BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg491768
Length=3560
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT4G29900.1 | Symbols: ACA10, CIF1, ATACA10 | autoinhibited Ca(... 5437 0.0
AT4G29890.1 | Symbols: | choline monooxygenase, putative (CMO-... 134 8e-30
> AT4G29900.1 | Symbols: ACA10, CIF1, ATACA10 | autoinhibited Ca(2+)-ATPase
10 | chr4:14610883-14619573 REVERSE LENGTH=3762
Length=3762
Score = 5437 bits (2944), Expect = 0.0
Identities = 3304/3469 (95%), Gaps = 60/3469 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGAGTGGACAATTCAATAATTCTCCTCGAGCGGAAGACAAGGACGTGGAGGCTGGAACC 60
|||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 211 ATGAGTGGACAATTCAATAATTCTCCACGAGGGGAAGACAAGGACGTGGAGGCTGGAACC 270
Query 61 AGCACCTTCACCGACTATGAGGATAGTCCGTTTGACATTGCCAGCACTAAGAATGCTCCA 120
|||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 271 AGCAGCTTCACCGAATATGAAGATAGTCCGTTTGACATTGCCAGTACTAAGAATGCTCCA 330
Query 121 GTGGAGCGACTACGCCGTTGGAGGCAAGCTGCGCTTGTTCTTAATGCTTCTCGCCGATTT 180
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 331 GTGGAGCGGCTACGCCGTTGGAGGCAAGCTGCGCTTGTTCTTAATGCTTCTCGTCGATTT 390
Query 181 CGATATACTTTGGACTTAAAAAGGGAAGAAGATAAGAGACAGATGCTGAGGAAGATGAGA 240
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 391 CGATATACGCTGGACTTAAAAAGGGAAGAAGATAAGAAACAGATGCTGAGGAAGATGAGA 450
Query 241 GCGCATGCCCAAGCAATAAGAGCTGCACACCTTTTTAAAGCAGCTGCAAGCCGAGTGACT 300
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 451 GCGCACGCCCAAGCAATAAGAGCTGCACACCTTTTTAAAGCAGCTGCAAGCCGCGTGACT 510
Query 301 GGAGTTACAAGTCCACCTCCGACTCCTGGCGGTGGTGATTTTGGTATCGGACAGGAGCAG 360
||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 511 GGAATTGCAAGTCCACTTCCAACTCCTGGCGGTGGTGATTTTGGTATCGGACAGGAGCAG 570
Query 361 ATTGTATCAATATCGAGGGATCAAAATATAGGAGCTCTTCAAGAGCTTGGAGGGGCATCC 420
||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 571 ATTGTGTCAATATCAAGGGATCAAAATATAGGAGCTCTTCAAGAGCTTGGA--GG----- 623
Query 421 ATAAAACTTATGCATGTAAGAGGGTTATCTGACCTGTTGAAAACAAACTTGGAGAAGGGT 480
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 624 -----------G---GTAAGAGGGTTATCTGACCTGTTGAAAACAAACTTGGAGAAGGGT 669
Query 481 ATACACGGGGATGATGATGACATATTGAAAAGGAAATCTGCTTTTGGATCAAACACATAC 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 670 ATACACGGGGATGATGATGACATATTGAAAAGGAAATCTGCTTTTGGATCAAACACATAC 729
Query 541 CCCCAGAAGAAAGGGAGGAGTTTCTGGAGGTTTGTATGGGAAGCTTCTCAAGATCTTACT 600
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 730 CCTCAGAAGAAAGGGAGGAGTTTCTGGAGGTTTGTATGGGAAGCTTCTCAAGATCTTACT 789
Query 601 TTGATCATACTGATTGTAGCAGCAGCTGCTTCTTTGGCATTGGGAATAAAGACCGAGGGT 660
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 790 TTGATCATACTGATTGTAGCAGCAGTTGCTTCTTTGGCATTGGGAATAAAGACCGAGGGT 849
