BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg492401
Length=3995
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT4G24450.1 | Symbols: GWD3, PWD, ATGWD2 | phosphoglucan, water... 6119 0.0
> AT4G24450.1 | Symbols: GWD3, PWD, ATGWD2 | phosphoglucan, water
dikinase | chr4:12635426-12642797 FORWARD LENGTH=4150
Length=4150
Score = 6119 bits (3313), Expect = 0.0
Identities = 3793/4017 (94%), Gaps = 64/4017 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TAATTGATGCTGTTTACAAGAAG--tttt-tttGATGCAGGAAACTACCTGTGTATAATT 57
||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||| | |||
Sbjct 15 TAATTGATGCTGTTTACAAAAAGTTTTTTCTTTGATGCAGGAAACTACTTGTGTGT-ATT 73
Query 58 TTGAAGAGCTTCTGTAGATTTGCTACG-TTAA-G-AT------AGCT-AA-------AAG 100
||||||||||||| |||||||| |||| |||| | || |||| || |||
Sbjct 74 TTGAAGAGCTTCTATAGATTTGATACGTTTAACGCATAAAAACAGCTCAAGTTTGTGAAG 133
Query 101 TGGAACAAGCTGCCATGGCAACCTCTAAAGCCCAACAATTCCAGCTAATTGAAGGGATGG 160
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 134 TGGAACAAGCTGCCATGGCAACCTCTAAATCCCAACAATTCCAGCTAATTGAAGGGATGG 193
Query 161 AGCTTCAGATCACTGTCACTGGGTTGCCGAATGGGAGCAGTGTAAGTGCTGAGTTTCACC 220
||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 194 AGCTTCAGATCACCGTCACTGGATTGCCGAATGGGAGCAGTGTAAGAGCTGAGTTTCACC 253
Query 221 TTAAGAACTGCACTCGCACATGGATTCTTCATTGGGGTTGTATTTACCAAGGAAATAACA 280
| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 254 TGAAGAACTGCACTCGCGCATGGATTCTTCATTGGGGTTGTATTTACCAAGGAAATAACC 313
Query 281 ACTGGTTTGTCCCATCTGAACATTCCTCGAAGCAAGGTGCATTGCAGACTCCCTTTGTGA 340
| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 314 ATTGGTATATCCCATCTGAACATTCCTCGAAGCAAGGTGCATTGCAGACTACCTTTGTGA 373
Query 341 AGAGTGGGAATGCTTATGTAGTGATCCTTGAGTTGCGTGATCCAAGAGTACGTGCCGTTG 400
|||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||
Sbjct 374 AGAGTGGGGATGCATATGTAGTGATCCTTGAGTTGCGGGATCCAAGGGTACGCGCAATTG 433
Query 401 AATTTGTTTTGAAAGATGGTAGTCACAACAGATGGTTGAAACAGCATAATGGAAACTTCC 460
|||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 434 AATTTGTTTTGAAAGATGGTAGCCATAACAGATGGTTGAGACAGCATAATGGAAACTTCC 493
Query 461 GTGTTGAGATTCCCTGGAATGATCTGCATGTTCATCATCAGATACCGAAGAATCTGATAG 520
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||
Sbjct 494 GTGTTGAGATTCCCTGGAATGATCTGCATGCTCATCATCGGATACCGAAGACTCTGATAG 553
Query 521 AAAGAAGAGCACATAAGATATGGGACCGGAAGGGCCGACCACAAAGCTCTGCACGTGAAC 580
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 554 AAAGAAGAGCACATAAGATATGGGACCGGAAGGGACGACCACAAAGCTCTGCACGTGAAC 613
Query 581 AACAGATAGACTATGACAATGCAGTAAGAGAGCTCCAAACCGAGCTCGCTAGAGGAATAT 640
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 614 AACAGATAGACTATGACAATGCAGTAAGAGAGCTCCACGCCGAGCTCGCTAGAGGAATAT 673
Query 641 CTTTAGACGACCTTCAGGCTAACTCTACAGTACCAGTGGAGAAAGAAGTAACCAGTGAGC 700
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 674 CTTTAGACGAACTTCAGGCTAACTCTACAGTACCAGTGGAGAAAGAAGAAACCAGTGAGC 733
