BLASTN 2.2.26+


Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.



Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
           33,602 sequences; 51,074,197 total letters



Query= Ahg489124

Length=3553
                                                                      Score     E
Sequences producing significant alignments:                          (Bits)  Value

  AT5G22750.1 | Symbols: RAD5, RAD5A | DNA/RNA helicase protein |...  5446    0.0  


> AT5G22750.1 | Symbols: RAD5, RAD5A | DNA/RNA helicase protein 
| chr5:7565037-7571083 REVERSE LENGTH=3639
Length=3639

 Score = 5446 bits (2949),  Expect = 0.0
 Identities = 3321/3497 (95%), Gaps = 40/3497 (1%)
 Strand=Plus/Plus

Query  89    TCTTTAGCCACAATTTCTTTGAAATTTCTAG-AAAGTTTCGAGATTTCCCCCT-G-AAAT  145
             |||||||||||||  ||  |||| |||| || |||||||| | ||||  |||| | ||||
Sbjct  135   TCTTTAGCCACAAGCTCACTGAATTTTC-AGTAAAGTTTCAAAATTT--CCCTGGAAAAT  191

Query  146   TGTAGGATTAGGGTTTT-GAAATGGGAACAAAAGTCTCAGACGATCTTGTTTCCACCGTC  204
             ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  192   TGTAGGATTAGGGTTTTGGAAATGGGAACGAAAGTCTCAGACGATCTTGTTTCCACCGTC  251

Query  205   AGATCAGTCGTGGGTTCCGATTACTCAGACATGGATATAATCAGGGCTTTACACATGTCG  264
             ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct  252   AGATCAGTCGTGGGTTCCGATTACTCAGATATGGATATAATCAGGGCTTTACACATGGCG  311

Query  265   AACCGTGATCCAACGGCTGCTATCAATATAATCTTCGATACTCCAAGTTTCGGCAAACCT  324
             || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||
Sbjct  312   AATCATGATCCAACGGCTGCTATCAATATAATCTTCGACACTCCAAGTTTCGCCAAACCT  371

Query  325   GATGTAGCAACTCCTACCCCGAGCGGCTCTAATGGAGGGAAGAGAGTGGAGAATCGAATA  384
             |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | | || ||
Sbjct  372   GATGTAGCCACTCCTACCCCGAGCGGCTCTAATGGAGGGAAGCGAGTTGATAGTGGATTA  431

Query  385   AAGGGCTGTTCTTTTGGTGACAGCGCAAGTGTTGGAGTGACTCATCTCGTGGAGGAAGAA  444
             ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||
Sbjct  432   AAGGGCTGTACTTTTGGTGACAGCGGAAGTGTTGGAGCGAATCATCGCGTGGAGGAAGAA  491

Query  445   GACGAGAGTGTTAATGGTGGAGGAGAAGAGAGTGTTTCAGGGAATGAGTGGTGGTTTGTG  504
              | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct  492   AATGAGAGTGTTAATGGTGGAGGAGAAGAGAGTGTTTCAGGGAATGAGTGGTGGTTTGTT  551

Query  505   GGTTGTTCTGAATTGGCGGGGTTATCGACATGTAAAGGAAGGAAATTGATGTCCGGTGAC  564
             ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| 
Sbjct  552   GGTTGTTCTGAATTGGCTGGGTTATCGACATGTAAAGGAAGGAAATTGAAGTCTGGTGAT  611

Query  565   GAATTGGTGTTTACGTTTCCGCATTGTAAAGGATTAAAGCCTGAGACTACGCCTGGGAAG  624
             ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  612   GAATTGGTGTTCACGTTTCCGCATAGTAAAGGATTAAAGCCTGAGACTACGCCTGGGAAG  671

Query  625   CGCGGGTTTGGACGGGGGAGGCCAGCTTTGCGTGGTGCTTCTGATATCGTCAGGTTCTCT  684
             ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct  672   CGCGGTTTTGGGCGGGGAAGGCCAGCTTTGCGTGGTGCTTCTGATATCGTTAGGTTCTCT  731

