BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg492440
Length=3622
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT4G24200.1 | Symbols: | Transcription elongation factor (TFII... 5485 0.0
> AT4G24200.1 | Symbols: | Transcription elongation factor (TFIIS)
family protein | chr4:12556646-12560944 REVERSE LENGTH=3663
Length=3663
Score = 5485 bits (2970), Expect = 0.0
Identities = 3453/3676 (94%), Gaps = 73/3676 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGTTATTGAATATTTATTACCAAAAAGAATAAACGAAG--AAAGCCTTTTCTTCTCTCTC 58
||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1 AGTTATTAAATATTTATTGCCAAAAAGAATAAACGAAGAAAAAGCCTTTTCTTCTCTCTC 60
Query 59 GTTTTCGCGACAACCTTTTCCTCGAAGAAGAAGAAGAACGAGGTTTTCTCAT-AGAGCTG 117
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||
Sbjct 61 GTTTTCGCGACAACCTTTTCCTCGAAGAAGAAGAAGAACGAGGTTTTCTC-TCAGAGCTG 119
Query 118 CCAACCA----T---C---G--TT-----GCC------AAATCGTAACAGAGTGAGAAAT 154
||||||| | | | || || |||||||||| |||||||| ||
Sbjct 120 CCAACCATCGTTGCCCGGAGATTTAAAAAACCTGTGATAAATCGTAACTGAGTGAGAGAT 179
Query 155 ATATACACACATATAT--ACAGAGGGACAAGG-AAGGGATTGGGATATGCGAGTGGGCAT 211
||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||
Sbjct 180 ATATACACATATATATACACAGAGGGACAAGGAAAGAGATTGGGATATGCGAGTGCGCAT 239
Query 212 CGGTTCTGTCGGAACGGCTAACTCGCTTGACCTAGGGTTTCGTCTTCCTTGTGCTTCATG 271
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 240 CGGTTCTGTCGGAACGGCTAACTCGCTTGACCTAGGGTTTCGTCTTCCTTGTGCTTCGTG 299
Query 272 GACTTTTTCGAATGGGAGAAAGAACCTTTTTGC-TTCATAACAGTGTTCTATATTTTTGG 330
|| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||
Sbjct 300 GAGTTTTTCGAATGGGAGAAAGAACCTTTTTGCTTTC-TAACCGTGTTCTATATTTTTGG 358
Query 331 AGTTGTCATAAGTAAAGCAGTATGACGCTTGAAGATTTCTTTACCCTAACAGAAATAAAA 390
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 359 AGTTGTCATAAGTAAAGCAGTATGACGCTTGAAGATTTCTTTACCCTAACAGAAATAAAA 418
Query 391 GATGGACTCACGGTCACTTCTCGTGTTGAAGAGCTCGTGTCTGTTATGCAAAGTAATAAA 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||
Sbjct 419 GATGGACTCACGGTCACTTCTCGTGTTGAAGAGCTTGTGTCTGTTATGCAGAGTAATAAG 478
Query 451 GATTCAGTTTTGAAGAATAATGGTGATGCTTCTAGACAATGGACTGCTGTTGCAAGCACA 510
||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 479 GATTCAGTTTTGAAGAATAGTGGTGATGCTTTTAGACAATGGACTGCTGTTGCAAGCACA 538
Query 511 ATTGCGGCCACTAAGAACAGAGATTGTCTTGATGTTTTTGTAAATTTAGATGGACTCGTT 570
|||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 539 ATTGCGGCTACAAAGAACAGAGATTGTCTTGATGTTTTTGTAAATTTAGATGGACTTGTT 598
Query 571 TACTTAAGTAGCTGGCTAGCTGAAGCTCAGATGTTGGCTAACGATTCAGTTGACAGATCT 630
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 599 TACTTAAGTAGCTGGCTAGCTGAAGCTCAGATGTTGGATAACGATTCAGTTGACAGATCT 658
