BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg488656
Length=2762
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G17920.1 | Symbols: ATCIMS, ATMETS, ATMS1 | Cobalamin-indepe... 4614 0.0
AT3G03780.1 | Symbols: ATMS2, MS2 | methionine synthase 2 | chr... 2815 0.0
> AT5G17920.1 | Symbols: ATCIMS, ATMETS, ATMS1 | Cobalamin-independent
synthase family protein | chr5:5935038-5939487 FORWARD
LENGTH=2771
Length=2771
Score = 4614 bits (2498), Expect = 0.0
Identities = 2683/2772 (97%), Gaps = 13/2772 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCACCACCAGATCTACACAAATTACACAGAGCCCAAC---GATGTA--TC--AT-TTTT 52
|||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| || | ||||
Sbjct 2 AGCACCACCAGATCTACAGAAATGACACAGAGCCCAACGATGATGTATCTCGTTTATTTT 61
Query 53 GGCTATAAATAGACTCACAGAGCCCACTCTTGTTcctcgctctctctttcgccttctctt 112
|||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 62 CGCTATAAATAAACTCACACAGCCCACTCTTCTTCCTCGCTCTCTCTTTCGCCTTCTCTT 121
Query 113 agccaaccctttttcctt-ctcctctccgattcttcctccGTCAGTAAAAGAAAATCAAA 171
|||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 122 AGCCTACCCTTTTTCCTTCCTCCTCTCCGATTCTTCCTCCGTCAGTAAAAGAAAATCAAA 181
Query 172 ATGGCTTCACACATTGTTGGATATCCACGTATGGGCCCTAAGAGAGAGCTCAAGTTTGCT 231
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 182 ATGGCTTCACACATTGTTGGATACCCACGTATGGGCCCTAAGAGAGAGCTCAAGTTTGCA 241
Query 232 TTGGAATCTTTCTGGGATGGTAAGAGCACTGCTGAGGATCTTCAGAAGGTGTCTGCTGAT 291
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 242 TTGGAATCTTTCTGGGATGGTAAGAGCACTGCTGAGGATCTTCAGAAGGTGTCTGCTGAT 301
Query 292 CTCAGGTCATCCATCTGGAAACAGATGTCTGCGGCTGGGACTAAGTTCATCCCAAGCAAC 351
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 302 CTCAGGTCATCCATCTGGAAACAGATGTCTGCCGCTGGGACTAAGTTCATCCCTAGCAAC 361
Query 352 ACCTTTGCTCACTACGACCAGGTTCTCGACACCACCGCTATGCTCGGTGCTGTTCCACCT 411
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 362 ACCTTTGCTCACTACGACCAGGTTCTTGACACCACCGCCATGCTCGGTGCTGTTCCACCT 421
Query 412 AGATATGGTTACACTGGTGGTGAGATCGGGCTTGATGTTTACTTCTCCATGGCCAGAGGA 471
|| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 422 AGGTATGGATACACTGGTGGTGAGATCGGCCTTGATGTTTACTTCTCCATGGCTAGAGGA 481
Query 472 AATGCCTCTGTGCCTGCTATGGAAATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTACCATTACATC 531
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 482 AATGCCTCTGTGCCTGCCATGGAAATGACCAAGTGGTTCGACACCAACTACCATTACATC 541
Query 532 GTCCCTGAGTTGGGCCCTGAGGTCAACTTCTCTTACGCATCCCACAAGGCGGTGAATGAG 591
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 542 GTCCCTGAGTTGGGCCCTGAGGTTAACTTCTCTTACGCATCCCACAAGGCGGTGAATGAG 601
Query 592 TACAAGGAGGCCAAAGCTCTTGGTGTTGACACCGTCCCTGTACTTGTTGGCCCAGTCTCT 651
