BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg493252 Length=5952 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT4G16340.1 | Symbols: SPK1 | guanyl-nucleotide exchange factor... 9886 0.0 > AT4G16340.1 | Symbols: SPK1 | guanyl-nucleotide exchange factors;GTPase binding;GTP binding | chr4:9228185-9241317 REVERSE LENGTH=6338 Length=6338 Score = 9886 bits (5353), Expect = 0.0 Identities = 5784/5989 (97%), Gaps = 42/5989 (1%) Strand=Plus/Plus Query 1 GTTGGACTTATGGTTCCAGCTCGACTTTTGC-TTCCTGTCGAGTAATCTTCACTTTTTCC 59 |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| | Sbjct 4 GTTGGACTTACAGCTCCAGCTCGACTTTTGCTTTCCTCTTGAGTAATCTTCACTTTTT-C 62 Query 60 TTTTCCCCAACTGCTTCCTCTCACGGATCTCTTCCTCTCTGCGTAAAGACAAAGATTCAT 119 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 63 ---T-CCCAACTGCTTCCTCTCACGGATCTCTTCCTCTCTGCGTAAAGACAAAGATTCAT 118 Query 120 CCTCCTCT--TCCTCTACCTCCCCCACTCAG----A--T-CTACT------ATGTCCTTT 164 |||||||| |||| || ||||||||||||| | | ||||| ||||||||| Sbjct 119 CCTCCTCTCCTCCTTTAGCTCCCCCACTCAGATCTACTTACTACTCCAACAATGTCCTTT 178 Query 165 TTCCTTTTCTAGGTTTTCACAAATCCCCAA---T-TC---T--C-------T--CT-ACA 205 | || ||||||||||||||||||||||||| | || | | | || ||| Sbjct 179 TCCCATTTCTAGGTTTTCACAAATCCCCAATTCTCTCTAATGGCGTAGTAGTACCTCACA 238 Query 206 TTGTATTAGATCTATCTCAATGGAGAACAACAATCTTGGTCTTCGATTTCGTAAGATACC 265 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 239 TTGTATTAGATCTATCTCAATGGAGAACAACAATCTTGGTCTTCGATTTCGTAAGCTACC 298 Query 266 TCGTCAGCCTGTTGCTCTCCCTAAGCTCGATCCTTTGCTTGATGAGAATCTGGAACAATG 325 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 299 TCGTCAGCCTCTTGCTCTCCCTAAGCTCGATCCTTTGCTTGATGAGAATCTGGAACAATG 358 Query 326 GCCGCATTTGAATCAATTGGTTCAATGCTATGGCACTGAATGGGTTAAAGATGTTAATAA 385 ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 359 GCCACATTTGAATCAATTGGTTCAATGTTATGGCACTGAATGGGTTAAAGATGTTAACAA 418 Query 386 ATATGGTCACTATGAAAATATTCGACCTGATACTTTCCAGACTCAGATTTTTGAAGGACC 445 ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 419 ATACGGTCACTATGAAAATATTCGACCTGATTCTTTCCAGACTCAGATTTTTGAAGGACC 478 Query 446 TGATACTGATACCGAGACTGAAATCCGTCTTGCTAGTGCTAGGAGTGCAACTATTGAGGA 505 |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 479 TGATACTGATACTGAGACTGAGATTCGTCTTGCTAGTGCCAGGAGTGCAACTATTGAGGA 538 Query 506 GGATGTAGCTAGTATATCCGGGAGGCCGTTTTCTGATTCTGGATCCTCCAAGCACTTTGG 565 |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| Sbjct 539 GGATGTTGCCAGTATTTCCGGGAGGCCGTTTTCTGATCCTGGATCCTCTAAGCATTTTGG 598 Query 566 GCAACCTCCTTTACCTGCTTATGAACCAGCTTTTGACTGGGAAAATGAAAGAGCTATGAT 625 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 599 