BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg490214
Length=5798
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT4G03550.1 | Symbols: ATGSL05, GSL05, ATGSL5, PMR4, GSL5 | glu... 7461 0.0
> AT4G03550.1 | Symbols: ATGSL05, GSL05, ATGSL5, PMR4, GSL5 | glucan
synthase-like 5 | chr4:1573348-1579696 FORWARD LENGTH=5835
Length=5835
Score = 7461 bits (4040), Expect = 0.0
Identities = 4281/4396 (97%), Gaps = 22/4396 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGAAACTGAAACGCGGAAAGGAGGCAAAA-----TCGTC-TC---GTCGCCGTCTTCATC 51
||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||
Sbjct 1 AGAAACTGAAACGCGGAAAGGAGGCAAAATCTTCTCGTCGTCGTTGTCGCCGTCTTCA-G 59
Query 52 AGCTACAAACG--AAAACTCGCTTCCGTTTCGATTTATTTCTCCATTGTTATTG---ATT 106
||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||
Sbjct 60 AGCTACAAACGAAAAAACTCGCTTCCGTTTCG----ATTTCTCCATTGTTATTGTTTCTT 115
Query 107 CAGTCAAGC-TTTTTCTCCGAGAAATTTCCAAGATCTACCACATGCTACTATGAGCCTCC 165
|||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 116 CAGTGAAGCTTTTTTCTTCGAGAAATTTCTAAGATCTACCACATGCTACTATGAGCCTCC 175
Query 166 GCCACCGCACCGTCCCGCCGCAAACCGGACGGCCGTTGGCGGCGGATGCTGCCGGAATCG 225
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||
Sbjct 176 GCCACCGCACCGTCCCGCCGCAAACCGGACGGCCGTTGGCGGCGGAAGCTGTCGGAATCG 235
Query 226 AAGAGGAATCGTACAATATCATTCCCGTTAACAACCTCCTCGCCGACCATCCTTCTCTCC 285
||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 236 AAGAGGAGCCGTACAATATCATTCCCGTTAACAATCTCCTCGCCGACCATCCTTCACTCC 295
Query 286 GTTTTCCTGAGGTTCGTGCCGCCGCTGCTGCTCTTAAAACCGTCGGAGACCTTCGTCGTC 345
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 296 GTTTTCCCGAGGTTCGTGCCGCCGCTGCTGCTCTTAAAACCGTTGGAGACCTTCGTCGTC 355
Query 346 CGCCGTATGTTCAATGGCGTTCTCACTACGATCTTCTCGACTGGCTCGCTTTGTTCTTCG 405
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 356 CGCCGTATGTTCAATGGCGTTCTCACTACGATCTCCTCGACTGGCTCGCCTTGTTCTTCG 415
Query 406 GTTTCCAGAAAGATAACGTTCGTAACCAGCGTGAGCATATGGTGCTTCATCTCGCGAATG 465
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 416 GTTTCCAGAAAGATAACGTTCGTAACCAGCGTGAGCATATGGTGCTTCATCTCGCAAATG 475
Query 466 CTCAGATGCGTCTCTCCCCGCCGCCGGATAATATTGATTCTCTCGATTCCGCTGTTGTTC 525
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 476 CTCAGATGCGTCTCTCTCCGCCGCCGGATAATATTGATTCTCTCGATTCCGCGGTTGTTC 535
Query 526 GTCGGTTTCGCCGGAAACTTCTTGGTAACTACTCTAGCTGGTGTTCGTATTTGGGGAAAA 585
|||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 536 GTCGGTTTCGTCGGAAACTTCTCGCTAACTACTCTAGCTGGTGTTCGTATTTGGGGAAAA 595
Query 586 AATCAAATATCTGGATCTCAGATCGGAGCCCTGATTCGAGACGAGAGCTTCTCTATGTGG 645
