BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg489106
Length=1603
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G22480.1 | Symbols: | ZPR1 zinc-finger domain protein | chr... 2545 0.0
AT5G37340.2 | Symbols: | ZPR1 zinc-finger domain protein | chr... 1943 0.0
> AT5G22480.1 | Symbols: | ZPR1 zinc-finger domain protein | chr5:7451505-7456685
REVERSE LENGTH=1795
Length=1795
Score = 2545 bits (1378), Expect = 0.0
Identities = 1498/1557 (96%), Gaps = 3/1557 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4 TGCATCTTCTGGGAATCA-CTGACTTTGCACTTAATCGGAATTT-TCGGGATTGTTTGGA 61
|||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||| |||| | |||||||||||||
Sbjct 102 TGCATCTTCTTGGAATCAGCTGACTTTGCGGTCAATCGG-ATTTCTTGGGATTGTTTGGA 160
Query 62 GAAACTTTGGAGATGATGGACAACGGAAATGATCAACAAATTGATGTTAGATCAGTTGTT 121
|||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||
Sbjct 161 GAAACTTTGGAGGTGATGGACAACAAAAATGATCAGGATATTGATGTTAGATCAGTGGTT 220
Query 122 GAAGCTGTTTCCGCCGATCTTTCCTTCGGTGCTCCCCTCTATGTGGTTGAAAGCATGTGC 181
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 221 GAAGCTGTTTCCGCCGATCTTTCCTTTGGTGCTCCCCTCTATGTGGTTGAGAGCATGTGC 280
Query 182 ATGCGCTGCGAAGAAAATGGAACAACCAGATTTCTATTGACCTTAATTCCTCACTTCAGA 241
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 281 ATGCGCTGCCAAGAAAATGGAACAACCAGATTTCTATTGACCTTAATTCCTCACTTCAGA 340
Query 242 AAGGTCTTAATATCTGCATTTGAATGTCCACATTGCGGAGAAAGGAATAATGAAGTTCAA 301
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 341 AAGGTCTTAATATCTGCATTTGAATGTCCGCATTGCGGGGAAAGGAATAATGAAGTTCAG 400
Query 302 TTTGCGGGCGAGATCCAACCCCGAGGATGCTGTTACAATCTAGATGTTCTAGCTGGTGAT 361
|| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 401 TTCGCAGGCGAGATTCAACCCCGTGGATGCTGTTACAATCTAGAGGTTCTAGCTGGTGAT 460
Query 362 GTGAAGATATTTGACCGACAAGTTGTGAAATCTGAATCAGCCACTATTAAGATTCCTGAA 421
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 461 GTGAAGATATTTGACCGGCAAGTTGTGAAATCTGAATCAGCCACTATTAAGATTCCTGAA 520
Query 422 CTGGATTTTGAGATTCCACCAGAGGCCCAACGTGGAAGTTTGTCTACTGTGGAAGGGATA 481
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 521 CTGGATTTTGAGATTCCACCAGAGGCCCAACGTGGAAGTTTGTCTACTGTGGAAGGGATA 580
Query 482 TTAGCACGGGCTGCCGATGAACTGAGTGCCCTTCAAGAAGAACGCAAGAAAGTTGATCCT 541
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 581 TTAGCACGGGCTGCTGATGAACTGAGTGCCCTTCAAGAAGAACGCAAGAAAGTTGATCCT 640
Query 542 AAAACTGCTGAAGCAATAGACCAATTCTTGTCCAAACTGAGAGCTTGTGCTAAAGCAGAG 601
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 641 AAAACTGCTGAAGCAATAGACCAATTCTTGTCCAAACTGAGAGCTTGTGCTAAAGCAGAG 700
Query 602 ATATCCTTCACCTTCATTTTGGATGATCCTGCTGGAAACAGTTTCATTGAAAACCCACAT 661
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 701 ACATCCTTCACCTTCATTTTGGATGATCCTGCTGGAAACAGTTTCATTGAGAACCCACAT 760
Query 662 GCTCCATCACCAGATCCCTCTTTAACCATCAAATTCTATGAGCGGACACCAGAGCAACAA 721
