BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg492801
Length=4326
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT4G20850.1 | Symbols: TPP2 | tripeptidyl peptidase ii | chr4:1... 7005 0.0
> AT4G20850.1 | Symbols: TPP2 | tripeptidyl peptidase ii | chr4:11160721-11169889
REVERSE LENGTH=4357
Length=4357
Score = 7005 bits (3793), Expect = 0.0
Identities = 4143/4311 (96%), Gaps = 28/4311 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGATCTGAGTCTGCAGCTGCAGGTCCACGGCGCGTTAAT---CAAAGGCCCGTCGTGT 57
|||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGATCTGAGTCTGCAGCTGCAGATTCACGGCGCGTTAATCAACAAAGGCCCGTCGTGT 60
Query 58 Ccttcttattgggcttcctcttcttcttcactctctcttcttcctcgtggtttcatttct 117
||||||||||||| | |||||||||||||| | || ||||||||| | ||||||||||
Sbjct 61 ACTTCTTATTGGGC-T--TCTTCTTCTTCACT-T-TC-TCTTCCTCGCGATTTCATTTCT 114
Query 118 tcttctccgtttcttcttcATCGAAGACTC---AGAAGAAGCTGCTCTCGTTCTCGTGGA 174
|||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 115 TCTTCTACGTTTCTTCTTCATCGAAGACTCAGAAGAAGAAGCTGCTCTCGTTCTCGTGGA 174
Query 175 ATTCGATTAAGGCGGAGTCGTTTCTCGGCGATGCCTTGTTCTTCTTCTGATACTCTTACG 234
|| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 175 ATCCGATTAAGACGGAGTGGTTTCTCGGCGATGCCTTGTTCTTCTTCTGATACTCTTACG 234
Query 235 GCTTCTCGCGTCGGTTGTGGCGGAGGAggtggtggtggtg--g-tggcggtggAGCTGAT 291
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||
Sbjct 235 GCTTCTCGCGTCGGTTGTGGCGGAGGAGGTGGTGGTGGAGCCGTTGGCGGTGGAGCTGAG 294
Query 292 AATGCTTCTGTCGCTAATTTCAAGCTCAACGAATCTA-CTTTCCTTGCTTCTCTCATGCC 350
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||
Sbjct 295 AATGCTTCTGTCGCTAATTTCAAGCTGAACGAATCTACCTTT-ATTGCTTCTCTCATGCC 353
Query 351 TAAGAAAGAAATCCGTGCGGATCGCTTCATCGAAGCTCATCCTGAGTACGACGGTCGTGG 410
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 354 TAAGAAAGAAATCCGTGCGGATTGCTTCATCGAAGCTCATCCTGAGTACGACGGTCGTGG 413
Query 411 CGTCGTCATCGCTATCTTTGATTCTGGTTTTGATCCTTCTGCTGCTGGCTTGCATGTAAC 470
||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 414 CGTTGTTATAGCTATCTTTGATTCTGGTTTTGATCCTTCTGCTGCTGGCTTGCATGTAAC 473
Query 471 TTCTGATGGAAAACCCAAGGTTTTGGACGTCATTGACTGCACTGGAAGTGGGGATATAGA 530
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 474 TTCTGATGGAAAACCCAAGGTTTTGGACGTCATTGACTGCACTGGAAGTGGAGATATAGA 533
Query 531 TACATCCACAGTGGTGAAAGCCAATGAAGATGGTCAAATTCGTGGAGCATCAGGAGCACC 590
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |
Sbjct 534 TACATCCACAGTGGTGAAAGCCAATGAAGATGGTCATATTCGTGGAGCATCAGGGGCAAC 593