Query 631 GTAGAGGAGTCAATTCTTGCTTTGTTAGAAGCTGTTGAAAATCTAGGTGTAGACAGTTCG 690
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 659 GTAGAGGAGTCAATTCTTGCTTTGTTAGAAGCTGTTGAAAATCTAGGTGTAGACAGTTCC 718
Query 691 AAGTTAGTTTCTTCTGGGATATGGGTTGCTGTCAAGAAACTTGTTGACCATGGTAGTTCT 750
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 719 AAGTTAGTTTCTTCTGGGTTATGGGTTGCTGTCAAGAAACTTGTGGACCATGGTAGTTCT 778
Query 751 CGGGTTCAGGATCAGGCGAGAAAGCTCTTTGGTAGCTGGAAAGATAAGGATG-TGTATGA 809
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||
Sbjct 779 CGAGTTCAGGATCAGGCGAGAAAGCTCTTTGGTAGCTGGAAGGATAAGGATGAT-TATGA 837
Query 810 CCACTCTGAACATGACATTGAAAGCTGCAACAAAATTCATGAAGATGAGATGAGAGTCGT 869
||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 838 CCACTCTGAACATGACAGTGAAAGCTGTAACAAAATTCATGAAGATGAGATGAGAGTTGT 897
Query 870 AGCAGCAAGCATGGAGAGCAGTGGGCAAAAATCTGCTGTTACACTTTGTTCGACAAAAAG 929
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 898 AGCAGCAAGCATCGAGAGCAGTGGGCAAAAATCTGCTGTTACACTTTGTTCGATGCAAAG 957
Query 930 TAATAATGAAAAACACTGTCCTGAAATAGCAGATGAAGCCTTGCTGTCAGGATGCTCAGA 989
|| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 958 TACTAGTGAAAAACATTGTCCTGAAATAGCAGATGAAGCCTTGCTATCAGGATGCTCAGA 1017
Query 990 AGGAAACATCCCAGATCAAGATGAGGGTTTGGAACTGCAGAACGACAAGGCTGGGTTTGA 1049
|||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1018 AGGAAACATCCCAGATCAAGATAAGGGTTTGGGACTGCAGAACGACAAGGCTGGGTTTGT 1077
Query 1050 CTCGAACGTGAATTCCCATTGCTCGAATACGATGACTGAAACTGAAACTTTCAATGGTTC 1109
|||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||
Sbjct 1078 CTCGAACGTGAATTCCCACTGCTCTAATTCGATGACTGAAACT-----TT-CAATGGTTC 1131
Query 1110 TTCG-ACGGATGATATCATGAAAGAGGTTCAAGAAAAACTTTCCGTGAAGGAGAAAAGCT 1168
|| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||
Sbjct 1132 TT-GTACCGATGATATCATGAAAGAGGTTCAAGAAAAACTTTCTGTGAAGGAAAAAAGCT 1190
Query 1169 CTATGAAGGG-GACAGGTGGTCCAACGATTTTTGGTACTATGCCTACTGGTTCTAGTAGC 1227
||||| ||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1191 CTATGG-GGGAGACAAGTGGCCCAACGACTTTTGGTACTATGCCTACTGGGTCTAGTAGC 1249
Query 1228 CTACTTTATTTAGAGCGCGATAGTG-TAGAAGGGCCATCAAATGCTCCACTGGGTGCTGA 1286
||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1250 CTACTTTATTTAGAGCGTGATAGTGCT-GAAGGCCCATCAAATGCTCCACTGGATGCTGA 1308
Query 1287 GATACCCAAGGAAAAGCAGATGGCAAACTATTTTCTTGAAAAATTGGGTGAAGCAGGGAC 1346
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1309 GATACCCAAGGAAAAGCAGATGGCAAACTATTTTCTTGAAAAATTGGGTGAAGCAGGGAC 1368
Query 1347 ATCTAGTGCAACAGGATATGTAGCTGTGTCTTCTGATTCTAT-GATTGCCAGCATGGAGT 1405
|||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||
