BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg490579
Length=5253
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT4G38200.1 | Symbols: | SEC7-like guanine nucleotide exchange... 6951 0.0
> AT4G38200.1 | Symbols: | SEC7-like guanine nucleotide exchange
family protein | chr4:17915293-17922732 FORWARD LENGTH=5294
Length=5294
Score = 6951 bits (3764), Expect = 0.0
Identities = 4010/4126 (97%), Gaps = 27/4126 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1018 AGGTTTCTAAATGCCATCAAGCAATAT-CTCTGCCTGTCTCTATTAAAGAATAGCGCACT 1076
||||||||||||||||||||||| | | |||||| |||| || |||||||||||||||||
Sbjct 979 AGGTTTCTAAATGCCATCAAGCAGT-TGCTCTGCTTGTCGCTGTTAAAGAATAGCGCACT 1037
Query 1077 CTCGATTATGTCTATTTTTCAACTTCAATGTGCTATCTTCACTACCTTACTACGGAAATA 1136
||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1038 TTCGGTTATGTCTATTTTTCAACTTCAGTGTGCTATCTTCACAACCTTACTACGGAAATA 1097
Query 1137 TAGATCGGGTATGAAATCAGAAGTAGGTATATTCTTCCCGATGCTTGTCCTCCGGGTCCT 1196
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1098 TAGATCGGGTATGAAATCAGAAGTAGGTATATTCTTTCCGATGCTTGTCCTCCGGGTCCT 1157
Query 1197 TGAAAATGTTCTCCAGCCAAGTTTCGTGCAGAAAATGACCGTGCTCAGCTTACTCGAGAA 1256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1158 TGAAAATGTTCTCCAGCCAAGTTTCGTGCAGAAAATGACCGTGCTCAGCTTACTCGAGAA 1217
Query 1257 CATTTGCCACGACCCAAACCTAATCATTGACATATTTGTGAACTTTGACTGCGATGTGGA 1316
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1218 CATTTGCCACGACCCAAACCTAATCATTGACATATTTGTGAACTTTGACTGCGATGTGGA 1277
Query 1317 GTCTCCGAACATCTTCGAAAGGATTGTCAACGGTCTTCTGAAAACTGCTCTAGGGCCTCC 1376
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1278 GTCTCCCAACATCTTCGAAAGGATTGTCAACGGTCTTCTGAAAACTGCTCTAGGGCCTCC 1337
Query 1377 TCCTGGTTCATCGACAATATTGTCCCCAGTCCAGGATATTACTTTTCGGCACGAATCTGT 1436
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1338 TCCTGGTTCATCGACAATATTGTCCCCAGTCCAGGATATTACTTTTCGGCACGAATCTGT 1397
Query 1437 GAAGTGCTTGGTTAGCATTATTAAGGCAATGGGAACATGGATGGACCAACAATTGAGCAC 1496
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1398 GAAGTGCTTGGTTAGCATTATTAAGGCAATGGGAACATGGATGGACCAACAATTGAGCGT 1457
Query 1497 GGGAGAATCACTTCTGCCTAAGAGCTTAGAAAATGAAGCACCTGCAAACAATCATTCAAA 1556
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1458 GGGAGATTCACTTCTGCCTAAGAGCTTAGAAAATGAGGCACCTGCAAACAATCATTCAAA 1517
Query 1557 CTCAAATGAAGAAGACGGGACAACTACAGATCATGACTTTCACCCAGATTTGAGTTCAGA 1616
||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||
Sbjct 1518 CTCAAATGAAGAAGATGGGACGACTATAGATCATGACTTTCACCCAGATTTGAATCCAGA 1577
Query 1617 GTCATCAGACGCTGCAACTCTTGAACAAAGGAGGGCATACAAAATTGAACGCCAGAAAGG 1676
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1578 GTCATCAGACGCTGCAACTCTTGAACAGAGGAGGGCATACAAAATTGAACGCCAGAAAGG 1637
