BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg492777
Length=3357
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT4G21100.1 | Symbols: DDB1B | damaged DNA binding protein 1B |... 5489 0.0
AT4G05420.1 | Symbols: DDB1A | damaged DNA binding protein 1A |... 3807 0.0
> AT4G21100.1 | Symbols: DDB1B | damaged DNA binding protein 1B
| chr4:11258761-11265463 REVERSE LENGTH=3576
Length=3576
Score = 5489 bits (2972), Expect = 0.0
Identities = 3250/3382 (96%), Gaps = 28/3382 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGTTTAAATCTCAAAGAGAACCCAGAAGCTTCTTATAAAAGAGGCGGGAAATTTCTCACG 60
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 43 CGTTTAAATCTCAAAGAGAACCCAGAAGCTTGGTATAAAAGAGGCGGGAAATTTCTCACG 102
Query 61 CGTG-T----T-----G--------C-A---TTTTTCTGGGCCAAGAAGAAAATGAGCGT 98
||| | | | | | ||||||||||| |||||||| ||||||||
Sbjct 103 TGTGTTGCAATAGAAAGCAAAACCCCTAGTTTTTTTCTGGGCGAAGAAGAAGATGAGCGT 162
Query 99 ATGGAACTACGCCGTTACGGCTCAAAAACCGACCTGTGTCACTCACTCTTGCGTCGGAAA 158
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 163 ATGGAACTACGCCGTTACGGCTCAGAAACCGACCTGTGTCACTCACTCTTGCGTCGGGAA 222
Query 159 CTTCACCAGTCCTCAAGAACTCAATCTCATTGTTGCGAAATCCACTCGAATCGAGATCCA 218
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CTTCACAAGTCCTCAAGAACTCAATCTCATTGTTGCGAAATCCACTCGAATCGAGATCCA 282
Query 219 TCTGCTTTCTCCACAGGGACTTCAGACTATACTGGATGTTCCTCTATATGGGAGGATCGC 278
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 283 TCTGCTTTCTCCACAGGGACTTCAGACTATACTGGATGTTCCTCTATATGGGAGAATCGC 342
Query 279 CACTTTGGAATTGTTCCGTCCCCATGGTGAAGCACAAGATTTTTTGTTTGTTGCAACTGA 338
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 343 AACTATGGAATTGTTCCGTCCCCATGGTGAAGCACAAGACTTTTTGTTTGTTGCAACTGA 402
Query 339 GAGATATAAATTCTGCGTTCTTCAATGGGATTATGAGTCCTCTGAGCTTATAACAAGGGC 398
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 403 AAGATATAAATTCTGTGTTCTTCAATGGGATTATGAGTCCTCTGAGCTTATTACAAGGGC 462
Query 399 AATGGGGGATGTTTCTGATCGTATAGGCCGACCGACGGACAATGGTCAGATTGGTATAAT 458
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 463 AATGGGGGATGTTTCTGATCGTATAGGCCGACCGACAGACAATGGTCAGATTGGTATAAT 522
Query 459 TGATCCTGATTGCAGATTAATTGGTCTGCATCTGTATGACGGCTTGTTTAAGGTCATTCC 518
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 523 TGATCCTGATTGCAGAGTAATTGGTCTGCATCTGTATGACGGCTTGTTTAAGGTCATTCC 582
Query 519 ATTTGACAATAAAGGACAGCTCAAGGAAGCTTTTAACATAAGGCTGGAGGAGTTGCAGGT 578
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 583 ATTTGACAATAAAGGACAGCTCAAGGAAGCCTTTAACATAAGGCTGGAGGAGTTGCAGGT 642
Query 579 CCTAGATATCAAGTTTCTGTATGGATGCACGAAGCCAACAATTGCAGTACTTTATCAGGA 638
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 643 CCTAGATATCAAGTTTCTGTATGGATGCACGAAACCAACAATTGCAGTACTTTATCAGGA 702
Query 639 CAACAAAGATGCTCGTCATGTCAAAACATATGAAGTTTCTCTAAAGGAGAAGGACTTTGT 698
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||
Sbjct 703 CAACAAAGATGCTCGTCATGTCAAAACATATGAAGTTTCTCTAAAGGATAAGAACTTTGT 762
Query 699 CGAAGGTCCATGGTCACAGAACAATCTCGATAATGGTGCTGACTTATTGATCCCTGTACC 758