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 602 TACAAGGAGGCCAAGGCTCTTGGTGTTGACACCGTCCCTGTACTTGTTGGCCCAGTCTCT 661
Query 652 TACTTGCTGCTTTCCAAGGCTGCCAAGGGTGTTGACAAGTCATTTGATCTTCTTTCTCTT 711
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||
Sbjct 662 TACTTGCTGCTTTCCAAGGCTGCCAAGGGTGTTGACAAGTCATTCGAACTTCTTTCTCTT 721
Query 712 CTCCCTAAAATTCTCCCGATCTACAAGGAAGTGATTACCGAGCTTAAGGCAGCTGGTGCC 771
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 722 CTCCCTAAGATTCTCCCGATCTACAAGGAAGTGATTACCGAGCTTAAGGCTGCTGGTGCC 781
Query 772 ACCTGGATTCAGCTTGACGAGCCTGTCCTTGTTATGGATCTTGAGGGTCACAAACTCCAG 831
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 782 ACCTGGATTCAGCTTGACGAGCCTGTCCTTGTTATGGATCTTGAGGGTCAGAAACTCCAG 841
Query 832 GCCTTTACTGGTGCCTATGCTGAACTTGAATCAACTCTTTCTGGTTTGAATGTTCTTGTC 891
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 842 GCCTTTACTGGTGCCTATGCTGAACTTGAATCAACTCTTTCTGGTTTGAATGTTCTTGTC 901
Query 892 GAGACCTACTTCGCTGATATCCCTGCTGAGGCATACAAGACCCTAACTTCATTGAAGGGT 951
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 902 GAGACCTACTTCGCTGATATCCCTGCTGAGGCATACAAGACCCTAACCTCATTGAAGGGT 961
Query 952 GTGACTGCCTTTGGTTTTGATTTGGTTCGTGGCACCAAGACCCTTGATTTAGTCAAGGCA 1011
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 962 GTGACTGCCTTTGGATTTGATTTGGTTCGTGGCACCAAGACCCTTGATTTGGTCAAGGCA 1021
Query 1012 GGTTTCCCTGAGGGAAAGTACCTCTTTGCTGGTGTTGTTGATGGAAGGAACATCTGGGCC 1071
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1022 GGTTTCCCTGAGGGAAAGTACCTCTTTGCTGGTGTTGTTGATGGAAGGAACATCTGGGCC 1081
Query 1072 AATGACTTTGCTGCGTCTCTCAGCACCTTGCAGGCACTTGAAGGCATTGTTGGTAAAGAC 1131
|| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1082 AACGACTTTGCTGCGTCCCTAAGCACCTTGCAGGCACTTGAAGGCATTGTTGGTAAAGAC 1141
Query 1132 AAGCTTGTGGTCTCAACCTCCTGCTCTCTTCTCCACACCGCTGTTGATCTTATCAATGAG 1191
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1142 AAGCTTGTGGTCTCAACCTCCTGCTCTCTTCTCCACACCGCTGTTGATCTTATCAATGAG 1201
Query 1192 ACTAAGCTTGATGATGAAATCAAGTCATGGTTGGCGTTTGCTGCCCAGAAGGTTGTTGAA 1251
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1202 ACTAAGCTTGATGATGAAATCAAGTCATGGTTGGCGTTTGCTGCCCAGAAGGTCGTTGAA 1261
Query 1252 GTGAACGCATTGGCTAAGGCTTTGGCTGGTCAGAAGGATGAGGCTCTTTTCTCTGCCAAT 1311
|||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1262 GTGAACGCTTTGGCCAAGGCTTTGGCTGGTCAGAAGGACGAGGCTCTTTTCTCTGCCAAT 1321
Query 1312 GCTGCGGCTTTGGCTTCAAGGAGGTCTTCCCCAAGAGTCACCAACGAGGGTGTCCAGAAG 1371
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1322 GCTGCGGCTTTGGCTTCAAGGAGATCTTCCCCAAGAGTCACCAACGAGGGTGTCCAGAAG 1381
Query 1372 GCTGCTGCTGCTTTGAAGGGATCTGACCACCGTCGTGCAACTAATGTTAGTGCTAGGCTA 1431