Query 1677 CGTCACTCTATTCAATAGAAAGCCGTCAAAGGGTATTGAGTTTCTTATCAGCTCTAAAAA 1736
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1638 CGTCACTCTATTCAATAGAAAGCCGTCAAAGGGTATTGAGTTTCTTATCAGCTCTAAAAA 1697
Query 1737 GGTTGGCAACTCCCCGGATGAGGTGGTATCGTTCCTGAGGAATACCACAGGCTTGAATGC 1796
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1698 GGTTGGCAACTCCCCGGATGAGGTGGTGTCGTTCCTGAGGAATACCACAGGCTTGAATGC 1757
Query 1797 AACCATGATTGGTGATTATTTGGGTGAAAGAGAGGAGTTTCCAATGAAAGTTATGCATGC 1856
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1758 AACCATGATTGGTGATTATTTGGGTGAAAGAGAGGATTTTCCAATGAAAGTTATGCATGC 1817
Query 1857 CTATGTGGACTCGTTTGATTTCAAGGAGATGAATTTTGGTGAGGCAATTAGGTTTTTCTT 1916
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1818 CTATGTGGACTCGTTTGATTTCAAGGAGATGAATTTTGGTGAGGCAATTAGGTTTTTCTT 1877
Query 1917 AAGGGGCTTCAGGCTTCCTGGGGAAGCACAGAAAATTGACCGCATAATGGAAAAGTTTGC 1976
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1878 AAGGGGCTTCAGGCTTCCTGGGGAAGCACAGAAAATTGACCGCATAATGGAAAAGTTTGC 1937
Query 1977 TGAACGCTTTTGCAAATGCAATCCAAATTCATTCAGCAGTGCTGACACAGCATATGTTCT 2036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1938 TGAACGCTTTTGCAAATGCAATCCAAATTCATTCAGCAGTGCTGACACAGCATATGTTCT 1997
Query 2037 TGCATACTCTGTAATAATGCTTAACACTGATGCCCACAATGTCATGGTTAAAGAGAAGAT 2096
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1998 TGCATACTCTGTAATAATGCTTAACACTGATGCCCACAATATCATGGTTAAAGAGAAGAT 2057
Query 2097 GACCAAGGCTGATTTTATCAGAAATAACCGAGGCATTGATGATGGCAAAGATCTCCCAGA 2156
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2058 GACCAAGGCTGATTTTATCAGAAATAACCGAGGCATTGATGATGGCAAAGATCTCCCAGA 2117
Query 2157 AGAGTATCTTGGTGCGCTTTATGATCAAGTTGTCAAAAATGAAATAAAGATGAGTTCTGA 2216
|||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2118 AGAGTATCTTGGTGCGCTTTATGACCAAGTTGTCATAAATGAAATAAAGATGAGTTCTGA 2177
Query 2217 TTCTTCTGCCCCAGAAAGCAGGCAGTCCAATGGCCTGAATAAACTACTGGGTCTGGACGG 2276
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2178 TTCTTCAGCCCCAGAAAGCAGGCAGTCCAATGGCCTGAATAAACTACTGGGTCTGGACGG 2237
Query 2277 TATACTCAATCTGGTTTATTGGACACAGACAGAAGAAAAAGCGGTGGGGGCTAATGGTCT 2336
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2238 TATACTCAATCTGGTTTATTGGACACAGACGGAAGAAAAAGCGGTGGGGGCTAATGGTCT 2297
Query 2337 TCTTATAAAGCATATTCAAGAAAAGTTCAGGTCGAAGTCTGGAAAATCAGAATCAGCTTA 2396
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2298 TCTTATAAAGGATATTCAAGAAAAGTTCAGGTCGAAGTCTGGAAAATCAGAATCAGCTTA 2357
Query 2397 CCATGTAGTCACAGACGTTGCAATATTGCGTTTTATGGTTGAAGTTTCCTGGGGACCAAT 2456
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2358 CCATGTAGTCACAGACGTTGCAATATTGCGTTTTATGGTTGAAGTTTCCTGGGGACCAAT 2417