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 596 AATCAAATATCTGGATCTCAGATCGGAACCCTGATTCGAGACGAGAGCTTCTCTATGTTG 655
Query 646 GACTGTATCTTCTCATATGGGGAGAGGCTGCGAATCTTCGCTTCATGCCTGAATGTATTT 705
|||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 656 GACTCTATCTTCTCATTTGGGGAGAGGCTGCGAATCTTCGGTTCATGCCTGAATGTATCT 715
Query 706 GTTACATCTTCCATAACATGGCCTCGGAGCTCAACAAAATCTTAGAGGATTGCCTCGATG 765
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 716 GTTACATCTTCCATAACATGGCCTCTGAGCTCAACAAAATCTTAGAGGATTGCCTCGATG 775
Query 766 AGAACACCGGCCAACCTTATTTGCCTTCTCTCTCAGGCGAAAACGCTTTCTTGAA-CGGC 824
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||
Sbjct 776 AGAACACCGGCCAACCTTACTTGCCTTCTCTCTCAGGCGAAAACGCTTTCTT-AACCGGC 834
Query 825 GTGGTTAAACCTATTTACGATACAATTCAAGCTGAGATTGATGAGAGCAAGAACGGTACA 884
|| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 835 GTCGTTAAACCTATTTACGATACTATCCAAGCTGAGATTGATGAGAGCAAGAACGGTACA 894
Query 885 GTTGCGCATTCTAAGTGGAGGAACTACGACGATATCAACGAGTACTTCTGGACGGATCGA 944
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||
Sbjct 895 GTTGCGCATTGTAAGTGGAGGAACTACGACGATATCAATGAGTACTTCTGGACTGATCGG 954
Query 945 TGTTTCAGCAAACTGAAATGGCCGCTTGATTTGGGAAGCAATTTCTTCAAGAGTAGAGGC 1004
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 955 TGTTTCAGCAAATTGAAATGGCCGCTTGATTTGGGAAGCAATTTCTTTAAGAGTAGAGGC 1014
Query 1005 AAAAGTGTAGGGAAAACTGGTTTCGTGGAGCGCAGGACGTTCTTCTACCTTTACAGGAGT 1064
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1015 AAAAGTGTAGGGAAAACTGGTTTCGTGGAGCGCAGGACGTTCTTCTACCTTTACAGGAGT 1074
Query 1065 TTTGATCGACTTTGGGTGATGCTAGCTTTGTTCCTTCAAGCCGCCATTATAGTAGCTTGG 1124
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1075 TTTGATCGACTTTGGGTGATGCTAGCTTTGTTCCTTCAAGCCGCCATTATAGTAGCTTGG 1134
Query 1125 GAGGAAAAGCCAGATAATTCGTCGGTAACAAGGCAGCTGTGGAATGCTTTGAAGGCAAGA 1184
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1135 GAGGAAAAGCCAGATACCTCGTCGGTAACAAGGCAGCTGTGGAATGCTCTGAAGGCAAGA 1194
Query 1185 GATGTTCAGGTGAGACTTTTGACCGTGTTCTTGACATGGAGTGGTATGCGACTCTTGCAG 1244
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1195 GATGTTCAGGTGAGACTATTGACCGTGTTCTTGACATGGAGTGGTATGCGACTCTTGCAG 1254
Query 1245 GCTATGCTGGACGCGGCTTCACAATATCCCCTCATTTCCAGAGAGACCAAAAGGCACTTT 1304
||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1255 GCTGTGCTGGACGCGGCTTCACAATATCCCCTCGTTTCCAGAGAGACCAAAAGGCATTTT 1314
Query 1305 TTCAGAATGCTGATGAAGGTTATAGCTGCCGCAGTTTGGATTGTAGCTTTCACAGTCCTC 1364
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1315 TTCAGAATGCTGATGAAGGTTATAGCTGCCGCAGTTTGGATTGTAGCTTTCACTGTCCTC 1374
