BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg492423
Length=2340
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT4G24280.1 | Symbols: cpHsc70-1 | chloroplast heat shock prote... 3742 0.0
AT5G49910.1 | Symbols: CPHSC70-2EAT SHOCK PROTEIN 70-2, HSC70-7... 2170 0.0
> AT4G24280.1 | Symbols: cpHsc70-1 | chloroplast heat shock protein
70-1 | chr4:12589988-12593630 FORWARD LENGTH=2456
Length=2456
Score = 3742 bits (2026), Expect = 0.0
Identities = 2251/2358 (95%), Gaps = 21/2358 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAAAATGGCATCTTCCGCCGCCCAAATTCACGTCCTTGGCGGAATTGGATTCGCTTCTT 60
|||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||
Sbjct 102 GAAAAATGGCATCTTCAGCCGCCCAAATCCACGTTCTCGGCGGAATTGGATTCGCTTCTT 161
Query 61 CTTCTTCTTCCAAGAGAAATCTTAATGGTAAAGGCGGTACCTTTATGCCGAGAAGTGCCT 120
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 162 CTTCTTCTTCCAAGAGAAATCTCAATGGTAAAGGCGGTACCTTTATGCCGAGAAGTGCCT 221
Query 121 TCTTCGGTACAAGAACCGGTCCTTTCTCAACACCCACTTCTGCTTTTCTCAGAATGGGCA 180
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 222 TCTTCGGTACAAGAACCGGTCCTTTCTCCACACCCACTTCTGCTTTTCTCAGAATGGGCA 281
Query 181 CCAGAAATGGCGGCGGCGCTTCTAGATACGCGGTTGGTCCGGTTCGTGTGGTTAACGAGA 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 282 CCAGAAATGGCGGCGGCGCTTCTAGATACGCGGTTGGTCCGGTTCGTGTGGTTAACGAGA 341
Query 241 AGGTTGTTGGAATTGATTTGGGTACGACTAACTCCGCCGTTGCTGCTATGGAAGGAGGTA 300
|||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||
Sbjct 342 AGGTTGTTGGAATTGATTTGGGTACGACTAACTCTGCAGTAGCTGCTATGGAAGGAGGTA 401
Query 301 AGCCTACGATTGTTACTAACGCTGAAGGTCAGAGGACGACGCCGTCTGTGGTGGCTTACA 360
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||
Sbjct 402 AGCCTACGATTGTGACTAACGCTGAAGGTCAGAGGACAACGCCTTCTGTTGTGGCTTACA 461
Query 361 CGAAGAGTGGTGATAGGCTTGTTGGGCAGATTGCGAAGAGGCAAGCTGTTGTTAATCCCG 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 462 CGAAGAGTGGTGATAGGCTTGTTGGGCAGATTGCGAAGAGGCAAGCTGTTGTTAATCCCG 521
Query 421 AGAATACTTTCTTCTCCGTGAAGAGGTTTATTGGTAGGAAGATGAATGAGGTTGCTGAGG 480
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |
Sbjct 522 AGAATACTTTCTTCTCAGTGAAGAGGTTTATTGGTAGGAAGATGAACGAGGTTGATGAAG 581
Query 481 AGTCTAAGCAGGTTTCTTATAGAGTTGTTAGAGATGAGAACGGGAATGTTAAGTTTGAGT 540
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||
Sbjct 582 AGTCTAAGCAGGTTTCTTACAGAGTTGTTAGAGATGAGAACAATAATGTTAAGCTTGAGT 641
Query 541 GTCCTGCCATTAACAAACAATTTGCTGCTGAGGAGATTTCAGCTCAGGTTTTGAGGAAAC 600
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||
Sbjct 642 GTCCTGCCATTAACAAACAATTTGCTGCTGAGGAGATTTCAGCTCAGGTTCTAAGGAAAC 701
Query 601 TTGTGGATGATGCCTCAAGATTCTTGAACGACAAAGTAACCAAGGCTGTCATTACTGTGC 660
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 702 TTGTGGATGATGCATCAAGATTCTTGAACGACAAAGTAACCAAGGCTGTCATCACTGTGC 761
