BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg490723
Length=5009
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT4G39420.2 | Symbols: | unknown protein; INVOLVED IN: biologi... 6663 0.0
> AT4G39420.2 | Symbols: | unknown protein; INVOLVED IN: biological_process
unknown; LOCATED IN: cellular_component unknown;
EXPRESSED IN: leaf; EXPRESSED DURING: LP.04 four leaves visible,
LP.02 two leaves visible; Has 20 Blast hits to 19 proteins
in 8 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 0;
Fungi - 0; Plants - 20; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 0 (source:
NCBI BLink). | chr4:18339287-18355093 FORWARD LENGTH=10189
Length=10189
Score = 6663 bits (3608), Expect = 0.0
Identities = 3914/4061 (96%), Gaps = 23/4061 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 960 GGCATCGAAGGAGTTTGGTGATCAACGTTTAAAAGCTCACATACTGACTGTTTTGAGATA 1019
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6092 GGCATCGAAGGAGTTTGGTGATCAACGTTTAAAAGCTCACATACTGACTGTTTTGAGATA 6151
Query 1020 TGCCAACTCAAAAAAGAAAGCCAGCATATTGTACTCAGATGACCCAAGCAGAGGTTTTTC 1079
||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 6152 TGCCAACTCAAAAAAGAAAGCCACCACATCGTTCTCAGATGACCCAAGCAGAGGACTTTC 6211
Query 1080 ATGTTCCTCCTCAGAGGGTGGAGCTTATGTCTCTGCTGAACTCTTTCGTGTTTTGGCTTA 1139
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 6212 ATGTTCCCCCTCAGAGGGTGGAGCTTATGTCTCTGCTGAACTCTTTCGTGTTTTGGCATA 6271
Query 1140 CTCTGAGAAGCTAAAGAATCCTGGGGGATACCTTTTATCGAAAGCTAAGGAATTATCGTG 1199
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||
Sbjct 6272 CTCTGAGAAGCTAAAGAATCCTGGGGAATACCTTTTGTCAAAAGCTAAGGAATTCTCGTG 6331
Query 1200 GTCTATTTTGGCTCTCATAGCATCATGCTTTCCGGATGTTGCTCCTTTATCATGCCTAAC 1259
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 6332 GTCTATTTTGGCTCTCATAGCATCATGCTTTCCGGATGTTTCTCCTTTATCATGCCTAAC 6391
Query 1260 AATTTGGTTGGAAATTACCGCAGCCAGGGAAACGTCGTTTATCAAGGTGAACGATATAAC 1319
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 6392 AATTTGGTTGGAAATTACCGCAGCCAGGGAAACGTCGTCTATCAAGGTGAACGATATAAC 6451
Query 1320 AACTAAAATAGCAGAAAATATAGGAGCAGCTGTTGTATCTACAAATTCCTTGCCAACGGA 1379
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 6452 GACTAAAATAGCTGAAAATATAGGAGCAGCTGTTGTATCTACAAATTCCTTGCCGACGGA 6511
Query 1380 TGCTAGAGGTGTCCAGTTTCATTACAATAGGAGGAATCCCAAACGGAGACGACTTACTGC 1439
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6512 TGCTAGAGGTGTCCAGTTTCATTACAATAGGAGGAATCCCAAACGGAGACGACTTACTGC 6571
Query 1440 ACATACATCTGTGGATTTATTGGCTTCAGCCGATAGTGTATACACCTCTGCTGGTAAAAC 1499
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||