Query 701 CACATCAAACTATGAACAACCAATCATATCGTCGTAAGCATGATGTTCAGAAATGGTTAC 760
||||||| || ||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 734 CACATCACACAATG---ATCCAATCATATCGCCGGAAGCATGATGTTCAGAAATGGTTAC 790
Query 761 AGAAATATGCCGAACCAATCAACAGAAATGGAAGTGTTCAAAGTTCAACTCTTGTTGAAC 820
|||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||| ||||
Sbjct 791 AGAAATATACGGAACCAATCAACAGAAGTGGAAGTGTGAAAAGTTCAGCCCTTGCAGAAC 850
Query 821 TTTCCAAGAGATCTGTAGGCCAAGAAAATGTAATTTCACAAAAAAGCTTTCATGTCAGAA 880
| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 851 TCTCCAAGAGATCTGTGGGCCAAGAAAATCTAGTTTCACAGAAAAGCTTTCATGTCAGAA 910
Query 881 ACTACGAAATCACGGTCCTCCAGAGGAATGTTAAGGGAGGTTGTCGCTTATGGGTTGCCA 940
||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||
Sbjct 911 ACTACGAGATCACGGTCCTCCAAAGGGATGTTAAGGGAGATTGTCGCTTATGGATTGCCA 970
Query 941 CAAACATGGCAGGTCCAACAGTTCTCCATTGGGGAGTCGCAAAGTCATCTGCAGGAGAGT 1000
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 971 CGAACATGGCAGGTCCAACAGTTCTCCATTGGGGAGTCGCAAAGTCATCTGCAGGAGAGT 1030
Query 1001 GGTTGATTCCACCACCTGATGTGTTACCTGAGAAATCAAAATTTGTTCACGGAGCATGTC 1060
||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1031 GGTTGATACCACCACCTGACGTGTTACCTGAGAAATCAAAATTTGTTCACGGAGCATGTC 1090
Query 1061 AAACACATTTTACCGATATGTCGAGCAGAGAACACTATTATCAGTTTATTGATATAAATT 1120
||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1091 AAACACAATTTACCGATATGTCGAGCAGAGAACACTCTTATCAGTTTATTGATATAAATT 1150
Query 1121 TAAAACGAGGCGGTTTTGTTGGTATCCAATTTGTAATATGGTCTGGAGGCTACTGGTTAA 1180
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |
Sbjct 1151 TAAAACGAGGTGGTTTTGTTGGTATCCAATTTGTAATATGGTCGGGAGGCTACTGGGTGA 1210
Query 1181 ACAATAATGGAGCCAACTTCATTGTAAACCTGAAATCAGCAGACAGTACTAGTGATAAGC 1240
||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||
Sbjct 1211 ACAATAACGGAGCCAACTTCGTTGTAAACCTGAAGTCAGCAGACAGTACCAGTGGTAAGC 1270
Query 1241 TTGACGTGGATGGAAAGTATATTCTCAAATGGTTACTTGATGAAATATCTGAGCGAGAGA 1300
|||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1271 TTGACGTGGATGAAAAGTATGTTCTCAAATGGTTACTTGATGAAATATCTGAGCGAGAGA 1330
Query 1301 TAGAGGCTGAGAGATCATTGATGCACAGGTTCAACATTGCAACAGAGTTGACCGACCGTT 1360
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1331 AAGAGGCTGAGAGATCATTGATGCACAGGTTCAACATTGCAACAGAGTTGACCGAGCGTT 1390
Query 1361 GTAAGGATGAAGGAGAAGGTGGATGTATTGGTATAATGGTGTGGATGAGATTCATGGCCA 1420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1391 GTAAGGATGAAGGAGAAGGTGGATGTATTGGTATAATGGTGTGGATGAGATTCATGGCCA 1450
Query 1421 CCAGACATCTAACCTGGAATAAGAACTATAATGTGAAACCTCGGGAAATTAGTGAAGCGT 1480
|||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1451 CCAGACATCTCACCTGGAATAAGAACTATAACGTGAAACCTCGGGAAATTAGTGAAGCAC 1510
Query 1481 TAGAAAGATTCACCAATTTGATGGAGAAAATATATTTGCAGCAACCAAATAAGAGAGAAA 1540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1511 TAGAAAGATTCACCAATTTGATGGAGAAAATATATTTGCAGCAACCAAATAAGAGAGAAA 1570