Query 661 CTGCTTACTTCAACGACTCACAGAGGACAGCTACAAAAGATGCTGGTCGAATTGCTGGGT 720
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 762 CTGCTTACTTCAACGATTCACAGAGGACAGCTACAAAAGATGCTGGTCGAATTGCTGGGT 821
Query 721 TGGAAGTTCTTCGTATTATTAATGAGCCCACAGCTGCTTCGTTGGCTTATGGGTTTGACA 780
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 822 TGGAAGTTCTTCGTATTATCAATGAGCCCACAGCTGCTTCATTGGCTTATGGGTTTGACA 881
Query 781 GAAAAAG-CAATGAAACAATCCTAGTCTTTGATCTTGGTGGCGGTACCTTTGATGTCTCA 839
| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 882 G-AAAAGCCAATGAAACAATCCTAGTCTTCGATCTTGGTGGTGGTACCTTTGATGTCTCA 940
Query 840 GTGCTTGAGGTTGGTGATGGTGTGTTTGAAGTGCTTTCCACTTCTGGGGACACACATTTG 899
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 941 GTGCTTGAGGTTGGTGATGGTGTGTTTGAAGTGCTTTCCACTTCTGGCGACACACACTTG 1000
Query 900 GGTGGTGATGACTTCGACAAGAGAGTGGTTGATTGGCTTGCTGCAGAATTCAAGAAAGAT 959
|||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1001 GGTGGTGATGACTTTGACAAGAGAGTTGTTGATTGGCTTGCTGCAGAATTCAAGAAAGAC 1060
Query 960 GAAGGGATAGATCTTCTGAAAGACAAGCAAGCACTTCAGAGGTTAACAGAGGCAGCAGAA 1019
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1061 GAAGGGATAGATCTTCTGAAAGACAAGCAAGCTCTTCAGAGGTTAACAGAGGCAGCAGAA 1120
Query 1020 AAAGCTAAAATTGAGCTTTCCTCGCTGACTCAGACAAATATGAGCTTGCCATTTATCACC 1079
|||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||
Sbjct 1121 AAAGCTAAAATTGAGCTTTCTTCACTGACTCAGACAAATATGAGCTTACCTTTTATCACG 1180
Query 1080 GCCACAGCCGATGGACCTAAACACATAGAAACCACCCTCACACGTGCCAAGTTCGAAGAA 1139
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1181 GCCACAGCTGATGGACCTAAACACATAGAAACCACCCTCACACGTGCCAAGTTCGAAGAA 1240
Query 1140 TTGTGTTCAGATTTACTTGACAGGGTCAAGACTCCCGTCGAAAATTCCCTGAGGGATGCA 1199
|||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||||
Sbjct 1241 TTGTGTTCAGATTTACTTGACAGGGTCAGGACTCCTGTCGAGAATTCCCTGCGGGATGCA 1300
Query 1200 AAGCTCAGCTTCAAAGATATTGATGAAGTTATCCTTGTTGGTGGATCCACACGTATTCCT 1259
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1301 AAGCTCAGCTTCAAAGATATTGATGAAGTCATCCTTGTCGGTGGATCCACACGTATTCCT 1360
Query 1260 GCTGTTCAAGAACTCGTGAGGAAGGTGACTGGGAAAGAACCGAATGTCACAGTAAATCCT 1319
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||
Sbjct 1361 GCTGTTCAGGAACTCGTGAGGAAGGTGACTGGGAAAGAACCTAATGTTACAGTAAATCCT 1420
Query 1320 GATGAGGTTGTAGCTTTAGGTGCTGCAGTCCAGGCTGGTGTGCTTGCCGGAGATGTGAGT 1379
|| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||
Sbjct 1421 GACGAGGTTGTAGCGTTAGGTGCTGCAGTCCAGGCTGGTGTTCTTGCTGGAGATGTGAGT 1480
Query 1380 GACATTGTGCTTCTCGATGTGACACCGCTTTCCATTGGTTTGGAGACCCTTGGTGGTGTT 1439
|||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1481 GACATTGTGCTTCTTGATGTGACACCGCTTTCGATTGGTTTGGAGACCCTAGGTGGTGTT 1540
