BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg490392
Length=4374
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT4G01860.1 | Symbols: | Transducin family protein / WD-40 rep... 6098 0.0
> AT4G01860.1 | Symbols: | Transducin family protein / WD-40 repeat
family protein | chr4:801345-808060 REVERSE LENGTH=4337
Length=4337
Score = 6098 bits (3302), Expect = 0.0
Identities = 3800/4037 (94%), Gaps = 47/4037 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAACTCAAGTCGGAGTCGGAGCCGCATTGTTGAAGCAAAGCCATGTCGGAAGAAAACAGC 60
|||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||| ||||||||||||||
Sbjct 1 GAACTCAAGTCGGAGTCGGAGCCGCACTGTCGTAGCAAAGCTATGGCGGAAGAAAACAGC 60
Query 61 CGCCGGAAGTGGAACCCTCACGCCGGTCCATATCTCGGAGAAGTCTCTTCTCTAGCTTTC 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 CGCCGGAAGTGGAACCCTCACGCCGGTCCATATCTAGGAGAAGTCTCTTCTCTAGCTTTC 120
Query 121 CTCAATCTCCCTCTACATGTTTCTTCAATTCCTTATCTTCTCGCCGGTTCCGGTTCGGAG 180
|||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 CTCAATCTTCCTCAACATGTTTCTTCAATTCCTTATCTTCTCGCCGGTTCCGGTTCGGAG 180
Query 181 ATTCTTCTTTACGATTTGAGTTCCGGGGAATTGATTCGCTCGTTTCAAGTGTTTGAGGGA 240
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 181 ATTCTGCTTTACGATTTGAGTTCCGGGGAATTGATTCGATCGTTTCAAGTGTTTGAGGGA 240
Query 241 GTTCGTGTCCATGGAACTGTTTGTAGCAACAGCTTTATTCATTCAACGGACCGATATACG 300
||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||
Sbjct 241 GTTCGCGTCCATGGAACTGTTTGTAGCAAAAGCTTTGTTCATTCGGCGGAAAGATATACG 300
Query 301 TATAAACTTGTTATATTTGGAGAGAAGAAAGTGAAGATCTTTTCATTGATTGTTGAATTA 360
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 TATAAACTTGTAATATTTGGAGAGAAGAAAGTGAAGATCTTTTCATTGATTGTTGAATTA 360
Query 361 GCCTCGGGCTCTGGTGAAATCTCTGTGAATTTGGAAATTTTTGATTCTTTGCCGAGGCTT 420
|| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||
Sbjct 361 GCTTCGAGCTCTGGTGAAATCTCCGTGAATTTGGAAAATTTTGAATCTTTGCCTAGGCTT 420
Query 421 AGCAATTGGGTCTTCGACGTTTGTTTCTTACAGGACTCTACTGGTTCCTTGGGAGATGAA 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||
Sbjct 421 AGCAATTGGGTCTTCGACGTTTGTTTCTTACAGGACTCTACTGGTTCGTTGGAAGAAGAA 480
Query 481 GACAAGCTTCTAGCTATTGGTTGTAGTGATAACTCTCTCAGCATTTGGGATGTTAAAGAA 540
|| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 GATAAGCTTCTAGCTATTGGTTGTAGTGATAATTCCCTCAGCATTTGGGATGTTAAAGAA 540
Query 541 TCACGCATGGCTTTTGAAATTCAGTCACCTGAAAGGTGTCTACTGTATACTATGAGGTTA 600
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 541 TCACGCATGGCTTTTGAAATTCAGTCACCAGAAAGGTGTCTACTGTATACTATGCGGTTA 600
Query 601 TGGGGCGACAGTATTTCGACTCTCCGCATTGCTTCTGGCACTATTTTCAATGAGATCATT 660