Query 1541 TTGTGAGACTAACTATGGCACTTGTGGGTCGTGGAGGTCAAGGTGATGTTGGGCAGAGAA 1600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1571 TTGTGAGACTAACTATGGCACTTGTGGGTCGTGGAGGTCAAGGTGATGTTGGGCAGAGAA 1630
Query 1601 TCCGTGACGAAATCCTTGTTATTCAGAGAAATAACCACTGCAAATCCGGCATGATGGAAG 1660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1631 TCCGTGACGAAATCCTTGTTATTCAGAGAAATAACCACTGCAAATCCGGCATGATGGAAG 1690
Query 1661 AGTGGCACCAAAAGTTGCACAACAACAGTAGCGCAGATGATGTGATAATTTGTGAGGCTC 1720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1691 AGTGGCACCAAAAGTTGCACAACAACAGTAGCGCAGATGATGTGATAATTTGTGAGGCTC 1750
Query 1721 TCTTAAACTATGTGAGATCTGACTTTAGGATCGATGCCTACTGGCAAACACTAAAGACCA 1780
|||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1751 TCTTGAACTATGTGAGATCTGACTTCAGGATCGATGCATACTGGCAAACACTACAGACCA 1810
Query 1781 ATGGTATCACAAAAGAAAGGCTTGCAAGTTATGACCGCCCCATAGTATCAGAACCTCGTT 1840
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1811 ATGGTCTCACAAAAGAAAGGCTTGCAAGTTATGACCGCCCCATAGTATCAGAGCCTCGTT 1870
Query 1841 TCAGAAGTGATGCTAAAGAAGGACTCATCCGTGACCTTACAATGTACTTGAAAACATTAA 1900
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1871 TCAGAAGTGATTCTAAAGAAGGACTCATCCGTGACCTTACAATGTACTTGAAAACATTAA 1930
Query 1901 AGGCAGTTCATTCAGGTGCAGACCTTGAGTCTGCTATTGATACGTTCCTTTCTCCATCTA 1960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1931 AGGCAGTTCATTCAGGTGCAGACCTTGAGTCTGCTATTGATACGTTCCTTTCTCCATCTA 1990
Query 1961 AGGGTCATCATGTCTTTGCTGTCAATGGTTTATCACCAAAATTTCAGGATCTACTGAATT 2020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1991 AGGGTCATCATGTCTTTGCTGTCAATGGTTTATCACCAAAATTGCAGGATCTACTGAATT 2050
Query 2021 TAATTAAGAGGCTTGTTCGCGAAGAGAACACTGAGTCCCTAATAGAGAAGTTAGTTGATG 2080
|| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2051 TAGTTAAGAGGCTTGTTCGCGAAGAGAACACTGAGCCCCTAATAGAGAAGTTAGTTGATG 2110
Query 2081 CTCGCATTCAGTTACACCCTGCACTACGAGCACCTCGTACGAGGGCAAAAGATTTACTAT 2140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2111 CTCGCATTCAGTTACACCCTGCACTACGAGCACCTCGCACGAGGGCAAAAGATTTACTAT 2170
Query 2141 TTCTGGACATTGCGTTGGAGTCGTGTTTTAAAACAACAATAGAGAAGAGACTCATCTCTT 2200
|| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2171 TTTTGGACATTGCGTTGGAGTCATGTTTTAAAACAACAATAGAGAAGAGACTCATCTCTT 2230
Query 2201 TAAACTTCAATAACCCACCGGAAATTATATTTGTCATCTGCGTGGTGCTTGAGAATCTGT 2260
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2231 TAAACTTCAATAACCCACCGGAAATTATATATGTCATCTGCGTGGTGCTTGAGAATCTGT 2290
Query 2261 GCTTATCTACAGTTAACAATGAAGAAATCATCTTCT-TAAATTTTATTCTCTTTTGCGTC 2319
||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || | |
Sbjct 2291 GCTTATCTATAGTTAACAATGAAGAAATCATATTCTGTACA----A-------------- 2332
Query 2320 CAGGATTGGTACCGTATCAGTGAGGCTTACAAACCTCATGATGTTCAGTGGGCATTGCAA 2379
