BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg492274
Length=2673
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT4G25520.1 | Symbols: SLK1 | SEUSS-like 1 | chr4:13032178-1303... 4037 0.0
AT4G25515.1 | Symbols: SLK3 | SEUSS-like 3 | chr4:13028219-1303... 2122 0.0
> AT4G25520.1 | Symbols: SLK1 | SEUSS-like 1 | chr4:13032178-13036213
REVERSE LENGTH=2722
Length=2722
Score = 4037 bits (2186), Expect = 0.0
Identities = 2546/2711 (94%), Gaps = 59/2711 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTTCTGATTTTAGGGATTTGTGCAACTCCCAAGTCGATTCCTTTGACACTTTCTGGGTTT 60
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||
Sbjct 6 TTTCTGATTTTTGGGATTTGTGCAACTCCCAAGTCGA----TTT--CAGTTTCTGGGTTT 59
Query 61 TGATTTGAGCT-GCCGATTGGATTTAAAGTTTTAGTC-TTGTTTGGATTCTGCGAGG-AC 117
||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||| ||| |
Sbjct 60 TGATTTGAGTTCGCCGATTGGATTTGAAGTTTTAGTCTTTG-TT-GATTCTGAAAGGAAG 117
Query 118 GGTTTAAAGTTTCAAGC--TT--TT---C---AT---TCC-----TTTGGACGGCTTGAT 159
||||||||||||||||| || || | || ||| |||||||||||||||
Sbjct 118 GGTTTAAAGTTTCAAGCTTTTCATTCCGCTGAATCAGTCCTTGTATTTGGACGGCTTGAT 177
Query 160 CTG-TATCTGCTCTCGT--G-AGGGCATGAACAGAACGGCGGTCTCAGGAGCTGTCGAAT 215
||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||
Sbjct 178 CTGTTATCTGCTCTCGTGGGTGGGGCATGAACAGAACGGTGGTCTCGGGAGCTGTTGAAT 237
Query 216 CGAGTTTCTCATTGACTGATGCTCTTGGTACGGAAGCTCTAAATATGCAGAGGAGCAGTG 275
||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 238 CGAGTTTCTCATTGACTGATGCTGTTGGCACGGAAGCTCTAAATATGCAGAGGAGCAGTG 297
Query 276 GCATCAATAATAATATGCGTATCCCAACATCACCAATGTCTTTCTCCTCGAATAGCGGTA 335
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 298 GCATCAATAATAATATGCGTATCCCAACATCACCGATGTCTTTCTCCTCGAATAGCGTTA 357
Query 336 ACATGCCTGGTTCATTAGTTCTTGATGG--CT-CTGCTTCAATGCAACACTTACCTcagc 392
|||| || |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 358 ACATACCGGGTTCATTGGTTCTTGATGGCTCTGCTGCTTCAATGCAACACTTACCT---C 414
Query 393 agcagcagcagcagcaACTACTACAACAGCAAGCAGGACAAGGTTCAGTTCCAATGAGGG 452
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 415 AGCAGCAGCAGCAGCAACTACTACAACAGCAAACAGGACAAGGTTCTGTTCCAATGAGGG 474
Query 453 AGAACAATTATTCCCATGTGGATAAGAAACCCAGATTAGAAGTGAAGCAAGAGGATATGT 512
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 475 AGAACAATTATTCCCATGTGGATAAGAAACCCAGATTAGAAGTGAAGCAAGAAGATATGT 534
Query 513 TGCAGCAGCAGATTTTACAGCAGTTGATCCACCGTCAGGACCCCACGGGGAGGAATCCTC 572
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 535 TGCAGCAGCAGATTTTACAGCAGTTGATCCAGCGTCAGGACCCCACGGGGAGGAATCCGC 594
Query 573 A-ATTCCAAGCTTTGCTTCAGCAGCAGAGACTCAGGCAACATCAGCAGATGCTTCAATCC 631
| | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 595 AGA-TGCAAGCTTTGCTTCAGCAGCAGAGACTGAGGCAACATCAGCAGATGCTTCAATCC 653