|||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 TGGGGCGACAGTATTTCGACTCTCCGTATTGCTTCCGGCACTATTTTCAATGAGATCATT 660
Query 661 GTTTGGAGGACAGTTGGCTTTGATGGTGACAATGCCGACCATGGACATTATTCTGCTTCC 720
||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 661 GTTTGGAGGGCAGTTGGCCTTGATGGTGACAATGTCGACCATGGGCATTATTCTGCTTCC 720
Query 721 CCTATGCTTAGACTTGCTGGACATGAGGGTTCAATATTTCGCATTGTATGGTCTTTGGAT 780
| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 721 CATATGCTTAGACTTACTGGACATGAGGGTTCAATATTTCGCATTGTCTGGTCTTTGGAT 780
Query 781 GGATCGAAACTAGTCTCCGTCTCTGATGATCGTAGTGCTAGGATATGGGAAATTGATTCG 840
||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 781 GGATCAAAAATAGTCTCCGTCTCTGATGATCGTAGTGCTAGGATATGGGAAATTGACTCG 840
Query 841 CAGGAGGTCGTTGGCCCTGTGCTTTTTGGTCACAGTGTTAGGGTTTGGGACTGCTGCATC 900
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 CAGGAGGTCGTTGGCCCTGTGCTGTTTGGTCACAGTGTTAGGGTTTGGGACTGCTGCATC 900
Query 901 TCAGATTCTTTTATTGTCACTGCTGGTGAGGACTGTACATGCCGTGTCTGGGGTGTGGAT 960
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 901 TCAGATTCTTTGATTGTCACTGCTGGTGAGGACTGTACATGCCGTGTCTGGGGCGTGGAT 960
Query 961 GGTACCCAGCTGGAAGTGATAAAGGAACATATTGGAAGAGGCATATGGAGATGTTTGTAT 1020
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 GGTACCCAGCTGGAAGTGATAAAAGAACATATTGGAAGAGGCATATGGAGATGTTTGTAT 1020
Query 1021 GATCCGAACTCATCCCTTCTTGTTACTGCTGGATTTGACTCTGCAATCAAAGTACATCAA 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021 GATCCGAACTCATCCCTTCTTGTTACTGCTGGATTTGACTCTGCAATCAAAGTACATCAA 1080
Query 1081 TTGCATAATCGTGGGTCTGAAACGCT-GTTAGATGCTGTAGGAGTGCTTAATTCACCAGA 1139
||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1081 TTGCATAATCGTGGGTCTGAAAC-ATCGTTAGATGCTGTAGGAGTGCTTAATTCACCAGA 1139
Query 1140 TAAATTGGAATATTTTTCAACCTGCCTCCCAAATTCGACGGAGCATACTGGTCTCACTGA 1199
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||
Sbjct 1140 TAAATTGGAATATTTTTCAACCTGTCTCCCAAATTCAACGAAGCATACTGGTCTAACGGA 1199
Query 1200 CAGCAAGAGTGAGTATGTACGTTGCATGCAGCTCACACAGGAAGATACCATTTATGTGGC 1259
||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1200 CAGCAAGAGTGAGTATGTACGTTGCTTGCAGTTCACACAGGAAGATACCATTTATGTGGC 1259
Query 1260 CACAAACCATGGTTGCTTGTACCACGCAAGGTTATTGTCATCTGGAAATGTAAGGTGGAC 1319
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1260 CACAAACCATGGTTGCTTGTACCACGCAAGGTTATTGTCATCTGGAAATGTAAGGTGGAC 1319
Query 1320 TGAATTAGTTCGAATACCTGAAGAAGGGCCTATTATTACCATGGATGTCATGTCTGGCGG 1379
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1320 TGAATTAGTTCGCATACCTGAAGAAGGGCCTATTATTACCATGGATGTCATGTCTGGTGG 1379