Query 591 TTTGGTTGTCAATTCTTCATGGAAAAATCCCACTGGAGAGTGGCGTGTAGGTTCCAAGTT 650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 594 TTTGGTTGTCAATTCTTCATGGAAAAATCCCACTGGAGAGTGGCGTGTAGGTTCCAAGTT 653
Query 651 GGTTTATCAGTTATTTACAGATGACTTAACTTCTCGTGTGAAGAAAGAGAGAAGGAAATC 710
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 654 GGTTTATCAGTTATTTACAGATGACTTGACTTCTCGTGTGAAGAAAGAGAGAAGGAAATC 713
Query 711 TTGGGATGAAAAGAATCAGGAAGAAATTGCAAAGGCTGTAAACAATCTATATGATTTCGA 770
|||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||
Sbjct 714 CTGGGATGAAAAGAATCAGGAGGAAATTGCCAAGGCTGTAAATAATCTGTATGATTTCGA 773
Query 771 TCAGAAGCACAGCAAGGTGGAAGATGCGAAATTGAAGAAAACCCGTGAAGACCTCCAAAG 830
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 774 TCAGAAGCACAGCAAGGTGGAAGATGCGAAATTGAAGAAAACTCGTGAAGACCTCCAAAG 833
Query 831 CAAAGTTGATTTTCTGAAAAAACAAGCTGATAAATATGAAGACAAAGGGCCTGTTATTGA 890
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 834 CAAAGTTGATTTTCTGAAAAAACAAGCTGATAAATATGAAGACAAAGGGCCTGTTATTGA 893
Query 891 TGCTGTTGTGTGGCATGATGGAGAAGTATGGAGGGTTGCACTTGATACACAGAGTCTGGA 950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 894 TGCTGTTGTGTGGCATGATGGAGAAGTATGGAGGGTTGCACTTGATACACAGAGTCTGGA 953
Query 951 AGAGGATCCAGATAGCGGGAAACTAGCAGACTTCTCCCCCCTGACTAACTACCGAATTGA 1010
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 954 AGAGGATCCAGATAGCGGGAAACTAGCAGACTTCTCCCCACTGACTAACTACCGAATTGA 1013
Query 1011 GCGGAAGTATGGCGTGTTTAGCCGACTAGATGCATGCTCCTTTGTTGCTAACGTGTATGA 1070
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1014 ACGGAAGTATGGCGTGTTTAGCCGACTAGATGCATGCTCCTTTGTTGCTAACGTGTATGA 1073
Query 1071 TGAGGGGAAGGTTCTAAGCATTGTAACTGATAGTTCTCCTCATGGCACTCATGTTGCTGG 1130
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1074 TGAGGGAAAGGTTCTAAGCATTGTAACTGATAGTTCTCCTCACGGCACTCATGTTGCTGG 1133
Query 1131 AATAGCTACTGCACACCACCCTGAGGAGCATTTGTTAAATGGTGTGGCACCTGGTGCACA 1190
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1134 AATAGCTACTGCACACCACCCTGAGGAGCATTTGTTAAATGGTGTGGCACCTGGTGCACA 1193
Query 1191 GATAATATCTTGCAAAATTGGAGACTCGCGATTAGGTTCAATGGAGACCGGAACTGGATT 1250
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1194 AATAATATCTTGCAAAATTGGAGACTCGCGATTAGGTTCAATGGAGACCGGAACTGGATT 1253
Query 1251 GAGTCGGGCATTGATAGCTGCCCTGGAGCATAACTGTGATCTTGTCAACATGAGCTATGG 1310
|| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1254 GACTCGGGCATTGATAGCTGCCCTAGAGCATAACTGTGATCTTGTCAACATGAGCTATGG 1313
Query 1311 AGAGCCAGCATTACTTCCAGACTATGGGCGCTTTGTTGATCTTGTTACTGAAGCTGTGAA 1370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1314 AGAGCCAGCATTACTTCCAGACTATGGGCGCTTTGTTGATCTTGTTACTGAAGCTGTGAA 1373