Query 661 ATCAAAAAGGGATGGTATGATGGTATCAGCATTGCTTTTGCCGTTCTTCTTGTCATTGTG 720
||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 850 ATCGAAAAGGGATGGTACGATGGTATCAGCATTGCTTTTGCCGTTCTTCTTGTCATTGTG 909
Query 721 GTGACAGCTACCAGTGATTATCGGCAATCTCTTCAATTCCAGAACTTAAATGAAGAGAAA 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 910 GTGACAGCTACCAGTGATTATCGGCAATCTCTTCAATTCCAGAACTTAAATGAAGAGAAA 969
Query 781 AGAAATATACGTCTAGAGGTTACCCGCGATGGGAGAAGAGTTGAGATTTCAATTTATGAC 840
|||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 970 AGAAATATACGTCTAGAGGTAACCCGTGATGGGAGAAGAGTGGAGATTTCAATTTATGAC 1029
Query 841 ATTGTGGTAGGC-AAGT--T--GCAT-GAT-TTTTTCGATGCA-GTACCTGCTGATGGAG 892
||||| |||||| | || | | | || || | ||| || |||||||| |||||||
Sbjct 1030 ATTGTAGTAGGCGATGTCATACCCCTCAATATTGGT-GAT-CAGGTACCTGCGGATGGAG 1087
Query 893 TTTTAGTTGCTGGCCATTCCCTTGCAGTTGATGAGTCCAGCATGACTGGAGAGAGCAAAA 952
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1088 TTTTAGTTGCTGGACATTCCCTTGCAGTTGATGAGTCCAGCATGACTGGAGAGAGCAAAA 1147
Query 953 TTGTTCaaaaaaaCTCTACTAAGAATCCATTCCTAATGTCCGGCTGTAAAGTTGCAGATG 1012
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1148 TTGTTCAAAAAAACTCTACTAAGCATCCATTCCTAATGTCTGGCTGTAAAGTTGCAGATG 1207
Query 1013 GCAATGGGGCAATGTTGGTTACTGGGGTAGGGGTCAACACCGAATGGGGCTTACTAATGG 1072
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1208 GCAATGGGACAATGTTGGTTACTGGGGTAGGGGTCAACACTGAATGGGGCTTACTAATGG 1267
Query 1073 CTAGCGTCTCAGAGGACAATGGTGGAGAAACACCATTGCAGGTGCGCTTGAATGGTGTTG 1132
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1268 CTAGCGTCTCAGAGGACAATGGTGGAGAAACACCATTGCAGGTGCGCTTGAATGGTGTAG 1327
Query 1133 CAACATTTATCGGGATTGTGGGGCTCACAGTTGCTGGCGTTGTATTATTTGTCCTAGTCG 1192
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1328 CAACATTTATCGGGATTGTCGGGCTCACAGTTGCTGGCGTTGTATTATTTGTCCTAGTTG 1387
Query 1193 TCCGTTACTTTACCGGTCACACGAAGAATGAACAGGGAGGCCCACAGTTTATTGGAGGGA 1252
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1388 TCCGTTACTTTACCGGTCACACGAAGAATGAACAGGGAGGCCCACAGTTTATTGGAGGGA 1447
Query 1253 AGACAAAATTTGATCACGTGCTAGATGATCTTGTTGAAATCTTCACTGTTGCAGTTACAA 1312
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1448 AGACAAAATTTGAGCACGTGCTAGATGATCTTGTTGAAATCTTCACTGTTGCAGTTACAA 1507
Query 1313 TTGTTGTAGTGGCAGTGCCTGAAGGGCTTCCTTTGGCTGTTACCTTGACTCTTGCATATT 1372
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1508 TTGTTGTAGTGGCAGTGCCTGAAGGGCTTCCTTTAGCTGTTACCTTGACTCTTGCGTATT 1567
Query 1373 CCATGAGAAAAATGATGGCAGATAAAGCTTTGGTGCGTAGGCTTTCCGCCTGTGAGACCA 1432
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||
Sbjct 1568 CCATGAGAAAAATGATGGCAGATAAAGCTTTGGTGCGTAGGCTTTCAGCCTGTGAAACCA 1627
