BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg492569
Length=6795
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT4G22970.1 | Symbols: RSW4, AESP, ESP | homolog of separase | ... 1.070e+04 0.0
> AT4G22970.1 | Symbols: RSW4, AESP, ESP | homolog of separase
| chr4:12033437-12043572 REVERSE LENGTH=6809
Length=6809
Score = 1.070e+04 bits (5794), Expect = 0.0
Identities = 6478/6809 (95%), Gaps = 44/6809 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGCGTCCACT---GACGACCTCCGTCTTCTCTCTCTCATCGAATCTTCCGACGCCGGT 57
||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | | | || | |
Sbjct 1 ATGGCGTCCTCTGGCGACGACCTCCGTCTTCTCTCTCTCATCG-A-CGT-CG--G-C--- 51
Query 58 GATGATATCTTCTCTTCCTTCTCCGATTACCTTAAACCTTTCTCTACTCTATCCACTTCC 117
||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 52 GATAATGTCTTCTCTTCCTTCTCCGATTACCTTAAACCTTTCTCTACTCTATCCACTTCC 111
Query 118 CGGAAAAAACAAGACCGAGCAACCACCATTCGAGCCCTAGCTAAGCAATTTCTTCCTTTC 177
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 112 CGGAAAAAACAAGACCGAGCAACCACGATTCGAGCCCTAGCTAAGCAATTCCTTCCTTTC 171
Query 178 CTCAACAAATCGATCTCGCTCCTACCGAAACGCCTCTCCGTCGCCAAGTCTGACAAGGAA 237
||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||
Sbjct 172 CTCAACAAATCGATCTCTCTCCTACCGAAACGTCTCTCCGTCGCGAATTCTGATAAGGAA 231
Query 238 GCTCGTGAATCAGCCTTAGATCTGTTCCGTGCTTATGAACTTTGCTTGGATTGTTTAGAA 297
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||
Sbjct 232 GCTCGTGAATCAGCATTAGATCTGTTCCGTGCTTATGAACTTTGTTTGGACTGTTTAGAA 291
Query 298 TTGGTCTCTGCTCAATTAGCTTGTAAGCCTCATACCGTTCAATCTCAGAGGCTACGGATG 357
|||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||
Sbjct 292 TTGGTCTCTGCTCAATTAGCTTGTAAGCCTCACACTGTTCAATCTCAGAGGCTAAGGATG 351
Query 358 GTTTATTGTCTCGATGTTTGGGGTTTGTATGAGAATATGTATTCTGAAGCGTTTAAGGTT 417
|| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||
Sbjct 352 ATTCATTGTCTCGATGTTTGGGGTTTGTATGAGAATGTGTATACTGAAGCGTTTAAGGTT 411
Query 418 TTGGAGAAGCTAAGAGGCTCTGATAGCAAATCCCGGAATTGCCGGTTGTTGCCGGAGGTT 477
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||
Sbjct 412 CTGGAGAAGCTAAGAGGCTCTGATAGCAAATCCCGGAAGTCCCGGTTGTTGCCGGAGGTT 471
Query 478 CAGGACGGAGAGGCGGATATGGCTTTGGTTGTTGTTGATGCTGTGGCGGCCATTTTTAGG 537
||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 472 CAGGATGGAGATGCGGAGATGGCTTTAGTTGTTGTTGATGCTGTGGCGGCCATCTTTAGG 531
Query 538 GCTGTGGCAATGGGCCAGCAATTAGATGATAAGCGGTATCGGAAAGTTCTTCTTTTGCTG 597
|||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 532 GCTGTGGCAATGAGTCAGCAGTTAGATGATAAGCGGTATCGGAAAGTTCTTCTTTTGCTT 591
Query 598 GGGGAGGTCGGAGGCTGGTTTAGGGTCTTAGATGCTAAGGCGTATGAGAAGTTTCACAGA 657
| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||
Sbjct 592 GAGGAAGTCGGAGGCTGGTTAAGGGTCTTAGATGCTAAGGTGTATGAAAAGTTGCACAGA 651
Query 658 GCGATGGTGACAAATTTGGGTAAATGTTCTGTTTCTCTCGTTAGAGAAGCTGAGCGTTTT 717
||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 652 GCGATGGTGACAAGTATGGGTAAATGTGCTGTTTCTCTCGTTAGAGAAGCTGAGCGTTTC 711
Query 718 GATGGGGATTTAGTGATATCTTTCTGCGACTTAACTGTGAAGGAACACTATAAATCTGCA 777
