BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg488855
Length=4131
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G19610.1 | Symbols: GNL2 | GNOM-like 2 | chr5:6617746-662204... 6523 0.0
> AT5G19610.1 | Symbols: GNL2 | GNOM-like 2 | chr5:6617746-6622045
REVERSE LENGTH=4128
Length=4128
Score = 6523 bits (3532), Expect = 0.0
Identities = 3938/4137 (95%), Gaps = 15/4137 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGATCGTATCGCGGTGAGAGCAAAGCGGAAAGAGCTAGGGATATCATGCATGCTTAAC 60
|||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGATCGTATCGCCGTAAGAGCAAAGCGGAAAGAGCTAGGGATATCATGCATGCTTAAC 60
Query 61 ACGGAGGTTGGTGCAGTCCTTGCCGTCATTCGTAGACCCCTTTCGGAAAGTTACCTTTCT 120
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 61 ACGGAGGTTGGTGCAGTCCTTGCCGTCATTCGTAGACCCCTTTCAGAAAGTTACCTTTCT 120
Query 121 CCCCAAGAAACAGACCACTGTGATTCATCAGTCCAACAATCTCTAAAATCTCTTAGAGCC 180
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 121 CCCCAAGAAACAGACCACTGTGATTCATCAGTCCAACAATCTCTCAAATCTCTTAGAGCT 180
Query 181 CTTATCTTCAATCCTCAACAAGATTGGCGCACTATCGATCCTTCGGTTTACCTCTCTCCT 240
||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||
Sbjct 181 CTTATTTTCAATCCTCAACAAGATTGGCGCACCATAGATCCTTCGGTTTATCTTTCTCCT 240
Query 241 TTCCTCGAAGTTATTCAAAGCGATGAGATCCCGGCTAGCGCCACAGCTGTCGCCCTTTCC 300
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 241 TTCCTCGAAGTTATTCAAAGCGATGAGATTCCGGCTAGCGCCACAGCTGTCGCTCTTTCC 300
Query 301 TCCATCTTGAAGATCCTTAAAATCGAGATTTTCGATGAGAAAACACCTGGTGCAAAAGAT 360
|||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 TCCATCTTAAAGATCCTTAAAATCGAGATCTTCGATGAGAAAACACCTGGTGCAAAAGAT 360
Query 361 GCTATGAATTCAATTGTTTCGGGGATTACTAGTTGTCGTTTGGAGAAAACAGATTTGTTG 420
||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 361 GCTATGAATTCTATTGTCTCCGGGATTACTAGTTGTCGTTTGGAGAAAACAGATTTGGTG 420
Query 421 TCCGAAGATGCTGTGATGATGAGGATTCTTCAAGTTTTAATCGGAATCATGAAACATCCA 480
|| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 421 TCTGAAGATGCTGTAATGATGAGGATTCTTCAAGTTTTAACCGGAATCATGAAACATCCA 480
Query 481 TCCTCTGAGTTATTAGAAGATCAAGCGGTTTGCACTATCGTCAACACATGTTTCCAAGTG 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||
Sbjct 481 TCCTCTGAGTTATTAGAAGATCAAGCGGTTTGCACAATAGTCAATACATGTTTCCAAGTA 540
Query 541 GTGCAACAATCTACCGGTAGAGGAGATTTGTTGCAACGAAATGGAAGATACGCAATGCAC 600
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 541 GTGCAACAATCTACCGGTAGAGGAGATTTGCTGCAACGAAATGGAAGATACACAATGCAT 600
Query 601 GAACTGATTCAGATCATTTTCTCTAGATTACCTGATTTTGAAGTCAGAGGAGACGATGGT 660
|| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||
Sbjct 601 GAGCTGATTCAGATCATTTTCTCCAGATTACCTGATTTTGAGGTCAGAGGAGACGAAGGT 660
Query 661 GGTGAGGAATCAGAATCTGATACTGACGAAATAGACATGAGCGGCGGATATGGAATCCGA 720
|||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 GGTGAGGATTCAGAATCTGATACTGACGAAATCGACATGAGCGGCGGATATGGAATCCGA 720
Query 721 TGTTGTATCGACATTTTTCATTTCTTATGTTCGTTGCTCAATGTTGTTGAGGTTGTTGAG 780
