BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg489563
Length=2255
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G25780.1 | Symbols: EIF3B-2, EIF3B, ATEIF3B-2 | eukaryotic t... 3373 0.0
AT5G27640.2 | Symbols: TIF3B1, EIF3B, ATEIF3B-1, EIF3B-1, ATTIF... 3031 0.0
> AT5G25780.1 | Symbols: EIF3B-2, EIF3B, ATEIF3B-2 | eukaryotic
translation initiation factor 3B-2 | chr5:8973267-8976869 REVERSE
LENGTH=2409
Length=2409
Score = 3373 bits (1826), Expect = 0.0
Identities = 2122/2265 (94%), Gaps = 19/2265 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 ctctctctctctctctttcctcaaatcttcttcttcttcttc-at-tc-ttTG-GCAG-A 56
|||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | || || || ||| | || |
Sbjct 33 CTCTCTCTCTCTCTCTATCCTCAAAGCTTCTTCTTC--C-TCGATATCGATTGAG-AGAA 88
Query 57 TTTTTGATCTAAAGTTTTGAAATCAT---GGAGGTCGTTGATATTGATGCT-CGAGCAGC 112
|| | ||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||||| | | | ||||
Sbjct 89 ACTTCGTTCT-AAGATTCGAAATCATGGCGGCGGTTGTTGATATTGATG-TCCTAACAGC 146
Query 113 TAAGTTAGGGATTAATTGGTCTCAGGTTAATTTTGATTCCATCCAACTTCCTCCTGGAGA 172
| ||||||||||||||||||| | |||||| | ||||| |||||||||||||||||| |
Sbjct 147 TCAGTTAGGGATTAATTGGTCAGATGTTAATCTCGATTCAATCCAACTTCCTCCTGGA-A 205
Query 173 A-GACTTTGGGATTGAGAGTGATGATG-AAGCTGTTTACCACGATGACCAGTCAGAATTC 230
| ||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 206 ACGACTTTGGGATCGAAAGTGATGATGAAAG-TGTTTACCAAGATGACCAGTCAGAATTC 264
Query 231 GACACTGGATTCGGTAACATTATCGTGGTTGATCACCTCCCTGTTGTTCCCAAGGAGAAG 290
|||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 265 GACACTGGATTCGGTAACATTATCGTTGTCGATCACCTCCCTGTTGTTCCCAAGGAGAAG 324
Query 291 TTTGAGAAACTTGAAGGTGTTGTCAAGAAAATTTACAACCAGTTAGGTGTGATCAAGGAA 350
||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 325 TTTGAGAAACTAGAAGGTGTTGTTAAGAAAATTTACAACCAGTTAGGTGTGATTAAGGAA 384
Query 351 AATGGACTGTGGATGCCCGTTGATCCCGACACCAAGATGACATTGGGCTACTGTTTTATT 410
|||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 385 AATGGACTGTTGATGCCCGTTGATCCCGATACTAAGATGACATTGGGCTACTGTTTTATT 444
Query 411 GAGTTCAATACTCCTCAGGAAGCACAAAACGCTAAGGAAAAGTCTCATGGCTACAAGTTG 470
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GAGTTCAACACTCCTCAGGAAGCACAAAACGCTAAGGAAAAGTCTCATGGCTACAAGTTG 504
Query 471 GACAAGTCTCACATCTTTGCTGTAAACATGTTCGATGATTTCGACAGGTTGATGAATGTG 530
|||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 505 GACAAGTCTCACATATTTGCTGTTAATATGTTCGATGATTTCGATAGGTTGATGAATGTG 564
Query 531 CGGGAGGAGTGGGAGCCTCCTCAGGCCAGGCCATATGTCCCTGGGGAAAATTTACAAAAG 590
||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| || |||
Sbjct 565 AAGGAGGAGTGGGAGCCTCCTCAAGAAAGGCCCTATGTCCCTGGGGAAAATTTGCAGAAG 624
Query 591 TGGCTTACTGATGACAAAGCCCGGGACCAGCTAGTTATTCGTTCTGGCCCTGATACTGAA 650