GCAACCTCCTTTACCTGCTTATGAACCAGCTTTTGACTGGGAAAATGAAAGAGCTATGAT 658 Query 626 ATTTGGCCAGAGAACTCCTGAATCTCCTGCAGCAAGCTATTCCAGTGGATTGAAGATCTC 685 ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 659 TTTTGGTCAGAGAACTCCTGAATCTCCTGCAGCTAGCTATTCCAGTGGATTGAAGATCTC 718 Query 686 CGTCAGAGTTTTGTCTCTAGCTTTTCAGTCTGGCTTAGTTGAACCATTTTTTGGCTCGAT 745 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 719 TGTCAGAGTTTTGTCTCTAGCTTTTCAGTCTGGCTTAGTTGAACCATTTTTTGGCTCGAT 778 Query 746 TGCATTGTACAATCAAGAGAGGAAGGAGAAACTCTCTGAGGATTTTTATTTCCATATTTT 805 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 779 TGCATTGTACAATCAAGAGAGGAAGGAGAAACTCTCTGAGGATTTTTATTTCCAGATTCA 838 Query 806 GCCGACGGAAATGCAGGATGCTAAAAATTCATCTGAAAATCGTGGAGTATTTTATCTAGA 865 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 839 GCCGACGGAAATGCAGGATGCTAAACTTTCATCTGAAAATCGTGGAGTATTTTATCTAGA 898 Query 866 TGCCCCATCAGCATCAGTTTGCCTGCTTATTCAATTAGAAAAAACAGCAACAGAGGAGGG 925 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct 899 TGCCCCATCAGCATCAGTTTGCCTGCTTATTCAATTAGAAAAAACAGCAACTGAGGAAGG 958 Query 926 AGGCGTTACAACATCTGTCTATTCCCGTAAAGAGCCTGTGCACTTAACTGAGAGGGAAAA 985 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 959 AGGCGTTACATCATCTGTCTATTCCCGTAAAGAGCCTGTGCACTTAACTGAGAGGGAAAA 1018 Query 986 GCAAAAGTTGCAGGTCTGGTCTCGCATTATGCCTTACCGAGAGTCTTTTGCTTGGGCAGT 1045 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1019 GCAAAAGTTGCAGGTCTGGTCTCGCATTATGCCTTACCGAGAGTCTTTTGCTTGGGCAGT 1078 Query 1046 TGTTCCGCTTTTTGATAATAATGTCACCACAAACACTGGTGAATCTGCTTCCCCTAGCAG 1105 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1079 TGTTCCGCTTTTTGATAATAATCTCACCACAAACACTGGTGAATCTGCTTCCCCTAGCAG 1138 Query 1106 TCCTCTTGCTCCTAGTATGACCGCGTCAAGTTCCCATGATGGTGTTTATGAACCCATTGC 1165 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1139 TCCTCTTGCTCCTAGTATGACTGCGTCAAGTTCCCATGATGGTGTTTATGAACCAATTGC 1198 Query 1166 AAAGATCACATCAGATGGAAAGCAAGGTTATTCAGGTGGAAGTTCTGTCGTAGTTGAAAT 1225 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1199 AAAGATCACATCAGATGGAAAGCAAGGTTATTCAGGTGGAAGTTCTGTCGTAGTTGAAAT 1258 Query 1226 ATCTAATTTAAACAAAGTTAAAGAGAGCTACTCTGAAGAGTCAATTCAGGACCCCAAACG 1285 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 1259 ATCTAATTTAAATAAAGTTAAAGAGAGCTACTCTGAAGAGTCCATTCAGGACCCCAAACG 1318 Query 1286 GAAGGTTCACAAACCTGTTAAAGGGGTTCTAAGACTGGAAATTGAGAAACATCGGAATGG 1345 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1319 GAAGGTTCACAAACCTGTTAAAGGGGTTCTAAGACTGGAAATTGAGAAACATCGGAATGG 1378 Query 1346 ACATGGAGACTTTGAAGATCTATCTGAGAATGGAAGTATCATAAATGACTCCCTTGATCC 1405 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1379 