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 763 CGAAGGTCCATGGTCACAGAACAATCTCGACAATGGTGCTGACTTATTGATCCCTGTACC 822
Query 759 TTCTCCTCTGTGTGGCGTCCTCATCATTGGAGAAGAAACAATTGTCTATTGTAGTGCCAA 818
||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 823 TTCACCTCTATGTGGCGTCCTCATCATTGGGGAAGAAACAATTGTCTATTGTAGTGCCAA 882
Query 819 TGCATTCAAAGCAATCCCAATAAGACCTTCCATCACAAAAGCATATGGAAGAGTTGATCT 878
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 883 TGCATTCAAAGCAATACCAATAAGACCTTCCATCACAAAAGCATATGGAAGAGTTGATCT 942
Query 879 TGATGGTTCTAGGTATCTTCTTGGTGACCATACCGGACTGATTCACCTGCTTGTTATAAC 938
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 943 TGATGGTTCTAGGTATCTTCTTGGTGACCATGCCGGACTGATTCACCTGCTTGTTATAAC 1002
Query 939 CCATGAGAAAGAAAAGGTCACTGGCCTCAAAATTGAGCTTTTGGGTGAAACCTCTATTGC 998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1003 CCATGAGAAAGAAAAGGTCACTGGCCTCAAAATTGAGCTTTTGGGTGAAACCTCTATTGC 1062
Query 999 ATCTTCCATCTCGTATCTTGACAATGCTGTCGTCTTTGTCGGTTCAAGCTATGGAGATTC 1058
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1063 ATCTTCCATCTCGTATCTGGACAATGCTGTCGTCTTTGTCGGTTCAAGCTATGGAGATTC 1122
Query 1059 ACAGCTTATTAAGCTAAACTTGCAACCGGATGCAAAAGGTTCATACGTAGAAATTTTAGA 1118
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 1123 ACAGCTTATTAAGCTAAACCTGCAACCGGATGCAAAAGGGTCATATGTAGAAATTTTAGA 1182
Query 1119 AAAGTATGTCAACCTGGGGCCTATTGTTGACTTCTGTGTAGTTGACCTTGAGAGACAGGG 1178
||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1183 AAAGTATGTCAACTTGGGGCCTATTGTCGATTTTTGTGTAGTTGACCTTGAGAGACAGGG 1242
Query 1179 GCAAGGTCAGGTTGTAACTTGCTCTGGAGCATACAAGGATGGTTCTCTTCGCATAGTTCG 1238
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1243 GCAAGGTCAGGTTGTAACTTGCTCTGGAGCATACAAGGATGGTTCTCTTCGCATAGTTCG 1302
Query 1239 CAATGGGATAGGAATAAATGAACAGGCGTCCGTGGAACTTCAAGGCATCAAAGGAATGTG 1298
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1303 CAATGGGATAGGAATAAATGAACAGGCGTCCGTGGAACTTCAAGGCATCAAAGGAATGTG 1362
Query 1299 GTCGTTGAAATCGTCAATTGATGAAGCCTTTGATACATTCCTTGTAGTTAGTTTTATCAG 1358
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1363 GTCGTTGAAATCGTCAATTGATGAAGCCTTTGATACATTCCTTGTAGTTAGTTTTATCAG 1422
Query 1359 TGAAACTCGTATACTAGCCATGAATATAGAGGATGAACTGGAAGAAACAGAGATTGAAGG 1418
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1423 TGAAACTCGTATACTAGCCATGAATATAGAGGATGAACTGGAAGAAACAGAGATTGAGGG 1482
Query 1419 TTTCTTGTCTGAAGTGCAGACTTTATTTTGCCATGATGCTGTCTACAACCAACTTGTACA 1478
||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1483 TTTTTTGTCTGAAGTTCAGACTTTATTTTGCCATGATGCTGTCTACAACCAACTTGTACA 1542
Query 1479 GGTTACCTCAAATTCTGTTAGATTAGTTAGTTCTACAACTAGAGAATTGCGGAATAAGTG 1538
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 1543 GGTTACCTCAAATTCTGTTAGATTAGTTAGTTCTACAACTAGAGAGTTGCGGAATAAATG 1602
Query 1539 GGATGCCCCAGCTGGATTCGCTGTTAATGTTGCAACTGCAAATGCTAGCCAGGTGCTTTT 1598
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||
Sbjct 1603 GGATGCCCCAGCTGGATTCTCTGTTAATGTTGCAACTGCAAATGCGAGCCAGGTTCTTTT 1662
Query 1599 GGCCACTGGAGGTGGGCATTTGGTCTATCTAGAAATTGGGGATGGGACATTGACGGAAGT 1658
