BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg491371
Length=3302
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT4G33150.1 | Symbols: | lysine-ketoglutarate reductase/saccha... 4996 0.0
> AT4G33150.1 | Symbols: | lysine-ketoglutarate reductase/saccharopine
dehydrogenase bifunctional enzyme | chr4:15985189-15991536
REVERSE LENGTH=3576
Length=3576
Score = 4996 bits (2705), Expect = 0.0
Identities = 3054/3219 (95%), Gaps = 37/3219 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 19 GAGGAGAACAAGTTGGGGAATGGAGTTGTTGGGATTCTAGCTGAAACAGTGAACAAATGG 78
|||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 113 GAGGAGAAGAAGTTGGGGAATGGAGTTGTGGGGATTCTAGCTGAAACAGTTAACAAATGG 172
Query 79 GAGAGACGAACGCCCTTGACACCGTCGCATTGCGCCCGCCTTTTACACGGTGGCAAAGAC 138
||||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 173 GAGAGACGAACACCATTGACGCCATCGCATTGCGCTCGCCTTTTACACGGTGGGAAAGAC 232
Query 139 AGAACCGGCATTTCCCGCATTGTGGTTCAGCCATCTGCTAAGCGTATCCATCATGATGCC 198
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 233 AGAACCGGCATTTCCCGCATTGTGGTTCAGCCATCTGCTAAGCGTATCCATCATGATGCC 292
Query 199 TTGTATGAAGATGTTGGATGTGAAATTTCTGATGATTTGTCTCATTGTGGGCTTATACTC 258
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 293 TTGTATGAAGATGTTGGGTGTGAAATTTCTGATGATTTGTCTGATTGTGGGCTTATACTT 352
Query 259 GGTATCAAACAACCTGAGCTAGAAATGATTCTACCAGAGAGAGCATATGCTTTCTTTTCA 318
|| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 353 GGAATCAAACAACCTGAGCTAGAAATGATTCTTCCAGAGAGAGCATACGCTTTCTTTTCA 412
Query 319 CATACTCATAAGGCACAGAAAGAAAACATGCCTTTGTTGGATAAAATTCTTTCTGAGAGA 378
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 413 CATACTCATAAGGCACAGAAAGAGAACATGCCTTTGTTGGATAAAATTCTTTCTGAGAGA 472
Query 379 GTGACTTTGTGTGATTATGAGCTCATTGTTGGGGATCATGGGAACCGATTATTGGCCTTT 438
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||
Sbjct 473 GTGACTTTGTGTGATTATGAGCTCATTGTTGGGGATCATGGGAAACGATTATTGGCGTTT 532
Query 439 GGTAAATATGCAGGCAGAGCTGGTCTTGTTGATTTCTTACACGGACTGGGGCAGCGATAT 498
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||
Sbjct 533 GGTAAATATGCAGGCAGAGCTGGTCTTGTTGACTTCTTACACGGACTTGGACAGCGATAT 592
Query 499 CTAAGTCTAGGATACTCAACGCCTTTCCTTTCGCTCGGGT-CATCCTATATGTATTCCTC 557
|||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||
Sbjct 593 CTAAGTCTAGGATACTCAACACCTTTCCTCTCGCTC-GGTGCATCGTATATGTATTCCTC 651
Query 558 TTTGGCTGCTGCAAAAGCCGCTGTGATTTCTGTAGGCGAAGAAATTGCAAGCCAGGGACT 617
||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||
Sbjct 652 ATTGGCTGCTGCAAAAGCCGCTGTAATTTCTGTTGGTGAAGAAATTGCAAGCCAGGGACT 711
Query 618 GCCTTTAGGAATCTGCCCTCTTGTATTTGTCTTCACCGGAACAGGAAATGTTTCTCTCGG 677
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 712 GCCATTAGGAATCTGCCCTCTTGTATTTGTCTTCACCGGAACAGGAAATGTTTCTCTGGG 771
Query 678 GGCGCAAGAAATTTTCAAGCTTCTTCCTCACACTTTTGTTGAACCAAGCAAACTTCCTGA 737
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 772 GGCGCAAGAAATTTTCAAGCTTCTTCCTCACACTTTTGTTGAACCAAGCAAACTTCCTGA 831