Query 1380 AAAGGTACGCGAGTCTTGTGCATTAGATGATTGGGTTGCTCTTGGAGATGGCAAAGGAAA 1439
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1380 AAAGGTACGCGAGTCTTGTGCATTAGACGATTGGGTTGCTCTTGGAGATGGCAAAGGAAA 1439
Query 1440 TATGACAATTGTTCGGGTTATTGGTGATATATATAACCCACATGCTGGCTTGAATCAAAG 1499
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1440 TATGACAATTGTTCGGGTTATTGGTGATATGTATAACCCACATGCTGGCTTGAATCAAAG 1499
Query 1500 TTGGAAGGCTAGCCCTGAGAGACAACTTCTGGGGGCTTTCTGGTGCAAATCATTAGGCTA 1559
||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1500 TTGGAAGGCTAGCCCAGAGAGACAACTTCTAGGGGCATTCTGGTGCAAATCATTAGGCTA 1559
Query 1560 TAGGTTTGTTTTTTCATGCAATCCTAGAGGACTATTGAAGCTGTGGAAACTATCCGGTCC 1619
||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |
Sbjct 1560 TAGGTTTGTTTTTTCTTGCAATCCTAGAGGACTCTTGAAGCTATGGAAACTATCCGGTTC 1619
Query 1620 TTCAGAATCTGCTGCTTCTAGTGCTGCTGAAACTTATGATGTCTCCCTCTTGGCTGAATT 1679
|| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1620 TTTAGAA---------TC---TGCTGCTGAAACTTATGATGTCTCCCTCTTGGCTGAATT 1667
Query 1680 CTCCTCTTGTTTTGGAAAGCGAATAATGTGTGTTGATGCATCAGTAGAAGATGAGGTGAT 1739
||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1668 CTCCTCTGGTTTTGGAAAGCGAATAATGTGTGTTGACGCATCAGTAGAGGATGAGGTGAT 1727
Query 1740 TCTGTGTGGAGATTTACGTGGCAATATCACACTCTTTCCTCTGTCAAAGGACATGCTGAA 1799
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
Sbjct 1728 TCTGTGTGGAGATTTACGTGGCAATATCACACTCTTTCCTCTGACAAAGGACATGCTGCA 1787
Query 1800 CGGAGTTTCTGTTTCTTCAGAATTGAAGATACCTTCATTAAAATATTTCAAAGGTGCCCA 1859
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1788 CGGAGTTTCTGTTTCTTCAGAATTGAAGATACCATCACTAAAATATTTCAAAGGTGCCCA 1847
Query 1860 CGGGATTTCAAGTGTTTCCAGTCTTTCAGTTGCTAGATTAACTTCCAACAAAGCTGAAAT 1919
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1848 TGGGATTTCAACTGTTTCCAGTCTTTCAGTTGCTAGATTAACTTCGAACAAAGCTGAAAT 1907
Query 1920 ATGCTCGACTGGCGCAGATGGTTGCATATGCTATTTCGAATATGACAGAGAGAGGCAGAC 1979
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1908 ATGCTCGACTGGAGCAGATGGTTGCATATGCTATTTCGAATATGACAGAGAGATGCAGAC 1967
Query 1980 TTTAGAGTTCATGGGTTTGAAACAATTGAAAGAGTTGAACTTAGTTCAATCTGTTTGTCA 2039
||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1968 TTTAGAGTTCATGGGTTTGAAACAACTGAAAGAATTGAACTTAGTTCAATCTGTTTGTCA 2027
Query 2040 AGGGGTGCAGTTTTCCAAAGACCACCCAAACAATGACTATGCAGCCGGATTTGCGTCAAC 2099
||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2028 AGGGGTGCAATTTTCCGAAGACCATCCAAACAATGACTATGCAGCCGGATTTGCGTCAAC 2087
Query 2100 AGATTTCATATTGTGGAATTTAACAGCTGAAGCAAAGGTTACACAAATCACATGTGGTGG 2159
