BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg488877
Length=3906
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G19820.1 | Symbols: emb2734 | ARM repeat superfamily protein... 6276 0.0
> AT5G19820.1 | Symbols: emb2734 | ARM repeat superfamily protein
| chr5:6695224-6701311 REVERSE LENGTH=3922
Length=3922
Score = 6276 bits (3398), Expect = 0.0
Identities = 3756/3925 (96%), Gaps = 40/3925 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TAGCTTTAGCCACTTTTTAACCCTAGTTTTTCCCGCCGCCACCTTCCACCATGGCTTCCG 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||
Sbjct 15 TAGCTTTAGCCACTTTTTAACCCTAGTTTTTCCCGCCGCCACCATCCCCCATGGCTTCCG 74
Query 61 AGGCGAATCAGCTTCAACAAGCGCAACTCGCGATGGTTCTCGGCTCCGATTCGGCCCCCT 120
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||
Sbjct 75 AGGCGAATCAGCTTCAGCAAGCGCAACTCGCGATGGTTCTCGGCTCCGATTCCGCGCCCT 134
Query 121 TCGAGACGCTAATCTCTCACCTCATGTCTTCTTCCAACGAGCAACGTTCCTCCGCCGAGG 180
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 135 TCGAGACGCTAATCTCTCACCTCATGTCTTCTTCCAACGAGCAACGTTCCTCCGCCGAGT 194
Query 181 CTCTCTTCAATCTCGCTAAGCAAAGCAATCCCGATACCCTCGCTTTGAAGCTAGCTCATC 240
|||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||
Sbjct 195 CTCTTTTCAATCTCGCTAAACAAAGCAATCCCGATACCCTCTCTTTGAAGCTTGCTCATC 254
Query 241 TTCTTCAGCTTTCTCCTCATCCTGAAGGTCGTGCTATGGCCGCCGTCCTTCTCCGCAAGT 300
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 255 TTCTTCAGCTTTCTCCTCATCCCGAAGGTCGTGCTATGGCCGCCGTCCTTCTCCGGAAGT 314
Query 301 TGTTAACACGCGACGATGCTTATCTATGGCCTCGTCTCTCCCTCTCCACTCAATCTTCCC 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 315 TGTTAACACGCGACGATGCTTATCTATGGCCTCGTCTCTCCCTCTCCACTCAATCTTCCC 374
Query 361 TCAAATCTTCGATGTTGTCTTGTATTCAGCGTGAGGAGGCTAAATCGATCTCTAAGAAGA 420
|||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 375 TCAAATCTTCGATGTTGTATTGTATTCAACATGAGGAGGCTAAATCGATCTCTAAGAAGA 434
Query 421 TTTGCGATACAGTCTCTGAACTTGCATCGGGGATTTTGCCGGAGAATGGATGGCCGGAGT 480
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 435 TTTGCGATACAGTCTCTGAACTTGCATCCGGGATTTTACCGGAGAATGGATGGCCGGAGT 494
Query 481 TGCTTCCGTTTGTTTTCCAGTGTGTTTCTTCTGATT-CCCCTAAATTGCAGGAATCGGCG 539
|||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||
Sbjct 495 TGCTTCCGTTTGTTTTCCAGTGTGTTACTTCTG-TTACCCCTAAATTGCAGGAATCGGCG 553
Query 540 TTTTTAATCTTGGCGCAATTGTCGCAGTACGTTGGGGAAACTCTGACTCCTCACATCAAG 599
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||
Sbjct 554 TTTTTAATCTTGGCTCAATTGTCGCAGTACGTTGGGGAGACTCTTACCCCTCACATCAAG 613
Query 600 CTTCTCCATGGCGTGTTTCTCCAGTGCCTGAGTAGTAACTCTGCTAGCTCCGATGTTAAA 659
||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 614 GAACTCCATGGCGTGTTTCTTCAGTGCTTGAGTAGTAATTCTGCTAGCTCCGATGTTAAA 673
Query 660 ATCGCCGCTCTCAACGCTGTGATTAGTTTCGTTCAGTGTCTGTCGAACTCAACGGAGAGA 719
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||
