BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg489516
Length=3218
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G26850.1 | Symbols: | Uncharacterized protein | chr5:944544... 5199 0.0
> AT5G26850.1 | Symbols: | Uncharacterized protein | chr5:9445440-9450819
FORWARD LENGTH=3284
Length=3284
Score = 5199 bits (2815), Expect = 0.0
Identities = 3054/3172 (96%), Gaps = 5/3172 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTTCTTTCTAGATTAATCAAA-TCTTTGAAACCAGTTTCTCACTTTGCTTCTCTCTTCAG 59
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||
Sbjct 13 TTTCTTTCTAGATTAATCAAATTCTTTGAAACCAGTTTCTCACTTCGCCTCTCTCTTCAG 72
Query 60 ATCTGTCCTCTGGAGCTCCAGAAAAATGGGGTTTATCTCGAGGAATGTATTTCCGGCGTG 119
||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||
Sbjct 73 ATCCGTCCTCTGTAGCTCTAGAACAATGGGGTTTATCTCTAGGAATGTGTTTCCGGCATG 132
Query 120 CGAGAGTATGTGCGTTTGCTGTCCTGCTCTCAGGTCGAGATCTCGACAGCCTGTCAAGCG 179
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 133 CGAGAGTATGTGCATTTGCTGTCCTGCTCTCAGGTCGAGATCTCGTCAGCCTGTCAAGCG 192
Query 180 TTACAAGAAATTGCTTGGTGAGATCTTCCCTAAATCCCCTGATGGTGCACCAAATGAGAG 239
||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 193 TTACAAGAAATTGCTCGGCGAGATCTTCCCTAAATCCCCTGATGGTGGACCAAATGAGAG 252
Query 240 AAAGATTGTCAAATTGTGCGAGTATGCTGCGAAA-AACCCAATCCGTATCCCTAAGATTG 298
|||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 253 AAAGATTGTCAAATTGTGTGAGTATGCTGC-AAAGAACCCAATCCGTATCCCTAAGATTG 311
Query 299 CTAAGTTTCTTGAAGAGAGGTGTTACAAGGACCTTCGATCTGAACAGATGAAGTTCATCA 358
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 312 CTAAGTTTCTTGAAGAGAGGTGTTACAAGGACCTTCGATCTGAACAGATGAAGTTCATCA 371
Query 359 ATATTGTCACCGAGGCTTACAACAAAATGCTTTGCCATTGCAAGGATCAGATGGCTTATT 418
|||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 372 ATATTGTCACTGAAGCTTACAACAAAATGCTTTGCCACTGCAAGGATCAGATGGCTTATT 431
Query 419 TCGCTACAAGTTTGCTGAATGTGGTTACGGAACTACTTGACAATTCAAAGCAGGACACAC 478
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 432 TCGCTACAAGTTTGCTGAATGTGGTTACGGAACTACTTGACAATTCAAAGCAGGACACAC 491
Query 479 CGACCATTCTTGCATGCCAAACATTGACGAGGTTCATTTACAGTCAGGTTGATGGAACTT 538
|||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 492 CGACCATTCTTGGATGCCAAACACTGACGAGGTTCATTTACAGCCAGGTTGATGGAACTT 551
Query 539 ATACACACAGCATTGAAAAATTTGCGCTGAAAGTTTGCTCATTAGCTCGTGAAGAAGGTG 598
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 552 ATACACACAGCATTGAAAAATTTGCGCTCAAAGTTTGCTCATTGGCTCGTGAAGAAGGTG 611
Query 599 AAGAACATCAAAAACAGTGTCTGAGAGCATCTGGCCTGCAATGCCTTTCAGCGATGGTGT 658
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 612 AGGAACATCAAAAACAGTGTCTGAGAGCATCTGGCCTGCAATGCCTGTCAGCGATGGTGT 671
Query 659 GGTATATGGGAGAGTTCTCACATATCTTTGCTACTGTTGATGAGATTGTACATGCCATTC 718
|||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 672 GGTATATGGGAGAGTTTTCACATATCTTCGCTACTGTTGATGAGATTGTACATGCCATTC 731