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 721 TGTTGCATCGACATTTTTCATTTCTTATGTTCGTTGCTCAATGTTGTTGAAGTTGTTGAG 780
Query 781 AACTCGGAAGGGACAAGTGTTCACACTGCAGACGAAGATGTGCAGATTTTTGCTTTGGTT 840
|||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 781 AACTTAGAAGGGACAAACGTTCACACTGCAGACGAAGATGTGCAGATTTTTGCTTTAGTT 840
Query 841 TTAATCAATAGCGCGATTGAGTTAAGTGGTGATGCGATCGGGCAACACCCTAAGCTTCTT 900
||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 TTAATAAATAGCGCCATTGAGTTAAGCGGTGATGCGATCGGGCAACACCCTAAGCTTCTT 900
Query 901 CGGATGGTTCAAGACGATCTATTTCACCATTTAATCCATTATGGAGCTTCTTCAAGCCCG 960
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 CGGATGGTTCAGGACGATCTATTTCACCATTTAATCCATTATGGAGCTTCTTCAAGCCCT 960
Query 961 CTTGTTCTATCGATGATCTCTAGTTGTATACTCAATATATATCACTTCCTCCGCAAGTTC 1020
||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 CTTGTGCTATCAATGATCTGTAGTTGTATACTCAATATATATCACTTCCTCCGCAAGTTC 1020
Query 1021 ATGAGGCTACAGCTCGAAGCTTTCTTCTCCTTTGTGTTGTTGAGAGTTACAGCTTTTACA 1080
||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1021 ATGAGGCTACAACTCGAAGCTTTCTTCTCCTTCGTGTTGTTGAGAGTTACAGCTTTCACA 1080
Query 1081 GGCTTCCTTCCGTTACAAGAAGTTGCTCTTGAAGGGCTAATCAACTTTTGTCGACAACCC 1140
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1081 GGCTTCCTTCCGTTACAAGAAGTTGCTCTTGAAGGGCTAATCAACTTTTGTCGACAACCT 1140
Query 1141 GCTTTCATAGTCGAAGCCTATGTGAACTACGACTGTGATCCAATGTGTAGGAATAT-TTT 1199
||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||
Sbjct 1141 GCTTTCATAGTCGAAGCTTATGTAAACTACGACTGTGATCCGATGTGTAGAAATATATTT 1200
Query 1200 CGAAGAGACCGGAAAAGTTCTGTGTAGGCATACCTTCCCTACCTCTGGTCCTTTAACCTC 1259
|||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1201 -GAAGAGACCGGAAAAGTTCTATGCAGACATACATTCCCTACCTCTGGTCCTTTAACCTC 1259
Query 1260 TATACAAATCCAAGCCTTTGAAGGTCTTGTGATCTTGATTCACAACATCGCTGACAATAT 1319
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1260 TATACAAATCCAAGCCTTTGAAGGTCTTGTGATCTTGATTCACAACATCGCCGACAATAT 1319
Query 1320 GGATAGAGAGGAAGAAGAGGGTGCTGAAGAAGATG---ATAACTCCAATGCGATTAAGCC 1376
||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||
Sbjct 1320 GGATAGAGAGGAAGATGAGGGTAATGAAGAAGATGATAATAACTCCAATGTGATTAAGCC 1379
Query 1377 AAGCCCCGTTGAGATTCACGAGTACATACCCTTTTGGATAGATAAGCCAAAAGAGGATTT 1436
|||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1380 AAGCCCTGTTGAGATTCATGAGTACATACCCTTTTGGATAGATAAGCCAAAAGAGGATTT 1439
Query 1437 TGAGACGTGGGTAGATCATATAAGAGTGAGGAAAGCTCAGAAGAGGAAGCTAGCGATCGC 1496
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1440 TGAGACGTGGGTAGATCATATAAGAGTAAGGAAAGCTCAGAAGAGAAAGCTAGCGATCGC 1499
Query 1497 TGCAAATCATTTCAATAGAGATGAGAAAAAGGGTTTGGAGTATTTGAAGTATAACTACTT 1556
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1500 TGCAAATCATTTCAACAGAGATGAGAAAAAGGGTTTGGAGTATTTGAAGTATAACTACTT 1559
Query 1557 AGTCTCAGATCCTCTTGATCCAATGGCATTAGCTTCATTTTTCAGATTTACACCGGGTTT 1616
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1560 AGTCTCAGATCCTCTTGATCCAATGGCATTAGCTTCATTTTTCAGATTCACACCGGGTTT 1619
