BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg491589
Length=3265
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT4G31490.1 | Symbols: | Coatomer, beta subunit | chr4:1526853... 2691 0.0
AT4G31480.1 | Symbols: | Coatomer, beta subunit | chr4:1526315... 2617 0.0
> AT4G31490.1 | Symbols: | Coatomer, beta subunit | chr4:15268533-15273147
FORWARD LENGTH=3306
Length=3306
Score = 2691 bits (1457), Expect = 0.0
Identities = 1629/1714 (95%), Gaps = 3/1714 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATCTCTCACTTTGTGGGAGTGTTTTTGTTTTCCGAGATCCAAAATCTTCTCTTGGATCCA 60
||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 15 ATCTCTCACTTTGTGCGAGTGTTTTT-TTTTCCGAGATCCAAAATCTTCTAACGGATCC- 72
Query 61 AAAGCTTCGTAACTCCGTGGATCTCCTACCTTGAGCACCGGAAAAGATGGACAAATCTAG 120
||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 73 AAAGCTTTGTTACTCCGTGGATCTCCTACCTTGAGCACCTGAAAAGATGGACAAATCTAG 132
Query 121 TACCTTGCTTGTGCACTATGACAAAGGGACTCCTGCAGTGGCCAATGAGATTAAAGAAGC 180
|||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||
Sbjct 133 TACCATGCTTGTTCACTATGACAAAGGGACTCCAGCAGTTGCTAATGAGATTAAAGAAGC 192
Query 181 TCTCGAAGGAAATGATGTTGAAGCTAAAATTGATGCCATGAAGAAGGCGGTTATGCTTTT 240
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 193 TCTCGAAGGAAATGATGTTGAAGCTAAAGTTGATGCCATGAAGAAGGCAATTATGCTTTT 252
Query 241 GTTGAATGGTGAAACCATTCCTCAGCTTTTCATAACCATTATAAGATATGTGCTGCCTTC 300
| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 253 GCTGAATGGTGAAACCATTCCTCAGCTTTTCATTACCATTATAAGATATGTGCTGCCTTC 312
Query 301 TGAGGACCACACAATCCAAAAGCTTCTGTTGCTATACCTGGAGCTGATTGAAAAAACCGA 360
||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 313 TGAAGACCACACCATCCAAAAGCTTCTGTTGCTGTACCTGGAGCTGATTGAAAAGACAGA 372
Query 361 TTCTAAGGGGAAGGTGTTACCTGAAATGATTTTGATATGCCAGAATCTTCGGAATAACCT 420
||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 373 TTCGAAGGGGAAGGTGTTGCCTGAAATGATTTTGATATGCCAGAATCTTCGTAATAACCT 432
Query 421 TCAGCATTCGAATGAGTACATCCGTGGTGTGACACTCAGGTTTCTCTGCCGGTTGAAGGA 480
||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||
Sbjct 433 TCAGCATCCGAATGAGTACATCCGTGGAGTGACACTGAGGTTTCTCTGTCGGATGAAGGA 492
Query 481 GACTGAAATAGTAGAACCGTTGACTCCATCAGTGTTGCAAAATCTGGAGCATCGCCATCC 540
|||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 493 GACTGAAATAGTGGAACCTTTGACTCCATCAGTGTTACAAAATCTGGAGCATCGCCATCC 552
Query 541 GTTTGTTCGTAGGAATGCAATCCTAGCTATCATGTCAATATATAAGCTTCCACAAGGAGA 600
|||||||| ||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||| || ||
Sbjct 553 ATTTGTTCGCAGGAATGCAATTCTGGCAATCATGTCGATATATAAACTTCCACATGGCGA 612
Query 601 CCAACTCTTTGTGGATGCACCTGAAATGATCGAGAAAGTTCTATCAACAGAACAAGATCC 660
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 613 CCAACTCTTCGTGGATGCACCTGAAATGATCGAGAAAGTTCTATCAACAGAACAAGATCC 672
Query 661 GTCTGCCAAGAGAAATGCATTTCTAATGCTCTTTACCTGTGCCGAAGAACGAGCAGTGAA 720
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 673 TTCTGCCAAGAGAAATGCATTTCTAATGCTCTTTACCTGTGCCGAAGAACGTGCAGTGAA 732
