BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg493252
Length=5952
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT4G16340.1 | Symbols: SPK1 | guanyl-nucleotide exchange factor... 9886 0.0
> AT4G16340.1 | Symbols: SPK1 | guanyl-nucleotide exchange factors;GTPase
binding;GTP binding | chr4:9228185-9241317 REVERSE
LENGTH=6338
Length=6338
Score = 9886 bits (5353), Expect = 0.0
Identities = 5784/5989 (97%), Gaps = 42/5989 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTTGGACTTATGGTTCCAGCTCGACTTTTGC-TTCCTGTCGAGTAATCTTCACTTTTTCC 59
|||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |
Sbjct 4 GTTGGACTTACAGCTCCAGCTCGACTTTTGCTTTCCTCTTGAGTAATCTTCACTTTTT-C 62
Query 60 TTTTCCCCAACTGCTTCCTCTCACGGATCTCTTCCTCTCTGCGTAAAGACAAAGATTCAT 119
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 63 ---T-CCCAACTGCTTCCTCTCACGGATCTCTTCCTCTCTGCGTAAAGACAAAGATTCAT 118
Query 120 CCTCCTCT--TCCTCTACCTCCCCCACTCAG----A--T-CTACT------ATGTCCTTT 164
|||||||| |||| || ||||||||||||| | | ||||| |||||||||
Sbjct 119 CCTCCTCTCCTCCTTTAGCTCCCCCACTCAGATCTACTTACTACTCCAACAATGTCCTTT 178
Query 165 TTCCTTTTCTAGGTTTTCACAAATCCCCAA---T-TC---T--C-------T--CT-ACA 205
| || ||||||||||||||||||||||||| | || | | | || |||
Sbjct 179 TCCCATTTCTAGGTTTTCACAAATCCCCAATTCTCTCTAATGGCGTAGTAGTACCTCACA 238
Query 206 TTGTATTAGATCTATCTCAATGGAGAACAACAATCTTGGTCTTCGATTTCGTAAGATACC 265
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 239 TTGTATTAGATCTATCTCAATGGAGAACAACAATCTTGGTCTTCGATTTCGTAAGCTACC 298
Query 266 TCGTCAGCCTGTTGCTCTCCCTAAGCTCGATCCTTTGCTTGATGAGAATCTGGAACAATG 325
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 299 TCGTCAGCCTCTTGCTCTCCCTAAGCTCGATCCTTTGCTTGATGAGAATCTGGAACAATG 358
Query 326 GCCGCATTTGAATCAATTGGTTCAATGCTATGGCACTGAATGGGTTAAAGATGTTAATAA 385
||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 359 GCCACATTTGAATCAATTGGTTCAATGTTATGGCACTGAATGGGTTAAAGATGTTAACAA 418
Query 386 ATATGGTCACTATGAAAATATTCGACCTGATACTTTCCAGACTCAGATTTTTGAAGGACC 445
||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 419 ATACGGTCACTATGAAAATATTCGACCTGATTCTTTCCAGACTCAGATTTTTGAAGGACC 478
Query 446 TGATACTGATACCGAGACTGAAATCCGTCTTGCTAGTGCTAGGAGTGCAACTATTGAGGA 505
|||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 479 TGATACTGATACTGAGACTGAGATTCGTCTTGCTAGTGCCAGGAGTGCAACTATTGAGGA 538
Query 506 GGATGTAGCTAGTATATCCGGGAGGCCGTTTTCTGATTCTGGATCCTCCAAGCACTTTGG 565
|||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||
Sbjct 539 GGATGTTGCCAGTATTTCCGGGAGGCCGTTTTCTGATCCTGGATCCTCTAAGCATTTTGG 598
Query 566 GCAACCTCCTTTACCTGCTTATGAACCAGCTTTTGACTGGGAAAATGAAAGAGCTATGAT 625