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 712 AATGGGGATTTAGTGATTTCTTTCTGCGACTTAACTGTGAAGGAACATTATAAATCTGCA 771
Query 778 TTCTCAAAAGATCGAATTTATAAGTTTGCTCGCGAGGTGCTTTCTGTTCTGTTCAGATTT 837
|| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 772 TTATCAAAAGATCGAGTTTATAAGTTTGCTCGCGAGGTGCTTTCTGTTCTGTTTGGATTT 831
Query 838 AAGGATaaaaaaaTGTCAGTGACCATTGACATTTCAATGTCTTTGTTGCGCAGCTTAACT 897
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||
Sbjct 832 AAGGATAGAAAAATGTCAGTGACCATTGACATTTCAATGTCTGTGTTGCGCAGCTTATCT 891
Query 898 TGCCAATTTGAGGATGAAAGTAATGAGAATTTAATGGAGTTTGTTGACCTAGTCGCTTAT 957
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||
Sbjct 892 TGCCAATTTGAGGATGAAAGTAATGAGAATTTAATGGAGTTTTTTGACCTAGTCGATTAT 951
Query 958 TGCGCTCACAAGTTTCGAGCAGCAGGAGACATTTACTGTGCAAAAGTTTCAAAAAAGTTG 1017
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 952 TGCGCTCACAAGTTTCGAGCAGCAGGAGACATGTACTGTGCAAAAGTTTCAAAAAAATTG 1011
Query 1018 AATGAGATGGCAGCTATTTTCTTAGAGGCAATACCCCAACTTAATCTGGTTCTTAGACTG 1077
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1012 AATGAGATGGCAGCTATTTTCGTAGAGGCAATACCCCAACTTAATTTGGTTCTTAGACTG 1071
Query 1078 TATTCAACCGGGCTGTCCATCACGGTTTGCGATTCCAAGCTCGGAGAAAGTAAGGTTA-A 1136
||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | || |
Sbjct 1072 TATTCGACCGGGCTGTCCATCACGGTTTGCAATTCCAAGCTCGGAGAAATTAA-GCTAGA 1130
Query 1137 AGATTCCACAGATGATTGGAAGATTCAAGCAATGTTTGATGATGATGCTAGATGGCAAAG 1196
|||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1131 AGATTCAACAGATGATTGGAAGATTCAAGCTATGTTTGATGATGATGCTAGATGGCAAAG 1190
Query 1197 CTTAGTTTCTTTACTCGGCTTGGTTGATAGTTACTCAGGTGATGTGGGCAATCAGACTGG 1256
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1191 CTTAGTTTCTTTACTCGGCATGGTTGATAGTTACTCAGGTGATGAGGGCAATCAGACTGG 1250
Query 1257 TTCATCATTGATTGGTGGGCATAAAAACTACAACAATAAAACACATGGTAGCTGTACAGA 1316
|||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 1251 TTCATCATCGATTGGTGGGCATAGGAACTACAACAATAAAACACATGATAGCTGTAAAGA 1310
Query 1317 CATGAACAAGAAGACTTGTTGGCCACAATACTTAGATGCCTTGCAGTTCTTGTGCCAACC 1376
|| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||
Sbjct 1311 CAGGAACAAGATTACTTGTTGGCCACAATACGTAGATGCCTTGAAATTCTTGTGCCAACC 1370
Query 1377 ACTTGCAGACTTGATATATTCTGTGAAAAGAAAGATTGTGCTGGAGACAGAAATGTCCTG 1436
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1371 GCTTGCAGACTTTATATATTCTGTGAAAAGAAAGATTGTGCTGGAGACAGAAATGTCATG 1430
Query 1437 CGCTTCTGCTCATCTAACTACTATTCACGATGCCTTTCTCCAATTTTGTGATGGCTGTCT 1496
||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1431 CGCCTCTGCTCATCTAATTACTATTCACGATGCCTTTCTCCAGTTTTGTGATGGCTGTCT 1490
Query 1497 CTTCCTTCAGAGATGCACGTCTGACAAGGGAGATAGCGAAACTGACAATAACAAAGCTTT 1556
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||
Sbjct 1491 CTTCCTTCAGAGGTGCACGTCTGACAAGGGAGATAGAGAAATTGCCAATAACAAAGCTTT 1550
Query 1557 GTTAAACGTGGCTATGGGTGCTTTCATTGTCTCATTGAAAACCCAGCTTAAATTGCAGAT 1616
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||
Sbjct 1551 CTTAAACGCGGCTATGGGTGCTTTCATTGTCTCATTGAGAACCCAACTTAAATTGGAGAT 1610