|||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2333 -AGGATTGGTACCGTGTCAGCGAGGCTTACAGACCTCATGATGTTCAGTGGGCATTGCAA 2391
Query 2380 ACAAAAGCGGTTCTTGACCGTTTACAACTAGTACTTGCTGATAGATGTCAGCATTATTTT 2439
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2392 ACAAAAGCGGTCCTTGACCGTTTACAACTAGTACTTGCTGATAGATGTCAGCATTATTTT 2451
Query 2440 ACATTAATACAGCCTTCTGCAAGATATCTTGGTCGACTGTTACGTATTGACAAGCATGGG 2499
||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2452 ACAATAATACAGCCTACTGCAAAATATCTTGGTCAACTGTTACGTGTTGACAAGCATGGG 2511
Query 2500 ATTGATGTTTTCACTGAAGAGGTTATAAGATCAGGGCCAGGAGCCGTTCTATCAACTCTT 2559
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2512 ATTGATGTTTTCACTGAAGAGGTTATAAGAGCAGGGCCAGGAGCCGTTTTATCAACTCTT 2571
Query 2560 ATGAACAGATTTGATCCTTCTCTCAGGAAAATCGCGAATTTAGGCTGTTGGCAGGTTATC 2619
| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2572 GTAAACAGATTTGATCCTTCTCTAAGGAAAATCGCGAATTTAGGCTGTTGGCAGGTTATC 2631
Query 2620 AGCTCGGCTGATGCATATGGGTTTTTGGTTTGTGTCAATGAGTTAATAGTTGTTCAGAAT 2679
|||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2632 AGCTCGGCTGATGCATATGGGTTTGTGGTTTGTGTGAATGAGTTAATTGTTGTTCAGAAC 2691
Query 2680 AAAGTCTACTCGAAGCCAACTGTAATTATTGCAAGTAAAGTCACAGGAGAAGAGGAGATC 2739
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2692 AAATTCTACTCGAAGCCAACTGTAATTATTGCAAGTAAAGTCACAGGAGAAGAGGAGATC 2751
Query 2740 CCTGCTGGTGTTGTAGCTGTGCTGACTCCTAGTATGATTGATGTCTTGTCTCATGTCTCT 2799
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2752 CCTGCTGGTGTTGTAGCCGTGCTGACTCCTAGTATGATTGATGTCTTGTCTCATGTATCT 2811
Query 2800 ATTAGAGCAAGAAACAGCAAGGCATTTCTTCTGATGCAGATATGCTTTGCTACATGCTTC 2859
||||||||||||||||||||| || |||| | | | ||||||||||||
Sbjct 2812 ATTAGAGCAAGAAACAGCAAG--AT--------ATGC---T-T--T--GCTACATGCTTC 2853
Query 2860 GATCAGAATGTTCTCAGAAATCTGAGGTCGAAGGAAGGGAGAGCAATATCTATTCATACA 2919
||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2854 GATCAGAATGTTCTCAGCAATCTGAAGTCGAAGGAAGGGAGAGCAATATCTATTCATACA 2913
Query 2920 AAGTCTACTGGTTTAGTTATCAGTGATGGCAACAACTCTGATGTCTAC-GTTCGTCATGT 2978
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |
Sbjct 2914 AAGTCTACTGGTTTAGTTATCAGTGATGGCAACAACTCTGATGTCT-CTGTTCGTCATAT 2972
Query 2979 TTATATTTCCTCTGTTCCACGGGGAGTGATCTCCAAGGGGAAGAAGTTTTGTGGCCAATA 3038
|| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2973 TTTTATTTCCTCTGTTCCACGGGGAGTGATCTCTAAGGGGAAGAAGTTTTGTGGCCACTA 3032
Query 3039 TGTGATTTCAGCTAAGGAATTTACCGATGAAAGGGTCGGTTCAAAATCATACAATATCAA 3098
|||||||||| |||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||
Sbjct 3033 TGTGATTTCATCTAAGGAATTCACTGATGAAAGGGTTGGCTCAAAATCATACAATATAAA 3092
Query 3099 ATTTCTACGAGAAAGAGTTCCATCATGGATCAAGATACCTACCTCAGCTGCTCTTCCATT 3158
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3093 ATTTCTACGTGAAAGAGTTCCATCATGGATCAAGATACCTACCTCAGCTGCTCTTCCATT 3152
Query 3159 CGGAACATTTGAGAATGTACTCTCAGATGATTCCAACAAGGAAGTAGCACGCAGGATTTC 3218