Query 721 TTATCTTCTGAGCAATGTTGACAAGGTTTCAGACTGGAATGAATCACTTCAGATGGTGGT 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 733 TTATCTTCTGAGCAATGTTGACAAGGTTTCAGACTGGAATGAATCACTTCAGATGGTGGT 792
Query 781 GCTGGAGTTGATTCGAAGTGTGTGTAAGACTAAACCAACAGAGAAGGGGAAATATATTAA 840
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||
Sbjct 793 GCTGGAGCTGATTCGAAGTGTGTGTAAGACTAAACCAGCGGAGAAGGGAAAATATATTAA 852
Query 841 GATTATTATTTCTCTGTTAAGTGCTACTTCTTCTGCAGTTATCTATGAATGTGCTGGGAC 900
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 853 AATTATTATTTCTCTGTTAAGTGCTACTTCTTCTGCAGTTATCTATGAATGTGCTGGGAC 912
Query 901 ACTTGTTTCTCTCTCTTCTGCCCCGACTGCTATTAGGGCTGCTGCCAACACCTACTGCCA 960
||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||
Sbjct 913 ACTTGTTTCTCTCTCATCTGCCCCTACTGCTATTCGAGCTGCTGCCAACACCTACTGCCA 972
Query 961 ACTTCTTCTTTCTCAGAGTGACAACAATGTGAAGCTAATATTGCTCGATCGGTTGTATGA 1020
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||
Sbjct 973 ACTTCTTCTTTCTCAGAGTGACAACAATGTGAAGCTTATCTTGCTCGATCGGTTGTATGA 1032
Query 1021 GCTTAAGACATTGCACAGAGATATCATGGTTGAGTTGATAATAGATGTGCTCAGAGCACT 1080
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1033 GCTTAAGACATTGCACAGAGATATCATGGTTGAGCTGATAATCGATGTGCTCAGAGCACT 1092
Query 1081 CTCAAGCCCAAACCTTGATATCCGCAGGAAGACACTTGACATTGCCCTTGACTTGATTAC 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1093 CTCAAGCCCAAACCTTGATATCCGCAGGAAGACACTTGACATTGCCCTTGACTTGATTAC 1152
Query 1141 CCATCATAATATTAATGAGGTCGTTCAAATGTTGAAGAAAGAAGTTGTGAAGACACAGAG 1200
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1153 CCATCATAATATTAATGAAGTCGTTCAAATGTTGAAGAAAGAAGTTGTGAAGACACAGAG 1212
Query 1201 TGGAGAACTTGAGAAGAATGGGGAGTACAGACAAATGCTTATTCAAGCAATCCATGCTTG 1260
||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1213 TGGAGAACTTGAGAAGAATGGAGAGTACAGGCAAATGCTTATTCAAGCCATCCATGCTTG 1272
Query 1261 TGCAGTGAAGTTCCCCGAAGTTGCAAGTACAGTAGTCCATCTTCTAATGGATTTCTTGGG 1320
|||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||
Sbjct 1273 TGCAGTTAAGTTCCCCGAAGTTGCAAGCACAGTGGTCCATCTTCTGATGGATTTCCTGGG 1332
Query 1321 AGATAGCAATGTGGCTTCAGCTCTTGACGTGGTTGTTTTTGTTAGAGAGATAATAGAAAC 1380
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 AGATAGCAACGTGGCTTCAGCTCTTGACGTGGTTGTTTTCGTTAGAGAGATAATAGAAAC 1392
Query 1381 AAATCCGAAGTTAAGAGTTTCAATCATAACCAGGTTGTTGGACACGTTCTATCAGATCCG 1440
|||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1393 AAATCCCAAGTTGAGAGTTTCAATCATCACCAGGTTGTTGGACACGTTCTATCAGATCCG 1452
Query 1441 CGCAGGAAAGGTCTGCCCTTGTGCACTTTGGATTATTGGGGAGTATTGCCTATCACTTTC 1500
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1453 TGCAGGAAAGGTCTGCCCTTGTGCACTTTGGATCATTGGTGAGTATTGCCTATCACTTTC 1512
Query 1501 AGAAGTTGAGAGTGGCATTTCAACCATTAAACAATGCCTTGGCGATTTACCATTTTACTC 1560
|||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1513 AGAAGTTGAGAGTGGCATTTCAACTATTACACAATGCCTTGGCGAATTACCATTTTACTC 1572
Query 1561 TGTTTCTGAGGAGTCTGAGCCAACTGAGACATCGAAGAAGATTCAGCCTACCTCTTCTGC 1620
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1573 TGTTTCTGAGGAGTCTGAGCCAACTGAGACATCAAAGAAGATTCAGCCTACCTCTTCTGC 1632