Query 2457 GCTTGCCGCATTCAGCGTGACACTTGATCAGAGTGATGACAGGCTTGCTGCAGTTGAATG 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2418 GCTTGCCGCATTCAGCGTGACACTTGATCAGAGTGATGACAGGCTTGCTGCAGTTGAATG 2477
Query 2517 CTTACGAGGCTTTCGGTATGCAGTTCATGTGACAGCAGTTATGGGTATGCAAACGCAAAG 2576
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2478 CTTACGAGGCTTTCGGTATGCAGTTCATGTGACAGCAGTTATGGGTATGCAAACGCAAAG 2537
Query 2577 AGATGCATTTGTCACTTCCATGGCCAAGTTCACAAATCTCCATTGCGCAGGAGATATGAA 2636
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2538 AGATGCATTTGTCACTTCCATGGCCAAGTTCACAAATCTCCATTGCGCAGGAGATATGAA 2597
Query 2637 GCAAAAGAATGTCGATGCTGTTAAAGCCATCATATCAATTGCCATTGAAGATGGTAATCA 2696
|||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2598 GCAAAAGAATGTCGATGCTGTTAAAGCCATAATTTCAATTGCCATTGAAGATGGTAATCA 2657
Query 2697 CTTGCAAGATGCTTGGGAGCACATTTTGACTTGTCTTTCTAGAATAGAGCATTTGCAATT 2756
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2658 CTTGCAAGATGCTTGGGAGCACATTTTGACTTGTCTTTCTAGAATAGAGCATTTGCAATT 2717
Query 2757 ATTGGGTGAGGGTGCTCCAAGTGATGCATCTTATTTTGCTTCATCCGAGACCGAAGAGAA 2816
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2718 ATTGGGCGAGGGTGCTCCAAGTGATGCATCTTATTTTGCTTCAACCGAGACCGAAGAGAA 2777
Query 2817 GAAAGCCTTGGGGTTTCCTAACTTGAAGAAAAAAGGAGCCCTCCAGAATCCGGTGATGAT 2876
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2778 GAAAGCCTTGGGTTTTCCTAACTTGAAGAAAAAAGGAGCCCTCCAGAATCCGGTGATGAT 2837
Query 2877 GGCTGTGGTTCGAGGGGGCTCATATGATAGCAGCGCAGTTGGACCAAATATGCCGGGGCT 2936
||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2838 GGCTGTGGTTCGAGGGGGCTCATATGATAGCAGTACAATTGGACCAAATATGCCGGGGCT 2897
Query 2937 TGTGAAGCAGGACCAAATCAATAACTTCATTGCAAACTTGAATTTGCTTGACCAGATCGG 2996
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2898 TGTGAAGCAGGACCAAATCAATAACTTCATTGCAAACTTGAATTTGCTTGACCAGATCGG 2957
Query 2997 GAGTTTTCAGTTGAATAATGTATATGCTCATAGCCAGCGGTTGAAGACTGAAGCCATAGT 3056
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2958 GAGTTTTCAGTTGAATAATGTATATGCTCATAGCCAGCGGCTGAAGACTGAAGCCATAGT 3017
Query 3057 AGCATTTGTTAAAGCTCTATGCAAAGTCTCTATGTCAGAACTGCAGTCTCCTACGGATCC 3116
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3018 AGCATTTGTTAAAGCTCTATGCAAAGTCTCTATGTCAGAACTGCAGTCTCCTACGGATCC 3077
Query 3117 TCGAGTGTTTAGCCTCACAAAATTAGTTGAGATCGCCCACTACAACATGAACCGCATCAG 3176
|||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3078 TCGAGTATTTAGCCTTACAAAATTAGTTGAGATCGCCCACTACAACATGAACCGCATCAG 3137
Query 3177 GCTAGTCTGGTCTCGCATTTGGAGCATCCTGTCAGAtttttttGTATCTGTTGGCTTGTC 3236
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3138 GCTAGTCTGGTCTCGCATATGGAGCATCCTGTCAGATTTTTTTGTATCTGTTGGCTTGTC 3197
