BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg491109
Length=5217
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT4G35380.1 | Symbols: | SEC7-like guanine nucleotide exchange... 8492 0.0
> AT4G35380.1 | Symbols: | SEC7-like guanine nucleotide exchange
family protein | chr4:16819883-16826061 FORWARD LENGTH=5222
Length=5222
Score = 8492 bits (4598), Expect = 0.0
Identities = 5019/5226 (96%), Gaps = 13/5226 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGTCGACGTCACAAACTCTCGGCGGCGCCACACGTTGTGGCCGGATCATAGGTCCATCA 60
||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTCAACGTCACAAACCCTCGGCGGCGCCACACGTTGTGGCCGGATCATAGGTCCATCA 60
Query 61 TTAGACAAGATCATAAAAAACGCTGCGTGGCGTAAACACACGTACCTCGTCTCTTCATGT 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 61 TTAGACAAGATCATAAAAAACGCTGCGTGGCGTAAACACACGTACCTTGTCTCTTCATGT 120
Query 121 AAATCCGTTCTCGACAAGCTCGAATCTCTTCCCGACGACTTTCACGATCCTTCCTCCGTC 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 121 AAATCCGTTCTCGACAAGCTCGAATCTCTTCCCGACGACTTCCACGATCCTTCCTCCGTC 180
Query 181 GTCTCCGGCCTCGCCGCATCAGATGCAGATTCCGTTCTCCAACCTTTTCTCTTCTCTCTC 240
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 181 GTCTCTGGCCTCGCCGCATCAGATGCAGATTCCGTTCTCCAACCTTTTCTCTTATCTCTC 240
Query 241 GACACTGCTTATTCAAAAGTCGTCGAGCCATCTCTAGATTGCGCTTTTAAACTCTTCTCT 300
|| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 GAAACAGCTTATTCAAAAGTCGTCGAGCCTTCTCTAGATTGCGCTTTTAAACTCTTCTCT 300
Query 301 CTCTCAATCCTCCGTGGTGAGATCCAATCCTCAAAACAAGATTCTATCCTCTTCAAGCTC 360
|||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||
Sbjct 301 CTCTCAATCCTCCGCGGTGAGATCCAATCATCAAAACAAGATTCAATCCTCTTCAAACTC 360
Query 361 GTCAACGCCGTCTCCAAAGTCGGAGCTATAGCCGAAGAACCGATTCAACTCGCTGTTCTT 420
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 GTCAACGCCGTCTCCAAAGTCGGTGCTATAGCCGAAGAACCGATTCAACTCGCTGTTCTT 420
Query 421 CGAGTTCTTCTCGCCGCCGTTAGATCTCCATGTATTTTGATCCGTGGTGATTGCTTGTTG 480
||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 AGAGTTCTTCTCGCTGCCGTTAGATCTCCATGTATCTTGATCCGTGGTGATTGCTTGTTA 480
Query 481 CACGTTGTCAAGACTTGTTACAACATTTACCTCGGTGGCTTGAGCGGCACGACACAGATC 540
|||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 CACGTTGTCAAGACTTGTTATAATATTTACCTTGGTGGCTTGAGCGGCACGACACAGATC 540
Query 541 TGTGCTAAATCGGTGTTAGCTCAAATGATGCTTGTGATCTTCACAAGATCTGAAGAAGAT 600
||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 TGTGCTAAATCTGTCTTAGCTCAGATGATGCTTGTGATCTTCACAAGATCTGAAGAAGAT 600
Query 601 TCGCTTGATGTTTCCGTGAAAACGATTTACGTCAACGAGCTATTAACTTTCACGGACAAG 660
|||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 601 TCGCTTGATGTTTCTGTCAAAACGATTTACGTCAACGAGTTATTAACTTTCACGGACAAG 660