Query 1621 CATGGTGTCCTCTAGAAAGCCAGTGATTCTTGCTGATGGAACTTATGCTACCCAAAGCGC 1680
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1633 CATGGTGTCCTCTAGAAAGCCAGTTATTCTTGCTGATGGAACTTATGCTACACAAAGCGC 1692
Query 1681 AGCCTCTGAA-CCACATTCTCCTCACCTACAGTT 1713
|||||||||| ||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1693 AGCCTCTGAAACCACATTCTCCTCGCCTACAGTT 1726
Score = 2272 bits (1230), Expect = 0.0
Identities = 1460/1566 (93%), Gaps = 36/1566 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1715 GCACTGCTTCTAACTGGTGATTTTTTCCTTGGAGCAGTGGTTGCTTGCACGTTGACTAAA 1774
||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1760 GCACTCCTTCTAACTGGTGATTTTTTCCTCGGAGCTGTGGTTGCTTGCACGTTGACCAAA 1819
Query 1775 CTTGTTCTTAGGTTGGAAGAGGTTCAGTCTTCTAAAACTGAAGTAAACAAGACAGTCA-C 1833
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |
Sbjct 1820 CTTGTTCTTAGGTTGGAAGAGGTTCAGTCTTCCAAAACTGAAGTAAACAAGACAGT-ATC 1878
Query 1834 ACAGGCTTTGCTGATCATGGTTTCTATGTTGCAACTTGGGCAATCTCCTGTTTCTCCACA 1893
|||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1879 ACAGGCTTTGCTAATCATGGTTTCTATTTTGCAACTTGGGCAATCTCCTGTTTCTCCACA 1938
Query 1894 CCCTATTGATAATGATTCGTATGAGAGGATTGTGTTGTGCATAAAATTGCTTTGCCATAG 1953
||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1939 CCCTATTGATAATGATTCGTATGAGCGGATTATGTTGTGCATAAAATTGCTTTGCCATAG 1998
Query 1954 GAATGATGAGATGAAAAAGATATGGTTGGAATACTGCCGCCAGAGTTTTGTCAAGATGAT 2013
||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 GAATGTTGAGATGAAAAAGATATGGTTGGAATCCTGCCGCCAGAGTTTTGTCAAGATGAT 2058
Query 2014 TTCTGAAAAACAGCTTAGAGAGATGGAGGAACTAAAGGCAAAGACCCAAACAACTCATGC 2073
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2059 TTCTGAAAAACAGCTTAGAGAGATGGAGGAACTGAAGGCAAAGACCCAAACAACTCATGC 2118
Query 2074 TCAACCTGATGATCTAATTGACTTCTTCCATCTAAAGAGTCGGAAGGGAATGAGTCAACT 2133
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2119 TCAACCGGATGATCTAATTGACTTCTTCCATCTAAAGAGTCGGAAGGGAATGAGTCAACT 2178
Query 2134 TGAGTTGGAAGACCAGGTACAAGATGACCTAAAGCGTGCAACTGGAGAATTCACCAAGGA 2193
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2179 TGAGTTGGAAGACCAGGTACAAGATGACCTAAAGCGTGCAACTGGAGAATTCACCAAGGA 2238
Query 2194 CGAGAACGATGCTAACAAACTTAACCGCATTCTTCAGCTCACGGGATTCAGTGACCCAGT 2253
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2239 CGAGAACGATGCTAACAAACTTAACCGCATTCTTCAACTCACAGGATTCAGTGACCCAGT 2298
Query 2254 CTATGCTGAAGCATATGTGACGGTACACCATTATGATATTGCGCTCGAAGTTACAGTAAT 2313
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||
Sbjct 2299 CTATGCTGAAGCATATGTAACGGTACACCATTATGATATTGCTCTTGAAGTTACAGTAAT 2358
Query 2314 CAACCGTACCAAGGAAACCCTTCAGAATC-TGTGCTTGGAGTTAGCAACCATGGGTGATC 2372
|||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2359 CAACCGAACCAAGGAAACCCTTCAGAA-CTTGTGCTTGGAGTTAGCAACCATGGGTGATC 2417
Query 2373 TCAAACTTGTTGAGCGTCCTCAGAACTATAGTCTGGCACCTGAAAGAAGCATGCAGATAA 2432
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2418 TCAAACTTGTTGAGCGTCCTCAGAACTATAGTCTGGCACCTGAAAGAAGCATGCAGATTA 2477
