATTCATCGGCGAGAACACCGACACGATCTGGTGAATCG 69 Query 61 AATTCGATCGAATCGAGAGAGGGATAGTTTGAATTCTC-TTTCGGAATGCTCAGTGATAT 119 ||| |||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||||||||||||||| Sbjct 70 AATCCGATCGAATCGAGAGAGGAAAAGTTTGAATTTTCATTT-GGAATGCTCAGTGATAT 128 Query 120 TGGAACGAAGGAGGTGTTTCCTCTGATTGGGTTTTAGGGGTTCCTGTGAAAGAAGGAGAA 179 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||| |||| Sbjct 129 TGGAACGAAGGAGGTGTTTCCTCTGATTGGATTTTA-GTGTTCCCGTGAAAGAAGAAGAA 187 Query 180 AACAAAACATGGACGCGGAGCGATCGTCGTTGTGCAACTTTTTCGTCAACTTCCTGATGG 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 188 AACAAAACATGGACGCGGAGCGATCGTCGTTGTGCAACTTTTTCGTCAACTTCCTGATGG 247 Query 240 AGGAGAACTACCTTTTGACGGCGTTTGAGCTTCTTCACGAGCTCCTCGACGATGGCCGCG 299 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 248 AGGAGAACTACCTCTTGACGGCGTTTGAGCTTCTTCACGAGCTCCTCGACGATGGCCGCG 307 Query 300 ATGCCCAAGCAATTCGTCTTAAGGAGTTCTTTTCCGATCCTTCCCGTTTCCCTCCTGATC 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 308 ATGCCCAAGCAATTCGTCTTAAGGAGTTCTTTTCCGATCCTTCCCGTTTCCCTCCTGATC 367 Query 360 AGATTTCTCGGTATAATTCAATTCGAGTTGCGGATCCACAAAGTTTATTGGAGGAGAAAG 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 368 AGATTTCTCGGTATAATTCAATTCGAGTTGCGGATCCACAAAGTTTGTTGGAGGAGAAAG 427 Query 420 AAGCATTAGCTGAGAAGTTAGCTATCAGCGAATATGAATTTCGTCTAGCTCAGGAGGATA 479 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 428 AAGCTTTAGCTGAGAAGTTAGCTATCAGCGAATATGAATTTCGTCTAGCTCAGGAGGATA 487 Query 480 TTACAAGATTGAAAACTGAAGGACAGAAGAAATCTAATCCTTCGATTGACAAGTCAGAAG 539 || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 488 TTGCAAGATTGAAAACTGAAGGACAGAAGAAATCTGTTCCTTCGATTGACAAGTCAGAAG 547 Query 540 AGTTGGACTCGGATGAGTTTGGAGACAACAGGCCAGAGATTCAACGGAAAAAGAAAGATT 599 || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 548 AGATGGATTCGGATGAGTTTGGAGGCAACAGGCCAGAGATTCAACGGAAAAAGAAAGATT 607 Query 600 TTTCCTTCACTGATATAGGGCCTTTGAAGAACAATGAACGTCGAGACTTAAATTGTGCAG 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct 608 TTTCCTTCACTGATATAGGGCCTTTGAAGAACAATGAACGTCAAGACTTAAACTGTGCAG 667 Query 660 TGAAAGAATATCTTCTTCTAGCAGGTTACAGGCTTACGGCTATGACATTTTATGAGGAGG 719 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 668 TGAAAGAATATCTTCTTCTAGCAGGTTATAGGCTTACGGCTATGACATTTTATGAGGAGG 727 Query 720 TGACAGACCAGAACTTGGACGTTTGGCAGGACAGTCCAGCACATGTACCTGATGCCTTGC 779 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 728 TGACAGACCAGAACTTGGACGTTTGGCAGGACAGTCCAGCACACGTACCTGATGCCTTGC 787 Query 780 GCTATTATTACTATCAGTACCTCTCATCAACTTCAGAAGCAGCTGAGGAGAAAATAGCCA 839 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 788 GCTATTATTACTATCAGTACCTCTCATCAACTTCAGAAGCAGCTGAGGAGAAAATAGCCA 