Query 3237 AGAGAATCTTTCTGTTGCAATATTCGTTATGGACTCACTACGACAACTGTCTATGAAGTT 3296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3198 AGAGAATCTTTCTGTTGCAATATTCGTTATGGACTCACTACGACAACTGTCTATGAAGTT 3257
Query 3297 CTTGGAACGTGAGGAGCTGGCAAATTATAACTTTCAGAATGAATTTCTTCGACCATTTGT 3356
||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3258 CTTGGAACGTGAGGAGCTGGCTAATTACAACTTTCAGAATGAATTTCTTCGACCATTTGT 3317
Query 3357 CATTGTTATGCAAAAAAGCAGTTCTGCTGAAATAAGAGAACTAATAGTTCGGTGCATTTC 3416
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3318 CATTGTTATGCAAAAAAGCAGTTCTGCTGAAATAAGAGAACTAATAGTTCGGTGCATTTC 3377
Query 3417 TCAAATGGTACTCAGCCGTGTCAGTAATGTGAAATCAGGGTGGAAAAGTGTTTTCAAGGT 3476
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3378 TCAAATGGTACTCAGCCGTGTCAGTAATGTGAAATCAGGGTGGAAAAGTGTTTTCAAGGT 3437
Query 3477 TTTCACAACTGCAGCAGCTGATGAAAGGAAAAACATTGTATTGTTGGCCTTTGAGACAAT 3536
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3438 TTTCACAACTGCAGCAGCTGATGAAAGGAAGAACATTGTATTGTTGGCCTTTGAGACGAT 3497
Query 3537 GGAAAAAATTGTCCGAGAGTACTTTTCATACATCACAGAGACGGAGGCAACAACCTTTAC 3596
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3498 GGAAAAAATTGTCCGAGAGTACTTTTCATATATCACAGAGACGGAGGCAACAACCTTTAC 3557
Query 3597 TGATTGTGTTAGATGCCTCATAACTTTCACAAACAGCACGTTTACCAGCGATGTTAGCCT 3656
|||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3558 TGATTGTGTTCGATGCCTCATAACTTTTACAAACAGCACATTTACCAGCGATGTTAGCCT 3617
Query 3657 GAACGCTATCGCGTTTCTACGATTTTGTGCCCTAAAACTTGCAGACGGAGGCCTTGTGTG 3716
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3618 GAACGCTATCGCGTTTCTACGATTTTGTGCCCTAAAACTTGCAGACGGAGGCCTCGTGTG 3677
Query 3717 GAATGAGAAGGGTAGGTCCAGCAGTCCCGGTACTCCAGTAACAGATGACCATGCACCAAA 3776
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3678 GAATGAGAAGGGTAGGTCCAGCAGTCCCAGTACTCCAGTAACAGATGACCATTCACCAAG 3737
Query 3777 TACCCAAAATTTTATGGATGCAGATGAGAATATTTCATATTGGGTTCCTTTGCTCACAGG 3836
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3738 TACCCAAAATTTTATGGATGCAGATGAGAATATTTCATATTGGGTTCCTTTGCTCACAGG 3797
Query 3837 ATTGTCTACGCTAACTTCTGATTCCAGATCAGCAATCCGTAAAAGCTCCTTGGAAGTTCT 3896
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3798 ATTGTCTAAGCTAACTTCTGATTCCAGATCAGCAATCCGTAAAAGCTCCTTGGAAGTGCT 3857
Query 3897 CTTTAATATTTTAAAGGATCATGGCCATATTTTTTCACGAACATTCTGGATCGGCGTTTT 3956
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3858 CTTTAATATTTTGAAGGATCATGGCCATATTTTTTCACGAACATTCTGGATCGGCGTTTT 3917
Query 3957 CAGTTCTGTTATTTATCCTATATTTAACAGTGTGTGGGGCGAGAATGATCTGCTTTCTAA 4016
||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3918 TAGTTCTGTTATATATCCTATATTTAACAGCGTCTGGGGCGAGAATGATCTGCTTTCTAA 3977
Query 4017 AGATGAACACACTTCATTTCCATCTACATTTTCTCCACATCCTAGTGAAGTTTCTTGGGA 4076