Query 1365 TACACTAACATCTGGAAGCAGAAGAGGCAAGACAGGCAGTGGTCCAATACCGCGACGACT 1424
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1375 TACACTAACATCTGGAAGCAGAAGAGGCAAGACAGGCAGTGGTCCAATGCCGCGACGACT 1434
Query 1425 AAGATCTACCAATTCCTTTACGCTGTGGTGGCCTTCTTGGTGCCTGAAATTCTTGCTTTG 1484
||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||
Sbjct 1435 AAGATATACCAATTCCTTTACGCTGTGGGGGCCTTCTTGGTGCCCGAAATCCTGGCTTTG 1494
Query 1485 GCTTTGTTTATAATCCCATGGATGAGAAACTTCCTGGAAGAGACCAATTGGAAAATATTC 1544
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1495 GCTTTGTTTATTATCCCATGGATGAGAAACTTCCTGGAAGAGACCAATTGGAAAATATTC 1554
Query 1545 TTTGCTTTAACTTGGTGGTTTCAAGGCAAAAGCTTTGTGGGTCGAGGTTTGAGAGAGGGT 1604
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 TTTGCTCTAACTTGGTGGTTTCAAGGCAAAAGCTTTGTGGGTCGAGGTTTGAGAGAGGGT 1614
Query 1605 TTAGTGGACAACATCAAGTACTCGACTTTCTGGATCTTTGTCCTAGCTACGAAGTTTACA 1664
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1615 TTAGTGGACAACATCAAGTACTCGACTTTCTGGATCTTTGTCCTAGCTACAAAGTTTACA 1674
Query 1665 TTTAGTTACTTCCTGCAGGTTAAGCCAATGATTAAACCCTCAAAGCTGCTATGGAACTTA 1724
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1675 TTTAGTTACTTCCTGCAGGTTAAGCCAATGATTAAACCCTCAAAGCTGCTATGGAACTTA 1734
Query 1725 AACGATGTCAAATATGAGTGGCATCAGTTTTATGGAGACAGCAATAGGTTTTCTGTCGCA 1784
|| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1735 AAGGATGTCGATTATGAGTGGCATCAGTTTTATGGAGACAGCAATAGGTTTTCTGTCGCA 1794
Query 1785 TTGTTATGGTTGCCAGTTGTGTTGATATATCTGATGGATATCCAAATTTGGTACGCAATC 1844
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1795 TTGTTATGGTTGCCAGTTGTGTTGATATATCTGATGGATATCCAAATTTGGTACGCAATC 1854
Query 1845 TATTCTTCGATTGTTGGTGCTGTTGTTGGGCTATTTGATCATCTGGGGGAGATCAGGGAC 1904
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1855 TATTCTTCGATTGTTGGTGCTGTTGTTGGGCTGTTTGATCATCTGGGGGAGATCAGGGAC 1914
Query 1905 ATGGGACAGCTTAGGCTAAGGTTTCAATTCTTTGCTAGTGCTATTCAGTTCAACCTAATG 1964
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1915 ATGGGACAGCTGAGGCTAAGGTTTCAATTCTTTGCTAGTGCTATTCAATTCAACCTAATG 1974
Query 1965 CCTGAGGAACAACTCCTGAATGCTAGAGGCTTTGGTAACAAGTTCAAGGACGGCATTCAT 2024
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1975 CCTGAGGAACAACTCCTGAATGCTAGAGGCTTTGGTAACAAGTTCAAGGACGGCATTCAT 2034
Query 2025 AGATTGAAGCTAAGGTATGGATTTGGGAGGCCGTTTAAGAAACTCGAGTCGAATCAGGTC 2084
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2035 AGATTGAAGCTAAGGTATGGATTTGGGAGGCCGTTTAAGAAACTTGAGTCGAATCAGGTC 2094
Query 2085 GAGGCCAACAAGTTTGCGTTGATCTGGAACGAAATCATCTTAGCTTTCAGAGAAGAGGAT 2144
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2095 GAGGCCAACAAGTTTGCGTTGATCTGGAACGAAATCATCTTAGCTTTCAGAGAAGAGGAT 2154
