BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg492382
Length=3668
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT4G24610.2 | Symbols: | unknown protein; FUNCTIONS IN: molecu... 3740 0.0
> AT4G24610.2 | Symbols: | unknown protein; FUNCTIONS IN: molecular_function
unknown; INVOLVED IN: biological_process unknown;
EXPRESSED IN: 20 plant structures; EXPRESSED DURING: 12
growth stages; BEST Arabidopsis thaliana protein match is:
unknown protein (TAIR:AT5G65440.1). | chr4:12700607-12708109
REVERSE LENGTH=3908
Length=3908
Score = 3740 bits (2025), Expect = 0.0
Identities = 2172/2242 (97%), Gaps = 14/2242 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1431 GGCTGAGAAACTTCGCTGGTGGTCTGTTTTTCGTGAGCCAGAACATCAACATGTGGGAAA 1490
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1665 GGCTGAGAAACTTCGCTGGTGGTCTGTTTTTCGTGAGCCAGAACATCAACATGTGGGAAA 1724
Query 1491 ACTCCAGCTCTATATTGACTATTCAGCAAGTTTTGATGATAACAGCCATTTGAAGTGTGC 1550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1725 ACTCCAGCTCTATATTGACTATTCAGCAAGTTTTGATGATAACAGCCATTTGAAGTGTGC 1784
Query 1551 TTCTGTTGCGGAAACAGTCGCATATGACCTAGTCCTGGAAGTGGCCTTGAAAATGCAGCG 1610
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1785 TTCTGTTGCGGAAACAGTCGCATATGACCTAGTCCTGGAAGTGGCCTTGAAAATGCAGCG 1844
Query 1611 GTTTCAGCAAAGAAACTTGTTGTTATATGGTTCATGGAAATGGCTTTTGGAAGAATTTGC 1670
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1845 ATTTCAGCAAAGAAACTTGTTGTTATATGGTTCATGGAAATGGCTTTTGGAAGAATTTGC 1904
Query 1671 CACCTACTATGGGATTTCAGATGTCTACACCAAGCTCAGATACTTGTCCTATGTAATGGA 1730
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1905 CACCTACTATGGGATTTCAGATGTCTACACCAAGCTCAGATACTTGTCCTATGTAATGGA 1964
Query 1731 TGTCGCTACACCGACTTCCGACTGTCTCCATTTGGTACATGACTTGTTAACACCTGTCAT 1790
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1965 TGTCGCTACACCGACTTCCGACTGTCTCCATTTGGTACATGACTTGTTAACACCTGTCAT 2024
Query 1791 AATGAAGGGAAATGGCAAGAGCGCCTTGAGTCATCAAGAGAATCGGATCTTGAATGAAAT 1850
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2025 CATGAAGGGAAATGGCAAGAGCGCCTTGAGTCATCAAGAGAATCGGATCTTGAATGAAAT 2084
Query 1851 CAAGGACCAGATCGAGCAGATTCTGAAGCTGGTCTTTGAGAACTACAAATCTCTTGACGA 1910
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2085 CAAGGACCAGATCGAGCAGATTCTAAAACTGGTCTTTGAGAATTACAAATCTCTTGACGA 2144
Query 1911 GTCATCATTTTCTGGAATGATTGATGTGGTCAGTTCTGCATCAGGGGTTCCAGCGCCAGC 1970
||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 2145 GTCGTCATTTTCTGGAATGATTGATGTGGTCAATTCTGCGTCAGGTGTTCCAGCGCCAGC 2204
Query 1971 ACTCACTCCTGCTGTTAAATTGTACACGCTTCTGCACGATGTCTTATCACCCGAGGATCA 2030
||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2205 ACTCATTCCTGCTGTGAAATTGTACACGCTTCTGCACGATGTCTTATCACCCGAGGATCA 2264
