BLASTN 2.2.26+


Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.



Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
           33,602 sequences; 51,074,197 total letters



Query= Ahg493252

Length=5952
                                                                      Score     E
Sequences producing significant alignments:                          (Bits)  Value

  AT4G16340.1 | Symbols: SPK1 | guanyl-nucleotide exchange factor...  9886    0.0  


> AT4G16340.1 | Symbols: SPK1 | guanyl-nucleotide exchange factors;GTPase 
binding;GTP binding | chr4:9228185-9241317 REVERSE 
LENGTH=6338
Length=6338

 Score = 9886 bits (5353),  Expect = 0.0
 Identities = 5784/5989 (97%), Gaps = 42/5989 (1%)
 Strand=Plus/Plus

Query  1     GTTGGACTTATGGTTCCAGCTCGACTTTTGC-TTCCTGTCGAGTAATCTTCACTTTTTCC  59
             ||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |
Sbjct  4     GTTGGACTTACAGCTCCAGCTCGACTTTTGCTTTCCTCTTGAGTAATCTTCACTTTTT-C  62

Query  60    TTTTCCCCAACTGCTTCCTCTCACGGATCTCTTCCTCTCTGCGTAAAGACAAAGATTCAT  119
                | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  63    ---T-CCCAACTGCTTCCTCTCACGGATCTCTTCCTCTCTGCGTAAAGACAAAGATTCAT  118

Query  120   CCTCCTCT--TCCTCTACCTCCCCCACTCAG----A--T-CTACT------ATGTCCTTT  164
             ||||||||  |||| || |||||||||||||    |  | |||||      |||||||||
Sbjct  119   CCTCCTCTCCTCCTTTAGCTCCCCCACTCAGATCTACTTACTACTCCAACAATGTCCTTT  178

Query  165   TTCCTTTTCTAGGTTTTCACAAATCCCCAA---T-TC---T--C-------T--CT-ACA  205
             | || |||||||||||||||||||||||||   | ||   |  |       |  || |||
Sbjct  179   TCCCATTTCTAGGTTTTCACAAATCCCCAATTCTCTCTAATGGCGTAGTAGTACCTCACA  238

Query  206   TTGTATTAGATCTATCTCAATGGAGAACAACAATCTTGGTCTTCGATTTCGTAAGATACC  265
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct  239   TTGTATTAGATCTATCTCAATGGAGAACAACAATCTTGGTCTTCGATTTCGTAAGCTACC  298

Query  266   TCGTCAGCCTGTTGCTCTCCCTAAGCTCGATCCTTTGCTTGATGAGAATCTGGAACAATG  325
             |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  299   TCGTCAGCCTCTTGCTCTCCCTAAGCTCGATCCTTTGCTTGATGAGAATCTGGAACAATG  358

Query  326   GCCGCATTTGAATCAATTGGTTCAATGCTATGGCACTGAATGGGTTAAAGATGTTAATAA  385
             ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct  359   GCCACATTTGAATCAATTGGTTCAATGTTATGGCACTGAATGGGTTAAAGATGTTAACAA  418

Query  386   ATATGGTCACTATGAAAATATTCGACCTGATACTTTCCAGACTCAGATTTTTGAAGGACC  445
             ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  419   ATACGGTCACTATGAAAATATTCGACCTGATTCTTTCCAGACTCAGATTTTTGAAGGACC  478

Query  446   TGATACTGATACCGAGACTGAAATCCGTCTTGCTAGTGCTAGGAGTGCAACTATTGAGGA  505
             |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct  479   TGATACTGATACTGAGACTGAGATTCGTCTTGCTAGTGCCAGGAGTGCAACTATTGAGGA  538

Query  506   GGATGTAGCTAGTATATCCGGGAGGCCGTTTTCTGATTCTGGATCCTCCAAGCACTTTGG  565
             |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||
Sbjct  539   GGATGTTGCCAGTATTTCCGGGAGGCCGTTTTCTGATCCTGGATCCTCTAAGCATTTTGG  598

