BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg489225
Length=3939
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G23630.1 | Symbols: PDR2, MIA | phosphate deficiency respons... 6442 0.0
> AT5G23630.1 | Symbols: PDR2, MIA | phosphate deficiency response
2 | chr5:7960478-7967946 REVERSE LENGTH=3974
Length=3974
Score = 6442 bits (3488), Expect = 0.0
Identities = 3803/3954 (96%), Gaps = 25/3954 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GATTCCTTTTGGGTTTCGTCGTGATTCGATCTTAGCATGTCAATTTGAAAACCCTAG-TT 59
|||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1 GATTCCTTTTGGGTTTCGCCGTGATTCGATCTTCGCATGTCAATTTGAAAACCCTAGTTT 60
Query 60 TTGATCTCTCTCGATTTCAA-ATCCTACTGGTTGTGC-AGAAATCAAGGAACTTTAGACG 117
|||||||||||| ||| ||| | || || || | | |||| ||||||||||| |||||
Sbjct 61 TTGATCTCTCTCAATTCCAAGCTACTCCTAATT-T-CAAGAACTCAAGGAACTTCAGACG 118
Query 118 -ATTTGAA-GACGAACTAG-------GTTTTGGTTTTGAGATGTCGAGCTTTCGTGTGGG 168
|||| || || ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 119 AATTT-AAGGA-GAACTAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAATGTCGAGCTTTCGTGTGGG 176
Query 169 AGGAAAGGTAGTGGAGAAGGTTGATTTATGTAGGAAGAAACAGTTGGTGTGGCGCTTGGA 228
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 177 AGGAAAGGTAGTGGAGAAGGTTGATTTATGTAGGAAGAAACAATTGGTGTGGCGCTTGGA 236
Query 229 CGTTTGGCCTTTTGCGATTCTGTATACAGTATGGTTGACTACGATCGTTCCTAGCATAGA 288
||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 237 CGTTTGGCCATTTGCGATTCTGTATACTGTATGGTTGACTACGATCGTTCCTAGCATAGA 296
Query 289 CTTCACTGATGCTTGCATTGCGCTTGGTGCTCTTTCTGCTTTCCACATCCTAGTCTTGCT 348
||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 297 CTTCAGTGATGCTTGCATTGCGCTTGGTGGTCTTTCTGCTTTCCACATCTTAGTCTTGCT 356
Query 349 TTTCACTGCGTGGTCGGTGGATTTCAAGTGTTTTGTCCAGTTTAGCAAGGTTAACAGTAT 408
||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 357 TTTCACTACGTGGTCCGTGGATTTCAAGTGTTTTGTCCAGTTTAGCAAGGTTAACAGTAT 416
Query 409 CGACCAGGCAGATGCATGTAAAGTTACCCCAGCCAAATTTTCTGGTTCTAAAGAAGTCGT 468
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 417 CGACCAGGCAGATGCATGTAAAGTTACACCAGCCAAATTTTCTGGTTCTAAAGAAGTTGT 476
Query 469 GCCTCTTCATTTTCGTAGCCAAATGACAGGTTCGGCAGCCTCGGAAGACCTGGAAGAAAT 528
||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||| ||||||||||
Sbjct 477 GCCTCTTCATTTTCGTAGCCAAATGACAGATTCAGCATCCTCGGGAGACATGGAAGAAAT 536
Query 529 TTTCTTTGACTTCAGGAAGCAGCGTTTTATATACTCAAAAGAGTTAGGAGCCTTTTCCAA 588
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 537 TTTCTTTGACTTCAGGAAGCAGCGTTTTATATACTCAAAAGAGTTAGGAGCCTTTTCCAA 596
Query 589 GCTTCCTTACCCCACAAAAGAAACATTTGGTCATTATTTGAAATGTACTGGTCATGGTAC 648
||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 597 GCTTCCTTATCCCACAAAGGAAACATTTGGTCATTATTTGAAATGTACTGGTCATGGTAC 656
Query 649 AGAAGCTAAAGTTGCCACTGCCACGGAGAAGTGGGGAAGGAATGTATTTGATTATCCACA 708