Query 2031 GACTAATCTTTGTCATTATTTTCAGGCAGCAGCAAAGAAGAGATCTAGAAGGCACATGGG 2090
|||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2265 GACTCATCTTTGTCATTATTTCCAGGCAGCAGCAAAGAAGAGATCTAGAAGGCACATGGG 2324
Query 2091 TGAGACAGATGAGTTTGTTGCAAACAATAGTGAGCCCAATTTTTGGGATACGTCTGCAAT 2150
||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2325 TGAGACAGATGAGTTTGTTGCAAACAACAGCGAGCCCAATTTTTGGGATATGTCTGCAAT 2384
Query 2151 GTCAGCTGCTTACCAGAAAATGACAATGGTCTGCCAGAATGTAAAGAATGAGATCTACAC 2210
||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2385 GTCGGCTGCATACCAGAAAATGACAATGGCCTGCAAGAATGTAAAGAATGAGATCTATAC 2444
Query 2211 TGATATTGAGATCCAAAATGAAGATATACTTCCCAGCTTTCTTGACCTTCCAAACCTGTC 2270
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2445 TGATATTGAGATCCAAAATGAAGATATACTTCCCAGCTTTCTTGACCTTCCAAACCTGTC 2504
Query 2271 AGCGTCAATATATAGCACTGATCTCTGTAATAGACTTCGAGCATTCCTCGTTGCATGTCC 2330
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||
Sbjct 2505 AGCGTCTATATATAGCACTGATCTCTGTAATAGACTTCGAGCATTTCTCGTTGCTTGTCC 2564
Query 2331 ACCCTCTGGCCCTTCACCAACAGTTGCAGAGCTTGTGATTGCTACTGCAGACTTTCAACG 2390
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2565 GCCCTCTGGCCCTTCACCAACAGTTGCAGAGCTCGTGATTGCAACTGCAGACTTTCAACG 2624
Query 2391 TGATCTTTCCAGCTGGAACATTAGTCCTATCCAAGGCGGTGTTGATGCAAAAGAGTTGTT 2450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2625 TGATCTTTCCAGCTGGAACATTAGTCCTATCCAAGGCGGTGTTGATGCAAAAGAGTTGTT 2684
Query 2451 TCATCTATATATCATGATTTGGATTCAAGATAAACGCCTTTCATTACTTGAGTCCTGCAA 2510
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2685 TCATCTATATATCATGATTTGGATTCAAGATAAACGCCTTTCATTACTTGAGTCCTGCAA 2744
Query 2511 ACTTGATAAG--GTTAAA-TGGTCTGGAGTCAGGACACAGCATTCAACAACCCCATTTGT 2567
|||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 2745 ACTTGATAAGCAGGTAAAATGGTCTGGAGTCAGGACACAGCATTCAACAACTCCATTCGT 2804
Query 2568 TGATGAAATGTACAAGAGGCTGAACGAAACCATTCAAGACTATCAAGTTATCATTTCCAG 2627
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2805 TGATGAAATGTACAAGAGGCTGAACGAAACCATTCAAGACTATCAAGTTATCATTTCCAG 2864
Query 2628 ATGGCCAGAATATATCTTTGTTCTGGAGAGTGCCATTGCTGATGTTGAAAAAGCAACTGT 2687
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 2865 ATGGCCAGAATATATCTTTGTTCTGGAGAGTGCCATTGCTGATGTTGAAAAGGCAACAGT 2924
Query 2688 GGAAGCTCTGGAGAAGCAGTATGCAGATGTCTTATCACCTCTCAAAGAAAACTTGTCTCC 2747
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2925 GGAAGCTCTGGAGAAGCAGTATGCAGATGTCTTATCACCTCTCAAAGAAAACTTGGCTCC 2984
Query 2748 aaaaaaaCTAAGCTTCAAGTATGTCCAAAAACTGACCAAAAGATCTGTGATTCCATATAT 2807
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2985 AAAAAAACTAAGCTTCAAGTATGTCCAAAAACTGACCAAAAGATCTGTGATTCCATATGT 3044
