BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg489126
Length=3370
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G22780.1 | Symbols: | Adaptor protein complex AP-2, alpha s... 5251 0.0
AT5G22770.1 | Symbols: alpha-ADR | alpha-adaptin | chr5:7579544... 5155 0.0
> AT5G22780.1 | Symbols: | Adaptor protein complex AP-2, alpha
subunit | chr5:7589854-7598049 REVERSE LENGTH=3509
Length=3509
Score = 5251 bits (2843), Expect = 0.0
Identities = 3045/3142 (97%), Gaps = 15/3142 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 42 TTAGATCCGGTTTCGCCAGTTTGGATCTGCGCCGTGTGAGGCGGCGGAGGACGGTGGATC 101
|||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 144 TTAGATCCGGTTTCGCGAGTTCGGATCTGCGCCGTGTGAGGCGGTGGAGGACGGTGGATC 203
Query 102 TGAGGA-TTTGGTTCCACCATGACCGGAATGAGAGGTCTCTCCGTATTTATCAGCGACGT 160
|||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 204 TGAGGACTCT-GTTCCACCATGACCGGAATGAGAGGTCTCTCCGTATTTATCAGCGACGT 262
Query 161 TCGTAATTGCCAGAACAAGGAAGCGGAGAGACTCCGAGTTGATAAGGAGCTTGGAAACAT 220
||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 263 TCGTAATTGTCAGAACAAGGAAGCGGAGAGACTACGAGTTGATAAGGAGCTCGGAAACAT 322
Query 221 ACGTACATGCTTCAAGAATGACAAGGTTTTGACACCATATAAAAAGAAGAAATATGTCTG 280
|||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 323 TCGTACATGCTTCAAGAATGAGAAGGTCTTAACACCATACAAAAAGAAGAAATATGTCTG 382
Query 281 GAAAATGCTTTATATACATATGCTAGGCTACGATGTGGATTTTGGCCATATGGAGGCGGT 340
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 383 GAAAATGCTTTATATACATATGCTAGGCTACGATGTGGATTTTGGCCATATGGAGGCAGT 442
Query 341 TTCTCTTATATCTGCGCCAAAGTATCCAGAAAAGCAGGTTGGCTACATTGTTACATCTTG 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 443 TTCTCTTATATCTGCGCCAAAGTATCCAGAAAAGCAGGTTGGCTACATTGTTACATCTTG 502
Query 401 CTTGCTCAATGAGAACCATGACTTTTTGAAGTTGGCAATAAATACAGTGCGGAACGATAT 460
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 503 CTTGCTCAATGAGAACCATGACTTTTTGAAGTTGGCTATAAATACAGTGCGGAACGATAT 562
Query 461 TATTGGTCGGAATGAGACTTTCCAATGCCTAGCACTGACCTTGGTAGGAAATATTGGTGG 520
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 563 TATTGGTCGGAATGAGACTTTCCAATGCTTAGCACTGACCTTGGTTGGAAATATTGGTGG 622
Query 521 AAGAGATTTTGCTGAATCATTGGCACCTGATGTTCAAAAGCTACTTATTTCTAGTAGTTG 580
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 623 AAGAGATTTTGCTGAATCATTGGCACCTGATGTTCAAAAGCTACTTATTTCTAGTAGTTG 682
Query 581 CAGACCTCTCGTAAGGAAAAAAGCGGCACTGTGCCTACTGCGCTTATTCCGAAAAAATCC 640
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 683 CAGACCTCTCGTAAGGAAAAAAGCGGCACTGTGCCTACTGCGCTTATTCCGAAAAAATCC 742
Query 641 GGATGCTGTCAACGTTGATGGCTGGGCGGATCGTATGGCACAACTTTTGGATGAACGAGA 700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 743 GGATGCTGTCAACGTTGATGGCTGGGCGGATCGTATGGCACAACTTTTGGATGAACGAGA 802
Query 701 TCTTGGTGTCTTGACGTCTTCTACGAGTCTTCTTGTAGCTCTGGTATCTAATAATCATGA 760