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 599 GCAACCTCCTTTACCTGCTTATGAACCAGCTTTTGACTGGGAAAATGAAAGAGCTATGAT 658
Query 626 ATTTGGCCAGAGAACTCCTGAATCTCCTGCAGCAAGCTATTCCAGTGGATTGAAGATCTC 685
||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 659 TTTTGGTCAGAGAACTCCTGAATCTCCTGCAGCTAGCTATTCCAGTGGATTGAAGATCTC 718
Query 686 CGTCAGAGTTTTGTCTCTAGCTTTTCAGTCTGGCTTAGTTGAACCATTTTTTGGCTCGAT 745
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 719 TGTCAGAGTTTTGTCTCTAGCTTTTCAGTCTGGCTTAGTTGAACCATTTTTTGGCTCGAT 778
Query 746 TGCATTGTACAATCAAGAGAGGAAGGAGAAACTCTCTGAGGATTTTTATTTCCATATTTT 805
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 779 TGCATTGTACAATCAAGAGAGGAAGGAGAAACTCTCTGAGGATTTTTATTTCCAGATTCA 838
Query 806 GCCGACGGAAATGCAGGATGCTAAAAATTCATCTGAAAATCGTGGAGTATTTTATCTAGA 865
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 839 GCCGACGGAAATGCAGGATGCTAAACTTTCATCTGAAAATCGTGGAGTATTTTATCTAGA 898
Query 866 TGCCCCATCAGCATCAGTTTGCCTGCTTATTCAATTAGAAAAAACAGCAACAGAGGAGGG 925
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 899 TGCCCCATCAGCATCAGTTTGCCTGCTTATTCAATTAGAAAAAACAGCAACTGAGGAAGG 958
Query 926 AGGCGTTACAACATCTGTCTATTCCCGTAAAGAGCCTGTGCACTTAACTGAGAGGGAAAA 985
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 959 AGGCGTTACATCATCTGTCTATTCCCGTAAAGAGCCTGTGCACTTAACTGAGAGGGAAAA 1018
Query 986 GCAAAAGTTGCAGGTCTGGTCTCGCATTATGCCTTACCGAGAGTCTTTTGCTTGGGCAGT 1045
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1019 GCAAAAGTTGCAGGTCTGGTCTCGCATTATGCCTTACCGAGAGTCTTTTGCTTGGGCAGT 1078
Query 1046 TGTTCCGCTTTTTGATAATAATGTCACCACAAACACTGGTGAATCTGCTTCCCCTAGCAG 1105
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1079 TGTTCCGCTTTTTGATAATAATCTCACCACAAACACTGGTGAATCTGCTTCCCCTAGCAG 1138
Query 1106 TCCTCTTGCTCCTAGTATGACCGCGTCAAGTTCCCATGATGGTGTTTATGAACCCATTGC 1165
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1139 TCCTCTTGCTCCTAGTATGACTGCGTCAAGTTCCCATGATGGTGTTTATGAACCAATTGC 1198
Query 1166 AAAGATCACATCAGATGGAAAGCAAGGTTATTCAGGTGGAAGTTCTGTCGTAGTTGAAAT 1225
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1199 AAAGATCACATCAGATGGAAAGCAAGGTTATTCAGGTGGAAGTTCTGTCGTAGTTGAAAT 1258
Query 1226 ATCTAATTTAAACAAAGTTAAAGAGAGCTACTCTGAAGAGTCAATTCAGGACCCCAAACG 1285
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1259 ATCTAATTTAAATAAAGTTAAAGAGAGCTACTCTGAAGAGTCCATTCAGGACCCCAAACG 1318
Query 1286 GAAGGTTCACAAACCTGTTAAAGGGGTTCTAAGACTGGAAATTGAGAAACATCGGAATGG 1345
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1319 GAAGGTTCACAAACCTGTTAAAGGGGTTCTAAGACTGGAAATTGAGAAACATCGGAATGG 1378
Query 1346 ACATGGAGACTTTGAAGATCTATCTGAGAATGGAAGTATCATAAATGACTCCCTTGATCC 1405