Query 632 ATGTCACCCTCTCAGAGACTCCAACTTCAGCAGCAGCAGCAGTTGAGACAGCAATTACAG 691
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||
Sbjct 654 ATGTCACCCTCTCAGAGACTCCAACTTCAGCAACAGCAGCAGCTGAGACAGCAGTTACAG 713
Query 692 CAACAAGGAACCCAACAGATTCCTCCTAATGTACGTCCTTATGAAGTTGGCGTGTGTGCT 751
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 714 CAACAAGGAACCCAACAGATTCCTCCTAATGTACGTCCTTATGAAGTTGGCGTCTGTGCT 773
Query 752 CGGAAATTGATGATGTACTTGTATCATCTGCAGCAACGGCCTGCTGAAAATTGCATTACC 811
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 774 CGGAAATTGATGATGTACTTGTATCATCTGCAGCAACGGCCTGCTGAAAATTGCATTACC 833
Query 812 TATTGGAGGAAATTTGTGGCAGAATACTTCTCACCTCGTGCAAAGCAAAGGTTGTGCTTG 871
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||
Sbjct 834 TATTGGAGGAAATTTGTGGCAGAATACTTTTCACCTCGTGCAAAGCAGAGATTGTGCTTG 893
Query 872 TCACAGTACGAAAGTGCTGGGCACCATGCACTTGGCATGTTTCCACAGGCAGCTCCGGAT 931
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 894 TCACAGTACGAAAGTGCTGGGCACCATGCGCTTGGCATGTTCCCACAGGCAGCTCCGGAT 953
Query 932 ATGTGGCAGTGTGATCTTTGCGGCACCAAGTCTGGAAAGGGATTTGAGGCAACGTTTGAT 991
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 954 ATGTGGCAGTGTGATCTTTGCGGCACCAAGTCTGGAAAGGGATTTGAGGCAACGTTTGAT 1013
Query 992 GTGCTTGCCAGACTTATTGAAATCAAATTTGCAAGTGGTATTATTGATGAGCTCTTATAT 1051
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1014 GTGCTTGCCAGACTAATTGAAATCAAATTTGCAAGTGGTATTATTGATGAGCTGTTATAT 1073
Query 1052 CTGGATCACCCTCGAGAAAACAGATTTCCCAATGGACTGATGATGTTAGAATATAGAAAA 1111
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1074 CTGGATCACCCTCGAGAAAACAGATTTCCCAATGGACTGATGATGTTAGAATATAGAAAA 1133
Query 1112 GCAGTTCAGGAAACTGTACACGAGCAGTTCCGTGTTGTCCGTGAAGGCCATCTTCGTATC 1171
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||
Sbjct 1134 GCAGTTCAGGAAACTGTACACGAGCAGTTTCGTGTTGTCCGTGAGGGCCATCTTCGCATC 1193
Query 1172 ATATTCTCTCAAGATCTGAAGATACTGTCTTGGGAGTTTTGTGCTCGGCGTCATGAAGAG 1231
||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1194 ATATTTTCTCAAGATTTGAAGATACTTTCTTGGGAGTTTTGCGCTCGGCGTCATGAAGAG 1253
Query 1232 CTTCTTCTTCGCAGACTTATTGCTCCGCAGGTGAACCAGTTACTTCAGGTTGCACAGAAA 1291
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct 1254 CTTCTTCTTCGCAGACTTATTGCTCCACAGGTGAACCAATTGCTTCAGGTTGCACAGAAA 1313
Query 1292 TGCCAGAGCACGATTTCAGACAGTGGGTCAGAGGGAGTTTCTCAGCAGGATTTACAGTCA 1351
|||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1314 TGCCAGAGCACGATCTCAGAGAGTGGGTCAGAGGGGGTTTCTCAGCAGGATTTACAGTCA 1373
Query 1352 AACAGTAACATGGTCTTGGGAGCTGGACGGCAACTGGCAAAGTTCATGGAATTACAGTCG 1411
|| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1374 AATAGTAACATGGTCTTGGGAGCAGGACGGCAACTGGCAAAGTTCATGGAACTACAGTCG 1433