Query 661 AGTGTTAATGAAGGAAGCTCTGTTTATTTCTGTCAAGGGTTTGTGAATGAAGTCATGGCT 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 AGTGTTAATGAAGGAAGCTCTGTTTATTTCTGTCAAGGGTTTGTGAATGAAGTCATGGCT 720
Query 721 GCAGGACAAGGAAGTCCTCTTCCTCCTCCTGATGTGATTCAGATTCTTCTT-CAAAATCC 779
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||
Sbjct 721 GCAGGACAAGGAAGTCCTCTTCCTCCTCCTGATGTGATTCAGATTCTG-TTGCAAAATCC 779
Query 780 GGAGACTGAAACCGTTATGAATCCGGATTCACCGTCTTTTCGAGGCTACGTAGCAAACGG 839
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||
Sbjct 780 CGAGACTGAAACCGTTATGACTCCGGATTCACCGTCTTTCCGAGGATACGTGGCAAACGG 839
Query 840 AGAAGGTGATTCCGAGACCGGTGACATGAGTAAGATGAGACAGGACGCTTTTCTTCTGTT 899
|||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 840 AGAAGGTGATTCTGAGACCGGTGACATGAGTAAGGTGAGACAAGACGCTTTTCTTCTGTT 899
Query 900 CAAGAACTTGTGTAAATTGTCTATGAGGTTTTCGTCGAAAGAGAACAATGATGATCAGAT 959
||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||
Sbjct 900 CAAGAACTTGTGTAAATTGTCCATGAGGTTTTCGTCCAAGGAGAACAATGATGATCAGAT 959
Query 960 CATGGTGAGAGGTAAGACTTTGTCTTTGGAGTTGCTTAAAGTCATTATTGACAATGGTGG 1019
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 960 CATGGTGAGAGGTAAGACTCTGTCTTTGGAGTTGCTTAAAGTCATTATTGACAATGGTGG 1019
Query 1020 TTCTGTTTGGCGCTCTAATGAAAGCTTCATCAACGCCGTTAAGCAATACTTATGCTTATC 1079
|||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1020 TTCTGTTTGGCGGACTAATGAAAGCTTCATCAATGCCGTTAAGCAATACTTATGCTTATC 1079
Query 1080 ACTACTGAAGAACAGTGCGGTATCAATCATGTCAATATTTCAATTGCAATGTGCCATCTT 1139
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1080 ACTACTAAAGAACAGTGCGGTATCAATCATGTCAATATTTCAATTGCAATGTGCTATCTT 1139
Query 1140 CATGAGCTTGTTATCAAAGCTTAGATCAGTCTTGAAAGCGGAAATCGGCATTTTCTTCCC 1199
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct 1140 CATGAGCTTGTTATCAAAGCTTAGATCAGTCTTGAAAGCAGAAATCGGCATTTTCTTTCC 1199
Query 1200 GATGATTGTTCTTCGCGTGCTTGAGAATGTTCTTCAACCTAGTTACTTGCAGAAGATGAC 1259
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1200 GATGATTGTTCTTCGCGTGCTTGAGAATGTTCTTCAACCTAGTTACTTGCAGAAGATGAC 1259
Query 1260 TGTTCTCAACTTGCTAGATAAAATGTCACAAGATCCGCAGTTGATAGTCGATATCTTTGT 1319
|||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1260 TGTTCTCAACTTGCTAGACAAAATGTCGCAAGATCCGCAGTTGATGGTCGATATCTTTGT 1319
Query 1320 GAACTACGACTGCGATGTGGAGTCTTCAAACATACTTGAAAGGATTGTCAACGGTCTTCT 1379
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1320 GAACTATGACTGCGATGTGGAGTCTTCAAACATACTTGAAAGGATTGTCAACGGTCTTCT 1379
Query 1380 CAAAACTGCTCTAGGACCACCCACCGGATCATCGACAACGCTCTCTCCAGCGCAAGATAT 1439
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||