Query 738 ATTATTTGTCAAAGACAAAGGAATTAGCCAAAATGGAAAATCCACAAAGCGAGTCTATCA 797
| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||
Sbjct 832 ACTATTTGTAAAAGACAAAGGAATTAGTCAAAATGGGATTTCAACAAAGCGAGTCTATCA 891
Query 798 AGTATATGGTTGTATCATTACCAGCCAAGACATGGTTGAACACAAAGATCCATCAAAGGC 857
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 892 AGTATATGGTTGTATTATTACCAGCCAAGACATGGTTGAACACAAAGATCCATCAAAGTC 951
Query 858 GTTCGACAAAGCCGACTATTATGCACACCCGGAACAGTACAGTCCAGTTTTCCACGAAAA 917
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||
Sbjct 952 ATTCGACAAAGCCGACTATTATGCACACCCGGAACATTACAATCCAGTTTTCCACGAAAA 1011
Query 918 GATATCGCCGTATACGTCTGTTCTTGTAAACTGTATGTACTGGGAGAAGAGGTTTCCCCG 977
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1012 GATATCGCCATATACGTCTGTTCTTGTAAACTGTATGTACTGGGAGAAGAGGTTTCCCTG 1071
Query 978 TCTTCTGAGCATC-AAACAGCTTCAAGATTTAACAACAAAAGAACTCCCACTAGTGGGAA 1036
||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |
Sbjct 1072 TCTTCTGAGCA-CAAAACAGCTTCAAGATTTAACAAAAAAAGGACTCCCACTAGTAGGCA 1130
Query 1037 TATGTGATATAACTTGTGACATCGGTGGCTCCATTGAATTTGTTAACCGAGCTACGATAA 1096
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1131 TATGTGATATAACTTGTGACATCGGTGGCTCCATTGAATTTGTTAACCGAGCTACTTTAA 1190
Query 1097 TCGATTCCCCTTTCTTTAGGTTTAATCCCTCAAACAATTCATACTACGATGACATGGATG 1156
|||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1191 TCGATTCCCCTTTCTTCAGGTTTAATCCCTCGAACAATTCATACTACGATGACATGGATG 1250
Query 1157 GGGATGGCGTACTATGCATGGCCGTCGACATTTTACCCACAGAATTTGCAAAAGAGGCAT 1216
|||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1251 GGGATGGCGTACTATGCATGGCTGTTGACATTTTACCCACAGAATTTGCAAAAGAGGCAT 1310
Query 1217 CCCAGCATTTTGGAGATATTCTTTCTGGATTTGTCGGTAGTTTGGCTTCGATGACTGAAA 1276
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1311 CCCAGCATTTTGGAGATATTCTTTCCGGATTTGTCGGTAGTTTGGCTTCAATGACTGAAA 1370
Query 1277 TTGCAGATCTGCCAGCACACCTGAAGAGGGCTTGCATAAGCTATAGGGGAGAGTTGACAT 1336
|| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1371 TTTCAGATCTACCAGCACATCTGAAGAGGGCTTGCATAAGCTATAGGGGAGAATTGACAT 1430
Query 1337 CTTTGTATGAGTATATTCCACGTATGAGGAAGTCAAATCCAGAAGAGGCACAAGAT-A-A 1394
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
Sbjct 1431 CTTTGTATGAGTATATTCCACGTATGAGGAAGTCAAATCCAGAAGAGGCACAAGATAATA 1490
Query 1395 -TATCACTAACGGAGTTTCCAGCCAGAGAACATACAACATATTGGTATCTCTAAGCGGAC 1453
|||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1491 TTATCGCCAACGGGGTTTCCAGCCAGAGAACATTCAACATATTGGTATCTCTGAGCGGAC 1550
Query 1454 ACCTATTTGATAAGTTTCTAATAAACGAAGCTCTTGATATGATCGAAGCAGCAGGTGGCT 1513
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||
Sbjct 1551 ACCTATTTGATAAGTTTCTGATAAACGAAGCTCTTGATATGATCGAAGCGGCTGGTGGCT 1610
Query 1514 CATTTCATTTGGCTAAATGTGAACTGGGGCAGAGCGCCGATGCTGAATCGTACTCAGAAC 1573
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1611 CATTTCATTTGGCTAAATGTGAACTGGGGCAGAGCGCTGATGCTGAATCGTACTCAGAAC 1670