Sbjct 1369 ATCTAGTGCAGCAGGACACGTAGCTGTGTCTTCTGATTCTATTG-TTGCCAGCATGGAGT 1427
Query 1406 TGGAGAAAAATAGTCTTTTGCAGAGTAGTCTTGATTCAAATGAGGTGAGCAAGAATGCAT 1465
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1428 TGGAGAAAAATAGTCTTTTGCAGAGTAGTCTTGATTCAAATGAGGTGAGCAAGAATGTGT 1487
Query 1466 CTGAGACGATATGTGGGTCGCACGGTGCGAGCGTAGCCCATAATAGCAAACAGGTGTCTT 1525
||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1488 CTGGGACGATATGTGGGTCGCACGATGTGAGCGTAGCCCATAATAGCAAACAGGTGTCTT 1547
Query 1526 CATTGACTCATATAACGGACAATCAAGATTCTGACAGTTCATCAAGATTATCAGGTGGCC 1585
||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1548 CATTGACTCATATGACGGACAATCAAGATTCTGACAATTCATCAAGATTATCAGGTGGCC 1607
Query 1586 TTGGTAGAAGTAGAAAATTTGAGAGTGACAATTTAAATGCTCTTGCTGACAATGAAGGAA 1645
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||
Sbjct 1608 TTGGTAGAAGTAGAAAATTTGAGAGTGACAATTTAACTGGTCTTGCTGACAATGAAGGAA 1667
Query 1646 AAGATGATATGGGTCATTCAGACAAAAAGAGGAGAGTAAAACGGATaaaaaaaCGCAGCT 1705
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 1668 AAGATGATATGGGTCATTCTGACAAAAAGAGGAGAGTAAAACGGAGAAAAAAACGCATCT 1727
Query 1706 CTTCTAGATCAATGACCATATCCCAGCGCCTGGGAGCAATTGATAAAACAACTACTGATA 1765
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1728 CTTCTAGATCAATGACCATATCCCAGCGCCTTGGAGCAATTGACAAAACAACTACTGATA 1787
Query 1766 TTGATCTTGGTATTTTGGATGCCTTGGAGGTCGCTACCAAAGTCGCACAAGAAGTCGCTA 1825
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
Sbjct 1788 TTGATCTTGGTATTTTGGATGCCTTGGAGGTCGCTACCAAAGTCGCACAGGAAGTCGCAA 1847
Query 1826 GAGAAGTAGACTCTGGAGAACCTTCTCATAGTTCTTCAGAAGAACTATCCGATGAAAGCG 1885
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1848 GAGAAGTGGACTCTGGAGAACCTTCTCATAGTTCTTCAGAAGAACTATCCGATGAAAGCG 1907
Query 1886 GGCAGTCTGGTTCGCAAGACTCCCGCGATGATGATGTACATACAGGTTCTCGATCTAAGG 1945
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1908 GGCAGTCTGGTTCGCAATACTCCCGCGATGATGATGTACATACAGGTTCTCCATCTAAGG 1967
Query 1946 GATTATCAGT-AGGTGAAAACCATTCCTTTGAGGAACCTAATGTTGGAGATGATGATGTC 2004
|||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 1968 GATTATCAGTGAC-TGAAAACCATTCCTTTGAGGAACCTCATGTTGGAGATGATGATCTA 2026
Query 2005 ATGGATGAGAATGTTGACAAACCTGAAAGTGATGATGTTGAAGAAAGCCACTTAGCAGCA 2064
||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||
Sbjct 2027 ATGGATGAGAAAGATGACAAACCTGAAAGTGGTGATGTTGAAGAAAGACACCTAGCAACA 2086
Query 2065 GCTGCTAAATCTGAAGTAGGCAGAGAGAAAAGCCCATGTGGATTTGATCTTAATCAAGAT 2124
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2087 GCTGCTAAATCTGAAGTAGGCAGAGAGAAAAGCCCATGTGGCTTTGATCTTAATCAAGAT 2146