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1663 GGCCACTGGAGGTGGGCATTTGGTCTATCTAGAAATTGGGGATGGGACATTGACGGAAGT 1722
Query 1659 CAAACATGTCCTGTTGGAGTACGAGGTTTCCTGTCTTGACATAAACCCCATTGGCGATAA 1718
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1723 GAAACATGTCCTGTTGGAGTACGAGGTTTCTTGTCTTGACATAAACCCCATTGGTGATAA 1782
Query 1719 TCCTAATTACAGTCAGCTAGCTGCAGTCGGGATGTGGACTGATATAAGTGTGAGGATTTT 1778
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1783 TCCTAATTACAGTCAGCTAGCTGCCGTCGGGATGTGGACTGATATAAGTGTGAGGATTTT 1842
Query 1779 TGTGCTGCCGGACTTGACTCTTATTACTAAGGAGCAACTAGGAGGAGAGATAATTCCCCG 1838
|||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1843 TGTGCTACCAGACTTGACTCTTATTACTAAGGAGGAACTAGGAGGAGAGATCATTCCCCG 1902
Query 1839 ATCTGTTCTTCTTTGTGCATTTGAAGGGATATCTTACTTGCTCTGTGCTCTTGGAGATGG 1898
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1903 ATCTGTTCTTCTTTGTGCATTTGAAGGGATATCTTACTTGCTCTGTGCTCTTGGAGACGG 1962
Query 1899 TCATCTCTTAAACTTCCAGTTGGATACAAGTAGCGGGAAATTAAGAGACCGGAAAAAAGT 1958
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1963 TCATCTCTTAAACTTCCAGTTGGATACAAGTTGCGGGAAATTAAGAGATCGGAAAAAAGT 2022
Query 1959 ATCACTTGGGACTC-AGCCTATAACTCTGCGTACTTTTTCATCTAAAAGTGCAACGCATG 2017
|||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2023 ATCACTGGGGACTCGA-CCTATAACTCTGCGTACTTTTTCATCTAAAAGTGCAACGCATG 2081
Query 2018 TCTTTGCTGCATCAGATAGACCAGCTGTTATATATAGCAACAACAAGAAGCTGTTATACA 2077
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2082 TCTTCGCTGCATCAGATAGACCAGCTGTTATATATAGCAACAACAAGAAGCTATTATACA 2141
Query 2078 GCAACGTGAATCTGAAAGAAGTTAGTCATATGTGTCCCTTCAACTCTGCTGCTTTTCCAG 2137
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2142 GCAACGTGAATCTGAAAGAAGTTAGTCATATGTGTCCCTTCAACTCTGCTGCTTTTCCAG 2201
Query 2138 ACAGTCTAGCAATTGCAAGGGAAGGCGAACTTACAATTGGCACCATCGATGACATTCAGA 2197
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2202 ACAGTCTAGCAATTGCAAGGGAGGGCGAACTTACAATTGGTACCATCGATGACATTCAGA 2261
Query 2198 AGCTTCACATACGTACCATTCCTATTGGAGAGCATGCTCGTCGCATATGCCATCAGGAAC 2257
||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||
Sbjct 2262 AGCTTCACATACGCACCATTCCCATTGGAGAGCATGCTCGTCGGATATGTCATCAGGAAC 2321
Query 2258 AAACACGGACATTTGCTATCTGCTGTTTGAGAAACCAACCAAGTGCAGAAGAATCTGAAA 2317
||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2322 AAACACGAACATTTGCTATCTCCTGTTTGAGAAACGAACCAAGTGCAGAAGAATCTGAA- 2380
Query 2318 T-GCATTTTGTCCGTCTGCTGGATGCCCAAAGTTTCGAGTTCTTGTCAACTTACCCTTTG 2376
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2381 TCGCATTTTGTCCGTCTGCTGGATGCCCAAAGTTTCGAGTTCTTGTCAAGTTACCCTTTG 2440
Query 2377 GATGCCTTTGAATACGGTTGCTCCATATTGAGCTGCTCGTTTACAGACGACAAAAATGTC 2436
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2441 GATGCCTTTGAATGTGGTTGCTCCATATTGAGCTGCTCGTTTACAGACGACAAAAATGTC 2500
Query 2437 TATTATTGTGTTGGTACGGCATATGTTTTGCCCGAGGAAAATGAACCCACTAAGGGAAGG 2496
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2501 TATTATTGTGTTGGTACAGCATATGTTTTGCCCGAGGAAAATGAACCAACTAAGGGAAGG 2560
Query 2497 ATACTGGTGTTTATAGTTGAAGAAGGGAGATTGCAGCTTATTACAGAGAAGGAAACCAAG 2556