Query 1412 CTGAATGATCTTGGCTATCCAAAAAGATATATCAGAACTCTACAGATATCTGAAGTTGTC 1471
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1434 CTGAATGATCTTGGCTATCCAAAAAGATATATCAGGACTCTGCAGATATCTGAAGTTGTC 1493
Query 1472 AAGAGCATGAAGGATCTGATGAATTTCACTGGCGAGCACAAAATCGGTCCTATTGAAGGG 1531
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct 1494 AAGAGCATGAAGGATCTGATGAATTTCACTGGCGAGCAAAAAATCGGTCCTATTGAGGGG 1553
Query 1532 TTGAAACGGCTTTTGGAACAGACGGTGACAGTGAAGATCCAGAGACAGAAAATGCAAGAG 1591
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||
Sbjct 1554 TTGAAACGGCTTTTGGAACAGACGGTGACAGTGAAGCTACAGAAACAGAAAATGCAAGAG 1613
Query 1592 ATGGAGCAGTTTGGGAATAGCGAATCTATGAATGGGCCAGCTCAAGCTCAAATGGCT-TT 1650
||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||| |||||||||||||| | ||
Sbjct 1614 ATGGAGCAGTTTGGGAATAATGGAGCTATAAATGGGCCAGTTCAAGCTCAAATGG-TGTT 1672
Query 1651 AACTTCAGGAACAG-TGAATGGCTCAACTGGCAACAACGCCAATAATAACCATCAAATTG 1709
|||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct 1673 AACTTCAGGAAC-GATGAATGGCTCAACGGGCAATAACACCAATAATCACCATCAAATTG 1731
Query 1710 TTGGTCGTGGAGCTATGAGTGGGCCAGCTCAAGCTCAAATGGCGTTATCTTCAGGTATGA 1769
||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||| | |
Sbjct 1732 TTGGTCGTGGAGCTATGAGTGGGCCAGCTGAAGGTCAAATGGTGATATCTTCAGGAACGG 1791
Query 1770 TGAGCGGTTCAACTGCCAACAACAACTCCAGTAATCACCATCAAATTGTTGGTCGTGGAG 1829
||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1792 TGAGCGGCGCAACTGCCAACAACAACTCCAATAATCACAATCAAATTGTTGGTCGTGGAG 1851
Query 1830 CTATGAATGGCTCAGCTCAAGCCGCAGCAGCTCTGACCAACTACCAAAGCATGCTTATGA 1889
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1852 CTATGAATGGCTCTGCTCAAGCCGCAGCAGCTCTGACCAACTACCAAAGCATGCTTATGA 1911
Query 1890 GGCAAAATGCTATGAATAACCCAAACTCAAATACGGGTAAACAAGAGGGGTTCTCGAGTC 1949
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1912 GGCAAAATGCTATGAATAACCCAAACTCAAATACGGGTAAACAAGAGGGGTTCTCGAGTC 1971
Query 1950 AGAACCCAACCCCGATTTCAAACCAGAGTACATCTTCTTCATCCCATCAGAGGCAGAACT 2009
||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||
Sbjct 1972 AGAACCCAACCCCAAACTCAAACCAGAGTCCATCTTCTTCATCCCAGCAGAGGCATAACT 2031
Query 2010 TAGTTACAGGTGGATTTCCCAGCTCTCCTCAAATGCAACAGCAGCAGCGCACCATGAATG 2069
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2032 TAGTTACAGGTGGATTTCCCAACTCTCCTCAAATGCAACAGCAGCAGCGCACCATGAATG 2091
Query 2070 GCCCTCCCAACATACTTCCGCAGAATCATCCTCATCAGTTGCAATCACCACAGTCACATG 2129
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||
Sbjct 2092 GCCCTACCAACATACTTCCGCAGAATCATCCTCATCAGTTACAATCACCACATTCACATG 2151
Query 2130 GTAACACTCCGGAGCAGCAGATGCTTCATCAGCTGTTGCAGGAGATGTCTGAAAATGGAG 2189
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2152 GTAACACTCCGGAGCAGCAGATGCTTCATCAGCTGTTGCAGGAGATGTCTGAAAATGGAG 2211