Query  566   GCAACCTCCTTTACCTGCTTATGAACCAGCTTTTGACTGGGAAAATGAAAGAGCTATGAT  625
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  599   GCAACCTCCTTTACCTGCTTATGAACCAGCTTTTGACTGGGAAAATGAAAGAGCTATGAT  658

Query  626   ATTTGGCCAGAGAACTCCTGAATCTCCTGCAGCAAGCTATTCCAGTGGATTGAAGATCTC  685
              ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  659   TTTTGGTCAGAGAACTCCTGAATCTCCTGCAGCTAGCTATTCCAGTGGATTGAAGATCTC  718

Query  686   CGTCAGAGTTTTGTCTCTAGCTTTTCAGTCTGGCTTAGTTGAACCATTTTTTGGCTCGAT  745
              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  719   TGTCAGAGTTTTGTCTCTAGCTTTTCAGTCTGGCTTAGTTGAACCATTTTTTGGCTCGAT  778

Query  746   TGCATTGTACAATCAAGAGAGGAAGGAGAAACTCTCTGAGGATTTTTATTTCCATATTTT  805
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  
Sbjct  779   TGCATTGTACAATCAAGAGAGGAAGGAGAAACTCTCTGAGGATTTTTATTTCCAGATTCA  838

Query  806   GCCGACGGAAATGCAGGATGCTAAAAATTCATCTGAAAATCGTGGAGTATTTTATCTAGA  865
             |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  839   GCCGACGGAAATGCAGGATGCTAAACTTTCATCTGAAAATCGTGGAGTATTTTATCTAGA  898

Query  866   TGCCCCATCAGCATCAGTTTGCCTGCTTATTCAATTAGAAAAAACAGCAACAGAGGAGGG  925
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct  899   TGCCCCATCAGCATCAGTTTGCCTGCTTATTCAATTAGAAAAAACAGCAACTGAGGAAGG  958

Query  926   AGGCGTTACAACATCTGTCTATTCCCGTAAAGAGCCTGTGCACTTAACTGAGAGGGAAAA  985
             |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  959   AGGCGTTACATCATCTGTCTATTCCCGTAAAGAGCCTGTGCACTTAACTGAGAGGGAAAA  1018

Query  986   GCAAAAGTTGCAGGTCTGGTCTCGCATTATGCCTTACCGAGAGTCTTTTGCTTGGGCAGT  1045
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1019  GCAAAAGTTGCAGGTCTGGTCTCGCATTATGCCTTACCGAGAGTCTTTTGCTTGGGCAGT  1078

Query  1046  TGTTCCGCTTTTTGATAATAATGTCACCACAAACACTGGTGAATCTGCTTCCCCTAGCAG  1105
             |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1079  TGTTCCGCTTTTTGATAATAATCTCACCACAAACACTGGTGAATCTGCTTCCCCTAGCAG  1138

Query  1106  TCCTCTTGCTCCTAGTATGACCGCGTCAAGTTCCCATGATGGTGTTTATGAACCCATTGC  1165
             ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct  1139  TCCTCTTGCTCCTAGTATGACTGCGTCAAGTTCCCATGATGGTGTTTATGAACCAATTGC  1198

Query  1166  AAAGATCACATCAGATGGAAAGCAAGGTTATTCAGGTGGAAGTTCTGTCGTAGTTGAAAT  1225
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1199  AAAGATCACATCAGATGGAAAGCAAGGTTATTCAGGTGGAAGTTCTGTCGTAGTTGAAAT  1258

Query  1226  ATCTAATTTAAACAAAGTTAAAGAGAGCTACTCTGAAGAGTCAATTCAGGACCCCAAACG  1285
             |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct  1259  ATCTAATTTAAATAAAGTTAAAGAGAGCTACTCTGAAGAGTCCATTCAGGACCCCAAACG  1318

Query  1286  GAAGGTTCACAAACCTGTTAAAGGGGTTCTAAGACTGGAAATTGAGAAACATCGGAATGG  1345
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1319  GAAGGTTCACAAACCTGTTAAAGGGGTTCTAAGACTGGAAATTGAGAAACATCGGAATGG  1378

