BLASTN 2.2.26+


Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.



Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
           33,602 sequences; 51,074,197 total letters



Query= Ahg490568

Length=3683
                                                                      Score     E
Sequences producing significant alignments:                          (Bits)  Value

  AT4G38120.1 | Symbols:  | ARM repeat superfamily protein | chr4...  5834    0.0  


> AT4G38120.1 | Symbols:  | ARM repeat superfamily protein | chr4:17888519-17896107 
REVERSE LENGTH=3694
Length=3694

 Score = 5834 bits (3159),  Expect = 0.0
 Identities = 3533/3708 (95%), Gaps = 47/3708 (1%)
 Strand=Plus/Plus

Query  1     TTCTCGTTTGTGATTGCTTAG-TTTTCCCCCGGAGATTGAAACATGTTCACGGCGGCAGC  59
             ||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct  5     TTCTCGTTTTTGATTGCTTAGTTTTTTCCCGGGAGACTGAAACATGTTCACGGCGGCAGC  64

Query  60    TTCGTCAAGCGCGGGAAGGTGGCGGACGGCGTTTCTCTCTCTGAGGGACGAAATCGCAAC  119
             ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||
Sbjct  65    TTCGTCAAGCGTGGGAAGGTGGCGGACGGCGTTTCTCTCTCTCAGGGACGAAATCTCAAC  124

Query  120   GACTCCACCGCCGCCGGTTCCTCTGTTGCTCCAGGATCTACTCTTCTCTCAATCCCATTC  179
              |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  125   CACTCCACCGCCGCCGGTTCCTCTGTTGCTCGAGGATCTACTCTTCTCTCAATCCCATTC  184

Query  180   CCTTGTCTCTGCCGTCTCTCACCTCCCACCGCACGAGCTCACTTCCGATTGCTTGTTCCT  239
             |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  185   CCTTATCTCTGCCGTCTCTCACCTCCCACTGCACGAGCTCACTTCCGATTGCTTGTTCCT  244

Query  240   GCTCGATTTGGTTTCCAAAGCTGATGGTCCTGACTGGATCCCTGTCTCTCGTCATACTTG  299
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  245   GCTCGATTTGGTTTCCAAAGCTGATGGTCCTGACTGGATCCCTGTCTCTCGTCATACTTG  304

Query  300   TCAACTGATTCACGATGTTTGTGCTCGTCTACTTTTCCAACTTAATTCTTCGTCATGGCC  359
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct  305   TCAACTGATTCACGATGTTTGTGCTCGTCTACTTTTCCAACTAAATTCTTCGTCATGGCC  364

Query  360   GTTCCTTCTTCACTCTTTTGCTTCTGTCTTGGAGTTTCTTCTTCGCCAACCCATGCCTTC  419
             | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  365   GCTCCTTCTTCACTCTTTTGCTTCTGTCTTGGAGTTTCTTCTTCGCCAACCCATGCCTTC  424

Query  420   TTCACCCTATTCCACTGCATATTTCTCCAGAATCGAACCTGTCATCCAATGCTTCGAGAC  479
             |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct  425   TTCACCTTATTCCGCTGCCTATTTCTCCAGAATCGAACCTGTGATCCAATGCTTCGAGAC  484

Query  480   TCTAAGACGTTTGGCCGCTATGCACCCGGAGGACATTCATCTTGTCAAGTTTCTTCTGCG  539
             | |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||
Sbjct  485   TTTAAGACGTTTGGCCCCTATGCATCCGGAGAACATTCATCTAGTCAAGTTTCTTGTGCG  544

Query  540   CATAATTCCTTTATTACACCAGGATTTAGTTTTATCGTATGGTTTCTCAAATCAAAACCC  599
             | || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||
Sbjct  545   CGTAGTTCCTTTATTACACCAGGATTTAGTTTTATCCTATGGTTTCTCAAATCAAGACCC  604

Query  600   CCCTCCTACTTTAGATCTGGAAAAGAAACTGCCTCAACAGAATAGCTTATGGGATTTCAT  659
               |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||
Sbjct  605   TTCTCCTACTTTACTTGTGGAAAAGAAACTGCCTCAACAGAATCGCTTATGGGATTCCAT  664