Sbjct 6572 ACATACATCTGTGGATTTATTGGCTTCAGCCAATAGTTTAAACATCTCTGCTGGTAAAAC 6631
Query 1500 ATTTTGTTCTCTTAGAACAGAAGCTGCAGAAGATGAAAAAGTTGAAGATAGCAGTGTTAC 1559
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 6632 ATTTTGTTCTCATAGAACAGAAGCTGCAGAAGATGAAAAAGCGGAAGATAGCAGTGTTAT 6691
Query 1560 TAATGATTCGTCTGATGAGCATGCGTCTCTATCAAAAATGGTCGCAGTGCTTTGTGAACA 1619
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6692 TGATGATTCGTCTGATGAGCATGCGTCTCTATCAAAAATGGTCGCAGTGCTTTGTGAACA 6751
Query 1620 ACGCTTGTTTCTTCCTCTGCTAAAAGCTTTTGACTTGTTCCTCCCGTCCTGCTCTCTGTT 1679
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 6752 ACGCTTGTTTCTTCCTCTGCTAAAAGCTTTTGACTTGTTCCTCCCGTCCTGCTCTCTACT 6811
Query 1680 GCCATTTTTTCGTGCTCTTCAGGCATTTTCTCAAATGCGCCTGTCTGAAGCTTCAGCACA 1739
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6812 GCCATTTTTCCGTGCTCTTCAGGCATTTTCTCAAATGCGCCTGTCTGAAGCTTCAGCACA 6871
Query 1740 TCTGGGTTCTTTTTGGGCTAGAGTTAAAGAGGAATCAATGCATTTTCAGTCAAATATAGC 1799
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 6872 TCTGGGTTCTTTTTGGGGTAGAGTTAAAGAGGAATCAATGCATTTTCAGTCAAATACAGC 6931
Query 1800 CAAAGATGTCAATTTTGGAGCATCTTGGATCAGCAGAACAGCTGTTAAAGCTGCTGATGC 1859
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 6932 CAAAGATGTCAATTTTGGGGCATCTTGGATCAGCAGAACAGCTGTTAAGGCTGCTGATGC 6991
Query 1860 TGTTTTGTCAACTTGTCCATCTCCATATGAGAAAAGATGCTTACTGCAACTTCTTGCTGC 1919
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 6992 TGTTTTGTCAGCTTGTCCATCTCCATATGAGAAAAGATGCTTACTACAACTTCTTGCTGC 7051
Query 1920 AACTGATTTTGGTGATGGGGGATCTGCGGCAACATATTATCGGCGTCTTTATTGGAAAGT 1979
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7052 AACTGATTTTGGTGATGGGGGATCTGCGGCAACATATTATCGGCGTCTTTATTGGAAAGT 7111
Query 1980 TAACTTGTCTGAGCCATCACTCCGGGAGAATGATCTTGACTTAGGAAATGAGTCCCTTGA 2039
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7112 TAACTTGGCTGAGCCATCACTCCGGGAGAATGATCTTGACTTAGGAAATGAGTCCCTTGA 7171
Query 2040 TGATGGCTCTCTTCTGACAGCTTTAGAAAAGAACAGGCAATGGGAGCAAGCAAGAAACTG 2099
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7172 TGATGGCTCTCTTCTGACAGCTTTAGAAAAGAACAGGCAATGGGAGCAAGCAAGAAACTG 7231
Query 2100 GGCCAAGCAACTTGAAACCATTGGTGCCACTTGGACATCCTCTGTACATCATGTTACTGA 2159
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7232 GGCCAAGCAACTTGAAACCATTGGTGCCACTTGGACATCCTCTGTACATCATGTTACTGA 7291
Query 2160 AACGCAGGCAGAATCCATGGTTGCAGAATGGAAAGAATTCCTTTGGGATGTTCCAGAAGA 2219
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7292 AACACAGGCAGAATCCATGGTTGCAGAATGGAAAGAATTCCTTTGGGATGTTCCAGAAGA 7351
Query 2220 GAGAATCGCATTGTGGGGTCACTGCCAAACTCTGTTCATCAGATACTCTTTCCCTGCTTT 2279