Query  1346  ACATGGAGACTTTGAAGATCTATCTGAGAATGGAAGTATCATAAATGACTCCCTTGATCC  1405
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1379  ACATGGAGACTTTGAAGATCTATCTGAGAATGGAAGTATCATAAATGACTCCCTTGATCC  1438

Query  1406  GACTGACCGCCTCAGTGACCTGACACTTATGAAGTGTCCCAGTTCTGGTTCTGGTGGACC  1465
              ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct  1439  AACTGACCGCCTCAGTGACCTGACTCTTATGAAGTGTCCCAGTTCTAGTTCTGGTGGACC  1498

Query  1466  CCGTAATGGCTGTTCGAAGTGGAATTCAGAGGATGCAAAGGATGTTTCAAGAAACCTAAC  1525
             ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct  1499  CCGTAATGGCTGTTCAAAGTGGAATTCAGAGGATGCAAAGGATGTTTCGAGAAATCTAAC  1558

Query  1526  AAGTTCAAGTGGGACTCCTGACTTAAATTGTTATCATGCTTTTGATTTCTGCTCTACGAC  1585
             ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct  1559  AAGTTCATGTGGGACTCCTGACTTAAATTGTTATCATGCTTTTGATTTTTGCTCTACGAC  1618

Query  1586  AAGAAACGAGCCTTTTCTACATCTCTTCCATTGCCTTTATGTGTATCCTGTAGCTGTTAC  1645
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1619  AAGAAACGAGCCTTTTCTACATCTCTTCCATTGCCTTTATGTGTATCCTGTAGCTGTTAC  1678

Query  1646  TTTAAGTCGGAAGAGGAATCCCTTTATCCGTGTAGAATTGAGAAAGGATGACACTGATGT  1705
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
Sbjct  1679  TTTAAGTCGGAAGAGGAATCCCTTTATCCGTGTAGAATTGAGAAAGGATGACACAGATAT  1738

Query  1706  CCGAAAACAACCACTCGAGGCAATATATCCAAGAGAGCCTGGTGTTTCACTCCAGAAGTG  1765
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||
Sbjct  1739  CCGAAAACAACCACTCGAGGCAATATATCCAAGAGAACCTGGTGTTTCACTCCAGAAATG  1798

Query  1766  GGTTCATACACAGGTTGCTGTTGGTGCTAGGGCTGCTAGCTACCATGATGAAATTAAGGT  1825
             ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1799  GGTTCATACACAGGTCGCTGTTGGTGCTAGGGCCGCTAGCTACCATGATGAAATTAAGGT  1858

Query  1826  CTCTCTTCCTGCCACATGGACGCCATCACATCATCTGTTATTCACtttttttCATGTTGA  1885
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1859  CTCTCTTCCTGCCACATGGACGCCATCACATCATCTGTTATTCACTTTTTTTCATGTTGA  1918

Query  1886  TCTCCAGACAAAGCTTGAAGCTCCAAGACCAGTAGTTGTTGGATATGCATCACTTCCATT  1945
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1919  TCTCCAGACAAAGCTTGAAGCTCCAAGACCAGTAGTTGTTGGATATGCATCACTTCCATT  1978

Query  1946  ATCTACCTATATCCACTCACGGTCTGATATTTCTCTACCAGTAATGAGAGAACTGGTTCC  2005
             |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct  1979  ATCTACATATATCCACTCACGGTCTGATATTTCTCTACCAGTAATGAGAGAACTTGTTCC  2038

Query  2006  CCACTATCTTCAGGAAACCACCAAGGAGAGGTTGGATTATTTGGAAGATGGCAAGAATAT  2065
             ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct  2039  CCACTATCTTCAGGAAAGCACCAAGGAGAGGTTGGATTATTTGGAAGATGGCAAAAATAT  2098

Query  2066  TTTTAAGTTGCGACTGAGACTTTGTTCGTCTCTTTATCCCACCAATGAACGTGTCAGGGA  2125
             ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  2099  TTTTAAGTTGCGACTGAGACTTTGTTCATCTCTTTATCCCACCAACGAACGTGTCAGGGA  2158