ACATGGAGACTTTGAAGATCTATCTGAGAATGGAAGTATCATAAATGACTCCCTTGATCC 1438 Query 1406 GACTGACCGCCTCAGTGACCTGACACTTATGAAGTGTCCCAGTTCTGGTTCTGGTGGACC 1465 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 1439 AACTGACCGCCTCAGTGACCTGACTCTTATGAAGTGTCCCAGTTCTAGTTCTGGTGGACC 1498 Query 1466 CCGTAATGGCTGTTCGAAGTGGAATTCAGAGGATGCAAAGGATGTTTCAAGAAACCTAAC 1525 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct 1499 CCGTAATGGCTGTTCAAAGTGGAATTCAGAGGATGCAAAGGATGTTTCGAGAAATCTAAC 1558 Query 1526 AAGTTCAAGTGGGACTCCTGACTTAAATTGTTATCATGCTTTTGATTTCTGCTCTACGAC 1585 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1559 AAGTTCATGTGGGACTCCTGACTTAAATTGTTATCATGCTTTTGATTTTTGCTCTACGAC 1618 Query 1586 AAGAAACGAGCCTTTTCTACATCTCTTCCATTGCCTTTATGTGTATCCTGTAGCTGTTAC 1645 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1619 AAGAAACGAGCCTTTTCTACATCTCTTCCATTGCCTTTATGTGTATCCTGTAGCTGTTAC 1678 Query 1646 TTTAAGTCGGAAGAGGAATCCCTTTATCCGTGTAGAATTGAGAAAGGATGACACTGATGT 1705 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | Sbjct 1679 TTTAAGTCGGAAGAGGAATCCCTTTATCCGTGTAGAATTGAGAAAGGATGACACAGATAT 1738 Query 1706 CCGAAAACAACCACTCGAGGCAATATATCCAAGAGAGCCTGGTGTTTCACTCCAGAAGTG 1765 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || Sbjct 1739 CCGAAAACAACCACTCGAGGCAATATATCCAAGAGAACCTGGTGTTTCACTCCAGAAATG 1798 Query 1766 GGTTCATACACAGGTTGCTGTTGGTGCTAGGGCTGCTAGCTACCATGATGAAATTAAGGT 1825 ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1799 GGTTCATACACAGGTCGCTGTTGGTGCTAGGGCCGCTAGCTACCATGATGAAATTAAGGT 1858 Query 1826 CTCTCTTCCTGCCACATGGACGCCATCACATCATCTGTTATTCACtttttttCATGTTGA 1885 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1859 CTCTCTTCCTGCCACATGGACGCCATCACATCATCTGTTATTCACTTTTTTTCATGTTGA 1918 Query 1886 TCTCCAGACAAAGCTTGAAGCTCCAAGACCAGTAGTTGTTGGATATGCATCACTTCCATT 1945 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1919 TCTCCAGACAAAGCTTGAAGCTCCAAGACCAGTAGTTGTTGGATATGCATCACTTCCATT 1978 Query 1946 ATCTACCTATATCCACTCACGGTCTGATATTTCTCTACCAGTAATGAGAGAACTGGTTCC 2005 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1979 ATCTACATATATCCACTCACGGTCTGATATTTCTCTACCAGTAATGAGAGAACTTGTTCC 2038 Query 2006 CCACTATCTTCAGGAAACCACCAAGGAGAGGTTGGATTATTTGGAAGATGGCAAGAATAT 2065 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 2039 CCACTATCTTCAGGAAAGCACCAAGGAGAGGTTGGATTATTTGGAAGATGGCAAAAATAT 2098 Query 2066 TTTTAAGTTGCGACTGAGACTTTGTTCGTCTCTTTATCCCACCAATGAACGTGTCAGGGA 2125 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 2099 TTTTAAGTTGCGACTGAGACTTTGTTCATCTCTTTATCCCACCAACGAACGTGTCAGGGA 2158 Query 2126 TTTCTGTCTAGAGTATGATAGACATACCCTCCGGACAAGCCCTCCCTGGGGTTCAGAACT 2185 