Query 1617 CAGTGCCCATCTAGTTGAGGATGTAATTGCCAGTCCATGGATCCGATCTCAAGAACTCAA 1676
|||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1611 AAGTGCCCATCTAGTTGAGGATGTAATTGGAAGCCCATGGATCCAATCTCAAGAACTCAA 1670
Query 1677 GTATCTAATTGCGACGCTTTACAATATTGGTATCGTTTTGTACAGAAATAAGGAGCTAAA 1736
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1671 GTATCTAATTGCGACGCTGTACAATATTGGTATCGTTTTGTACAGAAATAAGGAGCTAAA 1730
Query 1737 CAAGGCTTGTGAGGCACTCAAGCTGTGCTCTAAGGCATCATGGAGATGTGTTGAGCTACA 1796
||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1731 CAAGGCTTGTGAGGCGCTTAAGCTGTGCTCCAAGGTATCATGGAGATGTGTTGAACTACA 1790
Query 1797 TTGTCAGATGTTTGTAAATCAGTCTAGTTCATCTGATAATGACATGTCAGAAGATGCCAT 1856
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1791 TTGTCATATGTTTGTAAATCAGTCTAGTTCATCTGATAATGACTTGTCAGAAGATGCCAT 1850
Query 1857 TATGGATTTTGTGGGCGAAGCATGTAATAGGTGTGCATTCTACCTGGATATACTCCAGAA 1916
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 TATGGATTTTGTGGGCGAAGCATGTAATAGGTGTGCATTCTACCTGGATATACTCCAGAA 1910
Query 1917 ATGTAGCAGACATAAGATTAGACAGAATATTGTTCATATTCTACAAAATTGGTTGTCAGC 1976
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1911 ATGTAGCAGACGTAAGATTAGACAGAATATTGTTCATATTCTAGAAAATTGGTTGTCAGC 1970
Query 1977 TGAACATCTGATTAGAAGGTTACCAGGCCCTGAGGCAATTGTAAAGCAATGGGTTAAGAT 2036
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1971 TGAACATCTGATTAGACGGTTACCAGGCCCTGAGGCAATTGTAAAGCAATGGGTTAAGAT 2030
Query 2037 AGAACGGGAATGTCACACGGATCTGGATGCGGCAGATTCTTGTACAACTTTGTACTCATT 2096
||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2031 AGAGCGGGAATGTCACACGGATCTGGATGCGGCAGGTTCTTGTACAACTTTGTACTCATT 2090
Query 2097 GTTATCATCTTCTCaaaaaaaGTCAAAGCGTGGTATCGGAAAAATCCTAGAGCAGGAGCT 2156
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2091 GTTATCATCTTCTCAAAAAAAGTCAAAGCGGGGTATCGGAAAAATCCTTGAGCAGGAGCT 2150
Query 2157 TCTTGCCTATGATAGAGTGCTT-CCTTTAAGGTCAAATCTAGGTCAACAAACTCGAATCA 2215
|||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2151 TCTTGCCTATGACAGAGTG-TTACCTTTAAGGTCAAATCTAGGTCAACAAACGCGAATCA 2209
Query 2216 AGATAACAGATATCCTTTTGAAGGATGTTTATGTCACTGAGGATATGCATATAGAGAGAG 2275
||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2210 AGATAGCAGATATCCTCTTGAAGGATGTTTATGTCACTGAGGATATGCATATAGAGAGAG 2269
Query 2276 CAAGAATCTTGATATGGAAAGCACAAATGACAAGGACATCTGGAACTGAACATATAACCG 2335
||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2270 CAAGAATTTTGATATGGAAAGCACGAATGACAAGGACATCTGGAACTGAACATATAACCG 2329
Query 2336 AGTGCATTTGTTTTCTGTCCGAAGCAATCTCTATATTGGGTGTGTTACATCATGGGCCAA 2395
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2330 AGTGCATTTGTTTTCTGTCTGAAGCAATCTCTATATTGGGTGAGTTACATCATGGGCCAA 2389
Query 2396 ATAAAGAGGGTTCTCCATCTTCTCCCATGTTACCTATTGCGTATTGCTTGAGAGCTTTTT 2455
|| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2390 ATGAAGAGGGTTCTCCATCTTCTCACATGTTACCTATTGCGTATTGCTTGAGAGCTTTTT 2449
Query 2456 GTACCCAGGAAGCTGAGCCAAACTCGAAGAAAGTCTTTCAAGATATTAGCACTTCACTAA 2515
