BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg489433
Length=2322
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G27640.2 | Symbols: TIF3B1, EIF3B, ATEIF3B-1, EIF3B-1, ATTIF... 3530 0.0
AT5G25780.1 | Symbols: EIF3B-2, EIF3B, ATEIF3B-2 | eukaryotic t... 3014 0.0
> AT5G27640.2 | Symbols: TIF3B1, EIF3B, ATEIF3B-1, EIF3B-1, ATTIF3B1
| translation initiation factor 3B1 | chr5:9781010-9785288
REVERSE LENGTH=2536
Length=2536
Score = 3530 bits (1911), Expect = 0.0
Identities = 2197/2332 (94%), Gaps = 31/2332 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 CTTCTTCTTTG-TTTTTCCTACTCCAATCCAT-TTTGTATTGGATTTTTGATATAATGTT 59
||||||||||| ||||| || ||| | || | ||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 58 CTTCTTCTTTGTTTTTTGCT-CTCGGCT-GATCTCTGTATTGGATTTTTGATATAAGGTT 115
Query 60 TGAAATCATGTTGATGGCGGCGGTAGTTGATATTGATGCCCTATCGGCTCAA-TTAGGGG 118
|||||||||| || ||| |||||||||||||||| | | ||| || ||||||
Sbjct 116 TGAAATCATG--GA-------GGTCGTTGATATTGATGCCCGAGCTGCT-AAGTTAGGGA 165
Query 119 TTAATTGGTCTGAGGTTAATCTCGATTCAATCCAACTTCCTTCTGGA-AACAACTTTGGG 177
|| |||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||
Sbjct 166 TTGATTGGTCTCAGGTTAATTTTGATTCCATCCAACTTCCTCCTGGAGAA-GACTTTGGG 224
Query 178 ATCGAGAGTGATGATGAAGCTGTATACCATGATGATCAGTCGGAATTCGACACTGGATTT 237
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||
Sbjct 225 ATCGAGAGTGATGATGAAGCTGTTTACCAGGATGACCAGTCTGAATTCGACACTGGATTC 284
Query 238 GGTAACATTATCGTGGTTGATCACCTCCCTGTTGTTCCCAAGGAGAAGTTTGAGAAACTA 297
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 285 GGTAACATTATCGTGGTCGATCACCTCCCTGTTGTTCCCAAGGAGAAGTTTGAGAAACTT 344
Query 298 GAAGGTGTTCTCAAGAAAATTTACAATCAGTTAGGTGTTATTAAGGAAAATGGACTGTGG 357
||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 345 GAAGGTGTTGTCAAGAAAATTTACAACCAGTTAGGTGTGATTAAGGAAAATGGACTGTGG 404
Query 358 ATGCCCGTTGATCCCGATACGAAGATGACATTGGGCTACTGTTTTATTGAGTTCAATACT 417
||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 405 ATGCCTGTTGATCCCGATACCAAGATGACATTGGGCTACTGTTTTATTGAGTTCAACACT 464
Query 418 CCTC----AGGAG-ACAGAACTAGATTGTTTGACAATGGTAGTGTATATT-CTAAGAGTT 471
|||| ||||| || |||||| ||| || |||||| | |||| || |||||||||
Sbjct 465 CCTCAGAAAGGAGCCCA-AACTAGGTTG-TTCTTAATGGTTGAGTAT-TTCCTAAGAGTT 521
Query 472 TGTTTCAATGTCTGGGGCTCTTTGCAGGAAGCACAAAATGCTAAGGAAAAGTCGCATGGC 531
| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||
Sbjct 522 TCTCTCAATGTCTGGGGCTCTTTGCAGGAAGCACAAAACGCTAAGGAAAAGTCTCATGGC 581
Query 532 TACAAGTTGGACAAGACTCACATCTTTGCTGTTAACATGTTTGATGATTTCGATAGGTTG 591
||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||
Sbjct 582 TACAAGTTGGACAAGTCTCACATCTTTGCTGTAAACATGTTCGATGATTTTGACAGGTTG 641
Query 592 ATGAATGTGAGGGAGGAGTGGGAGCCTCCTCAGGCCAGGCCCTATGTCCCTGGGGAAAAT 651