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||
Sbjct 625 TGGCTTACTGATGACAAAGCCCGGGACCAGCTAGTCATTCGTTTTGGCCATGATACTGAA 684
Query 651 GTTTACTGGAATGATGCTAGGCAGAAGAAGCCTGAACCTGTTCATAAGCGTCCTTATTGG 710
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 685 GTTTACTGGAATGATGCTAGGCAGAAGAAGCCTGAACCTGTTCATAAGCGTTCTTATTGG 744
Query 711 ACAGAGAGTTATGTGCAGTGGTCTCCTTTAGGTACATACCTTGTGACACTTCACAAGCAG 770
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 745 ACAGAGAGTTATGTGCAGTGGTCTCCAATAGGTACATACCTTGTGACACTTCACAAGCAG 804
Query 771 GGGGCAGCTGTTTGGGGTGGTGCTGATACATTCACACGTCTCATGCGTTATCAGCATTCT 830
|||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||
Sbjct 805 GGGGCAGCTGTTTGGGGTGGTGCTGATACATTTACGCGTCTCATGCGTTATCAGCATTCA 864
Query 831 ATGGTTAAACTAGTTGATTTCTCACCAGGTGAGAAATATCTGGTAACTTACCACAGCCAA 890
||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||
Sbjct 865 ATGGTCAAACTAGTTGATTTCTCGCCTGGTGAGAAATATCTTGTAACTTACCATAGCCAA 924
Query 891 GAACCAAGCAACCCGCGGGATGCAAGTAAAGTAGAGATTAAGGTTTTTGATGTGAGAACT 950
||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 925 GAACCAAGCAATCCGAGAGATGCAAGTAAAGTAGAGATTAAGGTCTTTGATGTGAGAACC 984
Query 951 GGGAGGATGATGAGAGATTTCAAGGGTAGTGCTGATGAGTTTTCAATTGGAGGACCTGGT 1010
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 985 GGGAGGATGATGAGAGATTTCAAGGGTAGTGCTGATGAGTTTTCAATTGGAGGACCTGGT 1044
Query 1011 GGTGTTGCTGGTGCCTCTTGGCCTGTTTTCAGATGGGCTGGTGGAAAAGATGATAAATAC 1070
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1045 GGTGTTGCTGGTGCCTCTTGGCCTGTTTTCAGATGGGCTGGCGGAAAAGATGATAAATAC 1104
Query 1071 TTTGCCAAGCTTAGCAAAAACACTATCTCCGTCTATGAGACTGAGACTTTCAGCCTAATA 1130
||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1105 TTTGCCAAGCTGAGCAAAAACACTATCTCTGTCTATGAGACTGAGACTTTCAGCCTAATA 1164
Query 1131 GACAAGAAATCCATGAAGGTTGATAATGTTGTGGATATCTGCTGGTCTCCTACTGATTCC 1190
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||
Sbjct 1165 GACAAGAAATCCATGAAGGTTGATAATGTTGTGGATATTTGCTGGTCTCCCACTGATTCA 1224
Query 1191 ATCCTTTCATTGTTTGTTCCTGAACAAGGTGGTGGAAACCAACCTGCCAAGGTCGCTCTA 1250
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||
Sbjct 1225 ATCCTTTCATTGTTTGTTCCTGAACAAGGTGGTGGAAACCAACCAGCCAAGGTTGCTCTA 1284
Query 1251 GTCCAAATCCCGAGCAAGGTGGAGCTGAGGCAGAAGAATCTCTTCAGTGTGAGCGACTGC 1310
|||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1285 GTCCAAATCCCGAGTAAGGTAGAGCTGAGGCAGAAGAATCTCTTCAGTGTGAGCGACTGC 1344
Query 1311 AAGATGTACTGGCAGAGTAGTGGAGAGTATCTTGCTGTCAAGGTTGATCGGTACACGAAA 1370
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||
Sbjct 1345 AAGATGTACTGGCAGAGTAGTGGAGAGTATCTTGCTGTTAAGGTTGATCGATACACAAAA 1404
Query 1371 ACTAAGAAGAGCACATACTCTGGATTTGAGCTTTTCCGTATCAAAGAAAGGGATATTCCC 1430
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1405 ACTAAGAAGAGTACATACTCTGGATTTGAGCTTTTCCGTATCAAAGAAAGGGATATTCCA 1464