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2450 GTACCCAGGAAGCTGACCCAAACTCGAAGAAAGTCTTTCAAGATATTAGCACTTCACTAA 2509
Query 2516 ATCTCTGGCTGAA-GATTCTTAGCCTAGATGATAGTGGGGACAGTCTACCAACAGAAAAC 2574
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct 2510 ATCTCTGGCT-AAGGATTCTTAGCCTAGATGATAGTGGAGACAGTCTACCAACAGAGAAT 2568
Query 2575 ATAATTCCGTTACTGTATAATATGATTGATTTGATGTCAGTGAAGGGATGTACAGAGCTC 2634
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2569 ATAATTCCGTTACTGTATAATATGATTGATTTGATGTCAGTGAAGGGATGTACAGAGCTC 2628
Query 2635 CATCATCATATATACCAACTGATTTTCAGATTGTTTAAATGGAAGAAAGTCAAATTGGAG 2694
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2629 CATCATCATATATACCAACTGATTTTCAGATTGTTTAAATGGAAGAATGTCAAATTGGAG 2688
Query 2695 GTCTGCCTTGCAATGCTGTGGGAATGTAGAAGGCTTAGTCATGCCTTATGCCCTTCCCCC 2754
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2689 GTCTGCCTTGCAATGCTGTGGGAATGTAGAAGGCTTAGTCATGCCTTATGCCCTTCCCCC 2748
Query 2755 ATAAGTGATGCCTTTATCCAGACCTTATCAGAGAATTGTGGTGACAAATCCACATGCATT 2814
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2749 ATAAGTGATGCCTTTATCCAGACCTTATCAGAGAATTGTGCTGACAAATCCACATGCATT 2808
Query 2815 GATTTCTGGATGGATTGCCTGAAAGATTCAAAAGCAAAGCTAATTGGGTTCCAGCAGAAC 2874
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2809 GATTTCTGGATGGATTGCCTGAAAGATTCAAAAGCAAAGTTAATTGGGTTCCAGCAGAAC 2868
Query 2875 TTCCATGATTTACATAATAAGGATGAAGGTCCCTTTCAATCAGACTTCACAATAGGCGAT 2934
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||
Sbjct 2869 TTCCATGATTTACATAATAAGGATGAAGGTCCCTTTCAATCAGACATCACAATTGACGAT 2928
Query 2935 ATTAAAGATGCAGCTTCAGAACTCATTTCCAGTGCGTCACTCTCTGGTAATTCATCTTTT 2994
|||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2929 ATTAAAGATGCAGCATCAGAACTCATCTCCAGTGCATCACTCTCTGGTAATTCATCTTTT 2988
Query 2995 GTAGCTGCATATCTCTATTATGATCTCTGTGAAAGGCTCATATCATTTGGAAAACTTTCT 3054
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2989 GCAGCTGCATATCTCTATTATGATCTCTGTGAAAGGCTCATATCATTTGGAAAACTTTCT 3048
Query 3055 GAGGCTCTTTCATATGCAAAAGAAGCCTATAGGATACGGACTCTTATATTTCAAGAGAAA 3114
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3049 GAGGCTCTTTCATATGCAAAAGAAGCCTATAGGATAAGGACTCTTATATTTCAAGATAAA 3108
Query 3115 TTTAAGTATACAGCTGAGAAGAAGT-TCGTAAAACACAATGACGCTGGAAAAATATCAGA 3173
||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||| | ||| |||||||||||
Sbjct 3109 TTTAAGTATACAGCTGAGAAGCA-TATCGAAAAACACAATGAAGATGGGAAAATATCAGA 3167
Query 3174 GATACGGACTTTTGGCATAAAAAATTTCCAAGTCTACAGATTGTTCGCAACTGATTTTTG 3233
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3168 AATACGGACTTTTAGCATAAAAAATTTCCAAGTCTACAGATTGTTAGCAACTGATTTTTG 3227
Query 3234 GCCATGTGGAAATTTTCTCTGGGACATCAATTGCTGCTACCTAAGTCCTTGGAGTGTACT 3293
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3228 GCCATGTGGAAATTTTCTCTGGGACATCAATCGCTGCTACCTAAGTCCTTGGAGTGTACT 3287
Query 3294 CCAATGTTATTTGGAAAGCACCCTTCAGGTTGGAATTCTGAATGAGCTAATAGGGAATGG 3353
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3288 CCAATGTTATTTGGAAAGCACCCTTCAGGTTGGAATTCTGAATGAGCTCATAGGGAATGG 3347