Query  2126  TTTCTGTCTAGAGTATGATAGACATACCCTCCGGACAAGCCCTCCCTGGGGTTCAGAACT  2185
             |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct  2159  TTTCTGTCTAGAGTATGATAGACATACCCTCCAGACAAGGCCTCCCTGGGGTTCAGAACT  2218

Query  2186  GTTGCAGGCAATAAACAGTTTGAAGCACGTTGATTCTACTGCCTTGCTTCAGTTTCTTTA  2245
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2219  GTTGCAGGCAATAAACAGTTTGAAGCACGTTGATTCTACTGCCTTGCTTCAGTTTCTTTA  2278

Query  2246  CCCAATTCTTAATATGCTCCTTCATCTTATTGGCAATGGTGGAGAAACTCTTCAGGTTGC  2305
             |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct  2279  CCCAATTCTTAACATGCTCCTTCATCTTATTGGCAATGGTGGAGAAACCCTTCAGGTTGC  2338

Query  2306  AGCATTCAGAGCCATGGTGGATATTTTAACTCGGGTGCAGCAGGTGTCGTTTGATGATGC  2365
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2339  AGCATTCAGAGCCATGGTGGATATTTTAACTCGGGTGCAGCAGGTGTCGTTTGATGATGC  2398

Query  2366  TGACCGAAATCGATTTCTGGTCACCTATGTTGATTATTCTTTTGATGATTTTGGAGGCAA  2425
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2399  TGACCGAAATCGATTTCTGGTCACCTATGTTGATTATTCTTTTGATGATTTTGGAGGCAA  2458

Query  2426  TCAACCACCAGTTTATCCTGGATTAGCAACTGTATGGGGAAGTTTAGCTAGAAGCAAGGC  2485
             ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2459  TCAACCACCGGTTTATCCTGGATTAGCAACTGTGTGGGGAAGTTTAGCTAGAAGCAAGGC  2518

Query  2486  CAAAGGTTACCGGGTTGGACCTGTATATGACGATGTATTATCAATGGCGTGGTTTTTCCT  2545
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2519  CAAAGGTTACCGGGTTGGACCTGTATATGACGATGTATTATCAATGGCGTGGTTTTTCCT  2578

Query  2546  CGAGTTGATTGTTAAATCGATGGCATTGGAGCAGGCACGTCTTTATGATCACAATCTACC  2605
             |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2579  CGAGTTGATTGTTAAATCAATGGCATTGGAGCAAGCACGTCTTTATGATCACAATCTACC  2638

Query  2606  TTCAGGCGAGGATGTTCCACCCATGCAGCTCAAAGAAAGTGTTTTCCGATGTATCATGCA  2665
             | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2639  TACAGGCGAGGATGTTCCACCCATGCAGCTCAAAGAAAGTGTTTTCCGATGTATCATGCA  2698

Query  2666  ATTGTTTGATTGTCTTTTAACTGAAGTTCATGAACGTTGTAAAAAGGGCCTAAGCTTGGC  2725
             ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct  2699  ATTGTTTGATTGTCTTTTAACTGAAGTACATGAACGTTGTAAAAAGGGCTTAAGCTTGGC  2758

Query  2726  GAAACGTCTGAACAGCAGTTTGGCCTTCTTCTGTTATGATCTTTTATATATAATTGAGCC  2785
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct  2759  GAAACGTCTGAACAGCAGTTTGGCCTTCTTCTGTTATGATCTTTTATATATCATTGAGCC  2818

Query  2786  CTGCCAGGTTTATGAACTGGTATCGTTATACATGGACAAGTTTTCTGGTGTTTGTCAATC  2845
             ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2819  CTGCCAGGTCTATGAACTGGTATCGTTATACATGGACAAGTTTTCTGGTGTTTGTCAATC  2878

Query  2846  TGTTCTACACGAATGCAAGCTCACGTTTTTGCAAATTATCTCCGACCATGATCTTTTTGT  2905
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2879  TGTTCTACACGAATGCAAGCTCACGTTTTTGCAAATTATCTCCGACCATGATCTTTTTGT  2938