Query 1433 TGGGGTCTGCAACAACAATTTGCAGTGATAAGACTGGAACTTTGACCTTAAACGAGATGA 1492
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1628 TGGGGTCTGCAACAACAATTTGCAGTGATAAGACTGGAACTTTGACCTTAAACGAGATGA 1687
Query 1493 CCGTTGTTGAGTGTTATGCTGGGTTCCAAAAGATGGATCCTCCCGACAGCAGCTCAAAAT 1552
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1688 CCGTTGTTGAGTGTTATGCTGGGTTACAAAAGATGGATTCTCCCGACAGCAGCTCAAAAT 1747
Query 1553 TGCCATCTGCTTTTACATCCATACTTGTTGAGGGTATTGCTCACAATACAACCGGCAGTG 1612
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1748 TGCCATCTGCTTTTACATCCATACTTGTTGAGGGTATTGCTCACAATACAACCGGCAGTG 1807
Query 1613 TGTTCCGATCTGAAGGTGGTGAGATTCAGGTTTCTGGATCTCCGACAGAAAGAGCAATTC 1672
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1808 TGTTCCGATCTGAAAGTGGTGAGATTCAGGTTTCTGGATCTCCTACAGAAAGAGCAATTC 1867
Query 1673 TCAGTTGGGCGATAAAGTTGGGCATGGATTTCGATGCTCTTAAGTCTGAGTCTTCTGCTG 1732
||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1868 TCAATTGGGCGATAAAGTTGGGTATGGATTTTGATGCTCTTAAGTCTGAGTCTTCTGCTG 1927
Query 1733 TACAATTTTTTCCATTCAACTCAGAGAAGAAACGGGGAGGTGTAGCAGTGAAATCACCAG 1792
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1928 TACAATTTTTTCCATTCAACTCAGAGAAGAAACGAGGAGGTGTAGCAGTGAAATCACCAG 1987
Query 1793 ATTCGAGTGTCCATGTTCACTGGAAAGGCGCTGCCGAAATTGTTTTGGGATCCTGCACGC 1852
|||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1988 ATTCGAGTGTCCATATTCACTGGAAAGGTGCTGCCGAAATTGTTTTGGGATCCTGCACGC 2047
Query 1853 ACTATATGGATGAGAATGAGAGTTTTGTAGATATGAGTGAAGATAAGATGGCTGGGTTAA 1912
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2048 ACTATATGGATGAGAGTGAGAGTTTTGTAGATATGAGTGAAGATAAGATGGGTGGGTTAA 2107
Query 1913 AAGATGCTATCGATGATATGGCTGCAAGGAGTCTACGCTGTGTTGCAATTGCCTTCAGAA 1972
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2108 AAGATGCTATCGATGATATGGCTGCAAGGAGTCTGCGCTGTGTTGCAATTGCCTTCCGAA 2167
Query 1973 CATTTGAAGCGGATAAGATTCCAACTGATGAAGAGCAACTCTCTAGATGGGTATTACCTG 2032
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2168 CATTTGAAGCGGATAAGATTCCAACTGATGAAGAGCAACTCTCTAGATGGGAATTACCTG 2227
Query 2033 AGGATGATCTTGTATTGTTGGCTATCGTTGGTATTAAGGATCCATGTCGCCCAGGTGTCA 2092
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2228 AGGATGATCTTATATTGTTGGCTATCGTTGGTATTAAGGATCCATGTCGCCCAGGTGTCA 2287
Query 2093 AAAATTCAGTTTTACTATGTCAACAAGCTGGAGTCAAGGTTCGTATGGTGACTGGTGATA 2152
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2288 AAAATTCAGTTTTACTGTGTCAACAAGCTGGAGTCAAGGTTCGTATGGTGACTGGTGATA 2347
Query 2153 ACATTCAGACTGCCAAAGCAATTGCATTGGAGTGTGGTATATTAGCTTCAGACTCAGATG 2212
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2348 ACATTCAGACTGCCAAAGCAATTGCACTGGAGTGTGGTATATTAGCTTCAGACTCAGATG 2407
Query 2213 CTAGTGAGCCTAATCTGATTGAAGGAAAAGTATTTCGATCCTATTCAGAAGAAGAAAGAG 2272