Query 3354 ACTGGAGGCAGAAACCATTCTATCATGGGGAAAAGCCTTTTCATGCTCGCAAAGTCTATT 3413
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3348 ACTGGAGGCAGAAACCATTCTATCATGGGGGAAAGCCTTTTCATGCTCGCAAAGTCTATT 3407
Query 3414 CCCTTTCATAGTTGCATTTTCTTCTGCCTTAGGAAATCTTTACCACAAAAAGCAGTGTCT 3473
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3408 CCCTTTTGTAGTTGCATTTTCTTCTGCCTTAGGAAATCTATACCACAAAAAGCAGTGTCT 3467
Query 3474 GGATCTGGCAGAAATTGAACTCCAAAATGCAAAAGAGATATTAATTGCTAATCAGCGAGA 3533
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3468 GGATCTGGCAGAAAAGGAACTCCAAAATGCAAAAGAGATATTAATTGCTAATCAGCGAGA 3527
Query 3534 TTTTTCTTGTTTTAAGTGCAAACTGAAGTTGGAAGTTACATTGGATAAACAACTTGGAGA 3593
||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3528 TTTTTCTTGCGTAAAGTGCAAACTGAAGTTGGAAGTTACATTGGATAAACAACTTGGAGA 3587
Query 3594 CATATCTCGGaaaaaaaTTGATAGAGTTTCCCAGACAGATGGATTTTTGCATGCTGAAAG 3653
||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3588 CATATCTCGGAAACAAATTGATAGAGTTTCACAGACAGATGGATTCTTGCATGCTGAAAG 3647
Query 3654 CTTGTTTAGTGCTGCCCTGGGAAAAGTCTGTTGCTCAGCATGGAAAAGCTGCATTAGATC 3713
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3648 CTTGTTTAGTGCTGCCCTGGGAAAATTCTGTTGCTCAGCATGGAAAAGCTGCATTAGATC 3707
Query 3714 ACATGGGGAAGAAATTGCTGAGGAAATAGTGGTTAATAGAAATGGAGGGGACGGTTTAGG 3773
|||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3708 ACATGGGGAAGAAATTGCTGAGGAGATAGTGATTGATAGAAATGGAGGGGAAGGTTTAGG 3767
Query 3774 ACATAAATCAAGTAAAACGAAGCTCAGTATAAAGGAGCCACCAGGAAACAGAGGCTCCAG 3833
|||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3768 ACATAATTCAAGTAAAACAAAGCTCAGTATAAAGGAGCCACCAGGAAACAGAGGCTCCAG 3827
Query 3834 GAGGGGTCTAAGAGCTAACCAAACTTGTTTGTCAAAGGACCAGGATTTGATATCTGAGCC 3893
||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3828 GAGGGGTGGAAGAGCTAACAAAACTTGTTTGTCAAAGGATCAGGATTTGATATCTGAGCC 3887
Query 3894 AACGTCAAGGTTGACTCGATCTATGCGTCACTCACTTAAAGAGCAATGCCAAAACCGTTC 3953
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3888 AACATCAAGGTTGACTCGATCTATGCGTCACTCACTTAGAGAGCAATGCCAAAACCGTTC 3947
Query 3954 TAATGTGCCTGAAGTTGTTTCAAAGAAGCCTAATTTCTGTGATAGATCTGTTGGTTCTAG 4013
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3948 TAATGTGCCTGAAGTTGTTTCAAAGAAGCCTAATTTATGTGATAGATCTGTTGGTTCTAG 4007
Query 4014 GGGTGAAAGGGTGTTGTTGGACACAAAAAATGCAGTCCCTGGATTTTGCATTTGCTACAA 4073
|||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||| ||||| |||||||||||
Sbjct 4008 GGGTGAAAGGGTTTTGTTGGACACGAGTAATGCACTCCCTGGCTTTTGTATTTGCTACAA 4067
Query 4074 AGAAAAATGTCAGCAGTGCTTCTCCGAAGGAGTAACAGAATCTGGGTCTCTCAACAATCT 4133
||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 4068 AGAAAAACGTCAGCAGTGCCTCTCGGAAGAAGTAACAGAATCTGGGTCTCTCAACAATTT 4127
Query 4134 AGTAAGTTTGAAATGGAAACTCTGCCATAGGAAGCTTGCGTCCTCAATACTTGTTAGCCT 4193
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4128 AGTAAGTTTGAAATGGGAACTCTGCCATAGGAAGCTTGCGTCCTCAATACTTGTTAGCCT 4187
Query 4194 GGGAAAATGTTTGGCAGACTCTGGTAGAGTTCATCTAGCTCATGAGGCTTTACTGCATAG 4253
