BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg491170
Length=2287
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT4G34860.1 | Symbols: | Plant neutral invertase family protei... 3670 0.0
AT4G34850.1 | Symbols: LAP5 | Chalcone and stilbene synthase fa... 108 3e-22
> AT4G34860.1 | Symbols: | Plant neutral invertase family protein
| chr4:16609746-16612907 REVERSE LENGTH=2330
Length=2330
Score = 3670 bits (1987), Expect = 0.0
Identities = 2204/2305 (96%), Gaps = 30/2305 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAATAAAATGCATACAAAAAGCAAACAACCTCCGTGCAAATCATATCATATGCATGGCTT 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 16 AAATAAAATGCATACAAAAAGCAAACAACCTCCGTGCAAATCATATCATATGCATGGCTT 75
Query 61 AAAGGGTTTTGCCTTCACCTCCCCGATCGCTAGAGTTACTGTGCTCGTCTCCATCTTCCC 120
||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 76 AAAGGGTTTAGGCTTCACCTTCCCGATCGCTAGAGTTACTGTGCTAGTCTCTATCTTCCC 135
Query 121 GTCACAGTCACATCTCGTCCGTACACGTGGACCCACATCCTCCTTAAGCTCACTAGCTGA 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 136 ATCACAGTCACATCTCGTCCGTACACGTGGACCCACATCCTCTTTAAGCTCACTAGCTGA 195
Query 181 TTGAT-TCGTC-T-TACCTTTGGCCGTTTCGtctctctctctctcGTTTAATTACTTGTA 237
||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 196 TTGATATCGTCTTATACCTTTGGCCGTTTCGTCTCTCTCTCTCTCGTTTAATTACTTGTA 255
Query 238 TC-GTCGACTCTAGTGATACTCTCGCTTCTGAGAGAGAAGATA-AAGAGGC-ATAGCTCG 294
| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || | || | ||||||
Sbjct 256 CCTATCAACTC-AGTGATACTCTCGCTTCTGAGAGAGAAGAGAGAA-A-GCGA-AGCTCG 311
Query 295 CTTCATATCG---TC-TTC-C-T--T-CGACGCTGGATTCATAAGGTTC-GTGATCTA-T 343
||| ||||| || ||| | | | ||||||||||||||||||| | |||| | |
Sbjct 312 TTTCGTATCGTCTTCTTTCTCTTCATCCGACGCTGGATTCATAAGG-GCATTGAT-AATT 369
Query 344 CTACGTGTTGGTTAAGATTTGAATCAATCTGGGGCAATGTCGATTTTTAATCTGAGTGTA 403
|| |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 370 GGACTTGTTGGTTAAGATTTGAATCAACCTGGAGCTATGTCGAGTTTTAATCTGAGTGTA 429
Query 404 GATGTGAATCAGAATGGGAATGTCAAGAATGTTGATTCTTTATCTACATTGGACGATATT 463
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 430 GATGTGAATCAGAATGGGAATATCAAGAATGTTGATTCTTTATCTACATTGGACGATATT 489
Query 464 GATGACATTGATTTCGCCAAGTTGCTAGAGAAGCCAAGGCCGTTGAATATTGATAGACTG 523
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 490 GATGACATTGATTTTGCCAAGTTGCTAGAGAAGCCAAGGCCATTGAATATTGATAGACTG 549
Query 524 AGATCACTTGACGAAAGGTCTCTTCA-TGAATTAACTGGTTCACCACAGCTTAGAAATGC 582
|||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 550 AGATCACTTGACGAAAGGTCTCTT-ACTGAATTAACTGGTTCACCACAGCTTAGAAATGC 608
Query 583 AGATAATGCTTCTCGGGCCCCTGATCACGCTGATTATGTGATTTCACCAAGCGTTGGTAG 642
|||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 609 GGATAATGCTTCTCGGGCCCCTGATCATGCGGATTATGTGATTTCACCAAGCTTTGGTAG 668
Query 643 GAGGTCTGGATTCAATACTCCTAGGTCACAGCCTGGATTTGAGTCTCATCCTATGGTTGG 702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 669 GAGGTCTGGATTCAATACTCCTAGGTCACAGCCTGGATTTGAGTCTCATCCTATGGTTGG 728
Query 703 TGAGGCCTGGGATGCTTTGAGGCGCTCAATGGTTTACTTTCGTGGACAACCTGTTGGGAC 762