Query 2125 ATATGTCCTGATGAAACAGATGTCATTATGTCCTCCATATCTACAGCCCCTACTCCTATG 2184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 2147 ATATGTCCTGATGAAACAGATGTCATTATGTCCTCCACATCTACAACCCCTGCTCCTATG 2206
Query 2185 TCTGTTTCATTTTCTGTCTCATCTTCTGGAATGCCTGCAGCAGCACCGTTGCAATTGGAA 2244
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||
Sbjct 2207 TCTGTTTCATTTTCTGTCTCATCTTCTGCAATGCCTGCAGCAGCACCGTGGCATTTGGAA 2266
Query 2245 AGATCTCTTAGCGGGAAAGGATCAGCTGCTACTAGTGTATTCCACCCAGCATTACCTCAT 2304
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||
Sbjct 2267 AGATCTCTTAGCGGGAAAGGATCAGCTGCTACGAGTGTATTTCACTCAGCATTACCTCAT 2326
Query 2305 AAAGTTCCTAGTGGGGATTTAAGAGAAAAGCAGGTGATTTCCCGTGGTATCGATCTGAAC 2364
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2327 AAAGTTCCTAGTGGGGATTTAAGAGAAAAGCAGGTGATTTCTCGTGGTATCGATCTGAAC 2386
Query 2365 GTGGCTGAGCTAGGAGATGATCAAGTTGAAGATCTGACTCCCTGGAAACAGTTTCCTTTC 2424
||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2387 GTGGCTGAGGTAGGAGATGATCAAGTTGAAGATCTTACTCCTTGGAAACAGTTTCCTTTC 2446
Query 2425 TCCTCATCAAACTCTAGGGGTGGAGAGTCTTCACATGAAGCCAGTCTCCGAGGATCAAGC 2484
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2447 TCCTCATCAAACTCTAGGGGTGGAGAGTCTTCACATGAAGCCAGTCTGCGAGGATCAAGC 2506
Query 2485 AGGTTCAACTTGGATTTGAATTGTATGAACGAGGACGATGAGATGCCTCCACCTTCTGAG 2544
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2507 AAGTTCAACTTGGATTTGAATTGTATGAACGAGGACGATGAGATGCCTCCACCTTCTGAG 2566
Query 2545 TTGAAGATGGAGACAAGATTGTTTTTAAGTCACAATGGTCAGCAAAGCGCATCACCTGTC 2604
| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2567 TCGAAGATGGAAACAAGATTGTTTTTAAGTCACAATGGTCAGCAAAGCGCATCACCTGTC 2626
Query 2605 TCCTCATCGTCAGTTGCTCAGCAATCAGGCAAGGAAGTTAACTTTGATTTGAATGACAGG 2664
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2627 TCCTCATCGTCAGTTGCTCAACAATCAGGCAAGGAAGTAAACTTTGATTTGAATGACAGG 2686
Query 2665 CCACAGTTTTTCATCGATTCACGTGATCAGGGTCCCTACTATGGGCGGCACCCATGGAGT 2724
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2687 CCACAGTTTTTCATTGATTCACGTGATCAGGGTCCCTACTATGGGCGGCACCCATGGAGT 2746
Query 2725 ACGGCCTCCTATGGAGGGCACAAATTGGAAGAACCAGGTATTTCTATCTTGGGTACAAAA 2784
|| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2747 ACAGCCTCCTATGGGGGGCACAAATTGGAAGAACCAGGTATATCTATCTTGGGTACAAAA 2806
Query 2785 GTGGATGTTGATAGAAAAGAGTCTGGATCTCAGATGGCTTCGTTCTTGTCCAATGGCAAG 2844
||||| | ||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2807 GTGGAAGCTGACAGAAAAGACTCTGTACCTCAGATGGCTTCGTTCTTGTCCAATGGCAAG 2866
Query 2845 TCCCTCGAACCTGCAGCAGGATTATACATGGGAAGAACGGGAACCTCTTTGGGTCTAGCC 2904
|||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2867 TCCCTCGAGCCTGCAACAGGTTTACACATGGGAAGAACGGGAAACTCTTTGGGTCTAGCC 2926
Query 2905 CCAGGTGTCTCCTTTTCTCCAGCTCCTATTTATGGCTACAACGGAATGAGTGGTCCTCCT 2964
|| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||
Sbjct 2927 CCTGGTGTCTCCTTTTCTCCAGCCCCTATGTATGGCTACAACGGATTGACTGGTCCTCCT 2986
Query 2965 GGTTTGTCAATGTCATCGCCAATGTATGTTCCTGGAACTGCTATTCCATACATGGTGGAT 3024
||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2987 GGTTTGTCAATGTCATCACCCATGTATGTTCCTGGAACTGCTATTCCATACATGGTGGAT 3046
Query 3025 TCAAGAGGTACTCCAGTGATGATGCCGCAAATAATCGGATCGACC-CCGTATGTGCAGCC 3083
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||
Sbjct 3047 TCAAGAGGTACCCCAGTGATGATGCCGCAAATAATCGGATC-AGCGCCGTATGTGCAGCC 3105
Query 3084 ACCATTCCCTCAACAACACATGTTCATGAGCTTGGCGGGTGGATCCCCTAGTATGAATGG 3143
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||
Sbjct 3106 ACCATTCCCTCAACAACACATGTTCATGAGCTTGGCGGGTGGATCGCCTAGTACGAATGG 3165
Query 3144 ATCAGTGCGGCCAAACTTTGATCAGAACTCTGGGTTTGGACTTGAGATAGGAAACAGAGA 3203
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3166 ATCAATGCGGCCAAACTTTGATCAGAACTCTGGGTTTGGACTTGAGATAGGAAACAGAGA 3225
Query 3204 GTCGATAAATTTGAGGCAGTTTCTATCGCCGTCACAAAGCGGGGCAATGGGAGAGCATTC 3263
|||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3226 GTCGCTAAATTTGAGGCAGTTTCTATCACCTTCACAAAGCGGGGCTATGGGAGAGCATTC 3285
Query 3264 GGGAGCAAATGTAGAGCCCTCATCGAGTTCGTCTATTAGCATTGGTGGAAAGCGAAAAGA 3323
||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3286 AGGAGCAAATGTAGAGCCCTCATCGAGTTCTTCTATCAGCATTGGTGGAAAGCGAAAAGA 3345
Query 3324 GCCGGAGACACGGTGGGAGTTCCCTCCATGGAGGTGAGTGATGTACAA-GTGGTGGGGAT 3382
||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||
Sbjct 3346 GCCGGAGCCACGTTGGGAGTTTCCTCCATGGAGGTGAGTGATCTACAAAGTGGTGGAGAT 3405
Query 3383 GGGTTCTTGAATAGGTTGATGAATTGATTGATTGGTCAAAGGATGATGACAAGTGTT--G 3440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3406 GGGTTCTTGAATAGGTTGATGAATTGATTGATTGGTCAAAGGATGATGACAAGTGTTTTG 3465
Query 3441 AGGTAACTTATAAAGTGGTCTTGCTGAACttttctct-cagttttccct-ttt--tcagg 3496
||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||| | ||| ||||
Sbjct 3466 AGGTAACTTATAAAGTG-TCTTGCTGAACTTTTC-CTTCTTTTTTTTTTATTTCCTCAGT 3523
Query 3497 ttt----tttt--a--tttt--attttatttCATAACATATAGGAGGATTAGTTCAAACA 3546
||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3524 TTTCCCATTTTTCAGGTTTTTTATTTTATTTCATAACATATAGGAGGATTAGTTCAAACA 3583
Query 3547 TTTGGTATATGTCAAGCTTCTTTTTTAACCTTGTTGGGTTTTTCTCCATAAATAAATATA 3606
|| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3584 TT-GGTATATGTCAAGCTTCTTTTT-AACCTTGTTGGGTTTTTCTCCATAAATAAATATA 3641
Query 3607 TAGTTTTAAGATACAG 3622
||||||||||||||||
Sbjct 3642 TAGTTTTAAGATACAG 3657
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 180350160085
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5