||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4188 TGGAAAATGTTTGGGAGACTCTGGTAGAATTCATCTAGCTCATGAGGCTTTACTGCATAG 4247
Query 4254 TATCTCTGTTTTATTTAAAAGCAACTGGTCCAGCCACAACCAGCCTTCTGTCTA-TCAGT 4312
||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||
Sbjct 4248 TATCTCTGTTTTATTCAAAAGCACCTGGTCCAGCCACAACCAGCCTTCTGTC-AGTCAGT 4306
Query 4313 TGCTGGAGTTTATCGGGAAAGAAGTTACAAGAGATGTATTTGCTGTTGACCGTGCAATAA 4372
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||
Sbjct 4307 TGCTGGAATTTATCGGGAAAGAAGTTACAAGAGATGTATTTGCCGTTGATCGTGCAATAA 4366
Query 4373 TACTATACAACTTGTGCTGGTTGAATTTGCGGAATTACCACTGCAGGGATAGTAGGTCTA 4432
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||
Sbjct 4367 TATTATACAACTTGTGCTGGTTGAATTTGCGGAATTACCACTGCAGGAAGAGTAGGTCTA 4426
Query 4433 TTTGCTGTGATCTGTTTCATATTCCTTTCACAAAACTGGTGTCATGGTTAATGTTAGCAT 4492
| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 4427 TCTGCTGTGATCTGTTTCATATCCCTTTCACAAAACTAGTGTCATGGTTAATGTTAGCAT 4486
Query 4493 TTGTACTCAGCAGAGCGGTTCCAATATTATTTCAAAAGGTTTCAAGATTGCTTGCCTCTT 4552
||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4487 TTGTACTCAGCGGAGAGGTTCCAATATTATTTCAAAAGGTTTCAAGATTGCTTGCCTCTT 4546
Query 4553 TATATCTACTTTCTTCCTCAAGTGCTGAATTCTCATTCGAATATGATGGAAGTGAGCTGT 4612
||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||
Sbjct 4547 TATATCTGCTTTCTTCCTCAAATTCTGAATTCACATTCGAATCTGATGGAAATGAGCTGT 4606
Query 4613 CAGCAAGTCATTGGGTCTCATTTTTCCATCAAGCCTCGCTTGGTACCCATATCAGTTATC 4672
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
Sbjct 4607 CAGCAAGTCATTGGGTCTCATTTTTCCATCAAGCCTCGCTTGGTACCCATCTCAGTTACC 4666
Query 4673 ATTTCATTTCAAAGTTGAGTCAAAAACACAAATCACGGTGCCTCTCAGATAAAGAGTGCA 4732
||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 4667 ATTTCATTTCAAATTTGAGCCAAAAACACAAATCACAGTGCCTCTCAGATAAAGAGTGCA 4726
Query 4733 CAGAGGCTACTTGCTCGAGTTGCATGGTTCCTGAGGATTTGGACTTACCCAGGCTTGCTC 4792
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4727 CAGAGGCTACTTGCTCGAGTTGCATGGTTCCTGAGGATTTGGACTTACCCAGGCTTGCTC 4786
Query 4793 CTGAGCGTACTCAAGATCTTGTACAATTCGCTAAAGAATTTTTCATCAATCTTCCAAGCT 4852
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4787 CTGACCGTACTCAAGATCTTGTACAATTCGCTAAAGAATTTTTCATCAATCTTCCAAGCT 4846
Query 4853 CAACAATCATCTGCATTAGTTTGCTTGGAGGTGCTTTAAACCAATTGTTACAGGAGCTAA 4912
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4847 CAACAATCATCTGCATTAGTTTGCTTGGAGGTGCTTTAAACCAATTGTTACAGGAGCTAA 4906
Query 4913 TGCATATTCGTTCACCTGTTTGTGCCTGGGTGCTCATATCGCGCCTAAACCCAGAAAGTC 4972
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 4907 TGCATATTCGTTCACCTGTTTGTGCCTGGGTGCTCATATCACGCCTAAACCCAGAAAGTC 4966
Query 4973 AACCGGTTGCCACACTTCTATCTGTAGATTCGATTCTAGAAGACATGTCAGATAACAGTG 5032
||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 4967 AACCGGTTGCCACACTTTTACCTGTAGATTCGATTGTAGAAGACATGTCAGATGACAGTG 5026
Query 5033 CAAACCTTAGCTCTACGGAAGCGACTCAAGTTAAGAGTTTAAAGGGGCCTTGGCTTTGTC 5092
|||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 5027 CAAATCTTAGCTCTACCGAAGCGACTCAAGTCAAGAGTTTAAAGGGGCCCTGGCTTTGTC 5086