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 729 TGAGGCCTGGGATGCTTTGAGGCGCTCAATGGTTTACTTTCGTGGACAACCTGTTGGCAC 788
Query 763 TATTGCTGCTGTGGATAATTCTGAAGAAAAACTCAACTATGATCAGGTGTTCGTGAGAGA 822
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 789 TATTGCTGCTGTGGATAATTCTGAAGAAAAACTCAACTATGATCAGGTGTTCGTGAGAGA 848
Query 823 TTTTGTACCAAGTGCTTTAGCATTCTTGATGAATGGAGAGCCAGATATAGTTAAAAACTT 882
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 849 TTTTGTACCAAGTGCTTTAGCATTCTTGATGAATGGAGAGCCAGATATAGTTAAAAACTT 908
Query 883 CCTTTTGAAGACTCTTCGTCTTCAATCGTGGGAGAAAAAGATTGATAGATTCCAGCTTGG 942
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 909 CCTTTTGAAGACTCTTCGTCTTCAATCTTGGGAGAAAAAGATTGATAGATTCCAGCTTGG 968
Query 943 TGAGGGTGTTATGCCTGCCAGCTTCAAAGTTTTCCATGATCCTGTTAGAAACCATGAAAC 1002
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 969 TGAGGGTGTTATGCCTGCTAGCTTCAAAGTTTTCCATGATCCTGTTAGAAACCATGAAAC 1028
Query 1003 GCTGATAGCTGATTTTGGCGAGAGTGCAATTGGAAGAGTAGCGCCGGTTGATTCAGGATT 1062
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1029 GCTGATAGCTGATTTTGGCGAGAGTGCTATTGGAAGAGTAGCGCCGGTTGATTCAGGGTT 1088
Query 1063 TTGGTGGATTATACTGCTCAGAGCCTACACAAAATCTACAGGGGACTCTTCTCTTGCTGA 1122
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1089 TTGGTGGATTATATTGCTCAGAGCCTACACAAAATCTACAGGAGACTCTTCTCTTGCTGA 1148
Query 1123 CATGCCTGAATGCCAGAAGGGTATCCGGCTGATACTAAGCCTGTGTCTGTCTGAGGGATT 1182
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1149 CATGCCTGAATGCCAGAAGGGTATTCGGCTGATACTTAGCCTGTGTCTGTCTGAGGGATT 1208
Query 1183 TGATACATTTCCCACTCTCTTATGTGCTGATGGTTGCTGTATGATTGATCGTAGGATGGG 1242
|||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1209 TGATACCTTCCCCACTCTCTTATGTGCTGATGGTTGCTGTATGATTGATCGTAGGATGGG 1268
Query 1243 AGTCTATGGTTACCCGATAGAGATTCAAGCCCTTTTCTTTATGGCCCTAAGGTGTGCATT 1302
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||
Sbjct 1269 AGTTTATGGTTACCCGATAGAGATTCAAGCCCTTTTCTTTATGGCCTTAAGGTGTGCCTT 1328
Query 1303 GCTCCTGCTTAAACATGACGGAGAAGGTAAGGAAATGGTGGAACAGATAGTTAAGCGACT 1362
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1329 GCTCCTGCTTAAACATGACGGAGAAGGTAAAGAAATGGTGGAACAGATAGTGAAGCGACT 1388
Query 1363 TCATGCATTGAGCTACCACATGAGGAGCTACTTTTGGCTAGACTTGAAGCAGCTTAATGA 1422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1389 TCATGCATTGAGCTACCACATGAGGAGCTACTTTTGGCTAGACTTGAAGCAGCTTAATGA 1448
Query 1423 CATTTACCGATATAAGACAGAGGAATACTCTCACACTGCTGTCAACAAGTTCAACGTAAT 1482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1449 CATTTACCGATATAAGACAGAGGAATACTCTCACACTGCTGTCAACAAGTTCAACGTAAT 1508
Query 1483 CCCTGATTCTCTTCCAGAATGGGTTTTCGACTTTATGCCGCCTCACGGAGGtttttttAT 1542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 1509 CCCTGATTCTCTTCCAGAATGGGTTTTCGACTTTATGCCGCCTCACGGAGGGTTCTTTAT 1568
Query 1543 TGGCAATGTTAGCCCTGCAAGAATGGATTTCCGTTGGTTTGCTTTGGGTAATTGTATAGC 1602
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1569 TGGCAACGTTAGCCCTGCAAGAATGGATTTCCGTTGGTTTGCTTTGGGTAATTGTATAGC 1628