Query 1574 TTGAAGTTGGTGCGGATGATAAGAGAGTATTGGATCAAATCATTGATTCATTAACTCGAT 1633
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1671 TTGAAGTTGGTGCGGATGATAAGAGAGTATTGGATCAAATCATTGATTCATTAACTCGGT 1730
Query 1634 TAGCTAATCCAAATGAAGATTATATATCTCCACGTAGAGAAGCAAATAAGATCTCACTGA 1693
|||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1731 TAGCTAATCCAAATGAAGATTATATATCCCCACATAGAGAAGCAAATAAGATCTCACTGA 1790
Query 1694 AGATTGG-AAAGGTCCAGCAAGAAAATGAGGTAAAAGAGAAGCCTGAAATGACGAAGAAA 1752
||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1791 AGATTGGTAAA-GTCCAGCAAGAAAATGAGATAAAAGAGAAGCCTGAAATGACGAAAAAA 1849
Query 1753 TCAAGTGTTTTGATTCTTGGTGCTGGACGTGTGTGTCGCCCGGCTGCTGAGCTCCTTGCT 1812
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||
Sbjct 1850 TCAGGTGTTTTGATTCTTGGTGCTGGACGTGTGTGTCGCCCAGCTGCTGATTTCCTAGCT 1909
Query 1813 TCAGTCAGAACCATTTCGTCACAGCAATGGTACAAAACCTATTTCGGAGCAGACTCTGAA 1872
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1910 TCAGTTAGAACCATTTCGTCACAGCAATGGTACAAAACATATTTCGGAGCAGACTCTGAA 1969
Query 1873 GA-ACAAACAGATGTTCATGTGATTGTCGCATCTCTGTATCTTAAGGATGCCAAAGAGAC 1931
|| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1970 GAGA-AAACAGATGTTCATGTGATTGTCGCGTCTCTGTATCTTAAGGATGCCAAAGAGAC 2028
Query 1932 GGTTGAAGGTATTTCAGATGTAGAAGCAGTTCAGCTAGATGTGTCTGATAGTGAGAGCCT 1991
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||
Sbjct 2029 GGTTGAAGGTATTTCAGATGTAGAAGCAGTTCGGCTAGATGTATCTGATAGTGAAAGTCT 2088
Query 1992 CCTTAAGTATATTTCTCTGGTTGATGTTGTTCTAAGTTTATTACCTGCAAGTTGTCATGC 2051
|||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2089 CCTTAAGTATGTTTCTCAGGTTGATGTTGTCCTAAGTTTATTACCTGCAAGTTGTCATGC 2148
Query 2052 TGTTGTAGCAAAGACATGCATTGAGCTGAAGAAACATCTCGTCACTGCTAGCTATGTTGA 2111
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2149 TGTTGTAGCAAAGACATGCATTGAGCTGAAGAAGCATCTCGTCACTGCTAGCTATGTTGA 2208
Query 2112 TGATGAAACGTCCATGTTACATGAGAAAGCTAAGAGTGCTGGGATAACGATTCTAGGCGA 2171
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2209 TGATGAAACGTCCATGTTACATGAGAAGGCTAAGAGTGCTGGGATAACGATTCTAGGCGA 2268
Query 2172 AATGGGACTGGACCCTGGAATCGATCACATGATGGCGATGAAAATGATCAACGAGGCTCA 2231
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2269 AATGGGACTGGACCCTGGAATCGATCACATGATGGCGATGAAAATGATCAACGATGCTCA 2328
Query 2232 TATCAAAAAGGGGAAAGTGAAGTCTTTTACCTCTTATTGTGGAGGGCTTCCCTCTCCTGC 2291
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2329 TATCAAAAAAGGGAAAGTGAAGTCTTTTACCTCTTATTGTGGAGGGCTTCCCTCTCCTGC 2388
Query 2292 TGCAGCAAATAATCCATTAGCATATAAATTTAGCTGGAACCCTGCTGGAGCAATTCGAGC 2351
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2389 TGCAGCAAATAATCCATTAGCATATAAATTTAGCTGGAACCCTGCTGGAGCAATTCGAGC 2448
Query 2352 TGGTCAAAACCCTGCCAAATACAAAAGCAATGGTGACATAATACATGTTGATGGGAAGAA 2411
|||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2449 TGGTCAAAACCCCGCCAAATACAAAAGCAACGGCGACATAATACATGTTGATGGGAAGAA 2508
Query 2412 TCTGTATGATTCAGCCACAAGATTCCGAGTACCTAATCTTCCAGCTTTTGCATTGGAGTG 2471