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 642 ATGAATGTGAAGGAGGAGTGGGAGCCTCCTCAGGCCAGGCCCTACGTCCCTGGGGAAAAT 701
Query 652 TTGCAGAAGTGGCTTACCGATGAAAAAGCCCGGGACCAGCTAGTCATTCGTTCAGGCCCT 711
||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 702 TTGCAAAAATGGCTTACTGATGAAAAAGCCCGAGACCAGCTAGTCATTCGTTCTGGCCCT 761
Query 712 GATACTGAGGTTTACTGGAATGATGCTAGGCAGAAGAAGCCTGAACCTGTTCATAAGCGT 771
|||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 762 GATACTGAAGTTTTCTGGAATGATACTAGGCAGAAGGCGCCTGAACCTGTTCATAAGCGT 821
Query 772 CCTTATTGGACAGAGAGTTATGTGCAGTGGTCTCCTTTAGGTACATACCTTGTGACACTT 831
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 822 CCTTATTGGACAGAGAGTTATGTGCAGTGGTCTCCTTTAGGTACATACCTTGTGACACTC 881
Query 832 CACAAGCAGGGGGCAGCTGTTTGGGGTGGTGCTGATACATTCACGCGTCTCATGCGTTAT 891
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 882 CACAAGCAGGGGGCAGCTGTTTGGGGTGGTGCTGATACATTCACGCGTCTCATGCGTTAT 941
Query 892 CAGCATTCTATGGTCAAACTAGTTGATTTCTCGCCAGGTGAGAGATATCTTGTAACTTAC 951
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 942 CAGCATTCTATGGTAAAACTAGTTGATTTCTCGCCAGGTGAGAAATATCTTGTAACTTAC 1001
Query 952 CATAGCCAAGAACCAAGCAATCCGAGAGATGCAAGTAAAGTAGAGATTAAGGTCTTTGAT 1011
|||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||
Sbjct 1002 CATAGCCAAGAACCAAGCAACCCGCGAGATGCAAGTAAAGTTGAGATTAAGGTTTTTGAT 1061
Query 1012 GTGAGAACCGGGAGGATGATGAGAGATTTCAAGGGTAGTGCTGATGAGTTTTCAATTGGA 1071
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1062 GTGAGAACCGGGAGGATGATGAGAGATTTCAAGGGTAGTGCTGATGAGTTTTCAATTGGA 1121
Query 1072 GGACCTGGTGGTGTTGCTGGTGCCTCTTGGCCTGTTTTCAGATGGGCTGGTGGAAAAGAT 1131
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1122 GGACCTGGTGGTGTTGCTGGTGCCTCTTGGCCTGTTTTCAGATGGGCTGGTGGAAAAGAT 1181
Query 1132 GATAAATACTTTGCCAAGCTTAGCAAAAACACCATCTCTGTCTATGAGACTGAGACTTTC 1191
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1182 GATAAATACTTTGCCAAGCTTAGCAAAAACACTATCTCTGTCTATGAGACTGAGACTTTC 1241
Query 1192 AGCCTAATAGACAAGAAATCCATGAAGGTTGATAATGTTGTGGATATTTGCTGGTCTCCC 1251
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1242 AGCCTAATAGACAAGAAATCCATGAAGGTAGATAATGTTGTGGATATCTGCTGGTCTCCT 1301
Query 1252 ACTGATTCTATCCTTTCATTGTTTGTTCCTGAACAAGGTGGTGGAAACCAACCTGCCAAG 1311
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1302 ACTGATTCCATCCTTTCATTGTTTGTTCCTGAACAAGGTGGTGGAAACCAACCTGCGAAG 1361
Query 1312 GTTGCTCTAGTCCAAATCCCGAGTAAGGTGGAGCTGAGGCAGAAGAATCTCTTCAGTGTG 1371
||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1362 GTTGCCCTAGTCCAAATCCCGAGCAAGGTGGAGCTGAGGCAGAAGAATCTCTTCAGTGTG 1421
Query 1372 AGCGACTGCAAGATGTACTGGCAGAGTAGTGGAGAGTATCTTGCTGTTAAGGTTGATCGA 1431
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1422 AGCGACTGCAAGATGTACTGGCAGAGTAGTGGAGAGTATCTTGCTGTCAAGGTTGATCGA 1481