||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3978 AGATGAACATAGTTCATTTCCATCTACATTTTCTTCACATCCTAGTGAAGTTTCTTGGGA 4037
Query 4077 TGCTGAGACTTCAGCTATGGCGGCACAGTCTCTGGTAGACCTATTTGTCAGCTTTTTTAC 4136
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 4038 TGCTGAGACTTCAGCTATGGCGGCACAGTATCTGGTAGACCTATTTGTCAGTTTTTTTAC 4097
Query 4137 TGTGATAAGGTCTCAACTTTCAAGTGTAGTATCCTTACTTGCTGGTCTTATAAGAAGTCC 4196
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4098 TGTGATAAGGTCTCAACTTTCAAGTGTAGTATCCTTACTTGCTGGTCTTATAAGAAGTCC 4157
Query 4197 AGCTCAGGGTCCTACAGTAGCTGGAGTTGGCGCGTTGTTGCGGTTGGCAGACGAATTGGG 4256
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 4158 AGCTCAGGGTCCTACAGTAGCTGGGGTTGGCGCGTTGCTGCGGTTGGCAGACGAATTGGG 4217
Query 4257 TGACAGGTTCTCGGAAGATGAGTGGAAGGAGAtttttttGGCTGTGAAAGAAGCTGCTTC 4316
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 4218 TGACAGGTTCTCGGAAAATGAGTGGAAGGAGATTTTTTTGGCTGTGAACGAAGCTGCTTC 4277
Query 4317 ATTGACATTGTCTAGTTTCATGAAAACACTGAGAACCATGGATGACATTCCAGATGAGGA 4376
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4278 ATTGACATTGTCTAGTTTCATGAAAACACTGAGAACCATGGATGACATTCCAGATGAGGA 4337
Query 4377 --C-TT-T---A---G---T--A--A-TGAAGATGACGTCGACGAGGACAGCCTGCAAAC 4418
| || | | | | | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 4338 TACATTGTCTGATCAGGACTTTAGTAATGAAGATGACATCGACGAGGACAGCCTGCAAAC 4397
Query 4419 TATGTCTTATGTTGTTGCAAGAACAAAGAGTCACATAGCCGTCCAGTTGCAAGTTGTTCA 4478
||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||
Sbjct 4398 TATGTCTTATGTTGTGGCAAGAACAAAAAGTCACATAACCGTCCAGCTGCAAGTTGTTCA 4457
Query 4479 GGTAGTGACGGATCTCTACCGAATCCATCAGCAGTCATTGTTGGCATCGCACGTCACTGT 4538
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 4458 GGTAGTGACGGATCTCTACCGAATCCATCAGCAGTCATTGTTGGCATCGCACGTTACTGT 4517
Query 4539 TATACTGGAGATACTCTCATCAATCTCATCACATGCCCACCAGCTAAATTCTGATTTGAT 4598
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 4518 TATACTGGAGATACTCTCATCAATCTCATCACATGCCCACCAGTTAAATTCTGATTTGAT 4577
Query 4599 ATTGCAGAAGAAAGTGAGGAGAGCGTGCTCTATCCTGGAGCTCTCTGAACCTCCCATGCT 4658
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4578 ATTGCAGAAGAAAGTGAGGAGAGCGTGCTCTATCCTGGAGCTCTCTGAACCTCCCATGCT 4637
Query 4659 TCATTTCGAAAATGACACGCATCAGAACTACCTGGACATTCTTCAAGCCATACTGACATA 4718
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
Sbjct 4638 TCATTTCGAAAATGACACGTTTCAGAACTACCTGGACATTCTTCAAGCCATAGTGACAAA 4697
Query 4719 CAATCCAGGAGTGTCCTTGGAGCTAAACATAGAGTCTCAGCTGATGACAGTGTGTGTGCA 4778
|||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 4698 TAATCCAGGAGTGTCGTTGGAGCTAAACGTAGAGTCTCAGCTGATGACAGTGTGTATGCA 4757
Query 4779 ATTACTGAAGATGTACCTGAAATGCACTTTGTTTCAGGGTGAAGAGTTGGAAGAAACCAG 4838