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7352 GAGAATCGCATTGTGGGGTCACTGCCAAACTCTGTTCATCAGATACTCTTTCCCTGCTTT 7411
Query 2280 ACAGGCAGGCTTATTTTTCCTTAGGCACGCAGAAGTGGTGGAGAAAGATCTTCCTGCAAG 2339
||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7412 ACAGGCAGGTTTATTTTTCCTTAGGCATGCAGAAGTGGTGGAGAAAGATCTTCCTGCAAG 7471
Query 2340 AGAGATCTATGAGCTGTTACTGCTATCCCTTCAGTGGTTGAGTGGGCTAACAACTCTGTC 2399
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||
Sbjct 7472 AGAGATCTATGAGCTGTTACTGCTATCCCTTCAGTGGCTAAGTGGGCTAACAACTCTGTC 7531
Query 2400 GCACCCGGTTTATCCTTTGCATCTTCTCCGAGAAATCGAGACTAGGGTGTGGTTACTGGC 2459
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 7532 GCACCCGGTTTATCCTTTGCATCTTCTCCGAGAAATCGAGACTAGGGTATGGTTACTGGC 7591
Query 2460 TGTAGAAGCAGAATCACATGTGAAAAATGTCGGAGCATTTAGTTCGAGTAGTATCGGAAA 2519
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 7592 TGTAGAAGCAGAATCACATGTGAAAAATGTCGGAGCATTTAGTCCGAGTAGTATCGGAAA 7651
Query 2520 AGACATGGTGAATGGAAATAGTTCAAATCTTATAGACCGAACTGCAAGTATCATAACAAA 2579
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 7652 AGACATGGTGAATGGATATAGTTCAAATCTTATAGATCGAACTGCAAGTATCATAACAAA 7711
Query 2580 AATGGACAGCCATATTTCTTCAGCAACGAAAAATAGAATTGGAGAAAAACATGACTCCAG 2639
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 7712 AATGGACAGCCATATTTCTTCAGCAACGAAAAATAGAATTGGAGAAAAACATGACGCCAG 7771
Query 2640 GGCCGCTGGCCATGGACATCAAAGGAACCAAGACACGAGCACTTCAATCTTTGGTGCTAG 2699
|||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 7772 GGCCGCTGGCCAAGGAAATCAAAGGAACCAAGACACGAGCACTTCAATATTTGGTGCTAG 7831
Query 2700 CACAAAGCCCAAGAGGAGAGCAAAAGGAAATGTCCCACAAATAAGACATTTTGTGGATTC 2759
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7832 CACTAAGCCCAAGAGGAGAGCAAAAGGAAATGTCCCACAAATAAGACATTTTGTGGATTC 7891
Query 2760 TTCAGATAGGAATACTGATTTTGAAGATTCTTCATCTCTTCTAAACATCAAAAGTGAGTT 2819
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||
Sbjct 7892 TTCAGATAGGAATACTGACTTTGAAGATTCTTCATCTCTTATAAACATCAAAAGCGAGTT 7951
Query 2820 CCAGCTTCAAGAGGAAAACATGGGTTTGGAAATATCCTTATCAAAGTGGGAAGAAAGTAT 2879
||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 7952 CCAGCTTCAAGAGGAGAGCACGGGTTTGGAAATATCCTTATCGAAGTGGGAAGAAAGTAT 8011
Query 2880 AGAACCTGCAGAGTTGGAAAGAGCTGTTCTGTCCTTACTGGAGTTCGGACAAGTAACAGC 2939
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 8012 AGAACCTGCAGAGTTGGAAAGAGCTGTTCTGTCCTTACTGGAGTTCGGACAAGTAACAGC 8071
Query 2940 TGCTAAGCAGCTCCAACTTAAGCTTGCTCCAGGGAATTTACCTTCTGAGCTGATAATTTT 2999
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 8072 TGCTAAGCAGCTCCAACTTAAGCTTGCTCCAGGGAATCTACCTTCTGAGCTGATAATTTT 8131