Query  685   ACAAAGGATTCAGGAGAGATTGGTAGAATACCAAACGAGTGGGCTCGGTGTCTTCTACCG  744
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct  732   ACAAAGGATTCAGGAGAGATTGGTAGAATACCAAACGAGTGGGCTCGGTGTCTTCTACCA  791

Query  745   CTTGTGAGAGACAAGAAAATTAAGATAGAAGGGAGTTGCAAGTCGGCACCTGAAGCATTG  804
             |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct  792   CTTGTGAGAGACAAGAAAATTAGGATAGAAGGCAGTTGCAAGTCGGCGCCTGAAGCTTTG  851

Query  805   AGCATCATGGACACAATTCTTCTTTCTGTACGCGTGTACATTAATAGTTCCATGTTTCAA  864
             ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  852   AGCATCATGGATACAATTCTTCTGTCTGTAAGCGTGTACATTAATAGTTCCATGTTTCAA  911

Query  865   AAGCATAGTGCGACTTCATTTAAGACAGCCAGTAATACAGCAGAGGAATCAATGTTCCAT  924
             ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct  912   AAGCATAGTGCGACTTCATTTAAGACAGCTAGTAATACGGCAGAGGAATCAATGTTCCAT  971

Query  925   CCTCTCCCAAATCTCTTTCGGTTACTCGGTTTGATCCCCTTTAAGAAGGCAGAGTTTACT  984
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  972   CCTCTCCCAAATCTCTTTCGGTTACTCGGTTTGATCCCCTTTAAGAAGGCAGAGTTTACT  1031

Query  985   CCAGAGGATTTGTCCTCTAAGAAGCGACCTTTTAGTTCCAAGGATGGTTCTGCTATTCCT  1044
             ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1032  CCAGAGGATTTTTACTCTAAGAAGCGACCTTTGAGTTCCAAGGATGGTTCTGCTATTCCT  1091

Query  1045  ACTTCGTTGCTTCAGCTAAACAAGGTCAATAATATGAATCAAGATGCAAACGGAGATGAA  1104
             ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1092  ACTTCGTTGCTTCAATTAAACAAGGTCAAGAATATGAATCAAGATGCAAACGGAGATGAA  1151

Query  1105  AATGAGCAGTGTATCAGTGATGGTGATCTTGATAACATTGTTGGTGTTGGGGACAGTTCT  1164
             ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1152  AATGAGCAGTGTATCAGCGATGGTGATCTTGATAACATTGTTGGTGTTGGGGACAGTTCT  1211

Query  1165  GGATTAAAGGAAATGGAAACTCCACATAAACTTCTGTGTGAGCTTCGTCCATACCAAAAG  1224
             |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1212  GGATTAAAGGAAATGGAAACTCCACATACACTTCTGTGTGAGCTTCGTCCATACCAAAAG  1271

Query  1225  CAGGCACTTCATTGGATGACCCAACTGGAGAAAGGAAATTGCACTGATGAAGCAGCAACA  1284
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct  1272  CAGGCACTTCATTGGATGACCCAACTGGAGAAAGGAAATTGCACTGATGAGGCAGCAACA  1331

Query  1285  ATGCTTCACCCATGTTGGGAAGCATACTGTTTAGCAGACAAGAGGGAACTTGTTGTCTAC  1344
             ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct  1332  ATGCTTCACCCGTGTTGGGAAGCATACTGTTTAGCAGACAAGAGGGAACTGGTTGTCTAC  1391

Query  1345  CTGAATTCTTTTACCGGTGATGCTACAATACACTTCCCTAGCACACTTCAAATGGCAAGA  1404
             |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1392  CTGAATTCTTTTACTGGTGATGCTACAATACACTTCCCTAGCACACTTCAAATGGCAAGA  1451

Query  1405  GGAGGAATTTTAGCAGACGCAATGGGTCTCGGAAAGACCGTAATGACCATATCCCTTTTA  1464
             |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| 
Sbjct  1452  GGAGGAATATTAGCAGACGCAATGGGTCTTGGAAAGACTGTAATGACCATATCCCTTTTG  1511

Query  1465  ATTGCCCATTCTTGGAAAGCTGCATCAACTGGGTTTCTATGCCCCAACTATGAAGGAGAC  1524
              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1512  CTTGCCCATTCTTGGAAAGCTGCATCAACTGGGTTTCTATGCCCCAACTATGAAGGAGAC  1571