||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2509 TCTCTATGATTCCGCGGCAAGATTCCGAGTACCTAATCTTCCAGCTTTTGCATTGGAGTG 2568
Query 2472 TCTTCCAAATCGTAACTCCTTGGTTTACGGGGACCATTATGGCATCAAGAGCGAAGCAAC 2531
| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2569 TTTTCCAAATCGTGACTCCTTGGTTTACGGGGAACATTATGGCATCGAGAGCGAAGCAAC 2628
Query 2532 AACGATATTTCG---A----T----T-T-A-G--T--A-T--GATAATGGCAACACTTTC 2570
|||||||||||| | | | | | | | | | ||||||||||||||||||
Sbjct 2629 AACGATATTTCGTGGAACACTCAGATATGAAGGGTTTAGTATGATAATGGCAACACTTTC 2688
Query 2571 GAAACTTGGATTCTTTGACAATGAAACAAATCAAGTACTCTCCACTGGAAAGAGGATTAC 2630
|||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2689 GAAACTTGGATTCTTTGACAGTGAAGCAAATCAAGTACTCTCCACTGGAAAGAGGATTAC 2748
Query 2631 GTTTGGTGCTCTTTTAAGTAACATTCTAAAGAGGGATGCAGACAATGAGCCAGAGCCTCT 2690
|||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||
Sbjct 2749 GTTTGGTGCTCTTTTAAGTAACATTCTAAATAAGGATGCAGACAATGAATCAGAGCCCCT 2808
Query 2691 AGCGGGAGAAGAAGAGATAAGCAAGAGAATTATCAAGCTTGGATATTCCAAGGAGACTGC 2750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2809 AGCGGGAGAAGAAGAGATAAGCAAGAGAATTATCAAGCTTGGACATTCCAAGGAGACTGC 2868
Query 2751 AGCCAAAGCTGCCAAAACAATTGTATTCTTGGGGTTCAACGAAGAGAGGGAGATTCCATC 2810
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2869 AGCCAAAGCTGCCAAAACAATTGTATTCTTGGGGTTCAACGAAGAGAGGGAGGTTCCATC 2928
Query 2811 ACTGTGTAAAAGCCTATTTGATGCAACTTGCTACCTAATGGAAGAGAAACTAGCTTATTC 2870
||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2929 ACTGTGTAAAAGCGTATTTGATGCAACTTGTTACCTAATGGAAGAGAAACTAGCTTATTC 2988
Query 2871 TGGAAATGAGCAGGACATGGTGCTTCTGCACCACGAAGTAGAAGTGGAATTCTCT-GAAA 2929
|||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||
Sbjct 2989 CGGAAATGAACAGGACATGGTGCTTTTGCATCACGAAGTAGAAGTGGAATTC-CTTGAAA 3047
Query 2930 GCAAACGTATGGAGAAGCACAGTGCGACTCTTTTGGAATTCGGGGACATCAATAACGGAC 2989
|||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||
Sbjct 3048 GCAAACGTATAGAGAAGCACACTGCGACTCTTTTGGAATTCGGGGACATCAAGAATGGAC 3107
Query 2990 AAACAACGACCGCTATGGCCAAGACTGTTGGGATCCCTGCAGCCATTGGAGCTCTGCTGT 3049
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3108 AAACAACAACCGCTATGGCCAAGACTGTTGGGATCCCTGCAGCCATTGGAGCTCTGCTGT 3167
Query 3050 TAATTGAAGACAAGATCAAGACAAGAGGAGTCTTAAGGCCTCTCGAACCAGAGGTCTATT 3109
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||
Sbjct 3168 TAATTGAAGACAAGATCAAGACAAGAGGAGTCTTAAGGCCTCTCGAAGCAGAGGTGTATT 3227
Query 3110 TGCCAGCTTTGGATATATTGCAAGCATATGGTATAAAGCTGATGGAGAAGACAGAATGAT 3169
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3228 TGCCAGCTTTGGATATATTGCAAGCATATGGTATAAAGCTGATGGAGAAGGCAGAATGAT 3287
Query 3170 CAA-GAACTCTGTATAATGTTTCTCT--ATAACTTGGAG 3205
||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||
Sbjct 3288 CAAAGAACTCTGTATATTGTTTCTCTCTATAACTTGGAG 3326
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 164296738325
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5