BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg491448
Length=3458
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT4G32640.1 | Symbols: | Sec23/Sec24 protein transport family ... 5515 0.0
AT3G44340.1 | Symbols: CEF | clone eighty-four | chr3:16011621-... 1711 0.0
> AT4G32640.1 | Symbols: | Sec23/Sec24 protein transport family
protein | chr4:15742032-15750862 FORWARD LENGTH=3942
Length=3942
Score = 5515 bits (2986), Expect = 0.0
Identities = 3246/3371 (96%), Gaps = 19/3371 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGTGAATTTTCTGTC-T-TC-TACGGACAACAAATTTTTAGTTTTGATTGGTCGTCTGAA 57
||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||
Sbjct 1 TGTGAATTTTCTGTCTTCTCTTACGGACAACAAAATTTTAGTTTTTATCAGTCGTCTGAA 60
Query 58 TCCTGTGACACACACCGACGCCGTTAACCGTCGTCGCTGT-GTATCTCTCTCTCTTTCTC 116
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||
Sbjct 61 TCCTGTGACAGACACCGACGCCGTTAACCGTCGTCGCTGTCG-CTGTGTCTCTCTTTCTC 119
Query 117 ACTCTGTTCCATAGATCTGAGCTTCTACCAATATTTC-CCGATCGCTATCAGTCAAATCT 175
||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||
Sbjct 120 ACTCTGTTCCATAGATCTGAGCTTCTATCAATA-TTCTCGGATCGCTATCAGTCAAATCT 178
Query 176 TAAGAAGAATTTCCACGCTTTAGCTCAATT----C---AGATTGTTGAGCAAGGTTTT-G 227
| ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||| || ||||| |
Sbjct 179 T---AAGAATTTCGTCGCTTTAGCTCAATTCGGACTTTAGATTGTGGAGGAA-GTTTTAG 234
Query 228 GGTTTGATCTCCATCTCGTATCCAAGCATGGTTGCTCCTGTGCCTCCAGGGCCACCTAGA 287
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 235 GATTTGATCTCCATCTCGTATCCAAGCATGGTTGCTCCTGTGCCTCCAGGGGCACCTAGA 294
Query 288 CCCAACAGTCAGCAAAATTCCGGGCCACCAAATTTCTACCCGGGTTCACAAGGGAACTCA 347
|||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 295 CCCAACAGCCAGCAAAATTCCGGGCCACCTAATTTCTACCCGGGTTCACAAGGGAACTCA 354
Query 348 AATTCTTTAGCCGACAATATCCAGAATTTGAGCTTGAATCGACCACCTCCGATGATGCCT 407
||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 355 AATGCTTTAGCCGACAATATGCAGAACTTGAGCTTGAATCGACCACCTCCGATGATGCCT 414
Query 408 GGCTCAGGTCCTAGACCACCTCCTCCTTTTGGTCAGTCTCCACAGCCTTTCCCTCAGCAA 467
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 415 GGCTCAGGTCCTAGACCACCTCCTCCTTTTGGTCAGTCACCACAGCCTTTCCCTCAGCAA 474
Query 468 TCCCCTTCTTATGGAGCTCCTCAACGTGGGCCTTCACCCATGTCCCGGCCTGTACCTCCT 527
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 475 TCCCCTTCTTATGGAGCTCCGCAACGTGGGCCTTCACCCATGTCCCGGCCTGGACCTCCA 534
Query 528 GCTGGGATGGCGAGGCCAGGTGGTCCCCCTCCGGTATCACAACCAGCTGGATTTCAGTCA 587
||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 535 GCTGGCATGGCGAGACCAGGTGGTCCGCCTCCTGTATCACAACCAGCTGGGTTTCAGTCA 594