Query 1432 TACACAAAAACTAAGAAGAGCACATACTCTGGATTTGAGCTTTTCCGTATCAAAGAAAGG 1491
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1482 TACACAAAAACTAAGAAGAGCACATACTCTGGATTTGAACTTTTCCGTATCAAAGAAAGG 1541
Query 1492 GATATTCCCATCGAGGTTCTTGAGCTGGATAACAAGAACGACAAGATCATTGCTTTCGCT 1551
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1542 GATATTCCCATCGAGGTTCTTGAGCTGGACAACAAGAACGACAAGATCATTGCTTTTGCA 1601
Query 1552 TGGGAGCCCAAGGGTCACAGGTTTGCTGTGATTCATGGTGACCAACCAAGACCAGATGTC 1611
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1602 TGGGAGCCCAAGGGTCACAGGTTTGCTGTGATTCATGGTGACCAACCAAGACCAGATGTC 1661
Query 1612 AGTTTCTACTCGATGAAGACCGCACAAAATACTGGAAGGGTTTCAAAGCTCGCAACGTTG 1671
||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1662 AGTTTCTACTCAATGAAGACCGCACAAAACACTGGAAGGGTTTCAAAGCTCGCAACTTTG 1721
Query 1672 AAGGCCAAACAAGCCAATGCCCTCTTCTGGTCGCCCACAGGAAAGTACATCATTCTTGCT 1731
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||
Sbjct 1722 AAGGCCAAACAAGCTAATGCCCTCTTCTGGTCGCCCACAGGCAAGTACATAATTCTTGCT 1781
Query 1732 GGGTTAAAAGGTTTCAATGGCCAGCTTGAATTTTTCAACGTGGATGAGCTCGAGACAATG 1791
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1782 GGGTTAAAAGGTTTCAATGGCCAGCTTGAATTTTTCAACGTGGATGAGCTCGAGACAATG 1841
Query 1792 GCCACAGCTGAACACTTCATGGCCACGGATATCGAATGGGACCCAACTGGAAGGTACGTT 1851
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1842 GCCACAGCTGAACACTTCATGGCCACGGATATCGAATGGGACCCGACTGGAAGGTACGTT 1901
Query 1852 GCAACCGCAGTGACATCAGTCCACGAGATGGAGAATGGGTTCACCATATGGTCTTTCAAC 1911
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1902 GCAACCGCAGTGACATCAGTCCATGAGATGGAGAATGGGTTCACCATATGGTCTTTCAAC 1961
Query 1912 GGGAATT-TGGTTTACCGGATACTGAAGGATCATTTCTTCCAGTTGGCTTGGCGTCCAAG 1970
|||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1962 GGGA-TTATGCTTTACCGGATATTGAAGGATCATTTCTTCCAGTTGGCTTGGCGTCCAAG 2020
Query 1971 ACCGCCATCATTCTTAACTGCAGAGAAGGAAGAAGAGATAGCAAAGAACCTGAAGAAGTA 2030
||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2021 ACCTCCATCATTCTTGACTGCAGAGAAGGAAGAAGAGATAGCAAAGACCCTGAAGAAGTA 2080
Query 2031 CAGCAAGAAGTATGAGGCAGAGGATCAGGACGTGTCGTTGCTGTTGAGTGAACAAGACAG 2090
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2081 CAGCAAGAAGTATGAGGCAGAGGATCAGGACGTGTCGTTGCTGTTGAGTGAACAAGACAG 2140
Query 2091 AGAGAAGAGAAGGGCATTGAAGGAAGAATGGGAGAAATGGGTGATGCAGTGGAAGTCTCT 2150
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2141 AGAGAAGAGAAAGGCATTGAAGGAAGAATGGGAGAAATGGGTAATGCAGTGGAAGTCTCT 2200
Query 2151 GCATGAAGAGGAGAAACTCGCGAGGCAAAATCTTCGAGATGGTGAAGTTAGTGATGTGGA 2210
|||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2201 GCATGAAGAGGAGAAACTCGTGAGGCAAAACCTTCGGGATGGTGAAGTAAGTGATGTGGA 2260
Query 2211 AGAAGATGAATATGAAGCCAAGGAAGTTGAGTTTGAGGATCTTATTGATGTCACTGAGGA 2270
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2261 AGAAGATGAATATGAAGCCAAAGAAGTTGAGTTTGAGGATCTTATCGATGTCACTGAGGA 2320