Query 2145 ATAGTTTCTGATCGTGAAGTAGAGCTACTGGAGCTGCCAAAGAATTCCTGGGATGTGACG 2204
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2155 ATAGTTTCTGATCGTGAAGTAGAGCTACTGGAGCTGCCAAAGAATTCCTGGGATGTGACG 2214
Query 2205 GTTATTCGCTGGCCGTGTTTCTTGTTGTGCAATGAGCTTTTGCTTGCACTGAGCCAGGCC 2264
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2215 GTTATTCGCTGGCCGTGTTTCTTGTTGTGCAATGAGCTTTTGCTTGCACTGAGCCAGGCC 2274
Query 2265 AGAGAGCTGATAGACGCACCTGATAAATGGCTGTGGCACAAAATATGCAAGAATGAATAC 2324
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2275 AGAGAGCTGATAGACGCACCTGATAAATGGCTGTGGCACAAAATATGCAAGAATGAATAC 2334
Query 2325 AGGCGTTGTGCTGTAGTTGAGGCATATGACAGCATCAAACATCTATTGCTCTCAATCATC 2384
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2335 AGGCGTTGTGCTGTAGTTGAGGCATATGACAGCATCAAACATCTATTGCTCTCAATCATC 2394
Query 2385 AAAGTTGACACTGAAGAACATTCGATAATTACGGTCTTCTTTCAGATGATTAATCAATCC 2444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 2395 AAAGTTGACACTGAAGAACATTCGATAATTACGGTCTTCTTTCAGATAATTAATCAGTCC 2454
Query 2445 ATTCAGTCAGAGCAGTTCACCAAGACCTTTAGAGTGGACCTGCTGCCAAAAATTTACGAA 2504
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2455 ATTCAGTCAGAGCAGTTCACCAAGACCTTTAGAGTGGACCTGCTGCCAAAAATTTATGAA 2514
Query 2505 ACACTGCAGAAATTGGTTGGGCTGGTAAATGATGAGGAAACAGATAGTGGGCGGGTGGTG 2564
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2515 ACACTGCAGAAATTGGTTGGGCTGGTAAATGATGAGGAAACAGATAGTGGGCGGGTGGTG 2574
Query 2565 AATGTTCTGCAGTCTCTTTATGAGATTGCAACTCGACAGTTCTTTATAGAGAAGAAGACA 2624
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2575 AATGTTCTGCAGTCTCTTTATGAGATTGCAACTCGACAGTTCTTTATAGAGAAGAAGACA 2634
Query 2625 ACTGAACAGCTATCTAATGAAGGCTTGACTCCTCGAGACCCAGCCTCAAAGTTGCTGTTT 2684
||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2635 ACTGAACAGCTATCTAATGAAGGTTTAACTCCTCGAGACCCAGCCTCAAAGTTGCTGTTT 2694
Query 2685 CAAAATGCTATTAGGCTTCCTGATGCAAGCAATGAAGACTTCTACCGGCAGGTTAGGCGT 2744
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2695 CAAAATGCTATTAGGCTTCCTGATGCAAGCAATGAAGACTTCTACCGGCAGGTTAGGCGT 2754
Query 2745 TTACACACGATTCTCACCTCTAGGGACTCTATGCACAGCGTCCCTGTGAATCTAGAGGCG 2804
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2755 TTACACACGATTCTCACCTCTAGGGACTCTATGCACAGCGTCCCTGTGAATCTAGAGGCG 2814
Query 2805 AGACGGCGGATTGCTTTCTTCAGTAATTCGCTTTTCATGAACATGCCTCATGCCCCTCAG 2864
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2815 AGACGGCGGATTGCTTTCTTCAGTAATTCGCTTTTCATGAACATGCCTCATGCCCCTCAG 2874