847 Query 840 TGCTTCAGGAGAATGAATCTTTGAAAAAGGAGATTGAGAGGCTAAACAAAGAAAAGGACG 899 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 848 TGCTTCAGGAGAATGAATCATTGAAAAAGGAGATTGAGAGGCTAAGCAAAGAAAAGGACG 907 Query 900 GACTACTTAAGAGCAAAGAAAATTTCGAAGAGCAAATCGGTGCTTTTAACAAGTCTACAG 959 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 908 GACTACTTAAGAGCAAAGAAAATTTCGAAGAGCAAATAGGTGCTTTTAACAAGTCTACAG 967 Query 960 AATCACTTCAGAAGGATCTTCGGGACAGAGAAAAGCAGGTGCAAAGTTTGAAGCAATCCT 1019 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 968 AATCACTTCAGAAGGATCTTCGGGACAGAGAAAAGCAGGTGCAAAGTTTGAAGCAATCCT 1027 Query 1020 CAGAGCATCAGAGGAGGAACCTCAATGACTGTAGGGCTGAGATCACTTCTCTTAAAATGC 1079 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1028 CAGAGCATCAGAGGAGGAACCTCAATGACTGTAGGGCTGAGATCACTTCTCTTAAAATGC 1087 Query 1080 ATATTGAAGGGTCTCGTGCTGGTCAATATGTGTCATC-GAATGAAGGTGATCCTGTAAAA 1138 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| Sbjct 1088 ATATTGAAGGGTCTCGCGCTGGTCAATATGTGTCA-CTGAATGAAGGTGATCCTGTAAAA 1146 Query 1139 TTACAATCC-----A----AGGAACAGATCAGCACGCTGTCGGAGGAAGTTGTAAAACCA 1189 ||||||||| | |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||| Sbjct 1147 TTACAATCCAAGGAAGTCGAGGAACAGATAAGCACTCTGTCAGAGGAAGTTGTAAATCCA 1206 Query 1190 ACAGTGGAAAAGGATGGTGGTTTGATTTCTGAAGTTTCTATATTGGCTGAGAAAGGGCAC 1249 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 1207 ACAGTGGAAAAGGATGGTGGTTTGATTTCTAAAGTTTCTATATCGGCTGAGAAAGGGCAC 1266 Query 1250 ATACAAACAGAAGACGATCTGGTGGTGGAAGAGGTTAAGAATATTATTGCTGATCAAAGA 1309 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1267 ATACAAACAGAAGACGATATGGTGGTGGAAGAGGTTAAGAATATTATTGCTGATCAAAGA 1326 Query 1310 GAGGTGGCAGCAGAGGCCAGCAATATATC-TATTGCCAACAATGGTACTTTAGAAAACCA 1368 |||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| || || ||||| Sbjct 1327 GAGGTGGCAGGAGAGGCCGGCAATATATCTTA-TGCCAACAATGGTACGTTGGAGAACCA 1385 Query 1369 GAAAGAAGTCTCAAACTATTTGTTAAGTCCATCAAACGGCAATTTCTCACCCAGAGACCT 1428 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 1386 GAAAGAAGTCTCAAACTATTTGTTAAGTCCATCAAACGGTAATTTCTCACCCAGAGACCT 1445 Query 1429 AGGAAGCATCTTGAAAGTGGATCCTGGAATTGGTCGTGGTTCTAACTCAAAATCAGACAA 1488 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 1446 TGGAAGCATCTTGAAAGTGGATCCTGGAATTGGTCGTGATTCTAACTCAAAATCAGACAA 1505 Query 1489 TGCAAATGGTGAAGCTGCTTCTGAGGAAATGGGTTTAGGAACGATTCAGATACTTGCAGA 1548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1506 TGCAAATGGTGAAGCTGCTTCTGAGGAAATGGGTTTAGGAACGATTCAGATACTTGCAGA 1565 Query 1549 TGCTTTGCCGAAGATTGTTCCGTATGTTCTGATAAACCATCGAGAGGAACTCCTTCCCCT 1608 |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1566 