Query 2190 CGAGTGTGCAACAGCAACAAGCCTTTTCGGGTCAAAGTGGTAGCAACAGTAACGCAGAGA 2249
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2212 GGAGTGTGCAACAGCAACAAGCCTTTTCGGGTCAAAGTGGTAGCAACAGTAACGCAGAGA 2271
Query 2250 GAAACACAACGGCCTCTACTTCCAACATCTCAGGAGGAGGCCGAGCTCCAAGCCGAAACA 2309
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2272 GAAACACAACTGCCTCTACTTCCAACATCTCAGGAGGAGGCCGAGCTCCAAGTCGAAACA 2331
Query 2310 ACAGTTTTAAAGCAGCCTCAAACAACAACCTTCATTTTTCAGAAGATATATCGATTACAG 2369
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2332 ACAGTTTTAAAGCAGCCTCGAACAACAACCTTCATTTTTCAGAAGATATATCGATCACAG 2391
Query 2370 ACCATGATTTCTCAGAAGATGGCTTCTTCAACAACAGCGATATCTATGGTGGCTTGTAAT 2429
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2392 ACCATGATTTCTCAGAAGATGGCTTCTTCAACAACAATGATATCTATGGTGGCTTGTAAT 2451
Query 2430 AT-CCCGACAGAACAG-AGGCATTGTTACTTTGACTTAACACAGTGAAAAAGACTTTAGG 2487
|| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||
Sbjct 2452 ATTCCC-ACAGAAC-GCAGGCATTGTTACTTTGACTTAACACAGTGAAAGAGAATTTAGG 2509
Query 2488 GCTTATTTTTCTCATTTAGGCTGGTCTTTGTATAGAAACCAAAGAGATATGAGGCCGGCC 2547
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2510 GCTTATTTTTCTCATTTAGGTTGGTCTTTGTATAGAAACCAAAGAGATATGAGGCCGGCC 2569
Query 2548 AATGAAGGAATTTGTGATTTGTTGTAACCTATCTATAGGAACTTTTA-GCATCTTCAATT 2606
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||
Sbjct 2570 AATGAAGGAATTTGTGATTTGTTGTAACTTATCTATAGGAACTTTTAAGCATCTTCA-TT 2628
Query 2607 TTTTCCCTTTTAGAGATAG-ATGA--AA-TCTTAGATTATGATTCTGCAGACACTTTCAA 2662
| ||||||||||||||| | || || |||||||| | ||||||||||||||||||
Sbjct 2629 TC--CCCTTTTAGAGATAGTAAGATTAAATCTTAGATAAC--TTCTGCAGACACTTTCAA 2684
Query 2663 GTAATCTTATT 2673
|||||||||||
Sbjct 2685 GTAATCTTATT 2695
Score = 128 bits (69), Expect = 3e-28
Identities = 114/135 (84%), Gaps = 5/135 (4%)
Strand=Plus/Plus
Query 1717 TGGAGCTATGAGTGGGCCAGCTCAAGCTCAAATGGCGTTATCTTCAGGTATGATGAGCGG 1776
||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| | ||||| ||
Sbjct 1634 TGGAGCTATAAATGGGCCAGTTCAAGCTCAAATGGTGTTAACTTCAGGAACGATGAATGG 1693
Query 1777 TTCAACTGCCAACAACAACTCCAGTAATCACCATCAAATTGTTGGTCGTGGAGCTATGAA 1836
||||| | ||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1694 CTCAACGGGCAATAAC-A--CCAATAATCACCATCAAATTGTTGGTCGTGGAGCTATGAG 1750
Query 1837 TGG-CTCAGCTCAAG 1850
||| | ||||| |||
Sbjct 1751 TGGGC-CAGCTGAAG 1764
> AT4G25515.1 | Symbols: SLK3 | SEUSS-like 3 | chr4:13028219-13031799
FORWARD LENGTH=2394
Length=2394
Score = 2122 bits (1149), Expect = 0.0
Identities = 1380/1491 (93%), Gaps = 17/1491 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 260 ATGCAGAGGAGCAGTGGCATCAATAATAATATGCGTATCCCAACATCACCAATGTCTTTC 319
||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| || || ||||||||||||