Query 2865 GTTGAGAAAATGATGGCGTTCAGTGTTCTGACTCCATATTACAATGAGGAAGTTGTATAC 2924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2875 GTTGAGAAAATGATGGCGTTCAGTGTTCTGACTCCATATTACAGTGAGGAAGTTGTATAC 2934
Query 2925 AGCAAAGAACAGCTCCGAAATGAGACTGAGGATGGGATTTCCACCCTATACTACCTGCAG 2984
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2935 AGCAAAGAACAGCTCCGAAATGAGACTGAGGATGGGATTTCCACCCTATACTACCTGCAG 2994
Query 2985 ACAATTTATGCTGATGAATGGAAAAATTTCAAGGAACGGATGCATAGGGAAGGAATCAAG 3044
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2995 ACAATTTATGCTGATGAATGGAAAAATTTCAAGGAACGGATGCATAGGGAAGGAATCAAG 3054
Query 3045 ACAGATAGTGAGTTGTGGACAACCAAGCTGAGAGACCTCAGGCTTTGGGCTTCCTACAGA 3104
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3055 ACAGATAGTGAGTTGTGGACAACCAAGCTGAGAGACCTCAGGCTTTGGGCTTCCTACAGA 3114
Query 3105 GGTCAGACATTGGCACGTACAGTTCGTGGGATGATGTACTACTACCGGGCTCTTAAGATG 3164
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3115 GGTCAGACATTGGCACGTACAGTTCGTGGGATGATGTACTACTACCGGGCTCTTAAGATG 3174
Query 3165 CTCGCTTTTCTTGACTCTGCGTCTGAAATGGACATTCGGGAGGGTGCTCAGGAGCTTGGT 3224
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3175 CTCGCTTTTCTTGACTCTGCGTCTGAAATGGACATTCGGGAGGGTGCTCAGGAGCTTGGT 3234
Query 3225 TCAGTGAGGAGTTTGCAGGGAGAACTGGGTGGTCAATCTGATGGGTTTGTCTCTGAAAAC 3284
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3235 TCAGTGAGGAATTTGCAGGGAGAACTGGGTGGTCAATCTGATGGGTTTGTCTCTGAAAAC 3294
Query 3285 GACCGATCTTCCTTACGCAGAGCAAGTAGTTCCGTGAGTACGCTGTATAAAGGCCATGAG 3344
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3295 GACCGATCTTCCTTAAGCAGAGCAAGTAGTTCCGTGAGTACGCTGTATAAAGGCCATGAG 3354
Query 3345 TACGGGACTGCATTGATGAAATTCACATATGTTGTGGCGAGCCAGATCTATGGGTCTCAA 3404
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||
Sbjct 3355 TATGGGACTGCATTGATGAAATTCACATATGTTGTGGCGTGTCAGATCTACGGGTCTCAA 3414
Query 3405 AAAGCAAAGAAAGAGCCTCAGGCAGAGGAAATTCTGTATCTGATGAAGCAGAACGAAGCT 3464
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3415 AAAGCAAAGAAAGAGCCTCAGGCAGAGGAAATTCTGTATCTGATGAAGCAGAACGAAGCT 3474
Query 3465 CTCCGTATTGCATATGTGGATGAGGTGCCTGCGGGAAGAGGAGAGACTGATTATTACTCC 3524
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3475 CTCCGTATTGCATATGTGGATGAGGTGCCTGCGGGAAGAGGAGAGACTGATTATTACTCC 3534
Query 3525 GTTCTGGTGAAATACGATCACCAGTTGGAAAAGGAAGTGGAGATATTCCGTGTGAAGCTA 3584
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3535 GTTCTGGTGAAATACGATCACCAGTTGGAGAAGGAAGTGGAAATATTCCGTGTGAAGCTA 3594
Query 3585 CCTGGTCCGGTGAAGCTGGGTGAGGGAAAGCCAGAGAACCAGAATCATGCAATGATCTTT 3644
|||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3595 CCTGGTCCAGTGAAGCTGGGCGAGGGAAAGCCAGAGAACCAGAATCATGCAATGATCTTT 3654