Query 1371 CAAGAGACGCCTAATATTTGTAAGTAGTGCTGGCAACAGTGGTCCAGCTTTGACAACGGT 1430
||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1374 CAAGAGACGTCTAATTTTTGTAAGTAGTGCTGGCAACAGTGGTCCAGCTTTGACAACAGT 1433
Query 1431 AGGAGCACCGGGTGGAACGACGTCCAGTATCATCGGGGTTGGTGCATATGTTTCTCCTGC 1490
||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1434 CGGAGCACCGGGTGGAACAACGTCCAGTATCATTGGGGTTGGTGCGTATGTTTCTCCTGC 1493
Query 1491 AATGGCAGCCGGTGCCCATTCAGTGGTGGAACCTCCCAGTGAGGGGCTTGAATACACTTG 1550
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1494 AATGGCAGCAGGTGCCCATTCAGTGGTGGAACCTCCCAGTGAGGGGCTTGAATACACTTG 1553
Query 1551 GTCAAGCCGGGGGCCAACATCTGATGGGGATCTTGGTGTCTGCATAAGTGCACCTGGTGG 1610
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1554 GTCAAGCCGGGGGCCAACATCTGATGGAGATCTTGGTGTCTGCATAAGTGCACCTGGTGG 1613
Query 1611 GGCTGTTGCTCCTGTTCCTACATGGACGCTTCAAAGACGCATGCTCATGAATGGAACATC 1670
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1614 GGCTGTTGCTCCTGTTCCTACATGGACGCTTCAAAGACGCATGCTCATGAATGGAACATC 1673
Query 1671 AATGGCATCTCCTTCTGCCTGTGGAGCAATTGCGTTACTTCTAAGTGCTATGAAGGCTGA 1730
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1674 AATGGCATCTCCTTCTGCCTGTGGGGCAATTGCGTTACTTCTAAGTGCTATGAAGGCTGA 1733
Query 1731 GGGCATCCCAGTTAGCCCGTACAGTGTGAGAAGGGCCCTTGAGAATACATCTACACCTGT 1790
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||
Sbjct 1734 GGGCATCCCAGTTAGCCCGTACAGTGTGAGAAGGGCCCTTGAAAATACATCTACACCAGT 1793
Query 1791 AGGTGATCTACCTGAAGATAAACTAACTACTGGACAAGGGCTTATGCAAGTTGATAAGGC 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1794 AGGTGATCTACCTGAAGATAAACTAACTACTGGACAAGGGCTTATGCAAGTTGATAAGGC 1853
Query 1851 ATATGAATACTTAAAAAAGTTTCAGGACTATCCATGCGTATTTTATCAGATAAAGGTCAA 1910
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1854 ATATGAATACTTAAAACAGTTTCAGGACTATCCATGCGTATTTTATCAGATAAAGGTCAA 1913
Query 1911 TCTCTCCGGGAAAACAATTCCAACATCACGGGGCATCTACCTGCGGGAGGGTACTTCTTG 1970
||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1914 TCTCTCCGGTAAAACAATTCCAACATCACGAGGCATCTACCTGCGGGAGGGTACTGCTTG 1973
Query 1971 CAGACAGTCTACTGAGTGGACGGTACAAGTTGATCC-AAAGTTCCATGAAGGTGCAAGTA 2029
||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1974 CAGACAGTCTACTGAGTGGACAATACAAGTTGATCCGAAA-TTCCATGAAGGTGCAAGTA 2032
Query 2030 ATTTAAAGGAACTTGTCCCTTTTGAGGAATGTCTTGAGTTGCACTCCACAGATGAAGGAG 2089
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2033 ATTTAAAGGAACTTGTCCCTTTCGAGGAATGTCTTGAGTTGCACTCCACAGATGAAGGAG 2092
Query 2090 TTGTACGGGCTCCTGACTATCTCCTTCTCACTCATAACGGACGTAGCTTCAACGTTGTTG 2149