|||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2088 AGATTTCATACTGTGGAATTTAACAGCTGAAACAAAGGTTACACAAATCTCATGTGGTGG 2147
Query 2160 ATGGCGCCGACCCCATTCCTTTTATCTCGGGGAAATCCCTGAGTGGCAAAACTGTTTTGC 2219
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2148 CTGGCGCCGACCCCATTCCTTTTATCTCGGGGAAATCCCTGAGTGGCAAAACTGTTTTGC 2207
Query 2220 ATATTTGAAGGATGATGTCATTCATATTCATAGACACTGGGTTGTG-GGAAAGAAGACCA 2278
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||
Sbjct 2208 ATATGTGAAGGATGATGTCATTCATATTCATAGACACTGGGTTG-GAGGACAGAAGACCA 2266
Query 2279 AAGTTTTTCCTCTAAATTTGCATACACAGTTTCATGGCAGAGAATTGCATTCGTTATGCT 2338
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2267 AAGTCTTTCCTCTAAATTTGCATACACAGTTTCATGGCAGAGAATTGCATTCCTTATGCT 2326
Query 2339 TCATCTCTGCAGATACAAAAGCCGGG-TTCGA---T---GAAAGTAAATTATCTGATCGG 2391
|||||||| |||||||||||| |||| ||||| | ||||||||| |||||||||||
Sbjct 2327 TCATCTCTACAGATACAAAAG-CGGGATTCGATTCTGAAGAAAGTAAAATATCTGATCGG 2385
Query 2392 TCTAGTTGGATTGCAACAGGGTGTGAAGATGGATCTGTAAGATTGACAAGGTATGTATCT 2451
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||
Sbjct 2386 TCTAGTTGGATTGCAACAGGGTGTGAAGATGGATCTGTGAGATTGAGTAGGTATGCATCT 2445
Query 2452 GAGTTTGGAAACTGGTCAACATCAGAGCTATTAGGAGAACATGTTGGAGGCTCAGCTGTG 2511
||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2446 GAGTTTGGAAATTGGTCAACATCAGAGCTTTTAGGAGAACATGTTGGAGGCTCAGCTGTG 2505
Query 2512 AGATCAGTTTGCTGCGTATCAAATATGCACATGATTTCTTCGGACATGCCTAACGTACCA 2571
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||
Sbjct 2506 AGATCAGTTTGCTGCGTATCAAATATGCACATGATGTCTTCGGACGTACCTAACTTACCA 2565
Query 2572 GACGTGTGTGAACAAGACTCTGCAGTGGATGATAGCGAAAGTCCTTGCTTACTGATTTCT 2631
||| |||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2566 GACATGTGCGATCAAGACTATGCAGTGGATGATTGCGAAAGTCCTCGCTTACTGATTTCT 2625
Query 2632 GTTGGAGCCAAGCGTGTTGTAACCTCTTGGCTCCTAAGGAATGGTAGACAAAATAAAAAG 2691
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||
Sbjct 2626 GTTGGAGCCAAGCGTGTTGTAACCTCTTGGCTCCTAAGGAATGGTAGACACAAGAAAAAG 2685
Query 2692 GGAGAACCTTGTATTAGTGATAATGGACACAATAGAGCTTCATCGGAAGTGTCTTCAGTG 2751
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||
Sbjct 2686 GGAGAATCTTGTATTAGTGATAATGGACACAATAGAGCGTCATCGGAAGTGTCTCCAGTG 2745
Query 2752 ACATTCCAATGGCTTGCTACTGACATGCCAACCAAATCTCGTCCTTGTGGAAAGACCGAG 2811
|| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2746 ACGTTCCAATGGCTTGCTACTGACATGCCCACCAAATATCGTCCTTGTGGAAAGATCGAG 2805
Query 2812 AAATCTCCAAAATTGGACGGAGTTGATGAAGATACTACTGCTAACATCACAAAGTTAGGG 2871
|||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||