Query 3645 ACCCGTGGTGATGCTGTTCAGACCATTGATATGAACCAAGACAGCTATTTTGAGGAAGCT 3704
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3655 ACCCGTGGTGATGCTGTTCAGACCATTGATATGAACCAAGACAGTTATTTTGAGGAAGCT 3714
Query 3705 CTCAAGATGAGAAATTTGCTCCAGGAGTACAAACATTATCATGGTATCAGAAAACCAACT 3764
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3715 CTCAAGATGAGAAATTTGCTCCAGGAGTACAACCATTATCATGGTATCAGAAAACCAACT 3774
Query 3765 ATTCTTGGTGTCAGGGAGCATATCTTCACGGGATCAGTCTCGTCACTGGCGTGGTTCATG 3824
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3775 ATTCTTGGTGTCAGGGAGCATATCTTCACGGGATCAGTCTCGTCACTGGCGTGGTTCATG 3834
Query 3825 TCTGCTCAGGAGACAAGTTTTGTCACTCTTGGTCAGCGTGTTCTTGCAAACCCGCTGAAG 3884
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3835 TCTGCTCAGGAGACAAGTTTTGTCACTCTTGGTCAGCGTGTTCTTGCAAACCCACTGAAG 3894
Query 3885 GTCAGAATGCATTATGGCCACCCTGATGTATTTGACAGATTCTGGTTCTTGAGTCGAGGC 3944
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3895 GTCAGAATGCATTATGGCCACCCTGATGTATTTGACAGATTCTGGTTCTTGAGTCGAGGC 3954
Query 3945 GGCATCAGCAAGGCTTCCAGAGTTATAAATATCAGTGAGGACATCTTTGCCGGGTTTAAT 4004
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3955 GGCATCAGTAAGGCTTCCAGAGTTATAAATATCAGTGAGGACATCTTTGCCGGGTTTAAC 4014
Query 4005 TGCACATTGAGGGGCGGAAACGTCACCCACCACGAGTACATTCAGGTCGGGAAGGGTCGG 4064
||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 4015 TGCACGTTAAGGGGGGGAAACGTCACCCACCACGAGTACATTCAGGTCGGGAAGGGACGG 4074
Query 4065 GATGTTGGATTGAATCAGATATCAATGTTTGAGGCTAAGGTAGCTAGTGGGAACGGAGAG 4124
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 4075 GATGTTGGATTGAATCAGATATCAATGTTTGAGGCTAAGGTAGCCAGTGGGAACGGAGAG 4134
Query 4125 CAGGTTCTTAGCCGAGACGTGTACCGGCTCGGTCACAGGCTTGATTTCTTCAGAATGTTA 4184
|||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4135 CAGGTTCTCAGCCGAGATGTGTACCGGCTCGGGCACAGGCTTGATTTCTTCAGAATGTTA 4194
Query 4185 TCATTTTTCTACACAACTGTAGGGTTTTTCTTCAACACGATGATGGTCATTCTTACTGTT 4244
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 4195 TCATTTTTCTACACAACTGTAGGGTTTTTCTTCAACACAATGATGGTCATTCTTACTGTT 4254
Query 4245 TACGCTTTCCTCTGGGGACGGGTTTATCTGGCTCTCAGCGGGGTTGAGAAGTCCGCTCTA 4304
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4255 TACGCTTTCCTCTGGGGACGGGTTTATCTGGCTCTCAGCGGGGTTGAGAAGTCCGCTCTA 4314
Query 4305 GCAGACAGTACGGACAGCAACGCCGCGCTTGGGGTGATCCTGAACCAGCAGTTCATCATT 4364
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4315 GCAGACAGTACGGACACCAACGCCGCGCTTGGGGTGATCCTGAACCAGCAGTTCATCATT 4374
Query 4365 CAGCTCGGTCTGTTCA 4380
||||||||||||||||
Sbjct 4375 CAGCTCGGTCTGTTCA 4390
Score = 2230 bits (1207), Expect = 0.0