Sbjct 1380 CAAAACTGCTCTAGGACCACCCACCGGATCATCAACAACGTTGTCTCCAGCGCAAGATAG 1439
Query 1440 TACATTCAGGAATGATTCTGTAAAGTGTTTGGTTAACATAGCCAAGGCAATGGGAAATTG 1499
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1440 TACATTCAGGAATGATTCTGTCAAGTGTTTGGTTAACTTAGCCAAGGCAATGGGAAATTG 1499
Query 1500 GATGGACCAGCAGTTGAAAGTGAATGAGACCGTTTGGCCTAAAGGCTCACAAGTTTATGC 1559
|||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1500 GATGGACCAGCAGTTGAAAGTGAACGAGACGGTCTGGCCTAAGGGCTCACAAGTTTATGC 1559
Query 1560 TTCTATGGACAGTAATGCAGGCCAGATTGGTGAATTAGAAGGAACTATATCTGACTGTGA 1619
||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1560 TTCTATGGACAGTAATGCAAGCCAGATTAGTGAGTTAGAAGGAACTATATCTGACTGTGA 1619
Query 1620 TTCACAGCCAGATACTACTAATCCAGAAGCTTATGATGCCTCTATGCTTGAGCAACGAAG 1679
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1620 TTCACAGCCAGATACTAGTAATCCAGAAGCTTATGATGCTTCTATGCTTGAGCAACGAAG 1679
Query 1680 GGCTTACAAAATTGAATTGCAGAAAGGTATCTCTCTGTTCAATAGGAAGCCGTCGAAAGG 1739
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1680 GGCTTACAAAATTGAATTGCAGAAAGGTATCTCTCTGTTCAATAGGAAGCCGTCGAAAGG 1739
Query 1740 TATCGAATTTCTCATAAGTACCAAGAAAATAGGTAGTTCTCCAGAGGAAGTGGCTTCGTT 1799
| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||
Sbjct 1740 TGTCGAATTTCTCATAAGTACCAAGAAAATAGGTAGCTCCCCTGAGGAAGTTGCTTCGTT 1799
Query 1800 TCTGATGAAGACTGCAGGGCTAAATGGAACTGTGATTGGTGATTATCTTGGTGAAAGAGA 1859
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1800 TCTGATGAAGACCGCAGGGCTAAATGGAACTGTGATTGGTGATTATCTTGGTGAAAGAGA 1859
Query 1860 GGAACTTCCACTCAAAGTTATGCATGCATATGTCGACTCGTTTAACTTCGAAAAGAAGGA 1919
||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1860 TGAACTTCCACTAAAAGTTATGCATGCATATGTTGATTCGTTTAACTTTGAAAAGAAGGA 1919
Query 1920 TTTTGTCGAAGCGATAAGGTTCTTTCTGCGCGGCTTTAGGTTACCAGGAGAAGCACAGAA 1979
|||||||||||| ||| |||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1920 TTTTGTCGAAGCAATACGGTTCTTTCTACGTGGGTTTAGGCTACCAGGAGAAGCACAGAA 1979
Query 1980 AATTGATCGAATCATGGAAAAGTTTGCAGAACATTACTGGAAATGCAACCCTGGTTCTTT 2039
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1980 GATTGATCGAATCATGGAGAAGTTTGCAGAACATTACTGGAAATGCAACCCTGGTTCTTT 2039
Query 2040 TACTAGTGCAGACACTGCTTATGTTCTTGCATATTCTGTGATAATGCTCAACACAGATGC 2099
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2040 TACTAGTGCAGACACTGCTTATGTTCTTGCATACTCTGTGATAATGCTCAACACAGATGC 2099
Query 2100 ACACAACAACATGGTTAAGGATAAGATGACGAAAGCTGACTTCGTCCGCAACAATAGGGG 2159
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2100 ACACAACAACATGGTTAAGGATAAGATGACGAAAGCTGACTTCGTCCGCAACAATAGGGG 2159
Query 2160 GATAGATGATGGAAATGACTTGCCTGAAGAGTATTTAGGTTCTCTATATGATCGAGTTGT 2219