Sbjct 674 ATCGCCGCTCTCAACGCCGTGATTAGTTTCGTTCAGTGTCTGGCCAACTCAACGGAGAGA 733
Query 720 GATAGATTCCAAGATGTTTTGCCTGCCATGATCAGGACGTTGACCGAATCTCTGAACAAC 779
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 734 GATAGATTCCAAGATGTTTTGCCTGCGATGATCAGGACGTTGACCGAATCTCTGAACAAT 793
Query 780 GGGAACGAAGCAACTGCACAGGAGGCTCTTGAGCTTTTGATTGAATTGGCTGGTACTGAG 839
||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 794 GGGAATGAAGCAACTGCACAGGAGGCACTTGAGCTTTTGATTGAATTGGCTGGTACCGAG 853
Query 840 CCACGGTTCCTTAGACGGCAGCTTCTTGACATAGTTGGTTCGATGCTTCAGATCGCAGAG 899
|||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 854 CCACGGTTCCTTAGACGGCAACTTGTTGACATAGTTGGTTCGATGCTTCAGATTGCAGAG 913
Query 900 GCTGATTCCTTGGAGGAAAGTACCCGTCATCTTGCGATTGAGTTTTTGGTTACTCTGGCC 959
||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 914 GCTGATTCCCTCGAGGAGAGTACACGTCATCTTGCGATTGAGTTTTTGGTTACTCTGGCT 973
Query 960 GAGGCGCGTGAGCGTGCCCCTGGTATGGTCAGGAAGCTCCCTCAGTTCATTGACAGGTTG 1019
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct 974 GAGGCGCGTGAGCGTGCCCCTGGTATGGTCAGGAAGCTTCCTCAGTTTATTGACAGGTTG 1033
Query 1020 TTTGCGGTTCTTATGAAGATGCTCGAGGATATTGAGGACGATCCTGCTTGGTACAGCGCT 1079
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1034 TTTGCTGTTCTTATGAAGATGCTCGAGGATATTGAGGACGATCCTGCTTGGTACAGCGCT 1093
Query 1080 GAGACTGAGGACGAAGATGCCGGCGAGACCAGTAACTACAGCATGGGTCAAGAGTGTTTG 1139
||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1094 GAGACTGAGGATGAAGATGCTGGCGAGACAAGCAACTACAGCATGGGTCAAGAGTGTTTG 1153
Query 1140 GATCGGTTAGCAATTTCTTTGGGAGGAAACACCATTGTTCCGGTTGCATATCAGCAGTTT 1199
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1154 GATCGGTTAGCAATTTCTCTGGGAGGAAACACCATTGTTCCGGTTGCATATCAGCAGTTT 1213
Query 1200 TCTGCTTACTTGGCTGCCTCTGAGTGGCAGAAACACCATGCTTCTTTGATTGCACTTGCT 1259
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1214 TCTGCTTACTTGGCTGCCTCTGAGTGGCAGAAACATCATGCTTCTTTGATTGCACTTGCT 1273
Query 1260 CAGATTGCTGAAGGTTGCTCAAAGGTGATGATAAAAAATCTAGACCAAGTGGTGTCCATG 1319
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1274 CAGATTGCTGAAGGTTGTTCAAAGGTGATGATAAAAAATCTAGACCAAGTGGTGTCAATG 1333
Query 1320 GTTTTGAGCCAGTTTCAAAGTCCTCATCCTCGTGTAAGGTGGGCTGCTATAAATGCAATT 1379
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1334 GTTTTGAGCCAGTTTCAAAGTCCTCATCCTCGCGTAAGGTGGGCTGCTATAAATGCGATT 1393
Query 1380 GGACAGTTGTCTACAGATTTGGGTCCAGATTTGCAAAACCAACATCATGAGAGAGTGCTC 1439
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1394 GGACAGTTGTCTACAGATTTGGGTCCAGATTTGCAAAACCAACATCATGAGAGAGTGCTC 1453
Query 1440 CCTGCACTTGCTGCCGCTATGGATGATTTCCAGAATCCACGAGTGCAGGCTCATGCTGCT 1499
|| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1454 CCCGCACTTGCTGCTGCTATGGATGATTTCCAGAATCCACGAGTGCAGGCTCATGCTGCT 1513
Query 1500 TCAGCAGTACTCAACTTCAGTGAAAATTGTACACCTGAAATATTGGCACCTTATTTAGAC 1559