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 803 TCTTGGTGTCTTGACGTCTTCTACGAGTCTTCTTGTAGCTCTGGTATCTAACAATCATGA 862
Query 761 GGCGTACTCAAGTTGTCTACCTAAATGTGTCAAAATATTAGAACGCCTTGCTAGGAACCA 820
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 863 GGCGTACTCAAGTTGTCTACCTAAATGTGTCAAAATATTAGAACGCCTTGCTAGGAACCA 922
Query 821 GGATGTTCCTCAGGAGTACACATACTATGGCATCCCATCACCTTGGCTCCAGGTTAAGGC 880
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 923 GGATGTTCCTCAGGAGTACACATACTATGGCATCCCATCTCCTTGGCTCCAGGTTAAGGC 982
Query 881 AATGAGGGCTCTTCAATATTTTCCAACCATTGAAGATCCCAGTACCAGAAAAGCTCTCTT 940
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 983 AATGAGGGCTCTTCAATATTTTCCAACCATTGAAGATCCCAGTACCAGAAAAGCTCTCTT 1042
Query 941 TGAGGTCCTTCAGCGAATATTGATGGGGACAGATGTTGTGAAAAATGTGAATAAAAACAA 1000
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1043 TGAGGTCCTTCAGCGAATATTGATGGGCACAGATGTTGTGAAAAATGTGAATAAAAACAA 1102
Query 1001 TGCGTCTCATGCTGTGCTGTTTGAAGCTCTATCCCTGGTCATGCATCTTGATGCTGAGAA 1060
|||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1103 TGCGTCTCATGCCGTGCTGTTTGAAGCTCTCTCCCTGGTCATGCATCTTGATGCTGAGAA 1162
Query 1061 GGAAATGATGTCACAGTGTGTTGCTCTTCTTGGCAAGTTTATTTCTGTCCGTGAGCCCAA 1120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1163 GGAAATGATGTCACAGTGTGTTGCTCTTCTTGGCAAGTTTATTTCTGTCCGTGAGCCCAA 1222
Query 1121 CATCAGATATCTGGGCTTGGAAAATATGACACGAATGCTGATGGTCACAGATGTTCAAGA 1180
|||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1223 CATCAGATATCTAGGCTTGGAAAATATGACGCGAATGCTGATGGTCACAGATGTTCAAGA 1282
Query 1181 TATCATAAAGAAGCATCAGTCTCAGATAATCACCTCCTTGAAAGACCCTGACATCAGTAT 1240
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1283 TATCATAAAGAAGCATCAGTCTCAGATAATCACCTCGTTGAAAGACCCTGACATCAGTAT 1342
Query 1241 TCGTAGACGTGCTCTTGATTTGCTATATGGGATGTGCGATGTGTCAAATGCAAAGGATAT 1300
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1343 TCGTAGACGCGCTCTTGATTTGCTATATGGGATGTGCGATGTGTCAAATGCAAAGGATAT 1402
Query 1301 AGTCGAAGAGTTGTTGCAGTATCTTAGCACAGCGGAATTTTCCATGCGGGAGGAATTATC 1360
||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1403 AGTTGAAGAGTTGTTGCAGTATCTTAGCACAGCAGAATTTTCTATGCGGGAGGAATTATC 1462
Query 1361 ACTTAAAGCTGCAATTCTTGCTGAGAAGTTTGCTCCTGATCTATCATGGTATGTAGATGT 1420
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1463 ACTTAAAGCTGCTATTCTTGCTGAGAAGTTTGCTCCTGATCTTTCATGGTATGTAGATGT 1522
Query 1421 GATCCTTCAGTTAATCGACAAGGCTGGGGATTTTGTTAGCGACGACATTTGGTTTCGTGT 1480
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1523 GATCCTTCAGTTGATCGACAAGGCTGGGGATTTTGTTAGCGATGACATTTGGTTTCGTGT 1582
Query 1481 GGTTCAGTTTGTAACAAATAATGAAGACCTCCAGCCTTATGCCGCATCAAAAGCAAGAGA 1540
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1583 GGTTCAGTTTGTAACAAATAATGAAGACCTGCAGCCTTATGCGGCATCAAAAGCAAGAGA 1642
Query 1541 ATATTTGGACAAAATTGCAATACATGAGACCATGGTGAAGGTCAGTGCTTATATTTTGGG 1600
