BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg488633
Length=3846
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G17680.1 | Symbols: | disease resistance protein (TIR-NBS-L... 6039 0.0
> AT5G17680.1 | Symbols: | disease resistance protein (TIR-NBS-LRR
class), putative | chr5:5822999-5827153 FORWARD LENGTH=3885
Length=3885
Score = 6039 bits (3270), Expect = 0.0
Identities = 3653/3839 (95%), Gaps = 21/3839 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 9 tcttccttcttcttcttcttcttcAGCCGTGTGGAAAACGGACGTTTTCGTTAGTTTTAG 68
|||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 16 TCTT-CTTCTTCTTCTTCTTCTTCAACAGTGTGGAAAACGGACGTTTTCGTGAGTTTTAG 74
Query 69 AGGAGAAGATGTGCGTAAAACATTCGTGAGCCATCTATTCTGCGAGTTTGATCGGATGGG 128
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AGGAGAAGATGTGCGTAAAACATTCGTGAGCCATCTATTCTGCGAGTTTGATCGGATGGG 134
Query 129 GATCAACGCTTTCAGAGACGATTTGGATCTACAGAGAGGAAAATCTATTTCCCCAGAGCT 188
||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||
Sbjct 135 GATTAAAGCTTTCAGAGACGATTTGGATCTACAGAGAGGAAAATCCATCTCCCCTGAGCT 194
Query 189 TATTGATGCGATCAAAGGCTCCAGATTCGCCATTGTCGTGGTCTCTAGGAACTACGCAGC 248
||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 195 TATAGATGCGATCAAAGGCTCCAGATTTGCCATTGTTGTGGTCTCTAGGAACTACGCAGC 254
Query 249 TTCAAGCTGGTGCTTAGACGAGCTCTTGAAGATCATGGAATGTAAAGATACGATTAGTCA 308
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | || |
Sbjct 255 TTCAAGCTGGTGCTTAGACGAGCTCTTGAAGATCATGGAATGT--A-ATA--A--AG--A 305
Query 309 GACAATCT-TGCCCATTTTCTACGAGGTTGATCCTTCGGACGTGAGAAGACAGAGAGGAA 367
|| || | | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 306 TACGAT-TGTACCCATTTTCTACGAGGTTGATCCTTCGGATGTGAGAAGACAGAGAGGAA 364
Query 368 GTTTCGGTGAAGATGTTGAGAGTCACAGTGACAAGGAGAAAGTGAGGG-AATGGAGAGAA 426
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||
Sbjct 365 GTTTCGGTGAAGATGTTGAGAGTCACAGTGACAAGGAGAAAGTG-GGGAAATGGAAAGAA 423
Query 427 GCTTTGAAGAAATTAGCTGCCATTTCTGGTGAAGACTCACGAAATTGGAGGGATGAGTCA 486
||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||| |||
Sbjct 424 GCTTTGAAGAAATTAGCTGCCATTTCTGGTGAAGATTCTCGGAATT---GGGATGACTCA 480
Query 487 AAGCTGATTAAGAAGATTGTTAGAGACATTTCTGATAAATTGGTTTCGACTTCAAGGGAT 546
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||
Sbjct 481 AAGCTGATTAAGAAGATTGTTAAAGACATTTCTGATAAATTGGTTTCTACTTCATGGGAT 540
Query 547 GATTCAAAAGGTTTGATTGGAATGAGTTCTCATATGGACTTTCTTCAGTCTATGATGTCT 606
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||
Sbjct 541 GATTCAAAAGGTTTGATTGGAATGAGTTCTCATATGGACTTTCTGCAGTCTATGATATCT 600
Query 607 ATAGAGGACAAGGATGTTCGAATGGTGGGGATTTGGGGAATGGGTGGAGTTGGGAAAACT 666
|||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 ATAGTGGACAAGGATGTTCGAATGTTGGGGATTTGGGGAATGGGTGGAGTTGGGAAAACT 660