|||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2160 GATAGACGATGGAAAGGACTTGCCTGAAGAGTATTTAGGTTCTCTATATGATCGAGTTGT 2219
Query 2220 GAAAGAAGAAATCAAGATGAACTCCGATACTTTAGCCCCGCAAAACAAACAGGTGAATGG 2279
|||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2220 GAAAGAAGAAATCAGGATGAACTCGGACACTTTAGCCCCACAAAACAAACAGGTGAATGG 2279
Query 2280 CTTGAATAAACTATTGGGCCTAGACGGCATTCTCAATCTGGTTTCTTGGATGCAACCAGA 2339
|||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2280 CTTGAATAAACTGTTGGGCCTAGACGGAATTCTCAATCTGGTTTCTTGGATGCAACCAGA 2339
Query 2340 TGAGAAACCACATGGTGCCAATGGACGTCTTATAAGGGATATTCAGGAACAGTTCCAAGC 2399
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2340 TGAGAAACCTCATGGTGCCAATGGACGTCTTATAAGGGATATTCAGGAACAGTTCCAAGC 2399
Query 2400 TAAGCCAGAGAAATCAGAGTCAGTTTATCATACTGTTACAGATATTTCGATCTTGAGATC 2459
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2400 TAAGCCAGAGAAATCAGAGTCAGTTTATCATACTGTTACAGATATTTCGATCTTGAGATT 2459
Query 2460 CATACTCGAGGTCTCCTGGGGACCGATGCTTGCTGCATTTAGTGTCACTCTTGACCAGAG 2519
|||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||
Sbjct 2460 CATACTAGAGGTCTCTTGGGGACCGATGCTTGCTGCATTCAGTGTCACTATTGACCAGAG 2519
Query 2520 TGATGATCGACTAGCAACTTCTCTTTGCTTACAAGGCTTCCGATATGCGGTGCACGTCAC 2579
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||
Sbjct 2520 TGATGATAGACTAGCAACTTCTCTTTGCTTACAAGGCTTCAGATATGCGGTTCATGTCAC 2579
Query 2580 TGCAGTTATGGGAATGCAAACTCAGAGAGATGCTTTTGTAACTTCCATGGCCAAGTTCAC 2639
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2580 TGCAGTTATGGGAATGCAAACTCAAAGAGATGCTTTTGTAACTTCCATGGCCAAGTTCAC 2639
Query 2640 TAATCTTCATTGTGCTGCAGATATGAAACAGAAAAATGTTGATGCTGTTAAAGCGATAAT 2699
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2640 TAATCTTCATTGTGCTGCAGATATGAAGCAGAAAAATGTTGATGCTGTTAAAGCGATAAT 2699
Query 2700 AACGATAGCCATAGAAGACGGTAACCATCTACATGGTTCTTGGGAACATATTTTAACTTG 2759
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2700 AACAATAGCCATAGAAGACGGTAACCATCTACATGGTTCTTGGGAACATATTTTAACTTG 2759
Query 2760 TCTTTCACGTATTGAACATTTGCAACTCCTTGGAGAAGTATCACCATCAGAGAAACGTAA 2819
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2760 TCTTTCACGCATTGAACATTTGCAACTCCTTGGAGAAGTATCACCATCAGAGAAACGTTA 2819
Query 2820 CGTCCCTACCaaaaaaa-CTGAGGTAGATGAAAAGAAAGCTTTGGGGTTTCCAAATTTAA 2878
||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2820 CGTCCCTAC-AAAAAAAGCTGAGGTAGATGACAAGAAAGCTTTAGGGTTTCCAAATTTAA 2878
Query 2879 AGAAACGGGGATCTTTTCAGAATCCATCTGTTATGGCTGTTGTTAGGGGAGGTTCTTATG 2938
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2879 AGAAACGTGGATCTTTTCAGAATCCATCTGTTATGGCTGTTGTTAGGGGAGGTTCTTATG 2938
Query 2939 ATAGTACTTCACTTGTTAAAAGCGTTCCCAAACTAGTTACTCCGGAGCAGATCAAGAGTT 2998