Query 1431 ATCGAGGTTCTTGAGCTGGACAACAAGAACGACAAGATCATTGCTTTCGCGTGGGAGCCC 1490
|||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1465 ATCGAGGTTCTTGAGCTGGATAACAAGAACGATAAGATCATTGCTTTCGCGTGGGAGCCC 1524
Query 1491 AAGGGTCACAGGTTTGCTGTGATTCATGGTGACCAACCAAGACCAGACGTCAGTTTCTAC 1550
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||
Sbjct 1525 AAGGGTCACAGGTTTGCTGTGATTCATGGTGACCAGCCAAGACCGGATGTTAGTTTCTAC 1584
Query 1551 TCAATGAAGACCACACAAAACACTGGAAGGGTTTCAAAGCTCGCAACTTTGAAGGCCAAA 1610
|| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1585 TCGATGAAGACTGCACAAAACACTGGAAGAGTTTCAAAGCTCGCAACTTTGAAGGCCAAA 1644
Query 1611 CAAGCTAATGCCCTCTTCTGGTCGCCCACAGGCAAGTACATAATTCTTGCTGGGTTAAAA 1670
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1645 CAAGCCAATGCCCTCTTCTGGTCGCCCACAGGCAAGTACATCATTCTTGCTGGGTTAAAA 1704
Query 1671 GGTTTCAATGGCCAGCTTGAGTTTTTCAACGTGGATGAGCTCGAGACAATGGCCACAGCT 1730
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1705 GGTTTCAATGGCCAGCTTGAATTTTTCAACGTGGATGAGCTCGAGACAATGGCCACAGCT 1764
Query 1731 GAACACTTCATGGCCACTGATATCGAATGGGACCCGACTGGAAGGTACGTAGCAACCGCG 1790
||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |
Sbjct 1765 GAACACTTCATGGCCACAGATATCGAATGGGACCCAACTGGAAGGTACGTTGCAACCTCA 1824
Query 1791 GTGACATCAGTCCACGAGATGGAGAATGGGTTCACCATATGGTCTTTCAACGGGATTGTG 1850
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||
Sbjct 1825 GTGACAACAGTCCACGAGATGGAGAATGGGTTCACCATATGGTCTTTCAATGGGAATATG 1884
Query 1851 ATTTACCGGATACTGAAGGATCATTTCTTCCAGTTGGCCTGGCGTCCAAGACCGCCATCA 1910
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||
Sbjct 1885 GTTTACCGGATACTGAAGGATCATTTCTTCCAGTTGGCTTGGCGTCCAAGACCGGCATCA 1944
Query 1911 TTCTTGACTGCAGAGAAGGAAGAAGAGATAGCAAAGAACCTGAAGAAGTACAGCAAGAAG 1970
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |
Sbjct 1945 TTCTTGACTGCGGAGAAGGAAGAAGAGATAGCAAAGAACCTGAGGAATTACAGCAAGAGG 2004
Query 1971 TATGAGGCAGAGGATCAGGACGTGTCGTTGCTGTTGAGTGAACAAGACAGAGAGAAGAGG 2030
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2005 TATGAGGCAGAGGATCAGGACGTGTCGTTGCTATTGAGTGAACAAGACAGAGAGAAGAGG 2064
Query 2031 AAGGCATTAAAGGAAGAATGGGAGAAATGGGTGATGCAGTGGAAGGCTCTGCATGAAGAG 2090
| |||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2065 AGGGCATTGAATGAAGAGTGGCAGAAATGGGTGATGCAGTGGAAGTCTCTGCATGAAGAG 2124
Query 2091 GAGAAACTCGCGAGGCAAAATCTTCGGGATGGTGAAGTTAGTGATGTGGAAGAAGATGAG 2150
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2125 GAGAAACTCGTGAGGCAAAATCTTCGGGATGGTGAAGTTAGTGATGTGGAAGAAGATGAG 2184
Query 2151 TATGAAGCCAAAGAAGTTGAGTTTGAGGATCTTATTGATGTCACTGAGGAAATCGTTCAG 2210
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||
Sbjct 2185 TATGAAGCCAAAGAAGTTGAGTTTGAGGATCTTATTGATGTTACTGAGGAAATTGTTCAA 2244