Query 588 AATGTACCCTTGAACAGACCCACTGGTCCACCTTCTAGTCAGCCACCATTTGGCTCTAGA 647
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||
Sbjct 595 AATGTACCCTTGAACAGACCCACTGGTCCACCTTCTCGTCAGCCATCATTTGGGTCTAGA 654
Query 648 CCGTCAATGCCTGGAGGACCAGTGCCGCAGCCTGCCGCCTCATCTAGTGGTTTTCCAGCT 707
|| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 655 CCTTCAATGCCTGGAGGACCAGTGGCGCAGCCTGCCGCCTCTTCTAGTGGTTTTCCAGCT 714
Query 708 TTTGGTCCATCAGGTAGTGTAGCTGCAGGTCCTCCTCCAGGAGCTCGCCCAATGGCATTT 767
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 715 TTTGGTCCATCAGGTAGTGTAGCTGCAGGTCCTCCTCCAGGATCTCGCCCAATGGCATTT 774
Query 768 GGTTCACCTCCACCTATCGGATCTGGCATGTCTATGCCTCCCTCAGGCATGCTTGGTGGT 827
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 775 GGTTCACCTCCACCTGTCGGATCTGGCATGTCTATGCCTCCCTCAGGCATGATTGGTGGT 834
Query 828 CCAGTCAGTAATGGGCATCAAATGGCTGCTTCAGGGGGATTTCCGAGGGGAACCCAGTTC 887
||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 835 CCAGTCAGTAATGGGCATCAAATGGTTGGTTCAGGGGGATTTCCGAGGGGAACCCAGTTC 894
Query 888 CCCGGTGCTGCTGTTACAACTCCACAGTCACCCTATATGCGGCCTCCCTCAGCACCTTTC 947
||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |
Sbjct 895 CCCGGTGCTGCTGTTACAACTCCACAGGCACCCTATGTGCGGCCTCCTTCAGCACCTTAC 954
Query 948 GCTCGGGCTCCTCCGCAGCCACTAGGTACACATTCTCTTTCTGGAAATCCACCATTAAAT 1007
|||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |
Sbjct 955 GCTCGGACTCCTCCGCAGCCACTAGGTTCACATTCTCTTTCCGGAAATCCACCATTAACT 1014
Query 1008 CTGTCTACTGCTCCTTCAATGCCCCCACCGGCAACCTTTCCTGGAGCCCCTCATGGCAGG 1067
| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1015 CCGTTTACTGCTCCTTCAATGCCCCCACCAGCAACCTTTCCTGGAGCCCCTCATGGCAGG 1074
Query 1068 CCAGCGGTATCAAACTTGCCTTACGGTCCACCATCAGCGCAGGTCCCCCCTCCTCTAGGC 1127
|||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||
Sbjct 1075 CCAGCGGTATCAGGCTTGCCTTATGGTCCACCATCAGCGCAGGTTGCCCCACCTCTAGGC 1134
Query 1128 TTTCCTGGCCCAATGCAACCACCAAGATATGGCATGGGTCCTTTGCCAAATCAGTCGATG 1187
|||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1135 TTTCCTGGTCAAATGCAACCACCAAGATATGGGATGGGTCCTTTGCCAAATCAGTCGATG 1194
Query 1188 ACCAACATACCCACTGCCATGGGCCAACCCGGTGCCTCTGTTCCTGGACCCTCAAGAATT 1247
||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1195 ACCAACATACCCACTGCCATGGGCCAACCTGGTGCCACTGTTCCTGGACCCTCAAGAATT 1254
Query 1248 GATCCTAATCAAATCCCAAGGCCAGGTTCAAGCTCCAGCCCAACTGTGTTTGAAACTCGC 1307
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1255 GATCCTAATCAAATCCCAAGGCCAGGTTCAAGCTCCAGCCCAACTGTATTTGAAACTCGC 1314
Query 1308 CAGAATAATCAGGCTAATCCTCCCCCGCCTGCTACTAGTGATTATGTTGTTCGAGACACT 1367
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1315 CAGAGTAATCAGGCTAATCCTCCCCCGCCTGCTACTAGTGATTATGTTGTTCGAGACACC 1374