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1379 ACATGGAGACTTTGAAGATCTATCTGAGAATGGAAGTATCATAAATGACTCCCTTGATCC 1438
Query 1406 GACTGACCGCCTCAGTGACCTGACACTTATGAAGTGTCCCAGTTCTGGTTCTGGTGGACC 1465
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1439 AACTGACCGCCTCAGTGACCTGACTCTTATGAAGTGTCCCAGTTCTAGTTCTGGTGGACC 1498
Query 1466 CCGTAATGGCTGTTCGAAGTGGAATTCAGAGGATGCAAAGGATGTTTCAAGAAACCTAAC 1525
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 1499 CCGTAATGGCTGTTCAAAGTGGAATTCAGAGGATGCAAAGGATGTTTCGAGAAATCTAAC 1558
Query 1526 AAGTTCAAGTGGGACTCCTGACTTAAATTGTTATCATGCTTTTGATTTCTGCTCTACGAC 1585
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1559 AAGTTCATGTGGGACTCCTGACTTAAATTGTTATCATGCTTTTGATTTTTGCTCTACGAC 1618
Query 1586 AAGAAACGAGCCTTTTCTACATCTCTTCCATTGCCTTTATGTGTATCCTGTAGCTGTTAC 1645
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1619 AAGAAACGAGCCTTTTCTACATCTCTTCCATTGCCTTTATGTGTATCCTGTAGCTGTTAC 1678
Query 1646 TTTAAGTCGGAAGAGGAATCCCTTTATCCGTGTAGAATTGAGAAAGGATGACACTGATGT 1705
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
Sbjct 1679 TTTAAGTCGGAAGAGGAATCCCTTTATCCGTGTAGAATTGAGAAAGGATGACACAGATAT 1738
Query 1706 CCGAAAACAACCACTCGAGGCAATATATCCAAGAGAGCCTGGTGTTTCACTCCAGAAGTG 1765
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1739 CCGAAAACAACCACTCGAGGCAATATATCCAAGAGAACCTGGTGTTTCACTCCAGAAATG 1798
Query 1766 GGTTCATACACAGGTTGCTGTTGGTGCTAGGGCTGCTAGCTACCATGATGAAATTAAGGT 1825
||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1799 GGTTCATACACAGGTCGCTGTTGGTGCTAGGGCCGCTAGCTACCATGATGAAATTAAGGT 1858
Query 1826 CTCTCTTCCTGCCACATGGACGCCATCACATCATCTGTTATTCACtttttttCATGTTGA 1885
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1859 CTCTCTTCCTGCCACATGGACGCCATCACATCATCTGTTATTCACTTTTTTTCATGTTGA 1918
Query 1886 TCTCCAGACAAAGCTTGAAGCTCCAAGACCAGTAGTTGTTGGATATGCATCACTTCCATT 1945
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1919 TCTCCAGACAAAGCTTGAAGCTCCAAGACCAGTAGTTGTTGGATATGCATCACTTCCATT 1978
Query 1946 ATCTACCTATATCCACTCACGGTCTGATATTTCTCTACCAGTAATGAGAGAACTGGTTCC 2005
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1979 ATCTACATATATCCACTCACGGTCTGATATTTCTCTACCAGTAATGAGAGAACTTGTTCC 2038
Query 2006 CCACTATCTTCAGGAAACCACCAAGGAGAGGTTGGATTATTTGGAAGATGGCAAGAATAT 2065
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2039 CCACTATCTTCAGGAAAGCACCAAGGAGAGGTTGGATTATTTGGAAGATGGCAAAAATAT 2098
Query 2066 TTTTAAGTTGCGACTGAGACTTTGTTCGTCTCTTTATCCCACCAATGAACGTGTCAGGGA 2125
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2099 TTTTAAGTTGCGACTGAGACTTTGTTCATCTCTTTATCCCACCAACGAACGTGTCAGGGA 2158
Query 2126 TTTCTGTCTAGAGTATGATAGACATACCCTCCGGACAAGCCCTCCCTGGGGTTCAGAACT 2185