Query  2906  AGAAATGCCTGGTAGAGACCCATCAGACAGGAACTATTTATCATCCATATTAATACAGGA  2965
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2939  AGAAATGCCTGGTAGAGACCCATCAGACAGGAACTATTTATCATCCATATTAATACAGGA  2998

Query  2966  GTTATTTCTTTCCCTGGATCATGATGAGCTGCCTCTGCGGGCGAAGGGAGCAAGAATTTT  3025
             ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2999  GTTATTTCTCTCACTGGATCATGATGAGCTGCCTCTGCGGGCGAAGGGAGCAAGAATTTT  3058

Query  3026  AGTGATCCTCTTATGCAAGCATGAATTTGATGCACGGTACCAGAAAGCTGAAGATAAGCT  3085
             ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3059  AGTGATCCTTTTATGCAAGCATGAATTTGATGCGCGGTACCAGAAAGCTGAAGATAAGCT  3118

Query  3086  GTATATTGCACAACTATATTTTCCATTTGTCGGGCAGATTTTAGATGAAATGCCCGTCTT  3145
             ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct  3119  GTATATTGCACAACTGTATTTTCCTTTTGTCGGGCAGATTTTAGATGAAATGCCTGTTTT  3178

Query  3146  TTATAACCTAAATGCTACTGAAAAGCGTGAGGTTTTAATTGGCGTGCTGCAAATTGTTCG  3205
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct  3179  TTATAACCTAAATGCTACTGAAAAGCGTGAGGTTTTAATTGGTGTGCTGCAAATTGTTCG  3238

Query  3206  TAATCTGGATGACACATCACTTGTCAAGGCATGGCAGCAGAGCATCGCTCGTACTAGATT  3265
             ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct  3239  TAATCTGGATGACACATCACTTGTCAAAGCATGGCAGCAGAGCATCGCTCGTACTCGATT  3298

Query  3266  GTATTTCAAACTCATGGAAGAATGCCTCATACTTTTCGAGCACAAGAAGGCTGCTGACAG  3325
              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3299  ATATTTCAAACTCATGGAAGAATGCCTCATACTTTTCGAGCACAAGAAGGCTGCTGACAG  3358

Query  3326  CATCCTCGGGGGCAACAATTCTCGTGGTCCTGTTAGTGAAGGAGCTGGATCACCAAAGTA  3385
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3359  CATCCTCGGGGGCAACAATTCTCGTGGTCCTGTTAGTGAAGGAGCTGGATCACCAAAGTA  3418

Query  3386  CTCCGAGCGACTTTCTCCTGCTATCAACAATTATCTGTCAGAGGCTTCTCGCCAAGAAGT  3445
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3419  CTCCGAGCGACTTTCTCCTGCTATCAACAATTATCTGTCAGAGGCTTCTCGCCAAGAAGT  3478

Query  3446  CAGGCTAGAGGGAACACCTGACAATGGGTACCTGTGGCAGAGAGTTAATTCTCAGTTGGC  3505
             ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3479  CAGGCTAGAGGGAACACCTGATAATGGGTACCTGTGGCAGAGAGTTAATTCTCAGTTGGC  3538

Query  3506  CTCCCCTAGCCAACCTTATTCTCTAAGAGAAGCTTTAGCTCAAGCACAATCTTCGCGGAT  3565
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct  3539  CTCCCCTAGCCAACCTTATTCTCTAAGAGAAGCTTTAGCTCAAGCACAATCTTCCCGGAT  3598

Query  3566  TGGAGCTTCAGCTCAGGCACTAAGAGAATCGCTGCACCCTATTTTGAGGCAAAAACTGGA  3625
             |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct  3599  TGGAGCTTCAGCCCAGGCACTAAGAGAATCGCTGCACCCAATTTTGAGGCAAAAACTGGA  3658

Query  3626  ACTTTGGGAAGAGAATGTAAGTGCCACTGTTAGCCTCCAGGTTTTGGAGATCACTGAAAT  3685
             ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct  3659  ACTTTGGGAGGAGAATGTAAGTGCCACTGTTAGCCTCCAGGTTTTGGAGATCACTGAAAA  3718