TGCTTTGCCGAATATTGTTCCATATGTTCTGATAAACCATCGAGAGGAACTCCTTCCCCT 1625 Query 1609 GATGATGTGTGCAATTGAGCGGCATCCAGTTAGCAGTACAAGAGATTCCTTGACTCATAC 1668 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1626 GATGATGTGTGCAATTGAGCGGCATCCAGTTAGCAGTACAAGAGATTCCTTGACTCATAC 1685 Query 1669 ACTGTTCAACCTGATCAAACGTCCAGATGAACAGCAGAGGCGGATTATTATGGATGCATG 1728 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1686 ACTGTTCAACCTGATCAAACGTCCAGATGAACAGCAGAGGCGGATTATTATGGATGCATG 1745 Query 1729 TGTTAGCCTATCGCGGAATGTTGGGGAAATGAGAACAGAAACAGAATTGCTTCCACAGTG 1788 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1746 TGTTAGCCTATCGAGGAATGTTGGGGAAATGAGAACAGAAACAGAATTGCTTCCGCAGTG 1805 Query 1789 CTGGGAACAGATAAATCATACATATGAAGAACGCAGGCTGCTAGTTGCTCAATCATGTGG 1848 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1806 CTGGGAACAGATAAATCATACATATGAAGAACGCAGGCTGCTAGTTGCTCAATCATGTGG 1865 Query 1849 GGAGCTTGCAGAATATGTCCGCCCTGAGATACGGGACTCTCTTATTTTATCTATCGTACA 1908 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1866 GGAGCTTGCAGAATATGTCCGCCCTGAGATACGGGACTCTCTTATTTTGTCTATCGTACA 1925 Query 1909 ACAACTCATAGAAGATTCTGCCACCGTTGTTCGAGAGGCTGCCGCTCATAATCTGGCATT 1968 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 1926 ACAACTCATAGAAGATTCTGCCACCGTTGTTCGAGAGGCTGCGGCTCATAATCTGGCATT 1985 Query 1969 GCTGCTTCCACTATTTCCGAACACAGACAAATATTTCAAGGTCGAGGAGATGATGTTTCA 2028 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 1986 GCTGCTTCCACTATTTCCTAACACAGACAAATATTTCAAGGTAGAGGAGATGATGTTTCA 2045 Query 2029 GCTGATATGTGATCCGTCTGGCCTGGTGGTTGAAACTACATTGAAAGAACTACTTCCTGC 2088 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2046 GCTGATATGCGATCCGTCTGGCCTGGTGGTTGAAACTACATTGAAAGAACTACTTCCTGC 2105 Query 2089 AGTGATAAAATGGGGTAACAGGCTGGATCATATCTTGAGAGGTCTTCTCTCTCACACTTT 2148 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2106 AGTGATAAAATGGGGTAACAGGCTGGATCATATCTTGAGAGGTCTTCTCTCTCACACTTT 2165 Query 2149 GAGCTCTGCTCAGCACTGCCCACCTCTTTCTGGAGTTGAAGGGTCATTGGAGTCTCATCT 2208 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2166 GAGCTCAGCTCAGCACTGCCCACCTCTTTCTGGAGTTGAAGGGTCATTGGAGTCTCATCT 2225 Query 2209 GCGGGTCTTAGGTGAACGGGAGCGATGGAACATTGATGTCCTACTACGAATGCTCATGGA 2268 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2226 ACGAGTCTTAGGTGAACGGGAGCGATGGAACATTGATGTCCTACTACGAATGCTCATGGA 2285 Query 2269 CTTGCTTCCAGCTATACACCAGAAGGCAATGACAACATGTCCTTTTTCTTCCATCTCAAA 2328 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 2286 GTTGCTTCCAGCTATACACCAGAAGGCAATGACAACATGTCCGTTTTCTTCCATCTCAAA 2345 Query 2329 GTCAGAGGAATCTGCATTCTCTGTTTCCTTGCTTGAGATCTATGCCGAGGGACGTTCTGA 2388 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2346 