Query 1368 GGAAATTGTAGTCCCCGTTACATGAGGTGTACGATCAATCAGATCCCATGTACAGTTGAT 1427
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1375 GGAAATTGTAGTCCCCGTTACATGAGGTGTACCATCAATCAGATCCCATGTACAGTTGAT 1434
Query 1428 CTTCTATCTACATCTGGAATGCAACTGGCGTTGATGGTCCAACCTCTGGCGCTTTCTCAT 1487
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1435 CTTCTATCTACATCTGGAATGCAACTGGCGTTGATGGTCCAACCGCTGGCGCTTTCTCAT 1494
Query 1488 CCATCTGAAGAGCCTATACAAGTTGTGGACTTTGGTGAGGGTGGGCCTGTTCGATGTTCA 1547
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1495 CCATCTGAAGAGCCTATACAAGTTGTGGACTTTGGTGAGGGTGGGCCTGTTCGATGTTCA 1554
Query 1548 CGCTGTAAGGGTTACATAAATCCTTTCATGAAGTTCATTGACCAAGGAAGGAAGTTCATC 1607
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CGCTGTAAGGGTTACATAAATCCTTTCATGAAGTTCATTGACCAAGGAAGGAAGTTCATC 1614
Query 1608 TGTAATTTCTGTGGATACACTGATGAGACTCCCCGTGACTATCACTGTAATCTGGGTCCA 1667
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1615 TGTAATTTCTGTGGATACACTGATGAGACTCCCCGTGACTATCACTGTAATCTGGGTCCA 1674
Query 1668 GATGGTAGACGCAGGGACGTTGATGAAAGACCTGAGCTGTGTAGGGGAACCGTTGAGTTT 1727
||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1675 GATGGTAGACGTAGGGATGTTGATGAAAGACCTGAGCTGTGTAGGGGAACCGTTGAGTTT 1734
Query 1728 GTTGCTACAAAAGAATACATGGTACGGGATCCAATGCCAGCAGTGTATTTTTTCCTCATT 1787
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1735 GTTGCTACAAAAGAATACATGGTACGGGATCCAATGCCAGCAGTATATTTTTTCCTCATT 1794
Query 1788 GATGTCTCAATGAATGCGATACAAACAGGTGCTACTGCCGCTGCTTGCAATGCAATCCAG 1847
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1795 GATGTCTCAATGAATGCGATACAAACAGGTGCTACTGCCGCTGCTTGCAATGCAATCCAG 1854
Query 1848 CAAGTACTTTCAGACCTTCCTGAAGGTCCTAGGACATTTGTTGGGATTGCTACGTTTGAC 1907
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1855 CAAGTACTTTCAGACCTTCCTGAAGGTCCTAGGACATTTGTTGGGATTGCTACATTTGAC 1914
Query 1908 TCAACAATCCACTTCTATAATTTGAAACGTGCACTGCAGCAGCCATTGATGCTCATTGTC 1967
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1915 TCAACAATCCACTTCTATAATTTGAAACGTGCACTGCAGCAGCCATTGATGCTCATTGTC 1974
Query 1968 CCTGATGTACAAGATGTTTATACACCATTAGAAACAGATGTCATTGTTCAGCTATCTGAG 2027
||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||
Sbjct 1975 CCTGATGTACAAGATGTCTATACACCTTTAGAAACAGATGTTGTAGTTCAGCTATCTGAG 2034
Query 2028 TGCCGTCAACATCTGGAGCTTTTGCTGGATAGTATCCCAACGATGTTTCAGGAAAGTAAA 2087
||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2035 TGCCGTCAACACCTAGAGCTTTTGCTGGATAGTATCCCAACGATGTTTCAGGAAAGTAAA 2094
Query 2088 ACTCCTGAATCTGCTTTTGGTGCAGCAGTTAAGGCTGCTTTCTTGGCGATGAAGAGCAAA 2147
