BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg489476
Length=3670
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G26570.1 | Symbols: PWD, OK1, ATGWD3 | catalytics;carbohydra... 6008 0.0
> AT5G26570.1 | Symbols: PWD, OK1, ATGWD3 | catalytics;carbohydrate
kinases;phosphoglucan, water dikinases | chr5:9261580-9267729
FORWARD LENGTH=3794
Length=3794
Score = 6008 bits (3253), Expect = 0.0
Identities = 3541/3681 (96%), Gaps = 16/3681 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGAGAGCATTGGCGGCCATTGTTGCAGCTCTCCTTTCACCTTCATCAGTAGAAA--C- 57
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
Sbjct 1 ATGGAGAGCATTGGCAGCCATTGTTGCAGCTCTCCTTTCACCTTCATCACTAGAAACTCA 60
Query 58 TCATCATCACTTCCCAAACTCGTTAACTTCACTCGTAGAGTTAATCTCAGCCACCAATCT 117
|||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 TCATCATCACTTCCTAGACTCGTTAACATCACTCACAGAGTTAATCTCAGCCACCAATCT 120
Query 118 CACCGACTCAGAAACTCCTCTTCTCGTCTCACTTGCACTGCTACTTCTTCTTCCACCATA 177
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 CACCGACTCAGAAACTCCAATTCTCGTCTCACTTGCACTGCTACTTCTTCTTCCACCATT 180
Query 178 GAGGAACAACTGAAGAAGAAAGATGGGTCTGGTACGAAAGTGAAGTTGAATGTGAGGTTA 237
|||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 181 GAGGAACAACGGAAGAAGAAAGATGGGTCAGGAACGAAAGTGAGGTTGAATGTGAGGTTA 240
Query 238 GATTATCAAGTTAAGTTTGGTGAACATGTGGCTATGTTTGGATCAGCTAAAGAGATTGGT 297
||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 GATCATCAAGTTAATTTTGGTGACCATGTGGCTATGTTTGGATCAGCTAAAGAGATTGGT 300
Query 298 TCATGGAAAAAGAAATCGCCTTTGAATTGGACTGAGAATGGATGGGTTTGTGAGTTGGAA 357
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 TCATGGAAAAAGAAATCGCCTTTGAATTGGAGTGAGAATGGATGGGTTTGTGAGTTGGAA 360
Query 358 CTTGACGGTGGTCAGGTTTTGGAGTATAAGTTTGTCATTGTTAAGGATGATGGTTCACTT 417
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 361 CTTGACGGTGGTCAGGTTTTGGAGTATAAGTTTGTCATTGTTAAGAATGATGGTTCACTT 420
Query 418 TCATGGGAATCTGGTGATAATCGTGTCCTTAAGGTTCCTAATTCTGGGAATTTCTCTGTT 477
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||
Sbjct 421 TCATGGGAATCTGGTGATAATCGTGTCCTTAAGGTTCCAAATTCTGGGAATTTTTCTGTT 480
Query 478 GTTTGTCATTGGGATGCTACAAGAGAAACCCTTGATTTGCCTCAGGAGGTTGATAATGAT 537
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 481 GTTTGTCATTGGGATGCTACTAGAGAAACCCTTGATTTGCCTCAGGAGGTTGGTAATGAT 540
Query 538 GA--A----GGTGGTGGTGGGGACGAGAGGGATAATCATGATGTTGGTGATGAGAGAGTA 591
|| | |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 541 GATGATGTTGGTGATGGTGGGCATGAGAGGGATAATCATGATGTTGGTGATGATAGAGTA 600
Query 592 GTGGGGAGTGAAAATGGTGCGCAGCTTCAGAAGAGTACATTGGGTGGGCAATGGCAAGGT 651