||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2561 ATACTTGTGTTTATAGTTGAAGAAGGAAGATTGCAGCTTATCACAGAGAAGGAAACCAAG 2620
Query 2557 GGAGCTGTTTATTCTCTCAATGCCTTCAACGGCAAACTTCTTGCTGCTATTAATCAAAAA 2616
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2621 GGAGCTGTTTATTCTCTCAATGCCTTCAATGGCAAACTTCTTGCTTCTATTAATCAAAAG 2680
Query 2617 ATTCAGTTGTATAAGTGGATGCTACGGGATGATGGCACTCGCGAGCTGCAGTCTGAATGT 2676
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2681 ATTCAGTTGTATAAGTGGATGCTGCGGGATGATGGCACTCGCGAGCTGCAATCTGAATGT 2740
Query 2677 GGACATCACGGTCACATACTAGCTCTCTACGTGCAGACCCGTGGAGACTTCATCG-TCGT 2735
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||
Sbjct 2741 GGACATCACGGTCACATACTAGCTCTCTACGTGCAGACCCGTGGAGACTTCATCGCT-GT 2799
Query 2736 TGGTGACCTCATGAAATCAATCTCTTTATTGATCTACAAGCACGAGGAAGGTGCGATCGA 2795
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2800 TGGTGATCTCATGAAATCAATCTCTTTATTGATCTACAAGCACGAGGAAGGTGCGATCGA 2859
Query 2796 GGAAAGAGCTCGGGACTATAATGCAAACTGGATGGCGGCAGTTGAGATACTCGATGATGA 2855
||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2860 GGAGAGAGCTCGGGACTATAATGCAAACTGGATGACGGCAGTTGAGATACTCAATGATGA 2919
Query 2856 CATCTACCTCGGTGCTGATAATTGCTTCAACCTATTCACAGTAAAGAAGAACAATGAAGG 2915
||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||
Sbjct 2920 CATCTACCTCGGTACTGATAATTGCTTCAACATATTCACCGTAAAGAAGAACAACGAAGG 2979
Query 2916 TGCCACAGATGAAGAACGGGCTCGTATGGAGGTCGTTGGTGAGTATCACATAGGGGAATT 2975
||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2980 TGCTACAGATGAAGAACGTGCTCGTATGGAGGTGGTTGGTGAGTATCACATAGGGGAATT 3039
Query 2976 TGTGAACCGATTCCGCCATGGCTCTCTTGTTATGAGGCTTCCTGATTCAGAGATTGGTCA 3035
|||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||
Sbjct 3040 TGTGAACCGATTCCGCCATGGCTCTCTTGTCATGAAGCTGCCTGATTCAGATATTGGTCA 3099
Query 3036 GATACCGACCGTCATATTTGGCACTGTCAGTGGGATGATTGGAGTGATAGCTTCTCTGCC 3095
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3100 GATACCGACAGTCATATTTGGCACTGTCAGTGGGATGATTGGAGTGATAGCGTCTCTGCC 3159
Query 3096 TCAAGAACAGTATGCGTTTCTAGAGAAACTGCAGACGAGTCTGAGGAAAGTGATTAAAGG 3155
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3160 TCAAGAACAGTATGCGTTTCTAGAGAAACTGCAGACGAGTCTGAGGAAAGTGATTAAAGG 3219
Query 3156 AGTTGGTGGTCTAAGCCACGAGCAATGGAGATCATTCAACAACGAGAAAAGAACTGCGGA 3215
|||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3220 AGTTGGTGGTCTAAGCCACGAGCAGTGGAGATCGTTCAACAACGAGAAAAGAACTGCGGA 3279
Query 3216 AGCAAAGAGTTACTTGGATGGAGATCTAATTGAATCGTTCTTGGATTTGAGCAGAGGTAA 3275
||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3280 AGCAAAGGGTTACTTGGATGGAGACCTTATTGAATCGTTCTTGGATTTGAGCAGAGGTAA 3339
Query 3276 GATGGAGGAGATCTCTAAAGGTATGGATGTCCAAGTGGAAGAGTTGTGCAAGAGAGTTGA 3335
||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3340 GATGGAGGAGATCTCCAAAGGTATGGATGTTCAAGTGGAAGAGTTGTGCAAGAGAGTTGA 3399
Query 3336 AGAACTAACTAGGCTTCACTGA 3357
|||||| |||||||||||||||
Sbjct 3400 AGAACTCACTAGGCTTCACTGA 3421
> AT4G05420.1 | Symbols: DDB1A | damaged DNA binding protein 1A
| chr4:2746121-2752943 FORWARD LENGTH=3714
Length=3714