|||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2939 ATAGTACTTCACTTGTGAAAAGTGTTCCCAAACTAGTTACTCCGGAGCAGATCAAAAGTT 2998
Query 2999 TCATTTCCAATTTGAATCTACTTGATCAAATAGGCAATTTTGAGTTGAACCATGTCTATG 3058
||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2999 TCATTGCAAATTTGAATCTACTTGATCAAATTGGCAATTTTGAGTTGAACCATGTCTATG 3058
Query 3059 CTAATAGCCAAAGGTTGAACAGTGAAGCTATAGTTGCCTTTGTTAAAGCGCTATGTAAAG 3118
||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3059 CTAATAGCCAAAGGTTGAACAGTGAAGCTATAGTTTCTTTTGTTAAAGCGCTATGTAAAG 3118
Query 3119 TCTCCATGTCAGAACTTCAGTCACCAACAGATCCTCGTGTCTTTAGCCTCACGAAACTAG 3178
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3119 TCTCCATGTCAGAACTTCAGTCACCAACAGATCCTCGTGTCTTTAGCCTCACGAAACTAG 3178
Query 3179 TCGAAACAGCGCATTATAACATGAACCGTATCCGATTAGTTTGGTCCCGCATATGGAATG 3238
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3179 TCGAAACAGCGCATTATAACATGAACCGGATCCGATTAGTTTGGTCCCGCATATGGAATG 3238
Query 3239 TTCTTTCTGATTTCTTCGTATCAGTCGGCTTGTCAGAGAATCTCTCTGTTGCAATATTTG 3298
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3239 TTCTTTCTGATTTCTTCGTATCAGTTGGCTTGTCAGAGAATCTCTCTGTTGCAATATTTG 3298
Query 3299 TCATGGATTCTCTTCGTCAGCTTTCCATGAAATTCTTGGAGCGTGAGGAGCTTGCAAACT 3358
||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3299 TCATGGACTCGCTTCGTCAGCTTTCCATGAAATTCTTGGAGCGTGAGGAGCTAGCAAACT 3358
Query 3359 ATCATTTCCAACATGAGTTTCTTCGACCATTCGTTATTGTTATGCAGAAAAGCAGTTCCG 3418
| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3359 ACCATTTCCAACATGAGTTTCTTCGACCATTCGTCGTTGTTATGCAGAAAAGCAGTTCCG 3418
Query 3419 CTGAGATTAGAGAGCTAATAGTCCGATGTGTCTCCCAAATGGTTCTTAGTCGAGTTAGTA 3478
| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3419 CGGAGATTAGAGAGCTAATAGTCCGATGTGTTTCTCAAATGGTTCTTAGTCGAGTTAGTA 3478
Query 3479 ATGTGAAATCTGGTTGGAAAAATGTCTTCACGGTTTTTACAACTGCTGCGGTTGATGAGA 3538
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||
Sbjct 3479 ATGTGAAATCTGGTTGGAAAAATGTCTTCACAGTTTTTACAACTGCAGCGCTTGATGAGA 3538
Query 3539 GGAAGAACATTGTACTGTTAGCTTTTGAGACAATCGAGAAAATCGTGCGGGATCATTTTC 3598
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3539 GGAAGAACATTGTACTGTTAGCTTTCGAGACAATCGAGAAAATTGTGCGGGATCATTTTC 3598
Query 3599 ATTGCATAATCGAGACAGAGATAACGGTATACGCAGACTGCATTAGATGTCTCAACACCT 3658
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3599 ATTGCATAATCGAGACAGAGATAACGGTATACGCAGACTGCATTAGATGTCTCATCACCT 3658
Query 3659 TCACAAACAGCAAGTTTGAAGGTGACATTGGCTTCAACACCATAGAATTTCTTCGTTTCT 3718
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3659 TCACAAACAGCAAGTTTGAAGGTGACATTGGCTTCAACACCATAGAATTTCTTCGTTTCT 3718
Query 3719 GCGCTTTAAAGCTTGCAGAAGGAGGACTAGTCTTGAATGAGAAACTCAAGAACAATACTA 3778