Query 719 TTGATAATTACGAGGCAGACATGATTGTTCAGACCAATGAAGACAGAGAAGAGCAAAATT 778
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 732 TTGATAATTACGAGGCAGACATGATTGTTCAGACAAATGAAGACAGAGAAGAGCAAAATT 791
Query 779 GTAACTGGGTGAATGAAGTGATTAGATGTGAAGGCCGAGGAACAACAGTTTGTAATAGCC 838
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 792 GTAACTGGGTAAATGAAGTGATTAGATGTGAAGGCCGAGGAACAACAATTTGTAATAGCC 851
Query 839 CTAGCTACATGATTGTCCGACCGAGGACTGCAAGAAAAGATCCGACTCTATTGACTAAAG 898
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 852 CTAGCTACATGATTGTCCGACCGAGAACTGCAAGAAAAGATCCGACTCTATTGACTAAAG 911
Query 899 AAGAGACTGAGATGCCCAAAGTTTGGGCACAGATTTGTCTCCAGAGGATGGTTGACCTGG 958
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 912 AAGAGACTGAGATGCCCAAAGTTTGGGCACAGATTTGTCTCCAGAGAATGGTTGACCTGG 971
Query 959 CTAAAGAAAGCACAACTTTGCGGCAAATATTGGATCCTATGTTCAGCTATTTTAATTCTA 1018
||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 972 CTAAAGAAAGCACAACTCTGCGGCAAATCTTGGATCCTATGTTCAGCTATTTTAATTCTA 1031
Query 1019 GACGCCAGTGGACTCCCCCAAATGGCCTGGCCATGATAGTTCTGTCTGATGCAGTATACT 1078
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1032 GACGCCAATGGACTCCCCCAAATGGCCTGGCCATGATAGTTCTGTCTGATGCAGTATACT 1091
Query 1079 TGATGGAAACCTCTGGGAGTCAGCAGTTGGTGTTGTCGACTGTTGTACGCTATCTTGACA 1138
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||
Sbjct 1092 TGATGGAAACCTCTGGGAGTCAGCAGTTGGTGTTGTCGACTGTTGTACGCCATCTGGACA 1151
Query 1139 ATAAGCATGTTGCCAATGACCCTGAGCTCAAGGCTTATATCATACAAGTTGCTGGTTGTC 1198
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1152 ATAAGCATGTTGCCAATGACCCTGAGCTCAAGGCTTATATCATACAAGTTGCTGGTTGTC 1211
Query 1199 TTGCAAAGCTGATCAGGACCAGCTCGTATCTCAGGGACATAAGTTTTGTTAATGACTTGT 1258
| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1212 TAGCAAAGCTGATCAGGACCAGCTCGTATCTTAGGGACATAAGTTTTGTTAATGACTTGT 1271
Query 1259 GTCGGCACCTAAGGAAAAGCTTTCAGGCGACATCTAGATCAATCGGAGATGAGGAACTCA 1318
|||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1272 GTCGCCACCTGAGGAAAAGCTTTCAGGCGACAGCTAGATCAATTGGAGATGAGGAACTCA 1331
Query 1319 ACTTGAACGTGATGCTTCAAAACTCTATTGAAGATTGTCTGCGGGAGATAGCCAAAGGAA 1378
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1332 ACTTGAACGTGATGATTCAAAACTCTATTGAAGATTGTCTGCGGGAGATAGCCAAAGGAA 1391
Query 1379 TTGTTAATACACAGCCCTTGTTCGATATGATGGCTGTTTCAGTCGAGGGGATTCCTTCTT 1438
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1392 TTGTTAATACACAGCCCCTGTTCGATATGATGGCTGTTTCAGTCGAGGGTCTTCCTTCTT 1451
Query 1439 CAGGAATTGTTTCACGTGCAGCGGTTGGATCACTGTTGATACTTGCTCATGCAATGTCTT 1498
|||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1452 CAGGAATTGTTTCACGCGCAGCCGTTGGATCACTGTTGATACTTGCACATGCAATGTCTT 1511
Query 1499 CAGCATTATCGCCATCTATGCGGTCACAACAGGTCTTCCCTGACACACTTCTTGATGCGC 1558
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1512 CAGCATTATCGCCATCTATGCGTTCACAACAGGTCTTCCCTGACACACTTCTTGATGCAC 1571