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 GTGGGAAGTGAAAATGGTGCGCAGCTTCAGAAGAGTACATTGGGTGGGCAATGGCAAGGT 660
Query 652 AAAGATGCGTCCTTTATGCGTTCTAATGATCATGGTAATAGAGAAGTTGGTAGAAATTGG 711
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 661 AAAGATGCGTCCTTTATGCGTTCTAATGATCATGGTAACAGAGAAGTTGGTAGAAATTGG 720
Query 712 GATACTAGTGGTCTTGAAGGCCCAGCTCTTAAGATGGTTGAAGGTGATCGTAACTCTAAG 771
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||
Sbjct 721 GATACTAGTGGTCTTGAAGGCACAGCTCTTAAGATGGTTGAGGGTGATCGCAACTCTAAG 780
Query 772 AACTGGTGGAGAAAGCTTGAAATGGTACGCGAGGTTATAGTTGGGAGTGTTGAGAGGGAG 831
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 AACTGGTGGAGAAAGCTTGAAATGGTACGCGAGGTTATAGTTGGGAGTGTTGAGAGGGAG 840
Query 832 GAACGATTGAAGGCGCTCATATACTCTGCGATTTATTTGAAGTGGATAAACACAGGTCAA 891
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 GAACGATTGAAGGCGCTCATATACTCTGCAATTTATTTGAAGTGGATAAACACAGGTCAG 900
Query 892 ATTCCTTGCTTTGAAGATGGAGGGCACCACCGTCCAAACCGGCATGCTGAGATTTCCAGA 951
|||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||
Sbjct 901 ATTCCTTGTTTTGAAGATGGAGGGCATCACCGTCCAAACAGGCATGCCGAGATTTCCAGA 960
Query 952 CTTATATTTCGTGAGTTGGAGCACATTTGCAGTAAGAAAGATGCTACGGCAGAGGAAGTG 1011
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 961 CTTATATTCCGTGAGTTGGAGCACATTTGCAGTAAGAAAGATGCTACTCCAGAGGAAGTG 1020
Query 1012 CTTGTTGCTCGGAAAATCCATCCTTGTTTACCTTCTTTCAAAGCAGAGTTTACTGCAGCT 1071
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021 CTTGTTGCTCGGAAAATCCATCCGTGTTTACCTTCTTTCAAAGCAGAGTTTACTGCAGCT 1080
Query 1072 GTCCCTCTAACTCGAATTAGGGACATAGCCCATCGCAATGATATTCCTCATGATCTCAAG 1131
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1081 GTCCCTCTAACTCGGATTAGGGACATAGCCCATCGCAATGATATTCCTCATGATCTCAAG 1140
Query 1132 CAAGAAATCAAGCATACCATACAAAATAAGCTTCACCGGAATGCGGGTCCAGAAGATCTA 1191
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1141 CAAGAAATCAAGCATACGATACAAAATAAGCTTCACCGGAATGCTGGTCCAGAAGATCTA 1200
Query 1192 ATTGCAACAGAAGCAATGCTTCAAAGAATTACTGAGACCCCAGGAAAATACAGTGGAGAC 1251
|||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1201 ATTGCAACAGAAGCAATGCTTCAACGAATTACCGAGACCCCAGGAAAATATAGTGGAGAC 1260
Query 1252 TTCGTGGAGCAATTTAAAATATTCCATAATGAGCTTAAAGATTTCTTTAATGCTGGAAGC 1311
|| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1261 TTTGTGGAGCAGTTTAAAATATTCCATAATGAGCTTAAAGATTTCTTTAATGCTGGAAGT 1320
Query 1312 CTCACTGAACAACTTGATTCTATGAAAATTTCCATGGACGATAGAGGTCTTTCTGCGCTC 1371
||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1321 CTCACTGAACAGCTTGATTCTATGAAAATTTCTATGGATGATAGAGGTCTTTCTGCGCTC 1380
Query 1372 AATTTGTTTTTTGAATGTAAAAAGCGCCTTGACGCATCAGGAGAATCAAGCAATGTTTTG 1431