Query  3686  TTTTTCATCAATGGTAGCCTCTCACAATATTGCAACGGACTATGGAAAATTGGACTGCAT  3745
             |||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||
Sbjct  3719  TTTTTCATCAATGGCAGCCTCTCACAATATTGCGACCGACTATGGCAAATTGGACTGCAT  3778

Query  3746  TACTACAATATTGACGAGTTTCTTCTCCCGGAACCAGTCATTAGCCTTCTGGAAAGCCTT  3805
             |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  3779  TACTACAATACTGACGAGTTTCTTCTCCCGAAACCAGTCATTAGCTTTCTGGAAAGCCTT  3838

Query  3806  CTTTCCAATTTTCAACAGAATCTTTGATCTTCATGGGGCTACACTGATGGCCAGGGAAAA  3865
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3839  CTTTCCAATTTTCAACAGAATCTTTGATCTTCATGGGGCTACACTGATGGCCAGGGAAAA  3898

Query  3866  CGATCGCTTCTTAAAACAGATAGCCTTCCATCTTCTCCGGCTTGCTGTTTACCGCAATGA  3925
              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3899  TGATCGCTTCTTAAAACAGATAGCCTTCCATCTTCTCCGGCTTGCTGTTTACCGCAATGA  3958

Query  3926  CAGTGTCAGGAAAAGGGCTGTCATTGGTCTTCAAATACTAGTTAAGAGCTCGCTATACTT  3985
             ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3959  CAGTGTCAGGAAAAGGGCTGTTATTGGTCTTCAAATACTAGTTAAGAGCTCGCTATACTT  4018

Query  3986  TATGCAGACTGCTAGGCTGAGGGCTTTGCTGACCATTACACTGTCAGAACTCATGTCGGA  4045
             ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4019  TATGCAGACTGCTAGGCTGAGGGCTTTGCTGACGATTACACTGTCAGAACTCATGTCGGA  4078

Query  4046  TGTCCAAGTGACTCATATGAAAACAGATAATACATTAGAAGAGAGTGGAGAAGCACGTCG  4105
             |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct  4079  TGTCCAAGTGACTCATATGAAGTCAGATAATACATTAGAAGAGAGTGGAGAAGCACGGCG  4138

Query  4106  GCTTCAACAGTCATTAAGCGAAATGGCTGATGAAGCTAAGAGTGTCGATTTGTTGAGGGA  4165
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct  4139  ACTTCAACAGTCATTAAGCGAAATGGCTGATGAAGCTAAGAGTGTCAATTTGTTGAGGGA  4198

Query  4166  GTGTGGTCTTCCTGATGATACACTGTTGGTAATTCCCGAGAAATTTACAGAGAATCGCTG  4225
             |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct  4199  GTGTGGTCTTCCTGATGATACACTGTTGATTATTCCCGAGAAATTTACAGAGAACCGCTG  4258

Query  4226  GTCATGGGCTGAAGTCAAACATCTTTCTGATAGCCTTGTTCTTGCTCTTGATGCCAGCCT  4285
             |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4259  GTCATGGGCTGAAGTCAAACATCTTTCTGACAGCCTTGTTCTTGCTCTTGATGCCAGCCT  4318

Query  4286  CGGGCATGCCCTTTTGGGATCTGTGATGGCTATGGATCGATATGCTGCAGCAGAGAGCTT  4345
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct  4319  CGGGCATGCCCTTTTGGGATCTGTGATGGCTATGGATCGATATGCTGCTGCAGAGAGCTT  4378

Query  4346  CTACAAACTTGGAATGGCATTTGCTCCTGTTCCGGATCTTCACATAATGTGGTTGCTGCA  4405
             |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||
Sbjct  4379  CTACAAACTTGGAATGGCGTTTGCTCCTGTTCCGGATCTTCACATAATGTGGTTATTGCA  4438

Query  4406  TCTATGTGATGCCCACCAGGAAATGCAGTCTTGGGCTGAAGCTGCACAGTGTGCTGTGGC  4465
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct  4439  TCTATGTGATGCCCACCAGGAAATGCAGTCTTGGGCAGAAGCTGCACAGTGTGCTGTGGC  4498

