BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg493067
Length=2454
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT4G18030.1 | Symbols: | S-adenosyl-L-methionine-dependent met... 3576 0.0
> AT4G18030.1 | Symbols: | S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases
superfamily protein | chr4:10012361-10015815
REVERSE LENGTH=2484
Length=2484
Score = 3576 bits (1936), Expect = 0.0
Identities = 2320/2494 (93%), Gaps = 72/2494 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAATTGAATTGAATCAAACGCGCCTTCATCATCAAGTT-AAAATCAAATCTTAATTAGT 59
|||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 22 GAAATTGAATAAAATCAAACGCGCCTTCATCTTCAAGTTAAAAATCAAATCTTAATTAGT 81
Query 60 GAAGACAAAGAAGAAGAAGACATTATTTTAAGTGAGTTCTCTCTCTGTCACACTCAAAAA 119
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 82 GAAGACAAAGAAGAAGAAGACATTATTTTAAGTGAGTTCTCTCTCTGTCACACTCACAAA 141
Query 120 GCTTTATAC---CT---T-CTGCTAGCTCATCACTCAAAAGAGCTTAAACCAGAGAGATC 172
||||||||| || | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 142 GCTTTATACTTTCTGGCTACTGCAAGCTCATCACTGAAAAGAGCTTAAACCAGAGAGATC 201
Query 173 TGATAATAGAAAGAGATTGTAGAGTCTCTCTCTGCTACATCAAGATCTACATCGACCAGG 232
|||| | || ||| ||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||
Sbjct 202 TGAT-A-AG--AGAAATTTTAGAG--TCTCTCTGCTTCAACAAGATCTACATCGACCAGG 255
Query 233 AGATTTGAAAGAATCATGGGTTCTAAGCATAACCCACCAGGCAATCACAGATCGAGAAGT 292
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||
Sbjct 256 AGATTAGAAAGAATCATGGGTTCTAAGCATAACCCACCAGGGAATAACAGATCGAGAAGT 315
Query 293 ACACTATCTTTACTCGTTGTGGTTGGTTTATGTTGTTTCTTCTACCTTCTTGGGGCTTGG 352
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||
Sbjct 316 ACACTATCTCTACTCGTTGTGGTTGGTTTATGTTGTTTCTTCTATCTTCTTGGAGCATGG 375
Query 353 CAAAAGAGTGGGTTTGGTAAAGGAGATAGCATAGCTATGGAGATAACTAAGCAAGCACTG 412
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |
Sbjct 376 CAAAAGAGTGGGTTTGGTAAAGGAGATAGCATAGCTATGGAGATTACAAAGCAAGCGCAG 435
Query 413 TGTACTGACATTGTCACTGATCTTGACTTTGAACCTCATCACAATACAGTGAAGATTCCA 472
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||
Sbjct 436 TGTACTGACATTGTCACTGATCTTGATTTTGAACCTCATCACAACACAGTGAAGATCCCA 495
Query 473 CGTAAAGCTGATCCAAAACCGGTTTCTTTCAAGCCGTGTGATGTGAAGCTCAAGGATTAT 532
| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 496 CATAAAGCTGATCCCAAACCTGTTTCTTTCAAACCGTGTGATGTGAAGCTCAAGGATTAC 555
Query 533 ACGCCTTGTCAAGAGCAAGACCGAGCTATGAAGTTCCCGAGAGAGAACATGATTTACAGA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 556 ACGCCTTGTCAAGAGCAAGACCGAGCTATGAAGTTCCCGAGAGAGAACATGATTTACAGA 615
Query 593 GAGAGACATTGTCCTCCTGATAATGAGAAACTGCGTTGTCTTGTTCCAGCTCCTAAAGGG 652
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 616 GAGAGACATTGTCCTCCTGATAATGAGAAGCTGCGTTGTCTTGTTCCAGCTCCTAAAGGG 675
Query 653 TATATGACTCCGTTCCCTTGGCCTAAAAGCAGAGATTATGTTCATTACGCTAATGCTCCT 712
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||
Sbjct 676 TATATGACTCCTTTCCCTTGGCCTAAAAGCAGAGATTATGTTCACTATGCTAATGCTCCT 735
Query 713 TTCAAGAGCTTGACTGTCGAAAAAGCTGGACAGAATTGGGTTCAGTTTCAAGGAAATGTG 772