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 2159 TTTCTGTCTAGAGTATGATAGACATACCCTCCAGACAAGGCCTCCCTGGGGTTCAGAACT 2218 Query 2186 GTTGCAGGCAATAAACAGTTTGAAGCACGTTGATTCTACTGCCTTGCTTCAGTTTCTTTA 2245 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2219 GTTGCAGGCAATAAACAGTTTGAAGCACGTTGATTCTACTGCCTTGCTTCAGTTTCTTTA 2278 Query 2246 CCCAATTCTTAATATGCTCCTTCATCTTATTGGCAATGGTGGAGAAACTCTTCAGGTTGC 2305 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 2279 CCCAATTCTTAACATGCTCCTTCATCTTATTGGCAATGGTGGAGAAACCCTTCAGGTTGC 2338 Query 2306 AGCATTCAGAGCCATGGTGGATATTTTAACTCGGGTGCAGCAGGTGTCGTTTGATGATGC 2365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2339 AGCATTCAGAGCCATGGTGGATATTTTAACTCGGGTGCAGCAGGTGTCGTTTGATGATGC 2398 Query 2366 TGACCGAAATCGATTTCTGGTCACCTATGTTGATTATTCTTTTGATGATTTTGGAGGCAA 2425 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2399 TGACCGAAATCGATTTCTGGTCACCTATGTTGATTATTCTTTTGATGATTTTGGAGGCAA 2458 Query 2426 TCAACCACCAGTTTATCCTGGATTAGCAACTGTATGGGGAAGTTTAGCTAGAAGCAAGGC 2485 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2459 TCAACCACCGGTTTATCCTGGATTAGCAACTGTGTGGGGAAGTTTAGCTAGAAGCAAGGC 2518 Query 2486 CAAAGGTTACCGGGTTGGACCTGTATATGACGATGTATTATCAATGGCGTGGTTTTTCCT 2545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2519 CAAAGGTTACCGGGTTGGACCTGTATATGACGATGTATTATCAATGGCGTGGTTTTTCCT 2578 Query 2546 CGAGTTGATTGTTAAATCGATGGCATTGGAGCAGGCACGTCTTTATGATCACAATCTACC 2605 |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2579 CGAGTTGATTGTTAAATCAATGGCATTGGAGCAAGCACGTCTTTATGATCACAATCTACC 2638 Query 2606 TTCAGGCGAGGATGTTCCACCCATGCAGCTCAAAGAAAGTGTTTTCCGATGTATCATGCA 2665 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2639 TACAGGCGAGGATGTTCCACCCATGCAGCTCAAAGAAAGTGTTTTCCGATGTATCATGCA 2698 Query 2666 ATTGTTTGATTGTCTTTTAACTGAAGTTCATGAACGTTGTAAAAAGGGCCTAAGCTTGGC 2725 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 2699 ATTGTTTGATTGTCTTTTAACTGAAGTACATGAACGTTGTAAAAAGGGCTTAAGCTTGGC 2758 Query 2726 GAAACGTCTGAACAGCAGTTTGGCCTTCTTCTGTTATGATCTTTTATATATAATTGAGCC 2785 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 2759 GAAACGTCTGAACAGCAGTTTGGCCTTCTTCTGTTATGATCTTTTATATATCATTGAGCC 2818 Query 2786 CTGCCAGGTTTATGAACTGGTATCGTTATACATGGACAAGTTTTCTGGTGTTTGTCAATC 2845 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2819 CTGCCAGGTCTATGAACTGGTATCGTTATACATGGACAAGTTTTCTGGTGTTTGTCAATC 2878 Query 2846 TGTTCTACACGAATGCAAGCTCACGTTTTTGCAAATTATCTCCGACCATGATCTTTTTGT 2905 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2879 TGTTCTACACGAATGCAAGCTCACGTTTTTGCAAATTATCTCCGACCATGATCTTTTTGT 2938 Query 2906 AGAAATGCCTGGTAGAGACCCATCAGACAGGAACTATTTATCATCCATATTAATACAGGA 