Query 2433 AAGCAAACATCAAGGTCTCGTCCACAGAGACGGGAGTCATATTCGGGAACATCGTCTATG 2492
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2478 AAGCAAACATCAAGGTCTCGTCCACAGAGACAGGAGTCATATTCGGGAACATCGTCTATG 2537
Query 2493 AGACATCAAATGTAATGGAGCGAAACGTCGTGGTTCTTAACGACATACACATTGATATCA 2552
|||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2538 AGACATCAAATGTAATGGAGCGCAATGTTGTGGTTCTTAACGACATACACATTGATATCA 2597
Query 2553 TGGACTATATCTCCCCTGCTGTGTGCTCAGAGGTTGCTTTCAGAACTATGTGGGCAGAGT 2612
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2598 TGGACTATATCTCCCCTGCTGTGTGCTCAGAGGTTGCTTTCAGAACTATGTGGGCAGAGT 2657
Query 2613 TTGAATGGGAAAACAAGGTTGCTGTGAACACCACAATTCAAAACGAAAGAGAATTCCTCG 2672
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2658 TTGAATGGGAAAACAAGGTTGCTGTGAACACCACAATTCAAAACGAAAGAGAATTCCTCG 2717
Query 2673 ACCACATTATCAAATCCACAAACATGAAATGTCTCACTGCCCCATCCGCAATAGAAGGTG 2732
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||
Sbjct 2718 ACCACATTATCAAATCCACAAACATGAAATGTCTCACTGCTCCATCTGCAATAGCAGGTG 2777
Query 2733 AATGTGGATTCCTTGCAGCAAACTTATATGCAAAAAGTGTGTTTGGTGAAGATGCTCTTG 2792
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2778 AATGTGGATTCCTTGCAGCAAACTTATATGCAAAAAGTGTGTTTGGTGAGGATGCTCTTG 2837
Query 2793 TGAATGTGAGTATTGAGAAGCAAACCGATGGAGCATTGAGTGGCTACATAAGGATAAGGA 2852
||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2838 TGAATTTGAGTATTGAGAAGCAAACGGATGGAACATTGAGTGGTTACATAAGGATAAGGA 2897
Query 2853 GCAAGACGCAAGGGATTGCTCTAAGTCTTGGGGACAAAATCACCCTCAAACAAAAGGGTA 2912
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2898 GCAAGACGCAAGGGATTGCTCTAAGTCTTGGAGACAAAATCACCCTCAAACAAAAGGGTG 2957
Query 2913 GTAGCTGAGGTTTGGAACGGTGGCGTGCAAGGTAACAGGTTTA-GACT-ACG-TACGTTT 2969
|||||||||| |||||| | | ||||||||||||| |||| | | | | | |||||||
Sbjct 2958 GTAGCTGAGGCTTGGAATGATAGCGTGCAAGGTAAAAGGTAAAAGGTTTAGGCTACGTTT 3017
Query 2970 CTCTCTTGAGCAATTTTTTGTTGGTTGAATCTGTTTACTACAAGGAGAGAGGAGGCGTTT 3029
|||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||
Sbjct 3018 CTCTCTTGAGCAATTTTTCGTTGGTTGATTCTGTTTACTACATGGAGAGAAGAGTCGTTT 3077
Query 3030 GA-GGATATGTAAAGAGTAATTTCAATTTGTTATCATTCTTCCTTAA-CCAGTATATTTT 3087
| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || || |||||||||
Sbjct 3078 AAAGGATATGTAAAGAGTAATTT------GTTATTATTCTTCCT-AAGCCGGTATATTTT 3130
Query 3088 CCGGTATGGCACCGATGGATTCTTCCTCATAC-GGCTGTGttttttttACACTACTAGAC 3146
||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||| ||||||||
Sbjct 3131 CCGGTATGGTACCGATGGATTCTTCCTCA-ACCGGCTGTCTTTTT---ACAGTACTAGAC 3186
Query 3147 GATTTTGTTTTATTGGTAATGCTTTCTTCTTCTTCTATAAAGTCGTTTGTTGAGGAGATT 3206
|||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||| | |||| | ||||||| |
Sbjct 3187 GATTTTGTTTTATTTGTAATACTTT-TTCTTCT---ATAATCTTGTTTATCGAGGAGACT 3242
Query 3207 -AAGCCGT-GA-CTTTCTTGAA-ATATAGTAGATTTCAAAG---CATGGGTTTGCTCCAA 3259
|| | || || | || | | |||||||||||||||| |||||||||| ||||
Sbjct 3243 GAA-CTGTTGAACGCG-TT-ATCA-ATAGTAGATTTCAAAGTTACATGGGTTTGTTCCAT 3298
Query 3260 TTTAGA 3265
||||||
Sbjct 3299 TTTAGA 3304