||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||
Sbjct 2093 TTGTACGGGTTCCTGACTATCTCCTTCTCACTAATAATGGACGTGGCTTCAACGTTGTTG 2152
Query 2150 TGGATCCCACAAATCTTGGTGATGGTGTGCATTACTTTGAAGTTTATGGGATTGATTGCA 2209
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2153 TGGATCCCACAAATCTTGGGGATGGTGTGCATTACTTTGAAGTTTATGGGATTGATTGCA 2212
Query 2210 AAGCACCAGAGCGTGGTCCTCTTTTCAGAATCCCAGTAACAATAATAATTCCCAAGACTG 2269
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2213 AAGCACCAGAGCGTGGTCCCCTTTTCAGAATCCCAGTAACAATAATAATTCCCAAGACTG 2272
Query 2270 TGGCAAATCGACCTCCTGTTATCTCATTTCAGCAAATGTCTTTCATCTCAGGCCACATTG 2329
||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2273 TGGCAAATCAACCTCCAGTTATTTCATTTCAGCAAATGTCTTTCATCTCAGGCCACATTG 2332
Query 2330 AACGAAGATATATTGAGGTACCACAAGGAGCAACATGGGCTGAGGCTACAATGCGAACTT 2389
||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2333 AACGAAGATATATCGAGGTACCACATGGAGCAACATGGGCTGAGGCTACAATGCGAACTT 2392
Query 2390 CAGGGTTTGATACTACACGACGATTTTATATTGATACACTTCAGCTTTGCCCATTGCGAA 2449
| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2393 CGGGGTTTGATACTACACGACGATTTTACATTGATACACTTCAGGTTTGCCCATTGCGAA 2452
Query 2450 GGCCTATCAAGTGGGAGAGCGCATCAACTTTCGCATCTCCGTCTGCGAAAAGCTTTGCGT 2509
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||
Sbjct 2453 GGCCTATCAAGTGGGAGAGCGCACCAACTTTCGCATCTCCGTCTGCTAAAAGCTTTGTGT 2512
Query 2510 TTCCTGTGGTTAGTGGTCAAACGATGGAACTAGCTATAGCTCAATTCTGGTCAAGTGGCC 2569
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2513 TCCCTGTGGTTAGTGGTCAAACGATGGAACTAGCTATAGCTCAATTTTGGTCAAGTGGCC 2572
Query 2570 TTGGAAGTCGTGAACCAACTATCGTTGATTTTGAGATTGAATTCCATGGAGTTGGTGTCG 2629
| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2573 TCGGAAGTCGTGAACCAACTATCGTTGACTTTGAGATTGAATTCCATGGAGTTGGTGTCG 2632
Query 2630 ATAAAGAAGAATTGTTACTTGATGGAAGTGAAGCACCAATAAAAGTTGAAGCTGAAGCAC 2689
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2633 ATAAAGAAGAATTGTTACTTGATGGAAGTGAAGCACCAATAAAAGTTGAAGCTGAAGCAC 2692
Query 2690 TATTGGCATCTGAAAAACTTGTTCCCATAGCTGTCCTGAACAAGATAAGAGTCCCGTATC 2749
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||
Sbjct 2693 TATTGGCATCTGAAAAACTTGTTCCCATAGCTGTCCTGAACAAGATACGAGTTCCATATC 2752
Query 2750 AACCTATTGATGCACAACTGAAGACTCTATCAACTGGCCGTGATAGACTACTGTCGGGCA 2809
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2753 AGCCTATTGATGCACAACTGAAGACTCTATCAACTGGCCGTGATAGACTACTGTCGGGCA 2812
Query 2810 AACAGATACTAGCATTGACCTTAACCTACAAGTTCAAATTAGAAGATTCAGCTGAAGTAA 2869
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2813 AACAGATACTAGCATTGACCTTAACCTACAAGTTCAAATTAGAAGATTCAGCTGAAGTGA 2872