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1514 TCAGCAGTACTCAACTTCAGTGAAAATTGTACTCCTGAAATATTGTCACCTTATTTAGAC 1573
Query 1560 GGAGTAGTGAGCAAGTTGCTTGTGCTACTACAAAATGGTAAACAAATGGTGCAAGAAGGA 1619
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1574 GGAGTAGTGAGCAAGTTACTTGTGCTACTACAAAATGGTAAACAAATGGTGCAAGAAGGA 1633
Query 1620 GCTTTAACTGCTCTTGCTTCAGTTGCTGATTCATCACAGGACCACTTTCAAAAGTACTAT 1679
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1634 GCTTTAACTGCTCTTGCTTCAGTGGCTGATTCATCACAGGAACACTTTCAAAAGTACTAT 1693
Query 1680 GATGCTGTCATGCCGTATCTCAAAACTATTTTGATGAATGCAACTGACAAGTCTAAGCGG 1739
||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1694 GATACTGTCATGCCTTATCTCAAAACTATTTTGATGAATGCAACTGACAAGTCTAAGCGG 1753
Query 1740 ATGCTTCGTGCCAAATCCATGGAGTGCATCAGTCTTGTTGGAATGGCAGTTGGAAAGGAC 1799
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1754 ATGCTTCGTGCCAAATCCATGGAGTGCATCAGTCTTGTTGGAATGGCAGTTGGAAAGGAC 1813
Query 1800 AGATTTAAGGATGATGCTAGGCAGGTCATGGAAGTGCTAATGTCATTGCAAGGGTCTCAG 1859
||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1814 AGATTCAAGGAAGATGCTAGACAGGTCATGGAAGTGCTAATGTCATTGCAAGGTTCTCAG 1873
Query 1860 ATGGAGGCAGACGATCCAATAACGAGTTACATGTTACAGGCATGGGCTAGGCTTTGCAAG 1919
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1874 ATGGAGGCAGACGATCCAATAACAAGTTACATGTTACAGGCATGGGCTAGGCTTTGCAAG 1933
Query 1920 TGTCTAGGTCAAGATTTCCTCCCATACATG-AGTGTTGTGATGCCTCCTTTGCTTCAGTC 1978
|||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1934 TGTCTAGGTCAAGATTTCCTCCCATACATGAAG-GTTGTGATGCCTCCTTTGCTTCAGTC 1992
Query 1979 AGCTCAACTTAAGCCAGATGTAACAATTACATCTGCTGATTCAGAAGATGAAGCAGAAGA 2038
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1993 AGCTCAACTTAAGCCAGATGTAACAATTACATCTGCTGATTCAGAAGATGAAGCAGAGGA 2052
Query 2039 TTCTGATGATGAAAGCATGGAGACCATTATCCTGGGAGACAAAAGAATAGGGATCAAAAC 2098
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2053 TTCTGATGATGAAAGCATGGAGACCATTATCCTGGGCGACAAAAGAATAGGGATCAAAAC 2112
Query 2099 AAGTGTTCTAGAGGAAAAGGCCACGGCTTGTAACATGCTTTGTTGCTATGCTGATGAGTT 2158
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2113 AAGTGTTCTAGAGGAAAAGGCCACGGCTTGTAACATGCTTTGTTGCTATGCTGATGAGTT 2172
Query 2159 AAAAGAAGGATTTTTTCCTTGGATTGATCAGGTTGCACCTACATTGGTTCCTCTACTGAA 2218
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2173 AAAAGAAGGATTTTTTCCTTGGATTGATCAGGTTGCACCTACATTGGTTCCTTTACTGAA 2232
Query 2219 ATTCTATTTTCACGAAGAAGTTAGAAGAGCAGCTGTTTCAGCCATGCCGGAACTAATGCG 2278
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2233 ATTCTATTTTCACGAAGAAGTTAGAAGAGCAGCTGTTTCAGCCATGCCGGAACTAATGCG 2292
Query 2279 CTCAGCCAAGCTGGCAATAGAGAAAGGGGAATCTCAAGGGCGCGATCTATCCTATTTGAA 2338
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||
Sbjct 2293 CTCAGCCAAGCTGGCAATAGAGAAAGGGGAATCTCAAGGGCGAGATCTATCATATTTGAA 2352
Query 2339 GCAGCTCTCTGACTACATTATTCCAGCCATGCTGGAAGCTTTGCATAAAGAACCTGATAC 2398