Score = 3807 bits (2061), Expect = 0.0
Identities = 2890/3295 (88%), Gaps = 38/3295 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 82 AAGAAGAAAATGAGCGT-ATGGAACTACGCCGTTACGGCTCAAAAACCGACCTGTGTCAC 140
|||| ||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||
Sbjct 159 AAGAGGAAGATGAGC-TCATGGAACTACGTTGTTACGGCTCACAAACCGACCAGTGTCAC 217
Query 141 TCACTCTTGCGTCGGAAACTTCACCAGTCCTCAAGAACTCAATCTCATTGTTGCGAAATC 200
|||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||
Sbjct 218 TCACTCGTGCGTTGGCAACTTCACAAGTCCTCAAGAGCTCAATCTCATTGTCGCGAAATG 277
Query 201 CACTCGAATCGAGATCCATCTGCTTTCTCCACAGGGACTTCAGACTATACTGGATGTTCC 260
|||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||| |||| |||| |||||
Sbjct 278 TACTCGAATCGAGATCCATTTGCTTACCCCACAAGGACTTCAGCCTATGTTGGACGTTCC 337
Query 261 TCTATATGGGAGGATCGCCACTTTGGAATTGTTCCGTCCCCATGGTGAAGCACAAGATTT 320
| ||||||| || ||||| ||| |||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||
Sbjct 338 TATATATGGAAGAATCGCTACTCTGGAGTTGTTCCGACCCCATGGCGAAGCGCAAGACTT 397
Query 321 TTTGTTTGTTGCAACTGAGAGATATAAATTCTGCGTTCTTCAATGGGATTATGAGTCCTC 380
|||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 398 TTTGTTCATTGCAACTGAGAGATACAAATTCTGTGTTCTTCAATGGGATCCTGAGTCCTC 457
Query 381 TGAGCTTATAACAAGGGCAATGGGGGATGTTTCTGATCGTATAGGCCGACCGACGGACAA 440
||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||
Sbjct 458 TGAGCTTATTACAAGAGCAATGGGGGATGTTTCTGATCGTATAGGCCGGCCAACAGACAA 517
Query 441 TGGTCAGATTGGTATAATTGATCCTGATTGCAGATTAATTGGTCTGCATCTGTATGACGG 500
|||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||
Sbjct 518 TGGTCAGATTGGTATAATTGATCCAGATTGTAGATTAATTGGACTCCATCTGTATGACGG 577
Query 501 CTTGTTTAAGGTCATTCCATTTGACAATAAAGGACAGCTCAAGGAAGCTTTTAACATAAG 560
|||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 578 CTTGTTCAAGGTTATTCCATTTGATAATAAGGGACAGCTCAAGGAAGCTTTTAATATCAG 637
Query 561 GCTGGAGGAGTTGCAGGTCCTAGATATCAAGTTTCTGTATGGATGCACGAAGCCAACAAT 620
||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||| | ||||| || ||
Sbjct 638 GCTTGAGGAATTGCAGGTTCTGGATATCAAGTTTCTGTTTGGATGTGCAAAGCCCACTAT 697
Query 621 TGCAGTACTTTATCAGGACAACAAAGATGCTCGTCATGTCAAAACATATGAAGTTTCTCT 680
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 698 TGCAGTACTATATCAGGACAACAAAGATGCTCGTCATGTCAAAACATATGAAGTCTCTCT 757
Query 681 -AAAGGAGAAGGACTTTGTCGAAGGTCCATGGTCACAGAACAATCTCGATAATGGTGCTG 739
|||| | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||
Sbjct 758 TAAAG-ATAAGGATTTTGTCGAGGGTCCATGGTCTCAGAACAGTCTCGACAATGGTGCTG 816
Query 740 ACTTATTGATCCCTGTACCTTCTCCTCTGTGTGGCGTCCTCATCATTGGAGAAGAAACAA 799
|||| |||| |||||||| | || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||
Sbjct 817 ACTTGCTGATTCCTGTACCACCACCGCTCTGTGGTGTCCTTATTATTGGTGAAGAAACAA 876
Query 800 TTGTCTATTGTAGTGCCAATGCATTCAAAGCAATCCCAATAAGACCTTCCATCACAAAAG 859
|||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 877 TTGTCTATTGCAGTGCTAGTGCATTCAAAGCAATACCAATAAGACCTTCCATCACTAAAG 936
Query 860 CATATGGAAGAGTTGATCTTGATGGTTCTAGGTATCTTCTTGGTGACCATACCGGACTGA 919
||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||| |||