Query 2870 AACCGTATATACCATTATTGAACAATCGCATATATGACACAAAATTTGAGTCCCAGTTTT 2929
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2873 AACCGTATATACCATTATTGAACAATCGCATATATGACACAAAATTTGAGTCCCAGTTTT 2932
Query 2930 ATATGATCTCTGATGCCAACAAGCGTGTATATGCCATGGGTGATGTTTATCCTGAGTCTT 2989
||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2933 TTATGATCTCTGATACTAACAAGCGTGTATATGCAATGGGTGACGTTTATCCTGAGTCTT 2992
Query 2990 CTAAACTTCCCAAGGGAGAATATAAACTTCAGCTGTATCTGAGGCATGAAAATGTGCAGC 3049
| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2993 CAAAACTTCCCAAGGGAGAGTATAAACTTCAGCTGTATCTGAGGCATGAAAATGTGGAGC 3052
Query 3050 TGCTGGAAAAGTTGAAGCAGCTCATTTTGTTTATTGAAAGAAATATGGGGGAGATTCGGC 3109
|||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3053 TGCTGGAAAAGTTGAAGCAGCTCACTGTGTTTATTGAAAGAAATATGGGGGAGATTCGGC 3112
Query 3110 TGAATTTACATTCTGAACCAGATGGTCCGTTCACAGGAAATGGTGCCTTTAAGTCCTCTA 3169
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3113 TGAATTTACATTCTGAACCAGATGGTCCGTTCACTGGAAATGGTGCCTTTAAGTCCTCTG 3172
Query 3170 TTCTAATGCCAGGGGTGAAGGAAGCGTTTTATCTGGGCCCACCAACAAAAGACAAGTTAC 3229
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||
Sbjct 3173 TTCTAATGCCAGGGGTGAAGGAAGCATTTTATCTGGGCCCACCAACAAAGGACAAGCTAC 3232
Query 3230 CCAAGAATACTCCCCAAGGATCTGTGTTGGTGGGAGAAATCTCATATGGCAAATTGTCAT 3289
|||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3233 CCAAGAATACCCCCCAAGGATCTATGTTGGTGGGAGAAATCTCATATGGGAAATTGTCAT 3292
Query 3290 TTGATGATAAAGAAGGGAAGAATCCAAAGGATAATCCTGTATCTTATCCGATATCATATG 3349
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3293 TTGATGAAAAAGAAGGGAAGAATCCAAAGGATAATCCGGTATCTTATCCGATATCATATG 3352
Query 3350 TGGTTCCACCAAATAAGCCTGAGGAAGATAAAAAGGCAGCTTCTGCTCC-AGATTGCTCT 3408
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||
Sbjct 3353 TGGTTCCACCAAATAAGCCTGAGGAAGATAAGAAGGCAGCTTCTGCCCCTAC-TTGCTCT 3411
Query 3409 AAATCAGTATCAGAACGCTTGGAACAAGAGGTTCGTGATACAAAAATCAAATTTCTTGGG 3468
||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||
Sbjct 3412 AAATCAGTATCAGAACGCTTGGAACAAGAGGTTCGCGACACAAAGATCAAATTTCTTGGG 3471
Query 3469 AACCTAAAACAAGAAACTGAGGAAGAGCGTTCAGAGTGGAAAAAGTTGTGTGCCTGTCTC 3528
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||
Sbjct 3472 AATCTAAAACAAGAAACTGAGGAAGAGCGTTCAGAGTGGAGAAAGTTGTGTACCTGTCTC 3531
Query 3529 AAGTCTGAATACCCAAACTACACTCCATTACTAGCTAAGATCCTGGAAGGTTTACTGTCT 3588
||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3532 AAGTCTGAATACCCAGACTATACTCCATTACTAGCTAAGATCCTGGAAGGTTTACTGTCT 3591