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2159 TTTCTGTCTAGAGTATGATAGACATACCCTCCAGACAAGGCCTCCCTGGGGTTCAGAACT 2218
Query 2186 GTTGCAGGCAATAAACAGTTTGAAGCACGTTGATTCTACTGCCTTGCTTCAGTTTCTTTA 2245
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2219 GTTGCAGGCAATAAACAGTTTGAAGCACGTTGATTCTACTGCCTTGCTTCAGTTTCTTTA 2278
Query 2246 CCCAATTCTTAATATGCTCCTTCATCTTATTGGCAATGGTGGAGAAACTCTTCAGGTTGC 2305
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2279 CCCAATTCTTAACATGCTCCTTCATCTTATTGGCAATGGTGGAGAAACCCTTCAGGTTGC 2338
Query 2306 AGCATTCAGAGCCATGGTGGATATTTTAACTCGGGTGCAGCAGGTGTCGTTTGATGATGC 2365
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2339 AGCATTCAGAGCCATGGTGGATATTTTAACTCGGGTGCAGCAGGTGTCGTTTGATGATGC 2398
Query 2366 TGACCGAAATCGATTTCTGGTCACCTATGTTGATTATTCTTTTGATGATTTTGGAGGCAA 2425
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2399 TGACCGAAATCGATTTCTGGTCACCTATGTTGATTATTCTTTTGATGATTTTGGAGGCAA 2458
Query 2426 TCAACCACCAGTTTATCCTGGATTAGCAACTGTATGGGGAAGTTTAGCTAGAAGCAAGGC 2485
||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2459 TCAACCACCGGTTTATCCTGGATTAGCAACTGTGTGGGGAAGTTTAGCTAGAAGCAAGGC 2518
Query 2486 CAAAGGTTACCGGGTTGGACCTGTATATGACGATGTATTATCAATGGCGTGGTTTTTCCT 2545
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2519 CAAAGGTTACCGGGTTGGACCTGTATATGACGATGTATTATCAATGGCGTGGTTTTTCCT 2578
Query 2546 CGAGTTGATTGTTAAATCGATGGCATTGGAGCAGGCACGTCTTTATGATCACAATCTACC 2605
|||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2579 CGAGTTGATTGTTAAATCAATGGCATTGGAGCAAGCACGTCTTTATGATCACAATCTACC 2638
Query 2606 TTCAGGCGAGGATGTTCCACCCATGCAGCTCAAAGAAAGTGTTTTCCGATGTATCATGCA 2665
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2639 TACAGGCGAGGATGTTCCACCCATGCAGCTCAAAGAAAGTGTTTTCCGATGTATCATGCA 2698
Query 2666 ATTGTTTGATTGTCTTTTAACTGAAGTTCATGAACGTTGTAAAAAGGGCCTAAGCTTGGC 2725
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2699 ATTGTTTGATTGTCTTTTAACTGAAGTACATGAACGTTGTAAAAAGGGCTTAAGCTTGGC 2758
Query 2726 GAAACGTCTGAACAGCAGTTTGGCCTTCTTCTGTTATGATCTTTTATATATAATTGAGCC 2785
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2759 GAAACGTCTGAACAGCAGTTTGGCCTTCTTCTGTTATGATCTTTTATATATCATTGAGCC 2818
Query 2786 CTGCCAGGTTTATGAACTGGTATCGTTATACATGGACAAGTTTTCTGGTGTTTGTCAATC 2845
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2819 CTGCCAGGTCTATGAACTGGTATCGTTATACATGGACAAGTTTTCTGGTGTTTGTCAATC 2878
Query 2846 TGTTCTACACGAATGCAAGCTCACGTTTTTGCAAATTATCTCCGACCATGATCTTTTTGT 2905
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2879 TGTTCTACACGAATGCAAGCTCACGTTTTTGCAAATTATCTCCGACCATGATCTTTTTGT 2938
Query 2906 AGAAATGCCTGGTAGAGACCCATCAGACAGGAACTATTTATCATCCATATTAATACAGGA 2965