Sbjct 937 CATATGGAAGAGTTGATGTTGATGGCTCTAGATATCTTCTTGGTGACCATGCTGGAATGA 996
Query 920 TTCACCTGCTTGTTATAACCCATGAGAAAGAAAAGGTCACTGGCCTCAAAATTGAGCTTT 979
|||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 997 TTCATCTGCTTGTTATAACGCACGAGAAAGAAAAGGTCACTGGCCTAAAAATTGAGCTTT 1056
Query 980 TGGGTGAAACCTCTATTGCATCTTCCATCTCGTATCTTGACAATGCTGTCGTCTTTGTCG 1039
|||||||||| ||||||||||| | || ||||| ||||||||||| || ||||||||||
Sbjct 1057 TGGGTGAAACATCTATTGCATCGACTATATCGTACCTTGACAATGCCGTTGTCTTTGTCG 1116
Query 1040 GTTCAAGCTATGGAGATTCACAGCTTATTAA-GCTAAA-CTTGCAACCGGATGCAAAAGG 1097
| ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||| || || || || |||||||||||
Sbjct 1117 GCTCAAGCTATGGTGATTCACAGCT-AGTAAAGCTGAATCTA-CACCCTGATGCAAAAGG 1174
Query 1098 TTCATACGTAGAAATTTTAGAAAAGTATGTCAACCTGGGGCCTATTGTTGACTTCTGTGT 1157
||||| |||||| | || |||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 1175 CTCATATGTAGAAGTCTTGGAAAGGTATATCAACTTGGGGCCTATTGTCGACTTTTGTGT 1234
Query 1158 AGTTGACCTTGAGAGACAGGGGCAAGGTCAGGTTGTAACTTGCTCTGGAGCATACAAGGA 1217
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||
Sbjct 1235 AGTTGACCTCGAGAGACAGGGGCAAGGTCAGGTTGTAACTTGTTCTGGAGCATTTAAGGA 1294
Query 1218 TGGTTCTCTTCGCATAGTTCGCAATGGGATAGGAATAAATGAACAGGCGTCCGTGGAACT 1277
|||||| || ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1295 TGGTTCCCTCCGCGTAGTTCGCAATGGAATAGGAATCAATGAACAGGCGTCTGTGGAACT 1354
Query 1278 TCAAGGCATCAAAGGAATGTGGTCGTTGAAATCGTCAATTGATGAAGCCTTTGATACATT 1337
|||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1355 TCAAGGTATCAAAGGAATGTGGTCGTTGAAATCTTCAATTGATGAAGCCTTCGATACATT 1414
Query 1338 CCTTGTAGTTAGTTTTATCAGTGAAACTCGTATACTAGCCATGAATATAGAGGATGAACT 1397
||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||
Sbjct 1415 TCTTGTTGTTAGCTTTATCAGTGAAACTCGCATATTAGCCATGAATCTTGAGGATGAACT 1474
Query 1398 GGAAGAAACAGAGATTGAAGGTTTCTTGTCTGAAGTGCAGACTTTATTTTGCCATGATGC 1457
|||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1475 GGAAGAAACAGAGATTGAGGGCTTCTTGTCTCAAGTGCAGACGTTATTTTGCCATGATGC 1534
Query 1458 TGTCTACAACCAACTTGTACAGGTTACCTCAAATTCTGTTAGATTAGTTAGTTCTACAAC 1517
||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||
Sbjct 1535 TGTGTACAATCAACTTGTACAGGTTACCTCAAATTCTGTTAGACTAGTCAGTTCTACAAC 1594
Query 1518 TAGAGAATTGCGGAATAAGTGGGATGCCCCAGCTGGATTCGCTGTTAATGTTGCAACTGC 1577
||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1595 TAGAGAATTGCGGGACGAGTGGCATGCCCCAGCTGGATTCACTGTTAATGTTGCAACTGC 1654
Query 1578 AAATGCTAGCCAGGTGCTTTTGGCCACTGGAGGTGGGCATTTGGTCTATCTAGAAATTGG 1637
|||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1655 AAATGCCAGCCAGGTTCTTTTGGCGACTGGAGGTGGGCATTTGGTTTATCTAGAAATTGG 1714
Query 1638 GGATGGGACATTGACGGAAGT-CAAACATGTCCTGTTGGAGTACGAGGTTTCCTGTCTTG 1696
||||||| |||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1715 AGATGGGAAATTGACGGAAGTGCAA-CATGCCCTTTTGGAGTACGAGGTTTCCTGTCTTG 1773
Query 1697 ACATAAACCCCATTGGCGATAATCCTAATTACAGTCAGCTAGCTGCAGTCGGGATGTGGA 1756
| |||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||