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2095 ATTCCTGAATCTGCTTTTGGTGCAGCAGTTAAGGCTGCTTTCTTGGCGATGAAGAGCAAA 2154
Query 2148 GGAGGGAAGCTTATGGTATTTCAATCAATTTTGTGTTCTGTTGGTGTTGGAGCACTTTCT 2207
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2155 GGAGGGAAGCTTATGGTATTTCAATCAATTTTGTGTTCTGTTGGTGTTGGAGCACTTTCT 2214
Query 2208 TCTAGAGAGGCTGAAGGGAGAGCTAATATGTCTGCTGGTGAAAAGGAGGCCCATAAATTA 2267
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2215 TCTAGAGAGGCCGAAGGGAGAGCTAATATGTCTGCTGGTGAAAAGGAGGCCCATAAATTA 2274
Query 2268 CTACAACCGGCAGACAAAACTCTAAAGACCATGGCTATTGAATTTGCTGAATACCAGGTC 2327
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2275 CTACAACCAGCAGACAAAACTCTAAAGACCATGGCTATTGAATTTGCTGAATACCAGGTC 2334
Query 2328 TGTGTTGATATATTTATCACAGCTCAGGCCTATGTTGACATGGCTTCAATTTCCGTCATT 2387
||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2335 TGTGTAGATATATTTATCACAACTCAGGCCTATGTTGACATGGCTTCAATTTCCGTTATT 2394
Query 2388 CCAAGAACTACTGGAGGACAGGTGTATTGTTATTACCCTTTCTCAGCTCTCTCAGATCCT 2447
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2395 CCAAGAACTACTGGAGGACAGGTGTATTGTTATTACCCTTTCTCAGCTCTCTCAGATCCT 2454
Query 2448 CCCAAGCTTTACAATGATCTTAAATGGAATATTACTAGGCCACAGGGTTTTGAGGCTGTC 2507
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2455 CCCAAGCTTTACAATGATCTTAAATGGAATATTACTAGGCCACAGGGTTTTGAGGCTGTC 2514
Query 2508 ATGCGAGTCAGATGCAGCCAGGGTATTCAAGTGCAAGAATACTCGGGGAATTTCTGCAAA 2567
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2515 ATGCGAGTCAGATGCAGCCAGGGTATTCAAGTGCAAGAATACTCTGGGAATTTCTGCAAA 2574
Query 2568 CGCATTCCAACTGACATTGATCTACCAGCGCATGATGACAAACTACAAGATGGAGCTGAA 2627
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2575 CGCATTCCAACTGACATTGATCTACCAGCGCATGATGACAAACTACAAGATGGAGCGGAA 2634
Query 2628 TGTGCTTTCCAGTGCGCCCTTCTGTATACTACAATATATGGAGAAAGAAGAATTAGGGTT 2687
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2635 TGTGCTTTCCAGTGCGCCCTTCTGTATACTACAATATATGGAGAAAGAAGAATTAGGGTT 2694
Query 2688 ACCACATTATCACTCTCCTGTACGAACATGCTCAGTAATTTGTTTCGCGCAGCTGACTTA 2747
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2695 ACCACATTATCACTCTCCTGTACAAACATGCTCAGTAATTTGTTTCGCGCAGCTGACTTA 2754
Query 2748 GATTCTCAATTTGCTTGTATGCTGAAACAAGCGGCGAATGAAATTCCTTCGAAGGCACTT 2807
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2755 GATTCTCAATTTGCTTGTATGCTGAAACAAGCGGCTAATGAAATTCCTTCGAAGGCACTT 2814
Query 2808 CCACTGGTAAAGGAGCAAGCAACTAATAGTTGCATAAATGCACTCTATGCCTACCGTAAA 2867
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2815 CCACTGGTAAAGGAGCAAGCAACTAATAGTTGCATAAATGCACTCTATGCCTACCGTAAA 2874
Query 2868 TTTTGTGCTACAGTGACATCATCTGGACAACTTATTCTTCCCGAGGCGCTCAAGCTATTT 2927