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 761 GCTCCATCACCAGATCCCTCTCTAACCATCAAATTCTATGAGCGAACACCAGAGCAACAA 820
Query 722 GCAACACTTGGGTATGTTGCTAACCCATCTCAGGCTGGACAATCAGAAGGAAGCCTTGGC 781
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 821 GCAACACTTGGATATGTTGCTAACCCATCTCAGGCTGGACAATCAGAAGGAAGCCTTGGC 880
Query 782 GCACCTTCTGCTAAAACAGCTTATGTACCTAATGGAACAATCGGAGCAACTGCTGGTCAT 841
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 881 GCACCTTCTACTAAAACAGCTTATGTACCTAATGGAACAATCGGAGCAACTGCTGGTCAT 940
Query 842 CGTGCGATTGCTCAGAGTAATAGCACTGATATTTCTGACAACTTGTTCAGATACTCTGCG 901
|| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 941 CGCGCGATTGCTCAGAGTAATAGCACTGATATTTCCGACAACTTGTTCAGATACTCTGCG 1000
Query 902 CCTGAAGAGGTGATGACTTTCCCTTCAACTTGCGGAGCATGTACGGAGCCGTGTGAGACA 961
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1001 CCTGAAGAGGTGATGACTTTCCCTTCAACTTGCGGAGCATGTACGGAGCCGTGTGAGACA 1060
Query 962 CGGATGTTCGTGACTAAAATCCCGTACTTTCAGGAAGTTATTGTCATGGCATCTACATGT 1021
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1061 CGGATGTTCGTGACTAAAATCCCGTACTTTCAGGAAGTTATTGTCATGGCATCTACATGT 1120
Query 1022 GACAGTTGTGGCTATCGTAATTCTGAGTTGAAGCCTGGTGGTGCAATTCCTGAGAAGGGA 1081
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1121 GACAGTTGTGGCTATCGTAATTCTGAGTTGAAGCCTGGTGGTGCAATTCCTGAAAAGGGA 1180
Query 1082 AAGAAAATTACTCTCTCTGTGAGGAACATTACTGACCTTAGCCGAGATGTTATCAAGTCG 1141
||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1181 AAGAAGATTACTCTCTCTGTGAGGAACATTACAGACCTTAGCCGAGATGTTATCAAGTCG 1240
Query 1142 GACACTGCAGGAGTGATAATCCCAGAACTTGATCTGGAGCTAGCTGGTGGTACACTTGGT 1201
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1241 GACACTGCAGGAGTGATAATCCCAGAACTTGATCTGGAGCTAGCTGGTGGTACACTTGGT 1300
Query 1202 GGAATGGTAACAACAGTGGAAGGGTTGGTCACACAGATCAGAGAAAGCCTAGCGAGAGTT 1261
||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1301 GGAATGGTAACAACAGTTGAAGGGTTGGTTACACAGATCAGAGAAAGCCTAGCGAGAGTT 1360
Query 1262 CACGGATTCACTTTTGGTGATAGTCTGGAAGAGAGTAAGAAGAACAAGTGGAGAGAATTT 1321
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||
Sbjct 1361 CACGGATTCACTTTTGGTGATAGTATGGAAGAGAGTAAGTTGAACAAATGGAGAGAATTT 1420
Query 1322 GGAGCCAGGCTCACTAAGCTCCTAAGCTTAGAACAGCCATGGACTTTGATTCTTGACGAC 1381
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||
Sbjct 1421 GGAGCCAGGCTCACTAAGCTCCTAAGCTTTGAACAGCCGTGGACATTGATTCTTGATGAT 1480
Query 1382 GAGTTAGCAAATTCCTTTATTGCGCCAGTAACAGATGATATCAAAGACGATCATCAGCTC 1441
|| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||
Sbjct 1481 GAATTAGCAAATTCCTTTATTGCACCAGTAACAGATGATATCAAAGATGACCATCAGCTC 1540
Query 1442 ACATATGAAGAGTACGAGAGGTCATGGGATCAAAACGAGGAGTTGGGTCTCAACGACATA 1501
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1541 ACATTTGAAGAGTACGAGAGGTCATGGGATCAAAACGAGGAGTTGGGTCTCAACGACATA 1600
Query 1502 GACACTTCTTCAGCCGATGCCGCTTATGAATCCACAGAGACAACTAAATTACCTTAA 1558
|| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1601 GATACTTCTTCAGCTGATGCTGCTTATGAATCCACAGAGACGACTAAATTACCTTAA 1657