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 4758 AATACTGAAGATGTACCTGAAATGCACTTTGTTTCAGGGTGATGAGTTGGAAGAAACCAG 4817
Query 4839 GCAGCCCAAAAACTGGATTCTACCCATGGGAGCAGCATCGAAGGAAGAAGCAGCAGCGAG 4898
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 4818 GCAGCCCAAAAACTGGATTCTACCCATGGGAGCAGCCTCGAAGGAAGAAGCAGCAGCGAG 4877
Query 4899 ATCTCCCCTAGTGGTTGCAGTGCTGAAGGCTCTGAGGGGACTGAAAAGAGATTCATTCAA 4958
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 4878 ATCTCCCCTAGTGGTTGCAGTGCTGAAGGCTCTGAGGGAACTGAAAAGAGATTCATTCAA 4937
Query 4959 GAGGTATGCACCAAATTTCTTCCCATTGTTGGTGGAGCTTGTGCGGAGCGAGCACAGCTC 5018
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4938 GAGGTATGCACCGAATTTCTTCCCATTGTTGGTGGAGCTTGTGCGGAGCGAGCACAGCTC 4997
Query 5019 TTCACAAGTCCCACAAGTCTTAAGCACAGTGTTCCATACATGTATGGGTGCAATGATGGA 5078
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4998 TTCACAAGTCCCACAAGTCTTAAGCACAGTGTTCCATACATGTATGGGTGCAATGATGGA 5057
Query 5079 TGAATAGAATTGGGTGGTTATAAGTGCGCTGAATTTTGACATTCGA 5124
|||||| | | ||||||||||||||| | | |||||||||||||
Sbjct 5058 TGAATA-A-TAGGGTGGTTATAAGTG-G--G--TTTTGACATTCGA 5096
Score = 1574 bits (852), Expect = 0.0
Identities = 947/991 (96%), Gaps = 14/991 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGTCGTCGTCGCAGAACCTTGGTGGCGCCACGAGATGCGGCCGGGTGATTGGGCCATCT 60
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTCGTCGTCGCAGAACCTTGGTGGCGCCACCAGATGCGGCCGGGTGATTGGGCCATCT 60
Query 61 TTGGACAAGATCATCAAAAATGCCGCCTGGCGCAAGCACACCTTCCTTGTTTCCGCCTGT 120
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 TTGGACAAGATCATAAAAAATGCCGCCTGGCGCAAGCACACCTTCCTTGTTTCCGCCTGT 120
Query 121 AAGTCTGTCCTCGACAAGCTCG-AGACTCTTTCTGATTCTCCCGATCCTTGGTCGCCTCT 179
|||||||| ||||||||||||| || |||| || |||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 121 AAGTCTGTACTCGACAAGCTCGAAG-CTCTCTCCGATTCTCCCGATCCTTCGTCGCCTCT 179
Query 180 CTTCGGTCTCACCACTTCCGATTCAGATGCCGTCCTTCAGCCACTTCTTCTCTCTCTTGA 239
|||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 180 CTTCGGTCTCACTACCTCCGATGCAGATGCCGTTCTTCAGCCACTCCTTCTCTCTCTTGA 239
Query 240 TACCGGCTACGCCAAGGTTATTGAGCCTGCTCTCGATTGCTCTTTCAAGctcttctctct 299
||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 240 TACCGGCTATGCTAAGGTTATTGAGCCTGCTCTCGATTGCTCTTTCAAGCTCTTCTCTCT 299
Query 300 ctcccttctccggggcgaggtctgctcctcttcccctgattctcttctctACAAGCTCAT 359
|||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 300 CTCCCTCCTCCGGGGCGAGGTCTGCTCCTCGTCCCCTGATTCTCTTCTCTACAAGCTCAT 359
Query 360 CCATGCGATCTGCAAGGTTTGCGGCATCGGCGAGGAGTCTGTTGAGCTGGCGGTCCTTCG 419
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 360 CCATGCGATCTGCAAGGTTTGCGGCATCGGCGAGGAGTCAATTGAGCTGGCGGTCCTTCG 419