Query  1525  AAAGTGATCAGCAGTTCTGTAGATGGGCTCACTAGTCCCCCAGTGAAGGCAACCAAGTTT  1584
             |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||
Sbjct  1572  AAAGTGATCAGCAGTTCTGTAGATGATCTCACTAGTCCCCCGGTGAAGGCAACCAAATTT  1631

Query  1585  CCAGGCTTTGATAAGAAGCTTCTTGAACAAAAATGTGTACATGAAAATGGTGGTAACCTG  1644
             | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||
Sbjct  1632  CTAGGCTTTGATAAGAGGCTTCTTGAACAAAAAAGTGTACTTCAAAATGGTGGTAACCTG  1691

Query  1645  ATTGTATGTCCGATGACACTTTTAGGACAGTGGAAGTCAGAGATTGAAATGCATGCAAAG  1704
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct  1692  ATTGTATGTCCGATGACACTTTTAGGACAGTGGAAGACAGAGATTGAAATGCATGCAAAG  1751

Query  1705  CCTGGGTCTCTATCTGTCTATGTTCACTATGGGCAGAGCAGGCCAAAGGATGCAAAACTT  1764
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||
Sbjct  1752  CCTGGGTCTCTATCTGTCTATGTTCACTATGGGCAAAGCAGGCCGAAGGATGCAAAACTT  1811

Query  1765  CTTTCCCAGAATGATGTGGTAATCACCACTTATGGAGTTCTAACATCCGAATTTTCGCAA  1824
             |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct  1812  CTTTCCCAGAGTGATGTGGTAATCACCACATATGGAGTTCTAACATCCGAATTCTCGCAA  1871

Query  1825  GAGAATTCAGCAGACCATGAAGGACTTTATGCAGTTCGATGGTTTAGGATTGTTCTTGAC  1884
             ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1872  GAGAACTCAGCAGACCATGAAGGAATTTATGCAGTTCGATGGTTTAGGATTGTTCTTGAC  1931

Query  1885  GAGGCACATACCATCAAAAACTCAAAAAGCCAAATTTCCTTGGCTGCTGCAGCTCTGGTT  1944
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1932  GAGGCACATACCATCAAAAACTCAAAAAGCCAAATTTCCTTGGCTGCTGCAGCTCTGGTT  1991

Query  1945  GCTGATCGGCGGTGGTGTCTTACGGGTACTCCTATTCAGAATAATCTGGAGGATTTATAC  2004
             |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  1992  GCTGATAGGCGTTGGTGTCTTACGGGTACTCCTATTCAGAACAATCTGGAGGATTTATAC  2051

Query  2005  AGCCTTCTACGGTTTTTGAGGATTGAACCATGGGGAACTTGGGCATGGTGGAATAAACTT  2064
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2052  AGCCTTCTACGGTTTTTGAGGATTGAACCATGGGGAACTTGGGCATGGTGGAATAAACTT  2111

Query  2065  GTCCAAAAGCCATTTGAAGAGGGTGATGAGAGAGGGCTAAAGCTAGTGCAGTCTATCTTA  2124
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct  2112  GTCCAAAAGCCATTTGAAGAGGGTGATGAGAGAGGGTTAAAGCTAGTGCAGTCTATCTTA  2171

Query  2125  AAACCTATCATGCTTAGGAGAACCAAGTCTAGCACAGACCGAGAAGGAAGGCCGATTCTT  2184
             ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2172  AAACCTATCATGCTTAGGAGAACAAAGTCTAGCACAGACCGAGAAGGAAGGCCGATTCTT  2231

Query  2185  GTTCTACCCCCTGCTGATGCACGGGTCATTTACTGTGAACTCTCAGAATCTGAAAGGGAT  2244
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||
Sbjct  2232  GTTCTACCCCCTGCTGATGCACGGGTCATTTACTGTGAACTTTCGGAGTCTGAGAGGGAT  2291

Query  2245  TTCTATGATGCGTTGTTTAAAAGATCCAAGGTCAAATTTGATCAATTTGTTGAACAAGGC  2304
             ||||| || ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2292  TTCTACGACGCGCTATTTAAAAGATCCAAGGTCAAATTTGATCAATTTGTTGAACAAGGC  2351