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1382 GCTGCTGCTGCTTTGAAGGGATCTGACCACCGTCGTGCAACCAATGTTAGTGCTAGGCTA 1441
Query 1432 GATGCTCAGCAGAAGAAGCTCAACCTCCCAATCCTGCCAACCACAACCATCGGATCCTTC 1491
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1442 GATGCTCAGCAGAAGAAGCTCAATCTCCCAATCCTACCAACCACAACCATTGGATCCTTC 1501
Query 1492 CCACAGACCGTAGAGCTCAGGAGAGTTCGTCGTGAGTACAAGGCGAAAAAGGTCTCTGAG 1551
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||
Sbjct 1502 CCACAGACTGTAGAGCTCAGGAGAGTTCGTCGTGAGTACAAGGCCAAAAAGGTCTCAGAG 1561
Query 1552 GAGGACTACGTTAAGGCCATCAAGGAAGAGATCAAGAAAGTTGTTGACCTCCAAGAGGAA 1611
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1562 GAGGACTACGTTAAAGCCATCAAGGAAGAGATCAAGAAAGTTGTTGACCTCCAAGAGGAA 1621
Query 1612 CTTGACATCGATGTTCTTGTCCACGGAGAGCCAGAGAGAAATGACATGGTTGAGTACTTC 1671
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1622 CTTGACATCGATGTTCTTGTCCACGGAGAGCCAGAGAGAAACGACATGGTTGAGTACTTT 1681
Query 1672 GGGGAGCAGTTGTCTGGTTTTGCCTTCACTGCAAACGGATGGGTCCAATCTTATGGATCT 1731
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1682 GGTGAGCAGTTGTCTGGTTTTGCCTTCACTGCAAACGGATGGGTCCAATCTTATGGATCT 1741
Query 1732 CGTTGTGTGAAGCCACCAGTTATCTACGGTGATGTGAGCCGTCCCAAGGCAATGACCGTC 1791
|| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1742 CGCTGTGTGAAGCCACCAGTTATCTATGGTGATGTGAGCCGTCCCAAGGCAATGACCGTC 1801
Query 1792 TTCTGGTCCGCAATGGCTCAGAGCATGACCTCTCGCCCAATGAAGGGTATGCTTACCGGT 1851
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1802 TTCTGGTCCGCAATGGCTCAGAGCATGACCTCTCGCCCAATGAAGGGTATGCTTACTGGT 1861
Query 1852 CCCGTCACCATTCTCAACTGGTCCTTCGTCAGAAACGACCAGCCCAGGCACGAAACCTGT 1911
|||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1862 CCCGTCACCATTCTCAACTGGTCCTTTGTCAGGAACGACCAGCCCAGGCACGAAACCTGT 1921
Query 1912 TACCAGATCGCTTTGGCCATCAAGGACGAAGTCGAGGATCTTGAGAAAGGTGGAATCGGT 1971
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1922 TACCAGATCGCTTTGGCCATCAAGGACGAAGTCGAGGATCTTGAGAAAGGTGGAATCGGT 1981
Query 1972 GTCATTCAGATTGATGAGGCTGCACTTAGAGAAGGACTACCACTCAGGAAATCCGAGCAT 2031
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1982 GTCATTCAGATTGATGAGGCTGCACTTAGAGAAGGACTACCACTCAGGAAATCCGAGCAT 2041
Query 2032 GCTTTCTACTTGGACTGGGCCGTTCACTCCTTCAGAATCACCAACTGTGGAGTCCAAGAC 2091
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2042 GCTTTCTACTTGGACTGGGCCGTCCACTCCTTCAGAATCACCAACTGTGGAGTCCAAGAC 2101
Query 2092 AGCACCCAGATCCACACTCACATGTGCTACTCCCACTTCAATGACATCATACACTCCATC 2151
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2102 AGCACCCAGATCCACACTCACATGTGCTACTCCCACTTCAATGACATCATACACTCCATC 2161
Query 2152 ATCGACATGGATGCTGATGTCATCACCATTGAGAACTCCAGGTCTGACGAGAAGCTTCTC 2211
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2162 ATCGACATGGATGCTGATGTCATCACCATTGAGAACTCCAGGTCTGATGAGAAGCTTCTT 2221