Query  4466  GGTTGCAGGTGTGATAATGCAGGCCTTGGTGGCTAGAAATGATGGTGTGTGGAGCAAGGA  4525
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct  4499  GGTTGCAGGTGTGATAATGCAGGCCTTGGTGGCTAGGAATGATGGTGTGTGGAGCAAGGA  4558

Query  4526  TCATGTGTCTGCCTTGCGTAAGATTTGCCCGATGGTAAGTGGCGAGTTTACAACAGAGGC  4585
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4559  TCATGTGTCTGCCTTGCGTAAGATTTGCCCGATGGTAAGTGGCGAGTTTACAACAGAGGC  4618

Query  4586  ATCTGCAGCTGAAGTCGAGGGTTATGGTGCTTCAAAGCTAACAGTTGACTCCGCCGTCAA  4645
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4619  ATCTGCAGCTGAAGTCGAGGGTTATGGTGCTTCAAAGCTAACAGTTGACTCCGCCGTCAA  4678

Query  4646  GTACCTACAGCTTGCTAATAAGCTTTTCTCTCAAGCTGAGCTCTACCATTTTTGTGCAAG  4705
             |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4679  GTATTTACAGCTTGCTAATAAGCTTTTCTCTCAAGCTGAGCTCTACCATTTTTGTGCAAG  4738

Query  4706  CATTTTGGAACTTGTTATTCCAGTTTACAAGAGCAGGAAGGCTTATGGGCAGTTGGCTAA  4765
             |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4739  CATTTTAGAACTTGTTATTCCAGTTTACAAGAGCAGGAAGGCTTATGGGCAGTTGGCTAA  4798

Query  4766  GTGTCACACTTTACTTACTAATATATATGAGTCCATTCTTGACCAAGAATCAAACCCAAT  4825
             ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4799  GTGTCACACTTTACTTACTAATATATACGAGTCCATTCTTGACCAAGAATCAAACCCAAT  4858

Query  4826  CCCATTTATTGATGCTACATATTACCGGGTGGGATTTTACGGGGAAAAGTTTGGGAAGTT  4885
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct  4859  CCCATTTATTGATGCTACATATTACCGGGTGGGATTTTATGGGGAAAAGTTTGGGAAGTT  4918

Query  4886  GGACAGAAAAGAATATGTATACCGTGAACCACGAGATGTGCGGCTAGGGGATATAATGGA  4945
             |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4919  GGACAGGAAAGAATATGTATACCGAGAACCACGAGATGTGCGGCTAGGGGATATAATGGA  4978

Query  4946  AAAGCTGAGCCATATCTATGAATCAAGAATGGACAGCAACCATATTCTGCACATTATACC  5005
             ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4979  AAAACTGAGCCATATATATGAGTCAAGAATGGACAGCAACCATATTCTGCACATTATACC  5038

Query  5006  AGATTCGAGACAAGTGAAAGCAGAAGAATTGCAGGCAGGAGTGTGCTACCTGCAAATTAC  5065
             ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct  5039  AGATTCGAGGCAAGTGAAGGCAGAAGACTTGCAGGCAGGAGTGTGCTATCTGCAAATTAC  5098

Query  5066  AGCTGTTGATGCAGTGATGGAAGATGAGGATCTTGGGAGCAGAAGAGAGAGAATATTTTC  5125
              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  5099  TGCTGTTGATGCAGTGATGGAAGATGAGGATCTTGGGAGCAGAAGAGAGAGAATATTTTC  5158

Query  5126  TCTTTCGACTGGAAGTGTTCGAGCACGAGTGTTTGATCGCTTCTTGTTTGACACACCATT  5185
             |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct  5159  TCTTTCAACTGGAAGTGTTCGAGCACGAGTGTTTGATCGTTTCTTATTTGACACACCATT  5218

Query  5186  TACAAAAAATGGTAAGACCCAAGGTGGATTAGAAGATCAATGGAAGAGAAGAACAGTGCT  5245
             ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  5219  TACGAAAAATGGTAAAACCCAAGGTGGATTAGAAGATCAATGGAAGAGAAGAACAGTGCT  5278

