BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg488965
Length=3697
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G20610.1 | Symbols: | unknown protein; BEST Arabidopsis tha... 3110 0.0
> AT5G20610.1 | Symbols: | unknown protein; BEST Arabidopsis thaliana
protein match is: unknown protein (TAIR:AT5G26160.1);
Has 918 Blast hits to 759 proteins in 180 species: Archae
- 6; Bacteria - 105; Metazoa - 264; Fungi - 89; Plants - 167;
Viruses - 5; Other Eukaryotes - 282 (source: NCBI BLink).
| chr5:6968690-6972995 FORWARD LENGTH=3783
Length=3783
Score = 3110 bits (1684), Expect = 0.0
Identities = 1904/2011 (95%), Gaps = 11/2011 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCTCCACCATTTTTCTCTTCTTCCAAGCTTCGACGGAGACGACTTTTCTTTAGTCGCCAT 60
|||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 4 CCTCCACCATTTTTATCTTATTCCAAGCTTCCACAGAGACGACTTTTCTTTAGTCGCCCT 63
Query 61 TTCACTCCGGA-TTCTCAG-TACAGGATGAGTAAAGTTAACAGTGAGGAATCTTCGAGTA 118
||||| || || |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 64 TTCACGCC-GATTTCT-GGTTCCAGGATGAGTAAAGTTAACAGTGAGGAATCTTCTAGTA 121
Query 119 GCCAAAAATTGTTGAAGGAGGTTGAGACAATAGGCGAAGCTCTGTATGTGAACAAGAATC 178
||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 122 GCCAAAAATTGTTGAAGGAGGTTGAGAAAATAAGCGAAGCTCTGTATGTGAACAAGAATC 181
Query 179 CTAGGGGTTCGGTTGCTGGTCCTAATAAGACTCCAACAAAACCTTTGAGTCGAAGCAACT 238
|||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||
Sbjct 182 CTAGGGGTTCAGTTGCTGGTTCTAATAAGACTCCAACGAAACCATTGAGTCGTAGCAACT 241
Query 239 TGGCTGAGCCTCATAAGGAGAAGAAATCGTTTTGGAATTGGCCTCTCAGAGCCATTAATC 298
|||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 242 TGGCTGAG-C-C-TAAGGAGAAGAAATCGTTTTGGAATTGGCCTCTCAGAGCTATTAATC 298
Query 299 ATGTCAGAAACCGCCGATTCAATTGTTGTTTCTCTGCTCAAGTCCATTCCATTGAAGGGT 358
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
Sbjct 299 ATGTCAGAAACCGCCGATTCAATTGTTGTTTCTCTGCTCAAGTCCATTCCATCGAAGGAT 358
Query 359 TACCCCCGATATTCCAGGATCTTTCTCTCACTGTGCACTGGAAACGTCGTGATGAATCTT 418
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 359 TACCACCGATATTCCAGGATCTTTCTCTCACTGTGCACTGGAAACGTCGTGATGAATCTT 418
Query 419 TAAGCACTCGTCCTGCAAAAGTTTCCAATGGAAGAGCTGAATTTAAGGATAAGCTGACAC 478
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 419 TAAGCACTCGTCCTGCAAAAGTTTCTAATGGAAGAGCTGAATTTAAGGACAAGCTGACAC 478
Query 479 ATACATGCTCGGTATACGGAAGCAGAAGTGGACCACATCACTCAGCTAAGTATGAAGCTA 538
||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 479 ATACATGCTCGGTCTACGGAAGCAGAAGTGGACCGCATCACTCAGCTAAGTATGAAGCTA 538
Query 539 AGCATTTCTTGTTGTATGT-TGCTCAGGTTGGATCTCCTGAGATTGATCTAGGAAAACAT 597
||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||
Sbjct 539 AGCATTTCTTGCTGTATGTCT-CTCTGGTTGGATCTCCTGAGATTGATTTGGGAAAACAT 597