Query 2212 TCCGTGTTCCGTGAAGGAGTGAAGTACGGTGCTGGAATTGGTCCAGGAGTCTACGACATC 2271
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2222 TCCGTGTTCCGTGAAGGAGTGAAGTACGGTGCTGGAATCGGTCCAGGAGTCTACGACATC 2281
Query 2272 CACTCTCCAAGAATACCATCTTCTGAGGAAATCGCAGAGAGGGTCAACAAGATGCTTGCT 2331
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2282 CACTCTCCAAGAATACCATCTTCTGAGGAAATCGCAGACAGGGTCAACAAGATGCTTGCT 2341
Query 2332 GTCCTAGAGCAGAACATCCTTTGGGTCAACCCTGACTGTGGTCTCAAGACCCGTAAGTAC 2391
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2342 GTCCTAGAGCAGAACATCCTTTGGGTTAACCCTGACTGTGGTCTCAAGACCCGTAAGTAC 2401
Query 2392 ACCGAGGTTAAGCCTGCGCTCAAGAACATGGTTGATGCGGCCAAGCTCATCCGTTCCCAG 2451
|||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||
Sbjct 2402 ACCGAGGTCAAGCCTGCACTCAAGAACATGGTTGATGCGGCTAAGCTCATCCGCTCCCAG 2461
Query 2452 CTCGCCAGTGCCAAGTGAAGAAAAGCTTGATTTGAACAAGGAAAACGTCtttttttt-tC 2510
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||
Sbjct 2462 CTCGCCAGTGCCAAGTGAAGAAAAGCTTGATTTGAACAAGGAAA-CGT-TTTTTTTTCTC 2519
Query 2511 TAAAATGGTTGTGTTTTATTTGCTTTAATAACTTTCTTAAAAATATCTTTAGTCGAAGTT 2570
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
Sbjct 2520 TAAAATGGTTGTGTTTTATTTGGTTTAATAACTTTCTTAAAAATATTTTTAGTCGAAGGT 2579
Query 2571 AGATTTGATACATATGGTTTCTTTCTTGTTGAGAGAGAGGGATGATATGGCATCCTTTGG 2630
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||
Sbjct 2580 AGATTTGATGCATATGGTTTCTTTCTTGTTGAGAGAGAGAAAGGCTATAGCATCCTTTGG 2639
Query 2631 ATTTGCTGCAATGTTTGTGATTTTCTTTTTGTCTCCAATATATTTCTCTGATGGAATGTC 2690
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2640 ATTTGATGCAATGTTTGTGATTTTCTTTTTGTCTCCAATATATTTCTCTGATGGAATGTC 2699
Query 2691 tttttttCTAAAGTCTCTTGAAAAGGAATAAGAGGATTGATTCTTATACAAATACTTTTG 2750
|||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2700 TTTTTT-CTAAAGTATCTTGAAAAGGAATAAGAGGATTGATTCTTATACAAATACTTTTG 2758
Query 2751 TTTGCGTCGTCC 2762
||||||| ||||
Sbjct 2759 TTTGCGTTGTCC 2770
> AT3G03780.1 | Symbols: ATMS2, MS2 | methionine synthase 2 | chr3:957235-960980
FORWARD LENGTH=2617
Length=2617
Score = 2815 bits (1524), Expect = 0.0
Identities = 2064/2324 (89%), Gaps = 40/2324 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 169 AAAATGGCTTCACACATTGTTGGATATCCACGTATGGGCCCTAAGAGAGAGCTCAAGTTT 228
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 77 AAAATGGCTTCCCACATTGTTGGATATCCACGTATGGGACCTAAGAGAGAGCTCAAGTTT 136
Query 229 GCTTTGGAATCTTTCTGGGATGGTAAGAGCACTGCTGAGGATCTT-CAGAAGGTGTCTGC 287
|| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||| || ||| || ||||||||||||||
Sbjct 137 GCATTGGAGTCTTTCTGGGATGGCAAGAGCAGTGCCGATGAT-TTGCAGAAGGTGTCTGC 195