Identities = 1361/1430 (95%), Gaps = 32/1430 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 4381 GAGGG-TTCCTTCTAGCGATATGGAATTTCATTCGAATGCAGATTCAGCTTTCAGCTGTC 4439
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4426 GAGGGTTTCCTTCTAGCGATATGGAATTTCATTCGAATGCAGATTCAGCTTTCAGCTGTC 4485
Query 4440 TTCTACACATTCTCAATGGGGACCAGAGCTCACTATTTCGGTCGAACTATTCTCCATGGT 4499
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4486 TTCTACACATTCTCAATGGGGACCAGAGCTCACTATTTCGGTCGAACTATTCTCCATGGT 4545
Query 4500 GGGGCAAAGTATAGAGCCACTGGACGTGGATTTGTTGTCGAGCACAAGGGATTCACTGAG 4559
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4546 GGGGCCAAGTATAGAGCCACTGGACGTGGATTTGTTGTCGAGCACAAGGGATTCACTGAG 4605
Query 4560 AACTACCGACTGTATGCACGCAGTCACTTTGTGAAGGCCATCGAGCTTGGGCTGATCCTC 4619
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4606 AACTACCGACTGTATGCACGCAGTCACTTTGTGAAGGCCATCGAGCTTGGGCTGATCCTC 4665
Query 4620 ATAGTCTACGCTTCGCACAGTCCGATTGCCAAAGACTCGTTGATTTACATAGCCATGACT 4679
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4666 ATAGTCTACGCTTCGCACAGTCCGATTGCCAAAGACTCGTTGATTTACATAGCCATGACT 4725
Query 4680 ATCACCAGCTGGTTCCTTGTGATTTCATGGATAATGGCCCCATTTGTGTTTAACCCATCA 4739
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4726 ATCACCAGCTGGTTTCTTGTGATTTCATGGATAATGGCCCCATTTGTGTTTAACCCATCA 4785
Query 4740 GGATTCGACTGGCTTAAGACAGTCTACGACTTTGAAGACTTTATGAATTGGATCTGGTAC 4799
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||
Sbjct 4786 GGATTCGACTGGCTTAAGACAGTCTATGACTTTGAAGACTTCATGAACTGGATCTGGTAC 4845
Query 4800 CAAGGCAGAATCTCAACGAAATCTGAACAAAGCTGGGAAAAATGGTGGTACGAGGAACAG 4859
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4846 CAAGGCAGAATCTCAACGAAATCTGAACAAAGCTGGGAAAAATGGTGGTACGAGGAACAG 4905
Query 4860 GACCACCTGAGAAACACCGGGC-GGTTAGGAATATTTGTGGAGATCATCTTGGACCTCCG 4918
||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 4906 GACCACCTGAGAAACACCGGGAAGGC-AGGATTATTTGTGGAGATCATCTTGGTCCTCCG 4964
Query 4919 GTTTTTCTTCTTTCAGTATGGGATTGTATACCAGCTCAAAATTGCAAACGGATCCACCAG 4978
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 4965 GTTTTTCTTCTTCCAGTATGGGATTGTATACCAGCTTAAAATTGCAAACGGATCCACCAG 5024
Query 4979 CTTTTTTGTCTACTTGTTCTCATGGATATACATCTTTGCTATATTTGTGCTCTTCCTAGT 5038
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5025 CCTTTTTGTCTACTTGTTCTCATGGATATACATCTTTGCTATATTTGTGCTCTTCCTAGT 5084
Query 5039 AATCCAATACGCCCGTGACAAGTACTCTGCAAAAGCTCACATACGGTACAGGCTTGTCCA 5098
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5085 CATCCAATACGCCCGTGACAAGTACTCGGCAAAAGCTCACATACGGTACAGGCTTGTCCA 5144
Query 5099 ATTCCTCCTGATCGTGTTTGCTATACTGGTGATTGTTGCTTTGCTTGAGTTCACGCATTT 5158