Query 2271 AATCGTTCAAGAGTCGATGTAAGTTTCTCGGTCTCTTTTGTTACCATCTCTT 2322
|||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2321 AATCGTTCAAGAGTCG-T--AAGATACTCGGTCTCTTTTGTTGCCATCTCTT 2369
> AT5G25780.1 | Symbols: EIF3B-2, EIF3B, ATEIF3B-2 | eukaryotic
translation initiation factor 3B-2 | chr5:8973267-8976869 REVERSE
LENGTH=2409
Length=2409
Score = 3014 bits (1632), Expect = 0.0
Identities = 1762/1827 (96%), Gaps = 0/1827 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 496 CAGGAAGCACAAAATGCTAAGGAAAAGTCGCATGGCTACAAGTTGGACAAGACTCACATC 555
|||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 460 CAGGAAGCACAAAACGCTAAGGAAAAGTCTCATGGCTACAAGTTGGACAAGTCTCACATA 519
Query 556 TTTGCTGTTAACATGTTTGATGATTTCGATAGGTTGATGAATGTGAGGGAGGAGTGGGAG 615
||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 520 TTTGCTGTTAATATGTTCGATGATTTCGATAGGTTGATGAATGTGAAGGAGGAGTGGGAG 579
Query 616 CCTCCTCAGGCCAGGCCCTATGTCCCTGGGGAAAATTTGCAGAAGTGGCTTACCGATGAA 675
|||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 580 CCTCCTCAAGAAAGGCCCTATGTCCCTGGGGAAAATTTGCAGAAGTGGCTTACTGATGAC 639
Query 676 AAAGCCCGGGACCAGCTAGTCATTCGTTCAGGCCCTGATACTGAGGTTTACTGGAATGAT 735
|||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 640 AAAGCCCGGGACCAGCTAGTCATTCGTTTTGGCCATGATACTGAAGTTTACTGGAATGAT 699
Query 736 GCTAGGCAGAAGAAGCCTGAACCTGTTCATAAGCGTCCTTATTGGACAGAGAGTTATGTG 795
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 700 GCTAGGCAGAAGAAGCCTGAACCTGTTCATAAGCGTTCTTATTGGACAGAGAGTTATGTG 759
Query 796 CAGTGGTCTCCTTTAGGTACATACCTTGTGACACTTCACAAGCAGGGGGCAGCTGTTTGG 855
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 760 CAGTGGTCTCCAATAGGTACATACCTTGTGACACTTCACAAGCAGGGGGCAGCTGTTTGG 819
Query 856 GGTGGTGCTGATACATTCACGCGTCTCATGCGTTATCAGCATTCTATGGTCAAACTAGTT 915
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 820 GGTGGTGCTGATACATTTACGCGTCTCATGCGTTATCAGCATTCAATGGTCAAACTAGTT 879
Query 916 GATTTCTCGCCAGGTGAGAGATATCTTGTAACTTACCATAGCCAAGAACCAAGCAATCCG 975
||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 880 GATTTCTCGCCTGGTGAGAAATATCTTGTAACTTACCATAGCCAAGAACCAAGCAATCCG 939
Query 976 AGAGATGCAAGTAAAGTAGAGATTAAGGTCTTTGATGTGAGAACCGGGAGGATGATGAGA 1035
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 940 AGAGATGCAAGTAAAGTAGAGATTAAGGTCTTTGATGTGAGAACCGGGAGGATGATGAGA 999
Query 1036 GATTTCAAGGGTAGTGCTGATGAGTTTTCAATTGGAGGACCTGGTGGTGTTGCTGGTGCC 1095
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1000 GATTTCAAGGGTAGTGCTGATGAGTTTTCAATTGGAGGACCTGGTGGTGTTGCTGGTGCC 1059
Query 1096 TCTTGGCCTGTTTTCAGATGGGCTGGTGGAAAAGATGATAAATACTTTGCCAAGCTTAGC 1155
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1060 TCTTGGCCTGTTTTCAGATGGGCTGGCGGAAAAGATGATAAATACTTTGCCAAGCTGAGC 1119