Query 3589 CGATCTGATGCTGGGGACAAAATCAGCCATCACGAAGAGATTATAGAAGCTGCAAACGAA 3648
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3592 CGGTCTGATGCTGGGGACAAAATCAGCCATCACGAAGAGATTATAGAAGCTGCAAACGAA 3651
Query 3649 GTAGTACGCAGTGTTGACGTAGATGAGTTAGCAAGATTCTTGCTAGACAAAACTGAACCA 3708
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3652 GTAGTACGCAGTGTTGACGTAGATGAGCTAGCAAGATTCTTGCTAGACAAAACTGAACCA 3711
Query 3709 GAAGATGCTGAAGCAGAGAAATTGAAGaaaaaaaTGGAGATGACACGTGATCAACTGGCA 3768
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3712 GAAGATGATGAAGCAGAGAAATTGAAGAAAAAAATGGAGGTGACACGTGATCAACTGGCG 3771
Query 3769 GATGCACTATACCAGAAAGGATTAGCCATGGCGAGAATCGAGAATCTGAAAGGTGAGAAG 3828
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3772 GATGCACTATACCAGAAAGGGTTAGCCATGGCGAGAATCGAGAATCTGAAGGGTGAGAAG 3831
Query 3829 GGAGATGAAGGAGAAGAAGAAAGTAGTCAGAGGGATAAATTCGAAGAGAACTTCAAAGAA 3888
| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3832 GAAGGTGAAGGAGAAGAAGAAAGTAGCCAGAAGGATAAATTCGAAGAGAATTTCAAAGAA 3891
Query 3889 CTGACAAAATGGGTAGACGTGAAATCATCTAAATATGGTACTCTCACTGTTCTAAGAGAG 3948
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3892 CTGACAAAATGGGTAGACGTGAAATCATCTAAATACGGTACTCTCACTGTTCTAAGAGAG 3951
Query 3949 AAACGGCTCTCACGACTCGGGACCGCATTGAAGGTACTTGATGACTTGATCCAAAACGAG 4008
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3952 AAACGGCTATCACGACTCGGGACCGCATTGAAGGTACTTGATGACTTGATCCAAAACGAG 4011
Query 4009 AACGAGACTGCGAATAAGAAACTCTACGAACTGAAACTGGGTTTGCTGGAGGAACTAGGT 4068
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||
Sbjct 4012 AACGAGACTGCGAATAAGAAACTCTACGAACTTAAACTGGATTTGCTGGAGGAAATAGGT 4071
Query 4069 TGGAGCCATTTGGTTACGTATGAGAAGCAATGGATGCAGGTTAGTTTCCCTACAAGCTTA 4128
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||
Sbjct 4072 TGGAGCCATTTGGTTACGTATGAGAAGCAATGGATGCAGGTTCGTTTCCCTAAAAGCCTA 4131
Query 4129 CCCCTCTTTTAGTAGTTGTTTCTACCTTCTTGTCCAATAAAAGCTTGTCCAGAACATATA 4188
|||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 4132 CCCCTCTTTTAGTAGTTGTTGCTACCTTCTTGTTCAATAAAAGCTTATCCAGAACATATA 4191
Query 4189 GT-GCTAAGTTCTTGTTCAATAAAAGCTTGTCCAGAACATTTAGTTCGTTGTTTTTCTAA 4247
|| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||
Sbjct 4192 GTTGC-AAGTTCTTGTTCAATAAAAGCTTGTCCAGAACAAATAGTTCGTTGTTTTTCGAA 4250
Query 4248 AACCCAAACTACTGT-TTGATTTTCTCTGTCTTTAGAAACTGTATGTTCTT 4297
| ||||||||||||| || ||||||| ||| || |||||||||||||||
Sbjct 4251 A-CCCAAACTACTGTCTT-ATTTTCT--GTCCGTATAAACTGTATGTTCTT 4297
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 215667687957
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5