Query 1440 ATGACTAAGATTATTCCAAGGAACACCACACTGCCTACTTCTAAATCAGAAGTCTTTTCA 1499
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1541 ATGACTAAGATTATTCCAAGGAACACCACACTGCCTACTTCTAAATCAGAAGTCTTTTCA 1600
Query 1500 ACTGCTGCTGATGGACAGACAAGTGTTGAGATTAATGTGTTGCAGGGTGAGAGGGAGTTT 1559
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1601 ACTGCTGCTGATGGACAGACAAGTGTTGAGATTAATGTGTTGCAGGGTGAGAGGGAGTTT 1660
Query 1560 GTTAGGGATAACAAGTCTCTTGGTAGCTTCCGTCTAGATGGTATTCCACCGGCACCACGT 1619
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||
Sbjct 1661 GTTAGGGATAACAAGTCTCTTGGTAGCTTCCGTCTAGATGGTATCCCCCCTGCACCACGT 1720
Query 1620 GGAGTTCCACAAATCGAAGTCAAATTTGACATTGATGCCAATGGAATTTTATCTGTCAGT 1679
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1721 GGAGTTCCACAAATCGAAGTCAAATTTGACATTGATGCCAATGGAATTCTATCTGTCAGT 1780
Query 1680 GCTGTTGACAAGGGCACAGGAAAGAAGCAAGACATCACCATTACTGGCGCGAGTACATTG 1739
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1781 GCTGTTGACAAGGGCACAGGAAAGAAGCAAGACATCACCATTACTGGCGCAAGTACATTG 1840
Query 1740 CCCAAGGATGAGGTAGACCAAATGGTCCAGGAAGCAGAAAGATTTGCAAAGGATGACAAG 1799
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1841 CCCAAGGATGAGGTAGACCAAATGGTCCAGGAGGCAGAAAGATTTGCAAAAGATGACAAA 1900
Query 1800 GAGAAGAGAGATGCAATCGACAC-AAAGAACCAGGCAGACTCAGTGGTGTATCAGACAGA 1858
||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||
Sbjct 1901 GAGAAGAGAGACGCAATCGACACGAAA-AACCAAGCAGATTCAGTGGTGTACCAGACAGA 1959
Query 1859 GAAGCAACTGAAAGAACTTGGAGAGAAAATTCCAGGTGAAGTGAAAGAGAAGGTGGAGGC 1918
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1960 GAAGCAACTGAAAGAACTAGGAGAGAAAATTCCAGGTGAAGTGAAAGAGAAGGTGGAGGC 2019
Query 1919 TAAGCTACAAGAGCTGAAAGACAAGATAGGAAGCGAATCAACTCAGGAAATCAAAGACGC 1978
||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||
Sbjct 2020 TAAGCTACAAGAGCTGAAAGACAAGATAGGAAGTGGATCAACCCAAGAAATCAAAGACGC 2079
Query 1979 CATGGCTGCTCTTAACCAAGAAGTGATGCAGATTGGTCAGTCTCTATACAACCAGCCTGG 2038
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2080 CATGGCTGCTCTTAACCAAGAAGTGATGCAGATTGGTCAGTCTCTATACAACCAGCCTGG 2139
Query 2039 AGCTGGAGCACCAGGTGCAGGTCCTTCCCCGGGAGGTGAAGGTGCTTCTTCAGCAGATTC 2098
|||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||
Sbjct 2140 AGCTGGAGGTCCAGGTGCAGGTCCTTCCCCGGGAGGCGAAGGTGCTTCATCAGGAGATTC 2199
Query 2099 ATCTTCAAGTAAAGGAGGAGATGGTGATGATGTGATCGATGCTGACTTCACAGACAGCAA 2158
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2200 ATCTTCAAGTAAAGGAGGAGATGGTGATGATGTGATCGATGCTGACTTCACAGACAGCCA 2259
Query 2159 ATGAGAAAGCAAACTAGGACGGCTTTGAAATTTATACATGGGATG---TG--A------- 2206
|||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| || |
Sbjct 2260 ATGAGAAAACAAACTAGGAAGGCTTTGGAATTCATACATGGGATGCGATGGGAGAGACAA 2319
Query 2207 -T--TTT-GTAGGTTGGATTTGAGAACACAAATGAATTTAAGCAATGCTTGTGGACAACA 2262
| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2320 ATGATTTTGTAGGTTGGATTTGAGAACACAAATGAATTTAAGCAATGCTTGTGGACAACA 2379
Query 2263 TTTATTTGTCGTTAGAAGGAAGCAGTGTGGTTACAAGAGGATGATGTTTAATACATAATA 2322
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2380 TTTATTTGTCGTTAGAAGGAAGCAGTGTGGTTACA-GAGGATGATGTTTAATACATAATA 2438
Query 2323 ATATGCAAGCCTTCTCTT 2340
||||||||||||||||||
Sbjct 2439 ATATGCAAGCCTTCTCTT 2456
> AT5G49910.1 | Symbols: CPHSC70-2EAT SHOCK PROTEIN 70-2, HSC70-7,
cpHsc70-2 | chloroplast heat shock protein 70-2 | chr5:20303414-20306469
FORWARD LENGTH=2387
Length=2387
Score = 2170 bits (1175), Expect = 0.0
Identities = 1761/2045 (86%), Gaps = 36/2045 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 6 ATGGCATCTTCCGCCGCCCAAATTCACGTCCTTGGCGGAATTGGATT--C-GCTTCTTCT 62
||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| | |||| |||
Sbjct 57 ATGGCTTCCTCCGCCGCCCAAATTCACATCCTCGGCGGAATCGGATTCCCTACTTCGTCT 116
Query 63 TCTT-CT--TCCAAGAGAAATCTTAATGGTAAAGGCGGTACCTTTATGCCGA-GAAGTGC 118
|||| || |||| | ||| || | ||| | | || || || | |||| |
Sbjct 117 TCTTCCTCCTCCACCAAAAACCTCGACAACAAAACCAATTCC---ATTCC-ACGAAGCGT 172
Query 119 CTTCTTCGG-TACAAGAACCGGTCCTTTCTCAACACCCACTTCTGCTTTTC-TCAGAATG 176
||||||||| || ||||| |||||||| | || || || || || || | || | |||
Sbjct 173 CTTCTTCGGCAAC-AGAACAAGTCCTTTCACTACTCCAACCTCCGCCTTCCTTC-GTATG 230
Query 177 GGCAC-CAGAAATGGCGGCGGCGCTTCTAGATACGCGGTTGGTCCGGTTCGTGTGGTTAA 235
|| || ||||| | | |||||| ||||| | |||||||| || |||||||||||
Sbjct 231 GG-ACGAAGAAA---CAACAACGCTTCCCGATACACCGTTGGTCCAGTCCGTGTGGTTAA 286
Query 236 CGAGAAGGTTGTTGGAATTGATTTGGGTACGACTAACTCCGCCGTTGCTGCTATGGAAGG 295
|||||| || || ||||| ||||| || ||||| || || || |||||||||||||||||
Sbjct 287 CGAGAAAGTCGTCGGAATCGATTTAGGCACGACGAATTCAGCTGTTGCTGCTATGGAAGG 346
Query 296 AGGTAAGCCTACGATTGTTACTAACGCTGAAGGTCAGAGGACGACGCCGTCTGTGGTGGC 355
|||||| || |||||||| ||||||||||||||||| || || || || ||||| |||||
Sbjct 347 AGGTAAACCAACGATTGTGACTAACGCTGAAGGTCAAAGAACTACACCTTCTGTTGTGGC 406
Query 356 TTACACGAAGAGTGGTGATAGGCTTGTTGGGCAGATTGCGAAGA-GGCAAGCTGTTGTTA 414
||| || |||||| ||||| |||||||| |||||||| || | | |||||||||||||
Sbjct 407 TTATACTAAGAGTAAAGATAGACTTGTTGGTCAGATTGCTAA-ACGTCAAGCTGTTGTTA 465
Query 415 ATCCCGAGAATACTTTCTTCTCCGTGAAGAGGTTTATTGGTAGGAAG-ATGAATGAGGTT 473
|||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||| |||
Sbjct 466 ATCCGGAGAATACTTTCTTCTCTGTTAAGAGGTTTATTGGTA-GAAGAATGAATGAAGTT 524
Query 474 GCTGAGGAGTCTAAGCAGGTTTCTTATAGAGTTGTTAGAGATGAGAACGGGAATGTTAAG 533
||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||
Sbjct 525 GCTGAAGAGTCTAAGCAGGTTTCTTATAGAGTTATTAAAGATGAGAATGGTAATGTTAAG 584
Query 534 TTTGAGTGTCCTGCCATTAACAAACAATTTGCTGCTGAGGAGATTTCAGCTCAGGTTTTG 593