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2408 CTAGTGAGCCTAATCTGATTGAAGGAAAAGTATTTCGATCCTATTCAGAAGAAGAAAGAG 2467
Query 2273 ATAGGATTTGTGAAGAAATATCTGTAATGGGTAGATCATCACCCAATGACAAACTTCTTC 2332
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2468 ATAGGATTTGTGAAGAGATATCTGTAATGGGTAGATCATCACCCAATGACAAACTTCTTC 2527
Query 2333 TTGTGCAATCGCTGAAGAGGAGGGGACACGTTGTGGCTGTGACTGGTGATGGAACCAATG 2392
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2528 TTGTGCAATCGCTGAAGAGGAGGGGACACGTCGTGGCTGTGACTGGTGATGGAACCAATG 2587
Query 2393 ATGCTCCTGCATTGCATGAGGCAGATATAGGTCTCGCAATGGGTATCCAAGGTACCGAAG 2452
||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2588 ATGCTCCTGCACTGCACGAGGCAGATATAGGTCTCGCAATGGGTATCCAAGGCACCGAAG 2647
Query 2453 TTGCAAAGGAAAAGTCAGACATCATTATCTTGGATGACAACTTTGAATCCGTTGTGAAGG 2512
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2648 TTGCAAAGGAAAAGTCAGACATCATTATCTTGGATGACAACTTTGAATCCGTTGTGAAGG 2707
Query 2513 TTGTCCGTTGGGGTCGATCTGTGTATGCCAATATTCAAAAGTTCATCCAGTTTCAGCTCA 2572
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2708 TTGTCCGTTGGGGTCGATCTGTGTATGCGAATATTCAAAAGTTCATCCAGTTTCAGCTCA 2767
Query 2573 CGGTTAATGTCGCAGCCCTTGTCATCAATGTTGTGGCTGCCATATCCGCCGGTGATGTTC 2632
|||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||
Sbjct 2768 CGGTTAATGTCGCAGCTCTTGTCATCAATGTGGTGGCTGCCATATCCGCGGGTGAAGTTC 2827
Query 2633 CTCTAACTGCAGTACAGCTCCTCTGGGTCAATCTTATAATGGATACTCTTGGGGCTCTTG 2692
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2828 CTCTAACTGCAGTACAGCTCCTTTGGGTCAATCTTATAATGGATACTCTTGGGGCTCTTG 2887
Query 2693 CTTTAGCCACTGAACCACCAACCGATCACTTAATGGATCGAGCCCCTGTTGGCAGAAGAG 2752
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2888 CTTTAGCCACTGAGCCACCAACCGATCACTTAATGGATCGAGCGCCTGTTGGCAGAAGAG 2947
Query 2753 AACCTCTCATCACAAATATCATGTGGAGAAACTTGTTTATACAAGCGATGTACCAAGTGA 2812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2948 AACCTCTCATCACAAATATCATGTGGAGAAACTTGTTTATACAAGCGATGTACCAAGTGA 3007
Query 2813 CAGTCTTGTTAATCCTCAATTTCCGTGGAATAAGTATCCTGCATCTGAAGAGTAAGCCAA 2872
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3008 CAGTCTTGTTAATCCTCAATTTCCGTGGAATAAGTATCCTGCATCTGAAGAGTAAGCCAA 3067
Query 2873 ATGCTGAGAGAGTGAAGAATACAGTCATCTTCAATGCCTTTGTAATCTGCCAGATATTCA 2932
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||
Sbjct 3068 ATGCTGAGAGAGTGAAGAATACAGTCATCTTCAATGCCTTTGTCATCTGCCAGGTATTCA 3127
Query 2933 ACGAGTTCAATGCACGGAAGCCAGATGAAATGAACATTTTCCGAGGAGTTCTCAGGAATC 2992
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3128 ACGAGTTCAATGCACGGAAGCCAGATGAAATAAACATTTTCCGAGGAGTTCTCAGGAATC 3187
Query 2993 ACCTTTTTGTGGGCATCATCTGTATCACCATTGTGCTCCAGGTAGTCATCGTCGAGTTCC 3052
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3188 ACCTTTTTGTGGGCATCATCTCTATCACCATTGTGCTCCAGGTAGTCATCGTCGAGTTCC 3247