Query 1156 AAAAACACCATCTCTGTCTATGAGACTGAGACTTTCAGCCTAATAGACAAGAAATCCATG 1215
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1120 AAAAACACTATCTCTGTCTATGAGACTGAGACTTTCAGCCTAATAGACAAGAAATCCATG 1179
Query 1216 AAGGTTGATAATGTTGTGGATATTTGCTGGTCTCCCACTGATTCTATCCTTTCATTGTTT 1275
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1180 AAGGTTGATAATGTTGTGGATATTTGCTGGTCTCCCACTGATTCAATCCTTTCATTGTTT 1239
Query 1276 GTTCCTGAACAAGGTGGTGGAAACCAACCTGCCAAGGTTGCTCTAGTCCAAATCCCGAGT 1335
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1240 GTTCCTGAACAAGGTGGTGGAAACCAACCAGCCAAGGTTGCTCTAGTCCAAATCCCGAGT 1299
Query 1336 AAGGTGGAGCTGAGGCAGAAGAATCTCTTCAGTGTGAGCGACTGCAAGATGTACTGGCAG 1395
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1300 AAGGTAGAGCTGAGGCAGAAGAATCTCTTCAGTGTGAGCGACTGCAAGATGTACTGGCAG 1359
Query 1396 AGTAGTGGAGAGTATCTTGCTGTTAAGGTTGATCGATACACAAAAACTAAGAAGAGCACA 1455
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1360 AGTAGTGGAGAGTATCTTGCTGTTAAGGTTGATCGATACACAAAAACTAAGAAGAGTACA 1419
Query 1456 TACTCTGGATTTGAGCTTTTCCGTATCAAAGAAAGGGATATTCCCATCGAGGTTCTTGAG 1515
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1420 TACTCTGGATTTGAGCTTTTCCGTATCAAAGAAAGGGATATTCCAATCGAGGTTCTTGAG 1479
Query 1516 CTGGATAACAAGAACGACAAGATCATTGCTTTCGCTTGGGAGCCCAAGGGTCACAGGTTT 1575
||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1480 CTGGATAACAAGAACGATAAGATCATTGCTTTCGCGTGGGAGCCCAAGGGTCACAGGTTT 1539
Query 1576 GCTGTGATTCATGGTGACCAACCAAGACCAGATGTCAGTTTCTACTCGATGAAGACCGCA 1635
|||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1540 GCTGTGATTCATGGTGACCAGCCAAGACCGGATGTTAGTTTCTACTCGATGAAGACTGCA 1599
Query 1636 CAAAATACTGGAAGGGTTTCAAAGCTCGCAACGTTGAAGGCCAAACAAGCCAATGCCCTC 1695
||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1600 CAAAACACTGGAAGAGTTTCAAAGCTCGCAACTTTGAAGGCCAAACAAGCCAATGCCCTC 1659
Query 1696 TTCTGGTCGCCCACAGGAAAGTACATCATTCTTGCTGGGTTAAAAGGTTTCAATGGCCAG 1755
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1660 TTCTGGTCGCCCACAGGCAAGTACATCATTCTTGCTGGGTTAAAAGGTTTCAATGGCCAG 1719
Query 1756 CTTGAATTTTTCAACGTGGATGAGCTCGAGACAATGGCCACAGCTGAACACTTCATGGCC 1815
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1720 CTTGAATTTTTCAACGTGGATGAGCTCGAGACAATGGCCACAGCTGAACACTTCATGGCC 1779
Query 1816 ACGGATATCGAATGGGACCCAACTGGAAGGTACGTTGCAACCGCAGTGACATCAGTCCAC 1875
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||
Sbjct 1780 ACAGATATCGAATGGGACCCAACTGGAAGGTACGTTGCAACCTCAGTGACAACAGTCCAC 1839
Query 1876 GAGATGGAGAATGGGTTCACCATATGGTCTTTCAACGGGAATTTGGTTTACCGGATACTG 1935
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1840 GAGATGGAGAATGGGTTCACCATATGGTCTTTCAATGGGAATATGGTTTACCGGATACTG 1899
Query 1936 AAGGATCATTTCTTCCAGTTGGCTTGGCGTCCAAGACCGCCATCATTCTTAACTGCAGAG 1995
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||