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1381 AATTTGTTTTTTGAATGTAAAAAGCGCCTTGACACATCAGGAGAATCAAGCAATGTTTTG 1440
Query 1432 GAGTTGATTAAAACCATGCATTCTCTGGCTTCTCTAAGAGAAACAATTATAAAAGAACTT 1491
|||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1441 GAGTTGATTAAAACCATGCATTCTCTAGCTTCTTTAAGAGAAACAATTATAAAGGAACTT 1500
Query 1492 AATAGCGGCTTGCGAAATGATGCTCCTGATACTGCCATTGCAATGCGCCAGAAGTGGCGC 1551
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1501 AATAGCGGCTTGCGAAATGATGCTCCTGATACTGCCATTGCAATGCGCCAGAAGTGGCGC 1560
Query 1552 CTTTGTGAGATCGGCCTCGAGGACTACTTTTTTGTTCTACTAAGCAGATTCCTCAATGCT 1611
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1561 CTTTGTGAGATCGGCCTCGAGGACTACTTTTTTGTTCTACTAAGCAGATTCCTCAATGCT 1620
Query 1612 CTTGAAACTATGGGAGGAGCTGATCAACTGGCAAAAGATGTGGGATCAAGAAATGTTTCC 1671
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||
Sbjct 1621 CTTGAAACTATGGGAGGAGCTGATCAACTGGCAAAAGATGTGGGATCAAGAAACGTTGCC 1680
Query 1672 TCATGGAATGATCCACTCGATGCTCTGGTGTTGGGTGTTCACCAAGTAGGTCTATCTGGT 1731
||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1681 TCATGGAATGATCCACTAGATGCTTTGGTGTTGGGTGTTCACCAAGTAGGTCTATCTGGT 1740
Query 1732 TGGAAGCAAGAAGAATGTTTAGCCATTGGAAATGAACTCCTTGCTTGGCGAGAGAGAGAC 1791
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||
Sbjct 1741 TGGAAGCAAGAAGAATGTTTAGCCATTGGAAATGAACTCCTTGCTTGGCGAGAAAGGGAC 1800
Query 1792 CTACTTGAAAAAGAAGGGGAAGAGGATGGAAAAACAATTTGGGCTATGAGGCTGAAAGCA 1851
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1801 CTACTTGAAAAAGAAGGGGAAGAGGATGGAAAAACAATTTGGGCCATGAGGCTGAAAGCA 1860
Query 1852 ACTCTTGATCGAGCACGCAGATTAACAGCAGAATATTCTGATTTACTTCTTCAAATATTT 1911
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1861 ACTCTTGATCGAGCACGCAGATTAACAGCAGAATATTCTGATTTGCTTCTTCAAATATTT 1920
Query 1912 CCTCCTAATGTGGAGATTTTAGGAAAAGCTCTAGGAATCCCAGAGAATAGTGTCAAGACT 1971
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1921 CCTCCTAATGTGGAGATTTTAGGAAAAGCTCTAGGAATTCCAGAGAATAGTGTCAAGACC 1980
Query 1972 TATACAGAAGCAGAGATTCGTGCTGGAATTATTTTCCAGATCTCAAAGCTCTGCACTGTT 2031
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1981 TATACAGAAGCAGAGATTCGTGCTGGAATTATTTTCCAGATCTCAAAGCTCTGCACTGTT 2040
Query 2032 CTTCTAAAAGCTGTAAGAAGTTCACTTGGTTCTGAGGGCTGGGATGTCGTTGTACCTGGA 2091
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2041 CTTCTAAAAGCTGTAAGAAATTCACTTGGTTCTGAGGGCTGGGATGTCGTTGTACCTGGA 2100
Query 2092 TCGACTTCTGGGACATTAGTTCAGGTTGAGAGCATTGTACCGGGATCTTTACCATCAACT 2151
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||
Sbjct 2101 TCGACGTCTGGGACATTAGTTCAGGTTGAGAGCATTGTTCCGGGATCATTGCCAGCAACT 2160
Query 2152 GGTGGTGGTCCTATTATTCTCTTGGTCAACAAAGCTGACGGCGATGAAGAGGTAAGTGCT 2211