Query 667 ACGATTGCTAAGTACTTATACAATCAACTCTCAGGTCGATTTCAAGCTCATTGCTTCATG 726
|||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||
Sbjct 661 ACGATTGCCAAATACTTATACAATCAACTCTCAGGTCAATTTCAAGTTCATTGCTTCATG 720
Query 727 GAGAATGTGAAAGAAGTCTGTAACAGATATGGAGTTAGGCGTTTACAAGGGGAGTTTTTA 786
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 721 GAGAATGTGAAGGAAGTCTGTAACAGATATGGAGTTAGGCGTTTACAAGTGGAGTTTTTA 780
Query 787 TGCAGAATGTTTCGAGAGAGAGATAAAGAAGCGTGGAGCTCGGTGTCTTGTTGCAGCATG 846
||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||
Sbjct 781 TGCAGAATGTTTCAAGAGAGAGACAAAGAAGCGTGGAGTTCGGTTTCTTGTTGCAATATA 840
Query 847 ATAAAGGAAAGGTTCAGGCACAAAAGGGTCTTGATTGTGCTCGACGATGTAGATAGATCT 906
||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct 841 ATAAAGGAAAGGTTCAGGCACAAAATGGTTTTCATTGTTCTTGACGATGTAGATAGATCT 900
Query 907 GAGCAATTGAATGAATTGGTGAAGGAGATTGATTGGTTTGGTCCGGGAAGCAGAATTATC 966
|||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 901 GAGCAACTGAATGAATTGGTGAAGGAGACTGGTTGGTTTGGTCCGGGAAGCAGAATCATC 960
Query 967 GTGACAACACGGGATAGACATTTGCTACTTTCTCATGGAATAGATTTGGTATATAAAGTG 1026
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||
Sbjct 961 GTGACAACACGGGATAGACATTTGCTACTTTCCCATGGAATAAATTTGGTGTATAAAGTG 1020
Query 1027 AAGTGTTTACCCAAAAAAGAAGCTCTCCAGCTCTTTTGTAACTATGCTTTCAGAGAGGAG 1086
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||
Sbjct 1021 AAGTGTTTACCCAAAAAAGAAGCTCTCCAGCTCTTTTGTAATTATGCTTTCAGAGAAGAG 1080
Query 1087 ATTAGAATTCCACATGGGTTTCAGGAGTTATCGGTTCAAGCTATTAACTATGCTTCTGGC 1146
|||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1081 ATTATACTTCCACATGGGTTTGAGGAGTTATCGGTTCAAGCTGTTAACTATGCTTCTGGT 1140
Query 1147 CTTCCACTGGCTCTAAGAGTTTTGGGTTCCTTCCTTTATCGAAGAAGCCAAAGAGAATGG 1206
||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1141 CTTCCACTGGCTCTAAGAGTTTTAGGCTCCTTCCTTTATCGAAGAAGCCAAATTGAATGG 1200
Query 1207 GAAAGCACTCTTGCTAGGCTTAAAACTTACCCTCATAGTGATATCATGGAAGTTCTGAGA 1266
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1201 GAAAGTACTCTTGCTAGGCTTAAAACTTACCCTCATAGTGATATCATGGAAGTTTTGAGA 1260
Query 1267 GTTAGCTACGACGGATTGGATGAGCAAGAGAAGGCTATTTTTCTCTATATATCATGTTTC 1326
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1261 GTTAGCTACGACGGATTGGATGAGCAAGAGAAGGCTATTTTTCTCTATATATCATGTTTT 1320
Query 1327 TATAACATGAAGCATGTTGATTATGTCACAAAACTTCTGGATATTTGTGGCTTTGCTGCT 1386
|||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||
Sbjct 1321 TATAACATGAAGCAGGTTGATTATGTCAGAAAACTTCTGGATCTTTGTGGCTATGCTGCT 1380
Query 1387 GAAATTGGTATCACGATTCTTACCGAGAAGTCTTTGATATTTGTATCAAATGGAAACATA 1446
||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||
Sbjct 1381 GAAATCGGAATAACGATACTTACCGAGAAGTCTTTGATAGTTGAATCAAATGGATGCGTA 1440
Query 1447 AAGATGCATGATTTGCTTGAACAGATGGGTAGAGAGATTGTTCGTCAACAAGCAGTTAAC 1506