|||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1643 ATATATGGACAAAATTGCAATCCATGAGACCATGGTGAAGGTCAGTGCTTATATTTTGGG 1702
Query 1601 GGAGTATGGTCACCTTCTAGCTCGACAACCTGGATGCAGTGCAAGTGAACTCTTTAGCAT 1660
|||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 GGAGTATGGTCACCTTTTAGCTAGACAACCTGGATGCAGTGCAAGTGAACTCTTTAGCAT 1762
Query 1661 CTTACATGAGAAGCTTCCCACAGTATCGACTCCCACCATTCCTATACTTCTTTCCACATA 1720
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||
Sbjct 1763 CTTACATGAGAAGCTTCCTACAGTATCGACTCCCACCATTCCTATTCTTCTTTCTACATA 1822
Query 1721 TGCAAAGCTTCTTATGCACACTCAACCCCCGGATCCAGAACTGCaaaaaaaaaTTTGGGC 1780
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1823 TGCAAAGCTTCTTATGCACGCTCAACCCCCGGATCCAGAACTGCAAAAAAAAGTTTGGGC 1882
Query 1781 TGTATTTCAGAAGTATGAGAGTTGTATTGATGTGGAGATACAACAGAGGGCAGTTGAATA 1840
||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1883 TGTATTTAAGAAATATGAGAGTTGTATCGATGTGGAGATACAACAGAGGGCAGTTGAATA 1942
Query 1841 TTTTGAATTGAGTAAAAAAGGGCCTGCCTTTATGGATGTATTGGCTGAGATGCCAAAATT 1900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1943 TTTTGAATTGAGTAAAAAAGGGCCTGCCTTTATGGATGTATTGGCTGAGATGCCAAAATT 2002
Query 1901 TCCGGAGCGCCAGTCTTCATTGATAAAAAAGGCAGAAAACGTGGAAGATACCGCAGACCA 1960
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2003 TCCGGAGCGCCAGTCTTCATTGATTAAAAAGGCAGAAAACGTTGAAGATACCGCAGACCA 2062
Query 1961 GAGTGCCATCAAGCTTAGAGCACAACAACAGCCTTCAAATGCT-TTGGTTTTGGCTGACC 2019
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||
Sbjct 2063 GAGTGCCATCAAACTTAGAGCACAACAACAGCCTTCAAATGCTATTG-TTTTGGCTGACC 2121
Query 2020 CACAGCCTGTTAATGGGGCACCCCCACCTTTGAAGGTTCCAATTGTAAGTGGAAGCACGG 2079
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2122 CACAGCCTGTTAATGGGGCACCACCACCTTTGAAGGTTCCAATTTTAAGTGGAAGCACGG 2181
Query 2080 GACCCC-AGTCAGTGGCTCGATCTCTCTCTCATCCTAATGGAACTTTAAGTAATATAGAT 2138
|||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2182 -ACCCTGAGTCAGTGGCTCGATCTCTCTCACATCCCAATGGAACTTTAAGTAATATAGAT 2240
Query 2139 CCACAAACTCCATCACCTGATCTCCTTAGTGACCTGCTCGGTCCTCTTGCAATAGAGGCT 2198
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2241 CCACAAACTCCATCACCTGATCTCCTTAGTGACCTACTCGGTCCTCTTGCAATAGAGGCT 2300
Query 2199 CCTCCTGGAGCTGTCTCAAATGAACAACATGGTCCCATAGGGGCAGAAGGAGTACCAGAT 2258
|| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2301 CCACCTGGAGCTGTCTCATATGAACAACATGGTCCCGTAGGGGCAGAAGGAGTTCCAGAT 2360
Query 2259 GAAGTTGGTGGTTCCGCCATTGTACCTGTTGAAGAGCAACCAAATACAGTGGAGCTTATC 2318
||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2361 GAAATTGATGGTTCCGCCATTGTACCTGTTGAAGAGCAAACAAATACAGTGGAGCTTATC 2420
Query 2319 GGAAATATTGCCGAGAGATTTCATGCTTTATGTTTGAAAGACAGTGGTGTCTTATACGAG 2378
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2421 GGAAATATTGCTGAGAGATTTCATGCTTTATGTTTGAAAGACAGTGGTGTCTTATACGAG 2480