GTCAGAGGAATCTGCATTCTCTGTTTCCTTGCTTGAGATCTATGCCGAGGGACGTTCTGA 2405 Query 2389 GTGGCCTATGTTTGAATGGATGCATGTTGATTGCTTTGCTAACTTGTTGCAACTGGCATG 2448 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2406 GTGGCCTATGTTTGAGTGGATGCATGTTGATTGCTTTGCTAACTTGTTGCAACTGGCATG 2465 Query 2449 CATGTTGCCCCAGAAGGAAGACCATTTGAGAAATCGGATAACAAAGTTTCTCTTGGCTGT 2508 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2466 CATGTTGCCCCAGAAGGAAGACCATTTGAGAAATCGGATAACAAAGTTTCTCTTGGCTGT 2525 Query 2509 ATCTGAACGTTTTGGAAGTTCCTACCTAACTCACATTGAGTTACCTGTATTCTTGGTGGC 2568 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 2526 ATCTGAACGTTTTGGAAGTTCCTACCTAACTCACATTGAGTTACCTGTATTTTTGGTGGC 2585 Query 2569 CGCTGGAGATGATGAGGCTGATCTTCGATTCTTACCTTCTGCAATCCATCCAAGGATAAA 2628 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 2586 CGCTGGAGATGATGAGGCTGATCTTCGATTCTTACCTTCTGCAATCCATCCAAGAATAAA 2645 Query 2629 AGGCCTGAAACCAAGAACTGCTGTAGCCAATAGACTTGCCACGCTTTGTATTCTACCGCT 2688 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 2646 AGGCCTGAAACCAAGAACTGCTGTAGCCAATAGACTTGCCACTCTTTGTATTCTACCGCT 2705 Query 2689 TCTGTTGGCAGGAGTTCTTGGTGCACCAAGTAAACGCGAAGAATTAACTATCCTCTTACG 2748 |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 2706 TCTGCTGGCAGGAGTTCTTGGTGCGCCAAGTAAACGCGAAGAATTAACTATCTTCTTACG 2765 Query 2749 ACAACTCTTAGTGGAGAGCAAAACAAAGGAAAACCAGTCAGCGAAGCACAATAATGAGGT 2808 |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||||| Sbjct 2766 ACAACTTTTAGTTGAGAGCAAAACCAAGGAAAACCAGTCATCGAAGCACAACAACGAGGT 2825 Query 2809 TTTGGATGCAGTTCGCTTCCTTTGCACATTTGAGGAACACCATAACATGATATTCGGAAT 2868 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct 2826 TTTGGATGCAGTTCGCTTCCTTTGCACATTTGAGGTACACCATAACATGATATTCGGCAT 2885 Query 2869 TTTGTGGGAAATGGTCGTTGATTCCACTGCAGAACTCAAAATCAACGCTGCTAAGTTGTT 2928 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2886 TTTGTGGGAAATGGTCGTTGATTCCACTGCAGAACTCAAAATCAACGCTGCTAAGTTGTT 2945 Query 2929 GAAGACCATTGTTCCATATATCGATGCAAAGGTTGCTTCTGCCAATGTTTTACCAGCCTT 2988 ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 2946 GAAGACCATCGTTCCATATATCGACGCAAAAGTTGCTTCCGCCAATGTTTTACCAGCCTT 3005 Query 2989 GATCACTCTTGGTTCAGACCAGAACCTGAATGTAAAATATGCAAGCATAGATGCATTTGG 3048 |||||||||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| Sbjct 3006 GATCACTCTTGGCTCGGACCAGAACCTGAATGTGAAGTACGCAAGCATAGATGCATTTGG 3065 Query 3049 ATCTGTAGCACAGCATTTCAAAATCGACATGATTGTTGATAAAATCCTAGTCCAGATGGA 3108 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3066 ATCTGTAGCACAGCATTTCAAAGTCGACATGATTGTTGATAAAATCCTAGTCCAGATGGA 3125 Query 3109 TGCTTTTTTGGAAGATGGATCTCATGAGGCTATAATCGCAGTCATTCGTGCACTCTTAGT 3168 