Query 2808 AGTCCCGGATGAGCTGGGCATTCTATTAAACTCCATGAAGAGGATGCTTGATGTTCTACG 2867
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3045 AGTCCCGGATGAGCTGGGCATTCTATTAAACTCCATGAAGAGGATGCTTGATGTTCTACG 3104
Query 2868 GCCTAATATAGAGGCTAAATTTAAAGCATGGTCTTCATGCATTCCTGATGGTGGGAATGC 2927
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3105 GCCTAATATAGAGGCTAAATTTAAAGCATGGTCTTCATGCATTCCTGATGGTGGGAATGC 3164
Query 2928 TGCTCCTGGTGATCGTCTTTCTGAGGTGACAGTGATGCTCAGAGCCAAGTTTCGTAGTTA 2987
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3165 AGCTCCTGGTGATCGTCTTTCTGAGGTGACAGTGATGCTCAGAGCCAAGTTTCGTAGTTA 3224
Query 2988 CCTTCAGGCTGTGGTCGAAAAGCTTGTAGAAAATAGCAAGCTACAAAAGACGACAATGTT 3047
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3225 CCTTCAGGCTGTGGTCGAAAAACTTGTAGAAAATAGCAAGCTACAAAAAACGACAATGTT 3284
Query 3048 GAAGAAGATTCTTCAGGACTCTAAAGAAAGTGTTGGAGAATCAGACATCAGAAGCAAAAT 3107
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3285 GAAGAAGATTCTTCAGGACTCTAAAGAAAGTGTTGGAGAATCAGACATCAGAAGCAAAAT 3344
Query 3108 GAATAACCTCAAGGAGCAGCTCACCAACACAGTGAATCATCTACACTCGGTTTGTGAGAT 3167
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3345 GAATAACCTCAAGGAGCAGCTCACCAACACAGTGAATCATCTACACTCGGTTTGTGAGAC 3404
Query 3168 GCATGTCTTCATCGCATTGTCTCGAGGATATTGGGATCGTATGGGGCAGGTAACTATTGT 3227
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | | | ||
Sbjct 3405 GCATGTCTTCATCGCATTGTCTAGAGGATATTGGGATCGTATGGGACAG--A--T-T-GT 3458
Query 3228 TTTAAGCTTTTTGGAGAACAGGAAAGAGAATAGAGCTTGGTACAAGGGTTCTAGAGTTGC 3287
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3459 TTTAAGCTTTTTGGAGAACAGGAAAGAGAACAGAGCTTGGTACAAGGGTTCTAGAGTTGC 3518
Query 3288 TGTCTCGATATTAGACGATACATTTGCAGCACAGATGCAACAGCTGCTTGGCAACTCGTT 3347
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3519 TGTCTCGATATTAGACGATACATTTGCAGCACAGATGCAACAGCTGCTTGGCAACTCGCT 3578
Query 3348 AAGAGAGCAAGACCTGGAGCCTCCTAGATCGATCATGGAGGTTCGGTCGATTCTTTGCAA 3407
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3579 AAGAGAGCAAGACCTGGAGCCTCCGAGATCGATCATGGAGGTCCGGTCGATTCTTTGCAA 3638
Query 3408 GGACACTGCAGATAATAAAGCCAAGTCGTTCTACTACTGAGCATCTTAACAGCTAAAAAT 3467
|||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3639 GGACCCTGCAGATAATAAAGCCAAATCGTTCTACTACTGAGCACCTTAACAGCTAAAAAT 3698
Query 3468 GCTTGAAAGATTTCAGATCTCATTTGCTCGTCTGCTTGAAGCTGCAAGTATTTTTACTGG 3527
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |
Sbjct 3699 GCTTGAAAGATTTCAGATCTCATTTGCTCGTCTGCTTGAAGCTTCAAGTATTTT-ACTTG 3757
Query 3528 GTGGAGCAAATCGACGAAACCTTGAGAAAGCTTTAGATGTATAATAAAGTACAATGGTTA 3587
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||
Sbjct 3758 GTGGAGCAAATCGTGGAAACCTTGAGAAAGCTTTAGATGTATAAGAAAGTACAATGGGTA 3817
Query 3588 CCACATCTTTCTTTAGTGCTAATGAA-TCTCAATATATTACAACAAGACTGGCATCACAT 3646