Query 5093 CATGGGGTGCCACCGTGGTTGATGAGGTAGCTCCAGCATTTAGATCAATATTGGAGGAAA 5152
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 5087 CATGGGGTACCACCGTGGTTGATGAGGTAGCTCCAGCATTTAAATCAATATTGGAGGAAA 5146
Query 5153 GCTACTCATCTTCTTCTACTCCTGAAGAAGACACAATAGAGAGTAGGGGCCTGTGGTGGA 5212
|| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5147 GCCACTCATCTTCTTCTACTACTGAAGAAGACACAATAGAGAGTAGGGGCCTGTGGTGGA 5206
Query 5213 AAAAGAGGAAGAAACTTGATCATCGTCTGGGAATATTCCTAAGGAATCTAGAAGCTTCAT 5272
||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 5207 AAAAGAGAAAGAAACTTAATCATCGTCTGGGAATATTCCTAAGGAATCTAGAAGCTTCCT 5266
Query 5273 GGCTGGGCCCCTGGAGGTGTCTGCTTCTTGGAGAATGGTCGAACTACAAATTGCCTGCCT 5332
||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 5267 GGCTGGGTCCCTGGAGGTGTCTGCTTCTCGGAGAATGGTCGAACTACAAATTGCCTGACT 5326
Query 5333 CAGTGCAGAAAAAGCTGGTAAATGATCTCAAGTCCAAGTGCAAAATGGAAGTAAATGAGA 5392
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5327 CAGCGCAGAAAAAGCTGGTAAATGATCTCAAGTCCAAGTGCAAAATGGAAGTAAATGAGA 5386
Query 5393 TGCTTTTGAAGGTTATTCTTGGAGGTGGGACAGACAACTTTAAAGGAGAAGCATGTGTCG 5452
||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |
Sbjct 5387 TGCTTTTGAAGGTTATTCTTGGAGGTGGGACGGATAACTTTAAAGGAGAAGCATGCGTTG 5446
Query 5453 CTCAGCTTTCTTTAAGAAATGGTTGCTATGTAGGTAGAGGGGGATATCTTTATGAAGAAG 5512
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5447 CTCAGCTTTCTTTAAGAAATGGTTGCTATGTAGGTAGAGGGGGATATCTTTATGAAGAAG 5506
Query 5513 ATAGCTGTAAAACTCCTACTGCTGCGTCTAATATATCTGAAAGTAGGCATGAATTAGCCT 5572
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 5507 ATAGCTGTAAAACTCCTACTGCTGCGTCTAATATATCTGAAAGTAGGCATGAATTGGCCT 5566
Query 5573 TAAAACTGATACATGACGCAGCAAGCAAACTAGGGCAACAAGATGGAGATGAAAATAGAG 5632
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 5567 TAAAACTGATACATGACGCAGCAAGCAAACTAGGGCAACAAGATGGACATGAAAATAGAG 5626
Query 5633 AACCTATCATTCTTGTGTTAGATCCTGAGGTTCAGATGCTTCCTTGGGAGAATATTCCAA 5692
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5627 AACCTATCATTCTTGTGTTAGATCCCGAGGTTCAGATGCTTCCTTGGGAGAATATTCCAA 5686
Query 5693 TACTAAGGAAACAGGAGGTGTACCGCATGCCTTCCGTAGGTTGCATATCTGCTGTGCTAA 5752
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 5687 TACTAAGGAAACAGGAGGTGTACCGCATGCCTTCCGTAGGTTGCATATCTGCCGTGCTAA 5746
Query 5753 AGAAGCGCAGTG---AAGGAGAGCCAGCAAGATCTCATGTTGCTTCCTTCCCTCTTATTG 5809
||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5747 AGAAGCGCAGTCTTCAAGGAGAGCCAGCAAAATCTCATGTTGCTTCCTTCCCTCTTATTG 5806
Query 5810 ATCCGCTAGATTCATTTTACTTGTTGAATCCTGGTGGTGATCTCACCGATACCCAAGACA 5869
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||
Sbjct 5807 ATCCGCTAGATTCATTTTACTTGTTGAATCCTGGTGGTGATCTCACCGATACACAAGTCA 5866
Query 5870 AGTTTGAGAGTTGGTTCAGAGATCAAAACTTTGAGGGGAAAGCTGGATTAGAACCAAGTG 5929
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||
Sbjct 5867 CGTTTGAGAGTTGGTTCAGAGATCAAAACTTTGAGGGTAAAGCTGGGTCAGAACCAAGTG 5926
Query 5930 CTATAGAGTTGACAGAAGCATTAAAAACTCATGATCTCTTTCTATACTTTGGTCATGGAA 5989
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5927 CTATAGAGTTGACAGAAGCATTAGAAACTCATGATCTCTTTCTATACTTTGGTCATGGAA 5986