Query  660   GGCTCTTGCCTTTGACATGTTTGGTAGAGCATTCTCTGTATCTGAATCTTTGTTTCCTAC  719
             ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||
Sbjct  665   GGCTCTTGCCTTTGACATGTTTGGTAGAGCATTTTCTCTATCTGAGTCTTTGTTTCCTAC  724

Query  720   TGACGTCTGCCAATGCTCGCTAGAGGTTCTAAGGAAAGTAATGGACGTCCTAGCATCTAA  779
             |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||
Sbjct  725   TGACGTCTCCCAATGCACGCTAGAGGTTCTAAGGAAAGTAATGGACGTATTAGCATCTAA  784

Query  780   GGGCCAGCTTGTCGAAAACCGATTTATGTGGAGGTACGTCTTAAGGGCTTTACAACTATG  839
             |||||||||||||||| ||||||| ||||    |   |     | ||   |   | ||||
Sbjct  785   GGGCCAGCTTGTCGAAGACCGATTCATGT----G---G-----A-GG---T---A-TATG  824

Query  840   CCTTTGGTTTTGTGGAGACTACAATTTACTCCTCTTTTTCCTGGTTTATATTAGACTTGT  899
             ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||
Sbjct  825   CCTTTGGTTTTGTGGAGACTACAATTTACTCCT-TTTTTTCTGGGTTCTATTAGACTTGT  883

Query  900   GGCCCCCTTAGCGGCATTGAGAATGTTTTTCTGTTTTGGACTTACTGGCCCACCTCAGTT  959
              |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  884   TGCCCTCTTAGCGTCATTGAGAATGTTTTTCTGTTTTGGACTTACTGGCCCACCTCAGTT  943

Query  960   ATCTCATTCTGATGTTGTTCACAAAGATAAGCATTTGAATGTCAAGCTTTCTACATTGAT  1019
             |||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct  944   ATCAGTTTCTGATGTTGTTCACAACGATAAGCATTTGAATGTCAAGCTTTCTCCATTGAT  1003

Query  1020  TTCTGGAGTAAGTAAGAATGCCAAGAATACTCCTTATAGGCCACCCCACTTGCGCAAGAG  1079
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1004  TTCTGGAGTAAGTAAGAATGCCAAGAATACTCCTTATAGGCCACCCCACTTGCGCAAGAG  1063

Query  1080  GGATGATTTGAACACTAAGCAGCCAGTGTATTGTGA-CTGGCGGCGCCTGTCTGCTCATG  1138
             ||||||||||||||||| ||||||||||| ||   | |||||||||||| ||||||||||
Sbjct  1064  GGATGATTTGAACACTAGGCAGCCAGTGTCTT-CAAGCTGGCGGCGCCTATCTGCTCATG  1122

Query  1139  ATTCTTGTAGTTCTGATGTTATATCATCAGATTCTGATTTTAGTGACAGTGACGGTTCCG  1198
             ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||
Sbjct  1123  ATTCTGGTAGTTCTGATGTTATATCATCAGATTCCGATTTTAGTGACAGTGACGGCTCCG  1182

Query  1199  TACCGGATTCTTATTTTGCCCAAAGCTCGAAGGTTAGAATAGCTGCAATTGTTTGCATAC  1258
             |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1183  TACCGGATTCTTATTTTGCCCAAAGCTCCAAGGTTAGAATAGCTGCAATTGTTTGCATAC  1242

Query  1259  AGGATCTTTGCCAGGCTGATTCAAAGTCATTTACCACTCAGTGGGTGACTCTCTTTCCAA  1318
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1243  AGGATCTTTGCCAGGCTGATTCAAAGTCATTTACCACTCAGTGGGTGACTCTCTTTCCAA  1302

Query  1319  CAAGTGATGTACTCAAGCCAAGGAAGTTTGAAGCTACTCTAATGACCTGCTTGCTTTTTG  1378
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1303  CAAGTGATGTACTCAAGCCAAGGAAGTTTGAAGCTACTCTAATGACCTGCTTGCTTTTTG  1362