Query 2379 GATCCTCATATCCAGATTGGCATCAAAGCTGAATGGAGAGGGCATCATGGGAGACTTGTT 2438
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||
Sbjct 2481 GATCCTCATATCCAGATTGGCATCAAAGCTGAATGGAGAGGACACCATGGGAGACTTGTT 2540
Query 2439 CTCTTCATGGGAAACAAGAATACTTCTCCACTTACATCAGTTCAAGCTCTGATACTACCC 2498
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2541 CTCTTCATGGGAAACAAGAATACTTCTCCACTTACATCAGTTCAAGCTCTGATACTACCC 2600
Query 2499 CCTGCCCATTTAAGACTGGATCTGTCTCCAGTACCTGATACAATTCCTCCTCGAGCACAG 2558
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2601 CCTGCCCACTTAAGACTGGATCTGTCTCCAGTACCTGATACAATTCCTCCTCGAGCACAG 2660
Query 2559 GTACAATCTCCACTTGAAGTGATGAACATCCGCCCTAGTAGGGATGTTGCAGTTTTGGAT 2618
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2661 GTACAATCTCCGCTTGAAGTGATGAACATCCGCCCTAGTAGGGATGTTGCAGTTTTGGAT 2720
Query 2619 TTCTCCTACAAGTTTGGTACAAACGTGGTCAGTGCCAAATTACGGATCCCGGCAACTTTG 2678
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||
Sbjct 2721 TTCTCCTACAAGTTTGGTACAAACGTGGTCAGTGCCAAATTACGCATCCCGGCAACCTTG 2780
Query 2679 AATAAGTTTCTTCAACCGCTACAATTGACATCTGAAGAGTTCTTCCCTCAATGGAGAGCA 2738
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2781 AATAAGTTTCTTCAACCTCTACAATTGACATCTGAAGAGTTCTTCCCTCAATGGAGAGCA 2840
Query 2739 CTTTCAGGGCCACCCTTGAAACTTCAGGAAGTTGTTAGAGGTGTAAGACCTCTAGCTCTT 2798
| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2841 ATCTCAGGGCCACCCTTGAAACTTCAGGAAGTGGTAAGAGGTGTAAGACCTCTAGCTCTT 2900
Query 2799 CCGGAAATGGCAAATCTGTTCAACAGTTTTCATGTGACGATATGCCCTGGGCTTGATCCA 2858
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2901 CCGGAAATGGCAAATCTGTTCAACAGTTTTCATGTGACGATATGCCCTGGGCTTGATCCA 2960
Query 2859 AACCCTAATAATCTAGTGGCAAGCACAACCTTCTACTCTGAAAGTACAGGAGCCATGCTC 2918
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2961 AACCCTAATAATCTAGTGGCAAGCACAACCTTCTACTCTGAAACTACAGGAGCCATGCTC 3020
Query 2919 TGTTTGGCAAGAATTGAAACAGACCCAGCGGACAGAACCCAATTGCGAATGACAGTAGGC 2978
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||
Sbjct 3021 TGTTTGGCAAGAATTGAAACAGACCCAGCGGACAGAACCCAACTACGATTGACAGTAGGC 3080
Query 2979 TCGGGAGATCCTACCCTTACATTTGAGTTAAAAGAATTCATCAAGGAACAACTAATTACT 3038
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3081 TCGGGAGATCCTACCCTTACATTTGAGTTAAAAGAATTCATCAAGGAACAATTAATTACT 3140
Query 3039 ATCCCAATGGGATCTCGAGCTCTAGTTCCAGCAGCAGGTTCAGCACCATCACCAGCACCA 3098
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3141 ATTCCAATGGGATCTCGAGCTCTAGTTCCAGCAGCAGGTCCAGCACCATCACCAGCA--- 3197
Query 3099 CCTGTAGCTCAACCGCCTAGCCCAGCGGCTTTAGCTGATGATCCAGGAGCTATGCTTGCT 3158
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3198 ---GT---TCAACCGCCTAGCCCAGCGGCTTTAGCTGATGATCCAGGAGCTATGCTTGCT 3251
Query 3159 GGCTTACTTTAATTTCATTGGG 3180
|||||||||||| |||||||||
Sbjct 3252 GGCTTACTTTAAATTCATTGGG 3273
> AT5G22770.1 | Symbols: alpha-ADR | alpha-adaptin | chr5:7579544-7588246