Query 598 CGAATGGATCTCACTAAATTGCTTCCTCTCACACTTGAGGAGTTGCAGGATGAGAAAAGC 657
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 598 CGAATGGATCTCACTAAATTGCTTCCTCTCACACTTGAGGAGTTGCAGGATGAGAAAAGC 657
Query 658 TCGGGTAAGTGGTCAACAACATTTCAGTTGACTGGAAAGGCTAATGGTGCTACTTTAAGC 717
|| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 658 TCTGGTAAGTGGTCAACGACATTTCAGTTGTCTGGAAAGGCTAATGGTGCTACTTTAAGC 717
Query 718 ATGAGTTTTGGGTACACTGTTGTTGGGGATACTCGTAATCCTGCTTCATCAGGTAGCACT 777
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 718 ATGAGTTTTGGGTACACTGTTGTTGGTGATACTCGTAATCCTGCTTCATCTGGTAGCACT 777
Query 778 CAGAATTTCCGCAGTTCTTCAAGTGTAAAACAAACTAGTAATAACACAGGGTTGACAAGA 837
||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 778 CAGAATTTCCGCAGTTCGTCAAATGTAAAACAAACTAGTAATAACACAGGGTTGACAAGA 837
Query 838 ACTATCAGTGCAAAGTCTAGTCTAGGGAATGGAAAGTCCACAG-CTCGGCGTTATGATCA 896
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||
Sbjct 838 GCTATCAGTGCAAAGTCTAGTCTAGGGAATGGAAAGTCCGC-GTCTCGGCGTTATGATCA 896
Query 897 CAGTATTGTTAACAAAGAATCGCATCCTTCGTCCCAGAATATGGAGGAAATTAAAGATCT 956
|||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 897 TAGTATTGTCAACAGAGAATCACATCCTTTGTCCCAGAATATGGAGGAAATTAAAGACCT 956
Query 957 TCATGAAATTTTGCCCGCTGCACAATCTGACCTGGGTAGTTCTGTAAACACTTTGTATCA 1016
||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 957 TCATGAAATTTTGCCTGCTGTACAATCTGACCTGGGTAGTTCTGTAAACACTTTGTATCA 1016
Query 1017 AAAATTTGATGAGGAGAAGGTGGATCCTGCAAATGAGTCTCAGTTCGAATTTGACGTTGT 1076
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1017 AAAATTTGATGAGGAGAAGGTGGATCCTGCAAATGAGTCTCAGTTCGAATTTGACGTTGT 1076
Query 1077 CACTAAATACATTGAACCTGTTGAGTCAATATCTCATGAAAAAGAAGATGCAAATGCACT 1136
||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1077 CACTAAACACATTGAACCTGTTGAGTCGATATCTCATGAAAAAGAAGATGCAAATGCACT 1136
Query 1137 TCAAAGCGAGTTGGGGACTGGGAATGAAACTGTTGTTCCTTTTGAGGAAATAAAAAACGC 1196
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1137 TCAAAGCGAGTTGGTAACTGGGAATGAAACTGTTGTTCCTTTTGAGGAAATAAAAAAAGC 1196
Query 1197 TGGCGAAGTTCCTACTGCTGGAAGTGATGAAGTTGGTACAGAAAATTTTCCTTCAGAAGA 1256
||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||
Sbjct 1197 TGGTGAAGTTCCTACTGCTGGAAGTGACGAAGTTGGTGCAGAAAATTTCCCTTTAGAAGA 1256
Query 1257 GCCCTTGGTAAACGGCAATGAAACTGATGTTCCTTTTGAAGTATTGAAGAAAGCTGGTGA 1316
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||
Sbjct 1257 GCCCTTGGTAAACGGTAATGAAACTGATGTTCCTTTTGAACTATTAAAGAAAGCTGGTGA 1316
Query 1317 AGTTCCTACGGCTGGAAGGGACGAAGTTGGTACAGAAATTTTGCCTTCAGAAGAGCCCTC 1376
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1317 AGTTCCTACTGCTGGAAGGGACGAAGTTGGTACAGAAATTTTGCCTCCAGAAGAGCCCTT 1376
Query 1377 GGTAAATGGGAATGAAACTGATGTTCCTTTTGAGGAATTAATGATTGTTAGTGAAGCTAC 1436
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||