2965 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2939 AGAAATGCCTGGTAGAGACCCATCAGACAGGAACTATTTATCATCCATATTAATACAGGA 2998 Query 2966 GTTATTTCTTTCCCTGGATCATGATGAGCTGCCTCTGCGGGCGAAGGGAGCAAGAATTTT 3025 ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2999 GTTATTTCTCTCACTGGATCATGATGAGCTGCCTCTGCGGGCGAAGGGAGCAAGAATTTT 3058 Query 3026 AGTGATCCTCTTATGCAAGCATGAATTTGATGCACGGTACCAGAAAGCTGAAGATAAGCT 3085 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3059 AGTGATCCTTTTATGCAAGCATGAATTTGATGCGCGGTACCAGAAAGCTGAAGATAAGCT 3118 Query 3086 GTATATTGCACAACTATATTTTCCATTTGTCGGGCAGATTTTAGATGAAATGCCCGTCTT 3145 ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct 3119 GTATATTGCACAACTGTATTTTCCTTTTGTCGGGCAGATTTTAGATGAAATGCCTGTTTT 3178 Query 3146 TTATAACCTAAATGCTACTGAAAAGCGTGAGGTTTTAATTGGCGTGCTGCAAATTGTTCG 3205 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 3179 TTATAACCTAAATGCTACTGAAAAGCGTGAGGTTTTAATTGGTGTGCTGCAAATTGTTCG 3238 Query 3206 TAATCTGGATGACACATCACTTGTCAAGGCATGGCAGCAGAGCATCGCTCGTACTAGATT 3265 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 3239 TAATCTGGATGACACATCACTTGTCAAAGCATGGCAGCAGAGCATCGCTCGTACTCGATT 3298 Query 3266 GTATTTCAAACTCATGGAAGAATGCCTCATACTTTTCGAGCACAAGAAGGCTGCTGACAG 3325 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3299 ATATTTCAAACTCATGGAAGAATGCCTCATACTTTTCGAGCACAAGAAGGCTGCTGACAG 3358 Query 3326 CATCCTCGGGGGCAACAATTCTCGTGGTCCTGTTAGTGAAGGAGCTGGATCACCAAAGTA 3385 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3359 CATCCTCGGGGGCAACAATTCTCGTGGTCCTGTTAGTGAAGGAGCTGGATCACCAAAGTA 3418 Query 3386 CTCCGAGCGACTTTCTCCTGCTATCAACAATTATCTGTCAGAGGCTTCTCGCCAAGAAGT 3445 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3419 CTCCGAGCGACTTTCTCCTGCTATCAACAATTATCTGTCAGAGGCTTCTCGCCAAGAAGT 3478 Query 3446 CAGGCTAGAGGGAACACCTGACAATGGGTACCTGTGGCAGAGAGTTAATTCTCAGTTGGC 3505 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3479 CAGGCTAGAGGGAACACCTGATAATGGGTACCTGTGGCAGAGAGTTAATTCTCAGTTGGC 3538 Query 3506 CTCCCCTAGCCAACCTTATTCTCTAAGAGAAGCTTTAGCTCAAGCACAATCTTCGCGGAT 3565 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 3539 CTCCCCTAGCCAACCTTATTCTCTAAGAGAAGCTTTAGCTCAAGCACAATCTTCCCGGAT 3598 Query 3566 TGGAGCTTCAGCTCAGGCACTAAGAGAATCGCTGCACCCTATTTTGAGGCAAAAACTGGA 3625 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 3599 TGGAGCTTCAGCCCAGGCACTAAGAGAATCGCTGCACCCAATTTTGAGGCAAAAACTGGA 3658 Query 3626 ACTTTGGGAAGAGAATGTAAGTGCCACTGTTAGCCTCCAGGTTTTGGAGATCACTGAAAT 3685 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3659 ACTTTGGGAGGAGAATGTAAGTGCCACTGTTAGCCTCCAGGTTTTGGAGATCACTGAAAA 3718 Query 3686 