||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1441 AAGATACATGATTTGCTTGAACAGATGGGTAGAGAGCTTGTTCGTCAACAAGCAGTTAAC 1500
Query 1507 AACCCAGCCCAACGGTTACT-TGTATGGGATCCTGAAGACATCTGTGATTTGCTGTCAGA 1565
|||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||
Sbjct 1501 AACCCAGCCCAACGGTTACTAT-TATGGGATCCTGAAGACATATGTCATTTGCTGTCAGA 1559
Query 1566 AAATTCTGGAACACAACTTGTTGAAGGAATTTCTCTGAACCTCTCTGAAATTTCTGAGGT 1625
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1560 AAATTCTGGAACACAACTTGTTGAAGGAATCTCTCTGAACCTCTCTGAAATTTCTGAGGT 1619
Query 1626 ATTTGCTAGTGATCGAGCTTTCGAGGGATTGTCTAATCTCAAGCTTCTTAACTTCTATGA 1685
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||
Sbjct 1620 ATTTGCTAGTGATCGAGCGTTCGAGGGATTGTCTAATCTCAAACTTCTCAACTTCTATGA 1679
Query 1686 TCTTTCATTTGATGGAGAGACTAGAGTGCATCTACCTAATGGCCTTAGTTATCTCCCACG 1745
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1680 TCTTTCGTTTGATGGAGAGACTAGAGTGCATCTACCTAATGGCCTCAGTTATCTCCCACG 1739
Query 1746 CAAGCTTCGTTATCTCCGTTGGGATGGATACCCTTTAAAGACTATGCCTTCAAGATTTTG 1805
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1740 CAAGCTTCGTTATCTCCGTTGGGATGGATACCCTTTAAAGACTATGCCTTCAAGATTTTT 1799
Query 1806 TCCTGAGTTTCTTGTTGAACTTTGTATGAGTAATAGCGATCTTGAAAAACTTTGGGATGG 1865
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1800 TCCTGAGTTTCTTGTTGAACTTTGTATGAGTAATAGCAATCTTGAAAAACTTTGGGATGG 1859
Query 1866 GATCCAGCCTCTTAGGAACTTGAAGAAGATGGATCTTTCTCGCTGTAAATACCTTGTCGA 1925
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1860 GATCCAGCCTCTGAGGAACTTGAAGAAGATGGATCTTTCTCGCTGTAAATACCTTGTCGA 1919
Query 1926 AATTCCTGATCTCTCAAAAGCCACAAATCTGGAGGAACTAAACCTTTCCTATTGCCAAAG 1985
| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1920 AGTTCCAGACCTCTCAAAAGCCACAAATCTGGAGGAACTAAACCTTTCCTATTGCCAAAG 1979
Query 1986 CTTGGTTGAGGTTACTCCATCTATCAAGAACCTTAAGGGACTTTCTTGCTTCTACATGAC 2045
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1980 CTTGGTTGAGGTTACTCCATCTATCAAGAACCTAAAGGGACTTTCTTGCTTCTACTTGAC 2039
Query 2046 TAATTGCATCCAACTCAAGAACATTCCGATTGGAATAACTTTGAAGTCACTTGAAACAGT 2105
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||
Sbjct 2040 TAATTGCATCCAACTCAAGGACATTCCGATTGGAATAATTTTGAAGTCGCTTGAAACAGT 2099
Query 2106 GCGAATGAGTGGATGCTCAAGTCTAATGCATTTTCCAGAAATTTCTTGGAATACTAGAAG 2165
| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2100 GGGAATGAGTGGATGCTCAAGCCTAAAGCATTTTCCAGAAATTTCTTGGAATACTAGAAG 2159
Query 2166 ACTCTATCTGAGCAGTACAAAGATAGAGGAACTGCCATCATCAATTAGTCGTCTCTCTTG 2225
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||
Sbjct 2160 ACTCTATCTGAGCAGTACAAAGATAGAGGAACTTCCATCATCAATCAGCCGTCTCTCTTG 2219
Query 2226 TCTGGTTGAATTGGATATGTCAGATTGCCAGAGACTCAGGACCCTTCCAAGCTATCTAAG 2285
||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |