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2939 AGAAATGCCTGGTAGAGACCCATCAGACAGGAACTATTTATCATCCATATTAATACAGGA 2998
Query 2966 GTTATTTCTTTCCCTGGATCATGATGAGCTGCCTCTGCGGGCGAAGGGAGCAAGAATTTT 3025
||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2999 GTTATTTCTCTCACTGGATCATGATGAGCTGCCTCTGCGGGCGAAGGGAGCAAGAATTTT 3058
Query 3026 AGTGATCCTCTTATGCAAGCATGAATTTGATGCACGGTACCAGAAAGCTGAAGATAAGCT 3085
||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3059 AGTGATCCTTTTATGCAAGCATGAATTTGATGCGCGGTACCAGAAAGCTGAAGATAAGCT 3118
Query 3086 GTATATTGCACAACTATATTTTCCATTTGTCGGGCAGATTTTAGATGAAATGCCCGTCTT 3145
||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 3119 GTATATTGCACAACTGTATTTTCCTTTTGTCGGGCAGATTTTAGATGAAATGCCTGTTTT 3178
Query 3146 TTATAACCTAAATGCTACTGAAAAGCGTGAGGTTTTAATTGGCGTGCTGCAAATTGTTCG 3205
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3179 TTATAACCTAAATGCTACTGAAAAGCGTGAGGTTTTAATTGGTGTGCTGCAAATTGTTCG 3238
Query 3206 TAATCTGGATGACACATCACTTGTCAAGGCATGGCAGCAGAGCATCGCTCGTACTAGATT 3265
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3239 TAATCTGGATGACACATCACTTGTCAAAGCATGGCAGCAGAGCATCGCTCGTACTCGATT 3298
Query 3266 GTATTTCAAACTCATGGAAGAATGCCTCATACTTTTCGAGCACAAGAAGGCTGCTGACAG 3325
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3299 ATATTTCAAACTCATGGAAGAATGCCTCATACTTTTCGAGCACAAGAAGGCTGCTGACAG 3358
Query 3326 CATCCTCGGGGGCAACAATTCTCGTGGTCCTGTTAGTGAAGGAGCTGGATCACCAAAGTA 3385
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3359 CATCCTCGGGGGCAACAATTCTCGTGGTCCTGTTAGTGAAGGAGCTGGATCACCAAAGTA 3418
Query 3386 CTCCGAGCGACTTTCTCCTGCTATCAACAATTATCTGTCAGAGGCTTCTCGCCAAGAAGT 3445
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3419 CTCCGAGCGACTTTCTCCTGCTATCAACAATTATCTGTCAGAGGCTTCTCGCCAAGAAGT 3478
Query 3446 CAGGCTAGAGGGAACACCTGACAATGGGTACCTGTGGCAGAGAGTTAATTCTCAGTTGGC 3505
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3479 CAGGCTAGAGGGAACACCTGATAATGGGTACCTGTGGCAGAGAGTTAATTCTCAGTTGGC 3538
Query 3506 CTCCCCTAGCCAACCTTATTCTCTAAGAGAAGCTTTAGCTCAAGCACAATCTTCGCGGAT 3565
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3539 CTCCCCTAGCCAACCTTATTCTCTAAGAGAAGCTTTAGCTCAAGCACAATCTTCCCGGAT 3598
Query 3566 TGGAGCTTCAGCTCAGGCACTAAGAGAATCGCTGCACCCTATTTTGAGGCAAAAACTGGA 3625
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3599 TGGAGCTTCAGCCCAGGCACTAAGAGAATCGCTGCACCCAATTTTGAGGCAAAAACTGGA 3658
Query 3626 ACTTTGGGAAGAGAATGTAAGTGCCACTGTTAGCCTCCAGGTTTTGGAGATCACTGAAAT 3685
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3659 ACTTTGGGAGGAGAATGTAAGTGCCACTGTTAGCCTCCAGGTTTTGGAGATCACTGAAAA 3718