Sbjct 1377 GGTAAATGGGAATGAAACTGATGTTCCTTTTGAGGAATTAATGATTACTGGCGAAGCTAG 1436
Query 1437 TATTGATAGAAGTGAGGAAGCTGTTGAGATTGGTACAGAAAAGTTGGCTCCAGAAGAGGG 1496
||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1437 TATTGCTAGAAGTGAGGAAGCTGTTGAGATTGTTACAGAAGAGTTGGCTCCAGAAGAGGG 1496
Query 1497 GAACAAAGTTTCTCCAAAGGACGAGGAAAGTGTTGTTCCTCAAGATGCAGAAGAGGTAAT 1556
|||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||
Sbjct 1497 AAACAAAATTTCTCCGAAGAACGAGGAAAGTGTTGTTCCTAAAGATGCTGAAGAGGTAAT 1556
Query 1557 GAACGGTGAGAGAGACTTGAAAGAAATGATAATGAAAGATCTTGAATCAGCTTTGAAAAG 1616
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1557 GAACGGTGAGAAAGACTTGAAAGAAATGATAATGAAAGATCTTGAATCAGCTTTGAAAAG 1616
Query 1617 TGTAGAAATGTTGGAAACAACTGCGTCAGAAGACGAGGAAGATCGAGAAAACCATGGAGA 1676
|||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||
Sbjct 1617 TGTAGAAATGTTGGAAGCTACTGCGTCAGAAGACGAGGAAGATCGAAAAAAGCATGGAGA 1676
Query 1677 CGAAGATAAATGTTTTATAACACCAATGAAGGAAGCAGCACCATCATGTTCGAGAGATGT 1736
| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1677 CAAAGATAAATATTTTATAACACCAATGAAGGAAACAGTGCCATCATGTTCGAGAGATGT 1736
Query 1737 GGCTGAATCTGTGGCAAGTGAGTTCTTAGACATGCTAGGTATTGAACACAGCCCTTTTGG 1796
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1737 GGCTGAATCTGTGGCATGTGAGTTCTTAGACATGCTAGGTATTGAACACAGCCCTTTTGG 1796
Query 1797 TCTAAGTTCTGAGAGTGAACCTGAGTCCCCAAGGGAGCGCTTGTTAAGAGAGTTTGAAAT 1856
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1797 TCTAAGTTCTGAGAGTGAACCTGAATCCCCAAGGGAGCGCCTGTTAAGAGAGTTTGAAAT 1856
Query 1857 GGAAACCCTAGCGGCAGGTTCTTTGTTTGACTTTAGTATTGAAGGTGATGATCCCCAAAT 1916
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1857 GGAAACTCTAGCGGCAGGTTCTTTGTTTGACTTTAGTATTGAAGGTGATGATCCCCAATT 1916
Query 1917 GGAATGTGATGAAAACTTTTCTAACGAGTATGAGTCGGATTTTGAAGAAGATTTCGATCT 1976
||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||
Sbjct 1917 GGAATGTGATGAAAACTTTCCGAACGAGTATGAGTCGGATTTTGAAGAAGGTTTTGATCT 1976
Query 1977 GGCATCCCTCGTTCATGATATAGAAGAAGAG 2007
||||||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct 1977 GGCATCCCTTGTTCATGACATAGAAGAAGAG 2007
Score = 2728 bits (1477), Expect = 0.0
Identities = 1642/1718 (96%), Gaps = 25/1718 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 2001 AGAAGAGCTTGGAAACAGAATCT-TGATGCGTGAGTGGGGTATGAATGAAAACACATTTC 2059
||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2058 AGAAG-GCTTGGAAACAGAATCTCTGATGCGTGAGTGGGGTATGAATGAAAACACATTTC 2116
Query 2060 AAAACTCTCCGCCTCACAATGGTCGTGATGCATTTCATCCAGCTGATTTTCCAGTGAAGG 2119
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2117 AAAACTCTCCGCCTCACAATGGTCGTGATGCGTTTCATCCAGCTGATTTTCCAGTGAAGG 2176
Query 2120 AGCCATTTGATTTGCCTCCTCTTGGAGATGGCTTGGGTCCAGTTGTGCAGACAAAGAATG 2179