|||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 657 AGAAGCTAAAATTGCCACTGCCACTGAGAAGTGGGGAAGGAATGTATTTGATTATCCACA 716
Query 709 ACCTACATTCCAGAAGCTAATGAAAGAAAACTGCATGGAACCCTTTTTTGTATTTCAGGT 768
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 717 ACCTACATTCCAGAAGCTAATGAAAGAAAACTGCATGGAACCCTTTTTTGTATTTCAGGT 776
Query 769 TTTCTGTGTGGGTCTTTGGTGCTTGGATGAATTCTGGTACTACAGTGTGTTCACACTATT 828
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 777 TTTCTGTGTGGGTCTTTGGTGCTTGGATGAATTCTGGTACTACAGTGTGTTCACACTATT 836
Query 829 CATGCTTTTCATGTTCGAGTCAACAATGGCAAAAAGCCGCTTGAAGACATTAACCGACCT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 837 CATGCTTTTCATGTTCGAGTCAACAATGGCAAAAAGCCGCTTGAAGACATTAACCGACCT 896
Query 889 AAGACGTGTTAGGGTGGACAGTCAGACCGTGATGGTGTATCGATCCGGAAAGTGGGTGAG 948
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 897 AAGAAGTGTTAGGGTGGACAGTCAGACCGTGATGGTGTATCGATCCGGAAAGTGGGTGAA 956
Query 949 GCTCTTAGGTACAGATCTGCTTCCAGGAGATGTTGTGTCCATTGGGCGACCTTCAACTCA 1008
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 957 GCTCTTAGGTACAGATCTGCTTCCAGGAGATGTTGTGTCCATTGGGCGACCTTCAACTCA 1016
Query 1009 GACTGGAGGAGAGGATAAGACAGTACCAGCGGACATGCTTTTACTGGTAGGAAGTGCTAT 1068
|||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1017 GACTGGAGGAGAGGATAAAACAGTACCAGCGGATATGCTTTTACTGGTAGGAAGTGCTAT 1076
Query 1069 TGTAAATGAAGCCATTTTGACAGGCGAGTCAACTCCCCAATGGAAGGTTCCCATTGTTGG 1128
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1077 TGTAAATGAAGCCATTTTGACAGGCGAGTCAACTCCCCAATGGAAGGTTCCAATTGTTGG 1136
Query 1129 CCAAGGATCTGATGAAAAATTATCGATCAAAAGGGATAAGAATCATGTTTTATTTGGCGG 1188
|||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1137 CCAAAGATCTGATGAAAAATTATCGATCAAAAGAAATAAGAATCATGTTTTATTTGGCGG 1196
Query 1189 GACCAAGATCTTGCAACATTCACCTGACAAGTCCTTCTCTCTGAAAACCCCTGATGGTGG 1248
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1197 GACCAAGATCTTGCAACATTCACCTGACAAGTCCTTCTCTCTGAAGACCCCTGATGGTGG 1256
Query 1249 CTGTCTAGCTGTTGTTCTCCGAACTGGATTTGAGACGAGCCAAGGAAAACTAATGAGGAC 1308
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1257 CTGTCTAGCTGTTGTTCTCCGAACTGGATTTGAGACGAGCCAAGGAAAACTAATGAGGAC 1316
Query 1309 AATTTTATTTTCTACAGAAAGGGTTACTGCAAACAGCTGGGAGAGTGGTCTGTTCATATT 1368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1317 AATTTTATTTTCTACAGAAAGGGTTACTGCAAACAGCTGGGAGAGTGGTCTGTTCATATT 1376
Query 1369 ATTTCTAGTGGTATTTGCCGTGATAGCTGCTGGCTATGTTCTTGTAAAGGGTCTCGAGGA 1428
|||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1377 ATTTCTTGTGGTATTTGCCGTGATAGCTGCAGGTTATGTTCTTGTAAAGGGTCTCGAGGA 1436
Query 1429 TCCTACAAGGAGCAAATATAAGCTTTTGTTAGGCTGTTCACTTATCATCACCTCAGTGAT 1488
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1437 TCCTACAAGGAGCAAATATAAGCTTTTGCTAGGCTGTTCACTTATCATCACCTCAGTGAT 1496
Query 1489 CCCGCCCGAATTGCCTATGGAATTATCCATTGCTGTCAATACTTCATTAATTGCTCTTGC 1548