Sbjct 2806 AAATCTCCAAAACTGGAAGGAGTTGAAGAAGATACTTCTGCCAACGTCACAAAGTTAGGA 2865
Query 2872 TCTAATACGTATCATGAGCGAGAAAACTATGAAGATGACTGGAGATACATGGCTGCCACT 2931
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2866 TCTAATACGTATAATGAGCGAGAAAACTATGAAGATGACTGGAGATACATGGCTGCCACT 2925
Query 2932 GCATTTCTTGTCAAATGTGTTGGTTCCAGGCTAACTATCTGTTTTATCGCTGTGGCTTGC 2991
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2926 GCATTTCTTGTCAAATGTGTTGGTTCTAGGCTAACTATCTGTTTTATCGCGGTGGCTTGT 2985
Query 2992 TCTGATGCCACCCTTACATTACGGGCCCTAGTCTTACCACATCGATTATGGTTTGATGTT 3051
||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2986 TCTGATGCCACCCTTACCTTACGTGCTCTAGTCTTGCCACATAGATTATGGTTTGATGTT 3045
Query 3052 GCATCGTTGGTTCCTCTAAAATCTCCAGTTCTGTCATTACAACACGCTGTTGTGCCTCTG 3111
||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3046 GCATCCTTGGTTCCTCTAAAATCTCCAGTTTTGTCATTACAACACGCCGTTGTGCCTCTG 3105
Query 3112 CATCCCCCACATGAAGGTAATACATCATCTAGTGATGTTTATCTCCTCATCAGTGGGGCC 3171
||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3106 GATCCCCCTCATGAAGGTAATACACCATATAGTGATGTTTATCTGCTCATCAGTGGGGCC 3165
Query 3172 ACAGATGGAAGCATAGCCTTTTGGGATGTAACTAAATGTGTAGAAGCTTTTGTAAAGCAA 3231
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3166 ACAGATGGAAGCATAGGCTTTTGGGATGTAACTAAATGTGTAGAAGCTTTTGTAAAGCAA 3225
Query 3232 GTATCCAGCATCCATATTGAGAAGTTCATTGATTGTCAGTTACGACCACGAACTGGAAGA 3291
||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3226 GTATCTAGCATCCATATTGAGAAGTACATTGATTGTCAGTTACGACCACGGACTGGAAGA 3285
Query 3292 GGGAGTCAAGGTGGTAAGAAATGGAAACTGTTAGGCTCCAAAATTTCTAAGAAA-CCACA 3350
|| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||
Sbjct 3286 GGAAGTCAAGGTGGTAGGAAATGGAAACTGTTAGGCTCCAAAATTTCTAAGAGAGCC-CA 3344
Query 3351 AGAGAACAGCAACTCAGTTGGTGACGCTGCAG--------CCA-C---GTCTTTGGAACT 3398
|||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||
Sbjct 3345 AGAGAACAGCAACTCAGTTGGTGAAGCTGCAGAAGAAGATCCAGCCTCGTCTTTGGAACT 3404
Query 3399 CACAAATGGCGTTCCTCAGGAAAACCATGAATACGAAGGTGCAGATTCTCCTCTCGAGAC 3458
|||||||| | |||||||||||| | || |||||| ||||||||||| || ||||||
Sbjct 3405 CACAAATGACCATCCTCAGGAAAATGGTAAAAACGAAGATGCAGATTCTCTTCCCGAGAC 3464
Query 3459 AAGCGAGATAAAGCCTTCACATGTCGTGAAGAATGCTCATCAATCTGGAGTTAATTGCCT 3518
||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3465 AAGCGAGATAAAGACTTCACATGTTGTGAAGAATGCTCATCAATCTGGAGTTAATTGCCT 3524
Query 3519 TTATGTTTCTCGCTCGAGCAGTTCTCCAAGTAATGGCAATAGCTTGATGTTCAATGTGAT 3578
| ||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||
Sbjct 3525 TCATGTTTCTCGCTCAAACAGTTCTCCGAGTTATGGCAATGGTTTGATGTTCAATGTGAT 3584