Query 420 TGTCCTCCTCGCCGCCGTCAGATCTCCTCGCATCCTAATCCGTGGCGATTGTTTGCTCCA 479
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 420 TGTCCTCCTCGCCGCCGTCAGATCTCCTCGCATCCTAATCCGTGGCGATTGTTTGCTCCA 479
Query 480 TCTAGTCAGGACCTGCTACAATGTGTATCTCGGCGGATTCAACGGGACCAACCAGATCTG 539
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 480 TCTAGTCAGGACCTGCTACAATGTGTATCTCGGCGGATTCAACGGGACCAACCAGATCTG 539
Query 540 CGCTAAATCTGTGTTGGCTCAGATCATGCTCATCGTCTTCACCAGATCCGAGGCCAATTC 599
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 540 CGCTAAATCTGTGCTGGCTCAGATCATGCTCATCGTCTTCACCAGATCCGAGGCGAATTC 599
Query 600 TATGGATGTATCACTCAAAACGGTTAACGTCAACGACTTGCTTGCCATCACGGATAAGAA 659
||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 600 CATGGATGCATCACTCAAAACGGTTAATGTCAACGACTTGCTTGCCATCACGGATAAGAA 659
Query 660 TGTCAACGAAGGGAACTCTGTTCATATTTGTCAGGGATTCATTAACGACGTTATTACGGC 719
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 660 TGTCAACGAAGGGAACTCTGTTCATATTTGTCAGGGATTCATTAACGACGTCATTACGGC 719
Query 720 CGGGGAAGCAGCTCCTCCTCCGGATTTCATGCTAGTCTTGCAGGGCCAACCACCAGACGA 779
|||||||||||||||||||||||||||| || | || || |||||||||||| ||
Sbjct 720 CGGGGAAGCAGCTCCTCCTCCGGATTTC--GC--G-CT---AGT-CCAACCACCAGAGGA 770
Query 780 AGGTGCTTCTTCAACTGAGGATGTGGGCACA---AGCAAGATCATGGAAGACGGTTTCCT 836
||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 771 AGGTGCTTCTTCAACTGAGGATGAAGGCACAGGCAGCAAGATCAGGGAAGACGGTTTCCT 830
Query 837 TCTCTTCAAAAACCTCTGTAAGTTGTCTATGAAGTTCTCGTCACAAGAGAACACCGACGA 896
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 831 TCTCTTCAAAAATCTCTGTAAGTTGTCTATGAAGTTCTCGTCACAAGAGAACACCGACGA 890
Query 897 TCAGATTCTTGTGAGAGGCAAGACTTTGTCCCTCGAGTTGCTCAAAGTCATCATTGATAA 956
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 891 TCAGATTCTTGTGAGAGGCAAGACTTTGTCTCTCGAGTTGCTCAAAGTCATCATTGATAA 950
Query 957 CGGCGGCCCAATTTGGCTCTCTGACGAAAGG 987
|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 951 CGGCGGCCCAATTTGGCTCTCTGACGAAAGG 981
Score = 224 bits (121), Expect = 7e-57
Identities = 129/133 (97%), Gaps = 0/133 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 5121 TCGATGGAGATGCGAGATTTACAGGTTTTGTGCGGTTGATTGCTAGTGCTGATATAAAGT 5180
|||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 5162 TCGACGGAGATGCGAGATTTACAGGTTTTGTGCTGTTGATTGATAGTGCTGATATAAAGT 5221
Query 5181 AATTGATTACTGTTTGTAGAAACTAAGAAAAGTATGGTGAGATTAGGAGGGTCATTGCAT 5240
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5222 AATTGATTACTGTTTGTAGAAACTAAGAAAAGAATGGTGAGATTAGGAGGGTCATTGCAT 5281
Query 5241 TTTGTCTGCAATG 5253
|||||||||||||
Sbjct 5282 TTTGTCTGCAATG 5294
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 262172444118
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5