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2353 GCAGCTTTCTGACTACATTATTCCAGCCATGCTGGAAGCTTTGCATAAAGAACCTGATAC 2412
Query 2399 AGAGATCTGTGTGAGTATGTTGGAAGCTATCAATGAGTGCTTGCAGATCTCTGGAAATCT 2458
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2413 AGAGATCTGTGTGAGTATGTTGGAAGCTATCAATGAATGCTTGCAGATCTCTGGAAATCT 2472
Query 2459 TTTGGATGAAGGGAAAATTAGATCCATAGTTGATGAGATAAAGCAAGTTATGACCGCAAG 2518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2473 TTTGGATGAAGGGAAAATTAGATCCATAGTTGATGAGATAAAGCAAGTTATGACCGCAAG 2532
Query 2519 CTCTAGTAGGAAGCTAGAGAGGGGAGAGAGGGCCCATGCTGAAGACTTCGACGCTGAAGA 2578
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2533 CTCTAGTAGGAAGCGAGAGAGGGGAGAGAGGGCCCATGCTGAAGACTTTGACGCTGAAGA 2592
Query 2579 GAGAGAGCTTATTAAAGAGGAAAATGAGCAAGAGGAAGAAATTTTTGATCAAGTTGGTGA 2638
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2593 GGGAGAGCTTATTAAAGAGGAAAATGAGCAAGAGGAAGAAATTTTTGATCAAGTCGGTGA 2652
Query 2639 AATATTGGGAACACTGGTTAAGACATTCAAGGCCTCATTTCTGCCTTTCTTCGATGAATT 2698
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
Sbjct 2653 AATATTGGGAACATTGGTTAAGACATTCAAGGCCTCATTTCTACCTTTCTTCGATGAACT 2712
Query 2699 GTCCTCTTACTTAACTCCTATGTGGGGAAGGGATAAAACAGCGGAAGAGAGAAGGATTGC 2758
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2713 GTCCTCTTACTTAACTCCTATGTGGGGAAGAGATAAAACAGCGGAAGAGAGAAGGATTGC 2772
Query 2759 TATATGCATTTTTGATGATGTAGCAGAACAATGCCGTGATGCTGCCTTTAAATATTATGA 2818
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2773 TATATGCATTTTTGATGATGTAGCAGAACAATGCCGTGAAGCTGCCTTTAAATATTATGA 2832
Query 2819 TACCTATCTTCCATTTGTACTGGAAGCTTGCAATGACGAGAGTCCTGAAGTTCGACAGGC 2878
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||
Sbjct 2833 TACCTATCTTCCATTTGTACTGGAAGCTTGCAATGACGAGAGCCCAGAGGTTCGACAGGC 2892
Query 2879 TGCCGTTTATGGGCTTGGTGTTTGTGCTGAGTTTGGCGGATCTGTATTCAAGCCTCTTGT 2938
||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
Sbjct 2893 TGCTGTTTATGGGCTTGGCGTTTGTGCTGAGTTTGGCGGCTCTGTATTCAAGCCTCTTAT 2952
Query 2939 TGGAGAGGCTCTGTCAAGATTAAATGTTGTGATACAGCAGCCAAATGCTCGGCAATCTGA 2998
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2953 TGGAGAGGCTCTGTCAAGATTAAATGTTGTGATACAGCTGCCAAATGCTCGGCAATCTGA 3012
Query 2999 AAATGCCATGGCATATGATAATGCTGTATCCGCTGTGGGAAAGATCTGCCAATATCACCG 3058
|||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3013 AAATGCCATGGCATATGATAATGCTGTATCAGCCGTGGGAAAGATCTGCCAATTTCACCG 3072
Query 3059 TGATAGTATTGATTCTTCTCAGGTACTTCCTGCGTGGTTGAACTGTTTGCCTATAAGCAA 3118
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3073 TGATAGTATTGATTCTTCTCAGGTACTTCCTGCGTGGTTGAACTGTTTGCCTATAAGCAA 3132
Query 3119 TGATGTCATTGAAGCCAAAGTGGTTCATGAACAGCTCTGCTCAATGGTTGAGAGGCAAGA 3178
||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3133 TGATGTCCTTGAAGCCAAAGTGGTTCATGATCAGCTCTGCTCAATGGTTGAAAGGCAAGA 3192