Query 288 TGATCTCAGGTCAT-CCATCTGGAAACAGATGTCTGCGGCTGGGACTAAGT-TCATCCCA 345
|||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||
Sbjct 196 TGATCTCAGGTC-TGATATCTGGAAACAGATGTCTGCTGCTGGGATTAAGTAT-ATCCCA 253
Query 346 AGCAACACCTTTGCTCACTACGACCAGGTTCTCGACACCACCGCTATGCTCGGTGCTGTT 405
|||||||||||| |||| || |||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||
Sbjct 254 AGCAACACCTTTTCTCATTATGACCAGGTGCTTGACACCACCGCCATGCTTGGTGCTGTT 313
Query 406 CCACCTAGATATGG--TTACACTGGTGGTGAGATCGGGCTTGATGTTTACTTCTCCATGG 463
||| |||||||||| |||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||||||
Sbjct 314 CCATCTAGATATGGATTTAC-C-AGTGGTGAGATCGGTCTCGATGTTTACTTCTCCATGG 371
Query 464 CCAGAGGAAATGCCTCTGTGCCTGCTATGGAAATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTACC 523
| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 372 CTAGAGGAAATGCCTCTGTTCCAGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTACC 431
Query 524 ATTACATCGTCCCTGAGTTGGGCCCTGAGGTCAACTTCTCTTACGCATCCCACAAGGCGG 583
||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||| |
Sbjct 432 ATTACATCGTCCCAGAGTTGGGCCCTGAAGTGAAATTTTCTTACGCATCTCACAAGGCTG 491
Query 584 TGAATGAGTACAAGGAGGCCAAAGCTCTTGGTGTTGACACCGTCCCTGTACTTGTTGGCC 643
| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 492 TCAATGAGTACAAGGAGGCCAAGGCTCTTGGTGTTGAGACCGTCCCTGTACTTGTTGGCC 551
Query 644 CAGTCTCTTACTTGCTGCTTTCCAAGGC-TGCCAAGGGTGTTGACAAGTCATTTGATCTT 702
| |||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 552 CTGTCTCTTACTTGCTTCTTTCCAA-GCTTGCTAAGGGTGTTGACAAGTCATTTGATCTT 610
Query 703 CTTTCTCTTCTCCCTAAAATTCTCCCGA-TCTACAAGGAAGTGATTACCGAGCTTAAGGC 761
|| || |||||||| ||||| ||||| | | ||||||||||| ||| | |||||||||||
Sbjct 611 CTCTCCCTTCTCCCCAAAATCCTCCC-AGTTTACAAGGAAGTCATTGCAGAGCTTAAGGC 669
Query 762 AGCTGGTGCCACCTGGATTCAGCTTGACGAGCCTGTCCTTGTTATGGATCTTGAGGGTCA 821
|||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||| ||||||||
Sbjct 670 AGCTGGTGCCTCCTGGATTCAGCTTGATGAGCCTCTCTTTGTCATGGATCTCGAGGGTCA 729
Query 822 CAAACTCCAGGCCTTTA-CTGGTGCCTATGCTGAACTTGAATCAACTCTTTCTGGTTTGA 880
|||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||
Sbjct 730 CAAACTCCAGGCTTTTAGC-GGTGCCTATGCTGAGCTTGAATCAACTCTCTCTGGTCTGA 788
Query 881 ATGTTCTTGTCGAGACCTACTTCGCTGATATCCCTGCTGAGGCATACAAGACCCTAACTT 940
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||
Sbjct 789 ATGTTCTTGTGGAGACCTACTTCGCTGATATCCCTGCTGAAGCATACAAGACCCTTACTT 848
Query 941 CATTGAAGGGTGTGACTGCCTTTGGTTTTGATTTGGTTCGTGGCACCAAGACCCTTGA-T 999
| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |
Sbjct 849 CCTTGAAGGGTGTGACTGCCTTCGGATTTGATTTGGTTCGTGGCACCAAGACCATTGACT 908
Query 1000 TTAGTCAAGGCAGGTTTCCCTGAGGGAAAGTACCTCTTTGCTGGTGTTGTTGATGGAAGG 1059
| | ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 909 TGA-TCAAGTCAGGTTTCCCACAGGGCAAGTACCTCTTTGCTGGTGTTGTTGACGGAAGG 967
Query 1060 AACATCTGGGCCAATGACTTTGCTGCGTCTCTCAGCACCTTGCAGGCACTTGAAGGCATT 1119
|||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||||||| || ||
Sbjct 968 AACATCTGGGCCAATGACCTCGCTGCCTCTCTCATCACCTTGCAGTCACTTGAGGGTGTT 1027
Query 1120 GTTGGTAAAGACAAGCTTGTGGTCTCAACCTCCTGCTCTCTTCTCCACACCGCTGTTGAT 1179
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 1028 GTTGGTAAAGACAAGCTTGTGGTCTCAACCTCTTGCTCTCTTCTCCACACTGCCGTTGAC 1087
Query 1180 CTTATCAATGAGACTAAGCTTGATGATGAAATCAAGTCATGGTTGGCGTTTGCTGCCCAG 1239
||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||| | || ||||||||||||
Sbjct 1088 CTTATTAACGAGACTAAGCTTGATGCTGAAATCAAGTCGTGGCTAGCTTTTGCTGCCCAG 1147
Query 1240 AAGGTTGTTGAAG-TGAACGCATTGGCTAAGGCTTTGGCTGGTCAGA-AGGATGAG-GCT 1296
||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||| | |
Sbjct 1148 AAGGTTGTTGAAGTTG-ACGCATTGGCCAAGGCTTTGGCCGGTCAGACA-AATGAGAG-T 1204
Query 1297 CTT-TTCTCTGCCAATGCTG-CGGCTTTGGCTTCAAGGAGGTCTTCCCCAAGAGTCACCA 1354
|| ||| ||||||| |||| | || ||| |||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1205 -TTCTTCACTGCCAACGCTGAC-GCATTGTCTTCGAGGAGGTCTTCCCCAAGAGTCACCA 1262
Query 1355 ACGAGGGTGTCCAGAAGGCTGCTGCTGCTTTGAAGGGATCTGACCACCGTCGTGCAACT- 1413
| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||
Sbjct 1263 ATGAGTCTGTCCAGAAGGCTGCTGCTGCTTTGAAGGGATCTGACCACCGCCGTACAACTG 1322
Query 1414 AATGTTAGTGCTAGGCTAGATGCTCAGCAGAAGAAGCTCAACCTCCCAATCCTGCCAACC 1473
|| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||
Sbjct 1323 AA-GTTAGCGCAAGGCTAGATGCTCAGCAGAAGAAGCTTAACCTTCCAATCCTCCCAACC 1381
Query 1474 ACAACCATCGGATCCTTCCCACAGACCGTAGAGCTCAGGAGAGTTCGTCGTGAGTACAAG 1533
|||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||
Sbjct 1382 ACAACCATTGGATCCTTCCCACAGACCGTGGAACTCAGGAGAGTTCGCCGTGAATACAAG 1441
Query 1534 GCGAA-AAAGGTCTCTGAGGAGGACTACGTTAAGGCCATCAAGGAAGAGATCAAGAAAGT 1592
|| || ||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1442 GCCAAGAAA-ATCTCTGAAGAGGATTACGTCAAGGCCATCAAGGAAGAGATCAAGAAAGT 1500
Query 1593 TGTTGACCTCCAAGAGGAACTTGACATCGATGTTCTTGTCCACGGAGAGCCAGAGAGAAA 1652
||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||
Sbjct 1501 TGTTGACATCCAAGAGGACCTTGACATTGATGTTCTTGTTCACGGAGAGCCTGAGAGAAA 1560
Query 1653 TGACATGGTTGAGTACTTCGGGGAGCAGTTGTCTGGTTTTGCCTTCACTGCAAACGGATG 1712
||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||
Sbjct 1561 CGACATGGTTGAGTACTTTGGAGAGCAATTGTCAGGTTTCGCATTCACAGCAAACGGATG 1620
Query 1713 GGTCCAATCTTATGGATCTCGTTGTGTGAAGCCACCAGTTATCTACGGTGATGTGAGCCG 1772
||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 1621 GGTGCAATCCTATGGATCTCGCTGTGTGAAGCCACCAGTTATCTATGGTGACGTGAGCCG 1680