Sbjct 1774 ATATAAACCCTATCGGTGACAATCCTAATTACAGTCAGCTAGCTGCGGTTGGGATGTGGA 1833
Query 1757 CTGATATAAGTGTGAGGAT-TTTTGTGCTGCCGGACTTGACTCTTATTACTAAGGAGCAA 1815
| ||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||| || ||||||
Sbjct 1834 CAGATATAAGTGTGAGGATCTTTTC-GCTGCCAGAATTGACTCTTATTACAAAAGAGCAA 1892
Query 1816 CTAGGAGGAGAGATAATTCCCCGATCTGTTCTTCTTTGTGCATTTGAAGGGATATCTTAC 1875
|| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1893 CTTGGAGGGGAAATAATTCCCCGATCTGTTCTTCTTTGTGCATTCGAAGGGATATCTTAC 1952
Query 1876 TTGCTCTGTGCTCTTGGAGATGGTCATCTCTTAAACTTCCAGTTGGATACAAGTAGCGGG 1935
||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||| || |||
Sbjct 1953 TTGCTATGTGCTCTTGGAGATGGCCATCTTTTGAACTTCCAGATGGATACAACTACCGG- 2011
Query 1936 A-AATTAAGAGACCGGAAAAAAGTATCACTTGGGACTCAGCCTATAACTCTGCGTACTTT 1994
| |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2012 ACAATTAAAAGACAGGAAAAAAGTATCACTCGGGACTCAGCCTATAACTCTGCGTACATT 2071
Query 1995 TTCATCTAAAAGTGCAACGCATGTCTTTGCTGCATCAGATAGACCAGCTGTTATATATAG 2054
|||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||
Sbjct 2072 TTCATCAAAAAGCGCCACACATGTCTTTGCTGCATCAGATAGACCAACCGTGATCTATAG 2131
Query 2055 CAACAACAAGAAGCTGTTATACAGCAACGTGAATCTGAAAGAAGTTAGTCATATGTGTCC 2114
|| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2132 CAGCAACAAGAAGCTGTTATATAGCAATGTCAATCTTAAAGAAGTTAGTCATATGTG-CC 2190
Query 2115 CTT-CAACTCTGCTGCTTTTCCAGACAGTCTAGCAATTGCAAGGGAAGGCGAACTTACAA 2173
||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |
Sbjct 2191 CTTTCAATTCTGCTGCTTTTCCCGACAGTTTAGCAATTGCCAGGGAAGGTGAACTTACGA 2250
Query 2174 TTGGCACCATCGATGACATTCAGAAGCTTCACATACGTACCATTCCTATTGGAGAGCATG 2233
|||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||
Sbjct 2251 TTGGAACCATTGATGATATTCAGAAGCTTCACATACGTACTATTCCTCTTGGAGAGCATG 2310
Query 2234 CTCGTCGCATATGCCATCAGGAACAAACACGGACATTTGCTATCTGCTGTTTGAGAAACC 2293
||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||
Sbjct 2311 CTCGTCGAATTTGCCATCAGGAGCAGACACGTACATTTGGTATCTGCAGTTTGGGAAACC 2370
Query 2294 AACCAAGTGCAGAAGAATCTGAAATGCATTTTGTCCGTCTGCTGGATGCCCAAAGTTTCG 2353
| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||| | |||||
Sbjct 2371 AGTCAAATTCCGAAGAATCTGAAATGCACTTTGTCCGTCTTTTGGACGACCAGACTTTCG 2430
Query 2354 AGTTCT-TGTCAACTTACCCTTTGGATGCCTTTGAATACGGTTGCTCCATAT-TGAGCTG 2411
|||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| || || | |||||||
Sbjct 2431 AGTT-TATGTCAACTTACCCCTTGGATTCCTTTGAATATGGTTGTTCAAT-TCTGAGCTG 2488
Query 2412 CTCGTTTACAGACGACAAAAATGTCTATTATTGTGTTGGTACGGCATATGTTTTGCCCGA 2471
||| || || || || |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||
Sbjct 2489 CTCATTCACCGAAGATAAAAATGTCTATTACTGCGTTGGAACCGCATATGTTTTACCGGA 2548
Query 2472 GGAAAATGAACCCACTAAGGGAAGGATACTGGTGTTTATAGTTGAAGAAGGGAGATTGCA 2531
|||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||| |||||
Sbjct 2549 GGAAAATGAACCAACTAAGGGAAGGATATTAGTATTTATAGTCGAAGATGGGAGGTTGCA 2608
Query 2532 GCTTATTACAGAGAAGGAAACCAAGGGAGCTGTTTATTCTCTCAATGCCTTCAACGGCAA 2591
||| || | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||