Query 3000 GGATGCTGTTATGAAGCTAGCAATGCTTTCTACGCCTTGCTGTCAAGTACCATTGTCAAT 3059
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||
Sbjct 8132 GGATGCTGTTATGAAGCTAGCAATGCTTTCTACGCCTTGCAGACAAGTACTATTGTCAAT 8191
Query 3060 GTTGGATGATGAAGTTCGTTCAGTCATTCAATCACAGAGTCTAAGAATAGACCAACCTCT 3119
||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |
Sbjct 8192 GTTAGATGATGAAGTTCGCTCTGTCATTCAATCACACAGTCTAAAAATAGACCAACCTAT 8251
Query 3120 GATTGAACCGCTGCAGGTTTTGGAGAATCTATCGAAC-ATTTTAAATGAAGGCAGTGGAC 3178
|||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 8252 GATTGAACCGCTGCAGATTTTGGAGAATCTATC-AACCATTTTAAATGAAGGCAGTGGAC 8310
Query 3179 GTGGGCTGGCAAGAAAAATCATTGCAGTTATAAAAGCTGCTAACATACTGGGCCTTACAT 3238
| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 8311 GAGGGCTGGCAAGAAAAATCATCGCAGTTATAAAAGCTGCTAACATACTGGGCCTTACAT 8370
Query 3239 TCACTGAGGCATATCAAAAGCAGCCAATAGAGTTGTTACGATTACTTTCTCTTAAAGCAC 3298
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 8371 TCACTGAGGCATATCAAAAGCAGCCGATAGAGTTGTTACGATTACTTTCTCTTAAAGCAC 8430
Query 3299 AAGATTCTTTTGAGGAAGCATGTCTCCTTGTCCAAACGCATTCAATGCCCGCTGCTAGTA 3358
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 8431 AAGATTCTTTTGAGGAAGCATGTCTCCTTGTCCAAACGCATTCAATGCCCGCTGCTAGTA 8490
Query 3359 TCGCTCAAATACTTGCAGAATCCTTTTTAAAGGGTTTATTGGCAGCTCATCGTGGAGGAT 3418
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 8491 TCGCTCAAATACTTGCAGAATCCTTTCTAAAGGGTTTATTGGCTGCTCATCGTGGAGGAT 8550
Query 3419 ATATAGATTCTCAAAAGGAGGAAGGGCCTGCTCCACTTTTGTGGAGATTTTCAGACTTTT 3478
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 8551 ATATAGATTCTCAAAAGGAGGAAGGGCCTGCTCCACTTTTGTGGAGATTTTCAGACTTTT 8610
Query 3479 TGAAGTGGGCGGAGCTTTGTCCATCTGAACAAGAAATGGGTCATGCATTAATGCGTCTTG 3538
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 8611 TGAAGTGGGCGGAGCTTTGTCCATCTGAACAAGAAATTGGTCATGCATTAATGCGTCTTG 8670
Query 3539 TAATTACCGGGCAGGAAATACCACACGCGTGTGAGGTTGAGCTTCTTATTCTGTCTCATC 3598
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 8671 TAATAACCGGGCAGGAAATACCACACGCGTGTGAGGTTGAGCTTCTTATTCTGTCTCATC 8730
Query 3599 ACTTCTACAAGTCATCCACGTGCCTTGATGGAGTTGATGTTCTTGTTGCACTTGCTGCCA 3658
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 8731 ACTTCTACAAGTCATCCACGTGCCTTGATGGAGTAGATGTTCTTGTGGCACTTGCTGCCA 8790
Query 3659 CAAGGGTTGAGGCTTATGTTGCCGAGGGCGATTTCTCATGCCTGGCTCGTCTAATAACTG 3718
|||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 8791 CAAGGGTTGAGGCTTATGTTGCTGAGGGAGATTTCTCATGCCTGGCTCGTCTAATAACTG 8850
Query 3719 GAGTTGGAAACTTTCATGCTCTTAATTTCATTCTCAATATTCTAATCGAAAACGGGCAGC 3778
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 8851 GAGTTGGAAACTTTCATGCTCTTAATTTCATTCTCAATATTCTAATCGAAAACGGGCAGC 8910