Query  5246  GCAGACTGAGGGTTCATTCCCTGCGCTTGTGAATAGGCTGTTGGTTACCAAGTCTGAATC  5305
             |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  5279  GCAGACTGAGGGTTCATTCCCTGCCCTTGTGAATAGGCTGTTGGTTACCAAGTCTGAATC  5338

Query  5306  CCTTGAATTCTCGCCAGTGGAGAATGCGATTGGAATGATTGAAACGCGGACAACTGCTCT  5365
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct  5339  CCTTGAATTCTCGCCAGTGGAGAATGCGATTGGAATGATTGAAACGCGGACAACCGCTCT  5398

Query  5366  GAGAAATGAGCTAGAGGAGCCTCGTAGCTCGGATGGGGATCACCTACCACGGCTTCAAAG  5425
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  5399  GAGAAATGAGCTAGAGGAGCCTCGTAGCTCGGATGGGGATCACCTACCACGGCTTCAAAG  5458

Query  5426  TCTGCAGAGGATTCTCCAAGGAAGTGTTGCAGTGCAGGTGAACAGTGGGGTGTTGAGCGT  5485
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  5459  TCTGCAGAGGATTCTCCAAGGAAGTGTTGCAGTGCAGGTGAACAGTGGGGTGTTGAGCGT  5518

Query  5486  GTGCACAGCATTCTTATCAGGAGAGCCTGCAACTAGATTGCGTTCGCAGGAACTGCAGCA  5545
             ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  5519  GTGCACAGCTTTCTTATCAGGAGAGCCTGCAACGAGATTGCGTTCACAGGAACTGCAGCA  5578

Query  5546  ACTGATCGCGGCACTGCTTGAATTCATGGCGGTTTGTAAGCGAGCCATTAGGGTTCACTT  5605
             ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  5579  ACTAATCGCGGCACTGCTTGAATTCATGGCGGTTTGTAAGCGAGCCATTAGGGTTCACTT  5638

Query  5606  TAGATTAATCGGAGAAGAAGATCAGGAATTCCATACTCAGCTTGTCAATGGATTTCAGTC  5665
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  5639  TAGATTAATCGGAGAAGAAGATCAGGAATTCCATACTCAGCTTGTCAATGGATTTCAGTC  5698

Query  5666  TCTCACCGCTGAACTCTCCCATTACATCCCTGCTATCTTGTCCGAACTTTAGTGTATCTT  5725
             ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct  5699  TCTCACCGCAGAACTCTCCCATTACATCCCTGCTATCTTATCCGAACTTTAGTGTATCTT  5758

Query  5726  TGTCAGTTTTTGCTACAAATTTTGTGCTTTTTTCTTCCACCATTTGGCTTGGGTATATGT  5785
             |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct  5759  TGTCAGTTTTTGTTACGAGTTTTGTGCTTTTTTCTTCCACCATTTGGCTTGGCTATATGT  5818

Query  5786  TTGTCATTTCTGTAATTCTTAGTTTAATGACAACAAATGAGAGAAAtttttttAATGACA  5845
             || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  || | |||||||
Sbjct  5819  TTATCATTTCTGTAATTCTTAGTTTAATGACAACAAGTGAGAAAAAAATTATAAATGACA  5878

Query  5846  ATTGTTTGACTTCTAATTCAGAAGCTTATGTTATATTCGATCGTGGAAATGAGCTC-C-C  5903
             |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | |
Sbjct  5879  ATTGGTTGACTTCTAATTCAGAAGCTTATGTTATATTCGATCGAGGACATGAGCTCTCTC  5938

Query  5904  AGCTTCAAACACAAGCCACTCAACTATTTAGGATGCCTCCGACATCTCA  5952
             ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct  5939  AGCTTCAAACACAAGCCGCTCAACTATTTAGGATGCCTGCGACATCTCA  5987



Lambda     K      H
    1.33    0.621     1.12 

Gapped
Lambda     K      H
    1.28    0.460    0.850 

Effective search space used: 296989912084


  Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
    Posted date:  Sep 25, 2014  6:13 PM
  Number of letters in database: 51,074,197
  Number of sequences in database:  33,602



Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5