||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3818 CCACATCTTTCTTTAGTGCTAATCAAATGTCAATATATTACAA---GACTGGCATCACAT 3874
Query 3647 CTGATACGAATTGTGATAAGAG 3668
|||||||||||||| |||||||
Sbjct 3875 CTGATACGAATTGTAATAAGAG 3896
Score = 1729 bits (936), Expect = 0.0
Identities = 978/999 (98%), Gaps = 0/999 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 397 CAGGAGTTTGATGAGACGTTTTCTTCTGAAGAAGTAAGCGATATTCCCAGTGCCCCTCCA 456
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CAGGAGTTTGATGAGACGTTTTCTTCTGAAGAAGTAAGCGATATTCCCAGTGCCCCTCCA 726
Query 457 TTTTCCGGGGCAGCAGAGGAATCTGAAGAAATTAAACCAGCAACTTCAAGCGTTCAAGTT 516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 727 TTTTCCGGGGCAGCAGAGGAATCTGAAGAAATTAAACCAGCAACTTCAAGCGTTCAAGTT 786
Query 517 TCAGAAGTCAAAACAGAAGATTGTGTAGAAAGTAGAAAGACTGGCCACTTTACTAGACCT 576
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 787 TCAGAAGTCAAAACAGGAGATTGTGTAGAAAGTAGAAAGACTGGCCACTTTACTAGACCT 846
Query 577 AGTGCAGCTTCTGAGTCATCTGGGCCACCTGATCAACATCCAGCTCGGCTTCCAACTTTT 636
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 847 AGTGCAGCTTCTGAGTCATCTGGGCCACCTGATCAACATCCAGCTCGGCTTCCTACTTTT 906
Query 637 CATGCAAGTTCTCGTGGGCCATGGCATGCCGTGGTTTCCTATGATGCATGTGTACGACTT 696
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 907 CATGCAAGTTCTCGTGGGCCATGGCATGCTGTGGTTTCCTATGATGCATGTGTACGACTT 966
Query 697 TGTCTGCATGCATGGTCAACGGGTTGCATGGAGGCTCCCATGTTTTTGGAAAATGAGTGT 756
||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 967 TGTCTGCATGCGTGGTCAACCGGTTGCATGGAGGCTCCCATGTTTTTGGAAAATGAGTGT 1026
Query 757 GCTCTTCTACGAGAAGCATTTGGGTTGCAGCAACTCCTTTTGCAATCGGAGGAGGAGATT 816
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||
Sbjct 1027 GCTCTTCTACGAGAAGCATTTGGGTTGCAGCAACTCCTTTTGCAATCAGAGGAAGAGCTT 1086
Query 817 CTGGCAAAGCGATCTTCACAAGCTCCGCACGAAGGAGTTGCACCAAAATCCAAGAAAAAC 876
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1087 CTGGCAAAGCGATCTTCACAAGCTCCGCACGAAGGAGTTGCACCAAAACCCAAGAAAAAC 1146
Query 877 ATTGGCAAAATGAAGGTGCAAGTACGACGTGTTAAAACAGTTATGGATGGTCCAACTGGC 936
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1147 ATTGGCAAAATGAAGGTGCAAGTACGACGTGTTAAAACAGTTATGGATGGTCCAACCGGC 1206
Query 937 TGTAGTATATCATCTTTGAAGCCATCATTGATAAAGTTTGAGAAAATCCGGATTCACTTT 996
|||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1207 TGTAGTATATCATCTTTGAAACCATCGTTGATAAAGTTTGAGAAAATCCGGATTCACTTT 1266
Query 997 TCCAATATGTCAACACGCTTATTTTCTGGATGGCGGGCTCTAAGGAAGATCCATGTCCGT 1056
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1267 TCCAATATGTCAACACGCTTATTTTCTGGATGGCGGGCTCTAAGGAAGATCCATGTCCGT 1326
Query 1057 GTACCAGCCAATGGCTCTTCTCTTCCTCGTCAAAGTCTGGCATATGTACATGCCAGTACA 1116