Query 3686 TTTTTCATCAATGGTAGCCTCTCACAATATTGCAACGGACTATGGAAAATTGGACTGCAT 3745
|||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3719 TTTTTCATCAATGGCAGCCTCTCACAATATTGCGACCGACTATGGCAAATTGGACTGCAT 3778
Query 3746 TACTACAATATTGACGAGTTTCTTCTCCCGGAACCAGTCATTAGCCTTCTGGAAAGCCTT 3805
|||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3779 TACTACAATACTGACGAGTTTCTTCTCCCGAAACCAGTCATTAGCTTTCTGGAAAGCCTT 3838
Query 3806 CTTTCCAATTTTCAACAGAATCTTTGATCTTCATGGGGCTACACTGATGGCCAGGGAAAA 3865
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3839 CTTTCCAATTTTCAACAGAATCTTTGATCTTCATGGGGCTACACTGATGGCCAGGGAAAA 3898
Query 3866 CGATCGCTTCTTAAAACAGATAGCCTTCCATCTTCTCCGGCTTGCTGTTTACCGCAATGA 3925
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3899 TGATCGCTTCTTAAAACAGATAGCCTTCCATCTTCTCCGGCTTGCTGTTTACCGCAATGA 3958
Query 3926 CAGTGTCAGGAAAAGGGCTGTCATTGGTCTTCAAATACTAGTTAAGAGCTCGCTATACTT 3985
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3959 CAGTGTCAGGAAAAGGGCTGTTATTGGTCTTCAAATACTAGTTAAGAGCTCGCTATACTT 4018
Query 3986 TATGCAGACTGCTAGGCTGAGGGCTTTGCTGACCATTACACTGTCAGAACTCATGTCGGA 4045
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4019 TATGCAGACTGCTAGGCTGAGGGCTTTGCTGACGATTACACTGTCAGAACTCATGTCGGA 4078
Query 4046 TGTCCAAGTGACTCATATGAAAACAGATAATACATTAGAAGAGAGTGGAGAAGCACGTCG 4105
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 4079 TGTCCAAGTGACTCATATGAAGTCAGATAATACATTAGAAGAGAGTGGAGAAGCACGGCG 4138
Query 4106 GCTTCAACAGTCATTAAGCGAAATGGCTGATGAAGCTAAGAGTGTCGATTTGTTGAGGGA 4165
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 4139 ACTTCAACAGTCATTAAGCGAAATGGCTGATGAAGCTAAGAGTGTCAATTTGTTGAGGGA 4198
Query 4166 GTGTGGTCTTCCTGATGATACACTGTTGGTAATTCCCGAGAAATTTACAGAGAATCGCTG 4225
|||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 4199 GTGTGGTCTTCCTGATGATACACTGTTGATTATTCCCGAGAAATTTACAGAGAACCGCTG 4258
Query 4226 GTCATGGGCTGAAGTCAAACATCTTTCTGATAGCCTTGTTCTTGCTCTTGATGCCAGCCT 4285
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4259 GTCATGGGCTGAAGTCAAACATCTTTCTGACAGCCTTGTTCTTGCTCTTGATGCCAGCCT 4318
Query 4286 CGGGCATGCCCTTTTGGGATCTGTGATGGCTATGGATCGATATGCTGCAGCAGAGAGCTT 4345
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 4319 CGGGCATGCCCTTTTGGGATCTGTGATGGCTATGGATCGATATGCTGCTGCAGAGAGCTT 4378
Query 4346 CTACAAACTTGGAATGGCATTTGCTCCTGTTCCGGATCTTCACATAATGTGGTTGCTGCA 4405
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 4379 CTACAAACTTGGAATGGCGTTTGCTCCTGTTCCGGATCTTCACATAATGTGGTTATTGCA 4438
Query 4406 TCTATGTGATGCCCACCAGGAAATGCAGTCTTGGGCTGAAGCTGCACAGTGTGCTGTGGC 4465
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 4439 TCTATGTGATGCCCACCAGGAAATGCAGTCTTGGGCAGAAGCTGCACAGTGTGCTGTGGC 4498