Query 2211 GAGTCGATGTAAGATACTCTGTCTCTTTTGTTGCCCTCTCTGAGT 2255
|||| |||||||| | ||| |||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 2245 GAGTTGATGTAAGTTTCTCGGTCTCTTTTGTTACCCTCTCTTAGT 2289
> AT5G27640.2 | Symbols: TIF3B1, EIF3B, ATEIF3B-1, EIF3B-1, ATTIF3B1
| translation initiation factor 3B1 | chr5:9781010-9785288
REVERSE LENGTH=2536
Length=2536
Score = 3031 bits (1641), Expect = 0.0
Identities = 1765/1826 (97%), Gaps = 3/1826 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 426 CAGGAAGCACAAAACGCTAAGGAAAAGTCTCATGGCTACAAGTTGGACAAGTCTCACATC 485
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 546 CAGGAAGCACAAAACGCTAAGGAAAAGTCTCATGGCTACAAGTTGGACAAGTCTCACATC 605
Query 486 TTTGCTGTAAACATGTTCGATGATTTCGACAGGTTGATGAATGTGCGGGAGGAGTGGGAG 545
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 606 TTTGCTGTAAACATGTTCGATGATTTTGACAGGTTGATGAATGTGAAGGAGGAGTGGGAG 665
Query 546 CCTCCTCAGGCCAGGCCATATGTCCCTGGGGAAAATTTACAAAAGTGGCTTACTGATGAC 605
||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 666 CCTCCTCAGGCCAGGCCCTACGTCCCTGGGGAAAATTTGCAAAAATGGCTTACTGATGAA 725
Query 606 AAAGCCCGGGACCAGCTAGTTATTCGTTCTGGCCCTGATACTGAAGTTTACTGGAATGAT 665
|||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 726 AAAGCCCGAGACCAGCTAGTCATTCGTTCTGGCCCTGATACTGAAGTTTTCTGGAATGAT 785
Query 666 GCTAGGCAGAAGAAGCCTGAACCTGTTCATAAGCGTCCTTATTGGACAGAGAGTTATGTG 725
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 786 ACTAGGCAGAAGGCGCCTGAACCTGTTCATAAGCGTCCTTATTGGACAGAGAGTTATGTG 845
Query 726 CAGTGGTCTCCTTTAGGTACATACCTTGTGACACTTCACAAGCAGGGGGCAGCTGTTTGG 785
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 846 CAGTGGTCTCCTTTAGGTACATACCTTGTGACACTCCACAAGCAGGGGGCAGCTGTTTGG 905
Query 786 GGTGGTGCTGATACATTCACACGTCTCATGCGTTATCAGCATTCTATGGTTAAACTAGTT 845
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 906 GGTGGTGCTGATACATTCACGCGTCTCATGCGTTATCAGCATTCTATGGTAAAACTAGTT 965
Query 846 GATTTCTCACCAGGTGAGAAATATCTGGTAACTTACCACAGCCAAGAACCAAGCAACCCG 905
|||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 966 GATTTCTCGCCAGGTGAGAAATATCTTGTAACTTACCATAGCCAAGAACCAAGCAACCCG 1025
Query 906 CGGGATGCAAGTAAAGTAGAGATTAAGGTTTTTGATGTGAGAACTGGGAGGATGATGAGA 965
|| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1026 CGAGATGCAAGTAAAGTTGAGATTAAGGTTTTTGATGTGAGAACCGGGAGGATGATGAGA 1085
Query 966 GATTTCAAGGGTAGTGCTGATGAGTTTTCAATTGGAGGACCTGGTGGTGTTGCTGGTGCC 1025
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1086 GATTTCAAGGGTAGTGCTGATGAGTTTTCAATTGGAGGACCTGGTGGTGTTGCTGGTGCC 1145
Query 1026 TCTTGGCCTGTTTTCAGATGGGCTGGTGGAAAAGATGATAAATACTTTGCCAAGCTTAGC 1085
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1146 TCTTGGCCTGTTTTCAGATGGGCTGGTGGAAAAGATGATAAATACTTTGCCAAGCTTAGC 1205
Query 1086 AAAAACACTATCTCCGTCTATGAGACTGAGACTTTCAGCCTAATAGACAAGAAATCCATG 1145