Sbjct 1 ATGCAGAGGAGCAGTGGCATC---AATAATCTGCATATCCCGACTTCGCCAATGTCTTTC 57
Query 320 TCCTCGAATAGCGGTAACATGCCTGGTTCATTAGTTCTTGATGGCTCTGCTTCAATGCAA 379
|| |||||| || |||| ||||||| ||| | ||||||||||| ||| |||||||||||
Sbjct 58 TCTTCGAATGGCATTAACCTGCCTGGATCAATGGTTCTTGATGGATCTCCTTCAATGCAA 117
Query 380 CACTTACCTcagcagcagcagcagcagcaACTACTACAACAGCAAGCAGGACAAGGTTCA 439
|||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 118 CACTTACCTCAGCAGCAGCAGC-G--GCAACTACTAGAACAGCAAGCAGGACAAGGTTCA 174
Query 440 GTTCCAATGAGGGAGAACAATTATTCCCATGTGGATAAGAAACCCAGATTAGAAGTGAAG 499
|||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 175 GTTCCAATGAGGGAAAACAGTTATTCCCATGTAGATAAGAAACTGAGATTAGAAGTGAAG 234
Query 500 CAAGAGGA-TATGTTGCAGCAGCAGATTTTACAGCAGTTGATCCACCGTCAGGACCCCAC 558
||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||
Sbjct 235 CAAGAAGACT-TGTTGCAGCAGCAGATTTTACAGCAGTTGATCCAGCGCCAGGACCCCAC 293
Query 559 GGGGAGGAATCCTCA-ATTCCAAGCTTTGCTTCAGCAGCAGAGACTCAGGCAACATCAGC 617
||| || ||||| || | | |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||
Sbjct 294 GGGAAGAAATCCGCAGA-TGCAAGCTTTGCTTCAGCAGCAGAGAGTGAGGCAACATCAGC 352
Query 618 AGATGCTTCAATCCATGTCACCCTCTCAGAGACTCCAACTTCAGCAGCAGCAGCAGTTGA 677
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||
Sbjct 353 AGATGCTTCAATCCATGTCACCCTCTCAGAGACTCCAACTTCAGAAACAGCAGCAGCTGA 412
Query 678 GACAGCAATTACAGCAACAAGGAACCCAACAGATTCCTCCTAATGTACGTCCTTATGAAG 737
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 413 GACAGCAGTTACAGCAACAAGGAACCCAACAGATTTCTCCTAATGTACGTCCTTATGAAG 472
Query 738 TTGGCGTGTGTGCTCGGAAATTGATGATGTACTTGTATCATCTGCAGCAACGGCCTGCTG 797
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 473 TTGGCGTCTGTGCTCGGAAATTGATGATGTACTTGTATCATCTGCAGCAACGGCCTGCTG 532
Query 798 AAAATTGCATTACCTATTGGAGGAAATTTGTGGCAGAATACTTCTCACCTCGTGCAAAGC 857
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 533 AAAATTGCATTACTTATTGGAGGAAATTTGTGGCAGAATACTTCTCACCTCGTGCAAAGC 592
Query 858 AAAGGTTGTGCTTGTCACAGTACGAAAGTGCTGGGCACCATGCACTTGGCATGTTTCCAC 917
| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 593 AGAGGTTGTGCTTGTCACAGTACGAAAGTGTTGGGCACCATGCCCTTGGCATGTTTCCAC 652
Query 918 AGGCAGCTCCGGATATGTGGCAGTGTGATCTTTGCGGCACCAAGTCTGGAAAGGGATTTG 977
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 653 AGGCAGCTCCGGATATGTGGCAGTGTGATCTTTGCGGCACTAAGTCTGGAAAGGGATTTG 712
Query 978 AGGCAACGTTTGATGTGCTTGCCAGACTTATTGAAATCAAATTTGCAAGTGGTATTATTG 1037
|||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||
Sbjct 713 AGGCTACTTTTGATGTGCTAGCCAGACTTATTGAAATAAAATTTGCAAGTGGCATCATTG 772
Query 1038 ATGAGCTCTTATATCTGGATCACCCTCGAGAAAACAGATTTCCCAATGGACTGATGATGT 1097
|||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 773 ATGAGCTCTTATATCTTGACCACCCACGAGAAAACAGATTTCCCAATGGACTGATGATGC 832