REVERSE LENGTH=3559
Length=3559
Score = 5155 bits (2791), Expect = 0.0
Identities = 3027/3141 (96%), Gaps = 16/3141 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 42 TTAGATCCGGTTTCGCCAGTTTGGATCTGCGCCGTGTGAGGCGGCGGAGGACGGTGGATC 101
||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 143 TTAGATCCGGTGCCGCGAGTTTGGATCTGCGCCGTGTGAGGCGGCGGAGCACGGTGGATT 202
Query 102 TGAGGATTTGGTTCCACCATGACCGGAATGAGAGGTCTCTCCGTATTTATCAGCGACGTT 161
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 203 TGAGGATTTGGTTCAACCATGACCGGAATGAGAGGTCTCTCCGTATTTATCAGCGACGTT 262
Query 162 CGTAATTGCCAGAACAAGGAAGCGGAGAGACTCCGAGTTGATAAGGAGCTTGGAAACATA 221
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 263 CGTAATTGCCAGAACAAGGAAGCGGAGAGACTACGAGTTGATAAGGAGCTCGGAAACATT 322
Query 222 CGTACATGCTTCAAGAATGACAAGGTTTTGACACCATATAAAAAGAAGAAATATGTCTGG 281
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 323 CGTACATGCTTCAAGAATGAGAAGGTTTTGACACCATATAAAAAGAAGAAATATGTCTGG 382
Query 282 AAAATGCTTTATATACATATGCTAGGCTACGATGTGGATTTTGGCCATATGGAGGCGGTT 341
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 383 AAAATGCTTTATATACATATGCTAGGCTACGATGTGGATTTTGGCCATATGGAGGCGGTT 442
Query 342 TCTCTTATATCTGCGCCAAAGTATCCAGAAAAGCAGGTTGGCTACATTGTTACATCTTGC 401
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 443 TCTCTTATATCTGCGCCAAAGTATCCAGAAAAGCAGGTTGGCTACATTGTTACATCTTGC 502
Query 402 TTGCTCAATGAGAACCATGACTTTTTGAAGTTGGCAATAAATACAGTGCGGAACGATATT 461
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 503 TTGCTCAATGAGAACCATGACTTTTTGAAGTTGGCAATAAATACAGTGCGGAACGATATT 562
Query 462 ATTGGTCGGAATGAGACTTTCCAATGCCTAGCACTGACCTTGGTAGGAAATATTGGTGGA 521
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||
Sbjct 563 ATTGGTCGGAATGAGACTTTCCAGTGCCTAGCACTGACCTTGGTTGGAAATATCGGTGGA 622
Query 522 AGAGATTTTGCTGAATCATTGGCACCTGATGTTCAAAAGCTACTTATTTCTAGTAGTTGC 581
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 623 AGGGATTTTGCTGAATCATTGGCACCTGATGTTCAAAAGCTACTTATTTCTAGTAGTTGC 682
Query 582 AGACCTCTCGTAAGGAAAAAAGCGGCACTGTGCCTACTGCGCTTATTCCGAAAAAATCCG 641
|||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 683 AGACCTCTTGTAAGGAAAAAAGCAGCACTGTGCCTACTGCGCTTATTCCGAAAAAATCCT 742
Query 642 GATGCTGTCAACGTTGATGGCTGGGCGGATCGTATGGCACAACTTTTGGATGAACGAGAT 701
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 743 GATGCTGTCAACGTGGATGGCTGGGCGGATCGTATGGCACAACTTTTGGATGAACGAGAT 802
Query 702 CTTGGTGTCTTGACGTCTTCTACGAGTCTTCTTGTAGCTCTGGTATCTAATAATCATGAG 761
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 803 CTTGGTGTCTTGACGTCTTCTACGAGTCTTCTTGTAGCTCTGGTATCTAATAATCATGAG 862
Query 762 GCGTACTCAAGTTGTCTACCTAAATGTGTCAAAATATTAGAACGCCTTGCTAGGAACCAG 821
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 863 GCGTACTCAAGTTGTCTACCTAAATGTGTCAAAATATTAGAACGCCTTGCTAGGAACCAA 922
Query 822 GATGTTCCTCAGGAGTACACATACTATGGCATCCCATCACCTTGGCTCCAGGTTAAGGCA 881