|||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 585 CTTGATTGTCCTGCTATTGGTAAACAATTTGCTGCTGAGGAGATTTCTGCTCAGGTTTTG 644
Query 594 AGGAAACTTGTGGATGATGCCTCAAGATTCTTGAACGACAAAGTAACCAAGGCTGTCATT 653
||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||
Sbjct 645 AGGAAGCTTGTGGATGATGCTTCGAGATTTTTGAATGATAAAGTAACGAAAGCTGTCATC 704
Query 654 ACTGTGCCTGCTTACTTCAACGACTCACAGAGGACAGCTACAAAAGATGCTGGTCGAATT 713
|||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||
Sbjct 705 ACTGTGCCTGCTTACTTCAATGATTCACAAAGGACGGCTACTAAAGATGCTGGTCGTATT 764
Query 714 GCTGGGTTGGAAGTTCTTCGTATTATTAATGAGCCCACAGCTGCTTCGTTGGCTTATGGG 773
||||| |||||||||||| | |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||
Sbjct 765 GCTGGATTGGAAGTTCTTAGGATTATTAATGAGCCTACTGCTGCTTCTTTGGCTTATGGG 824
Query 774 TTTGACAGAAAAAGCAATGAAACAATCCTAGTCTTTGATCTTGGTGGCGGTACCTTTGAT 833
||||| || |||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||||
Sbjct 825 TTTGAGAGGAAAAGCAATGAAACTATTCTTGTTTTTGATCTTGGTGGTGGTACTTTTGAT 884
Query 834 GTCTCAGTGCTTGAGGTTGGTGATGGTGTGTTTGAAGTGCTTTCCACTTCTGGGGACACA 893
|||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||
Sbjct 885 GTCTCAGTCCTTGAGGTTGGTGACGGTGTTTTTGAAGTGCTTTCGACTTCTGGTGATACA 944
Query 894 CATTTGGGTGGTGATGACTTCGACAAGAGAGTGGTTGATTGGCTTGCTGCAGA-ATTCAA 952
|||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||
Sbjct 945 CATTTGGGAGGTGATGACTTTGACAAGAGAGTCGTTGATTGGCTTGCTTCA-ACCTTCAA 1003
Query 953 GAAAGATGAAGGGATAGATCTTCTGAAAGACAAGCAAGCACTTCAGAGGTTAACAGAGGC 1012
||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||
Sbjct 1004 GAAGGATGAAGGTATAGATCTTCTCAAAGACAAGCAAGCGCTTCAGAGGTTGACGGAGGC 1063
Query 1013 AGCAGAAAAAGCTAAAATTGAGCTTTCCTCGCTGACTCAGACAAATATGAGCTTGCCATT 1072
||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||
Sbjct 1064 AGCTGAAAAAGCTAAAATTGAGCTTTCCTCACTGACTCAGACAAACATGAGTTTGCCTTT 1123
Query 1073 TATCACCGCCACAGCCGATGGACCTAAACACATAGAAACCACCCTCA-CACGTGCCAAGT 1131
|||||| || || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||| || | | |||||
Sbjct 1124 TATCACTGCAACGGCTGATGGGCCTAAGCACATTGAAACCACTCTCACCA-GGGGCAAGT 1182
Query 1132 TCGAAGAATTGTGTTCAGATTTACTTGACAGGGTCAAGACTCCCGTCGAAAATTCCCTGA 1191
| ||||||||||| || || ||||| |||||||||| ||| || || || ||||||||||
Sbjct 1183 TTGAAGAATTGTGCTCTGACTTACTCGACAGGGTCAGGACACCTGTGGAGAATTCCCTGA 1242
Query 1192 GGGATGCAAAGCTCAGCTTCAAAGATATTGATGAAGTTATCCTTGTTGGTGGATCCACAC 1251
|||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1243 GGGATGCAAAACTCAGCTTCAAAGATATTGATGAGGTGATCCTTGTTGGTGGATCCACAC 1302
Query 1252 GTATTCCTGCTGTTCAAGAACTCGTGAGGAAGGTGACTGGGAAAGAACCGAATGTCACAG 1311
|||| ||||||||||| || || || |||||| |||| || |||||||| |||||| |||
Sbjct 1303 GTATCCCTGCTGTTCAGGATCTTGTAAGGAAGCTGACAGGAAAAGAACCCAATGTCTCAG 1362