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2875 TTTTGTGCTACAGTGACATCATCTGGACAACTTATTCTTCCCGAGGCGCTCAAGCTATTT 2934
Query 2928 CCATTATATACTCTCGCATTGACCAAAAGTGTGGGTTTAAGGACGGATGGGAGAATTGAT 2987
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2935 CCATTATACACTCTCGCATTGACCAAAAGTGTGGGTTTAAGGACGGATGGAAGAATTGAT 2994
Query 2988 GATCGATCATTCTGGATTAACTATGTATCTTCCCTTTCTACTCCTTTGGCAATCCCATTG 3047
||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2995 GATCGATCATTCTGGATCAACTATGTGTCTTCCCTTTCTACTCCTTTGGCAATCCCATTG 3054
Query 3048 GTTTATCCCAGGATGATTTCTGTTCACGACCTTGATGCGAAGGACAATGAGGGATCGGTT 3107
|||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct 3055 GTTTATCCGAGAATGATTTCTGTTCACGACCTTGATGTGAAGGACACTGAGGGATCGGTC 3114
Query 3108 CTTCCTCCTCCAATCCCATTGTCAAGTGAACACATTAGCAATGAGGGAGTTTATTTTCTT 3167
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3115 CTTCCTCCTCCAATCCCATTGTCAGGTGAACACATTAGCAATGAGGGAGTTTATTTTCTT 3174
Query 3168 GAGAATGGTGAAGACGGTCTACTATATGTTGGCGAATCAGTAGACTCTGATATTCTGCAG 3227
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3175 GAGAATGGTGAAGACGGTCTACTATTTGTTGGCGAATCAGTAGACTCTGATATTCTGCAG 3234
Query 3228 AAACTTTTTGGTGTTCCTTCAGCTGCTGAAATTCCTAGCCAGTATGTGCTGCAGCAGTAT 3287
|||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3235 AAACTTTTTGCTGTTTCTTCAGCTGCTGAAATTCCTAACCAGTTTGTGCTGCAGCAGTAT 3294
Query 3288 GATAATCAGTTATCAAAGAAGTTCAATGATGCTGTGAATGAAATAAGGAGGCAAAGATGT 3347
|||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3295 GATAATCAGTTATCAAAGAAATTCAATGATGCGGTGAATGAAATAAGGAGGCAAAGATGT 3354
Query 3348 TCTTACCTAAG 3358
|||||||||||
Sbjct 3355 TCTTACCTAAG 3365
Score = 139 bits (75), Expect = 2e-31
Identities = 98/108 (91%), Gaps = 6/108 (6%)
Strand=Plus/Plus
Query 3357 AGGAGTCCTTACAGAAGTTTCGT--C--C--CATCTGTGTCATGTACGGAATTTGTGGTA 3410
||||||||||||||||||||| | | | |||||||||||||| ||||||||| ||||
Sbjct 3518 AGGAGTCCTTACAGAAGTTTCCTCCCATCTGCATCTGTGTCATGTTCGGAATTTGCGGTA 3577
Query 3411 GAAAAGCATAGCAGAAGGGGAAAGGGCATTGGTCTTATGGCTGCTTGA 3458
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3578 GAAAAGCATAGCAGAAGGGGAAAGGGCATCGGTCTTATGGCTGCTTGA 3625
> AT3G44340.1 | Symbols: CEF | clone eighty-four | chr3:16011621-16020254
REVERSE LENGTH=3723
Length=3723
Score = 1711 bits (926), Expect = 0.0
Identities = 1232/1382 (89%), Gaps = 12/1382 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1222 CCTCTGTTCCTGGACCCTC-AAGAATTGATCCTAATCAAATCCCAAGGCCAGGTTCAAGC 1280
|||||||| || | ||||| ||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct 1107 CCTCTGTTTCTAGCCCCTCAAAG-ATTGATCTTAATCAGATACCAAGGCCAGGTTCAAGC 1165