Query 1603 AATATTGTCTTCCTTGGCTACTCCCGAACAGTCAACAGCAATTATGGATCTCATAGAATC 1662
||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1629 AATATTGTCTTCCTTGGCTACACCTGAACAGTCGACAGCAATTATGGATCTGATAGAATC 1688
Query 1663 TCGCTGGGAAGAGTTGGTTGGAGAAATGCCACTGAAAGTTTGCTATCCCGCAATAGAAAG 1722
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1689 TCGCTGGGAAGAGTTGGTTGGAGAAATGCCACTGAAAGTTTGCTATCCCGCCATAGAAAG 1748
Query 1723 CCACGAATGGAGAATCGTAACTGGTTGTGACCCCAAAAACACTCGGTGGAGCTACCACAA 1782
||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1749 CCATGAATGGAGAATAGTAACTGGTTGTGACCCCAAAAACACTCGGTGGAGCTACCACAA 1808
Query 1783 CGGAGGATCCTGGCCAGTGCTGCTATGGCTTCTGACGGCTGCTTGCATCAAAACTGGTCG 1842
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1809 TGGAGGATCGTGGCCAGTGCTGCTATGGCTTCTGACGGCTGCTTGTATCAAAACTGGTCG 1868
Query 1843 ACCTCAAATAGCAAGGCGAGCAATTGAAGTAGCAGAGGCTAGGCTCCATAAGGACCATTG 1902
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 1869 ACCTCAAATAGCAAGACGAGCAATTGAAGTAGCAGAGGCTAGGCTTCATAAGGACCACTG 1928
Query 1903 GCCTGAATACTATGATGGAAAGGTCGGGAGATATGTGGGGAAACAGTCGCGTAAAAACCA 1962
|||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1929 GCCTGAATACTATGATGGAAAGGTAGGGAGATACGTGGGGAAACAGTCGCGTAAAAACCA 1988
Query 1963 GACTTGGTCAATCGCCGGATACTTAGTAGCCAAGATGATGCTGGAAGATCCGTCACATGT 2022
|||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1989 GACTTGGTCAGTCGCAGGATACTTAGTAGCCAAGATGATGCTGGAAGATCCGTCACATGT 2048
Query 2023 TGGTATGGTTTGTCTTGAGGAAGACAAACAGATGAAACCCGTTATGAGAAGATCCAACTC 2082
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2049 TGGTATGGTTTGTCTTGAGGAAGACAAACAGATGAAACCCGTTATGAGAAGATCCAACTC 2108
Query 2083 CTGGACTTGTTGAAAACGTTAGAAAGAGATGAGCTAAGAAGAACCTTCTTCGTGATTCCT 2142
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2109 CTGGACTTGTTGAAAACGTTGGAAAGAGATGAGCTAAGAAGAACCTTCTTCGTGATTCCT 2168
Query 2143 GGTTTTTAATGCTGATAACGACTCTTT-CTTCGTTTTTCAATTGCACATTTTACGTTGTT 2201
|| ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |
Sbjct 2169 GGCTTT-AATGCTGATAACGACTCTTTTCTTCATTTTTCAATTGCAAATTTTACGTTGCT 2227
Query 2202 TGCTTTGTGAAATATTTTTTAGACTATGAAAAAGATTTAAGCATCGTAAAAAATATTTCG 2261
||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2228 TGCTTTGTGAAATATTTTT-AGACTATGAAA--GATTTAAGCATCGTAAAAAATATTTCG 2284
Query 2262 TATGTTTAGCTTCATGTCTTTATTA 2286
|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2285 TATGTTTAGCTTCATGTCTTTATTA 2309
> AT4G34850.1 | Symbols: LAP5 | Chalcone and stilbene synthase
family protein | chr4:16608313-16609829 FORWARD LENGTH=1324
Length=1324
Score = 108 bits (58), Expect = 3e-22
Identities = 63/65 (97%), Gaps = 2/65 (3%)
Strand=Plus/Minus
Query 2222 AGACTATGAAAAAGATTTAAGCATCGTAAAAAATATTTCGTATGTTTAGCTTCATGTCTT 2281
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1324 AGACTATG--AAAGATTTAAGCATCGTAAAAAATATTTCGTATGTTTAGCTTCATGTCTT 1267
Query 2282 TATTA 2286
|||||
Sbjct 1266 TATTA 1262
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 113503432245
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5