||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2161 TCTGGTGGTCCTATTATTCTCTTGGTCAATAAAGCTGATGGCGATGAAGAGGTAAGTGCT 2220
Query 2212 GCTAATGGGAACATAGCCGGAGTCATGCTTCTGCAGGAACTGCCTCACTTGTCTCACCTT 2271
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 GCTAATGGGAACATAGCTGGAGTCATGCTTCTGCAGGAGCTGCCTCACTTGTCTCACCTT 2280
Query 2272 GGCGTTAGAGCGCGGCAGGAGAAAATTGTCTTTGTGACATGTGATGATGATGACAAGGTC 2331
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2281 GGCGTTAGAGCGCGGCAGGAGAAAATTGTCTTTGTGACATGTGATGATGATGACAAGGTT 2340
Query 2332 GCTGATATACGGCGACTTGTGGGAAAGTTCGTGAGGTTGGAAGCATCTCCAAGCCATGTG 2391
||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2341 GCTGATATACGACGACTTGTGGGAAAATTTGTGAGGTTGGAAGCATCTCCAAGTCATGTG 2400
Query 2392 AATCTTATACTTTCAACTGAGGGTAAGAGTCGTACTCCCAAATCTAGTGCGAACaaaaaa 2451
||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||
Sbjct 2401 AATCTGATACTTTCAACTGAGGGTAGGAGTCGCACTTCCAAATCCAGTGCGACCAAAAAA 2460
Query 2452 aCGGATAAGAACAGCTTATCTAAGaaaaaaaCGGATAAGAAGAGCTTATCTATCGATGAT 2511
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2461 ACGGATAAGAACAGCTTATCTAAGAAAAAAACAGATAAGAAGAGCTTATCTATCGATGAT 2520
Query 2512 GAAGAATCAAAGACTGGTTCTTCATCTTCCAGTAGCCTCCTTTACTCTTCCAAGGATATC 2571
|||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2521 GAAGAATCAAAGCCTGGTTCCTCATCTTCCAATAGCCTCCTTTACTCTTCCAAGGATATC 2580
Query 2572 CCTAGTGGAGGAATCATAGCACTTGCTGATGCAGATGTACCAACTTCTGGTTCAAAATCT 2631
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2581 CCTAGTGGAGGAATCATAGCACTTGCTGATGCAGATGTACCAACTTCTGGTTCAAAATCT 2640
Query 2632 GCTGCATGTGGTCTTCTTGCATCTTTAGCAGAAGCCTCTAGTAAAGTGCACAGCGAACAC 2691
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2641 GCTGCATGTGGTCTTCTTGCATCTTTAGCAGAAGCCTCTAGTAAAGTGCACAGCGAACAC 2700
Query 2692 GGAGTTCCAGCATCATTTAAGGTTCCAACTGGAGTTGTCATACCTTTTGGATCGATGGAA 2751
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2701 GGAGTTCCGGCATCATTTAAGGTTCCAACTGGAGTTGTCATACCTTTTGGATCGATGGAA 2760
Query 2752 TTAGCTTTAAAGCAAAGTAATTCGGAAGAAAAGTTTGCGTTTTTGCTAGAAAAGCTAGAA 2811
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||
Sbjct 2761 TTAGCTTTAAAGCAAAATAATTCGGAAGAAAAGTTTGCGTCTTTGCTAGAAAAACTAGAA 2820
Query 2812 ACCGCCAGACCTGAGGGCGGTGAGCTAGACGACATATGTGACCAGATCCATGAAGTGATG 2871
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2821 ACCGCCAGACCTGAGGGTGGTGAGCTAGACGACATATGTGACCAGATCCATGAAGTGATG 2880
Query 2872 AAAACGCTGCAAGTGCCTGAAGAAACAATCAACAGCATAAGCAAAGCGTTTCCCAAAGAT 2931
|||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2881 AAAACGTTGCAAGTGCCTAAAGAAACAATCAACAGCATAAGCAAAGCGTTTCTCAAAGAT 2940
Query 2932 GCTCGTCTCATTGTGCGTTCAAGTGCTAACGTGGAGGACTTAGCCGGAATGTCAGCTGCA 2991