Query 3179 TGTGGACCTTTTAGGCCCCAATAACCAGTATCTTCCGAAAATCTTAATAGTTTTTGCCGA 3238
||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3193 TGTAGACCTTTTAGGCCCCAATAACCAGCATCTTCCGAAAATCTTAATAGTTTTTGCCGA 3252
Query 3239 GGTGCTTACAGGGAAAGATGTGGTGACAGAAGAGACAGCAGGTCGTATGATAAATATATT 3298
||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3253 GGTACTTACAGGGAAAGATGTGGTGACACAAGAGACAGCAGGTCGTATGATAAATATATT 3312
Query 3299 AAGGCAACTTCAACAGACACTGCCACCATCGGCGTTGGCCTCAACATGGTCAACGCTGAA 3358
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3313 AAGGCAACTTCAACAGACACTGCCACCATCGGCGTTGGCCTCAACATGGTCAACGCTGAA 3372
Query 3359 ACCCGAACAGCAACTCGCTCTCCAATCCATGCTTTCCTCCTAAAATCACTCCAATCCG-T 3417
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |
Sbjct 3373 ACCCGAACAGCAGCTCGCTCTCCAATCCATGCTTTCCTCCTAAATTCAATCCAATCCGAT 3432
Query 3418 CTCTCTGTTTATTTT-ACAGTCTTGTGAGCTCTGTTTTCACCACCGAGCGTCGTCAGTTT 3476
||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3433 CTCTCTGTTTATTTTTACAGTTTTGTGAGCTCTGTTTTCACCACAAAGCGTCGTCAGTTT 3492
Query 3477 TGCATTTATGTGTTTACaaaaaaaTTTCTTCTT-TC--GCATTTTTCATCAAATTCTTTT 3533
||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||||
Sbjct 3493 TGCATTTATGTGTTTACAAAAGTGTTTCTTCTTCTTTTGCATTTTTCATCTAATTCTTTT 3552
Query 3534 GGGAGGGATGATGATGGGTCGGTCCGTCCTTCACAAGTTACAAAGTGAAAGTTTCTATCT 3593
||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||
Sbjct 3553 GGGAGGGATGATGATGGGTCGGTCCATCCTTCAGAAGTTACAAAATGAAAATTTCTATCT 3612
Query 3594 TTATGGTAGGAAGTGTATATTAGGAGGGAAGGATGAAATTGTTTGTGAAAAATGTGTCAT 3653
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||
Sbjct 3613 TTATGGTAGGAAGTGTATATTAGGAGGGAAGGATGAAATTGTTAGTGAAA--TGTGTCAT 3670
Query 3654 TGGGAAATTGGGTATGGTTCCCCAAATACACAGGTTTGGTGTTGGTGTTGGTGTTGGTGT 3713
|||| | |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |
Sbjct 3671 TGGG---T-----ATGGTTCCCCAAATACACAGGTCTGCTGTTGGTGTCGGTGTTGGT-T 3721
Query 3714 CGGTTTGGGTTTGAGAGAGGGATGAAGTTTTGGTGCTTTATACGAGAA--A-CA-----G 3765
| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || |
Sbjct 3722 ---T--GGGTTTGAGAGTGGGATGAAGTTTTGGTGCTTTATACGAGAAGGAACAAAACAG 3776
Query 3766 AAAgatttgattttgaattttttgtttttgtatgcaattgagaattttggatgaatgatt 3825
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||
Sbjct 3777 AAAGATTTGATTTTGAATTTTT-GTTTTTGTATGCAATTGGGAATTTTGGAAGAATGATT 3835
Query 3826 cttttCTCTCATTGCCATTGTTAATTTGTACACTCTTTTGGACACTCTT-T--GGCCTTT 3882
|||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||||
Sbjct 3836 CTTTTCTCTCATTGCCTTTGTTGATTTGTAC--TCTTTTGGACACTCTTCTTTGGCCTTT 3893
Query 3883 TCTTAATAAAAGAAATGt-tttttt 3906
|||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3894 TCTTAATAAAAGAAATGTCTTTTTT 3918
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 194597571897
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5