Query 5990 GCGGAGCACAGTATATACCTAGGCGCGAAATAGAGAAGCTAGATAACTGTTCTGCAACTT 6049
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5987 GCGGAGCACAGTATATACCTAGGCGTGAAATAGAGAAGCTAGATAACTGTTCTGCAACTT 6046
Query 6050 TCTTAATGGGATGCAGTAGTGGTTCACTATGGCTAAAAGGCTGCTACATCCCAGAAGGCA 6109
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 6047 TCTTAATGGGATGCAGTAGTGGTTCACTATGGCTAAAAGGCTGCTACATCCCACAAGGTG 6106
Query 6110 TACCACTTTCTTATCTCCTAGGTGGATCTCCAGCCATTGTGGCGACTCTATGGGACGTAA 6169
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6107 TACCACTTTCTTATCTCCTAGGTGGATCTCCAGCCATTGTGGCGACTCTATGGGACGTAA 6166
Query 6170 CAGACCGAGACATTGATCGGTTTGGGAAAGCGTTGTTGGAAGCATGGTTGCAAGAGAGGT 6229
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6167 CAGACCGAGACATTGATCGGTTTGGGAAAGCGTTGTTGGAAGCATGGTTGCAAGAGAGGT 6226
Query 6230 CAGATTCTTGTTCAGAGGGTGGTTGCAGCCAGTGTGAGTCGTTAGCAAATGAACTTGCAG 6289
||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||
Sbjct 6227 CAGATTCTTCTTCAGAGGGTGGCTGCAGCCAATGTGAGTCATTAGCTAATGACCTTGCAG 6286
Query 6290 CCATGAATCTAAAAGGCACCAACAACACCAAGAGGTCAAGGAAACCGTCATCGCGTAACA 6349
| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 6287 CAATGACTCTAAAAGGCACCAA---------GAGGTCAAGGAAACCATCATCGCGTAACA 6337
Query 6350 AGCCAGCTAAATCAAATGTCGATGGGTCAGGGAAGATTGAGTGCAACCACAAGCATAGAC 6409
|||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6338 AGCCAGCTCAATCAGATGTGGATGGGTCAGGGAAGATTGAGTGCAACCACAAGCATAGAC 6397
Query 6410 GTAAAATCGGTTCATTCATAGCCGCGGCTCGAGATGCGTGCACCTTGCAATACTTGATTG 6469
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 6398 GTAAAATCGGTTCATTCATAGCCGCGGCTCGAGATGCGTGCAACTTGCAATACTTGATTG 6457
Query 6470 GGGCTGCGCCTGTCTGTTATGGTGTACCAACTGGTATCACAAGGAAAAAAGGAATTGATG 6529
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 6458 GGGCTGCGCCTGTCTGTTATGGTGTGCCAACTGGTATCACTAGGAAAAAAGGAATTGATG 6517
Query 6530 CTCTTCTTCCTTCTACTTCTTCATCTTGTTAGTAGGTTAGAGCATCTCTAAAAATCCTCA 6589
|||||||||||||| | | || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 6518 CTCTTCTTCCTTCT--T-CATC-TC--GTTAGTAGGTTAGAGCATCTCTTAAAATCCTCA 6571
Query 6590 TTGTTTGGTCGTATAACAATTGTGAGGTAGCaaaaaaaTTTAGGAGTTAGGACGTCAAAT 6649
||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| ||
Sbjct 6572 TTGTTTGGTCGTATAACAATTTTGAGGGAGCAAATAAATTTAGGAGTTAGGACTTCAGAT 6631
Query 6650 CAGAGATCTTATGACAGCAACACAAGAGAAGAGaaaaaaaGGAGACTCTGGTCTAGAGAT 6709
||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||
Sbjct 6632 CAGAGATTTTATGACAACAACGCAAGAGAAGAGAAAAAA-GGAGACTCTAGTCTAGAGAT 6690
Query 6710 ATATATTCATCCCTGTTTTT--ATATAACAAA-TTGTAAAAAGGAATATCACATGATGTA 6766
|||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 6691 ATATATTCATCCCTGTTTTTTTATATAACAAAATTGTAAAAAAAAATATCACATGATGTA 6750
Query 6767 TTGTCCTCAAATTCTATATTATAAAAGTG 6795
|||||||| |||||||| |||||||||||
Sbjct 6751 TTGTCCTCGAATTCTATGTTATAAAAGTG 6779
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 339252318547
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5