> AT5G37340.2 | Symbols: | ZPR1 zinc-finger domain protein | chr5:14787264-14792771
REVERSE LENGTH=1807
Length=1807
Score = 1943 bits (1052), Expect = 0.0
Identities = 1375/1530 (90%), Gaps = 26/1530 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 50 GGATTGTTTGGAGAAA-CTTTGGAGATGATGGACAACGGAAATGATCAACAAATTGATGT 108
|||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||
Sbjct 59 GGATTGTTTGGAGAAATTTTTGGAGGTGATGGACAACGGGAATGATCAACAAATCGATGT 118
Query 109 TAGATCAGTTGTTGAAGCTGTTTCCGCCGATCTTTCCTTCGGTGCTCCCCTCTATGTGGT 168
| | || || |||||||| ||||| || |||| |||||| |||||||| |||||||| ||
Sbjct 119 TGGCTCGGTAGTTGAAGCAGTTTCGGCTGATCATTCCTTTGGTGCTCCTCTCTATGTAGT 178
Query 169 TGAAAGCATGTGCATGCGCTGCGAAGAAAATGGAACAACCAGATTTCTATTGACCTTAAT 228
||| || ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 179 TGAGAGTATGTGTATGCGCTGCGGTGAAAATGGAACAACTAGATTTCTATTGACCTTAAT 238
Query 229 TCCTCACTTCAGAAAGGTCTTAATATCTGCATTTGAATGTCCACATTGCGGAGAAAGGAA 288
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 239 ACCTCACTTCAGAAAGGTCTTAATATCTGCATTTGAATGTCCGCATTGCGGAGAAAGGAA 298
Query 289 TAATGAAGTTCAATTTGCGGGCGAGATCCAACCCCGAGGATGCTGTTACAATCTAGATG- 347
|||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| |
Sbjct 299 TAATGAAGTTCAGTTTGCTGGCGAGATTCAACCCCGAGGATGCTCTTACCATCTAGAGGT 358
Query 348 TTCTAGCTGGTGATGTGAAGATATTTGACCGACAAGTTGTGAAATCTGAATCAGCCACTA 407
||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 359 TTC-AGCTGGTGATGTGAAGACATTTGACCGGCAAGTTGTAAAATCTGAATCAGCCACTA 417
Query 408 TTAAGATTCCTGAACTGGATTTTGAGATTCCACCAGAGGCCCAACGTGGAAGTTTGTCTA 467
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||
Sbjct 418 TTAAGATTCCTGAACTGGATTTTGAGATTCCACCAGAGGCCCAAAGTGGTAGTTTATCTA 477
Query 468 CTGTGGAAGGGATATTAGC-ACGGGCTGCCGATGAACTGAGTGCCCTTCAAGAAGAACGC 526
| |||||||||||| || | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 478 CGGTGGAAGGGATACTATCCA-GGGCTGCTGATGAACTGAGTGCCCTTCAAGAAGAACGC 536
Query 527 AAGAAAGTTGATCCTAAAACTGCTGAAGCAATAGACCAATTCTTGTCCAAACTGAGAGCT 586
| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 537 AGGAAAGTGGATCCTAAAACAGCTGAAGCAATAGACCAATTCTTGTCTAAACTGAGAGCT 596
Query 587 TGTGCTAAAGCAGAGATATCCTTCACCTTCATTTTGGATGATCCTGCTGGAAACAGTTTC 646
|||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 597 TGTGCTAAAGCAGAGACATCATTCACCTTCATTTTGGATGATCCTGCTGGAAACAGTTTC 656
Query 647 ATTGAAAACCCACATGCTCCATCACCAGATCCCTCTTTAACCATCAAATTCTATGAGCGG 706
||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||
Sbjct 657 ATTGAGAACCCACATGCTCCATCATTAGATCCCTCACTAACGATCAAGTTCTATGAGCGT 716
Query 707 ACACCAGAGCAACAAGCAACACTTGGGTATGTTGCTAACCCATCTCAGGCTGGACAATCA 766
||||| || ||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||| ||||||| |||
Sbjct 717 ACACCCGAACAACAAGCAACTCTTGGATATCTTACTAACCCATCTCAGACTGGACAGTCA 776
Query 767 GAAGGAAGCCTTGGCGCACCTTCTGCTAAAACAGCTTATGTACCTAATGGAACAATCGGA 826