Query 1617 GGATAAGACAATGATTGGAGATTACCTTGGAGATCCTGATGAGTTACATCTCAGTGTTCT 1676
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1620 GGATAAGACAATGATTGGAGATTACCTTGGAGATCCTGATGAATTACATCTCAGTGTTCT 1679
Query 1677 TAAAAGCTTTACACATACGTTTGAGTTCACGGGTATGAATCTTGATACCGCATTGAGGAC 1736
|| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1680 TAGAAGCTTTACACATACATTTGAGTTCACTGGTATGAATCTTGATACCGCATTGAGGAC 1739
Query 1737 ATTTCTTGAGTCATTTCGGTTACCGGGAGAGTCGCAAAAGATCGAACGTATGATTGAAGC 1796
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1740 ATTTCTTGAGTCATTTCGGTTACCGGGAGAGTCTCAAAAGATCGAACGTATGATTGAAGC 1799
Query 1797 TTTCTCTGAAAGATTCTATGATCAACAATCATCTGATATTTTTGCAAGCAAAGATACTGT 1856
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1800 CTTCTCTGAGAGATTCTATGATCAACAATCATCTGATATTTTTGCAAGCAAAGATACTGT 1859
Query 1857 TCACATTTTGTGTTACTCGCTTATAATGCTCAACACGGATCAACATAACCCTCAGGTTAG 1916
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1860 TCACATTTTGTGTTACTCGCTTATAATGCTCAACACGGATCAACATAACCCTCAAGTTAG 1919
Query 1917 GAAGAAAATGACAGAAGATGAGTTTATCCGCAACAACCGAGCAATTAACGCGGGAAATGA 1976
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||
Sbjct 1920 GAGGAAAATGACAGAAGATGAGTTTATCCGCAACAACAGGGCAATTAACGCGGGAAATGA 1979
Query 1977 CCTTCCAAAGGAATACCTATCCGAGCTTTTTCAATCCATTGCAACAAATGCATTCGCTTT 2036
|||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1980 CCTTCCAAAGGAATACCTCTCTGAGCTTTTTCAGTCCATTGCAACAAATGCATTCGCTTT 2039
Query 2037 ATCGACACATTCAGGTCCTGTGGAAATGAATCCAAATAGATGGATTGAGCTGATGAACAG 2096
|||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2040 ATCGACACATTCCGGTCCGGTGGAAATGAATCCAAACAGATGGATTGAGCTAATGAACAG 2099
Query 2097 AACAAAGACGACACAACCTTTTAGTCTCTGCCAGTTCGATCGGCGAATAGGAAGGGATAT 2156
||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2100 AACAAAGACTACACAACCTTTTAGTTTATGTCAGTTTGATCGTAGAATAGGAAGGGATAT 2159
Query 2157 GTTTGCAACCATTGCAGGTCCATCAATAGCCGCTGTTTCTGCATTCTTTGAGCATTCAGA 2216
|||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2160 GTTTGCAACCATTGCAGGTCCATCAATAGCAGCAGTTTCTGCATTCTTTGAGCATTCAGA 2219
Query 2217 TGATGATGAAGTGCTTCATGAATGTGTGGATGCTATGATCTCTATAGCAAGAGTTGCTCA 2276
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2220 TGATGATGAAGTGCTTCATGAATGTGTTGATGCTATGATCTCTATAGCAAGAGTTGCTCA 2279
Query 2277 ATATGGCCTTGAAGACATTCTTGACGAGCTCATAGCTTCCTTTTGTAAATTCACAACGTT 2336
||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2280 GTATGGCCTTGAAGACATTCTTGATGAGCTCATTGCTTCCTTTTGTAAATTCACAACGTT 2339
Query 2337 GTTAAACCCTTACACTACACCCGAAGAGACTTTGTTCGCATTTAGTCACGATATGAAACC 2396
||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2340 GTTAAACCCTTACACTACACCTGAAGAGACTTTGTTTGCATTTAGTCACGATATGAAACC 2399
Query 2397 GCGAATGGCTACTCTCGCGGTTTTCACGCTCGCTAACAAC-TTTGGTGATTCTATTAGAG 2455
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||
Sbjct 2400 GCGAATGGCTACTCTCGCGGTTTTCACGCTCGCTAAC-ACATTTGGTGATTCTATCAGAG 2458