Query 1312 TAAATCCTGATGAGGTTGTAGCTTTAGGTGCTGCAGTCCAGGCTGGTGTGCT-TGCCGGA 1370
| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || | | |||
Sbjct 1363 TCAATCCTGATGAAGTTGTAGCTTTAGGTGCTGCAGTTCAGGCCGGTGTTCTAT-CAGGA 1421
Query 1371 GATGTGAGTGACATTGTGCTTCTCGATGTGACACCGCTTTC-CATTGGTTTGGAGACCCT 1429
||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || | |||||||||| || ||
Sbjct 1422 GATGTGAGTGACATTGTTCTTCTTGATGTGACGCCGCTATCGC-TTGGTTTGGAAACTCT 1480
Query 1430 TGGTGGTGTTATGACTAAGATTATTCCAAGGAACACCACACTGCCTACTTCTAAATCAGA 1489
||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||
Sbjct 1481 TGGTGGTGTCATGACCAAGATCATTCCAAGAAACACCACACTTCCAACTTCTAAGTCAGA 1540
Query 1490 AGTCTTTTCAACTGCTGCTGATGGACAGACAAGTGTTGAGATTAATGTGTTGCAGGGTGA 1549
|||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1541 AGTCTTCTCAACTGCTGCAGATGGACAGACAAGCGTTGAGATTAATGTGTTACAGGGTGA 1600
Query 1550 GAGGGAGTTTGTTAGGGATAACAAGTCTCTTGGTAGCTTCCGTCTAGATGGTATTCCACC 1609
||| ||||| || || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1601 GAGAGAGTTCGTAAGAGATAACAAGTCTATTGGTAGCTTCCGTCTTGATGGTATTCCACC 1660
Query 1610 GGCACCACGTGGAGTTCCACAAATCGAAGTCAAATTTGACATTGATGCCAATGGAATTTT 1669
|||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1661 TGCACCACGTGGAGTTCCACAAATCGAGGTCAAATTCGACATTGATGCCAATGGAATTCT 1720
Query 1670 ATCTGTCAGTGCTGT-TGACAAGGGCACAGGAAAGAAGCAAGACATCACCATTACTGGCG 1728
||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 1721 ATCTGTCAGTGCT-TCGGACAAAGGTACAGGAAAGAAGCAGGACATCACCATTACTGGTG 1779
Query 1729 CGAGTACATTGCCCAAGGATGAGGTAGACCA-AATGGTCCAGGAAGCAGAAAGATTTGCA 1787
| ||||| || || |||||||||||||| || |||||| || |||||||| || ||||||
Sbjct 1780 CTAGTACCTTACCAAAGGATGAGGTAGA-CACAATGGTGCAAGAAGCAGAGAGGTTTGCA 1838
Query 1788 AAGGATGACAAGGAGAAGAGAGATGCAATCGACACAAAGAACCAGGCAGACTCAGTGGTG 1847
||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||
Sbjct 1839 AAGGAAGACAAAGAAAAGAGAGATGCGATTGACACAAAGAACCAGGCTGACTCCGTCGTT 1898
Query 1848 TATCAGACAGAGAAGCAACTGAAAGAACTTGGAGAGAAAATTCCAGGTGAAGTGAAAGAG 1907
|| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1899 TACCAGACAGAGAAGCAGCTTAAAGAACTTGGAGAGAAAATTCCAGGTCCAGTGAAAGAA 1958
Query 1908 AAGGTGGAGGCTAAGCTACAAGAGCTGAAAGACAAGATAGGAAGCGAATCAACTCAGGAA 1967
||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||| |||
Sbjct 1959 AAGGTTGAGGCTAAGCTCCAAGAGCTGAAGGAGAAGATAGCAAGCGGATCAACTCAAGAA 2018
Query 1968 ATCAAAGACGCCATGGCTGCTCTTAACCAAGAAGTGATGCAGATTGGTCAGTCTCTATAC 2027
||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 2019 ATCAAAGACACCATGGCAGCTCTTAACCAAGAAGTGATGCAGATTGGCCAGTCTCTGTAC 2078
Query 2028 AACCA 2032
|||||
Sbjct 2079 AACCA 2083
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 116164061130
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5