Query 1281 TCCAGCCCAACTGTGTTTGAAACTCG-CCAGAATAATCAGGCTAATCCTCCCCCGCCTGC 1339
||||| |||| ||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||| || ||| |
Sbjct 1166 TCCAGTCCAATTGTGTATGAAACTCGTGTGGAA-AATAAGGCTAATCCTCCACCACCTAC 1224
Query 1340 TACTAG-TGATTATGTTGTTCGAGACACTGGAAATTGTAGTCCC-CGTTACATGAGGTGT 1397
|||| | ||||||| | | ||||||||||||||| || ||| ||||||||| | ||
Sbjct 1225 TACT-GTTGATTATATAACTAGAGACACTGGAAATTCCAG-CCCGCGTTACATGCGATGC 1282
Query 1398 ACGATCAATCAGATCCCATGTACAGTTGATCTTCTATCTACATCTGGAATGCAACTGGCG 1457
|| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1283 ACAATCAATCAGATCCCATGCACTGTTGATCTTCTATCTACATCTGGTATGCAACTGGCA 1342
Query 1458 TTGATGGTCCAACCTCTGGCGCTTTCTCATCCATCTGAAGAGCCTATACAAGTTGTGGAC 1517
| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1343 CTAATAGTCCAACCAATGGCGCTTTCTCATCCATCTGAAGAGCCTATCCAAGTTGTGGAC 1402
Query 1518 TTTGGTGAGGGTGGGCCTGTTCGATGTTCACGCTGTAAGGGTTACATAAATCCTTTCATG 1577
||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||
Sbjct 1403 TTTGGTGAGAGTGGCCCTGTTAGATGTTCACGTTGTAAGGGCTACGTGAATCCTTTCATG 1462
Query 1578 AAGTTCATTGACCAAGGAAGGAAGTTCATCTGTAATTTCTGTGGATACACTGATGAGACT 1637
||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||
Sbjct 1463 AAGTTCATTGACCAAGGAAGGAAGTTCATATGTAACTTGTGTGGATACACTGATGAGACT 1522
Query 1638 CCCCGTGACTATCACTGTAATCTGGGTCCAGATGGTAGACGCAGGGACGTTGATGAAAGA 1697
|| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||
Sbjct 1523 CCTCGTGACTACCAGTGTAATCTCGGTCCAGATGGTAGACGTAGGGATGCTGATGAAAGG 1582
Query 1698 CCTGAGCTGTGTAGGGGAACCGTTGAGTTTGTTGCTACAAAAGAATACATGGTACGGGAT 1757
|||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 1583 CCTGAGCTGTGTAGGGGAACTGTTGACTTTGTTGCTACAAAAGAATATATGGTACGAGAT 1642
Query 1758 CCAATGCCAGCAGTGTATTTTTTCCTCATTGATGTCTCAATGAATGCGATACAAACAGGT 1817
|||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||
Sbjct 1643 CCAATGCCAGCAGTATATTTCTTCCTCATTGATGTCTCAATGAACGCGATTCAAACAGGT 1702
Query 1818 GCTACTGCCGCTGCTTGCAATGCAATCCAGCAAGTACTTTCAGACCTTCCTGAAGGTCCT 1877
|| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 GCAACTGCAGCTGCTTGCAGTGCAATCCAGCAAGTCCTCTCAGACCTTCCTGAAGGTCCT 1762
Query 1878 AGGACATTTGTTGGGATTGCTACGTTTGACTCAACAATCCACTTCTATAATTTGAAACGT 1937
|||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||
Sbjct 1763 AGGACATTTGTTGGAATTGCCACGTTTGACTCAACAATTCACTTTTATAATTTGAAGCGT 1822
Query 1938 GCACTGCAGCAGCCATTGATGCTCATTGTCCCTGATGTACAAGATGTTTATACACCATTA 1997
||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||
Sbjct 1823 GCACTGCAGCAGCCATTGATGCTCATTGTTCCGGATGTTCAAGATGTGTATACACCTTTA 1882