Query 3779 TTGATCTTTTACTACAGAAATTTTCTGCTGCTGCTGCTGATGCAAACACTGGCACCGCTC 3838
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 8911 TTGATCTTTTACTACAAAAATTTTCTGCTGCTGCTG---ATGCAAACACTGGCACCGCTC 8967
Query 3839 AGGCTGTCAGAAGTTTCCGAATGGCTGTTTTGACCTCGTTGAATCTGTTTAACCCAAATG 3898
||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 8968 AGGCTGTCAGAAGTTTCCGGATGGCTGTTCTGACCTCGTTGAATCTGTATAACCCAAATG 9027
Query 3899 ACCATGATGCATTCGCAATGGTATATAAACACTTTGACATGAAGCATGAAACGGCTACTT 3958
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 9028 ACCATGATGCATTCGCAATGGTATATAAACACTTTGACATGAAGCATGAAACGGCTACTT 9087
Query 3959 TGCTAGAGGCACGTGCAGATCAGGCTGCACAGCAGTGGTTTCTACGGTATGACAAGGATC 4018
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 9088 TGCTAGAGGCACGTGCAGATCAGGCTGCACAGCAGTGGTTTCTACGGTATGACAAGGATC 9147
Query 4019 AAAATGAAGATCTCCTTAATTCTATGCGCTATTACATTGAAGCTGCGGAAGTTCACACTT 4078
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 9148 AAAATGAAGATCTCCTTGATTCTATGCGCTATTACATTGAAGCTGCCGAAGTTCACACTT 9207
Query 4079 CTATTGATGCTGGAAACAAAGCGCGAAAGGCTTGTGGTCAGGCTTCCCTTGTCTCCCTTC 4138
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 9208 CTATTGATGCTGGAAACAAAGCGCGAAAGGCTTGTGGTCAGGCTTCCCTTGTCTCCCTTC 9267
Query 4139 AAATAAGGATGCCAGATTCCAAGTGGCTCTGTTTATCTGAAACAAACGCCAGAAGAGCAC 4198
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 9268 AGATAAGGATGCCAGATTCCAAGTGGCTCTGTTTATCTGAAACAAACGCAAGAAGAGCAC 9327
Query 4199 TTGTTGATCAATCCCGTTTCCAGGAGGCTCTGATTGTAGCAGAAGCTTATGGTCTTAACC 4258
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 9328 TTGTAGATCAATCCCGTTTCCAGGAGGCTCTGATTGTAGCAGAAGCTTATGGTCTTAACC 9387
Query 4259 AGCCAAGCGAATGGGCGCTTGTGCTTTGGAATCTGATGCTCAAACCCGAACTAGCGGAAG 4318
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 9388 AGCCAAGCGAATGGGCGCTGGTGCTTTGGAATCTGATGCTCAAACCTGAACTAGCGGAAG 9447
Query 4319 ATTTTGTGGCTGAATTTGTAGCGGTGCTTCCCCTACAGGCTTCAATGCTTCTGGAACTGG 4378
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 9448 ATTTTGTGGCTGAATTTGTAGCGGTGCTTCCCCTACAGGCTTCAATGCTTCTGGAACTGG 9507
Query 4379 CTAGATTCTACAGAGCGGAAATGGCAGCTAGGGGAGACCAGTCTCAGTTCTCGGTCTGGC 4438
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 9508 CTAGATTCTACAGAGCGGAAATGGCAGCTAGGGGAGACCAGTCTCAGTTCTCAGTCTGGC 9567
Query 4439 TCACAGGAGGAGGCTTACCGGGTGAGTGGGCCAAATACATGTGGAGATCATTCAGGTGTT 4498
||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||
Sbjct 9568 TCACAGGAGGAGGCTTACCAGCTGAGTGGGCCAAATATATGTGGAGGTCATTCAGGTGTT 9627
Query 4499 TGTTGAAGAGAACACGGGATTTGAGGTTACGGTTACAGCTTGCTACAACAGCAACGGGAT 4558