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||
Sbjct 1497 CCCGCCCGAATTGCCTATGGAATTATCCATTGCTGTCAATACGTCATTACTTGCTCTTG- 1555
Query 1549 T-CGACGTGGGATATTTTGCACAGAGCCTTTTAGGATCCCTTTTGCCGGGAAGGTTGATT 1607
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1556 TACGACGTGGGATATTTTGCACAGAGCCTTTTAGGATCCCTTTTGCGGGGAAGGTTGATT 1615
Query 1608 TGTGTTGTTTCGATAAGACTGGTACACTCACGTCAGATGACATGGAGTTCCGAGGAGTTG 1667
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1616 TGTGTTGTTTTGATAAGACTGGTACACTCACGTCAGATGACATGGAGTTCCGAGGAGTCG 1675
Query 1668 GGGGCTTGTCTAATTCTGAAGAAGCAGAGACTGATATGAGCAAGGTTCCTGTACGCACAT 1727
|||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1676 GGGGTTTGTCTAATTGTGAAGAAGCAGAGACTGATATGAGCAAGGTTCCTGTACGCACAT 1735
Query 1728 TGGAAATTTTGGCTTCTTGTCATGCCTTGGTCTTTGTAGACAACAAGCTGGTTGGTGATC 1787
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1736 TGGAAATTTTGGCTTCTTGTCATGCCTTGGTCTTTGTAGAAAACAAGCTGGTTGGTGATC 1795
Query 1788 CTCTTGAGAAGGCTGCACTTAAAGGAATTGACTGGAGTTACAAAGCTGATGAAAAGGCCT 1847
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1796 CTCTTGAGAAGGCTGCACTTAAAGGAATTGACTGGAGTTACAAAGCTGATGAAAAGGCCT 1855
Query 1848 TGCCTAGAAGAGGAAATGGCAACTCGGTGCAGATTATGCAGAGATACCATTTTGCTTCGC 1907
| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1856 TACCTAGAAGAGGAAATGGCAACTCAGTGCAGATTATGCAGAGATACCATTTTGCTTCGC 1915
Query 1908 ATCTGAAGAGAATGTCTGTTATCGTTCGTATTCAGGAGGAATATTTGGTGTTTGTGAAGG 1967
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1916 ATCTGAAGAGAATGTCTGTTATCGTTCGTATTCAGGAGGAATATTTGGCATTTGTGAAGG 1975
Query 1968 GTGCGCCAGAGACAATCCAAGAGAGGCTTGTGGATGTGCCAGCACAATATATCGAAACAT 2027
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1976 GTGCGCCAGAGACAATCCAAGAGAGGCTTGTGGATGTGCCTGCACAATATATCGAAACAT 2035
Query 2028 ATAAGAGATACACACGCCAAGGATCTCGGGTTCTAGCCCTTGCGTATAAACGACTTCCTG 2087
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||
Sbjct 2036 ATAAGAGATACACACGCCAAGGATCTCGGGTTCTAGCCCTTGCATATAAACGACTGCCTG 2095
Query 2088 ATATGATGGTCAGTGAAGCTAGGGACATGGACAGAGATGCTGTTGAGAGTGATCTTACTT 2147
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2096 ATATGATGGTCAGTGAAGCTAGGGACATGGACAGGGATGCTGTTGAGAGTGATCTTACTT 2155
Query 2148 TTGCTGGGTTTGCGGTCTTCAACTGCCCCATTAGACCAGATTCAGCCCCCGTTCTCTTGG 2207
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||
Sbjct 2156 TTGCTGGGTTTGCGGTCTTCAACTGCCCCATTAGACCAGACTCAGCCCCCGTGCTCTTGG 2215
Query 2208 AGTTGAAGAATTCATCCCATGATTTGGTGATGATAACAGGTGATCAAGCTTTGACAGCTT 2267
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2216 AGTTGAAGAATTCATCCCATGATTTGGTGATGATAACAGGTGATCAAGCTTTGACAGCTT 2275
Query 2268 GTCATGTTGCAGGCCAAGTGCATATTGTATCAAACCCAGTTTTAATTCTTGGTCGATCAG 2327
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2276 GTCATGTTGCAGGCCAAGTGCATATTGTATCAAACCCAGTTTTAATTCTTGGACGATCAG 2335