Query 1998 GAAACAGATGTCATTGTTCAGCTATCTGAGTGCCGTCAACATCTGGAGCTTTTGCTGGAT 2057
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||
Sbjct 1883 GAAACAGATGTCATTGTTCAGCTATCTGAGTGCCGTCAACACCTAGAGATTTTGCTGGAA 1942
Query 2058 AGTATCCCAACGATGTTTCAGGAAAGTAAAACTCCTGAATCTGCTTTTGGTGCAGCAGTT 2117
||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1943 AGTATCCCAACAATGTTTCAGGAAAGTAAGAGTCCTGAATCTGCTTTTGGTGCAGCAGTT 2002
Query 2118 AAGGCTGCTTTCTTGGCGATGAAGAGCAAAGGAGGGAAGCTTATGGTATTTCAATCAATT 2177
||||| || ||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||| ||
Sbjct 2003 AAGGCCGCATTCTTAGCGATGAAGAGCACTGGAGGAAAGCTCATGGTGTTCCAATCAGTT 2062
Query 2178 TTGTGTTCTGTTGGTGTTGGAGCACTTTCTTCTAGAGAGGCTGAAGGGAGAGCTAATATG 2237
||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||
Sbjct 2063 TTGCCTTCTGTTGGCATTGGAGCACTTTCTTCTAGAGAAGCCGATGGGAGAGCTAATGCC 2122
Query 2238 TCTGCTGGTGAAAAGGAGGCCCATAAATTACTACAACCGGCAGACAAAACTCTAAAGACC 2297
||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||
Sbjct 2123 TCTGCGGGTGAAAAAGAGGCCCATAAATTACTACAACCCGCAGACAAAACTTTAAGGACC 2182
Query 2298 ATGGCTATTGAATTTGCTGAATACCAGGTCTGTGTTGATATATTTATCACAGCTCAGGCC 2357
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||| ||
Sbjct 2183 ATGGCTATTGAATTTGCTGAATACCAGGTCTGTGTAGATTTGTTTATCACAACTCAAGCG 2242
Query 2358 TATGTTGACATGGCTTCAATTTCCGTCATTCCAAGAACTACTGGAGGACAGGTGTATTGT 2417
||||||||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||| ||||||
Sbjct 2243 TATGTTGACATGGCTTCAATTTCTGAGATCCCAAGAACAACTGGAGGACAGGTTTATTGT 2302
Query 2418 TATTACCCTTTCTCAGCTCTCTCAGATCCTCCCAA-GCTT-TACAATGATCTTAAATGGA 2475
|||||||||||||||||||| ||||| || ||||| | || ||||| ||||||| |||||
Sbjct 2303 TATTACCCTTTCTCAGCTCTTTCAGACCC-CCCAAAG-TTATACAACGATCTTAGATGGA 2360
Query 2476 ATATTACTAGGCCACAGGGTTTTGAGGCTGTCATGCGAGTCAGATGCAGCCAGGGTATTC 2535
|||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2361 ATATCACGAGGCCCCAAGGTTTTGAGGCTGTCATGCGAGTCAGATGCAGTCAGGGTATTC 2420
Query 2536 AAGTGCAAGAATACTCGGGGAATTTCTGCAAACGCATTCCAACTGACATTGATCTACCAG 2595
|||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |
Sbjct 2421 AAGTGCAAGAATACTCAGGGAACTTCTGTAAGCGCATACCAACTGACATCGATCTACCTG 2480
Query 2596 CG 2597
||
Sbjct 2481 CG 2482
Score = 739 bits (400), Expect = 0.0
Identities = 653/773 (84%), Gaps = 26/773 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 2597 GCATGATGACAAACTACAAGATGGAGCTGAATGTGCTTTCCAGTGCGCCCTTCTGTATAC 2656
||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 2518 GCATGATGACAAACTACAAGATGGAGCTGAATGCGGTTTTCAGTGTGCCCTTCTGTATAC 2577
Query 2657 TACAATATATGGAGAAAGAAGAATTAGGGTTACC-A-CATTATCACTCTCCT-GTACGAA 2713