Query 3053 TTGGAACATTTGCCTCAACGACTAAGCTTGACTGGGAGATGTGGCTCGTCTGTATCGGAA 3112
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3248 TTGGAACATTTGCCTCAACGACTAAGCTTGATTGGGAGATGTGGCTCGTCTGTATCGGAA 3307
Query 3113 TCGGTTCCATCAGTTGGCCATTGGCGGTGATCGGAAAATTGATACCGGTTCCAGAAACTC 3172
||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3308 TCGGTTCTATCAGTTGGCCTTTGGCGGTGATCGGAAAATTGATACCGGTTCCAGAAACTC 3367
Query 3173 CAGTCAGCCAATACTTTAGAATAAACCGGTGGAGAAGGAACTCATCAGGTAATTTAAGTA 3232
| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||
Sbjct 3368 CGGTTAGTCAATACTTTAGAATAAACCGGTGGAGAAGGAACTCATCAGGT--T--AA-TA 3422
Query 3233 GTTAGGTTAATAATTAGTTTGAAAAGAG---AATACCAAAGGTGGCTTAGTAGTA-TCCA 3288
|||| || | || || ||||| || ||||||||||||||||| |||| | |
Sbjct 3423 ATTAGTTTGA-AA--AGA--GAAAACAGTTTAATACCAAAGGTGGCTTT-TAGTGGT--A 3474
Query 3289 ACTTGTGAATACTTTTACCTCTTT-CTCTCAGTATTTTCGCAAACGGCTTCTTCGGTTTA 3347
||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3475 -CTTGTGAATACGTTTACCTCTTTTCTCTCAGTATTTTCGCAAACGGCATCTTCGGTTTA 3533
Query 3348 ATACATCAAACAAATGAAAAATATACCTATTTTTGTTTAGTTGTTGTTAAGCCTGTTACC 3407
||||| | | ||| || || | |||||||||||||||| | ||||||| ||||||
Sbjct 3534 ATACAG-ATA-AAA--AATAA-A--CCTATTTTTGTTTAGT-G--GTTAAGCTTGTTACG 3583
Query 3408 TTAATCCTTAAATGCTCAAAGTCCAGAGTAATCCGAACGAAGTGACTTA 3456
|||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3584 TTAATCCTTAAATGCTCAAAGTCCGGAGTAATCTAAACGAAGTGACTTA 3632
Score = 134 bits (72), Expect = 8e-30
Identities = 92/101 (91%), Gaps = 4/101 (4%)
Strand=Plus/Plus
Query 3460 AAAGAGGCTTCATTTTATGCTTGGTGCAGAGATAATAGAACTGTAGAATATTCACATAAA 3519
||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3665 AAAGAGGCTTCATTTTATGTTTGGTGCAGAGAGAGTAGAACTGTAGAATATTCACATAAA 3724
Query 3520 TACATATATGCAAATATTTTCACAGTTTGAGATTGTGATGT 3560
|||||| || | ||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3725 TACATACAT--A--TATGTTCACAGTTTGAGATTGTGATGT 3761
> AT4G29890.1 | Symbols: | choline monooxygenase, putative (CMO-like)
| chr4:14608833-14610998 FORWARD LENGTH=1397
Length=1397
Score = 134 bits (72), Expect = 8e-30
Identities = 92/101 (91%), Gaps = 4/101 (4%)
Strand=Plus/Minus
Query 3460 AAAGAGGCTTCATTTTATGCTTGGTGCAGAGATAATAGAACTGTAGAATATTCACATAAA 3519
||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1379 AAAGAGGCTTCATTTTATGTTTGGTGCAGAGAGAGTAGAACTGTAGAATATTCACATAAA 1320
Query 3520 TACATATATGCAAATATTTTCACAGTTTGAGATTGTGATGT 3560
|||||| || | ||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1319 TACATACAT--A--TATGTTCACAGTTTGAGATTGTGATGT 1283
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 177239809619
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5