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1327 GTACCAGCCAATGGTTCTTCTCTTCCTCGTCAAAGTCTGGCATATGTTCATGCCAGTACA 1386
Query 1117 CAGTACTTAAAACAAGTTTCTGGTCTCCTGAAAACTGGTGTCACAAGTCTACGTAATAAT 1176
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1387 CAGTACTTAAAACAAGTTTCTGGTCTCCTGAAAACCGGTGTCACAAGTCTACGTAATAAT 1446
Query 1177 TCAACGTCTTATGATGTTGTACAAGAAACATACTCTTGTAAGTTAAGATTGAAAAGCTTA 1236
||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1447 TCAACATCTTATGATATTGTACAAGAAACATACTCGTGTAAGTTAAGATTGAAAAGCTTA 1506
Query 1237 GCTGAAGATGACGCCATTATGATGCAACCCGGATCTGGTGAAAGCCATGTTTTCTTTCCT 1296
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1507 GCTGAAGATAACGCCATTATGATGCAACCCGGATCTGGTGAAAGCCATGTTTTCTTTCCT 1566
Query 1297 GATAGTCATGGAGATGATCTGATTGTTGAGATCCTTGATCCAATGGGGAAGGATTTTGGG 1356
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1567 GATAGTCATGGAGATGATCTGATTGTTGAGATCCTGGATCCAATGGGGAAGGATTTTGGG 1626
Query 1357 CGTGTGCTTGTGCAACTAGCTAATATTTCTGAAGATTCG 1395
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1627 CGTGTACTTGTGCAACTAGCTAATATTTCTGAAGATTCG 1665
Score = 619 bits (335), Expect = 5e-176
Identities = 379/400 (95%), Gaps = 3/400 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGATCCCCAACGGAGAATTGAGATTGCCAGCTCCCAAGGTCCGTGATGGCCGCGTGTCT 60
|||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| | |||||||||
Sbjct 211 ATGATCCCCAACGGAGAATTGAGATTACCTGCTCTCAAGGTCCGTGAAGACCGCGTGTCA 270
Query 61 CCCTCAGCTCCTATTCCGGTCACCAGAACCCTCGTGGCCGATACTGACGCCACTTCCGAT 120
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||
Sbjct 271 CCCTCAGCTCCTATTCCGGTCACCAGAACCCTAGTGGCTGATACTGACGTCACTTCCGAT 330
Query 121 GACGACGATATGAGTACAAATTCCGAGGATGTCTCTCTCGATTCGTCTCCCGAGAACAGT 180
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 331 ---GACGATATGAGTACAAATTCCGAGGATGTCTCTCTCGATTCGTCTCCCGAGAACAGT 387
Query 181 AGAGTGTCCAGTGCCGTTGGTCGCAGCTACGGAAGAAATTCTTCTTATTATACATACTCC 240
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 388 AGAGTGTCCAGTGCCGTTGGTCGCAGCTACGGGAGAAATTCTTCTTATTATACTTACTCC 447
Query 241 GAGGTGAGCTCATCAAGAGAGACTTTGGTCGGTGCACGCGAACAGACGGGACCTAGATTT 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 448 GAGGTGAGCTCATCAAGAGAGACTTTGGTCGGTGCGCGCGAACAGACGGGACCTAGATTT 507
Query 301 GATGGTGATACGGAGGAGGATGAATCCACCGATTCAGCTTCTAGCTCGCAATTTTCTCCG 360
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 508 GATGGTGATACGGAGGAAGATGAATCCACCGATTCAGCTTCTAGCACGCAATTTTCTCCG 567
Query 361 CCGCCGGCAGCTGGAAGGATTAATGGCGGCGTACCTCAGG 400
|||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||
Sbjct 568 CCGCCGGCAGCTGGGAGGATTAACGACGGCGTATCTCAGG 607
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 182657839463
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5