> AT4G31480.1 | Symbols: | Coatomer, beta subunit | chr4:15263154-15267847
FORWARD LENGTH=3423
Length=3423
Score = 2617 bits (1417), Expect = 0.0
Identities = 1568/1643 (95%), Gaps = 2/1643 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 73 CTCCGTGGATCTCCTACC-TTGAGCACCGGAAAAGATGGACAAATCTAGTACCTTGCTTG 131
|||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 162 CTCCCTGGATCTCGTACCTTTGAGCACCGGAGAAGATGGACAAATCTAGTACCATGCTTG 221
Query 132 TGCACTATGACAAAGGGACTCCTGCAGTGGCCAATGAGATTAAAGAAGCTCTCGAAGGAA 191
| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 222 TTCACTATGACAAAGGGACTCCAGCAGTTGCTAATGAGATTAAAGAAGCTCTCGAAGGAA 281
Query 192 ATGATGTTGAAGCTAAAATTGATGCCATGAAGAAGGCGGTTATGCTTTTGTTGAATGGTG 251
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct 282 ATGATGTTGAAGCTAAAGTTGATGCCATGAAGAAGGCAATTATGCTTTTGCTGAATGGTG 341
Query 252 AAACCATTCCTCAGCTTTTCATAACCATTATAAGATATGTGCTGCCTTCTGAGGACCACA 311
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 342 AAACCATTCCTCAGCTTTTCATAACCATTATAAGATATGTGCTACCTTCTGAGGACCACA 401
Query 312 CAATCCAAAAGCTTCTGTTGCTATACCTGGAGCTGATTGAAAAAACCGATTCTAAGGGGA 371
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||
Sbjct 402 CAATCCAAAAGCTTCTGTTGCTGTACCTGGAGCTGATTGAAAAGACTGATTCTAAGGGGA 461
Query 372 AGGTGTTACCTGAAATGATTTTGATATGCCAGAATCTTCGGAATAACCTTCAGCATTCGA 431
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |
Sbjct 462 AGGTGTTACCTGAAATGATTTTGATATGCCAGAATCTTCGTAATAACCTTCAGCATCCTA 521
Query 432 ATGAGTACATCCGTGGTGTGACACTCAGGTTTCTCTGCCGGTTGAAGGAGACTGAAATAG 491
|||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |
Sbjct 522 ATGAGTACATCCGTGGAGTGACACTGAGGTTTCTCTGCCGGATGAAGGAGACTGAAATTG 581
Query 492 TAGAACCGTTGACTCCATCAGTGTTGCAAAATCTGGAGCATCGCCATCCGTTTGTTCGTA 551
| || || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |
Sbjct 582 TGGAGCCTTTAACTCCATCAGTGTTACAAAATCTGGAGCATCGCCATCCATTTGTTCGCA 641
Query 552 GGAATGCAATCCTAGCTATCATGTCAATATATAAGCTTCCACAAGGAGACCAACTCTTTG 611
||||||| || || || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 642 GGAATGCCATTCTGGCCATCATGTCGATATATAAGCTTCCACAAGGCGACCAACTCTTTG 701
Query 612 TGGATGCACCTGAAATGATCGAGAAAGTTCTATCAACAGAACAAGATCCGTCTGCCAAGA 671
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||
Sbjct 702 TGGATGCGCCTGAAATGATCGAGAAAGTTCTATCAACCGAACAAGATCCTTCTGCCAAGA 761
Query 672 GAAATGCATTTCTAATGCTCTTTACCTGTGCCGAAGAACGAGCAGTGAATTATCTTCTGA 731
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 762 GAAATGCATTTCTAATGCTCTTTACCTGTGCTGAAGAACGTGCAGTGAATTATCTTCTGA 821
Query 732 GCAATGTTGACAAGGTTTCAGACTGGAATGAATCACTTCAGATGGTGGTGCTGGAGTTGA 791
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 822 GCAATGTTGACAAGGTTTCAGACTGGAATGAATCACTTCAGATGGTGGTGCTGGAGTTGA 881
Query 792 TTCGAAGTGTGTGTAAGACTAAACCAACAGAGAAGGGGAAATATATTAAGATTATTATTT 851
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 882 TTCGAAGTGTGTGTAAGACTAAACCAGCAGAGAAGGGGAAATATATTAAGATTATTATTT 941
Query 852 CTCTGTTAAGTGCTACTTCTTCTGCAGTTATCTATGAATGTGCTGGGACACTTGTTTCTC 911