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2177 AGCCATTTGATTTGCCTCCTCTTGGAGATGGCTTGGGTCCAGTTGTGCAGACAAAGAATG 2236
Query 2180 GAGGGTTCTTGCGGTCAATGAATCCCTTACTGTTCAGGAACTCTAAAGCTGGAGGCAGCT 2239
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2237 GAGGGTTCTTGCGATCAATGAATCCCTTACTGTTCAGGAACTCTAAAGCTGGAGGCAGCT 2296
Query 2240 TGATCATGCAAGTGTCAAATCCAGTGGTGGTGCCTGCTGAGATGGGCTCTGGTATCATGG 2299
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2297 TGATCATGCAAGTGTCAACTCCAGTGGTGGTGCCTGCTGAGATGGGCTCTGGTATCATGG 2356
Query 2300 AGATACTTCAGAAACTAGCCACTGCTGGAATTGAGAAGCTCTCGATGCAGGCAAATAAAG 2359
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2357 AGATACTTCAAAAACTAGCCACTGCTGGAATTGAGAAGCTCTCGATGCAGGCAAATAAAG 2416
Query 2360 TAATGCCTTTGGATGATGTAACAGGGAAAACCATGGAAGAGGTGTTGTGGGAAACTTCAC 2419
||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2417 TAATGCCTTTGGACGATATAACAGGGAAAACCATGGAAGAGGTGTTGTGGGAAACTTCAC 2476
Query 2420 CTACAATTGACGGTGGGGACAGGGATCATGTATCAGTGCATGAATCTGATGATGCAGCTG 2479
||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||
Sbjct 2477 CTACAATTGACATTGGGGACAGGGATCATGTATCAGAGCGTGAATCTGGTGATGCATCTG 2536
Query 2480 GTTTTGTGAGGGGAGCTGAAAGACGAACATCATTTGCAGCTAAGCCAAAAAAGTTTGGTT 2539
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2537 GTTTTGTGAGGGGAGGTGAAAGACGAACATCATTTGCAGCTAAGCCAAAAAAGTTTGGTT 2596
Query 2540 CAAGCTCTGGTAACAATACCTTTGACTCGGAGTATGTATCACTTGAAGATCTTGCTCCTT 2599
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2597 CAAGCTCTGGTAACAATAACTTTGACTCGGAGTATGTATCACTTGAAGATCTTGCTCCTT 2656
Query 2600 TGGCTATGGATCAGATTGAAGCACTTTCTTTGGAAGGATTGAGAATACAATCAGGAATGT 2659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2657 TGGCTATGGATCAGATTGAAGCACTTTCTTTGGAAGGATTGAGAATACAATCAGGAATGT 2716
Query 2660 CAGATGAGGATGCACCCTCGGACATCACTGCACAATCTATTGGAGATATCTCAGCCTTCC 2719
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2717 CAGATGAGGATGCACCCTCGGACATCACTGCACAATCTATTGGAGATATCTCAGCCTTTC 2776
Query 2720 AGGGGAAAAGCGGGTGTGTTGGTCTAGAAGGTGCCGCCGGGTTACAACTTCTGGACATAA 2779
| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2777 AAGGGAAAAGCGGGTGCGTTGGTCTAGAAGGTGCTGCCGGTTTACAACTTCTGGACATAA 2836
Query 2780 AAgatgatggggacgatgatgatgatgatgGTTTAATGGGACTCTCCTTGACGCTTGATG 2839
||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2837 AAGATGATGGGGACGATGATGATGATG--G-TTTAATGGGACTCTCCTTGACTCTTGATG 2893
Query 2840 AGTGGATGAAGTTAGATTCAGGGGACATTGGCGATGAAGACGAAATAAATGAGCGAACTT 2899
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2894 AGTGGATGAAGTTAGATTCAGGGGACATTGGCGATGAAGACGAAATAAATGAGCGAACTT 2953
Query 2900 CAAAAATTTTGGCTGCCCATCATGCGAACCCGCTAAACTTTATCCGTaaaggatcaaaag 2959
|||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2954 CAAAAATTCTGGCTGCCCATCATGCAAACCCACTAAACTTTATCCGTAAAGGATCAAAAG 3013