Query 1559 TTCTAAAAGCAATGCTGCATCCAAATGTGGAAACTCGTGTAGGAGCGCATGAAATATTCT 1618
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1572 TTCTAAAAGCAATGCTGCATCCAAATGTGGAAACCCGTGTAGGAGCGCATGAAATATTCT 1631
Query 1619 CTGTAATTCTCTTGCAAAGTTCTGGTCAATCTCAGGCTGGACTTGCATCAGTGAGAGCTT 1678
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1632 CTGTAATTCTCTTGCAAAGTTCTGGTCAATCTCAGGCTGGACTTGCATCAGTGAGAGCTT 1691
Query 1679 CTGGCTATCTTAATGAATCAAGAAACTGGAGGAGCGATACAACCTCTGCGTTCACATCTG 1738
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1692 CTGGCTATCTTAATGAATCAAGAAACTGGAGGAGTGATACAACCTCTGCGTTCACATCTG 1751
Query 1739 TCACTGCTCGATTAGACAAGCTCAGGAAGGAGAAGGATGGCGTCAAGATTGAGAAGAATG 1798
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1752 TCACTGCTCGTTTAGACAAGCTCAGGAAGGAGAAGGATGGCGTCAAGATTGAGAAGAATG 1811
Query 1799 GTTACAATAATACTCACGAGGATCTTAAGAACTACAAATCGTCCCCAAAATTTCACAAGT 1858
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1812 GTTACAATAATACTCACGAGGATCTTAAGAACTACAAATCGTCCCCAAAGTTTCACAAGT 1871
Query 1859 TGAATTCCATAATTGATAGGACTGCTGCGTTTATCAATCTAGCTGATATGTTACCATCAA 1918
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1872 TGAATTCCATAATTGATAGGACTGCTGGGTTTATCAATCTAGCTGATATGTTACCATCGA 1931
Query 1919 TGATGAAGTTTACCGAAGATCAAATCGGGCAATTGTTATCTGCATTTTGGATACAATCAG 1978
||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1932 TGATGAAGTTTACGGAAGATCAAATCGGGCAACTGTTATCTGCATTTTGGATACAATCAG 1991
Query 1979 CACTTCCCGATATCTTACCTTCAAACATTGAAGCTATTGCTCATTCTTTCAGCTTGGTGC 2038
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1992 CACTTCCTGATATCTTACCTTCAAACATTGAAGCTATTGCTCATTCTTTTAGCTTGGTGC 2051
Query 2039 TTCTGTCCTTGCGGCTTAAGAATCCTGATGACGGGCTTGTTGTTCGAGCCTTCCAGCTTC 2098
||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2052 TTCTGTCCTTGCGACTAAAGAATCCTGATGACGGGCTTGTTGTTCGAGCCTTCCAGCTTC 2111
Query 2099 TCTTCTCATTGAGGAATCTTTCTTTGGACCTTAATAACGGCACATTACCCTCAGTTTGCA 2158
||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2112 TCTTCTCATTGAGGACTCTTTCGTTGGACCTTAATAACGGCACATTACCCTCAGTTTGCA 2171
Query 2159 AGAGGTTAATCCTTGCTTTATCCACAAGTACGTTGATGTTTGCTGCCAAAATATATCAGA 2218
|| |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2172 AGCGGTTGATCCTTGCTTTATCCACAAGTATGCTGATGTTCGCTGCCAAAATATATCAGA 2231
Query 2219 TTCCTCATATTTGCGAAATGCTGAAGGCCCAACTTCCTGGTGATGTGGATCCTTATCTAT 2278
||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2232 TTCCTCATATTTGTGAAATGTTGAAGGCCCAACTTCCTGGTGATGTGGATCCTTATCTTT 2291
Query 2279 TCATTGGAGATGACTTACAACTTCACGTGAGACCACAGGCAAATATGAAAGATTTTGGGT 2338
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2292 TCATTGGAGATGACTTACAACTTCACGTAAGACCACAGGCAAATATGAAAGATTTTGGGT 2351
Query 2339 CCTCAAGCGATAGCCAGATGGCTACTTCAATGCTGTTTGAGATGCGAAGCAAAGTAGAAC 2398
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2352 CCTCAAGCGATAGCCAGATGGCTACTTCAATGCTGTTTGAGATGCGAAGCAAAGTAGAAC 2411