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 942 CTCTGTTAAGTGCTACTTCTTCTGCAGTTATCTATGAATGTGCTGGGACACTTGTTTCTC 1001
Query 912 TCTCTTCTGCCCCGACTGCTATTAGGGCTGCTGCCAACACCTACTGCCAACTTCTTCTTT 971
|||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1002 TCTCATCTGCCCCTACTGCGATTCGGGCTGCTGCCAACACCTACTGCCAACTTCTTCTTT 1061
Query 972 CTCAGAGTGACAACAATGTGAAGCTAATATTGCTCGATCGGTTGTATGAGCTTAAGACAT 1031
||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1062 CTCAGAGTGACAACAATGTGAAGCTTATTTTACTCGATCGGTTGTATGAGCTTAAGACAT 1121
Query 1032 TGCACAGAGATATCATGGTTGAGTTGATAATAGATGTGCTCAGAGCACTCTCAAGCCCAA 1091
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1122 TGCACAGAGATATCATGGTTGAGTTGATAATAGATGTGCTCAGAGCACTCTCAAGCCCAA 1181
Query 1092 ACCTTGATATCCGCAGGAAGACACTTGACATTGCCCTTGACTTGATTACCCATCATAATA 1151
|||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1182 ACCTTGATATCCGCAGGAAGACGCTTGACATTTCCCTTGACTTGATTACCCATCATAATA 1241
Query 1152 TTAATGAGGTCGTTCAAATGTTGAAGAAAGAAGTTGTGAAGACACAGAGTGGAGAACTTG 1211
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1242 TCAATGAGGTCGTTCAAATGTTGAAGAAAGAAGTTGTGAAGACACAGAGTGGAGAACTTG 1301
Query 1212 AGAAGAATGGGGAGTACAGACAAATGCTTATTCAAGCAATCCATGCTTGTGCAGTGAAGT 1271
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1302 AGAAGAATGGGGAGTACAGACAAATGCTTATTCAAGCCATCCACGCTTGTGCAGTGAAGT 1361
Query 1272 TCCCCGAAGTTGCAAGTACAGTAGTCCATCTTCTAATGGATTTCTTGGGAGATAGCAATG 1331
|||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1362 TCCCCGAAGTTGCAAGCACAGTGGTCCACCTTCTGATGGACTTCTTGGGAGATAGCAATG 1421
Query 1332 TGGCTTCAGCTCTTGACGTGGTTGTTTTTGTTAGAGAGATAATAGAAACAAATCCGAAGT 1391
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1422 TGGCTTCAGCTCTTGACGTGGTTGTTTTTGTTAGAGAGATAATAGAAACAAATCCCAAGT 1481
Query 1392 TAAGAGTTTCAATCATAACCAGGTTGTTGGACACGTTCTATCAGATCCGCGCAGGAAAGG 1451
|||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1482 TAAGAGTTTCAATCATCACAAGGTTATTGGACACGTTCTATCAGATCCGAGCAGGAAAGG 1541
Query 1452 TCTGCCCTTGTGCACTTTGGATTATTGGGGAGTATTGCCTATCACTTTCAGAAGTTGAGA 1511
||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1542 TCTGCCCTTGTGCCCTTTGGATAATTGGGGAGTATTGCCTATCACTTTCGGAAGTTGAGA 1601
Query 1512 GTGGCATTTCAACCATTAAACAATGCCTTGGCGATTTACCATTTTACTCTGTTTCTGAGG 1571
||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1602 GTGGCATTTCAACTATCACGCAATGCCTTGGCGAATTACCATTTTACTCTGTTTCTGAGG 1661
Query 1572 AGTCTGAGCCAACTGAGACATCGAAGAAGATTCAGCCTACCTCTTCTGCCATGGTGTCCT 1631
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1662 AGTCTGAGCCAACTGAGACATCAAAGAAGATTCAGCCTACCTCTTCTGCCATGGTGTCCT 1721
Query 1632 CTAGAAAGCCAGTGATTCTTGCTGATGGAACTTATGCTACCCAAAGCGCAGCCTCTGAA- 1690
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1722 CTAGAAAGCCAGTGATTCTTGCTGATGGAACTTATGCTACCCAAAGCGCAGCCTCTGAAA 1781
Query 1691 CCACATTCTCCTCACCTACAGTT 1713
|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1782 CCACATTCTCCTCACCTACAGTT 1804
Score = 2266 bits (1227), Expect = 0.0
Identities = 1468/1578 (93%), Gaps = 42/1578 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 1714 AGCACTGCTTCTAACTGGTGATTTTTTCCTTGGAGCAGTGGTTGCTTGCACGTTGACTAA 1773