||| ||||||| || |||||||| || ||||| || | ||||| ||||||| ||||||
Sbjct 777 GAAAGAAGCCTGGGAACACCTTCTACTCAAACAACTGCTCTACCTCATGGAACTATCGGA 836
Query 827 GCAACTGCTGGTCATCGTGCGATTGCTCAGAGTAATAGCACTGATATTTCTGACAACTTG 886
||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||
Sbjct 837 GCAACAGCTGGTCATCGGGCTATTGCGCAGAGTAATAGCACTGATATTTCAGATAACTTG 896
Query 887 TTCAGATACTCTGCGCCTGAAGAGGTGATGACTTTCCCTTCAACTTGCGGAGCATGTACG 946
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 897 TTTAGATACTCTGCGCCTGAAGAGGTGATGACTTTCCCTTCAACTTGCGGAGCATGTACA 956
Query 947 GAGCCGTGTGAGACACGGATGTTCGT-----G-A--CT---AAAA-TCCCGTA-CT-TTC 992
||| ||||||||||||||||||||| | | || |||| || ||| | |||
Sbjct 957 AAGCTGTGTGAGACACGGATGTTCGTTACTAGTATTCTTTCAAAACTCT-GTAGCCGTTC 1015
Query 993 A--GGAAGTTATTGTCATGGCATCTACATGTGAC-AGTTGTGGCTATCGTAATTCTGAGT 1049
||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1016 CTTGGAGGTTATCGTCATGGCATCTACATGTGATGA-TTGTGGCTATCGGAATTCTGAGT 1074
Query 1050 TGAAGCCTGGTGGTGCAATTCCTGAGAAGGGAAAGAAAATTACTCTCTCTGTGAGGAACA 1109
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||
Sbjct 1075 TGAAGCCTGGTGGTGCAATTCCTGAAAAGGGAAAGAAAATTACGCTCTCTGTGAAGAACA 1134
Query 1110 TTACTGACCTTAGCCGAGATGTTATCAAGTCGGACACTGCAGGAGTGATAATCCCAGAAC 1169
| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1135 TAACTGACCTTAGCCGCGATGTTATCAAGTCAGACACTGCAGGAGTGAAAATCCCAGAAC 1194
Query 1170 TTGATCTGGAGCTAGCTGGTGGTACACTTGGTGGAATGGTAACAACAGTGGAAGGGTTGG 1229
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1195 TTGATTTGGAGCTAGCTGGTGGTACACTTGGTGGAATGGTAACAACAGTGGAAGGGTTGG 1254
Query 1230 TCACACAGATCAGAGAAAGCCTAGCGAGAGTTCACGGATTCACTTTTGGTGATAGTCTGG 1289
|||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||
Sbjct 1255 TCACACAGATCAGAGAAAGCTTAGCGAGAGTCCATGGATTCACTTTTGGTGACAGTTTGG 1314
Query 1290 AAG-AGAGTAAGAAGAACAAGTGGAGAGAATTTGGAGCCAGGCTCACTAAGCTCCTAAGC 1348
| | ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| || |||||||| ||||||
Sbjct 1315 A-GCAGAGTAAGATTAACAAGTGGAAAGAATTTGGATCCAGACTAACTAAGCTTCTAAGC 1373
Query 1349 TTAGAACAGCCATGGACTTTGATTCTTGACGACGAGTTAGCAAATTCCTTTATTGCGCCA 1408
||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| | |||
Sbjct 1374 TTAGAACAGGAATGGACATTGATTCTTGATGACGAATTAGCGAATTCTTTTATTTCACCA 1433
Query 1409 GTAACAGATGATATCAAAGACGATCATCAGCTCACATATGAAGAGTACGAGAGGTCATGG 1468
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1434 GTAACAGATGATATCAAAGATGATCATCAGCTCACATTTGAAGAGTACGAGAGATCATGG 1493
Query 1469 GATCAAAACGAGGAGTTGGGTCTCAACGACATAGACACTTCTTCAGCCGATGCCGCTTAT 1528
|| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||
Sbjct 1494 GAGCAAAACGAGGAGTTGGGTCTCAACGACATTGATACTTCTTCAGCTGATGCTGCTTAT 1553
Query 1529 GAATCCACAGAGACAACTAAATTACCTTAA 1558
|| ||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1554 GAGTCCACAGAGCCAACTAAATTACCTTAA 1583
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 79166259465
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5