Query 2399 TGTCCAACACTATTATAATTGATATTGTCGCAAAAAATCTATCTAACCTTTCAAAGCTTG 2458
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |
Sbjct 2412 TGTCCAACACTATTATAACCGATATTGTCGCAAAAAATCTACCTAAACTTTCGAAGCTCG 2471
Query 2459 AGGAAGCTGATGTAAAGATGCAAATCTTGGAGCCATTCACACCTGATGATGCCTTTATGT 2518
||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||
Sbjct 2472 AGGAAGCTGATGTGAAGATGCAAATCTTGGAGCAATTTACACCTGATGATGCTTTTATGT 2531
Query 2519 TTGGATCACGGCCAAACATTGAACCTCAACCAAACCAAAGTATCTCTAAGGAATCGCTGT 2578
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2532 TTGGATCAAGGCCAAACATTGAACCTCAACCAAACCAAAGTATCTCTAAGGAATCGCTGT 2591
Query 2579 CCTTCGATGAGGACATACCTGCAGGTTCAATGGTTGAAGACGAAGTGACGAGTGAACTCT 2638
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2592 CCTTCGATGAGGACATACCTGCCGGTTCAATGGTTGAGGACGAAGTGACGAGTGAACTCT 2651
Query 2639 TTGTGCGTTTTCCCCCAAGAGGTTCTCCTTCACCAACTATTCCTCAAGTTATCAGCATTG 2698
||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2652 CTGTGCGTTTCCCCCCAAGAGGATCTCCCTCACCATCTATTCCTCAAGTTATCAGCATTG 2711
Query 2699 GCCAGCTCATGGAGTCTGCGCTTGAGGTCGCTGGTCAAGTGGTTGGGTCATCTGTCTCTA 2758
| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2712 GACAGCTCATGGAATCTGCGCTTGAGGTCGCTGGTCAAGTGGTTGGGTCATCTGTCTCTA 2771
Query 2759 CTTCACCACTTTCTTATGATACAATGACAAACCGCTGTGAAACCTTTGGGACTGGTACTA 2818
|||| || ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2772 CTTCTCCGCTTCCTTATGACACAATGACTAACCGCTGTGAAACCTTTGGGACTGGTACTA 2831
Query 2819 GACAGAAGCTCTCAAGGTGGTTGGCCACTGAGAACCGCCAGATGAATGGGCTCTACAGAA 2878
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct 2832 GAGAGAAGCTCTCAAGGTGGTTGGCCACTGAGAACCGTCAGATGAATGGGCTCTATGGAA 2891
Query 2879 ATTCA-TCAGAGGAATCATCTGCACTTGAGAAGGTAGTAGAAGATGGTAACATCTATGGG 2937
||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2892 ATTCACTT-GAGGAATCATCTGCACTTGAGAAGGTAGTAGAAGATGGGAACATCTATGGG 2950
Query 2938 AGAGAATCTGGAATGTTGCAGGATTCATGGTCCATGATGAGACTACCTCCAGCTAGTCCC 2997
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2951 AGAGAATCTGGAATGTTGCAGGATTCATGGTCCATGATGAGACTACCTCCAGCTAGTCCC 3010
Query 2998 TTTGACAATTTCCTCAAAGCAGCAGGAGCAGGAAGATGATTCAACTAACTTGATCCTATA 3057
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3011 TTTGACAATTTCCTCAAAGCAGCAGGAGCTGGAAGATGATTCAACTAACTTGATCATATC 3070
Query 3058 AATCTCTGTAGAAAGTGTGTAATCTTGTTGTTGTTATTGGATTTGTAGAGAACTAACTTA 3117
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3071 AATCTCTGTAGAAAGTGTGTAATCTTGTTGTTCTTATTGGATTTGTAGAGAACTAACTTA 3130
Query 3118 TCTAGGGCCAATCACGATGCTTCTTGTAGTAATCTAGAATCAGTACTCAGTA 3169
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||
Sbjct 3131 TCTAGGGCCAATCACGATGCTTCTCGTAGTAATCTAGAATCAGTAGTAAGTA 3182
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 160082715113
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5