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1206 AAAAACACTATCTCTGTCTATGAGACTGAGACTTTCAGCCTAATAGACAAGAAATCCATG 1265
Query 1146 AAGGTTGATAATGTTGTGGATATCTGCTGGTCTCCTACTGATTCCATCCTTTCATTGTTT 1205
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1266 AAGGTAGATAATGTTGTGGATATCTGCTGGTCTCCTACTGATTCCATCCTTTCATTGTTT 1325
Query 1206 GTTCCTGAACAAGGTGGTGGAAACCAACCTGCCAAGGTCGCTCTAGTCCAAATCCCGAGC 1265
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct 1326 GTTCCTGAACAAGGTGGTGGAAACCAACCTGCGAAGGTTGCCCTAGTCCAAATCCCGAGC 1385
Query 1266 AAGGTGGAGCTGAGGCAGAAGAATCTCTTCAGTGTGAGCGACTGCAAGATGTACTGGCAG 1325
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1386 AAGGTGGAGCTGAGGCAGAAGAATCTCTTCAGTGTGAGCGACTGCAAGATGTACTGGCAG 1445
Query 1326 AGTAGTGGAGAGTATCTTGCTGTCAAGGTTGATCGGTACACGAAAACTAAGAAGAGCACA 1385
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1446 AGTAGTGGAGAGTATCTTGCTGTCAAGGTTGATCGATACACAAAAACTAAGAAGAGCACA 1505
Query 1386 TACTCTGGATTTGAGCTTTTCCGTATCAAAGAAAGGGATATTCCCATCGAGGTTCTTGAG 1445
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1506 TACTCTGGATTTGAACTTTTCCGTATCAAAGAAAGGGATATTCCCATCGAGGTTCTTGAG 1565
Query 1446 CTGGACAACAAGAACGACAAGATCATTGCTTTCGCGTGGGAGCCCAAGGGTCACAGGTTT 1505
|||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1566 CTGGACAACAAGAACGACAAGATCATTGCTTTTGCATGGGAGCCCAAGGGTCACAGGTTT 1625
Query 1506 GCTGTGATTCATGGTGACCAACCAAGACCAGACGTCAGTTTCTACTCAATGAAGACCACA 1565
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1626 GCTGTGATTCATGGTGACCAACCAAGACCAGATGTCAGTTTCTACTCAATGAAGACCGCA 1685
Query 1566 CAAAACACTGGAAGGGTTTCAAAGCTCGCAACTTTGAAGGCCAAACAAGCTAATGCCCTC 1625
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1686 CAAAACACTGGAAGGGTTTCAAAGCTCGCAACTTTGAAGGCCAAACAAGCTAATGCCCTC 1745
Query 1626 TTCTGGTCGCCCACAGGCAAGTACATAATTCTTGCTGGGTTAAAAGGTTTCAATGGCCAG 1685
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1746 TTCTGGTCGCCCACAGGCAAGTACATAATTCTTGCTGGGTTAAAAGGTTTCAATGGCCAG 1805
Query 1686 CTTGAGTTTTTCAACGTGGATGAGCTCGAGACAATGGCCACAGCTGAACACTTCATGGCC 1745
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1806 CTTGAATTTTTCAACGTGGATGAGCTCGAGACAATGGCCACAGCTGAACACTTCATGGCC 1865
Query 1746 ACTGATATCGAATGGGACCCGACTGGAAGGTACGTAGCAACCGCGGTGACATCAGTCCAC 1805
|| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1866 ACGGATATCGAATGGGACCCGACTGGAAGGTACGTTGCAACCGCAGTGACATCAGTCCAT 1925
Query 1806 GAGATGGAGAATGGGTTCACCATATGGTCTTTCAACGGGATTGTGATTTACCGGATACTG 1865
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||
Sbjct 1926 GAGATGGAGAATGGGTTCACCATATGGTCTTTCAACGGGATTATGCTTTACCGGATATTG 1985
Query 1866 AAGGATCATTTCTTCCAGTTGGCCTGGCGTCCAAGACCGCCATCATTCTTGACTGCAGAG 1925
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1986 AAGGATCATTTCTTCCAGTTGGCTTGGCGTCCAAGACCTCCATCATTCTTGACTGCAGAG 2045