Sbjct 1900 AAGGATCATTTCTTCCAGTTGGCTTGGCGTCCAAGACCGGCATCATTCTTGACTGCGGAG 1959
Query 1996 AAGGAAGAAGAGATAGCAAAGAACCTGAAGAAGTACAGCAAGAAGTATGAGGCAGAGGAT 2055
|||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1960 AAGGAAGAAGAGATAGCAAAGAACCTGAGGAATTACAGCAAGAGGTATGAGGCAGAGGAT 2019
Query 2056 CAGGACGTGTCGTTGCTGTTGAGTGAACAAGACAGAGAGAAGAGAAGGGCATTGAAGGAA 2115
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||
Sbjct 2020 CAGGACGTGTCGTTGCTATTGAGTGAACAAGACAGAGAGAAGAGGAGGGCATTGAATGAA 2079
Query 2116 GAATGGGAGAAATGGGTGATGCAGTGGAAGTCTCTGCATGAAGAGGAGAAACTCGCGAGG 2175
|| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2080 GAGTGGCAGAAATGGGTGATGCAGTGGAAGTCTCTGCATGAAGAGGAGAAACTCGTGAGG 2139
Query 2176 CAAAATCTTCGAGATGGTGAAGTTAGTGATGTGGAAGAAGATGAATATGAAGCCAAGGAA 2235
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||
Sbjct 2140 CAAAATCTTCGGGATGGTGAAGTTAGTGATGTGGAAGAAGATGAGTATGAAGCCAAAGAA 2199
Query 2236 GTTGAGTTTGAGGATCTTATTGATGTCACTGAGGAAATCGTTCAAGAGTCGATGTAAGTT 2295
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||
Sbjct 2200 GTTGAGTTTGAGGATCTTATTGATGTTACTGAGGAAATTGTTCAAGAGTTGATGTAAGTT 2259
Query 2296 TCTCGGTCTCTTTTGTTACCATCTCTT 2322
|||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2260 TCTCGGTCTCTTTTGTTACCCTCTCTT 2286
Score = 503 bits (272), Expect = 3e-141
Identities = 327/354 (92%), Gaps = 2/354 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 73 ATGGCGGCGGTAGTTGATATTGATGCCCTATCGGCTCAATTAGGGGTTAATTGGTCTGAG 132
||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||| |||||| |||||||||| ||
Sbjct 112 ATGGCGGCGGTTGTTGATATTGATGTCCTAACAGCTCAGTTAGGGATTAATTGGTCAGAT 171
Query 133 GTTAATCTCGATTCAATCCAACTTCCTTCTGGAAACAACTTTGGGATCGAGAGTGATGAT 192
||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||
Sbjct 172 GTTAATCTCGATTCAATCCAACTTCCTCCTGGAAACGACTTTGGGATCGAAAGTGATGAT 231
Query 193 G-AAGCTGTATACCATGATGATCAGTCGGAATTCGACACTGGATTTGGTAACATTATCGT 251
| ||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 232 GAAAG-TGTTTACCAAGATGACCAGTCAGAATTCGACACTGGATTCGGTAACATTATCGT 290
Query 252 GGTTGATCACCTCCCTGTTGTTCCCAAGGAGAAGTTTGAGAAACTAGAAGGTGTTCTCAA 311
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||
Sbjct 291 TGTCGATCACCTCCCTGTTGTTCCCAAGGAGAAGTTTGAGAAACTAGAAGGTGTTGTTAA 350
Query 312 GAAAATTTACAATCAGTTAGGTGTTATTAAGGAAAATGGACTGTGGATGCCCGTTGATCC 371
|||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 351 GAAAATTTACAACCAGTTAGGTGTGATTAAGGAAAATGGACTGTTGATGCCCGTTGATCC 410
Query 372 CGATACGAAGATGACATTGGGCTACTGTTTTATTGAGTTCAATACTCCTCAGGA 425
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 411 CGATACTAAGATGACATTGGGCTACTGTTTTATTGAGTTCAACACTCCTCAGGA 464
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 115260451320
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5