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 736 TTCAAGAGCTTGACTGTCGAAAAAGCTGGACAGAATTGGGTTCAGTTTCAAGGGAATGTG 795
Query 773 TTTAAATTCCCTGGTGGAGGAACTATGTTTCCTCAAGGCGCTGATGCGTATATAGAAGAG 832
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||
Sbjct 796 TTTAAATTCCCTGGTGGAGGAACTATGTTTCCTCAAGGTGCTGATGCGTATATTGAAGAG 855
Query 833 CTAGCTTCTGTTATCCCAATCAAAGATGGATCTGTTAGAACTGCATTGGATACCGGATGT 892
||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||
Sbjct 856 CTAGCTTCTGTTATCCCTATCAAAGATGGCTCTGTTAGAACCGCATTGGACACTGGATGT 915
Query 893 GGGGTTGCAAGTTGGGGTGCTTATATGCTTAAGAGGAATGTTTTGACTATGTCGTTTGCG 952
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 916 GGGGTTGCTAGTTGGGGTGCTTATATGCTTAAGAGGAATGTTTTGACTATGTCGTTTGCG 975
Query 953 CCAAGGGATAACCACGAAGCTCAAGTCCAGTTTGCGCTTGAGAGAGGTGTTCCAGCGATT 1012
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 976 CCAAGGGATAACCACGAAGCACAAGTCCAGTTTGCGCTTGAGAGAGGTGTTCCAGCGATT 1035
Query 1013 ATCGCTGTTCTTGGATCAATTCTTCTTCCTTACCCTGCAAGAGCCTTTGATATGGCTCAA 1072
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1036 ATCGCTGTTCTTGGATCAATCCTTCTTCCTTACCCTGCAAGAGCCTTTGACATGGCTCAA 1095
Query 1073 TGCTCTCGATGCTTGATACCATGGACCGCAAACGAGGGAACGTACTTAATGGAAGTTGAT 1132
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||
Sbjct 1096 TGCTCTCGATGCTTGATACCATGGACCGCAAACGAGGGAACATACTTAATGGAAGTAGAT 1155
Query 1133 AGAGTCTTGAGACCTGGAGGTTACTGGGTCTTATCGGGTCCTCCGATCAACTGGAAGACT 1192
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1156 AGAGTCTTGAGACCTGGAGGTTACTGGGTCTTATCGGGTCCTCCAATCAACTGGAAGACA 1215
Query 1193 TGGCACAAGACGTGGAACCGAACTAAAGCAGAGCTCAACGCCGAGCAAAAGAGAATAGAG 1252
||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||
Sbjct 1216 TGGCACAAGACGTGGAACCGAACTAAAGCAGAGCTAAATGCCGAGCAAAAGAGAATAGAG 1275
Query 1253 GGAATCGCAGAGTCCTTATGCTGGGAGAAGAAGTATGAGAAGGGAGACATTGCAATTTTC 1312
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1276 GGAATCGCAGAGTCCTTATGCTGGGAGAAGAAGTATGAGAAGGGAGACATTGCAATTTTC 1335
Query 1313 AGAAAGAAAATAAACGATAGATCATGCGATAGATCATCACCGGTTAACACCTGCAAGAGA 1372
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||
Sbjct 1336 AGAAAGAAAATAAACGATAGATCATGCGATAGATCAACACCGGTTGACACCTGCAAAAGA 1395
Query 1373 AAGGACACTGATGATATCTGGTACAAGGAAATTGAAACATGCGTAACACCATTCCCTAAA 1432
||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct 1396 AAGGACACTGACGATGTCTGGTACAAGGAGATAGAAACGTGTGTAACACCATTCCCTAAA 1455
Query 1433 GTATCAAGCGAAGAAGAAGTTGCTGGAGGAAAGCTAAAGAAGTTTCCCGAGAGGCTATTC 1492
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1456 GTATCAAACGAAGAAGAAGTTGCTGGAGGAAAGCTAAAGAAGTTCCCCGAGAGGCTATTC 1515
Query 1493 GCAGTGCCTCCAAGTATCTCTAAAGGTTTGATTAATGGCGTCGACGAGGAATCATACCAA 1552
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1516 GCAGTGCCTCCAAGTATCTCTAAAGGTTTGATTAATGGCGTCGACGAGGAATCATACCAA 1575
Query 1553 GAAGACATCAA-CTTATGGAAGAAGCGAGTGACCGCATACAAGAAAATCAACAGACTGAT 1611
||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||
Sbjct 1576 GAAGACATCAATCT-ATGGAAGAAGCGAGTGACCGGATACAAGAGAATTAACAGACTGAT 1634
Query 1612 AGGTTCCACCAGATACCGTAATGTGATGGATATGAATGCTGGTCTTGGTGGTTTCGCTGC 1671
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||