TTTTTCATCAATGGTAGCCTCTCACAATATTGCAACGGACTATGGAAAATTGGACTGCAT 3745 |||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| Sbjct 3719 TTTTTCATCAATGGCAGCCTCTCACAATATTGCGACCGACTATGGCAAATTGGACTGCAT 3778 Query 3746 TACTACAATATTGACGAGTTTCTTCTCCCGGAACCAGTCATTAGCCTTCTGGAAAGCCTT 3805 |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 3779 TACTACAATACTGACGAGTTTCTTCTCCCGAAACCAGTCATTAGCTTTCTGGAAAGCCTT 3838 Query 3806 CTTTCCAATTTTCAACAGAATCTTTGATCTTCATGGGGCTACACTGATGGCCAGGGAAAA 3865 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3839 CTTTCCAATTTTCAACAGAATCTTTGATCTTCATGGGGCTACACTGATGGCCAGGGAAAA 3898 Query 3866 CGATCGCTTCTTAAAACAGATAGCCTTCCATCTTCTCCGGCTTGCTGTTTACCGCAATGA 3925 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3899 TGATCGCTTCTTAAAACAGATAGCCTTCCATCTTCTCCGGCTTGCTGTTTACCGCAATGA 3958 Query 3926 CAGTGTCAGGAAAAGGGCTGTCATTGGTCTTCAAATACTAGTTAAGAGCTCGCTATACTT 3985 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3959 CAGTGTCAGGAAAAGGGCTGTTATTGGTCTTCAAATACTAGTTAAGAGCTCGCTATACTT 4018 Query 3986 TATGCAGACTGCTAGGCTGAGGGCTTTGCTGACCATTACACTGTCAGAACTCATGTCGGA 4045 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4019 TATGCAGACTGCTAGGCTGAGGGCTTTGCTGACGATTACACTGTCAGAACTCATGTCGGA 4078 Query 4046 TGTCCAAGTGACTCATATGAAAACAGATAATACATTAGAAGAGAGTGGAGAAGCACGTCG 4105 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 4079 TGTCCAAGTGACTCATATGAAGTCAGATAATACATTAGAAGAGAGTGGAGAAGCACGGCG 4138 Query 4106 GCTTCAACAGTCATTAAGCGAAATGGCTGATGAAGCTAAGAGTGTCGATTTGTTGAGGGA 4165 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 4139 ACTTCAACAGTCATTAAGCGAAATGGCTGATGAAGCTAAGAGTGTCAATTTGTTGAGGGA 4198 Query 4166 GTGTGGTCTTCCTGATGATACACTGTTGGTAATTCCCGAGAAATTTACAGAGAATCGCTG 4225 |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 4199 GTGTGGTCTTCCTGATGATACACTGTTGATTATTCCCGAGAAATTTACAGAGAACCGCTG 4258 Query 4226 GTCATGGGCTGAAGTCAAACATCTTTCTGATAGCCTTGTTCTTGCTCTTGATGCCAGCCT 4285 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4259 GTCATGGGCTGAAGTCAAACATCTTTCTGACAGCCTTGTTCTTGCTCTTGATGCCAGCCT 4318 Query 4286 CGGGCATGCCCTTTTGGGATCTGTGATGGCTATGGATCGATATGCTGCAGCAGAGAGCTT 4345 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 4319 CGGGCATGCCCTTTTGGGATCTGTGATGGCTATGGATCGATATGCTGCTGCAGAGAGCTT 4378 Query 4346 CTACAAACTTGGAATGGCATTTGCTCCTGTTCCGGATCTTCACATAATGTGGTTGCTGCA 4405 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 4379 CTACAAACTTGGAATGGCGTTTGCTCCTGTTCCGGATCTTCACATAATGTGGTTATTGCA 4438 Query 4406 TCTATGTGATGCCCACCAGGAAATGCAGTCTTGGGCTGAAGCTGCACAGTGTGCTGTGGC 4465 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 4439 TCTATGTGATGCCCACCAGGAAATGCAGTCTTGGGCAGAAGCTGCACAGTGTGCTGTGGC 