Query 2456 GAGGGTGGAGGAACATTGTGGATTGTCTCTTGAAACTTAGAAAGCTTCAGCTTCTTCCAC 2515
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2459 GAGGGTGGAGGAACATTGTGGATTGCCTCTTGAAACTTAGGAAGCTTCAGCTTCTTCCAC 2518
Query 2516 AGTCTGTTATTGAGTTTGAGATAACAAATGAGGAAAATAATGGCGGATCAGAATCCGACA 2575
|||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2519 AGTCTGTTATTGAGTTTGAGAT---AAATGA--AGAA-AATGGCGGATCAGAATCCGACA 2572
Query 2576 TGAACATTGTTTCAAACCAAGACACAAAATTTAACCGACGACAGGGTTCTAGTTTAATGG 2635
|||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||
Sbjct 2573 TGAACAATGTTTCGAGCCAGGACACAAAATTTAACCGACGACAAGGTTCTAGTCTAATGG 2632
Query 2636 GTCGGTTTTCACACTTCTTGGCATTAGACAGCGTGGAAGAGTCTCTGGCTCTTGGAATGA 2695
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||
Sbjct 2633 GTCGGTTTTCACACTTCTTGGCATTAGACAACGTGGAAGAATCTGTAGCTCTTGGAATGA 2692
Query 2696 GTGAGTTTGAACAAAACCTTAAAGTCATAAAACAATGCAGGATTGGTCAAATATTCAGCA 2755
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2693 GTGAGTTTGAACAAAACCTTAAAGTCATAAAACAATGCAGGATCGGTCAAATATTCAGCA 2752
Query 2756 AGAGCTCGGTGTTACCGGATGTTGCGGTGTTGAATCTAGGCCGGTCTTTAATCTATGCAG 2815
| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||
Sbjct 2753 AAAGCTCAGTGTTGCCGGATGTTGCGGTGTTGAATCTTGGTCGGTCTTTAATCTATGCAG 2812
Query 2816 CTGCTGGGAAAGGACAGAAGTTTAGTACAGCGATAGAAGAAGAAGAGACGGTCAAGTTCT 2875
||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |
Sbjct 2813 CTGCTGGGAAAGGACAGAAGTTTAGTACAGCTATCGAAGAAGAAGAGACGGTTAAGTTTT 2872
Query 2876 GCTGGGATTTGATCATAACCATTGCGTTATCTAACGTCCATCGGTTCAACATGTTCTGGC 2935
| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||
Sbjct 2873 GTTGGGATTTGATCATAACCATTGCATTATCTAACGTCCACCGGTTCAACATGTTTTGGC 2932
Query 2936 CAAGTTACCATGAATATCTACTCAATGTTGCAAACTTTCCGCTCTTTTCACCCATTCCGT 2995
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2933 CAAGTTACCATGAATATCTACTCAACGTTGCAAACTTTCCGCTCTTTTCACCCATTCCGT 2992
Query 2996 TTGTCGAAAAAGGGCTCCCGGGTTTATTTAGGGTATGCATCAAGATTCTTGCTTCTAACC 3055
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2993 TTGTCGAAAAAGGGCTCCCGGGTTTATTTAGGGTATGCATCAAGATTCTTGCTTCTAACC 3052
Query 3056 TTCAAGACCATCTACCAGAGGAGCTGATTTTTAGGTCCTTAACTATAATGTGGAAGATAG 3115
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||
Sbjct 3053 TTCAAGACCATCTACCAGAGGAGTTGATTTTTAGGTCCTTGACAATAATGTGGAAGATAG 3112
Query 3116 ATAAAGAAATCATCGAAACATGTTATGACACAATAACAGAGTTTGTCAGCAAGATCATTA 3175
| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3113 ACAAAGAAATCATTGAAACATGTTATGACACAATAACAGAGTTTGTCAGCAAGATCATTA 3172
Query 3176 CAGTGTACTCTGCAAATCTGCATACCAATATTGGGTGGAAAAGCGTTTTACAACTACTTT 3235
|| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3173 TAGACTACTCTGCGAATCTGCATACCAATATAGGGTGGAAAAGTGTTTTACAACTACTTT 3232
Query 3236 CTTTATGTGGAAGGCATCCAGAGACCAAAGAGCAAGCTGTGGATGCTCTCATCGGTTTAA 3295
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3233 CTTTATGTGGAAGACATCCAGAGACCAAAGAGCAAGCGGTGGATGCTCTCATCGGTTTAA 3292
Query 3296 TGTCGATA-AACGCATCGCATCTCTCGCAGTCAAGCTACGCTTATTGCATCGATTGCGCC 3354