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 923 GATGTTCCTCAGGAGTACACATACTATGGCATCCCATCTCCTTGGCTCCAGGTTAAGGCA 982
Query 882 ATGAGGGCTCTTCAATATTTTCCAACCATTGAAGATCCCAGTACCAGAAAAGCTCTCTTT 941
|||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 983 ATGAGGGCTCTTCAATATTTCCCGACCATTGAAGATCCCAGTACCAGAAAAGCTCTGTTT 1042
Query 942 GAGGTCCTTCAGCGAATATTGATGGGGACAGATGTTGTGAAAAATGTGAATAAAAACAAT 1001
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1043 GAGGTCCTTCAGCGAATATTGATGGGGACAGATGTTGTGAAAAATGTGAATAAAAACAAT 1102
Query 1002 GCGTCTCATGCTGTGCTGTTTGAAGCTCTATCCCTGGTCATGCATCTTGATGCTGAGAAG 1061
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1103 GCGTCTCATGCTGTGCTGTTTGAAGCTCTATCCCTGGTCATGCATCTTGATGCTGAGAAG 1162
Query 1062 GAAATGATGTCACAGTGTGTTGCTCTTCTTGGCAAGTTTATTTCTGTCCGTGAGCCCAAC 1121
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1163 GAAATGATGTCACAGTGTGTTGCTCTTCTTGGCAAGTTTATTTCTGTCCGTGAGCCCAAC 1222
Query 1122 ATCAGATATCTGGGCTTGGAAAATATGACACGAATGCTGATGGTCACAGATGTTCAAGAT 1181
||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1223 ATCAGATATCTAGGCTTGGAAAATATGACGCGGATGCTGATGGTCACAGATGTTCAAGAT 1282
Query 1182 ATCATAAAGAAGCATCAGTCTCAGATAATCACCTCCTTGAAAGACCCTGACATCAGTATT 1241
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1283 ATCATAAAGAAGCATCAGTCTCAGATAATCACCTCCTTGAAAGACCCTGACATCAGTATT 1342
Query 1242 CGTAGACGTGCTCTTGATTTGCTATATGGGATGTGCGATGTGTCAAATGCAAAGGATATA 1301
||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1343 CGTAGGCGTGCTCTTGATTTATTATATGGGATGTGTGATGTGTCAAATGCAAAGGATATA 1402
Query 1302 GTCGAAGAGTTGTTGCAGTATCTTAGCACAGCGGAATTTTCCATGCGGGAGGAATTATCA 1361
|||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1403 GTCGAAGAGTTGCTGCAGTATCTTAGCACAGCAGAGTTTTCCATGCGGGAAGAATTATCA 1462
Query 1362 CTTAAAGCTGCAATTCTTGCTGAGAAGTTTGCTCCTGATCTATCATGGTATGTAGATGTG 1421
||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1463 CTTAAAGCTGCTATCCTTGCTGAGAAGTTTGCTCCTGATCTATCATGGTATGTTGATGTG 1522
Query 1422 ATCCTTCAGTTAATCGACAAGGCTGGGGATTTTGTTAGCGACGACATTTGGTTTCGTGTG 1481
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||
Sbjct 1523 ATCCTTCAGTTGATCGACAAGGCTGGGGATTTTGTTAGCGATGACATATGGTTTCGTGTG 1582
Query 1482 GTTCAGTTTGTAACAAATAATGAAGACCTCCAGCCTTATGCCGCATCAAAAGCAAGAGAA 1541
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||
Sbjct 1583 GTTCAGTTTGTAACAAATAATGAAGACCTGCAGCCTTACGCCGCGTCAAAAGCAAGAGAA 1642
Query 1542 TATTTGGACAAAATTGCAATACATGAGACCATGGTGAAGGTCAGTGCTTATATTTTGGGG 1601
|||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1643 TATTTGGACAAAATCGCAATACATGAGACTATGGTGAAGGTCAGTGCTTATATTTTGGGG 1702
Query 1602 GAGTATGGTCACCTTCTAGCTCGACAACCTGGATGCAGTGCAAGTGAACTCTTTAGCATC 1661
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 GAGTATGGTCACCTTCTAGCTAGACAACCTGGATGCAGTGCAAGTGAACTCTTTAGCATC 1762