Sbjct 2609 GCTAATCGCCGAGAAAGAAACCAAAGGAGCTGTTTATTCTCTCAATGCCTTTAATGGAAA 2668
Query 2592 ACTTCTTGCTGCTATTAATCAAAAAATTCAGTTGTATAAGTGGATGCT-ACGGGATGATG 2650
||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||
Sbjct 2669 ACTTCTTGCTGCTATTAATCAGAAGATTCAGTTGTACAAGTGGATGCTGA-GGGATGATG 2727
Query 2651 GCACTCGCGAGCTGCAGTCTGAATGTGGACATCACGGTCACATACTAGCTCTCTACGTGC 2710
||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||
Sbjct 2728 GCACTCGTGAACTGCAGTCTGAATGCGGACATCACGGACACATTCTAGCTCTCTATGTGC 2787
Query 2711 AGACCCGTGGAGACTTCATCGTCGTTGGTGACCTCATGAAATCAATCTCTTTATTGATCT 2770
|||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |
Sbjct 2788 AGACCCGTGGAGACTTTATAGTTGTTGGTGATCTCATGAAATCAATCTCCTTATTGCTAT 2847
Query 2771 ACAAGCACGAGGAAGGTGCGATCGAGGAAAGAGCTCGGGACTATAATGCAAACTGGATGG 2830
||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||| || |||||||| ||||||
Sbjct 2848 ACAAGCACGAGGAAGGTGCAATTGAGGAGCGGGCTCGGGATTACAATGCAAATTGGATGT 2907
Query 2831 CGGCAGTTGAGATACTCGATGATGACATCTACCTCGGTGCTGATAATTGCTTCAACCTAT 2890
| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| || |
Sbjct 2908 CAGCGGTTGAGATACTCGATGATGATATTTACCTCGGTGCTGAGAACAATTTCAATCTGT 2967
Query 2891 TCACAGT-AAAGAAGAACAATGAAGGTGCCACAGATGAAGAACG-GGCTCG-TATGGAGG 2947
| ||||| ||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||| || || | | ||||
Sbjct 2968 TAACAGTGAAA-AAGAACAGTGAAGGTGCTACTGATGAAGAACGAGGA-CGGT-TAGAGG 3024
Query 2948 TCGTTGGTGAGTATCACATAGGGGAATTTGTGAACCGATTCCGCCATGGCTCTCTTGTTA 3007
| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |
Sbjct 3025 TAGTTGGAGAGTATCACCTTGGGGAATTTGTGAACAGATTCCGCCATGGATCTCTAGTAA 3084
Query 3008 TGAGGCTTCCTGATTCAGAGATTGGTCAGATACCGACCGTCATATTTGGCACTGTCAGTG 3067
||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || |||| ||
Sbjct 3085 TGAGGCTACCTGATTCAGAGATTGGTCAGATCCCAACTGTCATCTTTGGTACAGTCAATG 3144
Query 3068 G-GATGATTGGAGTGATAGCTTCTCTGCCTCAAGAACAGTATGCGTTTCTAG-AGAAACT 3125
| | |||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||| | ||||| | |||| |
Sbjct 3145 GAG-TGATTGGAGTAATAGCTTCACTTCCTCAAGAACAATATAC-TTTCTTGGAGAAGTT 3202
Query 3126 GCAGACGAGTCTGAGGAAAGTGATTAAAGGAGTTGGTGG-TCTAAGCCACGAGCAATGGA 3184
|||| | ||| |||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||
Sbjct 3203 GCAGTCAAGTTTGAGAAAAGTGATTAAAGGAGTCGGCGGAT-TAAGCCACGAGCAATGGA 3261
Query 3185 GATCATTCAACAACGAGAAAAGAACTGCGGAAGCAAAGAGTTACTTGGATGGAGATCT-A 3243
| || || || |||||||||||||| |||||||| | || || ||||||||| || || |
Sbjct 3262 GGTCGTTTAATAACGAGAAAAGAACCGCGGAAGCGAGGAATTTCTTGGATGGTGA-CTTA 3320
Query 3244 ATTGAATCGTT-CTTGGATTTGAGCAGAGGTAAGATGGAGGAGATCTCTAAAGGTATGGA 3302
|| |||||||| || |||| |||| ||| ||||||||||| || || ||| ||| |
Sbjct 3321 ATCGAATCGTTTCT-GGATCTGAGTAGAAACAAGATGGAGGATATATCGAAATCCATGAA 3379
Query 3303 TGTCCAAGTGGAAGAGTTGTGCAAGAGAGTTGAAGAACTAACTAGGCTTCACTGA 3357
||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3380 TGTTCAAGTGGAGGAGTTGTGTAAGAGAGTTGAAGAACTCACTAGGCTTCACTGA 3434
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 167055920190
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5