|||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3293 TGTC-ATTTAACGCATCGCATCTATCGCAGTCAAGCTACGCTTATTGCATCGATTGCGCC 3351
Query 3355 TTCAGTTTTGTTGCTCTAAGAAATAGCTCTGTTGAGAAGAACTTGAAAATATTGGATCTC 3414
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3352 TTCAGTTTTGTTGCTTTAAGAAATAGCTCTGTTGAGAAGAACTTGAAAATATTGGATCTC 3411
Query 3415 ATGGCAGATTCAGTGACAATGCTAGTAAAATGGTACAAAACGGCCTCGACTGATACCGCG 3474
||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||
Sbjct 3412 ATGGCAGATTCAGTGACAATGTTGGTAAAATGGTACAAAACTGCCTCTACTGATACCGCG 3471
Query 3475 AATAGCTACAGCCCGGCAAGCAACACAAGCAGTTCATCTTCCATGGAAGAAAACAGCTTG 3534
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||
Sbjct 3472 AATAGCTATAGCCCGGCAAGCAACACAAGCAGTTCATCATCCATGGAAGAAAACAACTTG 3531
Query 3535 AGAGGGGTTAACTTTGTTCATCATCTTTTCCTCAAACTCTCAGAGGCTTTTCGAAAAACG 3594
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3532 AGAGGGGTTAACTTTGTTCATCATCTTTTCCTCAAACTCTCCGAGGCTTTTCGAAAAACG 3591
Query 3595 ACACTTGCACGACGAGAAGAAATAAGGAACAGAGCAGTGACGTCTTTGGAGAAAAGCTTC 3654
|| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||
Sbjct 3592 ACCCTTGCACGCCGAGAAGAGATAAGGAACAGAGCAGTGACGTCTCTAGAGAAAAGTTTC 3651
Query 3655 ACCATGGGTCATGAAGACCTTGGATTCACGCCATCGGGTTGTATATACTGCATCGACCAT 3714
||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3652 ACCATGGGTCATGAAGATCTTGGATTCACACCTTCTGGTTGTATATACTGCATAGACCAT 3711
Query 3715 GTCATATTCCCAACAATTGATGACTTGCATGAGAAGCTTCTAGACTATTCAAGGCGCGAA 3774
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3712 GTCATATTCCCAACAATCGATGACTTGCATGAGAAGCTTCTCGACTATTCAAGGCGCGAA 3771
Query 3775 AACGCGGAAAGAGAGATGAGAAGCATGGAGGGGACATTGAAGATAGCTATGAAAATGCTC 3834
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3772 AACGCGGAAAGAGAGATGAGAAGCATGGAGGGGACGTTGAAGATAGCTATGAAAGTGCTC 3831
Query 3835 ATGAACGTTTTCTTGGTTTACTTGCAACAGATTGTAGAAAGTGCTGAGTTTAGAACTTTT 3894
|||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3832 ATGAACGTTTTCTTGGTTTACTTGGAACAAATTGTAGAAAGTGCTGAGTTTAGAACTTTT 3891
Query 3895 TGGTTAGGAGTGTTGCGGAGAATGGATACGTGTATGAAGGCGGATTTGGGAGAGTATGGA 3954
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3892 TGGTTAGGAGTGTTGAGGAGAATGGATACGTGTATGAAGGCGGATTTGGGAGAGTATGGA 3951
Query 3955 GATAATAAACTTCAAGAGGTTGTGCCTGAACTTTTGACCACCATGATTGGTACCATGAAG 4014
||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3952 GATAACAAACTTCAAGAGGTTGTCCCTGAACTTTTGACCACCATGATTGGTACCATGAAG 4011
Query 4015 GAGAAAAAGATTTTGGTGCAGAAGGAAGACGATGACCTTTGGGAGATTACTTATATTCAG 4074
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 4012 GAGAAAGAGATTTTGGTGCAGAAGGAAGACGATGACCTTTGGGAGATTACGTATATTCAG 4071
Query 4075 ATTCAATGGATTGCCCCATCCCTCAAGGATGAGTTATTTCCTGATGAAGAGATTTAG 4131
|||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 4072 ATTCAATGGATTGCTCCAGCGCTCAAGGATGAGTTATTTCCCGATGAAGAGATTTAG 4128
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 205885134072
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5