Query 1662 TTACATGAGAAGCTTCCCACAGTATCGACTCCCACCATTCCTATACTTCTTTCCACATAT 1721
||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1763 TTACATGAGAAGCTTCCTACAATATCGACTCCCACCATTCCTATTCTTCTTTCCACATAT 1822
Query 1722 GCAAAGCTTCTTATGCACACTCAACCCCCGGATCCAGAACTGCaaaaaaaaaTTTGGGCT 1781
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1823 GCAAAGCTTCTTATGCACGCTCAACCCCCGGATCCAGAACTGCAAAAAAAAGTTTGGGCT 1882
Query 1782 GTATTTCAGAAGTATGAGAGTTGTATTGATGTGGAGATACAACAGAGGGCAGTTGAATAT 1841
|||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1883 GTATTTAAGAAATATGAGAGTTGTATCGATGTGGAGATACAACAGAGGGCAGTTGAATAT 1942
Query 1842 TTTGAATTGAGTAAAAAAGGGCCTGCCTTTATGGATGTATTGGCTGAGATGCCAAAATTT 1901
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1943 TTTGAATTGAGTAAAAAAGGGCCTGCCTTTATGGATGTATTGGCTGAGATGCCAAAATTT 2002
Query 1902 CCGGAGCGCCAGTCTTCATTGATAAAAAAGGCAGAAAACGTGGAAGATACCGCAGACCAG 1961
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2003 CCGGAGCGCCAGTCTTCATTGATTAAAAAGGCAGAAAACGTTGAAGATACCGCAGACCAG 2062
Query 1962 AGTGCCATCAAGCTTAGAGCACAACAACAGCCTTCAAATGCTTTGGTTTTGGCTGACCCA 2021
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
Sbjct 2063 AGTGCCATCAAACTTAGAGCACAACAACAGCCTTCAAATGCTATGGTTTTGGCTGACCAA 2122
Query 2022 CAGCCTGTTAATGGGGCACCCCCACCTTTGAAGGTTCCAATTGTAAGTGGAAGCACGGGA 2081
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
Sbjct 2123 CAGCCTGTTAATGGGGCACCACCACCTTTGAAGGTTCCAATTTTAAGTGGAAGCACGG-A 2181
Query 2082 CCCC-AGTCAGTGGCTCGATCTCTCTCTCATCCTAATGGAACTTTAAGTAATATAGATCC 2140
||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2182 CCCTGAGTCAGTGGCTCGATCTCTCTCACATCCCAATGGAACTTTAAGTAATATAGATCC 2241
Query 2141 ACAAACTCCATCACCTGATCTCCTTAGTGACCTGCTCGGTCCTCTTGCAATAGAGGCTCC 2200
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2242 ACAAACTCCATCACCTGATCTCCTTAGTGACCTACTCGGTCCTCTTGCAATAGAGGCTCC 2301
Query 2201 TCCTGGAGCTGTCTCAAATGAACAACATGGTCCCATAGGGGCAGAAGGAGTACCAGATGA 2260
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2302 ACCTGGAGCTGTCTCAAATGAACAACATGGTCCCGTAGGGGCAGAAGGAGTTCCAGATGA 2361
Query 2261 AGTTGGTGGTTCCGCCATTGTACCTGTTGAAGAGCAA-CCAAATACAGTGGAGCTTATCG 2319
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||
Sbjct 2362 AGTTGATGGTTCCGCCATTGTACCTGTTGAAGAGCAAACCAA-TACAGTGGAGCTTATCG 2420
Query 2320 GAAATATTGCCGAGAGATTTCATGCTTTATGTTTGAAAGACAGTGGTGTCTTATACGAGG 2379
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2421 GAAATATTGCTGAGAGATTTCATGCTTTATGTTTGAAAGACAGTGGTGTCTTATACGAGG 2480
Query 2380 ATCCTCATATCCAGATTGGCATCAAAGCTGAATGGAGAGGGCATCATGGGAGACTTGTTC 2439
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||
Sbjct 2481 ATCCTCATATCCAGATTGGCATCAAAGCTGAATGGAGAGGACACCATGGTAGACTTGTTC 2540
Query 2440 TCTTCATGGGAAACAAGAATACTTCTCCACTTACATCAGTTCAAGCTCTGATACTACCCC 2499
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2541 TCTTCATGGGAAACAAGAATACTTCTCCACTTACATCAGTTCAAGCTCTGATACTACCCC 2600