|| |||| ||||||||| |||||||||||| | | | |||||| || ||| |||| ||
Sbjct 2578 CACCATATCTGGAGAAAGGAGAATTAGGGTT-CTTAAC-TTATCAATC-CCTTGTACAAA 2634
Query 2714 CATGCTCAGTAATTTGTTTCGCGCAGCTGACTTAGATTCTCAATTTGCTTGTATGCTGAA 2773
|||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2635 CATGCTCAGTAACTTGTTCCGCTCAGCTGACCTAGATTCCCAATTTGCTTGTATGCTGAA 2694
Query 2774 ACAAGCGGCGAATGAAATTCCTTCGAAGGCACTTCCACTGGTAAAGGAGCAAGCAACTAA 2833
||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2695 ACAAGCGGCTAATGAGATCCCTTCGAAGGCACTTCCGTTGGTAAAGGAGCAAGCAACTAA 2754
Query 2834 T-AGTTGCATAA--ATGCACT-CTATGCCTACCGTAAATTTTGTGCTACAGTGACATCAT 2889
| | |||||| | || ||| | || |||| |||||||| || |||||||| ||||||
Sbjct 2755 TGA-TTGCATCACCAT--ACTAC-ATTCCTATCGTAAATTCTGCGCTACAGTTACATCAA 2810
Query 2890 CTGGACAACTTATTCTTCCCGAGGCGCTCAAGCTATTT-CCATTATATACTCTCGCATTG 2948
|||||||||||||||| || || || |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct 2811 CTGGACAACTTATTCTACCTGAAGCACTCAAGCT-TTTGCCATTATATACTCTCGCCTTA 2869
Query 2949 ACCAAAAGTGTGGGTTTAAGGACGGATGGGAGAATTGATGATCGATCATTCTGGATTAAC 3008
|||||| ||||||| ||| | | ||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||
Sbjct 2870 ACCAAAGGTGTGGGGTTACGAATGGACGGGAGAATTGATGACCGATCATTTTGGATAAAC 2929
Query 3009 TATGTATCTTCCCTT-TCTACTCCTTTGGCAATCCCATTGGTTTATCCCAGGATGATTTC 3067
|||| ||||| || || ||||||||||| || || | |||||||| ||||||||| |
Sbjct 2930 CATGTGTCTTCA-TTGTCCACTCCTTTGGCTATTCCGCTAGTTTATCCAAGGATGATTGC 2988
Query 3068 TGTTCACGACCTTGATGCGAAGGACAATGAGGGATCGGTTCTTCCTCCTCCAATCCCATT 3127
||| || ||||||||||| || || ||||| | | || ||||| ||||||||||||
Sbjct 2989 TGTCCATGACCTTGATGCAAATGATAATGAAGAAAATGTGGTTCCTTGTCCAATCCCATT 3048
Query 3128 GTCAA-GTGAACACATTAGCAATGAGGGAGTTTATTTTCTTGAGAATGGTGAAGACGGTC 3186
||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 3049 A-CAAAGTGAACACCTTAGCGATGAGGGAGTCTATTTTCTTGAGAACGGTGAAGATGGTT 3107
Query 3187 T-ACTATATGTTGGCGAATCAGTAGACTCTGATATTCTGCAGAAACTTTTTGGTGTTC-C 3244
| | ||||| |||| ||||||||| | || ||||| || ||||| || ||| ||||| |
Sbjct 3108 TGA-TATATATTGGAGAATCAGTAAATTCAGATATCCTACAGAAGCTCTTTAATGTTCGC 3166
Query 3245 TTCAGCTGCTGAAATTCCTAGCCAGTATGTGCTGCAGCAGTATGATAATCAGTTATCAAA 3304
| ||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||
Sbjct 3167 T-CAGCTGCTGAACTTCCAAGTCAGTATGTGCTGCAAAAGTATGATAATCAGCTATCAAA 3225
Query 3305 GAAGTTCAATGATGCTG-TGAATGAAATAAGGAGGCAAAGATGTTCTTACCTA 3356
|||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3226 GAAGTTCAATGACG-TGGTGAATGAAATAAGGAGGCAAAGAAGTTCTTACCTA 3277
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 172122781433
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5