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 5145 ATTCCTCCTGATCGTGCTTGCTATACTGGTGATTGTTGCTTTGCTCGAGTTCACGCATTT 5204
Query 5159 CAGCTTCATCGATATCTTCACGAGTCTTCTTGCATTCATCCCAACTGGCTGGGGAATTCT 5218
||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5205 CAGCTTCATCGATATCTTCACAAGCCTTCTTGCATTCATCCCAACTGGCTGGGGAATTCT 5264
Query 5219 GCTGATCGCACAGACTCAAAGGG-GTTGGCTGAAGAAATACAGTATTTTCTGGAATGCTG 5277
|||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||||||||||
Sbjct 5265 GCTGATCGCACAGACTCAAAGGAAGT-GGCTGAAGAATTACACTATTTTCTGGAATGCTG 5323
Query 5278 TTGTCTCTGTTGCTCGCATGTATGACATATTGTTTGGGATACTCATAATGGTTCCAGTAG 5337
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5324 TTGTCTCTGTTGCTCGCATGTATGACATATTGTTTGGGATACTCATAATGGTTCCAGTAG 5383
Query 5338 CGTTCTTGTCGTGGATGCCTGGATTCCAATCAATGCAAACGAGGATATTATTCAATGAAG 5397
|||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5384 CGTTCTTGTCATGGATGCCTGGATTCCAGTCAATGCAAACGAGGATATTATTCAATGAAG 5443
Query 5398 CTTTTAGCAGAGGACTTCGCATCATGCAGATTGTCACTGGGAAGAAATCAAAAGGCGATG 5457
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5444 CTTTTAGCAGAGGACTTCGCATCATGCAGATTGTCACTGGGAAGAAATCAAAAGGCGATG 5503
Query 5458 TCTAAGTTTAAAAAATGGTCTTAAGAAGTAAATGATAGTTCAAATCCTATTGGTATGCGG 5517
||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 5504 TCTAAGTTTAAAAAACGGTCTTAAGAAGTAAATGGTAGTTCAAATCCTATTGGTATGTGG 5563
Query 5518 CGAAGGAATCTGTTGGAGGTTGTATTTTGGAGAG---GGT-GGATGAGGAATCGGGAAGT 5573
|||||||||| |||||||||| | || |||||| ||| |||||||||||||||||||
Sbjct 5564 CGAAGGAATCAGTTGGAGGTT-T-TT--GGAGAGTTTGGTTGGATGAGGAATCGGGAAGT 5619
Query 5574 TGGTTT-ATTCGGTTATAGATGGGTTTAGTCATTTAGTGAGATATTTTATCGTCAGTGTG 5632
|||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||| || |||||||||
Sbjct 5620 TGGTTTGATTCGGTTA--GATGGGTTTAG-------G-GAGATATTTGATTGTCAGTGTG 5669
Query 5633 TGTGGAGG-AACTCTGATTCTTGTATGGTTTT-GT-CTAAAGGTAGAGCAATTTGTGTAG 5689
|||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 5670 TGTGGAGGGAACTCTGATTCTTGTATGGTTTTTGTTCTAAAGGTACAGCAATTTGTGTAG 5729
Query 5690 T-AGGGCTTTTGTGTATTTGTTCTCCTTCTCTCGTTGTAGAGCTTTAGAGCATTTTTAGT 5748
| ||| |||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||
Sbjct 5730 TGAGG-CTTT-GTGTATTTGTTCTCCTTCTCTCATTATAGAGCTTTAGAGCATTTTTAGT 5787
Query 5749 TTATTATTCCAGTTTGCCATCTAATGTCATTTCGCAGAGCATTTGTTCAC 5798
|||| |||| || ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||
Sbjct 5788 TTAT-ATTC-AGATTGTTATCTAATGTCATCTCGCAGAGCTTTTGTTCAC 5835
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 289269377570
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5