Query  2305  AAAGTTCTTCATAATTATGCTTCAATCCTGGAATTGCTTTTGCGTCTTCGACAATGTTGT  2364
             |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2352  AAAGTTCTTCATAACTATGCTTCGATCCTGGAACTGCTTTTGCGTCTTCGACAATGTTGT  2411

Query  2365  GATCACCCATTTTTAGTAATGAGTCGAGGTGATACAGCGGAATACTCTGATCTGAATAAG  2424
             ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2412  GATCACCCATTTTTAGTAATGAGTCGAGGGGATACAGCGGAATACTCTGATCTGAATAAG  2471

Query  2425  CTCTCTAAACGTTTCCTTAGTGGAAAGTCTTCTGGCTTAGAAAGGGAAGGAAAAGATGTA  2484
             || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2472  CTTTCTAAACGTTTCCTTAGTGGAAAGTCTTCTGGCTTAGAAAGGGAAGGAAAAGATGTA  2531

Query  2485  CCATCAGAGGCTTTTGTTCAGGAGGTGGTAGAGGAACTACGCAAAGGAGAGCAAGGAGAG  2544
             || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct  2532  CCGTCAGAGGCTTTTGTTCAGGAGGTGGTAGAGGAACTGCGCAAAGGAGAGCAAGGAGAG  2591

Query  2545  TGTCCAATATGCCTTGAAGCATTTGAGGATGCCGTATTAACGCCATGTGCTCATAGATTA  2604
             ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2592  TGTCCAATATGCCTTGAAGCACTTGAGGATGCTGTATTAACGCCATGTGCTCATAGATTA  2651

Query  2605  TGTCGTGAGTGTCTCTTGGCAAGTTGGAGAAATTCTAATACTGGATTATGTCCTGTGTGT  2664
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||
Sbjct  2652  TGTCGTGAGTGTCTCTTGGCAAGTTGGAGAAATTCTACTTCTGGGTTATGTCCTGTGTGT  2711

Query  2665  AGGAAAACTGTAAGCAAACAAGAACTTATCACAGCACCAACCGAAAGTAGATTCCAGGTT  2724
             ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2712  AGGAACACTGTAAGCAAACAAGAACTCATCACAGCACCAACCGAAAGTAGATTCCAGGTT  2771

Query  2725  GATGTGGAAAAGAATTGGGTGGAATCATCCAAAATAACTGCTCTTCTAGAGGAGCTTGAA  2784
             || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||
Sbjct  2772  GACGTGGAAAAGAATTGGGTGGAATCATCGAAAATCACTGCTCTTCTGGAAGAGCTTGAA  2831

Query  2785  GGTCTTCGTTCTTCAGGCTCTAAGAGCATTCTCTTTAGCCAGTGGACCGCTTTCCTCGAT  2844
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2832  GGTCTTCGTTCTTCAGGCTCTAAGAGCATTCTCTTTAGCCAGTGGACCGCTTTCCTCGAT  2891

Query  2845  CTCCTCCAAATTCCCCTCTCTCGGAATAACTTTTCATTTGTCCGTCTTGATGGCACGCTA  2904
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2892  CTCCTCCAAATTCCCCTCTCTCGGAATAACTTTTCATTTGTCCGTCTTGATGGCACGCTA  2951

Query  2905  AATCAGCAGCAGCGAGAGAAGGTCCTTAAAGAATTTTCCGAAGATGGCAGTATCCTGGTA  2964
             | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2952  AGTCAGCAGCAACGAGAGAAGGTCCTTAAAGAATTTTCCGAAGATGGCAGTATCCTGGTA  3011

Query  2965  CTGTTGATGTCTCTAAAAGCTGGTGGCGTCGGGATAAATCTAACAGCTGCGTCCAATGCT  3024
             ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3012  CTGTTGATGTCTCTAAAAGCTGGTGGCGTTGGGATAAATCTAACAGCTGCGTCCAATGCT  3071