||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3719 GCGCTTTAAAGCTTGAAGAAGGAGGACTTGTCTTGAATGAGAAACTCAAGAACAATACTA 3778
Query 3779 TCTCAGCGTTAAAGGAAGATTCTTCTGATACACAGAGTTTTACTGAACTTGATGAACAAG 3838
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3779 TCTCAGCGTTAAAGGAAGATTTTTCTGATACACAGAGTTTTACTGACCTTGATGAACAAG 3838
Query 3839 TATCCTATTGGGTTCCTCTGCTTACAGGTCTATCTAAACAAGCCTCAGATCCAAGACCAG 3898
||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||| |||||||||||||
Sbjct 3839 TATCCTATTGGATTCCTCTGCTTACAGGTTTATGTAAGCAAGTCTCGGATCCAAGACCAG 3898
Query 3899 CAATTCGAAAGCGTTCCATAGAAGTATTGTTCCACATTCTGATGGATCATGGGCATCTTT 3958
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3899 CAATTCGAAAGCGTTCCATAGAAGTATTGTTCCACATTCTGATGGATCATGGTCATCTTT 3958
Query 3959 TTACAAGACCCTTTTGGACTGGAATCTTCAGCTCTATCATTCTCCCAGTTTTCAACAACA 4018
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3959 TTACAAGACCCTTTTGGACTGGAATCTTCAGCTCTATCATTCTCCCAGTTTTCAACAACA 4018
Query 4019 TACGAAGTAAAACTGATATGCTATTCGAAGAAAATGTTGATTCGCCATCCTCGGCTTCTC 4078
||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 4019 TACGAAGTAAAACCGATATGCTATTTGAAGAAAGTGTTGATTCGCCATCCTCAGCTTCTC 4078
Query 4079 TAGACACCGAAGAAACTACATGGGACGCTGAGACATCAGCACTTGCATTGCAGCTTCTCG 4138
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 4079 TAGACACCGAAGAAACTACATGGGACGTTGAGACATCAACACTTGCATTGCAGCTTCTCG 4138
Query 4139 TTGACCTACTCATTAAATTTTTCAGATCCGTGAGATCTCAGCTTCCAAGCGTTGTGTCAA 4198
| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4139 TCGATCTACTCGTTAAATTTTTCAGATCCGTGAGATCTCAGCTTCCAAGCGTTGTGTCAA 4198
Query 4199 TCCTCATAGGGTTCATAAAGAGTCCTTTTCAAGGCTCTACAGGCTCTGGAATCTCTGTTT 4258
|| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4199 TCATCGTAGGGTTCATAAAGAGTCCTTTTCAAGGCTCTACAGGCTCTGGAATCTCTGTTT 4258
Query 4259 TGCTTCATTTGGCTGATGGATTGGCTCGTAGTGCCTCTGAAGATGAATGGAGAGAGATTT 4318
|||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 4259 TGCTACATCTGGCTGATGGATTGGCTCGTAGTGCCTCTGAAGATGAATGGAGAGAGATAT 4318
Query 4319 TCTTGTCTCTCAAGGAAGCAGCCTCGCTGACTTTTGCCGGTTTCATGAAAGTCTTGAGAA 4378
||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4319 TCTTGGCTCTCAAGGAAGCAGCGTCGCTGACTTTCGCCGGTTTCATGAAAGTCTTGAGAA 4378
Query 4379 CAATGGATGATATCGAAGATGTTGAAACAGTTTCTGGTCAAAGTGTAAACAAAGATGATC 4438
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||
Sbjct 4379 CAATGGATGATATCGAAGATGTTGAAACACTTTCTGGTCAAAGCGTAAACATAGGTGATC 4438
Query 4439 TCGATGATGACAGTCTTCACATCATGTCGTATGTTGTCTCCAGAACAAAGAAACACATTG 4498
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4439 TTGATGATGACAGTCTTCACATCATGTCGTATGTTGTCTCCAGAACAAAGAAACACATTG 4498