Sbjct 2220 TCTGGTTAAATTGGATATGTCAGATTGTCAGAGACTCAGGACTCTTCCAAGCTATCTAGG 2279
Query 2286 GCACTTGGTCTCACTGAAATCCCTGAATTTGGACGGTTGCAAACGTCTTGAGAACCTCCC 2345
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2280 GCACTTGGTCTCACTGAAATCCCTGAATTTGGACGGTTGCAGACGTCTTGAGAACCTCCC 2339
Query 2346 AGACACATTACAGAACCTAACATCTCTTGAAACGCTTGAAGTATCTGGTTGCCTTAATGT 2405
|||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2340 AGACACGTTACAGAATCTAACATCTCTTGAAACGCTTGAAGTGTCTGGTTGCCTTAATGT 2399
Query 2406 CAACGAGTTCCCTCGTGTCGCCACGAATATAGAAGTTCTGCGTATATCTGAGACATCAAT 2465
|||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2400 CAACGAGTTCCCTCGTGTTTCCACGAGTATAGAAGTTCTGCGTATATCTGAGACATCAAT 2459
Query 2466 TGAAGAAATTCCTGCAAGGATCTGTAATCTCTCTCAGCTTAGGTCCTTGGATATTTCAGA 2525
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2460 TGAAGAAATTCCTGCAAGGATCTGTAATCTCTCTCAGCTTAGGTCCTTGGATATCTCAGA 2519
Query 2526 AAACAAAAGACTTAAATCACTTCCGTTAAGCATTTCTAAGCTAAGATCACTTGAAAAGCT 2585
||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2520 AAACAAAAGACTTGCATCACTTCCGGTAAGCATTTCTGAGCTAAGATCACTTGAAAAGCT 2579
Query 2586 CAAGCTTTCTGGATGTTCTGTACTCGAGAGTTTTCCACCAGAAATTTGTCAGACAATGAG 2645
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2580 CAAGCTTTCTGGATGTTCTGTACTCGAGAGTTTTCCACTAGAAATTTGTCAGACAATGAG 2639
Query 2646 CTGCTTGAGGTGGTTTGATTTAGATAGGACTAGCATTAAAGAACTACCTGAAAACATTGG 2705
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2640 CTGCTTGAGGTGGTTTGATTTAGATAGGACTAGCATTAAAGAACTACCTGAAAACATTGG 2699
Query 2706 GAATTTAGTAGCTCTTGAGGTGCTTCAAGCCAGTAGAACAGTGATAAGGCGAGCACCACG 2765
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2700 GAATTTAGTAGCTCTTGAGGTGCTTCAAGCCAGTAGAACAGTGATAAGGCGAGCACCATG 2759
Query 2766 GTCTACTGCACAACTTACCCGTCTTCAAGTTTTAGCGATTGGGAATAGTTTCTATACTCT 2825
||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2760 GTCTATTGCACGACTTACCCGTCTTCAAGTTTTAGCGATTGGGAATAGTTTCTTTACTCC 2819
Query 2826 AGAAGGTTTGTTGCATTCTCTTTGTCCTCCCTTATCAAGGTTTGATGACTTGAGAGCTCT 2885
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2820 AGAAGGTTTGTTGCATTCTCTTTGTCCTCCCTTATCAAGGTTTGATGACTTGAGAGCTCT 2879
Query 2886 GAGCCTAAGCAACATGAACATGGTAGAGATCCCTAACAGTATTGGTAACTTATGGAATCT 2945
|||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2880 GAGCCTAAGCAACATGAACATGACAGAGATTCCTAACAGTATTGGTAACTTATGGAATCT 2939
Query 2946 ACTAGAACTAGATTTGAGTGGGAACAGTTTCGAATTCATCCCCGCAAGCATCAAACGGCT 3005
|||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2940 ACTAGAACTAGATTTGAGTGGGAACAATTTTGAATTCATCCCCGCAAGCATCAAACGGCT 2999
Query 3006 CACCAGGTTGAACAGACTGAATTTAAACAATTGTCAGAGACTTCAAGCATTGCCCGATGA 3065
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3000 CACCAGGTTGAACAGACTGAATTTAAACAATTGCCAGAGACTTCAAGCATTGCCCGATGA 3059