Query 1926 AAGGAAGAAGAGATAGCAAAGAACCTGAAGAAGTACAGCAAGAAGTATGAGGCAGAGGAT 1985
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2046 AAGGAAGAAGAGATAGCAAAGACCCTGAAGAAGTACAGCAAGAAGTATGAGGCAGAGGAT 2105
Query 1986 CAGGACGTGTCGTTGCTGTTGAGTGAACAAGACAGAGAGAAGAGGAAGGCATTAAAGGAA 2045
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||
Sbjct 2106 CAGGACGTGTCGTTGCTGTTGAGTGAACAAGACAGAGAGAAGAGAAAGGCATTGAAGGAA 2165
Query 2046 GAATGGGAGAAATGGGTGATGCAGTGGAAGGCTCTGCATGAAGAGGAGAAACTCGCGAGG 2105
||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2166 GAATGGGAGAAATGGGTAATGCAGTGGAAGTCTCTGCATGAAGAGGAGAAACTCGTGAGG 2225
Query 2106 CAAAATCTTCGGGATGGTGAAGTTAGTGATGTGGAAGAAGATGAGTATGAAGCCAAAGAA 2165
||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2226 CAAAACCTTCGGGATGGTGAAGTAAGTGATGTGGAAGAAGATGAATATGAAGCCAAAGAA 2285
Query 2166 GTTGAGTTTGAGGATCTTATTGATGTCACTGAGGAAATCGTTCAGGAGTCGATGTAAGAT 2225
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||
Sbjct 2286 GTTGAGTTTGAGGATCTTATCGATGTCACTGAGGAAATCGTTCAAGAGTCG-T--AAGAT 2342
Query 2226 ACTCTGTCTCTTTTGTTGCCCTCTCT 2251
|||| ||||||||||||||| |||||
Sbjct 2343 ACTCGGTCTCTTTTGTTGCCATCTCT 2368
Score = 614 bits (332), Expect = 1e-174
Identities = 363/378 (96%), Gaps = 1/378 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 55 GATTTTTGATCTAAAGTTTTGAAATCATGGAGGTCGTTGATATTGATGCTCGAGCAGCTA 114
|||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||
Sbjct 98 GATTTTTGATAT-AAGGTTTGAAATCATGGAGGTCGTTGATATTGATGCCCGAGCTGCTA 156
Query 115 AGTTAGGGATTAATTGGTCTCAGGTTAATTTTGATTCCATCCAACTTCCTCCTGGAGAAG 174
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 157 AGTTAGGGATTGATTGGTCTCAGGTTAATTTTGATTCCATCCAACTTCCTCCTGGAGAAG 216
Query 175 ACTTTGGGATTGAGAGTGATGATGAAGCTGTTTACCACGATGACCAGTCAGAATTCGACA 234
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||
Sbjct 217 ACTTTGGGATCGAGAGTGATGATGAAGCTGTTTACCAGGATGACCAGTCTGAATTCGACA 276
Query 235 CTGGATTCGGTAACATTATCGTGGTTGATCACCTCCCTGTTGTTCCCAAGGAGAAGTTTG 294
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 277 CTGGATTCGGTAACATTATCGTGGTCGATCACCTCCCTGTTGTTCCCAAGGAGAAGTTTG 336
Query 295 AGAAACTTGAAGGTGTTGTCAAGAAAATTTACAACCAGTTAGGTGTGATCAAGGAAAATG 354
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 337 AGAAACTTGAAGGTGTTGTCAAGAAAATTTACAACCAGTTAGGTGTGATTAAGGAAAATG 396
Query 355 GACTGTGGATGCCCGTTGATCCCGACACCAAGATGACATTGGGCTACTGTTTTATTGAGT 414
||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 397 GACTGTGGATGCCTGTTGATCCCGATACCAAGATGACATTGGGCTACTGTTTTATTGAGT 456
Query 415 TCAATACTCCTCAGGAAG 432
|||| ||||||||| |||
Sbjct 457 TCAACACTCCTCAGAAAG 474
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 111897014805
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5