||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1837 AGCACTGCTACTAACTGGTGATTTTTTCCTCGGAGCAGTGGTTGCTTGCACGTTGACCAA 1896
Query 1774 ACTTGTTCTTAGGTTGGAAGAGGTTCAGTCTTCTAAAACTGAAGTAAACAAGACAGTCAC 1833
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1897 ACTTGTTCTTAGGTTAGAAGAGGTTCAGTCTTCTAAAACTGAAGTAAATAAGACAGTCAC 1956
Query 1834 ACAGGCTTTGCTGATCATGGTTTCTATGTTGCAACTTGGGCAATCTCCTGTTTCTCCACA 1893
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1957 ACAGGCTTTGTTGATCATGGTTTCTATGTTGCAACTTGGGCAATCTCCTGTTTCTCCACA 2016
Query 1894 CCCTATTGATAATGATTCGTATGAGAGGATTGTGTTGTGCATAAAATTGCTTTGCCATAG 1953
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2017 CCCTATTGATAATGATTCGTATGAGAGGATTGTGTTGTGCATAAAATTGCTTTGCCATAG 2076
Query 1954 GAATGATGAGATGAAAAAGATATGGTTGGAATACTGCCGCCAGAGTTTTGTCAAGATGAT 2013
||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2077 GAATGATGAGATGAAAAAGATATGGTTAGAATCCTGCCGCCAGAGTTTTGTCAAGATGAT 2136
Query 2014 TTCTGAAAAACAGCTTAGAGAGATGGAGGAACTAAAGGCAAAGACCCAAACAACTCATGC 2073
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||
Sbjct 2137 TTCTGAAAAACAGCTTAGAGAGATGGAGGAACTGAAGGCGAAGACCCAAACAACGCATGC 2196
Query 2074 TCAACCTGATGATCTAATTGACTTCTTCCATCTAAAGAGTCGGAAGGGAATGAGTCAACT 2133
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2197 TCAACCTGATGATCTAATTGACTTCTTCCATCTAAAGAGTCGGAAGGGAATGAGTCAACT 2256
Query 2134 TGAGTTGGAAGACCAGGTACAAGATGACCTAAAGCGTGCAACTGGAGAATTCACCAAGGA 2193
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2257 TGAGTTGGAAGACCAAGTACAAGATGACCTAAAGCGTGCAACTGGAGAATTCACCAAGGA 2316
Query 2194 CGAGAACGATGCTAACAAACTTAACCGCATTCTTCAGCTCACGGGATTCAGTGACCCAGT 2253
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2317 CGAGAACGATGCTAACAAACTTAACCGCATTCTTCAACTCACAGGATTCAGTGACCCAGT 2376
Query 2254 CTATGCTGAAGCATATGTGACGGTACACCATTATGATATTGCGCTCGAAGTTACAGTAAT 2313
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||
Sbjct 2377 CTATGCTGAAGCATATGTGACGGTACACCATTATGATATTGCTCTTGAAGTTACAGTAAT 2436
Query 2314 CAACCGTACCAAGGAAACCCTTCAGAATCT-GTGCTTGGAGTTAGCAACCATGGGTGATC 2372
|||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2437 CAACCGAACCAAGGAAACCCTTCAGAA-CTTGTGCTTGGAGTTAGCAACCATGGGTGATC 2495
Query 2373 TCAAACTTGTTGAGCGTCCTCAGAACTATAGTCTGGCACCTGAAAGAAGCATGCAGATAA 2432
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2496 TCAAACTTGTTGAGCGTCCTCAGAACTACAGTCTGGCACCTGAAAGAAGCATGCAGATTA 2555
Query 2433 AAGCAAACATCAAGGTCTCGTCCACAGAGACGGGAGTCATATTCGGGAACATCGTCTATG 2492
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2556 AAGCAAACATCAAGGTGTCGTCCACAGAGACGGGAGTCATATTCGGGAACATCGTCTATG 2615
Query 2493 AGACATCAAATGTAATGGAGCGAAACGTCGTGGTTCTTAACGACATACACATTGATATCA 2552
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2616 AGACATCAAATGTAATGGAGCGAAACGTCGTTGTTCTTAATGACATACACATTGATATCA 2675
Query 2553 TGGACTATATCTCCCCTGCTGTGTGCTCAGAGGTTGCTTTCAGAACTATGTGGGCAGAGT 2612
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2676 TGGACTATATCTCCCCTGCTGTGTGTTCAGAGGTTGCTTTCAGAACTATGTGGGCAGAGT 2735