Query 3066 GCTTCCACGAGGTCTCTTGTATATCTACATCCATAACTGCACATCCCTAGTGAGTATCTC 3125
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3060 GCTTCCACGAGGTCTCTTGTATATCTACATCCATAGCTGCACATCACTAGTGAGTATCTC 3119
Query 3126 AGGTTGCTTCAACCAATATTGTCTGCGCCAGTTTGTAGCTAGCAACTGTTACAAATTGGA 3185
||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3120 AGGTTGCTTCAACCAATATTGTCTGCGAAAGCTTGTAGCTAGCAACTGTTACAAATTGGA 3179
Query 3186 TCAAGCAGCGCAGATTCTCATTCACCGTAACATGAAGCTAGAGTCAGCAAAACCAGAACA 3245
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3180 TCAAGCAGCGCAGATTCTCATTCACCGTAACTTGAAGCTAGAGTCAGCAAAACCAGAACA 3239
Query 3246 CTCTTATTTTCCTGGAAGTGACATACCCAGTTGCTTCAATCACCAAGTCATGGGTCCTTC 3305
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3240 CTCTTATTTTCCTGGAAGTGACATACCCACTTGCTTCAATCACCAAGTCATGGGTCCTTC 3299
Query 3306 GCTGAGTATACAGTTACCTCAGAGTGAATCATCGTCTGACATTCTGGGATTTTCTGCCTG 3365
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3300 GCTGAATATACAGTTACCTCAGAGTGAATCATCGTCTGACATTCTGGGATTTTCTGCCTG 3359
Query 3366 CATCATGATTGGAGTTGATGGACTGTACCCGATGAACAATCTGAAGATACACTGCTCTTG 3425
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3360 CATCATGATTGGAGTTGATGGACAGTACCCGATGAACAATCTGAAGATACACTGCTCTTG 3419
Query 3426 TATTTTAAAAGATGCTGATGATTGTGAGCTGGTTGTTATGGATGAGGTGTGGTATCCTGA 3485
||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3420 TATATTAAAAGATGCTGATGCTTGTGAGCTGGTTGTTATGGATGAGGTGTGGTATCCTGA 3479
Query 3486 TCCAAAAGCTTTCACAAACATGTGTTTTGGAACAGATCACCTTCTCTTATTCAGCAGAAC 3545
||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3480 TCCAAAAGCTTTCACAAACATGTATTTTGGATCAGATCACCTTCTCTTATTCAGCAGAAC 3539
Query 3546 CTGCATGTCCATGGGAGCTTACAATGAAGCCTTGTTTGAATTCTCAATCGAAAACACAGA 3605
||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3540 CTGCACGTCCATGGAAGCTTACAGCGAAGCCCTGTTTGAATTCTCAGTCGAAAACACAGA 3599
Query 3606 AGGAGATTCTTTTAGCCCGCTTGGAGAGGTTAAAAAATGTGCAGTGCACCTTATATCATT 3665
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |
Sbjct 3600 AGGAGATTCCTTTAGCCCGCTTGGAGAGGTTAAAAAATGTGCGGTACACCTTATATCACT 3659
Query 3666 TAAAGACATGATGCAAGAGTTCTCTAATGACTCTGACAAAATTCAGAATTCTGATTTGGA 3725
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3660 CAAAGACATGATGCAAGAGTTCTCTAATGACTCTGACAAAATTCAGAGTTCTGATTTGGA 3719
Query 3726 TCTTTCAAAGGCATTTGATGACGCAAGACTTTTGAAAAGAAGAGCATATGAAACTGAGCT 3785
|||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3720 TCTTCCAAAGGCATTTGATGACGCAAGAATTTTGAAAAGAAGAGCATATGAAACTGAGTT 3779
Query 3786 CTTGCATAAGGAGCAACCAAGATCC-AAGAGGATCAAGTTTCTTCCAGTTCATTTGGCT 3843
|||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3780 CTTGCATAAGGAACAACTAA-ATCCCAAGAGGATCAAGTTTCTTCCAGTTCCTTTGGCT 3837
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 191587555317
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5