Query  1379  ATCCTCATTTGAAGGTAAGGATTGCATCTGCGTCAGCTCTTGCCACCATGATGGATGGGC  1438
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1363  ATCCTCATTTGAAGGTAAGGATTGCATCTGCGTCAGCTCTTGCCACCATGATGGATGGGC  1422

Query  1439  CTTCATCTATTTTCCTTCAAGTGGCAGAGTACAAGGAATCTACCAAATATGGATCATTTA  1498
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct  1423  CTTCATCTATTTTCCTTCAAGTGGCAGAGTACAAGGAATCTACTAAATATGGATCATTTA  1482

Query  1499  TGCCCCTCTCCAATTCCCTTGGTCTAATATTAATGCAACTCCACACAGGCATTCTACATT  1558
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1483  TGCCCCTCTCCAATTCCCTTGGTCTAATATTAATGCAACTCCACACAGGCATTCTACATT  1542

Query  1559  TGATTCACAGTGATAATCATGGTAGATTGTTGATTCAGCTGTTCAAGATCCTCTTGCTTC  1618
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1543  TGATTCACAGTGATAATCATGGTAGATTGTTGATTCAGCTGTTCAAGATCCTCTTGCTTC  1602

Query  1619  TGATATCAAGCACACCTTACTCGAGAATGCCGGGAGAATTGCTGCCAAAAGTTATAATGT  1678
             | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1603  TAATATCAAGCACACCTTACTCGAGAATGCCGGGAGAATTGCTGCCAAAAGTTATAATGT  1662

Query  1679  CTCTGCATGCTAGGATTAATGAGGGGTTTCCTTTCAAAAATGATAAAACTGGTCTGCTGG  1738
             ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1663  CTCTGCATGCTAGGATTAATGAGGGCTTTCCTTTCAAAAATGATAAAACTGGTCTGCTGG  1722

Query  1739  TTGCTGCAATAGGTTGCCTGACAGCTGCATTTTCCACCTTTCCTCCTCAAATGAAAGTGC  1798
             |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1723  TTGCCGCAATAGGTTGCCTGTCAGCTGCATTTTCCACCTTTCCTCCTCAAATGAAAGTGC  1782

Query  1799  ATTATATGCTTTTGGATGAGACATCAGCAGGATTCGATGGATGTGAATGGAATTCAGGAG  1858
             || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1783  ATAATATGCTTTTGGATGAGACATCAGCAGGATTCAATGGATGTGAATGGAATTCAGGAG  1842

Query  1859  TTCTTTCTACTTTATTTCGTTTTGCTGAGCAATTTTCTGACGCATCAACATGCATTGAGG  1918
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1843  TTCTTTCTACTTTATTTCGTTTTGCTGAGCAATTTTCTGACGCATCAACATGCATTGAGG  1902

Query  1919  CTCTTCAGGTCCTCCGAGCTGTGGCTCTCAATTACCCAACCTTAGTGCCAGCATATTGGG  1978
             |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1903  CTCTTCAGGTCCTCCGAGCTGTGGCTCTCAATTATCCAACCTTAGTGCCAGCATATTGGG  1962

Query  1979  AACGGGTCTCTGTCCTCGTGTATAAACTTTTGCAGTCTGCTGTTGTTGAAGATTCTCAAA  2038
             || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct  1963  AAAGGGTCTCTATCCTCGTGTATAAACTTTTGCAGTCTGCTGTTGTTGAAGATTCTCCAA  2022

Query  2039  CGACATGGAAGGCTTCAGTTAGAGAGTCTGTTGGATATAAT-GGG-----G-------A-  2084
             ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||     |       | 
Sbjct  2023  CGACATGGAAGTCTTCGGTTAGAGAGTCTGTTGGATATAATGGGGATAAAGTCCTTACAG  2082

Query  2085  ----TA--AA-GTTTTGGATGGATGCCTTCGCGCAATATCTGGATTTAAGGGAACAGAAG  2137
                 ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct  2083  CTGCTATTAAGGTTTTGGATGGATGCCTTCGCGCAATATCTGGATTTAAGGGAACCGAAG  2142

Query  2138  ATCTTCAGTACGATAGATTAATGGATACACCATTTACATCTGACTGCATAAGGTCAATAA  2197
             |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2143  ATCTTCAGTATGATAGATTAATGGATACACCATTTACATCTGACTGCATAAGGTCAATAA  2202