Query 4499 ATGTCCTGTCTCAAATCGTCGAGGTTGTGAGTGATTTATATAGAAAAAACCAGTTCTCGT 4558
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |
Sbjct 4499 ATGTCCTGTCTCAAATCGTTGAGGTTGTGAGTGATTTATACAGAAGAAACCAGTTCTCAT 4558
Query 4559 TGTCCGCATCACATGTGGATATCCTCGCAGACATTTTCTCGTGCATCGCGTCTCACGCGC 4618
||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 4559 TGTCCGCATCACACGTGGATATTCTGGCAGACATTTTCTCGTGCATCGCGTCTCACGCAC 4618
Query 4619 AGCAACTAAACACCGACACAGTTCTTAGAAGGAAGTTCAAGAGAGCATGCTCAGTCCAAA 4678
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 4619 AGCAACTAAACACCGACACAGTCCTTAGAAGGAAGTTCAAGAGAGCATGCTCTGTCCAAA 4678
Query 4679 ACCTAACAGAGCCTCAACTACTTAACTTCGAGAACGAGGCTTATAAATCCTACATGATGT 4738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 4679 ACCTAACAGAGCCTCAACTACTTAACTTCGAGAACGAGGCTTACAAATCCTACATGATGT 4738
Query 4739 TCCTACAAGACATGGTCACTTGCAATCCAAACGTCTCCAAAGAACTAGATCTCGAGTCGC 4798
|||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 4739 TCCTCCAAGACATGGTTACTTGCAATCCAAACGTCTCCAAAGAACTAGATCTCGAGTCTC 4798
Query 4799 GTCTAGTCACTGAATGCGCAAAAGTCGTGAAGATATACCTTAAATGCACAGATCCACAAC 4858
||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4799 GTCTAGTCACTGAATGCGCAAAAATCGTGAAGATCTACCTTAAATGCACAGATCCACAAC 4858
Query 4859 AACAA---CAACAA-A--GAAAACCAGTCCTATGGGTTCTTCCGATGGAATCAGATCGTG 4912
||||| |||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4859 AACAAGAACAACAACAAAGAAAACCGGTGCTATGGGTTCTTCCGATGGAATCAGATCGTG 4918
Query 4913 TAGAAGAAGCAACGGCGAGAACTTCACTGCTTGTTTCTTCACTCGAAGCCTTGTGCTCAT 4972
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4919 TAGAAGAAGCAACGGCGAGAACTTCACTGCTTGTTTCTTCACTCGAAGCCTTGTGCTCAT 4978
Query 4973 TAGAAGCAGAGTCTCTGAA-AAGACACGTGTCCAGCTTCTTCCCTTTGTTGGTGGATCTT 5031
||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4979 TAGAAGCAGAGTCTCTGAAGAA-ACACGTGTCCAGCTTCTTCCCTTTGTTGGTGGATCTT 5037
Query 5032 GTGAGGACTGAGCATTGCTCTCCACAAGTTCCGTACGTCCTAAGCAATGTTTTGAAATCG 5091
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5038 GTGAGGACTGAGCATTGCTCTCCACAAGTTCCGTACGTCCTAAGCAATGTTTTGAAATCG 5097
Query 5092 TGTATTGGTCCTATTTTGGCTTAGTCGCTTGCTTGTGGCTTAAGTAATTCACTGATCTGT 5151
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 5098 TGCATTGGTCCTATTTTGGCTTAGTCGCTTGCTTGTGGCTTAAGTAATTAACTGATCTGT 5157
Query 5152 GTTTCGTCCACATGtttttttttGGGGTTTGGCTGTCTACCCGAATAAAATTTGGCCATA 5211
|| |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 5158 GTGTCGTCCACAT-TTTGTTTTGGGGGTTTGGCTGTCTACCCGAATAAATTTTGGCCATA 5216
Query 5212 GATGTT 5217
||||||
Sbjct 5217 GATGTT 5222
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 260366434170
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5