Query 2500 CTGCCCATTTAAGACTGGATCTGTCTCCAGTACCTGATACAATTCCTCCTCGAGCACAGG 2559
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2601 CTGCCCACTTAAGACTGGATCTGTCTCCAGTACCTGATACAATTCCTCCTCGAGCACAGG 2660
Query 2560 TACAATCTCCACTTGAAGTGATGAACATCCGCCCTAGTAGGGATGTTGCAGTTTTGGATT 2619
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2661 TACAATCTCCACTTGAAGTGATGAACATCCGCCCTAGCAGGGATGTTGCGGTTTTGGATT 2720
Query 2620 TCTCCTACAAGTTTGGTACAAACGTGGTCAGTGCCAAATTACGGATCCCGGCAACTTTGA 2679
|||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |
Sbjct 2721 TCTCTTACAAGTTTGGTGCAAACGTGGTCAGTGCCAAATTACGGATCCCAGCAACCTTAA 2780
Query 2680 ATAAGTTTCTTCAACCGCTACAATTGACATCTGAAGAGTTCTTCCCTCAATGGAGAGCAC 2739
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2781 ATAAGTTTCTTCAACCTCTACAATTGACATCTGAAGAGTTCTTCCCGCAATGGAGAGCAA 2840
Query 2740 TTTCAGGGCCACCCTTGAAACTTCAGGAAGTTGTTAGAGGTGTAAGACCTCTAGCTCTTC 2799
| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2841 TCTCAGGTCCACCCTTGAAACTTCAGGAAGTGGTTAGAGGTGTAAGACCTCTAGCTCTTC 2900
Query 2800 CGGAAATGGCAAATCTGTTCAACAGTTTTCATGTGACGATATGCCCTGGGCTTGATCCAA 2859
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2901 CGGAAATGGCAAATCTGTTCAACAGTTTTCATGTGACGATATGCCCTGGGCTTGATCCAA 2960
Query 2860 ACCCTAATAATCTAGTGGCAAGCACAACCTTCTACTCTGAAAGTACAGGAGCCATGCTCT 2919
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2961 ACCCTAATAATCTAGTGGCAAGTACAACCTTCTACTCTGAAAGTACAGGAGCCATTCTCT 3020
Query 2920 GTTTGGCAAGAATTGAAACAGACCCAGCGGACAGAACCCAATTGCGAATGACAGTAGGCT 2979
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3021 GTTTGGCAAGAATAGAAACAGACCCAGCGGACAGAACCCAATTGCGAATGACAGTAGGCA 3080
Query 2980 CGGGAGATCCTACCCTTACATTTGAGTTAAAAGAATTCATCAAGGAACAACTAATTACTA 3039
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3081 CGGGAGATCCTACCCTTACATTTGAGTTGAAAGAATTTATCAAGGAACAACTAATTACTG 3140
Query 3040 TCCCAATGGGATCTCGAGCTCTAGTTCCAGCAGCAGGTTCAGCACCATCACCAGCACCAC 3099
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||
Sbjct 3141 TCCCAATGGGATCTCGAGCTTTAGTTCCAGCAGCAGGT-C--CA---------GCACCAC 3188
Query 3100 CTGTAGCTCAACCGCCTAGCCCAGCGGCTTTAGCTGATGATCCAGGAGCTATGCTTGCTG 3159
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3189 CTGTAGCTCAACCGCCAAGCCCAGCGGCTTTAGCTGATGATCCAGGAGCTATGCTCGCTG 3248
Query 3160 GCTTACTTTAATTTCATTGGG 3180
||||||||||| |||||||||
Sbjct 3249 GCTTACTTTAAATTCATTGGG 3269
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-12
Identities = 41/41 (100%), Gaps = 0/41 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTTCTCCAAAGATCAGTCTCTCCTTTTGAATTTCTTCGATT 41
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 9 CTTCTCCAAAGATCAGTCTCTCCTTTTGAATTTCTTCGATT 49
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 167708090449
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5