Query  3025  TTTGTCATGGATCCATGGTGGAACCCAGCGGTAGAGGAACAAGCTGTTATGCGTATTCAT  3084
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3072  TTTGTCATGGATCCATGGTGGAACCCAGCGGTAGAGGAACAAGCTGTTATGCGTATTCAT  3131

Query  3085  CGTATAGGGCAAACTAAGGAAGTCAAAATCAGAAGATTCATCGTTAAGGGAACGGTTGAG  3144
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct  3132  CGTATAGGGCAAACTAAGGAAGTCAAAATCAGAAGATTCATCGTTAAGGGAACGGTTGAA  3191

Query  3145  GAGAGAATGGAGGCGGTTCAGGCGAGGAAGCAGAGAATGATCTCTGGGGCTTTAACCGAT  3204
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3192  GAGAGAATGGAGGCGGTTCAGGCGAGGAAGCAGAGAATGATCTCTGGGGCTTTAACCGAT  3251

Query  3205  CAAGAAGTACGAAGTGCACGTATAGAGGAACTCAAGATGTTATTTACCTGAAACTATAGA  3264
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3252  CAAGAAGTACGAAGTGCACGTATAGAGGAACTCAAGATGTTATTTACCTGAAACTATAGA  3311

Query  3265  AACTGTTTTCAAGCCTGAAGTCTATCATACAATGCTA--TCTATGTGAAACTTGTCACAT  3322
             ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||  | |||| ||||||||||||| 
Sbjct  3312  AACTGTTCTCAAGCCTGAAGTCGATCATACAATTCTACATATATGGGAAACTTGTCACAC  3371

Query  3323  TATATGCAAAGAGAATCAGAGATTATAACGTATATCTGAAAACGGGTTTTGTTCTTTTCA  3382
             ||||||||| |||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||
Sbjct  3372  TATATGCAAGGAGAATCAGAGATTATAACGCAT--CTAAAAACGGGTTTTGTTCTTTTCA  3429

Query  3383  AGAAATATGATGTACAACTGTCACAG--------A--G---AGT-----T-CCCTAGTGT  3423
             ||| |||||||| |||| ||||||||        |  |   |||     | ||| |||||
Sbjct  3430  AGAGATATGATGGACAATTGTCACAGTTTTGGGGAATGTGCAGTGAGAGTTCCCAAGTGT  3489

Query  3424  ACCATAAACCTATCTGGGTTTTGTTGTTTTGTAACTGAGGA-TCAG-TTGTTTTTTGTAC  3481
             ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | | |||| |||||||||||||
Sbjct  3490  ACCATAAGCCTATCTGGGTTTTGTTGTTTTGTAA-TG-GAAATCAGATTGTTTTTTGTAC  3547

Query  3482  TTATTTCATTTAG--TGAACTGTAACTTTATA-T-T-ATATAGTTAACTCAATATGACAA  3536
             || |||||||||   ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||
Sbjct  3548  TT-TTTCATTTATAATGAACTGTAACTTTATACTATTATATAGTTAACTCAATATGACAA  3606

Query  3537  ATCTGCACAGTGAAAAG  3553
             || ||||||||||||||
Sbjct  3607  ATTTGCACAGTGAAAAG  3623


 Score =  141 bits (76),  Expect = 5e-32
 Identities = 94/102 (92%), Gaps = 3/102 (3%)
 Strand=Plus/Plus

Query  1    GGGAATTTGAGAGACTCGTCGCTAATTTACGCGCGTTTCTCGGTTCCGGCAGATTTCGTA  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct  1    GGGAATTTGAGAGACTCGTCGCTAATTTACGCGCGTTTCTCGGGTCCGGCAGATTTCGTA  60

Query  61   CGCCGTCGTCG---ATCTGCTTCAATTTCTATCTTTAGCCAC  99
            |||||||||||   |||| |||||||||||||  || |||||
Sbjct  61   CGCCGTCGTCGTCGATCTACTTCAATTTCTATAATTCGCCAC  102



Lambda     K      H
    1.33    0.621     1.12 

Gapped
Lambda     K      H
    1.28    0.460    0.850 

Effective search space used: 176888641018


  Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
    Posted date:  Sep 25, 2014  6:13 PM
  Number of letters in database: 51,074,197
  Number of sequences in database:  33,602



Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5