4498 Query 4466 GGTTGCAGGTGTGATAATGCAGGCCTTGGTGGCTAGAAATGATGGTGTGTGGAGCAAGGA 4525 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 4499 GGTTGCAGGTGTGATAATGCAGGCCTTGGTGGCTAGGAATGATGGTGTGTGGAGCAAGGA 4558 Query 4526 TCATGTGTCTGCCTTGCGTAAGATTTGCCCGATGGTAAGTGGCGAGTTTACAACAGAGGC 4585 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4559 TCATGTGTCTGCCTTGCGTAAGATTTGCCCGATGGTAAGTGGCGAGTTTACAACAGAGGC 4618 Query 4586 ATCTGCAGCTGAAGTCGAGGGTTATGGTGCTTCAAAGCTAACAGTTGACTCCGCCGTCAA 4645 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4619 ATCTGCAGCTGAAGTCGAGGGTTATGGTGCTTCAAAGCTAACAGTTGACTCCGCCGTCAA 4678 Query 4646 GTACCTACAGCTTGCTAATAAGCTTTTCTCTCAAGCTGAGCTCTACCATTTTTGTGCAAG 4705 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4679 GTATTTACAGCTTGCTAATAAGCTTTTCTCTCAAGCTGAGCTCTACCATTTTTGTGCAAG 4738 Query 4706 CATTTTGGAACTTGTTATTCCAGTTTACAAGAGCAGGAAGGCTTATGGGCAGTTGGCTAA 4765 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4739 CATTTTAGAACTTGTTATTCCAGTTTACAAGAGCAGGAAGGCTTATGGGCAGTTGGCTAA 4798 Query 4766 GTGTCACACTTTACTTACTAATATATATGAGTCCATTCTTGACCAAGAATCAAACCCAAT 4825 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4799 GTGTCACACTTTACTTACTAATATATACGAGTCCATTCTTGACCAAGAATCAAACCCAAT 4858 Query 4826 CCCATTTATTGATGCTACATATTACCGGGTGGGATTTTACGGGGAAAAGTTTGGGAAGTT 4885 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 4859 CCCATTTATTGATGCTACATATTACCGGGTGGGATTTTATGGGGAAAAGTTTGGGAAGTT 4918 Query 4886 GGACAGAAAAGAATATGTATACCGTGAACCACGAGATGTGCGGCTAGGGGATATAATGGA 4945 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4919 GGACAGGAAAGAATATGTATACCGAGAACCACGAGATGTGCGGCTAGGGGATATAATGGA 4978 Query 4946 AAAGCTGAGCCATATCTATGAATCAAGAATGGACAGCAACCATATTCTGCACATTATACC 5005 ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4979 AAAACTGAGCCATATATATGAGTCAAGAATGGACAGCAACCATATTCTGCACATTATACC 5038 Query 5006 AGATTCGAGACAAGTGAAAGCAGAAGAATTGCAGGCAGGAGTGTGCTACCTGCAAATTAC 5065 ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 5039 AGATTCGAGGCAAGTGAAGGCAGAAGACTTGCAGGCAGGAGTGTGCTATCTGCAAATTAC 5098 Query 5066 AGCTGTTGATGCAGTGATGGAAGATGAGGATCTTGGGAGCAGAAGAGAGAGAATATTTTC 5125 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5099 TGCTGTTGATGCAGTGATGGAAGATGAGGATCTTGGGAGCAGAAGAGAGAGAATATTTTC 5158 Query 5126 TCTTTCGACTGGAAGTGTTCGAGCACGAGTGTTTGATCGCTTCTTGTTTGACACACCATT 5185 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| Sbjct 5159 TCTTTCAACTGGAAGTGTTCGAGCACGAGTGTTTGATCGTTTCTTATTTGACACACCATT 5218 Query 5186 TACAAAAAATGGTAAGACCCAAGGTGGATTAGAAGATCAATGGAAGAGAAGAACAGTGCT 5245 ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5219 