|||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2941 GCTCGTCTCATTGTTCGTTCAAGTGCTAACGTCGAGGACTTAGCCGGAATGTCAGCTGCA 3000
Query 2992 GGACTCTATGAATCAATCCCCAACGTGAGTCCCTCAGATCCTTTGGTGTTTTC-GAATTC 3050
|||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||
Sbjct 3001 GGACTCTATGAATCAATCCCTAACGTGAGTCCCTCGGATCCTTTGGTGTTTTCAGA-TTC 3059
Query 3051 GGTTTGCCAAGTTTGGGCTTCTCTCTACACAAGAAGAGCTGTTCTAAGCCGTAGAGCTGC 3110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3060 GGTTTGCCAAGTTTGGGCTTCTCTCTACACAAGAAGAGCTGTTCTAAGCCGTAGAGCTGC 3119
Query 3111 TGGTGTCTCTCAAAGAGAAGCTTCAATGGCAGTTCTCGTTCAAGAAATGCTTTCGCCGGA 3170
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3120 TGGTGTCTCTCAAAGAGAAGCTTCAATGGCTGTTCTCGTTCAAGAAATGCTTTCGCCGGA 3179
Query 3171 CTTATCATTTGTTTTGCACACAGTGAGTCCAGCTGATCCGGACAGTAACCTCGTGGAAGC 3230
||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3180 CTTATCATTCGTTCTGCACACAGTGAGTCCAGCTGATCCGGACAGTAACCTTGTGGAAGC 3239
Query 3231 CGAGATCGCTCCTGGTTTAGGTGAGACTTTAGCTTCAGGGACAAGAGGAACACCATGGAG 3290
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3240 CGAGATCGCTCCTGGTTTAGGTGAGACTTTAGCTTCAGGAACAAGAGGAACACCATGGAG 3299
Query 3291 ACTCGCTTCGGGTAAGCTCGATGGGATTGTACAAACCTTAGCTTTTGCAAACTTCAGCGA 3350
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3300 ACTCGCTTCGGGTAAGCTCGACGGGATTGTACAAACCTTAGCTTTCGCAAACTTCAGCGA 3359
Query 3351 AGAGCTTCTTGTGTCAGGAACAGGTCCCGCTGATGGTAAATATGTTCGGTTGACCGTCGA 3410
||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||
Sbjct 3360 AGAGCTTCTTGTGTCAGGAACAGGTCCTGCTGATGGAAAATACGTTCGGTTGACCGTGGA 3419
Query 3411 CTATAGCAAGAAACGGTTAACCGTTGACTCGGTGTTTAGACAGCAGCTCGGTCAGAGACT 3470
||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3420 CTATAGCAAAAAACGTTTAACTGTTGACTCGGTGTTTAGACAGCAGCTCGGTCAGAGACT 3479
Query 3471 CGGTTCGGTTGGTTTCTTCTTGGAAAGAAACTTTGGCTGTGCTCAAGACGTGGAAGGTTG 3530
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3480 CGGTTCGGTTGGTTTCTTCTTGGAAAGAAACTTTGGCTGTGCTCAAGACGTTGAAGGTTG 3539
Query 3531 TTTGGTTGGTGAAGATGTTTACATTGTTCAGTCAAGGCCACAACCTCTGTAGAATCTTTT 3590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3540 TTTGGTTGGTGAAGATGTTTACATTGTTCAGTCAAGGCCACAACCTCTGTAGAATCTTTT 3599
Query 3591 ATTTTCTATAAAGCGAATAATACAAAAAATG-TCAGAAATAAAATCTGCATTTGCTTCAT 3649
|| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |
Sbjct 3600 AT---CTATAAAGCGAATAATACAAAAAATGCT-AGAAATAAAATCTGCATTTGCCTCGT 3655
Query 3650 TACCATATGTGAAGTTATGTT 3670
|||||||||||||||||||||
Sbjct 3656 TACCATATGTGAAGTTATGTT 3676
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 182758173349
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5