Query  2198  GAATCTCATCTGCACCATCATATGGATTTGATAATACCCAAGAGCCAATCTTTCAGGCAG  2257
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2203  GAATCTCATCTGCACCATCATATGGATTTGATAATACCCAAGAGCCAATCTTTCAGGCAG  2262

Query  2258  GATGTGACCAATGGTCTGAGGCTATTCGTAAACATATAGTTCTGGTGTTACACCATGGTT  2317
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2263  GATGTGACCAATGGTCTGAGGCTATTCGTAAACATATAGTTCTGGTGTTACACCATGGTT  2322

Query  2318  CTGCAGTGGTGAGGAGCACTACAGTTACTTGCTTTGCTGGTATAACATCCTCCATATTTG  2377
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| 
Sbjct  2323  CTGCAGTGGTGAGGAGCACTACAGTTACTTGCTTTGCTGGTATTACATCCTCCATATTTT  2382

Query  2378  CCGCTTTCAATAAGCAGGAAAAGGACTTTATTACTTCATCAATTATAACCGCTGCATTGC  2437
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2383  CCGCTTTCAATAAGCAGGAAAAGGACTTTATTACTTCATCAATTATAACCGCTGCATTGC  2442

Query  2438  ATGACAAAACACCTTCAGTCCGATCAGCAGCTTGCCGCGCTATTGGTGTAATTTCATGTT  2497
             |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||
Sbjct  2443  ATGACAAAACACCTTCAGTCAGATCAGCAGCTTGCCGAGCGATTGGTGTTATTTCATGTT  2502

Query  2498  TTCCAGAAACTTCTTTAAGTGCGGAGATATATGAAAAATTTATCATAGCTGTTGAAGCAA  2557
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
Sbjct  2503  TTCCAGAAACTTCTTTAAGTGCGGAGATATATGAAAAATTTATCTTAGCTGTTGAAGCGA  2562

Query  2558  ATACCCGCGACTCCTTGACCTCGGTGCGTATAACAGCATCATGGGCCTTGGCCAATGTAT  2617
             ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||
Sbjct  2563  ATACCCGGGACTCCTTGACCTCGGTGCGTATAACAGCATCATGGGCTTTGGCCAATCTAT  2622

Query  2618  GCGATGCTCTACGATACCGCGTCGATGATAGATCCTTTGAAGGATTAAAGACAACTTCAC  2677
             |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct  2623  GCGATGCTCTGCGATACCGCGTTGATGATAGGTCCTTTGAAGGATTGAAGACAACTTCAC  2682

Query  2678  AAGTTGTGGATGCACTAATAGAATGTGCTTTGCGCCTAACTGAGGATGGGGACAAGGTTA  2737
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2683  AAGTTGTGGATGCACTAATAGAATGTGCTTTGCGCCTAACTGAGGATGGGGACAAGGTTA  2742

Query  2738  AATCCAATGCAGTTCGGGCACTGGGGAGTATTTCAAAATATGTAAACTTGAGATGCATGA  2797
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct  2743  AATCCAATGCAGTTCGGGCACTGGGGAGTATTTCAAAATATGTAAAATTGAGATGCATGA  2802

Query  2798  CAAGTATAAAGTCAGTGGACCAAGATGTATTACCTTTTCCCCATCAACATTCATCAAATT  2857
             |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct  2803  CAAGTATAAAGTCAGTGGACCAAGATGTGTTACCTTTTCCCCATCAACAGTCATCAAATT  2862

Query  2858  CCCACCATCTATCCTGCGCGGGAGATACAAGGTGGTTGGAGAGAACCGTTCAGGCATTTC  2917
             | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||
Sbjct  2863  CTCACCATCTATCCTGCGCGGTAGATACAAGGTGGTTGGAGAGAACCGTGCAAGCATTTC  2922

Query  2918  TTTCCTGTGTTACTACTGGTAATGTTAAGGTTCAATGGAATGTTTGTCATGCGTTGAGCA  2977
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2923  TTTCCTGTGTTACTACTGGTAATGTTAAGGTTCAATGGAATGTTTGTCATGCGTTGAGCA  2982