Query 2960 gggagaaaagaaagggaaaaaaaggaaggaaaTGTGGTTTACTGGGGAATACCTTCACCG 3019
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3014 GGGAGAAAAGAAAGGGAAAAAAAGGAAGGAAATGCGGTTTACTGGGTAATACCTTCACCG 3073
Query 3020 TAGCACTAATGGTGCAACTTCGAGATCCTCTAAGGAACTACGAGCCAGTAGGAGCTCCTA 3079
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3074 TAGCACTAATGGTGCAACTTCGAGATCCACTAAGGAACTACGAACCAGTAGGAGCTCCTA 3133
Query 3080 TGCTTTCTCTTATCCAAGTTGAGAGATTGTTCGTCCCTCCAAAGCCCAAAATCTACAGCA 3139
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3134 TGCTTTCTCTTATCCAAGTTGAGAGATTGTTCGTCCCTCCAAAGCCCAAAATCTACAGCA 3193
Query 3140 CAGTTTCAGAGCTGAGGAAAACCGATGAAGAGGAGAAAGCTGAGGTGAGTGATGCAAAGA 3199
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||
Sbjct 3194 CAGTTTCAGAGCTGAAGAAAACCGATGAAGAGGAGGAAGCGGACGCGAGTGATGCAAAGA 3253
Query 3200 AAGAAGAGAAACCCATGGAGGAACAAGGAATCCCTCAGTACAAAATCTCAGAGGTACATC 3259
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3254 AAGAAGAGAAACCCATGGAGGAACAAGGAATACCTCAGTACAAAATCACAGAGGTACATC 3313
Query 3260 TTACCGGTATGAAGAGCGAGACCGATAAGAAACCATGGGGAATCACGACTCAGCAGCAGC 3319
|||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3314 TTACCGGTATGAAGAGCGAGACAGATAAGAAGCCATGGGGAATCACGACTCAGCAGCAGC 3373
Query 3320 AGGTGCAATCTGGTTCAAGATGGTTGATGGCTAACGGAATGGGGAAAGGGAACAACAAGC 3379
||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3374 AGGTGCAGTCTGGTTCAAGGTGGTTGATGGCTAACGGAATGGGAAAAGGGAACAACAAGC 3433
Query 3380 TTCCTCTTATGAAACCAAAATTGGGTTTGACAAAGCCTGGTGATAAGTTGTGGAGTGTCT 3439
||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3434 TTCCTCTTATGAAACCAAAATTGGGTTCGGCAAAGCCTGGTGACAAGTTGTGGAGTGTCT 3493
Query 3440 CTGGTTCTGGGTCTAAATGGAAAGAGCTTGGGAAAATGGGAAAGTTGAACACACACGTTC 3499
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||
Sbjct 3494 CTGGTTCTGGGTCTAAATGGAAAGAGCTTGGGAAAATGGGAAAGTCGAACACACACATTC 3553
Query 3500 GAAATCCGAATGTGATAATGCCAAAATGAAACTGAAGAAGTAGCATGTGTCTGCTCTATA 3559
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3554 GAAATCCGAATGTAATAATGCCAAAATGAAACTGAAGCAGTAGCATGTGTCTGCTCTGTA 3613
Query 3560 TTTTTGATGCTAAGTAAAGTTAATGTTATGTGGTG------A--G-----A--TTCACTT 3604
||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||
Sbjct 3614 TTTTTGATGCTAAGTAAAGTTAATGTTATGTGGTGTGGTGGATTGTGTGTAGATTCACTT 3673
Query 3605 CAAATGGTGCATGTGTTTTATATTGTGT----AGTTT-AGGTTTTGCGTATCAAACTAAT 3659
|||||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||
Sbjct 3674 CAAATGTTGCATGTGGTTTATATTGTGTTTGCAGTTTTAGGTTTTGCGGATCAAACTAAT 3733
Query 3660 CGCTGTTTGTGGTACAGTTAAAAGATCAATGGAACAAA 3697
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3734 CGCTGTTTGTGGTACAGTTAAGAGATCAATGGAACAAA 3771
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 184112680810
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5