||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 9628 TGTTGAAAAGAACACGGGATTTGAGGTTGCGGTTACAGCTTGCTACAACAGCAACGGGAT 9687
Query 4559 TTGCTGACATGGTAGATGGGTGTATGAATGCGTTGGATAAGGTCCCGGAAAATGCTGGAC 4618
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 9688 TTGCTGACATGGTAGATGTGTGTATGAATGCGTTGGATAAGGTCCCGGAAAATGCTGGAC 9747
Query 4619 CACTTGTACTAAAGAAAGGACATGGAGGAGGATACTTACCACTCATGTGAGTGAGTGAAC 4678
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 9748 CACTTGTACTAAAGAAAGGACATGGAGGAGGATACTTACCACTCATGTGAGTGAGTGAAC 9807
Query 4679 TCAGAGATCATCTCAAAGTATGCAATGTTAAGTAtctctctctctctctGCTTCATCGTT 4738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 9808 TCAGAGATCATCTCAAAGTATGCAATGTTAAGTATCTCTCTCTCT----GCTTCATCGTT 9863
Query 4739 GTGA-GAGGTCGATGGGGCTGTAAATTAGCCGAAGAAATTGGAAAAGGGGTTTTC-GATT 4796
|| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||
Sbjct 9864 GTAAAGAGGTCGATGGGGCTGTAAATTAGCCAAAGAAATCGGAAAAGGTTTTTTTTGATT 9923
Query 4797 GATATATTTTTGATGTTGTGGAAGAGACACAAACTTGAGTCTTTTTT--ATAGGGATTAG 4854
| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||
Sbjct 9924 GCTATCTTTTTGGTGTTGTGGAAGAGACACAAACTTAAGTCTTTTTTTTATAGGGTTTAG 9983
Query 4855 TATTTGTCTGT--GTTTTGTTGTTGGCTCTCACAATTCTTCTAttttttctttttctcct 4912
||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||
Sbjct 9984 TATTTATGTGTATGTTTTGTTGCTGGCTCTCACAATTCTTCAATTTTTG-TTTTTGACCT 10042
Query 4913 tgtaatttttttGTCCCGGCTATTATTAAATGGCAGTCTTgagagatagagagaga--ga 4970
| || |||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||| | ||||| ||
Sbjct 10043 TATATTTTTTTTGTCCCGGCTATTA--AA-TGGCAGTCCTGCGAGATACATAGAGATAGA 10099
Query 4971 ga-A-TAGAGTGTACAGTGTAATAACTGTCTTCGGTATAAG 5009
|| | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 10100 GAGACTACAGTGTACAGTGTAATAACTGTCTTTGGTATAAG 10140
Score = 1550 bits (839), Expect = 0.0
Identities = 905/937 (97%), Gaps = 3/937 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 25 GGACCTCTAGGATGGCTGTCTTTCTCAGGATATCCTACAGGGGAATACCTACTGCATAGA 84
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 5100 GGACCTCTTGGATGGCTGTCTTTCTCAGGATATCCTACAGGGGAATATCTACTGCATAGA 5159
Query 85 GGTGTTGAGTTCTTTATAAACGTCGATGATCCGACAGAGATAAGTGCCATATCTTGGGAA 144
|||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5160 GGTGTTGAGTTCTTTATAAATGTCGACGATCCGACAGAGATAAGTGCCATATCTTGGGAA 5219
Query 145 GCAATCATCCAGAAGCACATCGAAGAGGAACTTCATCACACAAAAACTGAGGGAACCGAG 204
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5220 GCAATCATCCAGAAGCACATCGAAGAGGAACTTCATCACACAAAAACTGAGGGAACCGAG 5279
Query 205 CTTGGACTTGAGCACTTCCTGTATCGCGGACGGCCACTTGCAGCTTTTAATGCTTTCCTG 264