Query 1098 TAGAATATAGAAAAGCAGTTCAGGAAACTGTACACGAGCAGTTCCGTGTTGTCCGTGAAG 1157
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |
Sbjct 833 TAGAATATAGAAAAGCAGTTCAGGAAACTGTACACGAGCAGTTTCGTGTTGTTCGTGAGG 892
Query 1158 GCCATCTTCGTATCATATTCTCTCAAGATCTGAAGATACTGTCTTGGGAGTTTTGTGCTC 1217
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 893 GCCATCTTCGTATCATATTCTCTCCAGATCTGAAGATACTGTCTTGGGAGTTTTGTGCTC 952
Query 1218 GGCGTCATGAAGAGCTTCTTCTTCGCAGACTTATTGCTCCGCAGGTGAACCAGTTACTTC 1277
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 953 GGCGTCATGAAGAGCTTCTTCTTCGCAGGCTTATTGCTCCGCAGGTGAACCAGTTGCTTC 1012
Query 1278 AGGTTGCACAGAAATGCCAGAGCACGATTTCAGACAGTGGGTCAGAGGGAGTTTCTCAGC 1337
||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||
Sbjct 1013 AGGTTGCTCAGAAATGCCAGAGCACGATTTCTGAGAGTGGTTCACAGGGAGTTTCTCAGC 1072
Query 1338 AGGATTTACAGTCAAACAGTAACATGGTCTTGGGAGCTGG-ACGGCAACTGGCAAAGTTC 1396
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||
Sbjct 1073 AGGATATACAGTCAAACAGTAACATGGTCTTGGGAGCAGGGA-GGCAGCTGGCAAAGTTC 1131
Query 1397 ATGGAATTACAGTCGCTGAATGATCTTGGCTATCCAAAAAGATATATCAGAACTCTACAG 1456
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1132 ATGGAATTACAGTCGCTCAATGATCTTGGCTATCCAAAAAGATATATCAGAACTCTACAG 1191
Query 1457 ATATCTGAAGTTGTCAAGAGCATGAAGGATCTGATGAATTTCACTGGCGAGCACAAAATC 1516
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1192 ATATCTGAAGTAGTCAAGAGCATGAAGGATCTGATGAATTTCACTGGCGAGCACAAAGTC 1251
Query 1517 GGTCCTATTGAAGGGTTGAAACGGCTTTTGGAACAGACGGTGACAGTGAAGATCCAGAGA 1576
|| ||| | || ||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||
Sbjct 1252 GGCCCTCTCGAGGGGTTAAAACAGCTTCTGGAACAGACGGCGACAGTGAAGCTTCAGAGA 1311
Query 1577 CAGAAAATGCAAGAGATGGAGCAGTTTGGGAATAGCGAATCTATGAATGGGCCAGCTCAA 1636
||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | |||| |||||||||||||
Sbjct 1312 CAGAAAATGCAAGAGATGGAGCAGTTTGGGAATAGTGGAGCAATGAGTGGGCCAGCTCAA 1371
Query 1637 GCTCAAATGGCTTTAACTTCAGGAAC-AGTGAATGGCTCAACTGGCAACAACG-C-C-AA 1692
||||||||| ||||| |||||||||| | ||| || ||||||| ||||||| | | ||
Sbjct 1372 GCTCAAATGACTTTATCTTCAGGAACGA-TGAGCGGTTCAACTGCCAACAACAACTCCAA 1430
Query 1693 TAATAACCATCAAATTGTTGGTCGTGGAGCTATGAGTGGGCCAGCTCAAGC 1743
|||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||
Sbjct 1431 TAATCACCATCAAATTGTTGGTCGTGGAGCTATGAATGGGTCACCTCAAGC 1481
Score = 1114 bits (603), Expect = 0.0
Identities = 734/798 (92%), Gaps = 6/798 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1716 GTGGAGCTATGAGTGGGCCAGCTCAAGCTCAAATGGCGTTATCTTCAGGTATGATGAGCG 1775
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||
Sbjct 1346 GTGGAGCAATGAGTGGGCCAGCTCAAGCTCAAATGACTTTATCTTCAGGAACGATGAGCG 1405