Query 2328 GGACTGGTAACGAATACAAGTGGATGTCACCTGATGAGAAGGAGATCATACCCTACAGTG 2387
||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2336 GGAGTGGTAACGAATACAAGTGGGTGTCACCTGATGAGAAGGAGATCATCCCCTACAGTG 2395
Query 2388 AAAAAGATATCGAAACCCTTGCAGAGACCCACGATTTATGCATTGGAGGTGACAGCATTG 2447
||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2396 AAAAAGAGATCGAAACCCTGGCAGAGACCCATGATTTATGCATTGGAGGTGACAGCATTG 2455
Query 2448 AAATGCTACAGGCTACATCTGCTGTTTTGCGAGTCATTCCGTTTGTTAAGGTTTTTGCGA 2507
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2456 AAATGCTACAGGCTACATCTGCTGTTTTGCGAGTCATTCCGTTTGTTAAGGTTTTTGCGA 2515
Query 2508 GAGTTGCTCCACAGCAGAAGGAGCTGATCTTAACCACCTTCAAAGCGGTAGGCAGAGGGA 2567
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
Sbjct 2516 GAGTTGCTCCACAGCAGAAGGAGCTGATCTTAACCACCTTCAAAGCGGTGGGCAGAGGTA 2575
Query 2568 CTCTGATGTGTGGGGATGGGACAAATGATGTTGGAGCATTGAAGCAGGCCCATGTTGGAG 2627
|| |||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2576 CTTTGATGTGTGGTGACGGGACAAATGATGTCGGAGCACTGAAGCAGGCCCATGTTGGAG 2635
Query 2628 TTGCCTTACTGAATACTATACCTCCCTCGTCTCCATCGGATTCGTCTAAAGATGACAAGT 2687
||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2636 TTGCCTTACTGAATAATAAACTTCCCTTGTCTCCATCGGATTCGTCTAAAGATGACAAGT 2695
Query 2688 CAAAGTCAAAAAAGTCCAAACTGCCATTAGAACCAGCAAGCAAAACTATAATTCAGAATG 2747
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||
Sbjct 2696 CAAAGTCAAAAAAGTCCAAACTGCCATTAGAACCAGCAAGCAAAACCATAACTCAGAATG 2755
Query 2748 GGGAAGGATCATCAAAAGGAAAGATTCCGCCCCAAAACCGTCACTTAACTGCTGCGGAAT 2807
||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2756 GGGAAGGATCATCAAAAGGAAAGATCCCACCCCAAAACCGCCACTTAACTGCTGCGGAAC 2815
Query 2808 TGCAAAGACAAAAGTTGAAGAAGATGATGGATGAACTAAACAGTGATGAAGGTGATGGCC 2867
||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2816 TGCAAAGACAAAAGTTGAAGAAGATTATGGATGACCTAAACAATGATGAAGGTGATGGCC 2875
Query 2868 GGTCAGCTCCCCTGGTCAAACTTGGGGATGCATCAATGGCATCCCCCTTCACAGCTAAAC 2927
||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2876 GGTCAGCTCCCCTAGTTAAACTTGGGGATGCATCAATGGCATCCCCCTTCACAGCTAAAC 2935
Query 2928 ATGCGTCGGTTGCCCCAGTGACAGACATAATCCGACAGGGTCGTAGTACACTTGTGACGA 2987
||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2936 ATGCGTCAGTTGCCCCAGTGACAGACATAATCCGGCAGGGTCGTAGCACACTTGTGACGA 2995
Query 2988 CTCTTCAGATGTTCAAAATTCTCGGTCTGAACTGTCTCGCCACAGCTTATGTCCTAAGTG 3047
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2996 CTCTTCAGATGTTCAAAATTCTCGGTCTGAACTGTCTCGCCACAGCATATGTCCTAAGTG 3055
Query 3048 TTATGTACTTAGACGGTGTAAAGCTCGGTGATGTCCAGGCTACAATCAGCGGAGTATTAA 3107
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3056 TTATGTACTTAGACGGTGTAAAGCTTGGTGATGTCCAGGCTACAATCAGCGGAGTGTTAA 3115
Query 3108 CAGCTGCGTTTTTCCTCTTCATTTCTCATGCCCGACCGCTTCAAACCCTCTCTGCAGAAC 3167
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3116 CAGCTGCGTTTTTCCTCTTCATTTCTCATGCCCGACCGCTTCAAACCCTCTCTGCAGAAC 3175