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3126 TGCTTTTATGGAAGATGGATCTCATGAGGCTATAATCGCAGTCATTCGTGCACTCTTAGT 3185 Query 3169 TGCTATTCCTCACACTACAGAACGGCTTCGAGATTATCTTTTGTCCAAGATTTTACAACT 3228 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3186 TGCTATTCCTCACACGACAGAACGGCTTCGAGATTATCTTTTGTCCAAGATTTTACAACT 3245 Query 3229 TTCAGCAAGTCCAAGCACTTCAACAGATGTAAATCGTCGGCGAGAAAGAGCTAACGCATT 3288 |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 3246 TTCAGCAAGTCCAAGCTCTTCAACAGACGTAAATCGTCGTCGAGAAAGAGCTAACGCATT 3305 Query 3289 CTGTGAAGCCATTCGTGCACTCGATGCAACTGATTTGTCTCAAACAAGTGTCAAAGAATA 3348 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3306 CTGTGAAGCCATTCGTGCACTCGATGCAACTGATTTGTCTCAAACAAGTGTCAAAGAATA 3365 Query 3349 TCTCCTTCCAGCGATTCAAAACCTACTGAAAGATCCAGATGCGCTAGATCCAGCTCACAA 3408 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3366 CCTCCTTCCAGCGATTCAAAACCTACTGAAAGATCCAGATGCGCTAGATCCAGCTCACAA 3425 Query 3409 GGAAGCGTTAGAGATCATAATGAAGGAGAGATCAGGTGGGACATTTGAAGCAATCAGTAA 3468 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 3426 GGAAGCGTTAGAGATCATAATGAAGGAGAGATCAGGTGGGACATTTGAAGCAATTAGTAA 3485 Query 3469 AGCTATGGGTGCTCACTTGGGGATTGCATCATCCGTCACAAGCTTGTTTGGAGAAGGAGG 3528 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 3486 AGCTATGGGTGCTCACTTGGGGATTGCATCATCCGTCACGAGCTTGTTTGGAGAAGGAGG 3545 Query 3529 CTTGTTGGGGAAGAAAGAAGCAACAGAAAGCACTGCGGTTGCACC-GTCATCACCGACAG 3587 |||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||| | ||||||||||| Sbjct 3546 CTTGTTGGGGAAGAAAGAAGCAACGGAAAGCAC-G-G----CACCTGG-ATCACCGACAG 3598 Query 3588 TTCAGGGACCTGAGTCCCCAAAGGTTGTGGCTGCAGCGACTGAAGACACGAGATTCAGAC 3647 ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct 3599 GTCAGGGACCCGAGTCACCAAAGGTTGTGGCTGCAGCAAGTGAAGACACGAGATTCAGAC 3658 Query 3648 GTATCATGAGAGGCAACTTCACTGAGATGCTAAGGAGTAAAGCCAAGAACCAAGATGAGA 3707 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 3659 GTATCATGAGAGGCAACTTCACTGAGATGCTAAGGAGTAAAGCCAAGACCCAAGATGAGA 3718 Query 3708 CACAGCCACAAAATCACTAAATATAAACCAGGTTTTTAATTCATTTAATACTTCTACTGC 3767 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct 3719 CACAGCCACAAAATCACTAAATATAGACCAGGTTTTTA-TTCATTTAATACATCTACTGC 3777 Query 3768 ATATATTCTTAATACACAGAGAAATAAAATCATGTtcttttgttatttagcctgctttat 3827 ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||| Sbjct 3778 ATATATTCTAAATACACAGA-AA-TAAAATCATGTTCTTTTGTTATTTGGCTTGCTTTAT 3835 Query 3828 ttttatctctcttttagctattttgttttt 3857 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3836 TTTTATCTCTCTTTTAGCTATTTTGTTTTT 3865 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 192139391690 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5