Query 2613 TTGAATGGGAAAACAAGGTTGCTGTGAACACCACAATTCAAAACGAAAGAGAATTCCTCG 2672
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2736 TCGAATGGGAAAACAAGGTTGCTGTGAACACCACAATACAAAACGAAAGAGAATTCCTCG 2795
Query 2673 ACCACATTATCAAATCCACAAACATGAAATGTCTCACTGCCCCATCCGCAATAGAAGGTG 2732
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 2796 ACCACATTATCAAATCTACAAACATGAAATGTCTCACTGCTCCATCCGCAATAGAAGGCG 2855
Query 2733 AATGTGGATTCCTTGCAGCAAACTTATATGCAAAAAGTGTGTTTGGTGAAGATGCTCTTG 2792
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||
Sbjct 2856 AATGTGGATTCCTTGCAGCAAACTTATACGCAAAAAGTGTATTTGGTGAGGATGCTCTTG 2915
Query 2793 TGAATGTGAGTATTGAGAAGCAAACCGATGGAGCATTGAGTGGCTACATAAGGATAAGGA 2852
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2916 TGAATGTGAGTATTGAGAAGCAAACGGATGGAGCATTGAGTGGTTACATAAGGATAAGGA 2975
Query 2853 GCAAGACGCAAGGGATTGCTCTAAGTCTTGGGGACAAAATCACCCTCAAACAAAAGGGTA 2912
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2976 GCAAGACGCAAGGGATTGCCCTAAGTCTTGGGGACAAAATCACCCTCAAACAAAAGGGTA 3035
Query 2913 GTAGCTGAGGTT---T---G--GA------ACGGTGGCGTGCAA-GGTAACAGGTTTAGA 2957
||||||||| | | | || || ||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3036 GTAGCTGAG-TACCATACCGATGATTTCTCACAGTGGCGTGCAAAGGTAACAGGTTTAGA 3094
Query 2958 CTACGTACGTTTCTCTCTTGAGCAATTTTTTGTTGGTTGAATCTGTTTACTACAAGGAGA 3017
|||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||| ||| || | ||||
Sbjct 3095 CTACGTACGTTTCTCT-T-GAGCAATTATC-GTTGGTTGAATCTGCTTATTATATGGAGG 3151
Query 3018 GAGGAGGCGTTTGAGG--ATATGTAAAGAGTAATTTCAATTTGTTATCATTCTTCCTTAA 3075
||||||||||| ||| ||||||||| || | | |||| | |||| ||||| |||||
Sbjct 3152 GAGGAGGCGTTCAAGGGTATATGTAAAAAG-AGT---AATTGGCTATCGTTCTTACTTAA 3207
Query 3076 CCAGTATATTTTCCGGTATGGCACCGATGGATT-CTTC--CTCATACGGCTGTGtttttt 3132
|| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||| |||| ||||
Sbjct 3208 CCGGTATATTTTCTGGTATGGTACCGATGGATTTCTTCATCTCATATGGCAGTGTGTTTT 3267
Query 3133 ttACACTACTAGACGATTTTGTTTTATTGGTAATGCTTTCTTCTTCTTCTATAAAGTCGT 3192
|||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||
Sbjct 3268 TTACTGTACTAGACGATTTTGTTTTATTTGTAATGCTTT-TTCTTCT---ATAATGTCGT 3323
Query 3193 TTGTTGAGGAGATTAAGCCGTGA-CTTTCTTGAAATATAGTAGATTTCAAAGC-A--TG- 3247
|||||||||| |||| |||||| |||| | || || | |||||||||||||| | |
Sbjct 3324 TTGTTGAGGACTTTAAACCGTGAACTTTAT-GATAT-T-GTAGATTTCAAAGCTACATTT 3380
Query 3248 GGTTTGCTCCAATTTAGA 3265
||||||||||| ||||||
Sbjct 3381 GGTTTGCTCCATTTTAGA 3398
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-15
Identities = 63/70 (90%), Gaps = 6/70 (9%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATCTCTCAC-T--TT-GTGGGAGTGTTTTTGTTTTCCGAGATCCAAAATCTTCTCTTGGA 56
||||||||| | || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 67 ATCTCTCACTTCCTTGGTGCGAGTG-TTTTGTTTTCCGAGATCCAAAATCTTCTCTTGGA 125
Query 57 TCCAAAAGCT 66
|||||| |||
Sbjct 126 TCCAAA-GCT 134
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 162440561434
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5