TACGAAAAATGGTAAAACCCAAGGTGGATTAGAAGATCAATGGAAGAGAAGAACAGTGCT 5278 Query 5246 GCAGACTGAGGGTTCATTCCCTGCGCTTGTGAATAGGCTGTTGGTTACCAAGTCTGAATC 5305 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5279 GCAGACTGAGGGTTCATTCCCTGCCCTTGTGAATAGGCTGTTGGTTACCAAGTCTGAATC 5338 Query 5306 CCTTGAATTCTCGCCAGTGGAGAATGCGATTGGAATGATTGAAACGCGGACAACTGCTCT 5365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 5339 CCTTGAATTCTCGCCAGTGGAGAATGCGATTGGAATGATTGAAACGCGGACAACCGCTCT 5398 Query 5366 GAGAAATGAGCTAGAGGAGCCTCGTAGCTCGGATGGGGATCACCTACCACGGCTTCAAAG 5425 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5399 GAGAAATGAGCTAGAGGAGCCTCGTAGCTCGGATGGGGATCACCTACCACGGCTTCAAAG 5458 Query 5426 TCTGCAGAGGATTCTCCAAGGAAGTGTTGCAGTGCAGGTGAACAGTGGGGTGTTGAGCGT 5485 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5459 TCTGCAGAGGATTCTCCAAGGAAGTGTTGCAGTGCAGGTGAACAGTGGGGTGTTGAGCGT 5518 Query 5486 GTGCACAGCATTCTTATCAGGAGAGCCTGCAACTAGATTGCGTTCGCAGGAACTGCAGCA 5545 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 5519 GTGCACAGCTTTCTTATCAGGAGAGCCTGCAACGAGATTGCGTTCACAGGAACTGCAGCA 5578 Query 5546 ACTGATCGCGGCACTGCTTGAATTCATGGCGGTTTGTAAGCGAGCCATTAGGGTTCACTT 5605 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5579 ACTAATCGCGGCACTGCTTGAATTCATGGCGGTTTGTAAGCGAGCCATTAGGGTTCACTT 5638 Query 5606 TAGATTAATCGGAGAAGAAGATCAGGAATTCCATACTCAGCTTGTCAATGGATTTCAGTC 5665 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5639 TAGATTAATCGGAGAAGAAGATCAGGAATTCCATACTCAGCTTGTCAATGGATTTCAGTC 5698 Query 5666 TCTCACCGCTGAACTCTCCCATTACATCCCTGCTATCTTGTCCGAACTTTAGTGTATCTT 5725 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 5699 TCTCACCGCAGAACTCTCCCATTACATCCCTGCTATCTTATCCGAACTTTAGTGTATCTT 5758 Query 5726 TGTCAGTTTTTGCTACAAATTTTGTGCTTTTTTCTTCCACCATTTGGCTTGGGTATATGT 5785 |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 5759 TGTCAGTTTTTGTTACGAGTTTTGTGCTTTTTTCTTCCACCATTTGGCTTGGCTATATGT 5818 Query 5786 TTGTCATTTCTGTAATTCTTAGTTTAATGACAACAAATGAGAGAAAtttttttAATGACA 5845 || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || | ||||||| Sbjct 5819 TTATCATTTCTGTAATTCTTAGTTTAATGACAACAAGTGAGAAAAAAATTATAAATGACA 5878 Query 5846 ATTGTTTGACTTCTAATTCAGAAGCTTATGTTATATTCGATCGTGGAAATGAGCTC-C-C 5903 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | | Sbjct 5879 ATTGGTTGACTTCTAATTCAGAAGCTTATGTTATATTCGATCGAGGACATGAGCTCTCTC 5938 Query 5904 AGCTTCAAACACAAGCCACTCAACTATTTAGGATGCCTCCGACATCTCA 5952 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 5939 AGCTTCAAACACAAGCCGCTCAACTATTTAGGATGCCTGCGACATCTCA 5987 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 296989912084 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5