Query  2978  ATTTATTCTCCAATGAGACAGTAAAATTGCAAGATATGGATTGGGCTCCAAGTGTTTTTA  3037
             |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2983  ATTTATTCTCCAATGAGACAGTAAAACTGCAAGATATGGATTGGGCTCCAAGTGTTTTTA  3042

Query  3038  GTATCTTACTATTGCTGCTTCGTGATGCATCAAACTTTAAGATTAGAATACAAGCTGCTG  3097
             |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| 
Sbjct  3043  GTATCTTACTATTGCTACTTCGTGATGCATCAAACTTTAAGATAAGAATACAAGCTGCTT  3102

Query  3098  CCGCTTTAGCTGTCCCAGCAACCCCACTTGCTTATGGGAGATCATTCCCTGATGTTGTCA  3157
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3103  CCGCTTTAGCTGTCCCAGCAACCCCACTTGCTTATGGGAGATCATTCCCTGATGTTGTCA  3162

Query  3158  AAGGTGTAGAGCATACTTTACAAAGTCTGCATTCTGACAGAGAGACGACTCCAACAAATT  3217
             |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct  3163  AAGGTGTAGAGCATACTTTACAAAGTCTCCATTCTGACAGAGAGACGACTCCAGCAAATT  3222

Query  3218  TTAAATATAAGAGATCGCTTGAGAATCAGTTAACCTCAACCATGCTGCATCTCCTGAGCC  3277
             | ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3223  TCAAATATAAGAGGTCGCTTGAGAATCAGTTAACGTCAACCATGCTGCATCTCCTGAGCC  3282

Query  3278  TAGTTTCAAGCTGTCATTTCGAAGCGTTGACTGATTTTCTTATAAGAAAAGCCGCTTTTC  3337
             ||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| | ||||
Sbjct  3283  TAGTTTCAAGCTGTCATTTCGAAGCGTTGTCAGAATTTCTTATAAGAAAAGCCTCATTTC  3342

Query  3338  TAGAGGAGTGGTTGAGAGGATTGTGTGTGACATTGAAGGAGGAAGATAATGTGTCTGGAT  3397
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||
Sbjct  3343  TAGAGGAGTGGTTGAGAGGATTGTGTGTGACATTGAAAGAGGAAGATAATGTTTCTGGAT  3402

Query  3398  CAAGCGGCACAAGCACTTCGGGTGGGAAGCTGAAGAAAGAGTTGATCTCTAGAGCGATAC  3457
             |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct  3403  CAAGCGGCACAAGCACTTCGGGTGGGAAGCAGAAGAAAGAGTTGATCTCTAGAGCTATAC  3462

Query  3458  GGTCGCTTGCCAGAAGCTTGCGGGCTGGACATAGCTCTGAAATGGCTCTAAAGTTGCAGG  3517
             |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct  3463  GGTCGCTTGCCAGAAGTTTGCGGGCTGGACATAGCTCTGAAATGGCTCAAAAGTTGCAGG  3522

Query  3518  AGTTAGAGAGCAATG--AATTGACTGAGCAAGCAATGCTTCTCGATCTGGTTAACTTGGC  3575
             ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct  3523  AGTTAGATAGCAATGTGAATTGACTGAGCAAGCAATGCTTCTCGATCGGGTTAACTTGGC  3582

Query  3576  TCTGTAATTTCTAACTCAAGTGACTGTAAACAATTCAATACATGTACATTAGCTCCCATG  3635
              |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct  3583  CCTGTAATTTCCAACTCAAGTGACTGTAAACAGTTCAACACATGTACATTAGCTCCCATG  3642

Query  3636  ACAAATTTTGCTAAAAGAATCAGAATGAAATTGGCGGATATATTATAG  3683
             ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3643  ACAAATTTTGCCAAAAGCATCAGAATGAAATTGGCGGATATATTATAG  3690



Lambda     K      H
    1.33    0.621     1.12 

Gapped
Lambda     K      H
    1.28    0.460    0.850 

Effective search space used: 183410343608


  Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
    Posted date:  Sep 25, 2014  6:13 PM
  Number of letters in database: 51,074,197
  Number of sequences in database:  33,602



Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5