Query 1776 GTTCAACTGCCAACAACAACTCCAGTAATCACCATCAAATTGTTGGTCGTGGAGCTATGA 1835
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1406 GTTCAACTGCCAACAACAACTCCAATAATCACCATCAAATTGTTGGTCGTGGAGCTATGA 1465
Query 1836 ATGGCTCAGCTCAAGCCGCAGCAGCTCTGACCAACTACCAAAGCATGCTTATGAGGCAAA 1895
|||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1466 ATGGGTCACCTCAAGCCACAGCAGCTCTGACCAACTACCAAAGCATGCTTATAAGGCAAA 1525
Query 1896 ATGCTATGAATAACCCAAACTCAAATACGGGTAAACAAGAGGGGTTCTCGAGTCAGAACC 1955
||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1526 ATGCTATGAATAACCAAAACTCAAATACGGGCAACCAAGAGGGGTTCTCGAGTCAGAACC 1585
Query 1956 CAACCCCGATTTCAAACCAGAGTACATCTTCTTCATCCCATCAGAGGCAGAACTTAGTTA 2015
|||| | || |||||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||
Sbjct 1586 CAACGCTGAACTCAAACCAGAGTCCATCTTCTTCATCGCAGCAGAGGGAGAACTTAGCTA 1645
Query 2016 CAGGTGGATTTCCCAGCTCTCCTCAAATGCAACAGCAGCAGCGCA-CCATGAATGGCCCT 2074
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||
Sbjct 1646 CAAGTGGATTTCCCAGCTCTCCTCAAATGCAACAGCAGCAGCACATCC-TGAATGGCACT 1704
Query 2075 CCCAACATACTTCCGCAGAATCATCCTCATCAGTTGCAATCACCACAGTCACATGGTAAC 2134
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||
Sbjct 1705 CCCAACATGCTTCCGCAGAATCATCCTCATCAGTTGCAATCGCCACATTCACATGGTAAC 1764
Query 2135 ACTCCGGAGCAGCAGATGCTTCATCAGCTGTTGCAGGAGATGTCTGAAAATGGAGCGAGT 2194
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1765 ACTCAGGAGCAGCAGATGCTTCATCAGCTGTTGCAGGAGATGACTGAAAATGGAGCGAGT 1824
Query 2195 GTGCAACAGCAACAAGCCTTTTCGGGTCAAAGTGGTAGCAACAGTAACGCAGAGAGAAAC 2254
||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||
Sbjct 1825 GTGGAACAGCAACAGGCCTTTCCGGGTCAAAGTGGTAGCAATAATAACACCGAGAGAAAC 1884
Query 2255 ACAACGGCCTCTACTTCCAACATCTCAGGAGGAGGCCGAGCTCCAAGCCGAAACAACAGT 2314
||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||
Sbjct 1885 ACAACTGCCTCTACTTCCAATATCTCAGGAGGAGGCCGAGTTCCAAGCCGCATCAATAGT 1944
Query 2315 TTTAAAGCAGCCTCAAACAACAACCTTCATTTTTCAGAAGATATATCGATTACAGACCAT 2374
||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||
Sbjct 1945 TTTAAAGCATCTTCAAACAACAACCTTCCTTTTTCAGAAGATATATCGGTTACGGACCAT 2004
Query 2375 GATTTCTCAGAAGATGGCTTCTTCAACAACAGCGATATCTATGGTGGCTTGTAATATCCC 2434
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2005 GATTTCTCAGAAGATGGCTTCTTCAACAACAGTGATATCTATGGTGGCTTGTAATATCCA 2064
Query 2435 GACAGAACAGAGGCATTGTTACTTTGACTTAACACAGTGAAAAAGACTTTAGGGCTTATT 2494
||| | |||| |||||| |||||||||| |||||||||||| ||| | |||| ||||||
Sbjct 2065 AACA-A-CAGATGCATTGGTACTTTGACT-AACACAGTGAAAGAGAGTGTAGG-CTTATT 2120
Query 2495 TTTCTCATTTAGGCTGGT 2512
|||||||||||| ||||
Sbjct 2121 GTTCTCATTTAGGTTGGT 2138
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 132741731178
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5