Query 4466 GGTTGCAGGTGTGATAATGCAGGCCTTGGTGGCTAGAAATGATGGTGTGTGGAGCAAGGA 4525
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 4499 GGTTGCAGGTGTGATAATGCAGGCCTTGGTGGCTAGGAATGATGGTGTGTGGAGCAAGGA 4558
Query 4526 TCATGTGTCTGCCTTGCGTAAGATTTGCCCGATGGTAAGTGGCGAGTTTACAACAGAGGC 4585
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4559 TCATGTGTCTGCCTTGCGTAAGATTTGCCCGATGGTAAGTGGCGAGTTTACAACAGAGGC 4618
Query 4586 ATCTGCAGCTGAAGTCGAGGGTTATGGTGCTTCAAAGCTAACAGTTGACTCCGCCGTCAA 4645
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4619 ATCTGCAGCTGAAGTCGAGGGTTATGGTGCTTCAAAGCTAACAGTTGACTCCGCCGTCAA 4678
Query 4646 GTACCTACAGCTTGCTAATAAGCTTTTCTCTCAAGCTGAGCTCTACCATTTTTGTGCAAG 4705
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4679 GTATTTACAGCTTGCTAATAAGCTTTTCTCTCAAGCTGAGCTCTACCATTTTTGTGCAAG 4738
Query 4706 CATTTTGGAACTTGTTATTCCAGTTTACAAGAGCAGGAAGGCTTATGGGCAGTTGGCTAA 4765
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4739 CATTTTAGAACTTGTTATTCCAGTTTACAAGAGCAGGAAGGCTTATGGGCAGTTGGCTAA 4798
Query 4766 GTGTCACACTTTACTTACTAATATATATGAGTCCATTCTTGACCAAGAATCAAACCCAAT 4825
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4799 GTGTCACACTTTACTTACTAATATATACGAGTCCATTCTTGACCAAGAATCAAACCCAAT 4858
Query 4826 CCCATTTATTGATGCTACATATTACCGGGTGGGATTTTACGGGGAAAAGTTTGGGAAGTT 4885
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 4859 CCCATTTATTGATGCTACATATTACCGGGTGGGATTTTATGGGGAAAAGTTTGGGAAGTT 4918
Query 4886 GGACAGAAAAGAATATGTATACCGTGAACCACGAGATGTGCGGCTAGGGGATATAATGGA 4945
|||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4919 GGACAGGAAAGAATATGTATACCGAGAACCACGAGATGTGCGGCTAGGGGATATAATGGA 4978
Query 4946 AAAGCTGAGCCATATCTATGAATCAAGAATGGACAGCAACCATATTCTGCACATTATACC 5005
||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4979 AAAACTGAGCCATATATATGAGTCAAGAATGGACAGCAACCATATTCTGCACATTATACC 5038
Query 5006 AGATTCGAGACAAGTGAAAGCAGAAGAATTGCAGGCAGGAGTGTGCTACCTGCAAATTAC 5065
||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 5039 AGATTCGAGGCAAGTGAAGGCAGAAGACTTGCAGGCAGGAGTGTGCTATCTGCAAATTAC 5098
Query 5066 AGCTGTTGATGCAGTGATGGAAGATGAGGATCTTGGGAGCAGAAGAGAGAGAATATTTTC 5125
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5099 TGCTGTTGATGCAGTGATGGAAGATGAGGATCTTGGGAGCAGAAGAGAGAGAATATTTTC 5158
Query 5126 TCTTTCGACTGGAAGTGTTCGAGCACGAGTGTTTGATCGCTTCTTGTTTGACACACCATT 5185
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 5159 TCTTTCAACTGGAAGTGTTCGAGCACGAGTGTTTGATCGTTTCTTATTTGACACACCATT 5218
Query 5186 TACAAAAAATGGTAAGACCCAAGGTGGATTAGAAGATCAATGGAAGAGAAGAACAGTGCT 5245
||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5219 TACGAAAAATGGTAAAACCCAAGGTGGATTAGAAGATCAATGGAAGAGAAGAACAGTGCT 5278