||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct 5280 CTTGGACTTGAGCACTTCCTGCATCGTGGACGGCCACTCGCAGCTTTTAATGCTTTTCTG 5339
Query 265 GAACAGAGAGTTGAAAAGCTAAAACTGGAAGATCAATCTGGCTCTTGGACACATGGACAA 324
||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||
Sbjct 5340 GAACATAGAGTTGAAAAGTTAAAACTGGAAGATCAATCTGGCTCTTCGATACATGGACAA 5399
Query 325 AGAAATATGCAGTCAGATGTTCCAATGCTACTTGCACCTCTGACGCAGAGTGATGAGTCA 384
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5400 AGAAATATGCAGTCAGATGTTCCGATGCTACTTGCACCTCTGACGCAGAGTGATGAGTCA 5459
Query 385 CTTCTTTCATCTGTCATACCACTTGCTATCACACACTTTGGGGATTCTGTGTTGGTGGCT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5460 CTTCTTTCATCTGTCATACCACTTGCTATCACACACTTTGGGGATTCTGTGTTGGTGGCT 5519
Query 445 TCGTGTGCCTTCCTTCTTGAGCTTTGTGGTTTATCTGCCAGCATGCTTCGGATAGACGTG 504
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 5520 TCGTGTGCCTTCCTTCTTGAGCTTTGTGGTTTATCTGCTAGCATGCTTCGGATAGACGTT 5579
Query 505 GCATCCTTGAGAAGAATATCATCCTTCTATAAATCAAATGATAATGCGGATATGGCACAA 564
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 5580 GCATCCTTGAGAAGAATATCATCCTTCTATAAATCAAATGGTAATGCGGATATGGCACAT 5639
Query 565 CAAAAATCGCTTAAGGGCTCTATGTTTCATAGGGTATCTAGTGAAGATGATCTAATGGGG 624
|| |||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5640 CAGAAATCGCTGAAGCGCTCAATGTTTCATAGTGTATCTAGTGAAGATGATCTAATGGGG 5699
Query 625 TCACTAGCTAGGGCCCTTGCTAACGAATACGCTTATCCTGATATCTCAAGTGTCTCTAAG 684
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||
Sbjct 5700 TCACTAGCTAGGGCCCTTGCTAACGAATACGCTTATCCTGATATTTCAAGTGTCCCTAAG 5759
Query 685 CAAAAACAGAATCCAAACAGTATTTCTGGTACTCAACCTGGTCTTCCGCTAATGCTTGTT 744
|||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 5760 CAAAAACAGAATCCAA---GTATTTCTGGTAGTCAACCCGGTCTTCCGCTAATGCTTGTT 5816
Query 745 CTTCATCATCTGGAACAAGCTAGTCTTCCAGAGATTGGAGTAGATAGAAAAACAAGTGGA 804
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 5817 CTTCATCATTTGGAACAAGCTAGTCTTCCAGAGATTGGAGTAGGTAGAAAAACAAGTGGA 5876
Query 805 TACTGGCTGTTAACAGGTGATGGTGATGGGTCTGAACTGCGGTCTCAACAGACATCTGCT 864
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5877 TACTGGCTGTTAACAGGTGATGGTGATGGGTCTGAACTGCGGTCTCAACAGACATCTGCT 5936
Query 865 AGCTTGCATTGGAGTTTAGTTACGCTTTTTTGTCAGATGCATAAGATTCCTCTGAGCACC 924
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5937 AGCTTGCATTGGAGTTTAGTTACTCTTTTTTGTCAGATGCATAAGATTCCTCTGAGCACC 5996
Query 925 AAATATCTTGCCATGCTAGCAAGAGACAATGATTGGG 961
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5997 AAATATCTTGCCATGCTAGCAAGAGACAATGATTGGG 6033
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 249931710026
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5