Query 3168 GACCCCACCCGAGTGTCTTCTCCTTGTACCTCTTCCTCTCTCTGCTAGGTCAGTTTGCTG 3227
| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||
Sbjct 3176 GGCCCCACCCGAGTGTCTTCTCCGTGTACCTCTTCCTCTCTCTGATAGGACAGTTTGCTG 3235
Query 3228 TTCACTTGACCTTCTTGATCTACTCTGTGAAGGAAGCTGAGAAACACATGCCCGAGGAAT 3287
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3236 TTCACTTGACCTTCTTGGTCTACTCTGTGAAGGAAGCTGAGAAACACATGCCCGAGGAAT 3295
Query 3288 GCATCGAACCAGACGCAAGTTTCCATCCTAATCTGGTGAACACAGTGTCGTACATGGTGA 3347
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3296 GCATCGAACCAGACGCAAGTTTCCATCCTAACCTGGTGAACACAGTGTCGTACATGGTGA 3355
Query 3348 GCATGATGCTTCAGGTTGCAACATTTGCTGTGAACTACATGGGACATCCCTTTAACCAGA 3407
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3356 GCATGATGCTTCAGGTTGCTACATTTGCTGTGAACTACATGGGACATCCCTTTAACCAGA 3415
Query 3408 GTATCAGAGAAAACAAACCGTTCTTCTACGCACTGATTGCTGGAGCAGGGTTCTTCACCG 3467
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3416 GTATCAGAGAAAACAAACCGTTCTTCTACGCACTCATTGCTGGAGCAGGGTTCTTCACCG 3475
Query 3468 TCATCGCCTCTGATCTCTTTAGAGACCTGAACGATTCGCTGAAGCTGGTTCCATTACCTC 3527
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3476 TCATCGCCTCTGATCTCTTCAGAGACCTGAACGATTCGCTGAAGCTAGTTCCATTACCTC 3535
Query 3528 AAGGTCTGAGGGATAAGCTTCTCCTCTGGGCCTCACTTATGTTCATCATCTGCTACTCGT 3587
|||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3536 AAGGTCTGAGAGATAAGCTTCTCATCTGGGCATCACTTATGTTCATCATCTGCTACTCAT 3595
Query 3588 GGGAGCGGTTGCTCAGGTGGGCTTTCCCCGGTAAGATCTCTTCTTGGAAACATAAGCAAA 3647
|||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3596 GGGAGCGGTTACTCAGGTGGGCTTTCCCTGGTAAGATTTCTTCTTGGAAACATAAGCAAA 3655
Query 3648 GAGCTGTCACTGCAAATCTGGAGAAGAAGAAGAAAGTTTGAAGAGAAACCAAACAGGTTA 3707
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3656 GAGCTGTCACTGCAAATCTGGAGAAGAAGAAGAAAGTTTGAAGAGAAACTAAACAGGTTA 3715
Query 3708 GGTTGAGGTAATAATCATCAATCCATACA-TTTTTTACTCGAGAAAGATGTTTGTTATTG 3766
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||
Sbjct 3716 GGTTGAGGTAATAATCATCAATCCATACAATTTTTTACTCGAGAAAGATGTTCGTTTTTG 3775
Query 3767 GGGATCTTGTTTTGC-AGAAAGCTTCCaaaaaaaaaaaaaaCATGAGCATTTTTCCCATA 3825
||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3776 GGGATCTTGTTTTGCCAGAAAGCTTC-AAAAAAAAAAA---CATGAGCATTTTTCCCATA 3831
Query 3826 GGTCTCACATTTTGTCTCATTACCTTATTTTGTCACTCTCTAAGAACCACTAAATCTAAG 3885
|||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3832 GGTCTCCCATATTGTCTCATTACCTTATTTTGTCACTCTCTAAGAACCACTAAATCTAAG 3891
Query 3886 GGTTTTCATTATTAGTCTCTGTAATTGTTTCTTTGTTTTACTTTCTTTGTATAA 3939
|| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||||||
Sbjct 3892 GGCTTTCATTATTAGTCTTTGTAATTGTTTCGTTGCTT-ACTTTCTTTGTATAA 3944
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 196253081016
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5