Query 5246 GCAGACTGAGGGTTCATTCCCTGCGCTTGTGAATAGGCTGTTGGTTACCAAGTCTGAATC 5305
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5279 GCAGACTGAGGGTTCATTCCCTGCCCTTGTGAATAGGCTGTTGGTTACCAAGTCTGAATC 5338
Query 5306 CCTTGAATTCTCGCCAGTGGAGAATGCGATTGGAATGATTGAAACGCGGACAACTGCTCT 5365
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 5339 CCTTGAATTCTCGCCAGTGGAGAATGCGATTGGAATGATTGAAACGCGGACAACCGCTCT 5398
Query 5366 GAGAAATGAGCTAGAGGAGCCTCGTAGCTCGGATGGGGATCACCTACCACGGCTTCAAAG 5425
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5399 GAGAAATGAGCTAGAGGAGCCTCGTAGCTCGGATGGGGATCACCTACCACGGCTTCAAAG 5458
Query 5426 TCTGCAGAGGATTCTCCAAGGAAGTGTTGCAGTGCAGGTGAACAGTGGGGTGTTGAGCGT 5485
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5459 TCTGCAGAGGATTCTCCAAGGAAGTGTTGCAGTGCAGGTGAACAGTGGGGTGTTGAGCGT 5518
Query 5486 GTGCACAGCATTCTTATCAGGAGAGCCTGCAACTAGATTGCGTTCGCAGGAACTGCAGCA 5545
||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 5519 GTGCACAGCTTTCTTATCAGGAGAGCCTGCAACGAGATTGCGTTCACAGGAACTGCAGCA 5578
Query 5546 ACTGATCGCGGCACTGCTTGAATTCATGGCGGTTTGTAAGCGAGCCATTAGGGTTCACTT 5605
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5579 ACTAATCGCGGCACTGCTTGAATTCATGGCGGTTTGTAAGCGAGCCATTAGGGTTCACTT 5638
Query 5606 TAGATTAATCGGAGAAGAAGATCAGGAATTCCATACTCAGCTTGTCAATGGATTTCAGTC 5665
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5639 TAGATTAATCGGAGAAGAAGATCAGGAATTCCATACTCAGCTTGTCAATGGATTTCAGTC 5698
Query 5666 TCTCACCGCTGAACTCTCCCATTACATCCCTGCTATCTTGTCCGAACTTTAGTGTATCTT 5725
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 5699 TCTCACCGCAGAACTCTCCCATTACATCCCTGCTATCTTATCCGAACTTTAGTGTATCTT 5758
Query 5726 TGTCAGTTTTTGCTACAAATTTTGTGCTTTTTTCTTCCACCATTTGGCTTGGGTATATGT 5785
|||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 5759 TGTCAGTTTTTGTTACGAGTTTTGTGCTTTTTTCTTCCACCATTTGGCTTGGCTATATGT 5818
Query 5786 TTGTCATTTCTGTAATTCTTAGTTTAATGACAACAAATGAGAGAAAtttttttAATGACA 5845
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || | |||||||
Sbjct 5819 TTATCATTTCTGTAATTCTTAGTTTAATGACAACAAGTGAGAAAAAAATTATAAATGACA 5878
Query 5846 ATTGTTTGACTTCTAATTCAGAAGCTTATGTTATATTCGATCGTGGAAATGAGCTC-C-C 5903
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | |
Sbjct 5879 ATTGGTTGACTTCTAATTCAGAAGCTTATGTTATATTCGATCGAGGACATGAGCTCTCTC 5938
Query 5904 AGCTTCAAACACAAGCCACTCAACTATTTAGGATGCCTCCGACATCTCA 5952
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 5939 AGCTTCAAACACAAGCCGCTCAACTATTTAGGATGCCTGCGACATCTCA 5987
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 296989912084
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5