Query 3579 TAGCGGGGGTGATGATCAAGCCCTTCATTGTCTTAGCTTCAACATCCTCAGTAGTAGTAA 3638
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3585 TAGCGGGGGTGATGATCAAGCCCTTCATTGTCTTAGCTTCAACATCCTCAGTAGTAGTAA 3644
Query 3639 TAGTCCAGCCAAAAAATCTGAAATCATGGATCTAAACCAAACCCCAAGTTACAGAATCAG 3698
|| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3645 TAATCGAGCCACAATATCTGAAATCATGGATCTAAACCAAACCCCAAGTTACAGAATCAT 3704
Query 3699 GCTCGCAGACCGTGGAGGTATTGCATCAGCTCATAGCTCTGCCATAAAAGGCGTATGGAT 3758
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||
Sbjct 3705 GCTCACAGACCGTGGAGGTATTGCATCAGCTCATAGCTCTGCCATCAAAGGCGTGTGGAT 3764
Query 3759 GGACATGAACTGGGTGTTCTCGACAGGTCTTGATCAACGTGTACGATGTTGGTTTCTCGA 3818
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3765 GGACACGAACTGGGTGTTCTCGACAGGTCTTGATCAACGTGTTCGATGTTGGTTTCTCGA 3824
Query 3819 CAAAGATAGTAAACTGATCGAGCACGCTCATATAGTTATCAGCGTGCCCGAGCCAGAGGC 3878
|||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3825 AAAAGATGGTAAACTGATCGAGCACGCTCATATAGTCATCAGCGTGCCCGAGCCAGAGGC 3884
Query 3879 GCTAGATGCTAAAGCCATTGATGAAAACCGATACCAAATAGCTGTTGCGGGACGCGGGAT 3938
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3885 ACTAGATGCTAAAGCCATTGATGAAAACCGATACCAAATAGCTGTTGCGGGACGCGGGAT 3944
Query 3939 CCAAATGGTTGAATTCTCCGGTTA-CTA--G---G-TTCAGAACCCAGTATTTGAT-CCA 3990
|||||||||||||||||||||||| | | | | |||||||||| || |||||| |||
Sbjct 3945 CCAAATGGTTGAATTCTCCGGTTAACAAAAGCTTGGTTCAGAACCCTGTTTTTGATTCCA 4004
Query 3991 TTTTTTGAGGTA-TTTG 4006
||||||||||| ||||
Sbjct 4005 GTTTTTGAGGTAATTTG 4021
Score = 213 bits (115), Expect = 1e-53
Identities = 180/209 (86%), Gaps = 14/209 (7%)
Strand=Plus/Plus
Query 4003 TTTGATC--AGAACTGTGCTTTTGTCGGTGCTCTACTTTATCTATTATTAGTCGCCGTCG 4060
||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | | || || | || ||||
Sbjct 4138 TTTGATCTGAGAACTGAGCTTTTGTCGGTGCTCTACTTTTTTTGTTTTTGGCCGAAGTCG 4197
Query 4061 GTGCTCTGCTAAATTCTGGTATCAGTGGTATGTATCATGTTTCTGAACCCAATTTGATAG 4120
||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4198 GTGCTCTGCTAAA------T-TC--TGGTATGTATCATGTTTCTGAACCCAATTTGATAG 4248
Query 4121 TAACATTATTATTGCTCA---TTTGGGTTATGGAATTGTGCCCATGTGGGACCTTTATGA 4177
|||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 4249 TAACGTTATTATTGCTCAAGATTTTGGTTATGGAATTGTGCCAATGTGGGACCTTTATGA 4308
Query 4178 GAGAAAGATCAACTCTTCACATGACATTA 4206
|||||| |||||| ||||||||||| |||
Sbjct 4309 GAGAAATATCAACACTTCACATGACCTTA 4337
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 218075701221
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5