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3153 CGGAACATTTGAGAATATACTCTCAGATGATTCCAATAAGGATGTAGCACGCAGGATTTC 3212
Query 3219 TACCCTTAAAGATTCTCTTAACAGAGGAGACCTGACAAAACTTAAGGCGATTCAAGAAGC 3278
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||
Sbjct 3213 TGTCCTTAAAGATTCTCTTAACAGAGGAGACCTGACAAAACTTAAGTCCATTCAAGAAGC 3272
Query 3279 TATATTACAAATGTGTGCTCCAATGGCTCTGAGAAATGAACTGATGACAAAATTGAGAAG 3338
||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3273 TATCTTACAAATGAGTGCTCCAATGGCTCTGAGAAATGAACTGATCACAAAATTGAGAAG 3332
Query 3339 TGAAAGAATGCCTTATCTTGGGGATGAATCAGGCTGGAACCAATCCTGGGTGGCAATTAA 3398
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3333 TGAAAGAATGCCTTATCTTGGTGATGAATCAGGCTGGAACCGCTCCTGGGTGGCAATTAA 3392
Query 3399 GAAGGTCTGGGCTTCAAAGTGGAACGAGAGAGCTTATGTCAGTTGCaaaaaaaCTAAGCT 3458
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3393 GAAGGTCTGGGCTTCAAAGTGGAACGAGAGAGCTTATGTCAGTTGCAAAAAAAATAAGCT 3452
Query 3459 TGATCATGATGAGGTCTGCATGGCGGTGCTGATTCAAGAAGTCATATGTGGCGATTATGC 3518
||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3453 TGATCATGATGCGGTCTGCATGGCTGTGCTGATTCAAGAAGTCATTTGTGGCGATTATGC 3512
Query 3519 TTTCGTCATTCACACAAACAATCCGGTCTCTGGTGATTCTTCAGAAATATACACAGAGAT 3578
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3513 TTTCGTCATTCACACAAACAATCCGGTCTCTGGTGACTCTTCAGAAATATACACAGAGAT 3572
Query 3579 TGTGAAGGGTTTGGGAGAGACCTTGGTTGGAGCATATCCTGGACGAGCAATGAGCTTCAT 3638
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3573 TGTGAAGGGTTTGGGAGAGACCTTGGTTGGAGCATATCCAGGACGAGCAATGAGCTTCAT 3632
Query 3639 CACCAAGAAAACAAACCTCAAGTCTCCAACGGTGATCAGTTACCCAAGTAAGAGGATAGG 3698
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3633 CACCAAGAAAACAAACCTCAAGTCTCCAACCGTGATCAGTTACCCAAGTAAGAGGATAGG 3692
Query 3699 TCTGTATTCTAAACCCTCAATCATATTCCGATCAGATTCAAACAACGAGGATCTTGAAGG 3758
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3693 TCTGTATTCTAAACCCTCAATCATATTCAGATCAGATTCAAACAACGAGGATCTCGAAGG 3752
Query 3759 CAACGCAGGAGCTGGACTTTACGACAGTGTGATAATGGATGAAGCAGAGGAAGTTGTGGT 3818
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3753 CAACGCAGGCGCTGGACTTTACGACAGTGTGATAATGGATGAAGCAGAGGAAGTAGTGGT 3812
Query 3819 GGACTACTCAAGGGAGCCGCTAATAATGGACAAATCCTTTCAAGTGCGTCTATTCTCAGC 3878
||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3813 GGATTACTCAAGGGAGCCACTAATAATGGACAAATCCTTTCGAGTGCGTCTATTCTCAGC 3872
Query 3879 GATTGCAGAAGCTGGAAATGTGATAGAGACACTCTATGGTTGTCCTCAAGACATTGAAGG 3938
|||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3873 GATTGCAGAAGCTGGAAATGTGATAGAGTCAATCTATGGTTGTCCTCAAGACATTGAAGG 3932
Query 3939 TGTTGTCAAAGGTGGACATATCTACATCGTCCAAGCTAGACCCCAAGTTTAAGCTCT 3995
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3933 TGTTGTCAAAGGTGGACATATCTACATCGTCCAAGCTAGACCCCAAGTTTAAGCTCT 3989
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 199062429824
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5