Sbjct 1635 AGGTTCCACCAGATACCGTAATGTGATGGATATGAACGCCGGTCTTGGTGGATTCGCTGC 1694
Query 1672 TGCGCTCGAATCGCCTAAATCTTGGGTTATGAATGTTATTCCAACCATTAACAAGAACAC 1731
|||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1695 TGCGCTTGAATCGCCTAAATCGTGGGTTATGAATGTGATTCCAACCATTAACAAGAACAC 1754
Query 1732 ATTGAGTGTTGTCTATGAGAGAGGTCTCATTGGTATCTACCATGACTGGTGTGAAGGGTT 1791
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct 1755 ATTGAGTGTTGTTTATGAGAGAGGTCTCATTGGTATCTATCATGACTGGTGTGAAGGCTT 1814
Query 1792 TTCAACTTATCCAAGAACATACGATTTCATTCATGCTAATGGTGTCTTCAGCTTGTATCA 1851
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1815 TTCAACTTATCCAAGAACATACGATTTCATTCACGCTAGTGGTGTCTTCAGCTTGTATCA 1874
Query 1852 ACACAGCTGCAAACTTGAGGATATTCTTCTTGAAACTGATCGGATTTTACGACCGGAAGG 1911
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1875 GCACAGCTGCAAACTTGAGGATATTCTTCTTGAAACTGATCGGATTTTACGACCGGAAGG 1934
Query 1912 GATTGTGATTTTCCGGGATGAGGTTGATGTTTTGAACGATGTGAGGAAGATCGCCGATGG 1971
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||
Sbjct 1935 GATTGTGATTTTCCGGGATGAGGTTGATGTTTTGAATGATGTGAGGAAGATCGTTGATGG 1994
Query 1972 AATGAGATGGGACACTAAGTTAATGGATCATGAAGACGGTCCTCTCGTGCCGGAGAAGAT 2031
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1995 AATGAGATGGGATACTAAGTTAATGGATCATGAAGACGGTCCTCTCGTGCCGGAGAAGAT 2054
Query 2032 TCTTGTCGCCACGAAGCAGTATTGGGTCGCCGGCGATGATGGAAACAGTTCTCCGTCTTC 2091
||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||
Sbjct 2055 TCTTGTCGCCACGAAGCAGTATTGGGTAGCCGGCGACGATGGAAACAATTCTCCGTCGTC 2114
Query 2092 TTCTTCTTCTGATAATAGTGAAGAAGAATaaaacaaaaacaaaaaaaaaaaaaCTCCTCA 2151
|||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2115 TTCT-------A-A-TAGTGAAGAAGAATAAAACAAAAACAAAAAA-------CTCCTCA 2158
Query 2152 GGTTACTAAGCTTGATGTGTAG--CTATTTTACAACA-CTTGGAAAATTCTTATCAAAT- 2207
||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||
Sbjct 2159 GGTTACTAAGCTTGAAGTGTAGATCTATTTTACAACATCT-GGAAAATTCTTATCAAAAA 2217
Query 2208 -GGTAGGAATCAGAATTTCCATTGAAGAAAGGTGTCAAAA-----T-G-AT--C-A-A-- 2253
|| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | | | | |
Sbjct 2218 AGGAAGGAATCAGAATTTCCATTAAAGAAAGGTGTCAAAAAAAAGTTGTAAAACTATATA 2277
Query 2254 G-A-----C--GA--A-TATGTGCAtttatgttttagtttttgttcc-tagtttttaatt 2301
| | | || | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2278 GTAGTGATCAAGACGAATATGTGCATTTATGTTTTA-TTTTTGTTCCCTAGTTTTTAATT 2336
Query 2302 ttatttttGAAGAAAGaaaaaaaaaaaaaGTAGTTCCATGTGCTCT-GAAAGATAGTTGA 2360
|||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||| | | | |||||||||||
Sbjct 2337 TTATTTTTTT-GAAGGAAGAAAAAAT----TAGTTCCATGTGTTTTTGCAAGATAGTTGA 2391
Query 2361 AACCTTGGACGCTTGTTATGTATGATGCGATATTGACATTTTTTAGTAATAGTTATTTTA 2420
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||
Sbjct 2392 AACCTTGGACGCTTGTTATGTATGATGCGATCTTGACATTTTTTAATAACAGTTATTTTA 2451
Query 2421 AATAAAAATTTATGATATAAATGGAAACTTCTAG 2454
|||||| ||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2452 AATAAA--TTTATGATATAAACGGAAACTTCTAG 2483
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 121755170661
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5