Query 1773 TCCCAAGGCAATGACCGTCTTCTGGTCCGCAATGGCTCAGAGCATGACCTCTCGCCCAAT 1832
|||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||
Sbjct 1681 CCCCAAGCCAATGACAGTCTTCTGGTCCTCAACAGCTCAGAGCATGACCAAACGTCCAAT 1740
Query 1833 GAAGGGTATGCTTACCGGTCCCGTCACCATTCTCAACTGGTCCTTCGTCAGAAACGACCA 1892
||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||
Sbjct 1741 GAAGGGTATGCTTACAGGTCCAGTCACAATTCTCAACTGGTCTTTTGTCAGAAACGACCA 1800
Query 1893 GCCCAGGCACGAAACCTGTTACCAGATCGCTTTGGCCATCAAGGACGAAGTCGAGGATCT 1952
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || || ||
Sbjct 1801 GCCCAGGCACGAAACCTGTTACCAGATCGCTTTGGCCATCAAAGATGAAGTGGAAGACCT 1860
Query 1953 TGAGAAAGGTGGAATCGGTGTCATTCAGATTGATGAGGCTGCACTTAGAGAAGGACTACC 2012
|||||||| || || || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| | ||
Sbjct 1861 CGAGAAAGGCGGTATTGGAGTCATTCAGATCGATGAAGCCGCACTTAGAGAAGGATTGCC 1920
Query 2013 ACTCAGGAAATCCGAGCA-TGCTTTCTACTTGGACTGGGCCGTTCACTCCTTCAGAATCA 2071
|| |||||| |||| || | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||
Sbjct 1921 TCTTAGGAAAGCCGAACACT-CTTTCTACTTGGACTGGGCTGTTCACTCTTTCAGAATCA 1979
Query 2072 CCAACTGTGGAGTCCAAGACAGCACCCAGATCCACACTCACATGTGCTACTCCCACTTCA 2131
|||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||
Sbjct 1980 CCAACTGTGGCGTCCAAGACAGCACTCAGATTCACACTCACATGTGTTACTCAAACTTCA 2039
Query 2132 ATGACATCATACACTCCATCATCGACATGGATGCTGATGTCATCACCATTGAGAACTC-C 2190
| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2040 ACGACATCATCCACTCAATCATTGACATGGACGCTGATGTCATCACCATTGAGAACTCTC 2099
Query 2191 AGGTCTGACGAGAAGCTTCTCTCCGTGTTCCGTGAAGGAGTGAAGTACGGTGCTGGAATT 2250
| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2100 -GTTCAGACGAGAAGCTTCTCTCAGTGTTCCGTGAAGGAGTGAAGTACGGTGCAGGAATC 2158
Query 2251 GGTCCAGGAGTCTACGACATCCACTCTCCAAGAATACCATCTTCTGAGGAAATCGCAGAG 2310
||||| || || |||||||| |||||||| ||||||||||| | || ||||| |||||
Sbjct 2159 GGTCCTGGTGTTTACGACATTCACTCTCCGAGAATACCATCCACAGATGAAATTGCAGAC 2218
Query 2311 AGGGTCAACAAGATGCTTGCTGTCCTAGAGCAGAACATCCTT-TGGGTCAACCCTGACTG 2369
||| |||||||||||||||| || || |||||||||||| || ||||| |||||||||||
Sbjct 2219 AGGATCAACAAGATGCTTGCGGTTCTTGAGCAGAACATC-TTGTGGGTTAACCCTGACTG 2277
Query 2370 TGGTCTCAAGACCCGTAAGTACACCGAGGTTAAGCCTGCGCTCAAGAAC-ATGGTTGATG 2428
|||||| ||||| | |||||||| |||||||| || || || || | | |||||||| |
Sbjct 2278 TGGTCTGAAGACAAGGAAGTACACTGAGGTTAAACCAGCACTTAA-AGCCATGGTTGACG 2336
Query 2429 CGGCCAAGCTCATCCGTTCCCAGCTCGCCAGTGCCAAGTGAAGA 2472
|||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2337 CGGCTAAGCTTATCCGCTCCCAGCTCGGTAGTGCCAAGTGAAGA 2380
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 137206589105
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5